Result of FASTA (omim) for pF1KA0178
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0178, 1233 aa
  1>>>pF1KA0178 1233 - 1233 aa - 1233 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 19.1071+/-0.00075; mu= -45.4949+/- 0.046
 mean_var=814.9804+/-167.598, 0's: 0 Z-trim(114.7): 261  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.044926
 statistics sampled from 24516 (24730) to 24516 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.29), width:  16
 Scan time: 12.520

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_006297 (OMIM: 300040,300590) structural mainten (1233) 7874 527.6 1.9e-148
NP_001268392 (OMIM: 300040,300590) structural main (1211) 7635 512.1 8.6e-144
NP_683515 (OMIM: 608685) structural maintenance of (1235) 4454 306.0   1e-81
XP_011528446 (OMIM: 608685) PREDICTED: structural  (1194) 4245 292.4 1.2e-77
XP_011528447 (OMIM: 608685) PREDICTED: structural  (1101) 3741 259.7 7.5e-68
NP_001278430 (OMIM: 608685) structural maintenance (1161) 3741 259.7 7.8e-68
XP_011516455 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1099)  610 56.8 9.2e-07
XP_011516454 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1115)  610 56.8 9.3e-07
XP_011510614 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural  (1216)  603 56.4 1.4e-06
NP_001275682 (OMIM: 605575) structural maintenance (1263)  603 56.4 1.4e-06
NP_001002800 (OMIM: 605575) structural maintenance (1288)  603 56.4 1.4e-06
NP_005487 (OMIM: 605575) structural maintenance of (1288)  603 56.4 1.4e-06
XP_011510613 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural  (1288)  603 56.4 1.4e-06
XP_006713522 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural  (1210)  596 55.9 1.9e-06
XP_016860980 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural  ( 952)  585 55.2 2.5e-06
NP_005436 (OMIM: 606062,610759) structural mainten (1217)  421 44.6  0.0049
NP_005723 (OMIM: 604040,613078) DNA repair protein (1312)  422 44.7   0.005
XP_011516453 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  416 44.2  0.0058
XP_016869700 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  416 44.2  0.0058
XP_016869701 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  416 44.2  0.0058
XP_011516452 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  416 44.2  0.0058
XP_016869699 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  416 44.2  0.0058
XP_016869698 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1147)  416 44.2  0.0058
XP_016869697 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  416 44.2   0.006
NP_001252531 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197)  416 44.2   0.006
XP_011516451 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  416 44.2   0.006
XP_011516450 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  416 44.2   0.006
XP_016869695 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  416 44.2   0.006
XP_016869696 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  416 44.2   0.006
NP_001036016 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197)  416 44.2   0.006
XP_006716996 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural  (1197)  416 44.2   0.006
NP_001036015 (OMIM: 605576) structural maintenance (1197)  416 44.2   0.006
NP_006435 (OMIM: 605576) structural maintenance of (1197)  416 44.2   0.006


>>NP_006297 (OMIM: 300040,300590) structural maintenance  (1233 aa)
 initn: 7874 init1: 7874 opt: 7874  Z-score: 2786.1  bits: 527.6 E(85289): 1.9e-148
Smith-Waterman score: 7874; 100.0% identity (100.0% similar) in 1233 aa overlap (1-1233:1-1233)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 DTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 ELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 AKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 QGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 IKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 MEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 NMDAIIVDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NMDAIIVDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 EPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 AKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 QTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEF
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 CREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQ
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 TVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 ANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 DSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRI
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 AAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATN
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 IDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALAL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 LFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230   
pF1KA0 IGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ
             1210      1220      1230   

>>NP_001268392 (OMIM: 300040,300590) structural maintena  (1211 aa)
 initn: 7635 init1: 7635 opt: 7635  Z-score: 2702.5  bits: 512.1 E(85289): 8.6e-144
Smith-Waterman score: 7635; 100.0% identity (100.0% similar) in 1197 aa overlap (37-1233:15-1211)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KA0 IEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLIH
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                 MLEVSIPTPHRYVRGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLIH
                               10        20        30        40    

         70        80        90       100       110       120      
pF1KA0 GAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGI
           50        60        70        80        90       100    

        130       140       150       160       170       180      
pF1KA0 LIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEEDTQFNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEEDTQFNY
          110       120       130       140       150       160    

        190       200       210       220       230       240      
pF1KA0 HRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNKELASKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNKELASKN
          170       180       190       200       210       220    

        250       260       270       280       290       300      
pF1KA0 KEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTS
          230       240       250       260       270       280    

        310       320       330       340       350       360      
pF1KA0 HKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQSQGRDLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQSQGRDLT
          290       300       310       320       330       340    

        370       380       390       400       410       420      
pF1KA0 LEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAKIKQKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAKIKQKLR
          350       360       370       380       390       400    

        430       440       450       460       470       480      
pF1KA0 EIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGD
          410       420       430       440       450       460    

        490       500       510       520       530       540      
pF1KA0 ARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAII
          470       480       490       500       510       520    

        550       560       570       580       590       600      
pF1KA0 VDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRYEPPHIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRYEPPHIK
          530       540       550       560       570       580    

        610       620       630       640       650       660      
pF1KA0 KALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLKAKARRW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLKAKARRW
          590       600       610       620       630       640    

        670       680       690       700       710       720      
pF1KA0 DEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLEQTKTRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLEQTKTRH
          650       660       670       680       690       700    

        730       740       750       760       770       780      
pF1KA0 LALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEFCREIGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEFCREIGV
          710       720       730       740       750       760    

        790       800       810       820       830       840      
pF1KA0 RNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQTVKKDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQTVKKDE
          770       780       790       800       810       820    

        850       860       870       880       890       900      
pF1KA0 NEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGGANKEMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGGANKEMT
          830       840       850       860       870       880    

        910       920       930       940       950       960      
pF1KA0 HLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGEDSVSGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGEDSVSGS
          890       900       910       920       930       940    

        970       980       990      1000      1010      1020      
pF1KA0 QRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRIAAPNMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRIAAPNMK
          950       960       970       980       990      1000    

       1030      1040      1050      1060      1070      1080      
pF1KA0 AMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATNIDEIYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATNIDEIYK
         1010      1020      1030      1040      1050      1060    

       1090      1100      1110      1120      1130      1140      
pF1KA0 ALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHS
         1070      1080      1090      1100      1110      1120    

       1150      1160      1170      1180      1190      1200      
pF1KA0 YKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPE
         1130      1140      1150      1160      1170      1180    

       1210      1220      1230   
pF1KA0 QGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ
       :::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ
         1190      1200      1210 

>>NP_683515 (OMIM: 608685) structural maintenance of chr  (1235 aa)
 initn: 4457 init1: 3317 opt: 4454  Z-score: 1588.1  bits: 306.0 E(85289): 1e-81
Smith-Waterman score: 4454; 53.7% identity (84.1% similar) in 1225 aa overlap (1-1225:1-1221)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKT
       :. :.:. .:::::..:::.::::.::: :::::::::::.:::.:::.::: .:::::.
NP_683 MAHLELLLVENFKSWRGRQVIGPFRRFTCIIGPNGSGKSNVMDALSFVMGEKIANLRVKN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEE
       ...::::: .::: .. : :...: ::..:..::::.: :: ::...:...:.   :  :
NP_683 IQELIHGAHIGKPISSSASVKIIYVEESGEEKTFARIIRGGCSEFRFNDNLVSRSVYIAE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEE
       :::.::..::.: :::::.::::..:.::::: .::::: ::::  ::...:... ::::
NP_683 LEKIGIIVKAQNCLVFQGTVESISVKKPKERTQFFEEISTSGELIGEYEEKKRKLQKAEE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 DTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNK
       :.:::...::::::::..:: :::::.::: : .:.   ..:::::.::::: .:. :: 
NP_683 DAQFNFNKKKNIAAERRQAKLEKEEAERYQSLLEELKMNKIQLQLFQLYHNEKKIHLLNT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 ELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIK
       .:   :...   .. ... :. .: .::: : . :. :: :::.:  .. ::::::::::
NP_683 KLEHVNRDLSVKRESLSHHENIVKARKKEHGMLTRQLQQTEKELKSVETLLNQKRPQYIK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 AKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQS
       :::::::..:::..::::.....:. .:.. :.  :: :. ... : . ::...:::   
NP_683 AKENTSHHLKKLDVAKKSIKDSEKQCSKQEDDIKALETELADLDAAWRSFEKQIEEEILH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 QGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAK
       . ::. :: .:. .:..:::.. :..::..:.:::.. .::.:..:: .:.:.. :....
NP_683 KKRDIELEASQLDRYKELKEQVRKKVATMTQQLEKLQWEQKTDEERLAFEKRRHGEVQGN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 IKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQV
       .::  ..::...:::::::::  :  . :.:.:. :  :..:.: .: :..:.:.::: .
NP_683 LKQIKEQIEDHKKRIEKLEEYTKTCMDCLKEKKQQEETLVDEIEKTKSRMSEVNEELNLI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 MEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGK
         .: .: :: .:..:::..::..: .::::: ::.:::.:::.: .::::.:::::.:.
NP_683 RSELQNAGIDTHEGKRQQKRAEVLEHLKRLYPDSVFGRLFDLCHPIHKKYQLAVTKVFGR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 NMDAIIVDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRY
        . ::.: :::...:::...::.:.:::::: ::::..:: .:.:::::: :.:::::. 
NP_683 FITAIVVASEKVAKDCIRFLKEERAEPETFLALDYLDIKPINERLRELKGCKMVIDVIKT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 EPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLK
       . :..::..:..:::.:::...:.::.::..: .:.:::::::::: ::::::::.::::
NP_683 QFPQLKKVIQFVCGNGLVCETMEEARHIALSGPERQKTVALDGTLFLKSGVISGGSSDLK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 AKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLE
        ::: :::: . .:.... .  .:::  ::. :::..:.:.:.  .: : ::::::..::
NP_683 YKARCWDEKELKNLRDRRSQKIQELKGLMKTLRKETDLKQIQTLIQGTQTRLKYSQNELE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 QTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEF
       . : .::.   ::.:.:.::: :.  .   ... :. :.:..:...::...:::..:..:
NP_683 MIKKKHLVAFYQEQSQLQSELLNIESQCIMLSEGIKERQRRIKEFQEKIDKVEDDIFQHF
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 CREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQ
       :.::::.::::::...::::.:: .::::::.:::::..::.. ...::.  .:..  ..
NP_683 CEEIGVENIREFENKHVKRQQEIDQKRLEFEKQKTRLNVQLEYSRSHLKKKLNKINTLKE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 TVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGG
       :..:  ..:..::: :.  .. ..: ::. :.::. .....: ..  . ..:: :::. .
NP_683 TIQKGSEDIDHLKKAEENCLQTVNELMAKQQQLKDIRVTQNSSAEKVQTQIEEERKKFLA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 ANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGE
       ...:. .:::::..:.:.::::: ..::::  ::.:::.. : .:..::: . : ....:
NP_683 VDREVGKLQKEVVSIQTSLEQKRLEKHNLLLDCKVQDIEIILLSGSLDDIIEVEMGTEAE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 DSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRI
       .    .:   .:: .:  .::::..: ::::  :...::. ..  : :..  :...: . 
NP_683 S----TQATIDIYEKEEAFEIDYSSLKEDLKALQSDQEIEAHLRLLLQQVASQEDILLKT
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pF1KA0 AAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATN
       ::::..:.:.:..:::::::..: :::.::.:.  .: :::.::.:.: :. ::: :. .
NP_683 AAPNLRALENLKTVRDKFQESTDAFEASRKEARLCRQEFEQVKKRRYDLFTQCFEHVSIS
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pF1KA0 IDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALAL
       ::.::: : ::.::::::.:::::::::.::.:::::::::: :::::::::: ::::::
NP_683 IDQIYKKLCRNNSAQAFLSPENPEEPYLEGISYNCVAPGKRFMPMDNLSGGEKCVAALAL
       1080      1090      1100      1110      1120      1130      

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pF1KA0 LFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESL
       :::.::..:::::::::.::::::::::::..:::::.  .:: ::::::::::..:..:
NP_683 LFAVHSFRPAPFFVLDEVDAALDNTNIGKVSSYIKEQTQDQFQMIVISLKEEFYSRADAL
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pF1KA0 IGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ      
       ::.:::  ::..:.:::.::..:::              
NP_683 IGIYPEYDDCMFSRVLTLDLSQYPDTEGQESSKRHGESR
       1200      1210      1220      1230     

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                                     :::.:::.::: .:::::....::::: .:
XP_011                               MDALSFVMGEKIANLRVKNIQELIHGAHIG
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       :: .. : :...: ::..:..::::.: :: ::...:...:.   :  ::::.::..::.
XP_011 KPISSSASVKIIYVEESGEEKTFARIIRGGCSEFRFNDNLVSRSVYIAELEKIGIIVKAQ
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pF1KA0 NFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEEDTQFNYHRKKN
       : :::::.::::..:.::::: .::::: ::::  ::...:... :::::.:::...:::
XP_011 NCLVFQGTVESISVKKPKERTQFFEEISTSGELIGEYEEKKRKLQKAEEDAQFNFNKKKN
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       :::::..:: :::::.::: : .:.   ..:::::.::::: .:. :: .:   :...  
XP_011 IAAERRQAKLEKEEAERYQSLLEELKMNKIQLQLFQLYHNEKKIHLLNTKLEHVNRDLSV
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pF1KA0 DKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTSHKIKK
        .. ... :. .: .::: : . :. :: :::.:  .. :::::::::::::::::..::
XP_011 KRESLSHHENIVKARKKEHGMLTRQLQQTEKELKSVETLLNQKRPQYIKAKENTSHHLKK
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pF1KA0 LEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQSQGRDLTLEENQ
       :..::::.....:. .:.. :.  :: :. ... : . ::...:::   . ::. :: .:
XP_011 LDVAKKSIKDSEKQCSKQEDDIKALETELADLDAAWRSFEKQIEEEILHKKRDIELEASQ
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pF1KA0 VKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAKIKQKLREIEEN
       . .:..:::.. :..::..:.:::.. .::.:..:: .:.:.. :.....::  ..::..
XP_011 LDRYKELKEQVRKKVATMTQQLEKLQWEQKTDEERLAFEKRRHGEVQGNLKQIKEQIEDH
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pF1KA0 QKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGDARIDR
       .:::::::::  :  . :.:.:. :  :..:.: .: :..:.:.::: .  .: .: :: 
XP_011 KKRIEKLEEYTKTCMDCLKEKKQQEETLVDEIEKTKSRMSEVNEELNLIRSELQNAGIDT
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pF1KA0 QESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAIIVDSEK
       .:..:::..::..: .::::: ::.:::.:::.: .::::.:::::.:. . ::.: :::
XP_011 HEGKRQQKRAEVLEHLKRLYPDSVFGRLFDLCHPIHKKYQLAVTKVFGRFITAIVVASEK
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pF1KA0 TGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRYEPPHIKKALQY
       ...:::...::.:.:::::: ::::..:: .:.:::::: :.:::::. . :..::..:.
XP_011 VAKDCIRFLKEERAEPETFLALDYLDIKPINERLRELKGCKMVIDVIKTQFPQLKKVIQF
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       .:::.:::...:.::.::..: .:.:::::::::: ::::::::.:::: ::: :::: .
XP_011 VCGNGLVCETMEEARHIALSGPERQKTVALDGTLFLKSGVISGGSSDLKYKARCWDEKEL
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        .:.... .  .:::  ::. :::..:.:.:.  .: : ::::::..::. : .::.   
XP_011 KNLRDRRSQKIQELKGLMKTLRKETDLKQIQTLIQGTQTRLKYSQNELEMIKKKHLVAFY
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       ::.:.:.::: :.  .   ... :. :.:..:...::...:::..:..::.::::.::::
XP_011 QEQSQLQSELLNIESQCIMLSEGIKERQRRIKEFQEKIDKVEDDIFQHFCEEIGVENIRE
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       ::...::::.:: .::::::.:::::..::.. ...::.  .:..  ..:..:  ..:..
XP_011 FENKHVKRQQEIDQKRLEFEKQKTRLNVQLEYSRSHLKKKLNKINTLKETIQKGSEDIDH
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       ::: :.  .. ..: ::. :.::. .....: ..  . ..:: :::. ....:. .::::
XP_011 LKKAEENCLQTVNELMAKQQQLKDIRVTQNSSAEKVQTQIEEERKKFLAVDREVGKLQKE
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       :..:.:.::::: ..::::  ::.:::.. : .:..::: . : ....:..    :   .
XP_011 VVSIQTSLEQKRLEKHNLLLDCKVQDIEIILLSGSLDDIIEVEMGTEAEST----QATID
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       :: .:  .::::..: ::::  :...::. ..  : :..  :...: . ::::..:.:.:
XP_011 IYEKEEAFEIDYSSLKEDLKALQSDQEIEAHLRLLLQQVASQEDILLKTAAPNLRALENL
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       ..:::::::..: :::.::.:.  .: :::.::.:.: :. ::: :. .::.::: : ::
XP_011 KTVRDKFQESTDAFEASRKEARLCRQEFEQVKKRRYDLFTQCFEHVSISIDQIYKKLCRN
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pF1KA0 SSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHSYKPAP
       .::::::.:::::::::.::.:::::::::: :::::::::: :::::::::.::..:::
XP_011 NSAQAFLSPENPEEPYLEGISYNCVAPGKRFMPMDNLSGGEKCVAALALLFAVHSFRPAP
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pF1KA0 FFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPEQGDCV
       ::::::.::::::::::::..:::::.  .:: ::::::::::..:..:::.:::  ::.
XP_011 FFVLDEVDAALDNTNIGKVSSYIKEQTQDQFQMIVISLKEEFYSRADALIGIYPEYDDCM
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pF1KA0 ISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ      
       .:.:::.::..:::              
XP_011 FSRVLTLDLSQYPDTEGQESSKRHGESR
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       :. :.:. .:::::..:::.::::.::: :::::::::::.:::.:::.::: .:::::.
XP_011 MAHLELLLVENFKSWRGRQVIGPFRRFTCIIGPNGSGKSNVMDALSFVMGEKIANLRVKN
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pF1KA0 LRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEE
       ...::::: .::: .. : :...: ::..:..::::.: :: ::...:...:.   :  :
XP_011 IQELIHGAHIGKPISSSASVKIIYVEESGEEKTFARIIRGGCSEFRFNDNLVSRSVYIAE
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       :::.::..::.: :::::.::::..:.::::: .::::: ::::  ::...:... ::::
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pF1KA0 DTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNK
       :.:::...::::::::..:: :::::.::: : .:.   ..:::::.::::: .:. :: 
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pF1KA0 ELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIK
       .:   :...   .. ... :. .: .::: : . :. :: :::.:  .. ::::::::::
XP_011 KLEHVNRDLSVKRESLSHHENIVKARKKEHGMLTRQLQQTEKELKSVETLLNQKRPQYIK
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pF1KA0 AKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQS
       :::::::..:::..::::.....:. .:.. :.  :: :. ... : . ::...:::   
XP_011 AKENTSHHLKKLDVAKKSIKDSEKQCSKQEDDIKALETELADLDAAWRSFEKQIEEEILH
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pF1KA0 QGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAK
       . ::. :: .:. .:..:::.. :..::..:.:::.. .::.:..:: .:.:.. :....
XP_011 KKRDIELEASQLDRYKELKEQVRKKVATMTQQLEKLQWEQKTDEERLAFEKRRHGEVQGN
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pF1KA0 IKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQV
       .::  ..::...:::::::::  :  . :.:.:. :  :..:.: .: :..:.:.::: .
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         .: .: :: .:..:::..::..: .::::: ::.:::.:::.: .::::.:::::.:.
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        . ::.: :::...:::...::.:.:::::: ::::..:: .:.:::::: :.:::::. 
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pF1KA0 ANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGE
       ...:. .:::::..:.:.::::: ..::::  ::.:::.. : .:..::: . : ....:
XP_011 VDREVGKLQKEVVSIQTSLEQKRLEKHNLLLDCKVQDIEIILLSGSLDDIIEVEMGTEAE
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       ..    :   .:: .:  .::::..: ::::  :...::. ..  : :..  :...: . 
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       ::::..:.:.:..:::::::..: :::.::.:.  .: :::.::.:.: :. ::: :. .
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XP_011 IDQIYKKLCRNNSAQFSSCPILCFR                                   
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>>NP_001278430 (OMIM: 608685) structural maintenance of   (1161 aa)
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pF1KA0 LRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEE
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pF1KA0 DTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNK
       :.:::...::::::::..:: :::::.::: : .:.   ..:::::.::::: .:. :: 
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       .:   :...   .. ... :. .: .::: : . :. :: :::.:  .. ::::::::::
NP_001 KLEHVNRDLSVKRESLSHHENIVKARKKEHGMLTRQLQQTEKELKSVETLLNQKRPQYIK
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       :::::::..:::..::::.....:. .:.. :.  :: :. ... : . ::...:::   
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       :.::::.::::::...::::.:: .::::::.:::::..::.. ...::.  .:..  ..
NP_001 CEEIGVENIREFENKHVKRQQEIDQKRLEFEKQKTRLNVQLEYSRSHLKKKLNKINTLKE
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NP_001 TIQKGSEDIDHLKKAEENCLQTVNELMAKQQQLKDIRVTQNSSAEKVQTQIEEERKKFLA
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NP_001 VDREVGKLQKEVVSIQTSLEQKRLEKHNLLLDCKVQDIEIILLSGSLDDIIEVEMGTEAE
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NP_001 S----TQATIDIYEKEEAFEIDYSSLKEDLKALQSDQEIEAHLRLLLQQVASQEDILLKT
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NP_001 AAPNLRALENLKTVRDKFQESTDAFEASRKEARLCRQEFEQVKKRRYDLFTQCFEHVSIS
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       ::.::: : ::.:::                                             
NP_001 IDQIYKKLCRNNSAQ---------------------------------------------
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pF1KA0 LFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESL
                                    :..:::::.  .:: ::::::::::..:..:
NP_001 -----------------------------VSSYIKEQTQDQFQMIVISLKEEFYSRADAL
                                         1100      1110      1120  

             1210      1220      1230         
pF1KA0 IGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ      
       ::.:::  ::..:.:::.::..:::              
NP_001 IGIYPEYDDCMFSRVLTLDLSQYPDTEGQESSKRHGESR
           1130      1140      1150      1160 

>>XP_011516455 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural main  (1099 aa)
 initn: 375 init1: 151 opt: 610  Z-score: 242.4  bits: 56.8 E(85289): 9.2e-07
Smith-Waterman score: 880; 25.8% identity (58.3% similar) in 1196 aa overlap (4-1133:3-1090)

               10        20         30        40        50         
pF1KA0 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQR-FTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLG-EKTSNLRV
          .: : .:.::::  :  .. :.  :.:: : :::::::..:.: :.::  . :..:.
XP_011  MHIKSIILEGFKSYAQRTEVNGFDPLFNAITGLNGSGKSNILDSICFLLGISNLSQVRA
                10        20        30        40        50         

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pF1KA0 KTLRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVY-------SEEGAE--DR-TFAR-VIVGGSSEYKI
       ..:.::..    :. . ..: ::...       :  : :  :. : .: :..:: ..: :
XP_011 SNLQDLVYKN--GQAGITKASVSITFDNSDKKQSPLGFEVHDEITVTRQVVIGGRNKYLI
      60          70        80        90       100       110       

       110       120       130       140       150       160       
pF1KA0 NNKVVQLHEYSEELEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQE
       :.  ..  . .. . ..:. ..  .::..:: . ..   .: :  ...:: .  :    :
XP_011 NGVNANNTRVQDLFCSVGLNVNNPHFLIMQGRITKVLNMKPPEILSMIEEAA--GTRMYE
       120       130       140       150       160         170     

       170       180       190       200         210       220     
pF1KA0 YDKRKKEMVKAEEDTQFNYHRKKNIAAERKEAKQ--EKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQL
       : :     . :..  .     ::.  :. :: :   :.: .   :.::.:  :..  :. 
XP_011 YKK-----IAAQKTIE-----KKE--AKLKEIKTILEEEITPTIQKLKEE--RSSY-LEY
              180              190       200       210          220

         230       240       250       260       270       280     
pF1KA0 FKLYHNEVEIEKLNKELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIK
        :...   :::.:..   . .  . .: :   .  .:::: . .. :...: .. .:.::
XP_011 QKVMR---EIEHLSRLYIAYQFLLAEDTKV--RSAEELKEMQDKVIKLQEELSENDKKIK
                 230       240         250       260       270     

         290       300       310       320       330       340     
pF1KA0 EKDSELNQKRPQYIKAKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEK
         . :... . .  : :: :.  ...:: :   : .::.   : .. .:  .:..   :.
XP_011 ALNHEIEELEKR--KDKE-TGGILRSLEDA---LAEAQRVNTKSQSAFDLKKKNLACEES
         280         290        300          310       320         

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pF1KA0 ARQEFEERMEEESQSQGRDLTLEENQVKKY----HRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQK
        :.:.:. : :.:..    :. .:..:::     : :.: ..: : .::   ..::  . 
XP_011 KRKELEKNMVEDSKT----LAAKEKEVKKITDGLHALQEASNKDAEALAAAQQHFNAVSA
     330       340           350       360       370       380     

             410                    420            430       440   
pF1KA0 ADQDRLDLEER-------------KKVETEAKIKQ-KLR----EIEENQKRIEKLEEYIT
       . ..  :  :              .:..::::  : ::.    :....: ...:..    
XP_011 GLSSNEDGAEATLAGQMMACKNDISKAQTEAKQAQMKLKHAQQELKNKQAEVKKMDSGYR
         390       400       410       420       430       440     

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pF1KA0 TSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGDARIDRQESSRQQRKAEI
        ....::  :.:. .:  :.:: :   .: :::     :.: . :  :: :    :  : 
XP_011 KDQEALEAVKRLKEKL--EAEMKKLNYEE-NKE-----ESLLEKR--RQLSRDIGRLKET
         450       460         470             480         490     

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pF1KA0 MESIKRLYPG---------------SVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAIIVD
       .:..   .:.                : : . .: .  . .   :.  : :. .  ..::
XP_011 YEALLARFPNLRFAYKDPEKNWNRNCVKGLVASLISVKDTSATTALELVAGERLYNVVVD
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pF1KA0 SEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVK-PTDEKLR---ELKG---AKLVIDVIRYE
       .: ::.  ..  . .:    :..::. . ..  . : ::   .: :   .........:.
XP_011 TEVTGKKLLERGELKRRY--TIIPLNKISARCIAPETLRVAQNLVGPDNVHVALSLVEYK
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pF1KA0 PPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLKA
       : ...::.... :...::::...:...::  .   .::.: : .:.  :..:::: .  :
XP_011 P-ELQKAMEFVFGTTFVCDNMDNAKKVAFDKRIMTRTVTLGGDVFDPHGTLSGGARSQAA
            620       630       640       650       660       670  

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pF1KA0 KA-RRWDE-KAV-DKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAE-LRQVQSQAHGLQMRLKYSQS
       .   ...: : : :.:. :...: . :.:.. . .. ::  ::...:      ..:  ..
XP_011 SILTKFQELKDVQDELRIKENEL-RALEEELAGLKNTAEKYRQLKQQ-----WEMKTEEA
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pF1KA0 DLEQTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVF
       :: ::: .. . . :..            ... .:. :.  :. .:. :: . ..:..  
XP_011 DLLQTKLQQSSYHKQQE------------ELDALKKTIEESEETLKNTKEIQRKAEEKY-
        730       740                   750       760       770    

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pF1KA0 EEFCREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHM
            :.   .... : :. .:. . :.:.:.  . :.      :  ....:: :     
XP_011 -----EVLENKMKNAEAER-ERELKDAQKKLDCAKTKA------DASSKKMKEKQ-----
                780        790       800             810           

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pF1KA0 WEQTVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKK
         : :.    :.:.::.:.  . . .. .   ... ..:  .  .::  ::.:      .
XP_011 --QEVEAITLELEELKREHTSYKQQLEAVNEAIKSYESQIEVMAAEVA-KNKE------S
          820       830       840       850       860              

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pF1KA0 LGGANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMD-DISQEEGS
       .. :..:.:. .. .:: .: .. : ..    .   : :.    :.   .: .::...  
XP_011 VNKAQEEVTKQKEVITAQDTVIKAKYAE----VAKHKEQNNDSQLKIKELDHNISKHK--
       870       880       890           900       910       920   

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pF1KA0 SQGEDSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSV
        ..::   :. ..:..      :. .   . .  .  . . .  .: .   :::.:..  
XP_011 REAED---GAAKVSKMLKDYDWINAERHLFGQPNSAYDFKTNNPKEAGQRLQKLQEMKEK
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       1020      1030      1040      1050      1060      1070      
pF1KA0 LQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFES
       : : .  ::.::. :  .......   . . ...  .:   ..:.. ... . .:  ...
XP_011 LGRNV--NMRAMNVLTEAEERYNDLMKKKRIVENDKSKILTTIEDLDQKKNQALNIAWQK
      980         990      1000      1010      1020      1030      

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pF1KA0 VATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPE-EPYLDGINYNCVAPGKRFRP-MDNLSGGEKT
       :  ..  :...:    .:.:.:.:  :: .  :::.... :: :. ..  . .::::.. 
XP_011 VNKDFGSIFSTLL--PGANAMLAP--PEGQTVLDGLEFK-VALGNTWKENLTELSGGQRQ
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pF1KA0 VAALALLFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFY
                                                                   
XP_011 KQQNHTTG                                                    
                                                                   

>>XP_011516454 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural main  (1115 aa)
 initn: 375 init1: 151 opt: 610  Z-score: 242.3  bits: 56.8 E(85289): 9.3e-07
Smith-Waterman score: 880; 25.8% identity (58.3% similar) in 1196 aa overlap (4-1133:3-1090)

               10        20         30        40        50         
pF1KA0 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQR-FTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLG-EKTSNLRV
          .: : .:.::::  :  .. :.  :.:: : :::::::..:.: :.::  . :..:.
XP_011  MHIKSIILEGFKSYAQRTEVNGFDPLFNAITGLNGSGKSNILDSICFLLGISNLSQVRA
                10        20        30        40        50         

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pF1KA0 KTLRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVY-------SEEGAE--DR-TFAR-VIVGGSSEYKI
       ..:.::..    :. . ..: ::...       :  : :  :. : .: :..:: ..: :
XP_011 SNLQDLVYKN--GQAGITKASVSITFDNSDKKQSPLGFEVHDEITVTRQVVIGGRNKYLI
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pF1KA0 NNKVVQLHEYSEELEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQE
       :.  ..  . .. . ..:. ..  .::..:: . ..   .: :  ...:: .  :    :
XP_011 NGVNANNTRVQDLFCSVGLNVNNPHFLIMQGRITKVLNMKPPEILSMIEEAA--GTRMYE
       120       130       140       150       160         170     

       170       180       190       200         210       220     
pF1KA0 YDKRKKEMVKAEEDTQFNYHRKKNIAAERKEAKQ--EKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQL
       : :     . :..  .     ::.  :. :: :   :.: .   :.::.:  :..  :. 
XP_011 YKK-----IAAQKTIE-----KKE--AKLKEIKTILEEEITPTIQKLKEE--RSSY-LEY
              180              190       200       210          220

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pF1KA0 FKLYHNEVEIEKLNKELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIK
        :...   :::.:..   . .  . .: :   .  .:::: . .. :...: .. .:.::
XP_011 QKVMR---EIEHLSRLYIAYQFLLAEDTKV--RSAEELKEMQDKVIKLQEELSENDKKIK
                 230       240         250       260       270     

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pF1KA0 EKDSELNQKRPQYIKAKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEK
         . :... . .  : :: :.  ...:: :   : .::.   : .. .:  .:..   :.
XP_011 ALNHEIEELEKR--KDKE-TGGILRSLEDA---LAEAQRVNTKSQSAFDLKKKNLACEES
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pF1KA0 ARQEFEERMEEESQSQGRDLTLEENQVKKY----HRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQK
        :.:.:. : :.:..    :. .:..:::     : :.: ..: : .::   ..::  . 
XP_011 KRKELEKNMVEDSKT----LAAKEKEVKKITDGLHALQEASNKDAEALAAAQQHFNAVSA
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pF1KA0 ADQDRLDLEER-------------KKVETEAKIKQ-KLR----EIEENQKRIEKLEEYIT
       . ..  :  :              .:..::::  : ::.    :....: ...:..    
XP_011 GLSSNEDGAEATLAGQMMACKNDISKAQTEAKQAQMKLKHAQQELKNKQAEVKKMDSGYR
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        ....::  :.:. .:  :.:: :   .: :::     :.: . :  :: :    :  : 
XP_011 KDQEALEAVKRLKEKL--EAEMKKLNYEE-NKE-----ESLLEKR--RQLSRDIGRLKET
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       .:..   .:.                : : . .: .  . .   :.  : :. .  ..::
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       .: ::.  ..  . .:    :..::. . ..  . : ::   .: :   .........:.
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       : ...::.... :...::::...:...::  .   .::.: : .:.  :..:::: .  :
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       .   ...: : : :.:. :...: . :.:.. . .. ::  ::...:      ..:  ..
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       :: ::: .. . . :..            ... .:. :.  :. .:. :: . ..:..  
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         : :.    :.:.::.:.  . . .. .   ... ..:  .  .::  ::.:      .
XP_011 --QEVEAITLELEELKREHTSYKQQLEAVNEAIKSYESQIEVMAAEVA-KNKE------S
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pF1KA0 LGGANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMD-DISQEEGS
       .. :..:.:. .. .:: .: .. : ..    .   : :.    :.   .: .::...  
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pF1KA0 SQGEDSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSV
        ..::   :. ..:..      :. .   . .  .  . . .  .: .   :::.:..  
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pF1KA0 LQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFES
       : : .  ::.::. :  .......   . . ...  .:   ..:.. ... . .:  ...
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pF1KA0 VATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPE-EPYLDGINYNCVAPGKRFRP-MDNLSGGEKT
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>>XP_011510614 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural main  (1216 aa)
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       :. :  .:..:..:...:: .  :. :.       :  .: ..:: ::  .  .:.  ..
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XP_011 LVKVKDEKIRQAFYFALRDTLVADNLDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQIIEQSGTMTGGG
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pF1KA0 YSQSDLEQTKTRHLA-----------LNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRI---IQSRE
       .:. ....:  .  :           ::.: : .::...   .:  .  : .   ... .
XP_011 HSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQVK-ELEANVLATAPDKKKQKLLEENVSAFK
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pF1KA0 REMKDLKEKMNQVEDEVFEEFCREIGVRNIREFEEEKVKRQ----NEIAKKRLEFENQKT
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pF1KA0 QHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGGANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKM
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XP_011 TNAAEES-LPEIQKEHRNLLQELKVIQENEHALQKDALSIKLKLEQ--IDGHIAEHNSKI
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XP_011 KYWHKEISKISLHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLEAR----CH----
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pF1KA0 AQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRA
            :.: ..... .  ....  :::.:      ..:.   ::.:              
XP_011 -----EMKPNLGAIAEYKKKEELYLQRVAE-----LDKITYERDSF--------------
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pF1KA0 KKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGIN
          .::.:...:.:...: : :  ..... : :. :. ...:.  :   .  .:. .:: 
XP_011 ---RQAYEDLRKQRLNEFMAGFYIITNKLKENYQMLTLGGDAELEL--VDSLDPFSEGIM
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pF1KA0 YNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVAN
       ..   : : .. . ::::::::...:::.::.: :::.:.. .::::::::  :.. :: 
XP_011 FSVRPPKKSWKKIFNLSGGEKTLSSLALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAF
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pF1KA0 YIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNE
       :: :: : : : :.:::.....  .. :::.:            :...::   .::    
XP_011 YIYEQ-TKNAQFIIISLRNNMFEISDRLIGIYK-----------TYNITKSVAVNPKEIA
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pF1KA0 Q    
            
XP_011 SKGLC
            

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       . .:  .:.    ..: :.:..:   ... .. :.. :: .    ::..:: ::.::: .
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pF1KA0 ----VEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTSHKIKKLEA
           . .:.: :.:..    .. ..: : :.:.  ...:   . ....:. .:  .: . 
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pF1KA0 AKKSLQNAQKHYK-------KRKGDMDE-------LEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQS
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pF1KA0 QGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKF-NRDQKA------DQDRL-----D
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       :.::: .  . :.:. :  .:..:..:...:: .  :. :.       :  .: ..:: :
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pF1KA0 DIKRI---IQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEFCREIGVRNIREFEEEKVKRQ----NE
         : .   ... . :.  . :: ..:: ::     ...   .: :....:.: :    ..
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pF1KA0 IAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQTVKKDENEIEKLKKEEQRHMKI
       : :.  :  .  :.  . .     .:.. ::.:   :. .:  :.:.. :  :    .: 
NP_001 INKQLDECASAITKAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVDDLTAE----LKS
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pF1KA0 IDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGGANKEMTHLQKEVTAIETKLEQK
       ...  :..  .:: . :..: . . ..: ... ..:   ...   :::.. .:. :::: 
NP_001 LEDKAAEV--VKNTNAAEES-LPEIQKEHRNLLQELKVIQENEHALQKDALSIKLKLEQ-
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pF1KA0 RSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTM---DDISQEEGSSQGEDSVSGSQRISSIYAREALI
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NP_001 -IDGHIAEHNSKIKYWHKEISKISLHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALL
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pF1KA0 EIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQ
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NP_001 EAR----CH---------EMKPNLGAIAEYKKKEELYLQRVAE-----LDKITYERDSF-
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pF1KA0 ETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATNIDEIYKALSRNSSAQAFLG
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NP_001 ----------------RQAYEDLRKQRLNEFMAGFYIITNKLKENYQMLTLGGDAELEL-
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NP_001 AALDFKNVSIVAFYIYEQ-TKNAQFIIISLRNNMFEISDRLIGIYK-----------TYN
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       .::   .::         
NP_001 ITKSVAVNPKEIASKGLC
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1233 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 09:09:25 2016 done: Thu Nov  3 09:09:27 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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