Result of FASTA (ccds) for pF1KA0143
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0143, 821 aa
  1>>>pF1KA0143 821 - 821 aa - 821 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4242+/-0.00091; mu= 19.4429+/- 0.055
 mean_var=62.6674+/-12.367, 0's: 0 Z-trim(104.5): 21  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.162014
 statistics sampled from 7918 (7924) to 7918 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.243), width:  16
 Scan time:  2.370

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34942.2 EFR3A gene_id:23167|Hs108|chr8         ( 821) 5377 1266.0       0
CCDS83328.1 EFR3A gene_id:23167|Hs108|chr8         ( 785) 5108 1203.1       0
CCDS46231.1 EFR3B gene_id:22979|Hs108|chr2         ( 817) 3449 815.3       0
CCDS82425.1 EFR3B gene_id:22979|Hs108|chr2         ( 782) 3241 766.7       0


>>CCDS34942.2 EFR3A gene_id:23167|Hs108|chr8              (821 aa)
 initn: 5377 init1: 5377 opt: 5377  Z-score: 6782.8  bits: 1266.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5377; 100.0% identity (100.0% similar) in 821 aa overlap (1-821:1-821)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MPTRVCCCCSALRPRYKRLVDNIFPEDPKDGLVKTDMEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MPTRVCCCCSALRPRYKRLVDNIFPEDPKDGLVKTDMEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 RLSRDVVRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLHMVAKLLESGEPKLQVLGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RLSRDVVRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLHMVAKLLESGEPKLQVLGT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 NSFVKFANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCHSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NSFVKFANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCHSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 NDELRATIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPSSPSATDKEENPAVLAENCFRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NDELRATIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPSSPSATDKEENPAVLAENCFRE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 LLGRATFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVHCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLGRATFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVHCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 DARKKDAPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVEFEANDLQGGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DARKKDAPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVEFEANDLQGGS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 VGSVNLNTSSKDNDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTSTHTLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VGSVNLNTSSKDNDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTSTHTLD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 ISQLGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTIVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQLVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ISQLGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTIVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQLVL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 EVMHNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDTSFMKKNGQQLYRHIYLGCKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EVMHNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDTSFMKKNGQQLYRHIYLGCKE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 EDNVQKNYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLAIALQDSAIINEDNLPMFHRCGIMAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EDNVQKNYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLAIALQDSAIINEDNLPMFHRCGIMAL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 VAAYLNFVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKCMLPKSLEKHEKDLYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VAAYLNFVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKCMLPKSLEKHEKDLYF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 LTNKIAESLGGSGYSVERLSVPYVPQVTDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILSNNVPSDDVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LTNKIAESLGGSGYSVERLSVPYVPQVTDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILSNNVPSDDVV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 SNTEEITFEALKKAIDTSGMEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHDRLAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SNTEEITFEALKKAIDTSGMEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHDRLAQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820 
pF1KA0 ILELTIRPPPSPSGTLTITSGHAQYQSVPVYEMKFPDLCVY
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILELTIRPPPSPSGTLTITSGHAQYQSVPVYEMKFPDLCVY
              790       800       810       820 

>>CCDS83328.1 EFR3A gene_id:23167|Hs108|chr8              (785 aa)
 initn: 5108 init1: 5108 opt: 5108  Z-score: 6443.3  bits: 1203.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5108; 100.0% identity (100.0% similar) in 785 aa overlap (37-821:1-785)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KA0 CCCSALRPRYKRLVDNIFPEDPKDGLVKTDMEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAERLSRDV
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83                               MEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAERLSRDV
                                             10        20        30

         70        80        90       100       110       120      
pF1KA0 VRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLHMVAKLLESGEPKLQVLGTNSFVKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLHMVAKLLESGEPKLQVLGTNSFVKF
               40        50        60        70        80        90

        130       140       150       160       170       180      
pF1KA0 ANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCHSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTVNDELRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCHSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTVNDELRA
              100       110       120       130       140       150

        190       200       210       220       230       240      
pF1KA0 TIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPSSPSATDKEENPAVLAENCFRELLGRAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPSSPSATDKEENPAVLAENCFRELLGRAT
              160       170       180       190       200       210

        250       260       270       280       290       300      
pF1KA0 FGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVHCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHLDARKKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVHCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHLDARKKD
              220       230       240       250       260       270

        310       320       330       340       350       360      
pF1KA0 APRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVEFEANDLQGGSVGSVNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 APRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVEFEANDLQGGSVGSVNL
              280       290       300       310       320       330

        370       380       390       400       410       420      
pF1KA0 NTSSKDNDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTSTHTLDISQLGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NTSSKDNDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTSTHTLDISQLGD
              340       350       360       370       380       390

        430       440       450       460       470       480      
pF1KA0 LGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTIVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQLVLEVMHNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTIVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQLVLEVMHNL
              400       410       420       430       440       450

        490       500       510       520       530       540      
pF1KA0 MDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDTSFMKKNGQQLYRHIYLGCKEEDNVQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDTSFMKKNGQQLYRHIYLGCKEEDNVQK
              460       470       480       490       500       510

        550       560       570       580       590       600      
pF1KA0 NYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLAIALQDSAIINEDNLPMFHRCGIMALVAAYLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLAIALQDSAIINEDNLPMFHRCGIMALVAAYLN
              520       530       540       550       560       570

        610       620       630       640       650       660      
pF1KA0 FVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKCMLPKSLEKHEKDLYFLTNKIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKCMLPKSLEKHEKDLYFLTNKIA
              580       590       600       610       620       630

        670       680       690       700       710       720      
pF1KA0 ESLGGSGYSVERLSVPYVPQVTDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILSNNVPSDDVVSNTEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ESLGGSGYSVERLSVPYVPQVTDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILSNNVPSDDVVSNTEEI
              640       650       660       670       680       690

        730       740       750       760       770       780      
pF1KA0 TFEALKKAIDTSGMEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHDRLAQILELTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TFEALKKAIDTSGMEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHDRLAQILELTI
              700       710       720       730       740       750

        790       800       810       820 
pF1KA0 RPPPSPSGTLTITSGHAQYQSVPVYEMKFPDLCVY
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RPPPSPSGTLTITSGHAQYQSVPVYEMKFPDLCVY
              760       770       780     

>>CCDS46231.1 EFR3B gene_id:22979|Hs108|chr2              (817 aa)
 initn: 2474 init1: 1180 opt: 3449  Z-score: 4347.4  bits: 815.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3449; 63.6% identity (85.6% similar) in 821 aa overlap (5-821:4-817)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MPTRVCCCCSALRPRYKRLVDNIFPEDPKDGLVKTDMEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAE
           :: ::.::::::::::::::::::.::::::.::::::::.::::::::::.::.:
CCDS46  MYGVCGCCGALRPRYKRLVDNIFPEDPEDGLVKTNMEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSE
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 RLSRDVVRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLHMVAKLLESGEPKLQVLGT
       :: ::: ::: ::: :::::::::::::: :::. ::::::.:::::::: .:.::.:::
CCDS46 RLIRDVGRHRYGYVCIAMEALDQLLMACHCQSINLFVESFLKMVAKLLESEKPNLQILGT
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 NSFVKFANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCHSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTV
       :::::::::::::::::: ::::::::: :::: :.: ::.:.::..::.:.::::::::
CCDS46 NSFVKFANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTV
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220        230         
pF1KA0 NDELRATIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPSSPSATDKE-ENPAVLAENCFR
       ::::.:.::.::::::::::::::.:..::..::   ::  .: .:: :.:: ::: :.:
CCDS46 NDELQANIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESR--SPSPLQAPEKEKESPAELAERCLR
     180       190       200       210         220       230       

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 ELLGRATFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVHCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGH
       ::::::.:::..::..::. :::.:.::.:. ::..:::::::::: :.:: :::..:::
CCDS46 ELLGRAAFGNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLGH
       240       250       260       270       280       290       

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 LDARKKDAPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVEFEANDLQGG
       ::: ...:  :::::..:: ::..::: ::.::::::.:::::..::::...    : :.
CCDS46 LDANSRSAATVRAGIVEVLSEAAVIAATGSVGPTVLEMFNTLLRQLRLSIDYA---LTGS
       300       310       320       330       340       350       

     360       370        380       390       400       410        
pF1KA0 SVGSVNLNTSS-KDNDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTSTH-
         :.:.:.:.  :...:.. :.:.:.:.: :.:.:: :::::...:::.:::    : : 
CCDS46 YDGAVSLGTKIIKEHEERMFQEAVIKTVGSFASTLPTYQRSEVILFIMSKVP--RPSLHQ
          360       370       380       390       400         410  

       420       430       440       450       460       470       
pF1KA0 TLDISQLGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTIVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQ
       ..: .. :.  .:  :::::.:::.:..:.. .....:::..::: ::: .:::: :.: 
CCDS46 AVDTGRTGENRNRLTQIMLLKSLLQVSTGFQCNNMMSALPSNFLDRLLSTALMEDAEIRL
            420       430       440       450       460       470  

       480       490       500       510       520       530       
pF1KA0 LVLEVMHNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDTSFMKKNGQQLYRHIYLG
       .:::.. ...::: :: :.  :  . :.. ::.: .:  :::: ::::..:::::::::.
CCDS46 FVLEILISFIDRHGNRHKFSTISTLSDISVLKLKVDKCSRQDTVFMKKHSQQLYRHIYLS
            480       490       500       510       520       530  

       540       550       560       570       580       590       
pF1KA0 CKEEDNVQKNYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLAIALQDSAIINEDNLPMFHRCGI
       :::: ::::.:: ::  ::::.:::::::::.:::::..:.:: : .::.:::...::..
CCDS46 CKEETNVQKHYEALYGLLALISIELANEEVVVDLIRLVLAVQDVAQVNEENLPVYNRCAL
            540       550       560       570       580       590  

       600       610       620       630       640       650       
pF1KA0 MALVAAYLNFVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKCMLPKSLEKHEKD
       .:: :::::..::. .:::::::. .::: :  ::::.::: .: ..  : ..:.    .
CCDS46 YALGAAYLNLISQLTTVPAFCQHIHEVIETRKKEAPYMLPEDVFVERPRLSQNLDGVVIE
            600       610       620       630       640       650  

       660       670       680       690       700       710       
pF1KA0 LYFLTNKIAESLGGSGYSVERLSVPYVPQVTDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILSNNVPSD
       : :  .::.: ::::::. .:: .::.::.:::::::.:.:: .:.:.::.. : : :  
CCDS46 LLFRQSKISEVLGGSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEK
            660       670       680       690       700       710  

       720       730        740       750       760       770      
pF1KA0 DVVSNTEEITFEALKKAI-DTSGMEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHD
       .    .::::.:.::::: :. ..::::.:.:: :.:::::::::::::.: ..:.::..
CCDS46 EERVPAEEITYETLKKAIVDSVAVEEQERERRRQVVEKFQKAPFEEIAAHCGARASLLQS
            720       730       740       750       760       770  

        780       790       800       810       820 
pF1KA0 RLAQILELTIRPPPSPSGTLTITSGHAQYQSVPVYEMKFPDLCVY
       .: ::.:.:::::::::::.: . :. : .:.:::::::::::::
CCDS46 KLNQIFEITIRPPPSPSGTITAAYGQPQNHSIPVYEMKFPDLCVY
            780       790       800       810       

>>CCDS82425.1 EFR3B gene_id:22979|Hs108|chr2              (782 aa)
 initn: 2266 init1: 1154 opt: 3241  Z-score: 4084.9  bits: 766.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3241; 62.6% identity (85.2% similar) in 789 aa overlap (37-821:1-782)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KA0 CCCSALRPRYKRLVDNIFPEDPKDGLVKTDMEKLTFYAVSAPEKLDRIGSYLAERLSRDV
                                     ::::::::.::::::::::.::.::: :::
CCDS82                               MEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSERLIRDV
                                             10        20        30

         70        80        90       100       110       120      
pF1KA0 VRHRSGYVLIAMEALDQLLMACHSQSIKPFVESFLHMVAKLLESGEPKLQVLGTNSFVKF
        ::: ::: :::::::::::::: :::. ::::::.:::::::: .:.::.:::::::::
CCDS82 GRHRYGYVCIAMEALDQLLMACHCQSINLFVESFLKMVAKLLESEKPNLQILGTNSFVKF
               40        50        60        70        80        90

        130       140       150       160       170       180      
pF1KA0 ANIEEDTPSYHRRYDFFVSRFSAMCHSCHSDPEIRTEIRIAGIRGIQGVVRKTVNDELRA
       :::::::::::: ::::::::: :::: :.: ::.:.::..::.:.::::::::::::.:
CCDS82 ANIEEDTPSYHRSYDFFVSRFSEMCHSSHDDLEIKTKIRMSGIKGLQGVVRKTVNDELQA
              100       110       120       130       140       150

        190       200       210       220        230       240     
pF1KA0 TIWEPQHMDKIVPSLLFNMQKIEEVDSRIGPPSSPSATDKE-ENPAVLAENCFRELLGRA
       .::.::::::::::::::.:..::..::   ::  .: .:: :.:: ::: :.:::::::
CCDS82 NIWDPQHMDKIVPSLLFNLQHVEEAESR--SPSPLQAPEKEKESPAELAERCLRELLGRA
              160       170         180       190       200        

         250       260       270       280       290       300     
pF1KA0 TFGNMNNAVRPVFAHLDHHKLWDPNEFAVHCFKIIMYSIQAQYSHHVIQEILGHLDARKK
       .:::..::..::. :::.:.::.:. ::..:::::::::: :.:: :::..:::::: ..
CCDS82 AFGNIKNAIKPVLIHLDNHSLWEPKVFAIRCFKIIMYSIQPQHSHLVIQQLLGHLDANSR
      210       220       230       240       250       260        

         310       320       330       340       350       360     
pF1KA0 DAPRVRAGIIQVLLEAVAIAAKGSIGPTVLEVFNTLLKHLRLSVEFEANDLQGGSVGSVN
       .:  :::::..:: ::..::: ::.::::::.:::::..::::...    : :.  :.:.
CCDS82 SAATVRAGIVEVLSEAAVIAATGSVGPTVLEMFNTLLRQLRLSIDYA---LTGSYDGAVS
      270       280       290       300       310          320     

         370        380       390       400       410        420   
pF1KA0 LNTSS-KDNDEKIVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQRSEIMMFIMGKVPVFGTSTH-TLDISQ
       :.:.  :...:.. :.:.:.:.: :.:.:: :::::...:::.:::    : : ..: ..
CCDS82 LGTKIIKEHEERMFQEAVIKTVGSFASTLPTYQRSEVILFIMSKVP--RPSLHQAVDTGR
         330       340       350       360       370         380   

           430       440       450       460       470       480   
pF1KA0 LGDLGTRRIQIMLLRSLLMVTSGYKAKTIVTALPGSFLDPLLSPSLMEDYELRQLVLEVM
        :.  .:  :::::.:::.:..:.. .....:::..::: ::: .:::: :.: .:::..
CCDS82 TGENRNRLTQIMLLKSLLQVSTGFQCNNMMSALPSNFLDRLLSTALMEDAEIRLFVLEIL
           390       400       410       420       430       440   

           490       500       510       520       530       540   
pF1KA0 HNLMDRHDNRAKLRGIRIIPDVADLKIKREKICRQDTSFMKKNGQQLYRHIYLGCKEEDN
        ...::: :: :.  :  . :.. ::.: .:  :::: ::::..:::::::::.:::: :
CCDS82 ISFIDRHGNRHKFSTISTLSDISVLKLKVDKCSRQDTVFMKKHSQQLYRHIYLSCKEETN
           450       460       470       480       490       500   

           550       560       570       580       590       600   
pF1KA0 VQKNYELLYTSLALITIELANEEVVIDLIRLAIALQDSAIINEDNLPMFHRCGIMALVAA
       :::.:: ::  ::::.:::::::::.:::::..:.:: : .::.:::...::...:: ::
CCDS82 VQKHYEALYGLLALISIELANEEVVVDLIRLVLAVQDVAQVNEENLPVYNRCALYALGAA
           510       520       530       540       550       560   

           610       620       630       640       650       660   
pF1KA0 YLNFVSQMIAVPAFCQHVSKVIEIRTMEAPYFLPEHIFRDKCMLPKSLEKHEKDLYFLTN
       :::..::. .:::::::. .::: :  ::::.::: .: ..  : ..:.    .: :  .
CCDS82 YLNLISQLTTVPAFCQHIHEVIETRKKEAPYMLPEDVFVERPRLSQNLDGVVIELLFRQS
           570       580       590       600       610       620   

           670       680       690       700       710       720   
pF1KA0 KIAESLGGSGYSVERLSVPYVPQVTDEDRLSRRKSIVDTVSIQVDILSNNVPSDDVVSNT
       ::.: ::::::. .:: .::.::.:::::::.:.:: .:.:.::.. : : :  .    .
CCDS82 KISEVLGGSGYNSDRLCLPYIPQLTDEDRLSKRRSIGETISLQVEVESRNSPEKEERVPA
           630       640       650       660       670       680   

           730        740       750       760       770       780  
pF1KA0 EEITFEALKKAI-DTSGMEEQEKEKRRLVIEKFQKAPFEEIAAQCESKANLLHDRLAQIL
       ::::.:.::::: :. ..::::.:.:: :.:::::::::::::.: ..:.::...: ::.
CCDS82 EEITYETLKKAIVDSVAVEEQERERRRQVVEKFQKAPFEEIAAHCGARASLLQSKLNQIF
           690       700       710       720       730       740   

            790       800       810       820 
pF1KA0 ELTIRPPPSPSGTLTITSGHAQYQSVPVYEMKFPDLCVY
       :.:::::::::::.: . :. : .:.:::::::::::::
CCDS82 EITIRPPPSPSGTITAAYGQPQNHSIPVYEMKFPDLCVY
           750       760       770       780  




821 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Wed Nov  2 18:14:16 2016 done: Wed Nov  2 18:14:17 2016
 Total Scan time:  2.370 Total Display time:  0.070

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com