Result of FASTA (omim) for
pF1KA0099
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0099, 1162 aa
1>>>pF1KA0099 1162 - 1162 aa - 1162 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0983+/-0.000427; mu= 0.6684+/- 0.027
mean_var=263.0588+/-55.652, 0's: 0 Z-trim(119.1): 73 B-trim: 386 in 1/54
Lambda= 0.079077
statistics sampled from 32651 (32727) to 32651 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.384), width: 16
Scan time: 18.090
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055491 (OMIM: 607204) pumilio homolog 1 isoform (1186) 4043 475.6 7.9e-133
NP_001018494 (OMIM: 607204) pumilio homolog 1 isof (1188) 3868 455.7 8e-127
XP_011531025 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 840) 3301 390.9 1.8e-107
XP_016859193 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1010) 3301 390.9 2.1e-107
XP_016859194 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1010) 3301 390.9 2.1e-107
XP_016859192 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1010) 3301 390.9 2.1e-107
XP_016859195 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1010) 3301 390.9 2.1e-107
XP_006712038 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1010) 3301 390.9 2.1e-107
XP_011531022 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1066) 3301 390.9 2.2e-107
XP_011531021 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1066) 3301 390.9 2.2e-107
XP_006712036 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1066) 3301 390.9 2.2e-107
XP_006712037 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1066) 3301 390.9 2.2e-107
XP_005262664 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1066) 3301 390.9 2.2e-107
XP_011531023 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1066) 3301 390.9 2.2e-107
XP_016859203 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 838) 3277 388.1 1.2e-106
NP_001269681 (OMIM: 607205) pumilio homolog 2 isof (1008) 3277 388.2 1.4e-106
XP_016859191 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1064) 3277 388.2 1.5e-106
NP_056132 (OMIM: 607205) pumilio homolog 2 isoform (1064) 3277 388.2 1.5e-106
XP_016859190 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom (1064) 3277 388.2 1.5e-106
XP_016859196 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 987) 2530 303.0 6.2e-81
XP_016859197 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 987) 2530 303.0 6.2e-81
XP_005262666 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 987) 2530 303.0 6.2e-81
XP_016859204 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 759) 2502 299.7 4.6e-80
NP_001269720 (OMIM: 607205) pumilio homolog 2 isof ( 929) 2502 299.7 5.4e-80
XP_016859202 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 929) 2502 299.7 5.4e-80
XP_016859199 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 985) 2502 299.8 5.7e-80
XP_005262667 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 985) 2502 299.8 5.7e-80
NP_001269719 (OMIM: 607205) pumilio homolog 2 isof ( 985) 2502 299.8 5.7e-80
XP_016859200 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 985) 2502 299.8 5.7e-80
XP_016859201 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 985) 2502 299.8 5.7e-80
XP_016859198 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 985) 2502 299.8 5.7e-80
XP_011531027 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 667) 823 108.1 1.9e-22
XP_011531026 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio hom ( 683) 823 108.1 1.9e-22
NP_055693 (OMIM: 609960) pumilio homolog 3 [Homo s ( 648) 272 45.2 0.0016
>>NP_055491 (OMIM: 607204) pumilio homolog 1 isoform 2 [ (1186 aa)
initn: 6598 init1: 2904 opt: 4043 Z-score: 2505.7 bits: 475.6 E(85289): 7.9e-133
Smith-Waterman score: 7664; 97.4% identity (97.4% similar) in 1189 aa overlap (1-1162:1-1186)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 HSSPVPGSIGVAGRSQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HSSPVPGSIGVAGRSQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLPGKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLPGKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMVEYVLSSSPGDSCLRKGGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMVEYVLSSSPGDSCLRKGGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFSRTPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFSRTPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 DYSGTQVPVDSAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIAGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
NP_055 DYSGTQVPVDSAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHI-GL
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 APAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 APAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAA
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 AAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAF
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KA0 GQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQA---
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQAAVA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KA0 ------------------------GTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSS
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 LFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKR
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 TSSSLTPIGHSFYNGLSFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TSSSLTPIGHSFYNGLSFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTN
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 GSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNN
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_055 RYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLMVDVFGN
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pF1KA0 YVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVINEMVREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
NP_055 YVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQ--NEMVREL
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pF1KA0 DGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHC
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1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 LPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKF
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 ASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQR
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1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 KIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII
1140 1150 1160 1170 1180
>>NP_001018494 (OMIM: 607204) pumilio homolog 1 isoform (1188 aa)
initn: 6622 init1: 3732 opt: 3868 Z-score: 2397.8 bits: 455.7 E(85289): 8e-127
Smith-Waterman score: 7688; 97.6% identity (97.6% similar) in 1189 aa overlap (1-1162:1-1188)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGT
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 HSSPVPGSIGVAGRSQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSSPVPGSIGVAGRSQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLPGKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLPGKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTS
130 140 150 160 170 180
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pF1KA0 DHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMVEYVLSSSPGDSCLRKGGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMVEYVLSSSPGDSCLRKGGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFSRTPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFSRTPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQF
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 DYSGTQVPVDSAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIAGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
NP_001 DYSGTQVPVDSAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHI-GL
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pF1KA0 APAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAA
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pF1KA0 AAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAF
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pF1KA0 GQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQA---
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQAAVA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KA0 ------------------------GTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSS
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pF1KA0 LFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKR
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 TSSSLTPIGHSFYNGLSFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSSSLTPIGHSFYNGLSFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTN
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 GSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNN
780 790 800 810 820 830
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pF1KA0 RYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLNVDVFGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_001 RYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLMVDVFGN
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880 890 900 910 920 930
pF1KA0 YVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVINEMVREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVINEMVREL
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 DGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHC
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1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 LPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKF
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 ASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQR
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 KIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII
1140 1150 1160 1170 1180
>>XP_011531025 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio homolog (840 aa)
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Smith-Waterman score: 4418; 80.6% identity (91.6% similar) in 844 aa overlap (350-1162:1-840)
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 EGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVDSAAATVGLF
::.::.: ::::: :.:::.::..::::::
XP_011 MEQVGLESLQFDYPGNQVPMDSSGATVGLF
10 20 30
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 DYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIAG-----LAPAAFVPNPYIISA
::::::::::: :::.:::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::
XP_011 DYNSQQQLFQRTNALTVQQLTAAQQQQYALAAAQQPHIAGVFSAGLAPAAFVPNPYIISA
40 50 60 70 80 90
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 APPGTDPYTA-GLAAAATL-GPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQ
:::::::::: :::::::: :::::: ::::: :::::::.::::::::: :.:.:.::
XP_011 APPGTDPYTAAGLAAAATLAGPAVVPPQYYGV-PWGVYPANLFQQQAAAA--ANNTASQQ
100 110 120 130 140
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pF1KA0 TTPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYP
.. ::: :::::::.::.::::::::.:::::.. :.::::.: .::::::::.:::::
XP_011 AASQAQPGQQQVLRAGAGQRPLTPNQGQQGQQAESLAAAAAANPTLAFGQGLATGMPGYQ
150 160 170 180 190 200
560 570 580 590
pF1KA0 VLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQA---------------
::::.:::::::::::. :::.::::::::.::.::.:::.::::
XP_011 VLAPTAYYDQTGALVVGPGARTGLGAPVRLMAPTPVLISSAAAQAAAAAAAGGTASSLTG
210 220 230 240 250 260
600 610 620 630 640
pF1KA0 ---------GTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSSLFSQGSAQPANTSLG
::: :: : ::::..:: :.::::..::...::::::::.: .::..::::
XP_011 STNGLFRPIGTQPPQQQ-QQQPSTNLQSNSFYGSSSLTNSSQSSSLFSHGPGQPGSTSLG
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pF1KA0 FGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLTPIGHSFYNG
:::..::::..::::.:::..:..: ..:..::.::. :::::::.::::.:::. :::.
XP_011 FGSGNSLGAAIGSALSGFGSSVGSSASSSATRRESLSTSSDLYKRSSSSLAPIGQPFYNS
330 340 350 360 370 380
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pF1KA0 LSFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAK
:.:::::.:.::::::: :::: :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
XP_011 LGFSSSPSPIGMPLPSQTPGHSLTPPPSLSSHGSSSSLHLGGLTNGSGRYISAAPGAEAK
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pF1KA0 YRSASSASSLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIM
::::::.::::: :: :: :::::. ::.::::::::::::::::.::::::.. :::.
XP_011 YRSASSTSSLFSSSSQLFPPSRLRYNRSDIMPSGRSRLLEDFRNNRFPNLQLRDLIGHIV
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830 840 850 860 870 880
pF1KA0 EFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLNVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQK
::::::::::::: :::::::::::.:::::::::::: .:::::::::::::::::.::
XP_011 EFSQDQHGSRFIQQKLERATPAERQMVFNEILQAAYQLMTDVFGNYVIQKFFEFGSLDQK
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890 900 910 920 930 940
pF1KA0 LALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVINEMVRELDGHVLKCVKDQNGNH
:::: ::::::: :::::::::::::::: : ::::::.:::.:::::::::::::::::
XP_011 LALATRIRGHVLPLALQMYGCRVIQKALESISSDQQVISEMVKELDGHVLKCVKDQNGNH
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pF1KA0 VVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQH
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: .::::::::::::
XP_011 VVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFVLSTHPYGCRVIQRILEHCTAEQTLPILEELHQH
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1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 TEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRT
::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.::::::::::::::::::::.
XP_011 TEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVSEIRGKVLALSQHKFASNVVEKCVTHASRA
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pF1KA0 ERAVLIDEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLR
:::.:::::: .::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.::::::::.:::
XP_011 ERALLIDEVCCQNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDMAEPAQRKIIMHKIRPHITTLR
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1130 1140 1150 1160
pF1KA0 KYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII
::::::::::::::::.::. ::::: :::::..
XP_011 KYTYGKHILAKLEKYYLKNSPDLGPIGGPPNGML
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>>XP_016859193 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio homolog (1010 aa)
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Smith-Waterman score: 5009; 77.0% identity (89.3% similar) in 1016 aa overlap (184-1162:1-1010)
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pF1KA0 ETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSE
.::::::::: ::.:: :::::..::::::
XP_016 MSQPIMVQRRSGQGFHGNSEVNAILSPRSE
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220 230 240 250 260
pF1KA0 SGGLGVSMVEYVLSSSPGD---SCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGT-FDGDKLGDL
:::::::::::::::::.: : .:::.:: :::..: .::..:.:.. :. :. ::
XP_016 SGGLGVSMVEYVLSSSPADKLDSRFRKGNFGTRDAETDGPEKGDQKGKASPFEEDQNRDL
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pF1KA0 KEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFSRTPGNCQNSANEV-DLLGPNQNGSEGLAQLTST
:. : .: :: . ::.::: :::.::::. : : .:: . :::: : ::::. : .
XP_016 KQGDDDDSKINGRGLPNGMDADCKDFNRTPGSRQASPTEVVERLGPNTNPSEGLGPLPNP
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.. :: ::.::: :.:. :: ::.::.: ::::: :.:::.::..::::::::::::::
XP_016 TANKPLVEEFSNPETQN--LDAMEQVGLESLQFDYPGNQVPMDSSGATVGLFDYNSQQQL
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pF1KA0 FQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIAG-----LAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPY
::: :::.:::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::::::::::
XP_016 FQRTNALTVQQLTAAQQQQYALAAAQQPHIAGVFSAGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPY
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pF1KA0 TA-GLAAAATL-GPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQTTPQAQQG
:: :::::::: :::::: ::::: :::::::.::::::::: :.:.:.::.. ::: :
XP_016 TAAGLAAAATLAGPAVVPPQYYGV-PWGVYPANLFQQQAAAA--ANNTASQQAASQAQPG
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pF1KA0 QQQVLRGGASQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYY
::::::.::.::::::::.:::::.. :.::::.: .::::::::.::::: ::::.:::
XP_016 QQQVLRAGAGQRPLTPNQGQQGQQAESLAAAAAANPTLAFGQGLATGMPGYQVLAPTAYY
330 340 350 360 370 380
570 580 590
pF1KA0 DQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQA-----------------------
::::::::. :::.::::::::.::.::.:::.::::
XP_016 DQTGALVVGPGARTGLGAPVRLMAPTPVLISSAAAQAAAAAAAGGTASSLTGSTNGLFRP
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pF1KA0 -GTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSSLFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLG
::: :: : ::::..:: :.::::..::...::::::::.: .::..:::::::..:::
XP_016 IGTQPPQ-QQQQQPSTNLQSNSFYGSSSLTNSSQSSSLFSHGPGQPGSTSLGFGSGNSLG
450 460 470 480 490 500
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 ATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLTPIGHSFYNGLSFSSSPG
:..::::.:::..:..: ..:..::.::. :::::::.::::.:::. :::.:.:::::.
XP_016 AAIGSALSGFGSSVGSSASSSATRRESLSTSSDLYKRSSSSLAPIGQPFYNSLGFSSSPS
510 520 530 540 550 560
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 PVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSAS
:.::::::: :::: :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:
XP_016 PIGMPLPSQTPGHSLTPPPSLSSHGSSSSLHLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSTS
570 580 590 600 610 620
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 SLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHG
:::: :: :: :::::. ::.::::::::::::::::.::::::.. :::.::::::::
XP_016 SLFSSSSQLFPPSRLRYNRSDIMPSGRSRLLEDFRNNRFPNLQLRDLIGHIVEFSQDQHG
630 640 650 660 670 680
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 SRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLNVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIR
::::: :::::::::::.:::::::::::: .:::::::::::::::::.:::::: :::
XP_016 SRFIQQKLERATPAERQMVFNEILQAAYQLMTDVFGNYVIQKFFEFGSLDQKLALATRIR
690 700 710 720 730 740
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pF1KA0 GHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVINEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIEC
:::: :::::::::::::::: : ::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 GHVLPLALQMYGCRVIQKALESISSDQQVISEMVKELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIEC
750 760 770 780 790 800
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 VQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQ
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::
XP_016 VQPQSLQFIIDAFKGQVFVLSTHPYGCRVIQRILEHCTAEQTLPILEELHQHTEQLVQDQ
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pF1KA0 YGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDE
::::::::::::::::::::::.::::.::.::::::::::::::::::::.:::.::::
XP_016 YGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVSEIRGKVLALSQHKFASNVVEKCVTHASRAERALLIDE
870 880 890 900 910 920
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHI
:: .::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.::::::::.:::::::::::
XP_016 VCCQNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDMAEPAQRKIIMHKIRPHITTLRKYTYGKHI
930 940 950 960 970 980
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pF1KA0 LAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII
::::::::.::. ::::: :::::..
XP_016 LAKLEKYYLKNSPDLGPIGGPPNGML
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>>XP_016859194 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio homolog (1010 aa)
initn: 4765 init1: 3176 opt: 3301 Z-score: 2049.2 bits: 390.9 E(85289): 2.1e-107
Smith-Waterman score: 5009; 77.0% identity (89.3% similar) in 1016 aa overlap (184-1162:1-1010)
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 ETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSE
.::::::::: ::.:: :::::..::::::
XP_016 MSQPIMVQRRSGQGFHGNSEVNAILSPRSE
10 20 30
220 230 240 250 260
pF1KA0 SGGLGVSMVEYVLSSSPGD---SCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGT-FDGDKLGDL
:::::::::::::::::.: : .:::.:: :::..: .::..:.:.. :. :. ::
XP_016 SGGLGVSMVEYVLSSSPADKLDSRFRKGNFGTRDAETDGPEKGDQKGKASPFEEDQNRDL
40 50 60 70 80 90
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pF1KA0 KEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFSRTPGNCQNSANEV-DLLGPNQNGSEGLAQLTST
:. : .: :: . ::.::: :::.::::. : : .:: . :::: : ::::. : .
XP_016 KQGDDDDSKINGRGLPNGMDADCKDFNRTPGSRQASPTEVVERLGPNTNPSEGLGPLPNP
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pF1KA0 NGAKP-VEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVDSAAATVGLFDYNSQQQL
.. :: ::.::: :.:. :: ::.::.: ::::: :.:::.::..::::::::::::::
XP_016 TANKPLVEEFSNPETQN--LDAMEQVGLESLQFDYPGNQVPMDSSGATVGLFDYNSQQQL
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pF1KA0 FQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIAG-----LAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPY
::: :::.:::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::::::::::
XP_016 FQRTNALTVQQLTAAQQQQYALAAAQQPHIAGVFSAGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPY
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pF1KA0 TA-GLAAAATL-GPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQTTPQAQQG
:: :::::::: :::::: ::::: :::::::.::::::::: :.:.:.::.. ::: :
XP_016 TAAGLAAAATLAGPAVVPPQYYGV-PWGVYPANLFQQQAAAA--ANNTASQQAASQAQPG
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pF1KA0 QQQVLRGGASQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYY
::::::.::.::::::::.:::::.. :.::::.: .::::::::.::::: ::::.:::
XP_016 QQQVLRAGAGQRPLTPNQGQQGQQAESLAAAAAANPTLAFGQGLATGMPGYQVLAPTAYY
330 340 350 360 370 380
570 580 590
pF1KA0 DQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQA-----------------------
::::::::. :::.::::::::.::.::.:::.::::
XP_016 DQTGALVVGPGARTGLGAPVRLMAPTPVLISSAAAQAAAAAAAGGTASSLTGSTNGLFRP
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pF1KA0 -GTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSSLFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLG
::: :: : ::::..:: :.::::..::...::::::::.: .::..:::::::..:::
XP_016 IGTQPPQ-QQQQQPSTNLQSNSFYGSSSLTNSSQSSSLFSHGPGQPGSTSLGFGSGNSLG
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pF1KA0 ATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLTPIGHSFYNGLSFSSSPG
:..::::.:::..:..: ..:..::.::. :::::::.::::.:::. :::.:.:::::.
XP_016 AAIGSALSGFGSSVGSSASSSATRRESLSTSSDLYKRSSSSLAPIGQPFYNSLGFSSSPS
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pF1KA0 PVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSAS
:.::::::: :::: :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:
XP_016 PIGMPLPSQTPGHSLTPPPSLSSHGSSSSLHLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSTS
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pF1KA0 SLFSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHG
:::: :: :: :::::. ::.::::::::::::::::.::::::.. :::.::::::::
XP_016 SLFSSSSQLFPPSRLRYNRSDIMPSGRSRLLEDFRNNRFPNLQLRDLIGHIVEFSQDQHG
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pF1KA0 SRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLNVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIR
::::: :::::::::::.:::::::::::: .:::::::::::::::::.:::::: :::
XP_016 SRFIQQKLERATPAERQMVFNEILQAAYQLMTDVFGNYVIQKFFEFGSLDQKLALATRIR
690 700 710 720 730 740
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pF1KA0 GHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVINEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIEC
:::: :::::::::::::::: : ::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 GHVLPLALQMYGCRVIQKALESISSDQQVISEMVKELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIEC
750 760 770 780 790 800
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 VQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQ
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::
XP_016 VQPQSLQFIIDAFKGQVFVLSTHPYGCRVIQRILEHCTAEQTLPILEELHQHTEQLVQDQ
810 820 830 840 850 860
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 YGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDE
::::::::::::::::::::::.::::.::.::::::::::::::::::::.:::.::::
XP_016 YGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVSEIRGKVLALSQHKFASNVVEKCVTHASRAERALLIDE
870 880 890 900 910 920
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHI
:: .::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.::::::::.:::::::::::
XP_016 VCCQNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDMAEPAQRKIIMHKIRPHITTLRKYTYGKHI
930 940 950 960 970 980
1140 1150 1160
pF1KA0 LAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII
::::::::.::. ::::: :::::..
XP_016 LAKLEKYYLKNSPDLGPIGGPPNGML
990 1000 1010
>>XP_016859192 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio homolog (1010 aa)
initn: 4765 init1: 3176 opt: 3301 Z-score: 2049.2 bits: 390.9 E(85289): 2.1e-107
Smith-Waterman score: 5009; 77.0% identity (89.3% similar) in 1016 aa overlap (184-1162:1-1010)
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 ETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSE
.::::::::: ::.:: :::::..::::::
XP_016 MSQPIMVQRRSGQGFHGNSEVNAILSPRSE
10 20 30
220 230 240 250 260
pF1KA0 SGGLGVSMVEYVLSSSPGD---SCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGT-FDGDKLGDL
:::::::::::::::::.: : .:::.:: :::..: .::..:.:.. :. :. ::
XP_016 SGGLGVSMVEYVLSSSPADKLDSRFRKGNFGTRDAETDGPEKGDQKGKASPFEEDQNRDL
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 KEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFSRTPGNCQNSANEV-DLLGPNQNGSEGLAQLTST
:. : .: :: . ::.::: :::.::::. : : .:: . :::: : ::::. : .
XP_016 KQGDDDDSKINGRGLPNGMDADCKDFNRTPGSRQASPTEVVERLGPNTNPSEGLGPLPNP
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 NGAKP-VEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVDSAAATVGLFDYNSQQQL
.. :: ::.::: :.:. :: ::.::.: ::::: :.:::.::..::::::::::::::
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::: :::.:::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::::::::::
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:: :::::::: :::::: ::::: :::::::.::::::::: :.:.:.::.. ::: :
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::::::.::.::::::::.:::::.. :.::::.: .::::::::.::::: ::::.:::
XP_016 QQQVLRAGAGQRPLTPNQGQQGQQAESLAAAAAANPTLAFGQGLATGMPGYQVLAPTAYY
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::: :: : ::::..:: :.::::..::...::::::::.: .::..:::::::..:::
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:.::::::: :::: :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:
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:::: :: :: :::::. ::.::::::::::::::::.::::::.. :::.::::::::
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::::: :::::::::::.:::::::::::: .:::::::::::::::::.:::::: :::
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:::: :::::::::::::::: : ::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::
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XP_006 TANKPLVEEFSNPETQN--LDAMEQVGLESLQFDYPGNQVPMDSSGATVGLFDYNSQQQL
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pF1KA0 FQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIAG-----LAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPY
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XP_006 FQRTNALTVQQLTAAQQQQYALAAAQQPHIAGVFSAGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPY
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pF1KA0 TA-GLAAAATL-GPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQTTPQAQQG
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XP_006 TAAGLAAAATLAGPAVVPPQYYGV-PWGVYPANLFQQQAAAA--ANNTASQQAASQAQPG
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XP_006 QQQVLRAGAGQRPLTPNQGQQGQQAESLAAAAAANPTLAFGQGLATGMPGYQVLAPTAYY
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pF1KA0 DQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQA-----------------------
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XP_006 DQTGALVVGPGARTGLGAPVRLMAPTPVLISSAAAQAAAAAAAGGTASSLTGSTNGLFRP
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XP_006 VQPQSLQFIIDAFKGQVFVLSTHPYGCRVIQRILEHCTAEQTLPILEELHQHTEQLVQDQ
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pF1KA0 YGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDE
::::::::::::::::::::::.::::.::.::::::::::::::::::::.:::.::::
XP_006 YGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVSEIRGKVLALSQHKFASNVVEKCVTHASRAERALLIDE
870 880 890 900 910 920
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 VCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHI
:: .::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.::::::::.:::::::::::
XP_006 VCCQNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDMAEPAQRKIIMHKIRPHITTLRKYTYGKHI
930 940 950 960 970 980
1140 1150 1160
pF1KA0 LAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII
::::::::.::. ::::: :::::..
XP_006 LAKLEKYYLKNSPDLGPIGGPPNGML
990 1000 1010
>>XP_011531022 (OMIM: 607205) PREDICTED: pumilio homolog (1066 aa)
initn: 4779 init1: 3176 opt: 3301 Z-score: 2048.9 bits: 390.9 E(85289): 2.2e-107
Smith-Waterman score: 5301; 76.8% identity (89.3% similar) in 1073 aa overlap (128-1162:1-1066)
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pF1KA0 SGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLPGKKFWETDE
.::::::::::.:.::: ::: ::::: :.
XP_011 MNHDFQALALESRGMGE-LLPTKKFWEPDD
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pF1KA0 SSKDGPKGIFLGD-QWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGG
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XP_011 STKDGQKGIFLGDDEWRETAWGASHHSMSQPIMVQRRSGQGFHGNSEVNAILSPRSESGG
30 40 50 60 70 80
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pF1KA0 LGVSMVEYVLSSSPGD---SCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGT-FDGDKLGDLKEE
::::::::::::::.: : .:::.:: :::..: .::..:.:.. :. :. :::.
XP_011 LGVSMVEYVLSSSPADKLDSRFRKGNFGTRDAETDGPEKGDQKGKASPFEEDQNRDLKQG
90 100 110 120 130 140
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pF1KA0 GDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFSRTPGNCQNSANEV-DLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGA
: .: :: . ::.::: :::.::::. : : .:: . :::: : ::::. : . ..
XP_011 DDDDSKINGRGLPNGMDADCKDFNRTPGSRQASPTEVVERLGPNTNPSEGLGPLPNPTAN
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pF1KA0 KP-VEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVDSAAATVGLFDYNSQQQLFQR
:: ::.::: :.:. :: ::.::.: ::::: :.:::.::..:::::::::::::::::
XP_011 KPLVEEFSNPETQN--LDAMEQVGLESLQFDYPGNQVPMDSSGATVGLFDYNSQQQLFQR
210 220 230 240 250 260
400 410 420 430 440
pF1KA0 PNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIAG-----LAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTA-
:::.:::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::::::::::::
XP_011 TNALTVQQLTAAQQQQYALAAAQQPHIAGVFSAGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAA
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pF1KA0 GLAAAATL-GPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQ
:::::::: :::::: ::::: :::::::.:::::::::: .:.:.::.. ::: ::::
XP_011 GLAAAATLAGPAVVPPQYYGV-PWGVYPANLFQQQAAAAA--NNTASQQAASQAQPGQQQ
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pF1KA0 VLRGGASQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQT
:::.::.::::::::.:::::.. :.::::.: .::::::::.::::: ::::.::::::
XP_011 VLRAGAGQRPLTPNQGQQGQQAESLAAAAAANPTLAFGQGLATGMPGYQVLAPTAYYDQT
390 400 410 420 430 440
570 580 590
pF1KA0 GALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSSAAQA------------------------GT
:::::. :::.::::::::.::.::.:::.:::: ::
XP_011 GALVVGPGARTGLGAPVRLMAPTPVLISSAAAQAAAAAAAGGTASSLTGSTNGLFRPIGT
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pF1KA0 QQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSSLFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATL
: :: : ::::..:: :.::::..::...::::::::.: .::..:::::::..::::..
XP_011 QPPQQQ-QQQPSTNLQSNSFYGSSSLTNSSQSSSLFSHGPGQPGSTSLGFGSGNSLGAAI
510 520 530 540 550 560
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pF1KA0 GSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLTPIGHSFYNGLSFSSSPGPVG
::::.:::..:..: ..:..::.::. :::::::.::::.:::. :::.:.:::::.:.:
XP_011 GSALSGFGSSVGSSASSSATRRESLSTSSDLYKRSSSSLAPIGQPFYNSLGFSSSPSPIG
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pF1KA0 MPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLF
:::::: :::: :::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::
XP_011 MPLPSQTPGHSLTPPPSLSSHGSSSSLHLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSTSSLF
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pF1KA0 SPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRF
: :: :: :::::. ::.::::::::::::::::.::::::.. :::.:::::::::::
XP_011 SSSSQLFPPSRLRYNRSDIMPSGRSRLLEDFRNNRFPNLQLRDLIGHIVEFSQDQHGSRF
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pF1KA0 IQLKLERATPAERQLVFNEILQAAYQLNVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHV
:: :::::::::::.:::::::::::: .:::::::::::::::::.:::::: ::::::
XP_011 IQQKLERATPAERQMVFNEILQAAYQLMTDVFGNYVIQKFFEFGSLDQKLALATRIRGHV
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pF1KA0 LSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVINEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQP
: :::::::::::::::: : ::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPLALQMYGCRVIQKALESISSDQQVISEMVKELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQP
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pF1KA0 QSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQLVQDQYGN
:::::::::::::::.:::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::::::
XP_011 QSLQFIIDAFKGQVFVLSTHPYGCRVIQRILEHCTAEQTLPILEELHQHTEQLVQDQYGN
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pF1KA0 YVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCT
:::::::::::::::::::.::::.::.::::::::::::::::::::.:::.::::::
XP_011 YVIQHVLEHGRPEDKSKIVSEIRGKVLALSQHKFASNVVEKCVTHASRAERALLIDEVCC
930 940 950 960 970 980
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pF1KA0 MNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAK
.::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.::::::::.::::::::::::::
XP_011 QNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDMAEPAQRKIIMHKIRPHITTLRKYTYGKHILAK
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pF1KA0 LEKYYMKNGVDLGPICGPPNGII
:::::.::. ::::: :::::..
XP_011 LEKYYLKNSPDLGPIGGPPNGML
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Smith-Waterman score: 5301; 76.8% identity (89.3% similar) in 1073 aa overlap (128-1162:1-1066)
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 SGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLPGKKFWETDE
.::::::::::.:.::: ::: ::::: :.
XP_011 MNHDFQALALESRGMGE-LLPTKKFWEPDD
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pF1KA0 SSKDGPKGIFLGD-QWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGG
:.::: ::::::: .::..:::.: ::.::::::::: ::.:: :::::..:::::::::
XP_011 STKDGQKGIFLGDDEWRETAWGASHHSMSQPIMVQRRSGQGFHGNSEVNAILSPRSESGG
30 40 50 60 70 80
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pF1KA0 LGVSMVEYVLSSSPGD---SCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGT-FDGDKLGDLKEE
::::::::::::::.: : .:::.:: :::..: .::..:.:.. :. :. :::.
XP_011 LGVSMVEYVLSSSPADKLDSRFRKGNFGTRDAETDGPEKGDQKGKASPFEEDQNRDLKQG
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pF1KA0 GDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFSRTPGNCQNSANEV-DLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]