Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0059
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0059, 718 aa
1>>>pF1KA0059 718 - 718 aa - 718 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7789+/-0.00101; mu= 0.3112+/- 0.060
mean_var=265.2544+/-58.317, 0's: 0 Z-trim(112.5): 116 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.078749
statistics sampled from 13153 (13269) to 13153 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.408), width: 16
Scan time: 4.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31288.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 ( 718) 5054 587.9 1.7e-167
CCDS7590.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 ( 778) 4912 571.8 1.3e-162
CCDS4294.1 ABLIM3 gene_id:22885|Hs108|chr5 ( 683) 2234 267.6 4.6e-71
CCDS81509.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 ( 748) 2231 267.2 6.2e-71
CCDS31289.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 ( 455) 1995 240.3 5e-63
CCDS47016.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 470) 1885 227.8 3e-59
CCDS47015.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 531) 1885 227.8 3.3e-59
CCDS81508.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 ( 401) 1851 223.9 3.8e-58
CCDS78069.1 ABLIM3 gene_id:22885|Hs108|chr5 ( 650) 1822 220.7 5.4e-57
CCDS47012.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 572) 1741 211.5 2.9e-54
CCDS47013.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 611) 1741 211.5 3.1e-54
CCDS47011.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 559) 1731 210.3 6.3e-54
CCDS47014.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 645) 1729 210.2 8.2e-54
CCDS54719.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 521) 1724 209.5 1e-53
CCDS78071.1 ABLIM3 gene_id:22885|Hs108|chr5 ( 544) 1443 177.6 4.4e-44
CCDS78311.1 DMTN gene_id:2039|Hs108|chr8 ( 365) 768 100.8 3.9e-21
CCDS6020.1 DMTN gene_id:2039|Hs108|chr8 ( 405) 756 99.5 1.1e-20
CCDS68669.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 346) 618 83.7 5e-16
>>CCDS31288.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 (718 aa)
initn: 5054 init1: 5054 opt: 5054 Z-score: 3120.5 bits: 587.9 E(32554): 1.7e-167
Smith-Waterman score: 5054; 99.7% identity (100.0% similar) in 718 aa overlap (1-718:1-718)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MLMTLEMTELTDPHHTMGDYKVAHPQDPHHPSEKPVIHCHKCGEPCKGEVLRVQTKHFHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLMTLEMTELTDPHHTMGDYKVAHPQDPHHPSEKPVIHCHKCGEPCKGEVLRVQTKHFHI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFVEGEVVTALGKTYHPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFVEGEVVTALGKTYHPN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 CFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMSSSPKETTFSSNCAGCGRDIKNGQALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMSSSPKETTFSSNCAGCGRDIKNGQALL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 ALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEACHQFITGKVLEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEACHQFITGKVLEAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 DKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYSRP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPEIETDHWPGPPSFAVIGPDMKRRSSGREEDDEELLRRR
::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS31 SEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPKIETDHWPGPPSFAVVGPDMKRRSSGREEDDEELLRRR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 QLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERSSLLASRYDSPINSASHIPSSKTASLPGYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERSSLLASRYDSPINSASHIPSSKTASLPGYG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQTLPDGHMPAMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQTLPDGHMPAMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KA0 LMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF
670 680 690 700 710
>>CCDS7590.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 (778 aa)
initn: 4911 init1: 4911 opt: 4912 Z-score: 3032.8 bits: 571.8 E(32554): 1.3e-162
Smith-Waterman score: 4912; 99.4% identity (99.7% similar) in 700 aa overlap (19-718:79-778)
10 20 30 40
pF1KA0 MLMTLEMTELTDPHHTMGDYKVAHPQDPHHPSEKPVIHCHKCGEPCKG
: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FTAHRRATITHLLYLCPKDYCPRGRVCNSVDPFVAHPQDPHHPSEKPVIHCHKCGEPCKG
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 EVLRVQTKHFHIKCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFVEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EVLRVQTKHFHIKCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFVEGE
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 VVTALGKTYHPNCFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMSSSPKETTFSSNCAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VVTALGKTYHPNCFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMSSSPKETTFSSNCAG
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 CGRDIKNGQALLALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CGRDIKNGQALLALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEAC
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 HQFITGKVLEAGDKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HQFITGKVLEAGDKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRP
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 TRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEP
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 FYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTP
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 TTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIY
470 480 490 500 510 520
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 KQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPEIETDHWPGPPSFAVIGPDMKRRSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::
CCDS75 KQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPKIETDHWPGPPSFAVVGPDMKRRSSG
530 540 550 560 570 580
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 REEDDEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERSSLLASRYDSPINSASHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 REEDDEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERSSLLASRYDSPINSASHI
590 600 610 620 630 640
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 PSSKTASLPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQTLPDGHMPAMRMDRGVSMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PSSKTASLPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQTLPDGHMPAMRMDRGVSMP
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 NMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRR
710 720 730 740 750 760
710
pF1KA0 NDMKKKAKLF
::::::::::
CCDS75 NDMKKKAKLF
770
>>CCDS4294.1 ABLIM3 gene_id:22885|Hs108|chr5 (683 aa)
initn: 1702 init1: 729 opt: 2234 Z-score: 1389.3 bits: 267.6 E(32554): 4.6e-71
Smith-Waterman score: 2523; 52.8% identity (74.6% similar) in 725 aa overlap (22-718:5-683)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MLMTLEMTELTDPHHTMGDYKVAHPQDPHHP-SEKPVIHCHKCGEPCKGEVLRVQTKHFH
. . :.:..: . . ::.:..::. :::::.::...:::
CCDS42 MNTSIPYQQNPYNPRGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFH
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 IKCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFVEGEVVTALGKTYHP
:.::::.:::: :::.:::.:: ::.:: :::..::::: .: .:. :::..:::.::::
CCDS42 IRCFTCQVCGCGLAQSGFFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 NCFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMSSS-PKETTFSSNCAGCGRDIKNGQA
.::.:..:..::: ::.:::.:..:.:: :.: :.:: : . :.:::: ..::.::.
CCDS42 KCFVCSLCRKPFPIGDKVTFSGKECVCQTCSQSMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LLALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEACHQFITGKVLE
:::::::::..::::..:. .::::::::::.::::.::.. ::.:::.: ..:.:.:::
CCDS42 LLALDKQWHVSCFKCQTCSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 AGDKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYS
:: :::::.:::: ::.::::::::::: :: :::: :::....:.::. ::: :: :
CCDS42 AGGKHYHPTCARCVRCHQMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTSETSI-S
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 RPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQ
::::: :::...: ::::::::.::::::.::::.::...:::::.::: :.
CCDS42 PPGSSI-GSPNRVICAKVDNEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEML
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 ERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQ--DVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQH
:: . ::: :::: : . :. :.:.: :..: : :.::.:::....:: ::::.:
CCDS42 ERCGYGESLGTLSPY-SQDIYENLDLRQR---RASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHH
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 FHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHAAL--
..: : : :::.:: . : : ::: :::::::.: ::::::::::.:. :
CCDS42 YYRSG--PESGRSSPYHSQLDVRSSTPTSYQAPKHFHIPAGDSNIYRKPPIYKRHGDLST
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 AAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPEIETDHWPGPPSFAVIGPDMKRRSSGREEDDE
:..::.:::: . ::. .::: . : : . : :. : .: ::: ::::
CCDS42 ATKSKTSEDISQTSKYSPIYSPDPYYASESEYWTYHGSPKV----PRARRFSSGGEEDDF
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580
pF1KA0 ELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRE--------RSS------LLASRYDS
.... ::.::.:.:::::::. .: ::: : .. :.
CCDS42 ---------DRSMHKLQSGIGRLILKEEMKARSSSYADPWTPPRSSTSSREALHTAGYEM
520 530 540 550 560
590 600 610 620 630
pF1KA0 PINSA--SHIPS------SKTASLPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQTLP
.:.. :: . ::.::::.: :::::: :.:. .:.:.. :. :.:.:
CCDS42 SLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGLHRTPSADLFHYDSMNAVNWGMREY----
570 580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 DGHMPAMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFREI
::.:::.:.::.::::.. ..::::::::::. : : ..
CCDS42 ---------------------KIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLSQEEFYQV
620 630 640 650
700 710
pF1KA0 FGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF
:::.:.::::: ::.::..::.:.::
CCDS42 FGMTISEFDRLALWKRNELKKQARLF
660 670 680
>>CCDS81509.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 (748 aa)
initn: 3826 init1: 2140 opt: 2231 Z-score: 1386.9 bits: 267.2 E(32554): 6.2e-71
Smith-Waterman score: 4974; 95.7% identity (96.0% similar) in 748 aa overlap (1-718:1-748)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MLMTLEMTELTDPHHTMGDYKVAHPQDPHHPSEKPVIHCHKCGEPCKGEVLRVQTKHFHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MLMTLEMTELTDPHHTMGDYKVAHPQDPHHPSEKPVIHCHKCGEPCKGEVLRVQTKHFHI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFVEGEVVTALGKTYHPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFVEGEVVTALGKTYHPN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 CFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMSSSPKETTFSSNCAGCGRDIKNGQALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMSSSPKETTFSSNCAGCGRDIKNGQALL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 ALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEACHQFITGKVLEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEACHQFITGKVLEAG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KA0 DKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLR-------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRLPNIRRSSSDFFY
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330
pF1KA0 ---------------PTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SKSLIRRTGRSPSLQPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKV
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 KAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTS
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 QGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHF
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 HVPDQGINIYRKPPIYKQH--AALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPEIETDHWP
::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS81 HVPDQGINIYRKPPIYKQHDAAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPKIETDHWP
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 GPPSFAVIGPDMKRRSSGREEDDEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRER
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GPPSFAVVGPDMKRRSSGREEDDEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRER
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 SSLLASRYDSPINSASHIPSSKTASLPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSLLASRYDSPINSASHIPSSKTASLPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQT
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640 650 660 670 680 690
pF1KA0 LPDGHMPAMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LPDGHMPAMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFR
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700 710
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::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF
730 740
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::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKL
10 20 30
290 300 310
pF1KA0 R----------------------------PTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDN
: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RLPNIRRSSSDFFYSKSLIRRTGRSPSLQPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDN
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320 330 340 350 360 370
pF1KA0 EILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEG
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380 390 400 410 420 430
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRP------------------
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 -----------------DQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDP
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::::.::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SETPKIETDHWPGPPSFAVVGPDMKRRSSGREEDDEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLI
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560 570 580 590 600 610
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKEEMEKESRERSSLLASRYDSPINSASHIPSSKTASLPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GDVSGGVRDYQTLPDGHMPAMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILREVDRT
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680 690 700 710
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RLERHLAPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF
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:..:: : :: : .: :. ::. ::::::::: :.
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::::::.::.::::::.::::...:::.:::::::.::::: .: .:.:::::.::::::
CCDS47 FHIKCFVCKACGCDLAEGGFFVRQGEYICTLDYQRLYGTRCFSCDQFIEGEVVSALGKTY
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pF1KA0 HPNCFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMS--SSPKETTFSSNCAGCGRDIKN
::.::.:..:. ::::::::::::..:.:: :. :.: :: . . .:.::: .:::
CCDS47 HPDCFVCAVCRLPFPPGDRVTFNGKECMCQKCSLPVSVGSSAHLSQGLRSCGGCGTEIKN
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pF1KA0 GQALLALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEACHQFITGK
::::.::::.:::::::::::::.:..::::::: :::: ::.. ::..:..:...:::.
CCDS47 GQALVALDKHWHLGCFKCKSCGKLLNAEYISKDGLPYCEADYHAKFGIRCDSCEKYITGR
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VLEAGDKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSES
:::::.:::::::: : ::.:::.::::::::::..::: :.:...::.. . :::::::
CCDS47 VLEAGEKHYHPSCALCVRCGQMFAEGEEMYLQGSSIWHPACRQAARTEDRNKETRTSSES
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pF1KA0 IYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYD
: : :.:: :::...::::. .:::::.::::.:: ::::::.:::.:.: :. . .
CCDS47 IISVPASSTSGSPSRVIYAKLGGEILDYRDLAALPKSKAIYDIDRPDMISYSPYISHSAG
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pF1KA0 DKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQ
: ::: ::::. :::::. :: :: :. :..: .: .: .: :::: :::::
CCDS47 D---RQSYGESPQLLSPTPT-EGDQDDRSYKQCRTSSPSSTGSVSLGR--YTPT-SRSPQ
350 360 370 380 390
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pF1KA0 HFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHAALA
:. ::. . :.:... :
CCDS47 HYSRPAARRSDGEDGSLDQDNRKQKSSWLMLKGDADTRTNSPDLDTQSLSHSSGTDRDPL
400 410 420 430 440 450
>>CCDS47015.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 (531 aa)
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pF1KA0 MLMTLEMTELTDPHHTMGDYKVAHPQDPHHPSEK-P--VIHCHKCGEPCKGEVLRVQTKH
:..:: : :: : .: :. ::. ::::::::: :.
CCDS47 MSAVSQPQAAPSPLEKSPSTAILCNTCGNVCKGEVLRVQDKY
10 20 30 40
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pF1KA0 FHIKCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFVEGEVVTALGKTY
::::::.::.::::::.::::...:::.:::::::.::::: .: .:.:::::.::::::
CCDS47 FHIKCFVCKACGCDLAEGGFFVRQGEYICTLDYQRLYGTRCFSCDQFIEGEVVSALGKTY
50 60 70 80 90 100
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pF1KA0 HPNCFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMS--SSPKETTFSSNCAGCGRDIKN
::.::.:..:. ::::::::::::..:.:: :. :.: :: . . .:.::: .:::
CCDS47 HPDCFVCAVCRLPFPPGDRVTFNGKECMCQKCSLPVSVGSSAHLSQGLRSCGGCGTEIKN
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GQALLALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEACHQFITGK
::::.::::.:::::::::::::.:..::::::: :::: ::.. ::..:..:...:::.
CCDS47 GQALVALDKHWHLGCFKCKSCGKLLNAEYISKDGLPYCEADYHAKFGIRCDSCEKYITGR
170 180 190 200 210 220
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pF1KA0 VLEAGDKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSES
:::::.:::::::: : ::.:::.::::::::::..::: :.:...::.. . :::::::
CCDS47 VLEAGEKHYHPSCALCVRCGQMFAEGEEMYLQGSSIWHPACRQAARTEDRNKETRTSSES
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pF1KA0 IYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYD
: : :.:: :::...::::. .:::::.::::.:: ::::::.:::.:.: :. . .
CCDS47 IISVPASSTSGSPSRVIYAKLGGEILDYRDLAALPKSKAIYDIDRPDMISYSPYISHSAG
290 300 310 320 330 340
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pF1KA0 DKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQ
: ::: ::::. :::::. :: :: :. :..: .: .: .: :::: :::::
CCDS47 D---RQSYGESPQLLSPTPT-EGDQDDRSYKQCRTSSPSSTGSVSLGR--YTPT-SRSPQ
350 360 370 380 390
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pF1KA0 HFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHAALA
:. :: ::
CCDS47 HYSRP---------------------------------------------------AA--
400
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 AQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPEIETDHWPGPPSFAVIGPDMKRRSSGREEDDEE
:::.: ::
CCDS47 ------------------------------------------------RRSDG--ED---
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 LLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERSSLLASRYDSPINSASHIPSSKTAS
:.: ....:..:: : . :. . : :. : :
CCDS47 -------------------GSL------DQDNRKKSSWLMLKGDADTRTNS--PDLDTQS
410 420 430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 LPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQTLPDGHMPAMRMDRGVSMPNMLEPKI
: : :: :: : .:: : :. .. ::
CCDS47 LS-------HS---------------SGTDRD---------PLQRMA-GDSFHSQY--KI
450 460
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pF1KA0 FPYEMLMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKA
.::. :.:::: : :. ..::::::::::.:: :.:.:::::.::::: ::.:::.::::
CCDS47 YPYDSLIVTNRIRVKLPKDVDRTRLERHLSPEEFQEVFGMSIEEFDRLALWKRNDLKKKA
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 KLF
::
CCDS47 LLF
530
>>CCDS81508.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 (401 aa)
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pF1KA0 ACHQFITGKVLEAGDKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKL
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pF1KA0 RPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITY
: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 R--------------------------AKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITY
40 50 60
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pF1KA0 EPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSY
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pF1KA0 TPTTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPP
:::::::::::::: :::::::::::
CCDS81 TPTTSRSPQHFHRP-----------------------------------DQGINIYRKPP
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pF1KA0 IYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPEIETDHWPGPPSFAVIGPDMKRRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::
CCDS81 IYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPKIETDHWPGPPSFAVVGPDMKRRS
150 160 170 180 190 200
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 SGREEDDEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERSSLLASRYDSPINSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SGREEDDEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRERSSLLASRYDSPINSAS
210 220 230 240 250 260
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pF1KA0 HIPSSKTASLPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQTLPDGHMPAMRMDRGVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HIPSSKTASLPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQTLPDGHMPAMRMDRGVS
270 280 290 300 310 320
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pF1KA0 MPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFREIFGMSIQEFDRLPLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFREIFGMSIQEFDRLPLW
330 340 350 360 370 380
710
pF1KA0 RRNDMKKKAKLF
::::::::::::
CCDS81 RRNDMKKKAKLF
390 400
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pF1KA0 MLMTLEMTELTDPHHTMGDYKVAHPQDPHHP-SEKPVIHCHKCGEPCKGEVLRVQTKHFH
. . :.:..: . . ::.:..::. :::::.::...:::
CCDS78 MNTSIPYQQNPYNPRGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFH
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 IKCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFVEGEVVTALGKTYHP
:.::::.:::: :::.:::.:: ::.:: :::..::::: .: .:. :::..:::.::::
CCDS78 IRCFTCQVCGCGLAQSGFFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHP
50 60 70 80 90 100
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pF1KA0 NCFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMSSS-PKETTFSSNCAGCGRDIKNGQA
.::.:..:..::: ::.:::.:..:.:: :.: :.:: : . :.:::: ..::.::.
CCDS78 KCFVCSLCRKPFPIGDKVTFSGKECVCQTCSQSMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQS
110 120 130 140 150 160
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pF1KA0 LLALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEACHQFITGKVLE
:::::::::..::::..:. .::::::::::.::::.::.. ::.:::.: ..:.:.:::
CCDS78 LLALDKQWHVSCFKCQTCSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLE
170 180 190 200 210 220
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pF1KA0 AGDKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYS
:: :::::.:::: ::.::::::::::: :: :::: :::....:.::. ::: :: :
CCDS78 AGGKHYHPTCARCVRCHQMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTSETSI-S
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 RPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQ
::::: :::...: ::::::::.::::::.::::.::...:::::.::: :.
CCDS78 PPGSSI-GSPNRVICAKVDNEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEML
290 300 310 320 330 340
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pF1KA0 ERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQ--DVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQH
:: . ::: :::: : . :. :.:.: :..: : :.::.:::....:: ::::.:
CCDS78 ERCGYGESLGTLSPY-SQDIYENLDLRQR---RASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHH
350 360 370 380 390
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pF1KA0 FHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHAAL--
..: :.: :: ::::::::::.:. :
CCDS78 YYR-----SAG---------DS---------------------NIYRKPPIYKRHGDLST
400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 AAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPEIETDHWPGPPSFAVIGPDMKRRSSGREEDDE
:..::.:::: . ::. .::: . : : . : :. : .: ::: ::::
CCDS78 ATKSKTSEDISQTSKYSPIYSPDPYYASESEYWTYHGSPKV----PRARRFSSGGEEDDF
430 440 450 460 470
540 550 560 570 580
pF1KA0 ELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRE--------RSS------LLASRYDS
.... ::.::.:.:::::::. .: ::: : .. :.
CCDS78 ---------DRSMHKLQSGIGRLILKEEMKARSSSYADPWTPPRSSTSSREALHTAGYEM
480 490 500 510 520
590 600 610 620 630
pF1KA0 PINSA--SHIPS------SKTASLPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQTLP
.:.. :: . ::.::::.: :::::: :.:. .:.:.. :. :.:.:
CCDS78 SLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGLHRTPSADLFHYDSMNAVNWGMREY----
530 540 550 560 570 580
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 DGHMPAMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFREI
::.:::.:.::.::::.. ..::::::::::. : : ..
CCDS78 ---------------------KIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLSQEEFYQV
590 600 610 620
700 710
pF1KA0 FGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF
:::.:.::::: ::.::..::.:.::
CCDS78 FGMTISEFDRLALWKRNELKKQARLF
630 640 650
>>CCDS47012.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 (572 aa)
initn: 2183 init1: 995 opt: 1741 Z-score: 1087.7 bits: 211.5 E(32554): 2.9e-54
Smith-Waterman score: 2170; 50.5% identity (67.0% similar) in 705 aa overlap (22-718:4-572)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MLMTLEMTELTDPHHTMGDYKVAHPQDPHHPSEK-P--VIHCHKCGEPCKGEVLRVQTKH
:..:: : :: : .: :. ::. ::::::::: :.
CCDS47 MSAVSQPQAAPSPLEKSPSTAILCNTCGNVCKGEVLRVQDKY
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 FHIKCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFVEGEVVTALGKTY
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::: ::
CCDS47 KKALLF
570
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]