Result of FASTA (omim) for
pF1KA0144
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0144, 983 aa
1>>>pF1KA0144 983 - 983 aa - 983 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.6539+/-0.000459; mu= -28.2404+/- 0.029
mean_var=475.2025+/-98.929, 0's: 0 Z-trim(122.8): 51 B-trim: 587 in 1/58
Lambda= 0.058835
statistics sampled from 41536 (41600) to 41536 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.755), E-opt: 0.2 (0.488), width: 16
Scan time: 13.500
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005245731 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a ( 983) 6468 564.0 1.4e-159
NP_001120792 (OMIM: 616472) ubiquitin-associated p ( 983) 6468 564.0 1.4e-159
XP_016858479 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a ( 983) 6468 564.0 1.4e-159
XP_016858478 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a ( 983) 6468 564.0 1.4e-159
NP_001274744 (OMIM: 616472) ubiquitin-associated p ( 976) 6389 557.3 1.4e-157
XP_016858477 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1067) 6349 553.9 1.6e-156
XP_005245729 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1067) 6349 553.9 1.6e-156
XP_016858476 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1068) 6349 553.9 1.6e-156
XP_016858475 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1068) 6349 553.9 1.6e-156
XP_016858471 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1084) 6349 553.9 1.6e-156
XP_016858473 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1084) 6349 553.9 1.6e-156
XP_016858472 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1085) 6349 553.9 1.6e-156
XP_016858466 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1086) 6349 553.9 1.6e-156
XP_016858470 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1086) 6349 553.9 1.6e-156
XP_016858469 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1086) 6349 553.9 1.6e-156
NP_055662 (OMIM: 616472) ubiquitin-associated prot (1087) 6349 553.9 1.6e-156
XP_016858468 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1087) 6349 553.9 1.6e-156
XP_016858467 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1087) 6349 553.9 1.6e-156
XP_016858463 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1103) 6349 553.9 1.7e-156
XP_016858462 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1103) 6349 553.9 1.7e-156
XP_011508518 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1104) 6349 553.9 1.7e-156
XP_005245730 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a ( 994) 5483 480.4 2e-134
NP_001274745 (OMIM: 616472) ubiquitin-associated p (1078) 5364 470.3 2.4e-131
NP_001317659 (OMIM: 616472) ubiquitin-associated p (1079) 5364 470.3 2.4e-131
XP_016858474 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1079) 5364 470.3 2.4e-131
XP_005245726 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1095) 5364 470.3 2.4e-131
XP_005245725 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1096) 5364 470.3 2.4e-131
XP_016858464 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1097) 5364 470.3 2.4e-131
XP_005245724 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1098) 5364 470.3 2.4e-131
XP_016858465 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1098) 5364 470.3 2.4e-131
XP_016858461 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1114) 5364 470.3 2.5e-131
XP_011508517 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1114) 5364 470.3 2.5e-131
XP_005245715 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a (1115) 5364 470.3 2.5e-131
XP_016858480 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-a ( 856) 4574 403.2 3e-111
>>XP_005245731 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-assoc (983 aa)
initn: 6468 init1: 6468 opt: 6468 Z-score: 2986.2 bits: 564.0 E(85289): 1.4e-159
Smith-Waterman score: 6468; 100.0% identity (100.0% similar) in 983 aa overlap (1-983:1-983)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
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550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
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610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGATGSAVKSDSPSTSSIPPLNETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGATGSAVKSDSPSTSSIPPLNETV
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670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SAASLLTTTNQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SAASLLTTTNQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTLLH
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730 740 750 760 770 780
pF1KA0 TSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSV
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pF1KA0 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
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850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
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pF1KA0 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KA0 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
:::::::::::::::::::::::
XP_005 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
970 980
>>NP_001120792 (OMIM: 616472) ubiquitin-associated prote (983 aa)
initn: 6468 init1: 6468 opt: 6468 Z-score: 2986.2 bits: 564.0 E(85289): 1.4e-159
Smith-Waterman score: 6468; 100.0% identity (100.0% similar) in 983 aa overlap (1-983:1-983)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
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pF1KA0 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
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pF1KA0 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
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pF1KA0 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
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pF1KA0 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
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pF1KA0 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
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pF1KA0 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
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pF1KA0 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
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pF1KA0 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
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pF1KA0 RYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGATGSAVKSDSPSTSSIPPLNETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGATGSAVKSDSPSTSSIPPLNETV
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pF1KA0 SAASLLTTTNQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAASLLTTTNQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTLLH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSV
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pF1KA0 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
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pF1KA0 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
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910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KA0 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
:::::::::::::::::::::::
NP_001 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
970 980
>>XP_016858479 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-assoc (983 aa)
initn: 6468 init1: 6468 opt: 6468 Z-score: 2986.2 bits: 564.0 E(85289): 1.4e-159
Smith-Waterman score: 6468; 100.0% identity (100.0% similar) in 983 aa overlap (1-983:1-983)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KENRDRDRDYSRRRGGPPRRGRGASRGREFRGQENGLDGTKSGGPSGRGTERGRRGRGRG
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pF1KA0 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
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250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
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XP_016 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
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NP_001 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
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XP_016 TGKNQDECVIALHDCNGDVNRAINVLLEGNPDTHSWEMVGKKKGVSGQKDGGQTESNEEG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
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pF1KA0 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEEWGTEDWNEDLSETKIFTASNVSSVPLPAENVTITAGQRIDLAVLLGKTPSTMENDSS
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pF1KA0 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
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XP_016 NLDPSQAPSLAQPLVFSNSKQTAISQPASGNTFSHHSMVSMLGKGFGDVGEAKGGSTTGS
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
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XP_016 QFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSPSLVQYDLKNPSDSAVHSPFTK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RQAFTPSSTMMEVFLQEKSPAVATSTAAPPPPSSPLPSKSTSAPQMSPGSSDNQSSSPQP
430 440 450 460 470 480
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pF1KA0 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
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XP_016 AQQKLKQQKKKASLTSKIPALAVEMPGSADISGLNLQFGALQFGSEPVLSDYESTPTTSA
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pF1KA0 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSSQAPSSLYTSTASESSSTISSNQSQESGYQSGPIQSTTYTSQNNAQGPLYEQRSTQTR
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XP_016 RYPSSISSSPQKDLTQAKNGFSSVQATQLQTTQSVEGATGSAVKSDSPSTSSIPPLNETV
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XP_016 SAASLLTTTNQHSSSLGGLSHSEEIPNTTTTQHSSTLSTQQNTLSSSTSSGRTSTSTLLH
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XP_016 TSVESEANLHSSSSTFSTTSSTVSAPPPVVSVSSSLNSGSSLGLSLGSNSTVTASTRSSV
730 740 750 760 770 780
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XP_016 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
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XP_016 ATTSGKAPPNLPPGVPPLLPNPYIMAPGLLHAYPPQVYGYDDLQMLQTRFPLDYYSIPFP
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pF1KA0 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TPTTPLTGRDGSLASNPYSGDLTKFGRGDASSPAPATTLAQPQQNQTQTHHTTQQTFLNP
850 860 870 880 890 900
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pF1KA0 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALPPGYSYTSLPYYTGVPGLPSTFQYGPAVFPVAPTSSKQHGVNVSVNASATPFQQPSGY
910 920 930 940 950 960
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pF1KA0 GSHGYNTGRKYPPPYKHFWTAES
::::::::
XP_016 GSHGYNTGVSVTSSNTGVPDISGSVYSKTQQSFEKQGFHSGTPAASFNLPSALGSGGPIN
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>>XP_016858471 (OMIM: 616472) PREDICTED: ubiquitin-assoc (1084 aa)
initn: 6349 init1: 6349 opt: 6349 Z-score: 2930.9 bits: 553.9 E(85289): 1.6e-156
Smith-Waterman score: 6349; 100.0% identity (100.0% similar) in 968 aa overlap (1-968:1-968)
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XP_016 MMTSVGTNRARGNWEQPQNQNQTQHKQRPQATAEQIRLAQMISDHNDADFEEKVKQLIDI
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pF1KA0 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGGSGRRGGRFSAQGMGTFNPADYAEPANTDDNYGNSSGNTWNNTGHFEPDDGTSAWRTA
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