FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0034, 1675 aa 1>>>pF1KA0034 1675 - 1675 aa - 1675 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4165+/-0.00128; mu= 18.5463+/- 0.077 mean_var=79.8962+/-15.651, 0's: 0 Z-trim(101.3): 26 B-trim: 0 in 0/48 Lambda= 0.143487 statistics sampled from 6466 (6474) to 6466 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.528), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16 Scan time: 5.490 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32696.1 CLTC gene_id:1213|Hs108|chr17 (1675) 11076 2303.7 0 CCDS74115.1 CLTC gene_id:1213|Hs108|chr17 (1679) 11054 2299.1 0 CCDS46662.2 CLTCL1 gene_id:8218|Hs108|chr22 (1640) 9404 1957.6 0 CCDS54497.2 CLTCL1 gene_id:8218|Hs108|chr22 (1583) 8587 1788.4 0 >>CCDS32696.1 CLTC gene_id:1213|Hs108|chr17 (1675 aa) initn: 11076 init1: 11076 opt: 11076 Z-score: 12379.9 bits: 2303.7 E(32554): 0 Smith-Waterman 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1510 1520 1530 1540 1550 1560 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KA0 FLQEEKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 FLQEEKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDAS 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KA0 ESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 ESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM 1630 1640 1650 1660 1670 >>CCDS46662.2 CLTCL1 gene_id:8218|Hs108|chr22 (1640 aa) initn: 9446 init1: 9404 opt: 9404 Z-score: 10509.5 bits: 1957.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9404; 85.0% identity (96.4% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1634) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN ::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:: CCDS46 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA 10 20 30 40 50 60 70 80 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