FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0128, 427 aa 1>>>pF1KA0128 427 - 427 aa - 427 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6827+/-0.00129; mu= 3.1173+/- 0.077 mean_var=216.0877+/-43.774, 0's: 0 Z-trim(107.3): 47 B-trim: 264 in 2/52 Lambda= 0.087249 statistics sampled from 9471 (9514) to 9471 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16 Scan time: 2.450 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14585.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 427) 2775 362.4 4.9e-100 CCDS14583.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 429) 2775 362.4 4.9e-100 CCDS14584.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 434) 2775 362.4 4.9e-100 CCDS34018.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4 ( 429) 2332 306.6 3e-83 CCDS77931.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4 ( 439) 2322 305.4 7.3e-83 CCDS43360.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 429) 2170 286.2 4.1e-77 CCDS43358.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 483) 2170 286.3 4.5e-77 CCDS43359.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 442) 2163 285.3 7.8e-77 CCDS75298.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 440) 2136 281.9 8.2e-76 CCDS42726.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 431) 2087 275.8 5.8e-74 CCDS46383.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 454) 2066 273.1 3.8e-73 CCDS82496.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 450) 2059 272.3 6.9e-73 CCDS82497.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 544) 2059 272.3 7.9e-73 CCDS47262.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 369) 1909 253.3 2.9e-67 CCDS5519.2 SEPT14 gene_id:346288|Hs108|chr7 ( 432) 1741 232.2 7.5e-61 CCDS75582.1 SEPT7 gene_id:989|Hs108|chr7 ( 401) 953 133.0 5.1e-31 CCDS13764.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22 ( 369) 870 122.5 6.7e-28 CCDS45795.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 335) 865 121.9 9.6e-28 CCDS74166.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 362) 865 121.9 1e-27 CCDS45793.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 422) 865 121.9 1.1e-27 CCDS45794.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 474) 865 122.0 1.2e-27 CCDS77122.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 567) 865 122.1 1.4e-27 CCDS45791.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 568) 865 122.1 1.4e-27 CCDS45792.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 579) 865 122.1 1.5e-27 CCDS45790.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 586) 865 122.1 1.5e-27 CCDS2548.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 ( 361) 841 118.9 8.2e-27 CCDS74682.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 ( 396) 841 118.9 8.8e-27 CCDS11609.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 459) 841 119.0 9.9e-27 CCDS56041.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 470) 841 119.0 1e-26 CCDS11610.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 478) 841 119.0 1e-26 CCDS58582.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 493) 841 119.0 1e-26 CCDS14027.2 SEPT3 gene_id:55964|Hs108|chr22 ( 350) 835 118.1 1.4e-26 CCDS14026.2 SEPT3 gene_id:55964|Hs108|chr22 ( 358) 835 118.1 1.4e-26 CCDS10678.3 SEPT1 gene_id:1731|Hs108|chr16 ( 414) 814 115.5 9.6e-26 CCDS10522.1 SEPT12 gene_id:124404|Hs108|chr16 ( 358) 785 111.8 1.1e-24 CCDS58581.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 331) 758 108.4 1.1e-23 CCDS63195.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 ( 371) 683 99.0 8.2e-21 CCDS56224.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22 ( 346) 666 96.8 3.4e-20 >>CCDS14585.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX (427 aa) initn: 2775 init1: 2775 opt: 2775 Z-score: 1909.5 bits: 362.4 E(32554): 4.9e-100 Smith-Waterman score: 2775; 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83.5% identity (96.2% similar) in 418 aa overlap (10-427:19-435) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGET ..: :.. :.::::::::::::::::.:::::::::::::: CCDS77 MEERKPAHVLRSFKYAAFMNEELRNLSLSGHVGFDSLPDQLVNKSTSQGFCFNILCVGET 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 GLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLQSNTYDLQESNVRLKLTIVSTVGFGDQINK :.:::::::::::::::..::::..:::.:.. .:.:::::::::::::.:::::::::: CCDS77 GIGKSTLMDTLFNTKFESDPATHNEPGVRLKARSYELQESNVRLKLTIVDTVGFGDQINK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 EDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHVCLYFIAPTGHSLKSLDLVTMK .::::::::.:::::::::::::::.: : .:::.:::.::::::::::::::::::::: CCDS77 DDSYKPIVEYIDAQFEAYLQEELKIKRSLFNYHDTRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMK 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 KLDSKVNIIPIIAKADAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNA ::::::::::::::::.:.:.:: ::: :: ::::::::::::::::.:.:::::.::.. CCDS77 KLDSKVNIIPIIAKADTIAKNELHKFKSKIMSELVSNGVQIYQFPTDEETVAEINATMSV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 HLPFAVIGSTEELKIGNKMMRARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTH ::::::.:::::.:::::: .:::::::.:::::: :::::::::::::::::::::::: CCDS77 HLPFAVVGSTEEVKIGNKMAKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTH 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 TRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS77 TRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVMRVK 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 EKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLDDEVNAFKQRKTAAELLQSQGS :::::::::::::::::: ::. ::.::::.::::: :..::: :...:.::.:::::.. CCDS77 EKEAELKEAEKELHEKFDLLKRTHQEEKKKVEDKKKELEEEVNNFQKKKAAAQLLQSQAQ 370 380 390 400 410 420 420 pF1KA0 QAGGSQTLKRDKEKKN :.:..:: :.::.::: CCDS77 QSGAQQT-KKDKDKKNASFT 430 >>CCDS43360.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 (429 aa) initn: 2181 init1: 2157 opt: 2170 Z-score: 1497.9 bits: 286.2 E(32554): 4.1e-77 Smith-Waterman score: 2170; 76.2% identity (92.5% similar) in 429 aa overlap (1-427:1-429) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MAATDIAR--QVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTL :::::. : .. :.. :.:::::::::::::.:::.::: ::::::::::.::::: CCDS43 MAATDLERFSNAEPEPRSLSLGGHVGFDSLPDQLVSKSVTQGFSFNILCVGETGIGKSTL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 MDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLQSNTYDLQESNVRLKLTIVSTVGFGDQINKEDSYKPI :.::::: :: : :.: . :.:. .:::::::::.::::::..:::::::::..::.:: CCDS43 MNTLFNTTFETEEASHHEACVRLRPQTYDLQESNVQLKLTIVDAVGFGDQINKDESYRPI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 VEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHVCLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVN :..:::::: :::::::::: : :::.:::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS43 VDYIDAQFENYLQEELKIRRSLFDYHDTRIHVCLYFITPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVN 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 IIPIIAKADAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVI :::::::::.:::::: :::::: .:::::::::::::::::.:::::..:::::::::. 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CCDS43 IIPIIAKADTISKSELHKFKIKIMGELVSNGVQIYQFPTDDEAVAEINAVMNAHLPFAVV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 GSTEELKIGNKMMRARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELY :::::.:.:::..::::::::.:::::: ::::::::::::::::::::::::.:::::: CCDS43 GSTEEVKVGNKLVRARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHSRHYELY 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 RRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELK ::::::::::.:.: ::.::::::::::::.:::.:::.::::::::::..::: : ::: CCDS43 RRCKLEEMGFQDSDGDSQPFSLQETYEAKRKEFLSELQRKEEEMRQMFVNKVKETELELK 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 EAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLDDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQT : :.::::::..::..::.::.:.:.:.. :..:.:::..::.:.: ::::. .: ..: CCDS43 EKERELHEKFEHLKRVHQEEKRKVEEKRRELEEETNAFNRRKAAVEALQSQALHATSQQP 370 380 390 400 410 420 420 pF1KA0 LKRDKEKKN :..::.:: CCDS43 LRKDKDKKKASGWSSIYSVTIP 430 440 >>CCDS75298.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 (440 aa) initn: 2147 init1: 1656 opt: 2136 Z-score: 1474.6 bits: 281.9 E(32554): 8.2e-76 Smith-Waterman score: 2136; 75.7% identity (92.1% similar) in 428 aa overlap (1-426:1-426) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MAATDIAR--QVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTL :::::. : .. :.. :.:::::::::::::.:::.::: ::::::::::.::::: CCDS75 MAATDLERFSNAEPEPRSLSLGGHVGFDSLPDQLVSKSVTQGFSFNILCVGETGIGKSTL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 MDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLQSNTYDLQESNVRLKLTIVSTVGFGDQINKEDSYKPI :.::::: :: : :.: . :.:. .:::::::::.::::::..:::::::::.. .:: CCDS75 MNTLFNTTFETEEASHHEACVRLRPQTYDLQESNVQLKLTIVDAVGFGDQINKDE--RPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 VEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHVCLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVN :..:::::: :::::::::: : :::.:::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS75 VDYIDAQFENYLQEELKIRRSLFDYHDTRIHVCLYFITPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 IIPIIAKADAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVI :::::::::.:::::: :::::: .:::::::::::::::::.:::::..:::::::::. CCDS75 IIPIIAKADTISKSELHKFKIKIMGELVSNGVQIYQFPTDDEAVAEINAVMNAHLPFAVV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 GSTEELKIGNKMMRARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELY :::::.:.:::..::::::::.:::::: ::::::::::::::::::::::::.:::::: CCDS75 GSTEEVKVGNKLVRARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHSRHYELY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 RRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELK ::::::::::.:.: ::.::::::::::::.:::.:::.::::::::::..::: : ::: CCDS75 RRCKLEEMGFQDSDGDSQPFSLQETYEAKRKEFLSELQRKEEEMRQMFVNKVKETELELK 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 EAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLDDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQT : :.::::::..::..::.::.:.:.:.. :..:.:::..::.:.: ::::. .: ..: CCDS75 EKERELHEKFEHLKRVHQEEKRKVEEKRRELEEETNAFNRRKAAVEALQSQALHATSQQP 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 LKRDKEKKN :..::.:: CCDS75 LRKDKDKKKASGWSSIYSVTIP 420 430 440 >>CCDS42726.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 (431 aa) initn: 2023 init1: 2023 opt: 2087 Z-score: 1441.4 bits: 275.8 E(32554): 5.8e-74 Smith-Waterman score: 2087; 71.0% identity (93.0% similar) in 428 aa overlap (1-427:1-427) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MAATDIARQVG-EGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLM ::....::.. :. :.. ..:::::.::::::::.:..::::::::::::::.:::::. CCDS42 MASSEVARHLKRENIRSLTMSGHVGFESLPDQLVNRSIQQGFCFNILCVGETGIGKSTLI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 DTLFNTKFEGEPATHTQPGVQLQSNTYDLQESNVRLKLTIVSTVGFGDQINKEDSYKPIV ::::::.:: ..: :.:.:...::.::::::.::::::.:::::::::::.::.::: CCDS42 DTLFNTNFEDYESSHFCPNVKLKAQTYELQESNVQLKLTIVNTVGFGDQINKEESYQPIV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 EFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHVCLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNI ..:::::::::::::::.: : ::::::::::::::.:::::::.:::.:::.::::::: CCDS42 DYIDAQFEAYLQEELKIKRSLFTYHDSRIHVCLYFISPTGHSLKTLDLLTMKNLDSKVNI 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 IPIIAKADAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIG ::.:::::..::.:: :::::. :::::::::::::::::...:..:..::..:::::.: CCDS42 IPVIAKADTVSKTELQKFKIKLMSELVSNGVQIYQFPTDDDTIAKVNAAMNGQLPFAVVG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 STEELKIGNKMMRARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYR : .:.:.::::..:::::::.:::::: :::::::::::: .:::::::::::::::::: CCDS42 SMDEVKVGNKMVKARQYPWGVVQVENENHCDFVKLREMLICTNMEDLREQTHTRHYELYR 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 RCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKE ::::::::: :. :..:: :.::::::::.:: :: :.:::::.:::::::::::: ::: CCDS42 RCKLEEMGFTDVGPENKPVSVQETYEAKRHEFHGERQRKEEEMKQMFVQRVKEKEAILKE 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 AEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLDDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTL ::.::. ::..::.:::.:. :::.:.. :..:. ::...:...:...::. : ::. : CCDS42 AERELQAKFEHLKRLHQEERMKLEEKRRLLEEEIIAFSKKKATSEIFHSQSFLATGSN-L 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 KRDKEKKN ..::..:: CCDS42 RKDKDRKNSNFL 420 430 427 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 2 18:10:04 2016 done: Wed Nov 2 18:10:04 2016 Total Scan time: 2.450 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]