Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0144
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0144, 983 aa
1>>>pF1KA0144 983 - 983 aa - 983 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.2547+/-0.00115; mu= -14.5881+/- 0.070
mean_var=389.0467+/-79.996, 0's: 0 Z-trim(114.6): 37 B-trim: 251 in 1/50
Lambda= 0.065024
statistics sampled from 15106 (15131) to 15106 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.465), width: 16
Scan time: 3.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44229.1 UBAP2L gene_id:9898|Hs108|chr1 ( 983) 6468 621.4 2.8e-177
CCDS72925.1 UBAP2L gene_id:9898|Hs108|chr1 ( 976) 6389 614.0 4.7e-175
CCDS1063.1 UBAP2L gene_id:9898|Hs108|chr1 (1087) 6349 610.2 6.9e-174
CCDS81381.1 UBAP2L gene_id:9898|Hs108|chr1 (1079) 5364 517.8 4.5e-146
CCDS6547.1 UBAP2 gene_id:55833|Hs108|chr9 (1119) 2122 213.7 1.7e-54
CCDS75828.1 UBAP2 gene_id:55833|Hs108|chr9 ( 358) 925 101.2 4e-21
>>CCDS44229.1 UBAP2L gene_id:9898|Hs108|chr1 (983 aa)
initn: 6468 init1: 6468 opt: 6468 Z-score: 3296.3 bits: 621.4 E(32554): 2.8e-177
Smith-Waterman score: 6468; 100.0% identity (100.0% similar) in 983 aa overlap (1-983:1-983)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGATGSAVKSDSPSTSSIPPLNETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGATGSAVKSDSPSTSSIPPLNETV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SAASLLTTTNQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SAASLLTTTNQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTLLH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 TSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KA0 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
:::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
970 980
>>CCDS72925.1 UBAP2L gene_id:9898|Hs108|chr1 (976 aa)
initn: 5447 init1: 5447 opt: 6389 Z-score: 3256.3 bits: 614.0 E(32554): 4.7e-175
Smith-Waterman score: 6389; 99.2% identity (99.2% similar) in 983 aa overlap (1-983:1-976)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGR-------VRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGATGSAVKSDSPSTSSIPPLNETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGATGSAVKSDSPSTSSIPPLNETV
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SAASLLTTTNQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SAASLLTTTNQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTLLH
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 TSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSV
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
900 910 920 930 940 950
970 980
pF1KA0 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
:::::::::::::::::::::::
CCDS72 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
960 970
>>CCDS1063.1 UBAP2L gene_id:9898|Hs108|chr1 (1087 aa)
initn: 6349 init1: 6349 opt: 6349 Z-score: 3235.3 bits: 610.2 E(32554): 6.9e-174
Smith-Waterman score: 6349; 100.0% identity (100.0% similar) in 968 aa overlap (1-968:1-968)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGATGSAVKSDSPSTSSIPPLNETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGATGSAVKSDSPSTSSIPPLNETV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SAASLLTTTNQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SAASLLTTTNQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTLLH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 TSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KA0 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
::::::::
CCDS10 GSHGYNTGVSVTSSNTGVPDISGSVYSKTQQSFEKQGFHSGTPAASFNLPSALGSGGPIN
970 980 990 1000 1010 1020
>>CCDS81381.1 UBAP2L gene_id:9898|Hs108|chr1 (1079 aa)
initn: 5314 init1: 5314 opt: 5364 Z-score: 2735.9 bits: 517.8 E(32554): 4.5e-146
Smith-Waterman score: 6308; 98.8% identity (98.8% similar) in 979 aa overlap (1-968:1-979)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
70 80 90 100 110 120
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]