Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0138
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0138, 953 aa
1>>>pF1KA0138 953 - 953 aa - 953 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5093+/-0.00112; mu= 1.0060+/- 0.068
mean_var=476.0908+/-96.643, 0's: 0 Z-trim(114.6): 104 B-trim: 132 in 2/50
Lambda= 0.058780
statistics sampled from 15035 (15130) to 15035 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.465), width: 16
Scan time: 4.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32879.1 SAFB2 gene_id:9667|Hs108|chr19 ( 953) 6418 559.8 9.1e-159
CCDS59339.1 SAFB gene_id:6294|Hs108|chr19 ( 917) 2879 259.7 2e-68
CCDS59340.1 SAFB gene_id:6294|Hs108|chr19 ( 916) 2861 258.1 5.6e-68
CCDS12142.1 SAFB gene_id:6294|Hs108|chr19 ( 915) 2855 257.6 8e-68
CCDS56077.1 SAFB gene_id:6294|Hs108|chr19 ( 848) 2200 202.0 4e-51
CCDS10168.2 SLTM gene_id:79811|Hs108|chr15 (1034) 893 91.3 1e-17
>>CCDS32879.1 SAFB2 gene_id:9667|Hs108|chr19 (953 aa)
initn: 6418 init1: 6418 opt: 6418 Z-score: 2963.9 bits: 559.8 E(32554): 9.1e-159
Smith-Waterman score: 6418; 100.0% identity (100.0% similar) in 953 aa overlap (1-953:1-953)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAETLPGSGDSGPGTASLGPGVAETGTRRLSELRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSVLMERL
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CCDS32 MAETLPGSGDSGPGTASLGPGVAETGTRRLSELRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSVLMERL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KKAVKEEGQDPDEIGIELEATSKKSAKRCVKGLKMEEEGTEDNGLEDDSRDGQEDMEASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KKAVKEEGQDPDEIGIELEATSKKSAKRCVKGLKMEEEGTEDNGLEDDSRDGQEDMEASL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ENLQNMGMMDMSVLDETEVANSSAPDFGEDGTDGLLDSFCDSKEYVAAQLRQLPAQPPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ENLQNMGMMDMSVLDETEVANSSAPDFGEDGTDGLLDSFCDSKEYVAAQLRQLPAQPPEH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 AVDGEGFKNTLETSSLNFKVTPDIEESLLEPENEKILDILGETCKSEPVKEESSELEQPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AVDGEGFKNTLETSSLNFKVTPDIEESLLEPENEKILDILGETCKSEPVKEESSELEQPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 AQDTSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEGDLDLASESTAHAQSSKADSLLAVVKREPAEQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AQDTSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEGDLDLASESTAHAQSSKADSLLAVVKREPAEQP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GDGERTDCEPVGLEPAVEQSSAASELAEASSEELAEAPTEAPSPEARDSKEDGRKFDFDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GDGERTDCEPVGLEPAVEQSSAASELAEASSEELAEAPTEAPSPEARDSKEDGRKFDFDA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 CNEVPPAPKESSTSEGADQKMSSFKEEKDIKPIIKDEKGRVGSGSGRNLWVSGLSSTTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CNEVPPAPKESSTSEGADQKMSSFKEEKDIKPIIKDEKGRVGSGSGRNLWVSGLSSTTRA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 TDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTSDEATKCISHLHRTELHGRMISV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTSDEATKCISHLHRTELHGRMISV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 EKAKNEPAGKKLSDRKECEVKKEKLSSVDRHHSVEIKIEKTVIKKEEKIEKKEEKKPEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EKAKNEPAGKKLSDRKECEVKKEKLSSVDRHHSVEIKIEKTVIKKEEKIEKKEEKKPEDI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KKEEKDQDELKPGPTNRSRVTKSGSRGMERTVVMDKSKGEPVISVKTTSRSKERSSKSQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KKEEKDQDELKPGPTNRSRVTKSGSRGMERTVVMDKSKGEPVISVKTTSRSKERSSKSQD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RKSESKEKRDILSFDKIKEQRERERQRQREREIRETERRREREQREREQRLEAFHERKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKSESKEKRDILSFDKIKEQRERERQRQREREIRETERRREREQREREQRLEAFHERKEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 ARLQRERLQLECQRQRLERERMERERLERERMRVERERRKEQERIHREREELRRQQEQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ARLQRERLQLECQRQRLERERMERERLERERMRVERERRKEQERIHREREELRRQQEQLR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 YEQERRPGRRPYDLDRRDDAYWPEGKRVAMEDRYRADFPRPDHRFHDFDHRDRGQYQDHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YEQERRPGRRPYDLDRRDDAYWPEGKRVAMEDRYRADFPRPDHRFHDFDHRDRGQYQDHA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 IDRREGSRPMMGDHRDGQHYGDDRHGHGGPPERHGRDSRDGWGGYGSDKRLSEGRGLPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IDRREGSRPMMGDHRDGQHYGDDRHGHGGPPERHGRDSRDGWGGYGSDKRLSEGRGLPPP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 PRGGRDWGEHNQRLEEHQARAWQGAMDAGAASREHARWQGGERGLSGPSGPGHMASRGGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PRGGRDWGEHNQRLEEHQARAWQGAMDAGAASREHARWQGGERGLSGPSGPGHMASRGGV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KA0 AGRGGFAQGGHSQGHVVPGGGLEGGGVASQDRGSRVPHPHPHPPPYPHFTRRY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AGRGGFAQGGHSQGHVVPGGGLEGGGVASQDRGSRVPHPHPHPPPYPHFTRRY
910 920 930 940 950
>>CCDS59339.1 SAFB gene_id:6294|Hs108|chr19 (917 aa)
initn: 3073 init1: 1582 opt: 2879 Z-score: 1342.1 bits: 259.7 E(32554): 2e-68
Smith-Waterman score: 4315; 70.5% identity (85.6% similar) in 958 aa overlap (1-953:1-917)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MAETLPGSGDSGP-GTASLGPGVAETGTRRLSELRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSVLMER
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CCDS59 MAETLSGLGDSGAAGAAALSSASSETGTRRLSDLRVIDLRAELRKRNVDSSGNKSVLMER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LKKAVKEEGQDPDEIGIELEATSKKSAKRCVKGLKMEEEGTEDNGLEDDSRDGQEDMEAS
::::...:: .:::: : :. .::..:: :: : ::::.::::::..: :::::.:.:
CCDS59 LKKAIEDEGGNPDEIEITSEG-NKKTSKRSSKGRKPEEEGVEDNGLEENSGDGQEDVETS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LENLQNMGMMDMSVLDETEVANSSAPDFGEDG-TDGLLDSFCDSKEYVAAQLRQLPAQPP
:::::.. .::.:::::.:. :.:. : :: .:.: .:. ::.: : .....:: :
CCDS59 LENLQDIDIMDISVLDEAEIDNGSVADCVEDDDADNLQESLSDSRELVEGEMKELPEQLQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EHAVDGEGFKNTLETSSLNFKVTPDIEESLLEPENEKILDILGETCKSEPVKEESSELEQ
:::.. . :.:.::: .: . .::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EHAIEDKETINNLDTSSSDFTILQEIEEPSLEPENEKILDILGETCKSEPVKEESSELEQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 PFAQDTSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEGDLDLASESTAHAQSSKADSLLAVVKREPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PFAQDTSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEGDLDLASESTAHAQSSKADSLLAVVKREPAE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 QPGDGERTDCEPVGLEPAVEQSSAASELAEASSEELAEAPTEAPSPEARDSKEDGRKFDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QPGDGERTDCEPVGLEPAVEQSSAASELAEASSEELAEAPTEAPSPEARDSKEDGRKFDF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 DACNEVPPAPKESSTSEGADQKMSSFKEEKDIKPIIKDEKGRVGSGSGRNLWVSGLSSTT
::::::::::::::::::::::::: ....: : . :.:::: :. :::.:::::::::
CCDS59 DACNEVPPAPKESSTSEGADQKMSSPEDDSDTKRLSKEEKGR--SSCGRNFWVSGLSSTT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 RATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTSDEATKCISHLHRTELHGRMI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::.:::.:::::.::
CCDS59 RATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTAEEATKCINHLHKTELHGKMI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 SVEKAKNEPAGKKLSDRKECEVKKEKLSSVDRHHSVEIKIEKTVIKKEEKIEKKEE-KKP
:::::::::.::: ::... . :::: :. :: .: .:...: ..:.. ::
CCDS59 SVEKAKNEPVGKKTSDKRDSDGKKEKSSNSDR---------STNLKRDDKCDRKDDAKKG
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 EDIKKEE-KDQDELKPGPTNRSRVTKSGSRGMERTVVMDKSKGEPVISVKTTSRSKERSS
.: . :. ::::. ::::..:::.::::::: ::::::::::: :::::::.. ::::.:
CCDS59 DDGSGEKSKDQDDQKPGPSERSRATKSGSRGTERTVVMDKSKGVPVISVKTSG-SKERAS
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 KSQDRKSESKEKRDILSFDKIKEQRERERQRQREREIRETERRREREQREREQRLEAFHE
::::::: :.:::...::::.:: : ..:. : . : ::. :::::..: :
CCDS59 KSQDRKSASREKRSVVSFDKVKEPR-----KSRDSE----SHSRVRERSEREQRMQAQWE
590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 RKEKARLQRERLQLECQRQRLERERMERERLERERMRVERERRKEQERIHREREELRRQQ
:.:. ::. : .: ::::::::::::::::::::.::.:::.::::::::::::::::
CCDS59 REERERLEIARERLAFQRQRLERERMERERLERERMHVEHERRREQERIHREREELRRQQ
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 EQLRYEQERRPG-RRPYDLDRRDDAYWPEGKRVAMEDRYRADFPRPDHRFHDFDHRDRGQ
: :::::::::. ::::::::::::::::.::.:...::..:: : : :::::::::::.
CCDS59 E-LRYEQERRPAVRRPYDLDRRDDAYWPEAKRAALDERYHSDFNRQD-RFHDFDHRDRGR
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 YQDHAIDRREGSRPMMGDHRDGQHYGDDRHGHGGPPERHGRDSRDGWGGYGSDKRLSEGR
: ::..::::::: :::. :.:::: . :::: :::::::::::::::::::.::::
CCDS59 YPDHSVDRREGSRSMMGE-REGQHYPER---HGGP-ERHGRDSRDGWGGYGSDKRMSEGR
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 GLPPPPRGGRDWGEHNQRLEEHQARAWQGAMDAGAASREHARWQGGERGLSGPSGPGHMA
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CCDS59 GLPPPPRGRRDWGDHGRREDD---RSWQGTADGGMMDRDHKRWQGGERSMSGHSGPGHMM
820 830 840 850 860
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 SRGGVAGRGGFAQGGHSQGHVVPGGGLEGGGVASQDRGSRVPHPHPHPPPYPHFTRRY
.:::..:::.:: :: :.:: .: ::..:: ..:.:::: : .:::::
CCDS59 NRGGMSGRGSFAPGGASRGHPIPHGGMQGG-FGGQSRGSR--------PSDARFTRRY
870 880 890 900 910
>>CCDS59340.1 SAFB gene_id:6294|Hs108|chr19 (916 aa)
initn: 3047 init1: 1582 opt: 2861 Z-score: 1333.9 bits: 258.1 E(32554): 5.6e-68
Smith-Waterman score: 4324; 70.5% identity (85.6% similar) in 958 aa overlap (1-953:1-916)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MAETLPGSGDSGP-GTASLGPGVAETGTRRLSELRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSVLMER
::::: : :::: :.:.:. . .::::::::.::::::::::.:::.:..:::::::::
CCDS59 MAETLSGLGDSGAAGAAALSSASSETGTRRLSDLRVIDLRAELRKRNVDSSGNKSVLMER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LKKAVKEEGQDPDEIGIELEATSKKSAKRCVKGLKMEEEGTEDNGLEDDSRDGQEDMEAS
::::...:: .:::: : :. .::..:: :: : ::::.::::::..: :::::.:.:
CCDS59 LKKAIEDEGGNPDEIEITSEG-NKKTSKRSSKGRKPEEEGVEDNGLEENSGDGQEDVETS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LENLQNMGMMDMSVLDETEVANSSAPDFGEDG-TDGLLDSFCDSKEYVAAQLRQLPAQPP
:::::.. .::.:::::.:. :.:. : :: .:.: .:. ::.: : .....:: :
CCDS59 LENLQDIDIMDISVLDEAEIDNGSVADCVEDDDADNLQESLSDSRELVEGEMKELPEQLQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EHAVDGEGFKNTLETSSLNFKVTPDIEESLLEPENEKILDILGETCKSEPVKEESSELEQ
:::.. . :.:.::: .: . .::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EHAIEDKETINNLDTSSSDFTILQEIEEPSLEPENEKILDILGETCKSEPVKEESSELEQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 PFAQDTSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEGDLDLASESTAHAQSSKADSLLAVVKREPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PFAQDTSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEGDLDLASESTAHAQSSKADSLLAVVKREPAE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 QPGDGERTDCEPVGLEPAVEQSSAASELAEASSEELAEAPTEAPSPEARDSKEDGRKFDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QPGDGERTDCEPVGLEPAVEQSSAASELAEASSEELAEAPTEAPSPEARDSKEDGRKFDF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 DACNEVPPAPKESSTSEGADQKMSSFKEEKDIKPIIKDEKGRVGSGSGRNLWVSGLSSTT
::::::::::::::::::::::::: ....: : . :.:::: :. :::.:::::::::
CCDS59 DACNEVPPAPKESSTSEGADQKMSSPEDDSDTKRLSKEEKGR--SSCGRNFWVSGLSSTT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 RATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTSDEATKCISHLHRTELHGRMI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::.:::.:::::.::
CCDS59 RATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTAEEATKCINHLHKTELHGKMI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 SVEKAKNEPAGKKLSDRKECEVKKEKLSSVDRHHSVEIKIEKTVIKKEEKIEKKEE-KKP
:::::::::.::: ::... . :::: :. :: .: .:...: ..:.. ::
CCDS59 SVEKAKNEPVGKKTSDKRDSDGKKEKSSNSDR---------STNLKRDDKCDRKDDAKKG
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 EDIKKEE-KDQDELKPGPTNRSRVTKSGSRGMERTVVMDKSKGEPVISVKTTSRSKERSS
.: . :. ::::. ::::..:::.::::::: ::::::::::: :::::::.. ::::.:
CCDS59 DDGSGEKSKDQDDQKPGPSERSRATKSGSRGTERTVVMDKSKGVPVISVKTSG-SKERAS
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 KSQDRKSESKEKRDILSFDKIKEQRERERQRQREREIRETERRREREQREREQRLEAFHE
::::::: :.:::...::::.:: :. :..: .: ::. :::::..: :
CCDS59 KSQDRKSASREKRSVVSFDKVKEPRKS----------RDSESHRVRERSEREQRMQAQWE
590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 RKEKARLQRERLQLECQRQRLERERMERERLERERMRVERERRKEQERIHREREELRRQQ
:.:. ::. : .: ::::::::::::::::::::.::.:::.::::::::::::::::
CCDS59 REERERLEIARERLAFQRQRLERERMERERLERERMHVEHERRREQERIHREREELRRQQ
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 EQLRYEQERRPG-RRPYDLDRRDDAYWPEGKRVAMEDRYRADFPRPDHRFHDFDHRDRGQ
: :::::::::. ::::::::::::::::.::.:...::..:: : : :::::::::::.
CCDS59 E-LRYEQERRPAVRRPYDLDRRDDAYWPEAKRAALDERYHSDFNRQD-RFHDFDHRDRGR
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 YQDHAIDRREGSRPMMGDHRDGQHYGDDRHGHGGPPERHGRDSRDGWGGYGSDKRLSEGR
: ::..::::::: :::. :.:::: . :::: :::::::::::::::::::.::::
CCDS59 YPDHSVDRREGSRSMMGE-REGQHYPER---HGGP-ERHGRDSRDGWGGYGSDKRMSEGR
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 GLPPPPRGGRDWGEHNQRLEEHQARAWQGAMDAGAASREHARWQGGERGLSGPSGPGHMA
:::::::: ::::.:..: .. :.:::. :.: .:.: :::::::..:: ::::::
CCDS59 GLPPPPRGRRDWGDHGRREDD---RSWQGTADGGMMDRDHKRWQGGERSMSGHSGPGHMM
820 830 840 850 860
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 SRGGVAGRGGFAQGGHSQGHVVPGGGLEGGGVASQDRGSRVPHPHPHPPPYPHFTRRY
.:::..:::.:: :: :.:: .: ::..:: ..:.:::: : .:::::
CCDS59 NRGGMSGRGSFAPGGASRGHPIPHGGMQGG-FGGQSRGSR--------PSDARFTRRY
870 880 890 900 910
>>CCDS12142.1 SAFB gene_id:6294|Hs108|chr19 (915 aa)
initn: 2683 init1: 1582 opt: 2855 Z-score: 1331.1 bits: 257.6 E(32554): 8e-68
Smith-Waterman score: 4296; 70.4% identity (85.5% similar) in 958 aa overlap (1-953:1-915)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MAETLPGSGDSGP-GTASLGPGVAETGTRRLSELRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSVLMER
::::: : :::: :.:.:. . .::::::::.::::::::::.:::.:..:::::::::
CCDS12 MAETLSGLGDSGAAGAAALSSASSETGTRRLSDLRVIDLRAELRKRNVDSSGNKSVLMER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LKKAVKEEGQDPDEIGIELEATSKKSAKRCVKGLKMEEEGTEDNGLEDDSRDGQEDMEAS
::::...:: .:::: : :. .::..:: :: : ::::.::::::..: :::::.:.:
CCDS12 LKKAIEDEGGNPDEIEITSEG-NKKTSKRSSKGRKPEEEGVEDNGLEENSGDGQEDVETS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LENLQNMGMMDMSVLDETEVANSSAPDFGEDG-TDGLLDSFCDSKEYVAAQLRQLPAQPP
:::::.. .::.:::::.:. :.:. : :: .:.: .:. ::.: : .....:: :
CCDS12 LENLQDIDIMDISVLDEAEIDNGSVADCVEDDDADNLQESLSDSRELVEGEMKELPEQLQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EHAVDGEGFKNTLETSSLNFKVTPDIEESLLEPENEKILDILGETCKSEPVKEESSELEQ
:::.. . :.:.::: .: . .::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EHAIEDKETINNLDTSSSDFTILQEIEEPSLEPENEKILDILGETCKSEPVKEESSELEQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 PFAQDTSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEGDLDLASESTAHAQSSKADSLLAVVKREPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PFAQDTSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEGDLDLASESTAHAQSSKADSLLAVVKREPAE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 QPGDGERTDCEPVGLEPAVEQSSAASELAEASSEELAEAPTEAPSPEARDSKEDGRKFDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QPGDGERTDCEPVGLEPAVEQSSAASELAEASSEELAEAPTEAPSPEARDSKEDGRKFDF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 DACNEVPPAPKESSTSEGADQKMSSFKEEKDIKPIIKDEKGRVGSGSGRNLWVSGLSSTT
::::::::::::::::::::::::: ....: : . :.:::: :. :::.:::::::::
CCDS12 DACNEVPPAPKESSTSEGADQKMSSPEDDSDTKRLSKEEKGR--SSCGRNFWVSGLSSTT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 RATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTSDEATKCISHLHRTELHGRMI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::.:::.:::::.::
CCDS12 RATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTAEEATKCINHLHKTELHGKMI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 SVEKAKNEPAGKKLSDRKECEVKKEKLSSVDRHHSVEIKIEKTVIKKEEKIEKKEE-KKP
:::::::::.::: ::... . :::: :. :: .: .:...: ..:.. ::
CCDS12 SVEKAKNEPVGKKTSDKRDSDGKKEKSSNSDR---------STNLKRDDKCDRKDDAKKG
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 EDIKKEE-KDQDELKPGPTNRSRVTKSGSRGMERTVVMDKSKGEPVISVKTTSRSKERSS
.: . :. ::::. ::::..:::.::::::: ::::::::::: :::::::.. ::::.:
CCDS12 DDGSGEKSKDQDDQKPGPSERSRATKSGSRGTERTVVMDKSKGVPVISVKTSG-SKERAS
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 KSQDRKSESKEKRDILSFDKIKEQRERERQRQREREIRETERRREREQREREQRLEAFHE
::::::: :.:::...::::.:: : ..:. : . : ::. :::::..: :
CCDS12 KSQDRKSASREKRSVVSFDKVKEPR-----KSRDSE----SHSRVRERSEREQRMQAQWE
590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 RKEKARLQRERLQLECQRQRLERERMERERLERERMRVERERRKEQERIHREREELRRQQ
:.:. ::. : .: ::::::::::::::::::::.::.:::.::::::::::::::::
CCDS12 REERERLEIARERLAFQRQRLERERMERERLERERMHVEHERRREQERIHREREELRRQQ
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 EQLRYEQERRPG-RRPYDLDRRDDAYWPEGKRVAMEDRYRADFPRPDHRFHDFDHRDRGQ
: :::::::::. ::::::::::::::::.::.:...::..:: : : :::::::::::.
CCDS12 E-LRYEQERRPAVRRPYDLDRRDDAYWPEAKRAALDERYHSDFNRQD-RFHDFDHRDRGR
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 YQDHAIDRREGSRPMMGDHRDGQHYGDDRHGHGGPPERHGRDSRDGWGGYGSDKRLSEGR
: ::..::::::: :::. :.:::: . :::: :::::::::::::::::::.::::
CCDS12 YPDHSVDRREGSRSMMGE-REGQHYPER---HGGP-ERHGRDSRDGWGGYGSDKRMSEGR
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 GLPPPPRGGRDWGEHNQRLEEHQARAWQGAMDAGAASREHARWQGGERGLSGPSGPGHMA
::::::: ::::.:..: .. :.:::. :.: .:.: :::::::..:: ::::::
CCDS12 GLPPPPR--RDWGDHGRREDD---RSWQGTADGGMMDRDHKRWQGGERSMSGHSGPGHMM
820 830 840 850 860
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 SRGGVAGRGGFAQGGHSQGHVVPGGGLEGGGVASQDRGSRVPHPHPHPPPYPHFTRRY
.:::..:::.:: :: :.:: .: ::..:: ..:.:::: : .:::::
CCDS12 NRGGMSGRGSFAPGGASRGHPIPHGGMQGG-FGGQSRGSR--------PSDARFTRRY
870 880 890 900 910
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10 20 30 40 50
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::::: : :::: :.:.:. . .::::::::.::::::::::.:::.:..:::::::::
CCDS56 MAETLSGLGDSGAAGAAALSSASSETGTRRLSDLRVIDLRAELRKRNVDSSGNKSVLMER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LKKAVKEEGQDPDEIGIELEATSKKSAKRCVKGLKMEEEGTEDNGLEDDSRDGQEDMEAS
::::...:: .:::: : :. .::..:: :: : ::::.::::::..: :::
CCDS56 LKKAIEDEGGNPDEIEITSEG-NKKTSKRSSKGRKPEEEGVEDNGLEENSGDGQ------
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LENLQNMGMMDMSVLDETEVANSSAPDFGEDGTDGLLDSFCDSKEYVAAQLRQLPAQPPE
.:. :: .
CCDS56 IED----------------------------------------KETI-------------
120
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 HAVDGEGFKNTLETSSLNFKVTPDIEESLLEPENEKILDILGETCKSEPVKEESSELEQP
:.:.::: .: . .::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ---------NNLDTSSSDFTILQEIEEPSLEPENEKILDILGETCKSEPVKEESSELEQP
130 140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FAQDTSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEGDLDLASESTAHAQSSKADSLLAVVKREPAEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FAQDTSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEGDLDLASESTAHAQSSKADSLLAVVKREPAEQ
180 190 200 210 220 230
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pF1KA0 PGDGERTDCEPVGLEPAVEQSSAASELAEASSEELAEAPTEAPSPEARDSKEDGRKFDFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PGDGERTDCEPVGLEPAVEQSSAASELAEASSEELAEAPTEAPSPEARDSKEDGRKFDFD
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 ACNEVPPAPKESSTSEGADQKMSSFKEEKDIKPIIKDEKGRVGSGSGRNLWVSGLSSTTR
:::::::::::::::::::::::: ....: : . :.:::: :. :::.::::::::::
CCDS56 ACNEVPPAPKESSTSEGADQKMSSPEDDSDTKRLSKEEKGR--SSCGRNFWVSGLSSTTR
300 310 320 330 340
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pF1KA0 ATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTSDEATKCISHLHRTELHGRMIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::.:::.:::::.:::
CCDS56 ATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGFVTMSTAEEATKCINHLHKTELHGKMIS
350 360 370 380 390 400
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pF1KA0 VEKAKNEPAGKKLSDRKECEVKKEKLSSVDRHHSVEIKIEKTVIKKEEKIEKKEE-KKPE
::::::::.::: ::... . :::: :. :: .: .:...: ..:.. :: .
CCDS56 VEKAKNEPVGKKTSDKRDSDGKKEKSSNSDR---------STNLKRDDKCDRKDDAKKGD
410 420 430 440 450 460
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 DIKKEE-KDQDELKPGPTNRSRVTKSGSRGMERTVVMDKSKGEPVISVKTTSRSKERSSK
: . :. ::::. ::::..:::.::::::: ::::::::::: :::::::.. ::::.::
CCDS56 DGSGEKSKDQDDQKPGPSERSRATKSGSRGTERTVVMDKSKGVPVISVKTSG-SKERASK
470 480 490 500 510
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pF1KA0 SQDRKSESKEKRDILSFDKIKEQRERERQRQREREIRETERRREREQREREQRLEAFHER
:::::: :.:::...::::.:: : ..:. : . : ::. :::::..: ::
CCDS56 SQDRKSASREKRSVVSFDKVKEPR-----KSRDSE----SHSRVRERSEREQRMQAQWER
520 530 540 550 560 570
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pF1KA0 KEKARLQRERLQLECQRQRLERERMERERLERERMRVERERRKEQERIHREREELRRQQE
.:. ::. : .: ::::::::::::::::::::.::.:::.:::::::::::::::::
CCDS56 EERERLEIARERLAFQRQRLERERMERERLERERMHVEHERRREQERIHREREELRRQQE
580 590 600 610 620 630
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pF1KA0 QLRYEQERRPG-RRPYDLDRRDDAYWPEGKRVAMEDRYRADFPRPDHRFHDFDHRDRGQY
:::::::::. ::::::::::::::::.::.:...::..:: : : :::::::::::.:
CCDS56 -LRYEQERRPAVRRPYDLDRRDDAYWPEAKRAALDERYHSDFNRQD-RFHDFDHRDRGRY
640 650 660 670 680
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 QDHAIDRREGSRPMMGDHRDGQHYGDDRHGHGGPPERHGRDSRDGWGGYGSDKRLSEGRG
::..::::::: :::. :.:::: . :::: :::::::::::::::::::.:::::
CCDS56 PDHSVDRREGSRSMMGE-REGQHYPER---HGGP-ERHGRDSRDGWGGYGSDKRMSEGRG
690 700 710 720 730 740
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pF1KA0 LPPPPRGGRDWGEHNQRLEEHQARAWQGAMDAGAASREHARWQGGERGLSGPSGPGHMAS
::::::: ::::.:..: .. :.:::. :.: .:.: :::::::..:: :::::: .
CCDS56 LPPPPRGRRDWGDHGRREDD---RSWQGTADGGMMDRDHKRWQGGERSMSGHSGPGHMMN
750 760 770 780 790 800
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pF1KA0 RGGVAGRGGFAQGGHSQGHVVPGGGLEGGGVASQDRGSRVPHPHPHPPPYPHFTRRY
:::..:::.:: :: :.:: .: ::..:: ..:.:::: : .:::::
CCDS56 RGGMSGRGSFAPGGASRGHPIPHGGMQGG-FGGQSRGSR--------PSDARFTRRY
810 820 830 840
>>CCDS10168.2 SLTM gene_id:79811|Hs108|chr15 (1034 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAETLPGSGDSGPGTASLGPGVAETGTRRLSELRVIDLRAELKKRNLDTGGNKSVLMERL
.: .:: . : :: .....::::::..:::.:::: : :.::. ::
CCDS10 MAAATGAVAASAASGQAEG--KKITDLRVIDLKSELKRRNLDITGVKTVLISRL
10 20 30 40 50
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pF1KA0 KKAVKEEGQDPDEIGIELEATSKKSAKRCVKGLKMEEEGTEDNGLEDDSRDGQEDMEASL
:.:..::: :::. ::: ... :. .:: ..:. : .: .::.
CCDS10 KQAIEEEGGDPDN--IELTVSTDTPNKKPTKGKGKKHEADELSG------------DASV
60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KA0 ENLQNMGMMDMSVLDETEVANSSAPDFGEDGTDGLLDS--FCDSKEYVAAQLRQLPAQPP
: : . . . :. :. : . .::.: : :: : ...: . . . : :.
CCDS10 E--------DDAFIKDCELENQEAHE--QDGNDELKDSEEFGENEEENVHSKELLSAEEN
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220
pF1KA0 EHA---VDGEGF----KNTLETSSLNFKVTPD----IEESLLEPENEKILDILGETCKSE
..: ...::. :. .:.. .. . : .. : :::: :: :
CCDS10 KRAHELIEAEGIEDIEKEDIESQEIEAQEGEDDTFLTAQDGEEEENEK--DIAGSG----
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 PVKEESSELEQPFAQDTSSVGPDRKLAEEEDLFDSAHPEEGD---LDLASESTAHAQSSK
. ..:. .:. .. : . :. :: . ... : : . . .:. : . .
CCDS10 ---DGTQEVSKPLPSEGSLAEADHTAHEEMEAHTTVKEAEDDNISVTIQAED-AITLDFD
210 220 230 240 250
290 300 310 320 330
pF1KA0 ADSLLAVVKR-----EPAEQPGDGERTDCEPVGLEPAVEQSSAASELAEASSEELAEAPT
.:.:: . : : .: ::. . .. : :. : :. .:. .. .
CCDS10 GDDLLETGKNVKITDSEASKPKDGQ----DAIAQSP--EKESKDYEM-NANHKDGKKEDC
260 270 280 290 300 310
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pF1KA0 EAPSPEARDSKEDGRKFDFDACNEVPPAPKESSTSEGAD-QKMSSFKEEKDIKPIIKDEK
.: ....:...: . . .. . :.. .: ::. : :: :: :: : ::.:
CCDS10 VKGDPVEKEARESSKKAE--SGDKEKDTLKKGPSSTGASGQAKSSSKESKDSKTSSKDDK
320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 GRVGSGSG------RNLWVSGLSSTTRATDLKNLFSKYGKVVGAKVVTNARSPGARCYGF
: ..: :: .:.:::::::.:.:.::::::.:::::..::::::::::::.:::.
CCDS10 GSTSSTSGSSGSSTKNIWVSGLSSNTKAADLKNLFGKYGKVLSAKVVTNARSPGAKCYGI
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VTMSTSDEATKCISHLHRTELHGRMISVEKAKNEPAGKKLSDRKECEVKKEKLSSVDRHH
::::.: :...::.:::::::::..:::::.:..:. :.. .:: . :. . :: :...
CCDS10 VTMSSSTEVSRCIAHLHRTELHGQLISVEKVKGDPSKKEM--KKENDEKSSSRSSGDKKN
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560
pF1KA0 SVEIKIEKT--VIKKEEK--IEKKEEKKPEDIKK-EEKDQ--DELKPGPTNRSRVTKS--
. . . :: .::::: ::.:.:. .: :: : ::. :. : :..: . ::
CCDS10 TSD-RSSKTQASVKKEEKRSSEKSEKKESKDTKKIEGKDEKNDNGASGQTSES-IKKSEE
490 500 510 520 530 540
570 580 590 600 610
pF1KA0 ----GSRGMERTVVMDKSKGEPVISV------KTTSRSKERSSKSQDRKSESKEKR-DIL
.:.. . :..:..::. : .::::. : :.: .. .: .::
CCDS10 KKRISSKSPGHMVILDQTKGDHCRPSRRGRYEKIHGRSKEKERASLDKKRDKDYRRKEIL
550 560 570 580 590 600
620 630 640 650 660
pF1KA0 SFDKIKEQRERER--QRQREREIRETERRRE---REQREREQRLEAFHERKEKARLQRER
:.:.:::: ::. . .: :. : .:::: ::.:::: :.. ..::.:. ::::::
CCDS10 PFEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERE-RIRIIREREERERLQRER
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LQLECQRQRLERERMERERLERERMRVERERRKEQERIHREREELRRQQEQLRYEQERRP
.:: .::.:::::::::::::::.:.:.::::: ::: ::::::::::.:::::::.:
CCDS10 ERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRN
670 680 690 700 710 720
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pF1KA0 G-RRPYDLD-RRDDAYWPEGKRVAMEDRYR----ADFPRPDHRFHDFDHRDRGQY-QDHA
. .:: :.: :::: :: :.:..... : .:. : ..::.:::::.::.. .. :
CCDS10 SLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDARFGHGSDYSRQQNRFNDFDHRERGRFPESSA
730 740 750 760 770 780
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pF1KA0 IDRREGSRPMMGDHRDGQHYGDDRHGHGGPPERHGRDSRDGWGGYGSDKRLSEGRGLPPP
.. : :: . :... .. : :. : . . ::.: :. :::
CCDS10 VQSSSFER------RD-RFVGQSEGKKARPTARREDPSFERYPKNFSDSR----RNEPPP
790 800 810 820 830
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pF1KA0 PRGG-RDWGEHNQRLEEHQARAWQGAMDAGAASREHARWQGGERGLSGPSGPGHMASRGG
::. :. ... : :. . :. . .: : : .:: : :.:.
CCDS10 PRNELRESDRREVRGERDERRTVIIHDRPDITHPRHPREAG-----PNPSRPTSWKSEGS
840 850 860 870 880
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pF1KA0 VAG-----------RGGFAQGGHSQGHVVPGGGLEGGGVASQ--DRGSRVPHP--HPHPP
.. :.: .::: . ::. ..: .:. ::: . . : :
CCDS10 MSTDKRETRVERPERSGREVSGHSVRGAPPGNRSSASGYGSREGDRGVITDRGGGSQHYP
890 900 910 920 930 940
950
pF1KA0 PYPHFTRRY
: ..:.
CCDS10 EERHVVERHGRDTSGPRKEWHGPPSQGPSYHDTRRMGDGRAGAGMITQHSSNASPINRIV
950 960 970 980 990 1000
953 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 00:30:16 2016 done: Fri Nov 4 00:30:17 2016
Total Scan time: 4.490 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]