Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0136
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0136, 939 aa
1>>>pF1KA0136 939 - 939 aa - 939 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4072+/-0.00128; mu= 6.6654+/- 0.076
mean_var=169.9974+/-33.943, 0's: 0 Z-trim(105.1): 68 B-trim: 11 in 1/51
Lambda= 0.098368
statistics sampled from 8220 (8258) to 8220 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.254), width: 16
Scan time: 2.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42924.1 MORC3 gene_id:23515|Hs108|chr21 ( 939) 6201 893.5 0
CCDS48146.1 MORC4 gene_id:79710|Hs108|chrX ( 900) 1795 268.2 5.1e-71
CCDS14525.2 MORC4 gene_id:79710|Hs108|chrX ( 937) 1795 268.2 5.3e-71
CCDS2955.1 MORC1 gene_id:27136|Hs108|chr3 ( 984) 440 75.9 4.3e-13
CCDS77668.1 MORC2 gene_id:22880|Hs108|chr22 (1032) 422 73.4 2.6e-12
>>CCDS42924.1 MORC3 gene_id:23515|Hs108|chr21 (939 aa)
initn: 6201 init1: 6201 opt: 6201 Z-score: 4767.4 bits: 893.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6201; 100.0% identity (100.0% similar) in 939 aa overlap (1-939:1-939)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAAQPPRGIRLSALCPKFLHTNSTSHTWPFSAVAELIDNAYDPDVNAKQIWIDKTVINDH
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CCDS42 MAAQPPRGIRLSALCPKFLHTNSTSHTWPFSAVAELIDNAYDPDVNAKQIWIDKTVINDH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ICLTFTDNGNGMTSDKLHKMLSFGFSDKVTMNGHVPVGLYGNGFKSGSMRLGKDAIVFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ICLTFTDNGNGMTSDKLHKMLSFGFSDKVTMNGHVPVGLYGNGFKSGSMRLGKDAIVFTK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 NGESMSVGLLSQTYLEVIKAEHVVVPIVAFNKHRQMINLAESKASLAAILEHSLFSTEQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NGESMSVGLLSQTYLEVIKAEHVVVPIVAFNKHRQMINLAESKASLAAILEHSLFSTEQK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LLAELDAIIGKKGTRIIIWNLRSYKNATEFDFEKDKYDIRIPEDLDEITGKKGYKKQERM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLAELDAIIGKKGTRIIIWNLRSYKNATEFDFEKDKYDIRIPEDLDEITGKKGYKKQERM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 DQIAPESDYSLRAYCSILYLKPRMQIILRGQKVKTQLVSKSLAYIERDVYRPKFLSKTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DQIAPESDYSLRAYCSILYLKPRMQIILRGQKVKTQLVSKSLAYIERDVYRPKFLSKTVR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ITFGFNCRNKDHYGIMMYHRNRLIKAYEKVGCQLRANNMGVGVVGIIECNFLKPTHNKQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITFGFNCRNKDHYGIMMYHRNRLIKAYEKVGCQLRANNMGVGVVGIIECNFLKPTHNKQD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FDYTNEYRLTITALGEKLNDYWNEMKVKKNTEYPLNLPVEDIQKRPDQTWVQCDACLKWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FDYTNEYRLTITALGEKLNDYWNEMKVKKNTEYPLNLPVEDIQKRPDQTWVQCDACLKWR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KLPDGMDQLPEKWYCSNNPDPQFRNCEVPEEPEDEDLVHPTYEKTYKKTNKEKFRIRQPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KLPDGMDQLPEKWYCSNNPDPQFRNCEVPEEPEDEDLVHPTYEKTYKKTNKEKFRIRQPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 MIPRINAELLFRPTALSTPSFSSPKESVPRRHLSEGTNSYATRLLNNHQVPPQSEPESNS
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CCDS42 MIPRINAELLFRPTALSTPSFSSPKESVPRRHLSEGTNSYATRLLNNHQVPPQSEPESNS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 LKRRLSTRSSILNAKNRRLSSQFENSVYKGDDDDEDVIILEENSTPKPAVDHDIDMKSEQ
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CCDS42 LKRRLSTRSSILNAKNRRLSSQFENSVYKGDDDDEDVIILEENSTPKPAVDHDIDMKSEQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SHVEQGGVQVEFVGDSEPCGQTGSTSTSSSRCDQGNTAATQTEVPSLVVKKEETVEDEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SHVEQGGVQVEFVGDSEPCGQTGSTSTSSSRCDQGNTAATQTEVPSLVVKKEETVEDEID
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 VRNDAVILPSCVEAEAKIHETQETTDKSADDAGCQLQELRNQLLLVTEEKENYKRQCHMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VRNDAVILPSCVEAEAKIHETQETTDKSADDAGCQLQELRNQLLLVTEEKENYKRQCHMF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 TDQIKVLQQRILEMNDKYVKKETCHQSTETDAVFLLESINGKSESPDHMVSQYQQALEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TDQIKVLQQRILEMNDKYVKKETCHQSTETDAVFLLESINGKSESPDHMVSQYQQALEEI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 ERLKKQCSALQHVKAECSQCSNNESKSEMDEMAVQLDDVFRQLDKCSIERDQYKSEVELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ERLKKQCSALQHVKAECSQCSNNESKSEMDEMAVQLDDVFRQLDKCSIERDQYKSEVELL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 EMEKSQIRSQCEELKTEVEQLKSTNQQTATDVSTSSNIEESVNHMDGESLKLRSLRVNVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EMEKSQIRSQCEELKTEVEQLKSTNQQTATDVSTSSNIEESVNHMDGESLKLRSLRVNVG
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KA0 QLLAMIVPDLDLQQVNYDVDVVDEILGQVVEQMSEISST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QLLAMIVPDLDLQQVNYDVDVVDEILGQVVEQMSEISST
910 920 930
>>CCDS48146.1 MORC4 gene_id:79710|Hs108|chrX (900 aa)
initn: 1384 init1: 662 opt: 1795 Z-score: 1388.4 bits: 268.2 E(32554): 5.1e-71
Smith-Waterman score: 1815; 37.9% identity (64.7% similar) in 897 aa overlap (8-887:29-875)
10 20 30
pF1KA0 MAAQPPRGIRLSALCPKFLHTNSTSHTWPFSAVAELIDN
:::::.. :..:..::.::: ::::.:::.::
CCDS48 MLLYRGAPAGPGAPGCGLARPGGGPQAFGIRLSTMSPRYLQSNSSSHTRPFSAIAELLDN
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 AYDPDVNAKQIWIDKTVINDHICLTFTDNGNGMTSDKLHKMLSFGFSDKVTMNGHVPVGL
: ::::.:. ..:: .... ::::::.: ::: :::.::::::.::: ... :.:.
CCDS48 AVDPDVSARTVFIDVEEVKNKSCLTFTDDGCGMTPHKLHRMLSFGFTDKVIKKSQCPIGV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 YGNGFKSGSMRLGKDAIVFTKNGESMSVGLLSQTYLEVIKAEHVVVPIVAFNKH-RQMIN
.:::::::::::::::.:::::: ...:::::::::: ..:. :.:::: ::.. ..::
CCDS48 FGNGFKSGSMRLGKDALVFTKNGGTLTVGLLSQTYLECVQAQAVIVPIVPFNQQNKKMII
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 LAESKASLAAILEHSLFSTEQKLLAELDAIIGKKGTRIIIWNLRSYKNA-TEFDFEKDKY
.: :: :::..:.:. :. :::..::: ::::::..:::.: ::. .:.::. :.:
CCDS48 TEDSLPSLEAILNYSIFNRENDLLAQFDAIPGKKGTRVLIWNIRRNKNGKSELDFDTDQY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 DIRIPEDLDEITGKKGYKKQERMDQIAPESDYSLRAYCSILYLKPRMQIILRGQKVKTQL
:: . :.: : .: ::..:::::.:.:::.::::.:.:: .:: ::.
CCDS48 DILVS-DFDTEEKMTGGVTSE-----LPETEYSLRAFCGILYMKPRMKIFLRQKKVTTQM
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 VSKSLAYIERDVYRPKFLSKTVRITFGFNCRNKDHYGIMMYHRNRLIKAYEKVGCQLRAN
..:::: .: :.:.: : .: :::::::.:.:....:::::: :::::..::::::.. .
CCDS48 IAKSLANVEYDTYKPTFTNKQVRITFGFSCKNSNQFGIMMYHNNRLIKSFEKVGCQVKPT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 -NMGVGVVGIIECNFLKPTHNKQDFDYTNEYRLTITALGEKLNDYWNEMKVKKNTEYPLN
. ::::.:.::::::::..:::::.::.::::::.::..::: ::.: . : : .
CCDS48 RGEGVGVIGVIECNFLKPAYNKQDFEYTKEYRLTINALAQKLNAYWKEKTSQDNFE--TS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 LPVEDIQKRPDQTWVQCDACLKWRKLPDGMD--QLPEKWYCSNNPDPQFRNCEVPEEPE-
.. : : ::::::::: :::::::: .: .:: .:.: : :..: : :::: :
CCDS48 TVARPIPKVPDQTWVQCDECLKWRKLPGKIDPSMLPARWFCYYNSHPKYRRCSVPEEQEL
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 -DEDLVHPTYEKTYKKTNKEKFRIRQPEMIPRINAELLFRPTALSTPSFSSPKESVPRRH
:::: .:..:.. ... . .: : . ::.: . . ..
CCDS48 TDEDLC-------LSKAKKQEQTVEEKKKMPMENE---------NHQVFSNPPKILTVQE
480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LSEGTNSYATRLLNNHQVPPQSEPESNSLKRRLSTRSSILNAKNRRLSSQFENSVYKGDD
.. : :. . . :. :. : .. .: : . . :... ..::... . :..
CCDS48 MA-GLNNKTIGYEGIHS--PSVLPSGGEESRSPSLQLKPLDSSVLQFSSKYKWIL--GEE
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 DDEDVIILEENSTPKPAVDHDIDMKSEQSHVEQGGVQVEFVGDSEPCGQTGSTSTSSSRC
: :. : :..:. .: . .:: . : . : :... ..:: :
CCDS48 PVEKRRRLQ-NEMTTPSLDY--SMPAPYRRVE---APVAY-----PEGENSHDKSSSERS
580 590 600 610 620
640 650 660 670 680
pF1KA0 DQGNTAATQTEVPSLVVKKEET---VEDEIDVRNDAVILPSCVEAEAKIHETQETTDKSA
:. . . ...:. : :. . .:: .: . ..:.. :.
CCDS48 TPPYLFPEYPEASKNTGQNREVSILYPGAKDQRQGS-LLPEELEDQMPRLVAEESNRGST
630 640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 DDAGCQLQELRNQLLLVTEEKENYKRQCHMFTDQIKVLQQRILEMNDKYVKKETCHQSTE
. .:. . .... . :. . : .... : . . :.
CCDS48 T---INKEEVNKGPFVAVVGVAKGVRDSGAPIQLIPFNREELAERRKAVESWNPVPYSVA
680 690 700 710 720 730
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 TDAV---FLLESINGKSESPDHMVSQYQQALEEIERLKKQCSALQHVKAECSQCSNNESK
. :. . :. : :: : . . .. .:.:.::. :..: :: : .
CCDS48 SAAIPAAAIGEKARGYEESEGHNTPKLKNQ-RELEELKRTTEKLERVLAE-----RNLFQ
740 750 760 770 780 790
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 SEMDEMAVQLDDVFRQLDKCSIERDQYKS-EVELLEMEKSQI---RSQCEELKTEVEQLK
....:. . . .. : . : :.. :.: : :... ... . ::.:.:. :
CCDS48 QKVEELEQERNHWQSEFKKVQHELVIYSTQEAEGLYWSKKHMGYRQAEFQILKAELERTK
800 810 820 830 840 850
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 STNQQTATDVSTSSNIEESVNHMDGESLKLRSLRVNVGQLLAMIVPDLDLQQVNYDVDVV
.:. .. . . : ... .:
CCDS48 EEKQELKEKLKETETHLEMLQKAQGFGKAYAATYPRQLSPYFCPPSLGAS
860 870 880 890 900
>>CCDS14525.2 MORC4 gene_id:79710|Hs108|chrX (937 aa)
initn: 1482 init1: 662 opt: 1795 Z-score: 1388.2 bits: 268.2 E(32554): 5.3e-71
Smith-Waterman score: 1910; 38.0% identity (64.8% similar) in 948 aa overlap (8-931:29-931)
10 20 30
pF1KA0 MAAQPPRGIRLSALCPKFLHTNSTSHTWPFSAVAELIDN
:::::.. :..:..::.::: ::::.:::.::
CCDS14 MLLYRGAPAGPGAPGCGLARPGGGPQAFGIRLSTMSPRYLQSNSSSHTRPFSAIAELLDN
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 AYDPDVNAKQIWIDKTVINDHICLTFTDNGNGMTSDKLHKMLSFGFSDKVTMNGHVPVGL
: ::::.:. ..:: .... ::::::.: ::: :::.::::::.::: ... :.:.
CCDS14 AVDPDVSARTVFIDVEEVKNKSCLTFTDDGCGMTPHKLHRMLSFGFTDKVIKKSQCPIGV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 YGNGFKSGSMRLGKDAIVFTKNGESMSVGLLSQTYLEVIKAEHVVVPIVAFNKH-RQMIN
.:::::::::::::::.:::::: ...:::::::::: ..:. :.:::: ::.. ..::
CCDS14 FGNGFKSGSMRLGKDALVFTKNGGTLTVGLLSQTYLECVQAQAVIVPIVPFNQQNKKMII
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 LAESKASLAAILEHSLFSTEQKLLAELDAIIGKKGTRIIIWNLRSYKNA-TEFDFEKDKY
.: :: :::..:.:. :. :::..::: ::::::..:::.: ::. .:.::. :.:
CCDS14 TEDSLPSLEAILNYSIFNRENDLLAQFDAIPGKKGTRVLIWNIRRNKNGKSELDFDTDQY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 DIRIPEDLDEITGKKGYKKQERMDQIAPESDYSLRAYCSILYLKPRMQIILRGQKVKTQL
:: . :.: : .: ::..:::::.:.:::.::::.:.:: .:: ::.
CCDS14 DILVS-DFDTEEKMTGGVTSE-----LPETEYSLRAFCGILYMKPRMKIFLRQKKVTTQM
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 VSKSLAYIERDVYRPKFLSKTVRITFGFNCRNKDHYGIMMYHRNRLIKAYEKVGCQLRAN
..:::: .: :.:.: : .: :::::::.:.:....:::::: :::::..::::::.. .
CCDS14 IAKSLANVEYDTYKPTFTNKQVRITFGFSCKNSNQFGIMMYHNNRLIKSFEKVGCQVKPT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 -NMGVGVVGIIECNFLKPTHNKQDFDYTNEYRLTITALGEKLNDYWNEMKVKKNTEYPLN
. ::::.:.::::::::..:::::.::.::::::.::..::: ::.: . : : .
CCDS14 RGEGVGVIGVIECNFLKPAYNKQDFEYTKEYRLTINALAQKLNAYWKEKTSQDNFE--TS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 LPVEDIQKRPDQTWVQCDACLKWRKLPDGMD--QLPEKWYCSNNPDPQFRNCEVPEEPE-
.. : : ::::::::: :::::::: .: .:: .:.: : :..: : :::: :
CCDS14 TVARPIPKVPDQTWVQCDECLKWRKLPGKIDPSMLPARWFCYYNSHPKYRRCSVPEEQEL
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 -DEDLVHPTYEKTYKKTNKEKFRIRQPEMIPRINAELLFRPTALSTPSFSSPKESVPRRH
:::: .:..:.. ... . .: : . ::.: . . ..
CCDS14 TDEDLC-------LSKAKKQEQTVEEKKKMPMENE---------NHQVFSNPPKILTVQE
480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LSEGTNSYATRLLNNHQVPPQSEPESNSLKRRLSTRSSILNAKNRRLSSQFENSVYKGDD
.. : :. . . :. :. : .. .: : . . :... ..::... . :..
CCDS14 MA-GLNNKTIGYEGIHS--PSVLPSGGEESRSPSLQLKPLDSSVLQFSSKYKWIL--GEE
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 DDEDVIILEENSTPKPAVDHDIDMKSEQSHVEQGGVQVEFVGDSEPCGQTGSTSTSSSRC
: :. : :..:. .: . .:: . : . : :... ..:: :
CCDS14 PVEKRRRLQ-NEMTTPSLDY--SMPAPYRRVE---APVAY-----PEGENSHDKSSSERS
580 590 600 610 620
640 650 660 670 680
pF1KA0 DQGNTAATQTEVPSLVVKKEET---VEDEIDVRNDAVILPSCVEAEAKIHETQETTDKSA
:. . . ...:. : :. . .:: .: . ..:.. :.
CCDS14 TPPYLFPEYPEASKNTGQNREVSILYPGAKDQRQGS-LLPEELEDQMPRLVAEESNRGST
630 640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 DDAGCQLQELRNQLLLVTEEKENYKRQCHMFTDQIKVLQQRILEMNDKYVKKETCHQSTE
. .:. . .... . :. . : .... : . . :.
CCDS14 T---INKEEVNKGPFVAVVGVAKGVRDSGAPIQLIPFNREELAERRKAVESWNPVPYSVA
680 690 700 710 720 730
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 TDAV---FLLESINGKSESPDHMVSQYQQALEEIERLKKQCSALQHVKAECS--QCSNNE
. :. . :. : :: : . . .. .:.:.::. :..: :: . : . .:
CCDS14 SAAIPAAAIGEKARGYEESEGHNTPKLKNQ-RELEELKRTTEKLERVLAERNLFQQKVEE
740 750 760 770 780 790
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 SKSEMDEMAVQLDDVFRQLDKCSIERDQ--YKSEVEL--LEMEKSQIRSQCEELKTEVEQ
..: .. .. : ..: : .. . : :. .. . : . .... :. : : ..
CCDS14 LEQERNHWQSEFKKVQHELVIYSTQEAEGLYWSKKHMGYRQAEFQILKAELERTKEEKQE
800 810 820 830 840 850
870 880 890 900 910
pF1KA0 LKSTNQQTATDVSTSSNIEESVNHMDGESL-----KLRSLRVNVGQLLAMIVPDLDLQQV
:: ..: : . .. . : .:..: :: ::..:. ::. ..: :.:...
CCDS14 LKEKLKETETHLEMLQKAQVSYRTPEGDDLERALAKLTRLRIHVSYLLTSVLPHLELREI
860 870 880 890 900 910
920 930
pF1KA0 NYDVDVVDEILGQVVEQMSEISST
.:: . :: :: :.:
CCDS14 GYDSEQVDGILYTVLEANHILD
920 930
>>CCDS2955.1 MORC1 gene_id:27136|Hs108|chr3 (984 aa)
initn: 537 init1: 210 opt: 440 Z-score: 348.6 bits: 75.9 E(32554): 4.3e-13
Smith-Waterman score: 684; 25.7% identity (54.5% similar) in 767 aa overlap (18-670:17-772)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MAAQPPRGIRLSALCPKFLHTNSTSHTWPFSAVAELIDNAYDPDVNAKQIW-IDKTVIND
:.:.:::.:.. :.:.:::.::: : .. ... .:. ..
CCDS29 MDDRYPALQRAQLRLDFIHANSTTHSFLFGALAELLDNARDAGAERLDVFSVDNEKLQG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
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