FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0178, 1233 aa 1>>>pF1KA0178 1233 - 1233 aa - 1233 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 19.1071+/-0.00075; mu= -45.4949+/- 0.046 mean_var=814.9804+/-167.598, 0's: 0 Z-trim(114.7): 261 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.044926 statistics sampled from 24516 (24730) to 24516 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16 Scan time: 12.520 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006297 (OMIM: 300040,300590) structural mainten (1233) 7874 527.6 1.9e-148 NP_001268392 (OMIM: 300040,300590) structural main (1211) 7635 512.1 8.6e-144 NP_683515 (OMIM: 608685) structural maintenance of (1235) 4454 306.0 1e-81 XP_011528446 (OMIM: 608685) PREDICTED: structural (1194) 4245 292.4 1.2e-77 XP_011528447 (OMIM: 608685) PREDICTED: structural (1101) 3741 259.7 7.5e-68 NP_001278430 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NP_683 MAHLELLLVENFKSWRGRQVIGPFRRFTCIIGPNGSGKSNVMDALSFVMGEKIANLRVKN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 LRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEE ...::::: .::: .. : :...: ::..:..::::.: :: ::...:...:. : : NP_683 IQELIHGAHIGKPISSSASVKIIYVEESGEEKTFARIIRGGCSEFRFNDNLVSRSVYIAE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 LEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEE :::.::..::.: :::::.::::..:.::::: .::::: :::: ::...:... :::: NP_683 LEKIGIIVKAQNCLVFQGTVESISVKKPKERTQFFEEISTSGELIGEYEEKKRKLQKAEE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 DTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNK :.:::...::::::::..:: :::::.::: : .:. ..:::::.::::: .:. :: NP_683 DAQFNFNKKKNIAAERRQAKLEKEEAERYQSLLEELKMNKIQLQLFQLYHNEKKIHLLNT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KA0 ELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIK .: :... .. ... :. .: .::: : . :. :: :::.: .. :::::::::: NP_683 KLEHVNRDLSVKRESLSHHENIVKARKKEHGMLTRQLQQTEKELKSVETLLNQKRPQYIK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA0 AKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQS :::::::..:::..::::.....:. .:.. :. :: :. ... : . ::...::: NP_683 AKENTSHHLKKLDVAKKSIKDSEKQCSKQEDDIKALETELADLDAAWRSFEKQIEEEILH 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 QGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAK . ::. :: .:. .:..:::.. :..::..:.:::.. .::.:..:: .:.:.. :.... NP_683 KKRDIELEASQLDRYKELKEQVRKKVATMTQQLEKLQWEQKTDEERLAFEKRRHGEVQGN 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 IKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQV .:: ..::...::::::::: : . :.:.:. : :..:.: .: :..:.:.::: . NP_683 LKQIKEQIEDHKKRIEKLEEYTKTCMDCLKEKKQQEETLVDEIEKTKSRMSEVNEELNLI 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 MEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGK .: .: :: .:..:::..::..: .::::: ::.:::.:::.: .::::.:::::.:. NP_683 RSELQNAGIDTHEGKRQQKRAEVLEHLKRLYPDSVFGRLFDLCHPIHKKYQLAVTKVFGR 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 NMDAIIVDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRY . ::.: :::...:::...::.:.:::::: ::::..:: .:.:::::: :.:::::. NP_683 FITAIVVASEKVAKDCIRFLKEERAEPETFLALDYLDIKPINERLRELKGCKMVIDVIKT 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 EPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLK . :..::..:..:::.:::...:.::.::..: .:.:::::::::: ::::::::.:::: NP_683 QFPQLKKVIQFVCGNGLVCETMEEARHIALSGPERQKTVALDGTLFLKSGVISGGSSDLK 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 AKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLE ::: :::: . .:.... . .::: ::. :::..:.:.:. .: : ::::::..:: NP_683 YKARCWDEKELKNLRDRRSQKIQELKGLMKTLRKETDLKQIQTLIQGTQTRLKYSQNELE 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 QTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEF . : .::. ::.:.:.::: :. . ... :. :.:..:...::...:::..:..: NP_683 MIKKKHLVAFYQEQSQLQSELLNIESQCIMLSEGIKERQRRIKEFQEKIDKVEDDIFQHF 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 CREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQ :.::::.::::::...::::.:: .::::::.:::::..::.. ...::. .:.. .. NP_683 CEEIGVENIREFENKHVKRQQEIDQKRLEFEKQKTRLNVQLEYSRSHLKKKLNKINTLKE 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KA0 TVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGG :..: ..:..::: :. .. ..: ::. :.::. .....: .. . ..:: :::. . NP_683 TIQKGSEDIDHLKKAEENCLQTVNELMAKQQQLKDIRVTQNSSAEKVQTQIEEERKKFLA 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KA0 ANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGE ...:. .:::::..:.:.::::: ..:::: ::.:::.. : .:..::: . : ....: NP_683 VDREVGKLQKEVVSIQTSLEQKRLEKHNLLLDCKVQDIEIILLSGSLDDIIEVEMGTEAE 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 DSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRI . .: .:: .: .::::..: :::: :...::. .. : :.. :...: . NP_683 S----TQATIDIYEKEEAFEIDYSSLKEDLKALQSDQEIEAHLRLLLQQVASQEDILLKT 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA0 AAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATN ::::..:.:.:..:::::::..: :::.::.:. .: :::.::.:.: :. ::: :. . NP_683 AAPNLRALENLKTVRDKFQESTDAFEASRKEARLCRQEFEQVKKRRYDLFTQCFEHVSIS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 IDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALAL ::.::: : ::.::::::.:::::::::.::.:::::::::: :::::::::: :::::: NP_683 IDQIYKKLCRNNSAQAFLSPENPEEPYLEGISYNCVAPGKRFMPMDNLSGGEKCVAALAL 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 LFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESL :::.::..:::::::::.::::::::::::..:::::. .:: ::::::::::..:..: NP_683 LFAVHSFRPAPFFVLDEVDAALDNTNIGKVSSYIKEQTQDQFQMIVISLKEEFYSRADAL 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1210 1220 1230 pF1KA0 IGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ ::.::: ::..:.:::.::..::: NP_683 IGIYPEYDDCMFSRVLTLDLSQYPDTEGQESSKRHGESR 1200 1210 1220 1230 >>XP_011528446 (OMIM: 608685) PREDICTED: structural main (1194 aa) initn: 4248 init1: 3108 opt: 4245 Z-score: 1515.1 bits: 292.4 E(85289): 1.2e-77 Smith-Waterman score: 4245; 53.1% identity (83.8% similar) in 1184 aa overlap (42-1225:1-1180) 20 30 40 50 60 70 pF1KA0 FKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLIHGAPVG :::.:::.::: .:::::....::::: .: XP_011 MDALSFVMGEKIANLRVKNIQELIHGAHIG 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KA0 KPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGILIKAR :: .. : :...: ::..:..::::.: :: ::...:...:. : ::::.::..::. XP_011 KPISSSASVKIIYVEESGEEKTFARIIRGGCSEFRFNDNLVSRSVYIAELEKIGIIVKAQ 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KA0 NFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEEDTQFNYHRKKN : :::::.::::..:.::::: .::::: :::: ::...:... :::::.:::...::: XP_011 NCLVFQGTVESISVKKPKERTQFFEEISTSGELIGEYEEKKRKLQKAEEDAQFNFNKKKN 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KA0 IAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNKELASKNKEIEK :::::..:: :::::.::: : .:. ..:::::.::::: .:. :: .: :... XP_011 IAAERRQAKLEKEEAERYQSLLEELKMNKIQLQLFQLYHNEKKIHLLNTKLEHVNRDLSV 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KA0 DKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTSHKIKK .. ... :. .: .::: : . :. :: :::.: .. :::::::::::::::::..:: XP_011 KRESLSHHENIVKARKKEHGMLTRQLQQTEKELKSVETLLNQKRPQYIKAKENTSHHLKK 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KA0 LEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQSQGRDLTLEENQ :..::::.....:. .:.. :. :: :. ... : . ::...::: . ::. :: .: XP_011 LDVAKKSIKDSEKQCSKQEDDIKALETELADLDAAWRSFEKQIEEEILHKKRDIELEASQ 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 pF1KA0 VKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAKIKQKLREIEEN . .:..:::.. :..::..:.:::.. .::.:..:: .:.:.. :.....:: ..::.. XP_011 LDRYKELKEQVRKKVATMTQQLEKLQWEQKTDEERLAFEKRRHGEVQGNLKQIKEQIEDH 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 480 490 pF1KA0 QKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGDARIDR .::::::::: : . :.:.:. : :..:.: .: :..:.:.::: . .: .: :: XP_011 KKRIEKLEEYTKTCMDCLKEKKQQEETLVDEIEKTKSRMSEVNEELNLIRSELQNAGIDT 400 410 420 430 440 450 500 510 520 530 540 550 pF1KA0 QESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAIIVDSEK .:..:::..::..: .::::: ::.:::.:::.: .::::.:::::.:. . ::.: ::: XP_011 HEGKRQQKRAEVLEHLKRLYPDSVFGRLFDLCHPIHKKYQLAVTKVFGRFITAIVVASEK 460 470 480 490 500 510 560 570 580 590 600 610 pF1KA0 TGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRYEPPHIKKALQY ...:::...::.:.:::::: ::::..:: .:.:::::: :.:::::. . :..::..:. XP_011 VAKDCIRFLKEERAEPETFLALDYLDIKPINERLRELKGCKMVIDVIKTQFPQLKKVIQF 520 530 540 550 560 570 620 630 640 650 660 670 pF1KA0 ACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLKAKARRWDEKAV .:::.:::...:.::.::..: .:.:::::::::: ::::::::.:::: ::: :::: . XP_011 VCGNGLVCETMEEARHIALSGPERQKTVALDGTLFLKSGVISGGSSDLKYKARCWDEKEL 580 590 600 610 620 630 680 690 700 710 720 730 pF1KA0 DKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLEQTKTRHLALNL .:.... . .::: ::. :::..:.:.:. .: : ::::::..::. : .::. XP_011 KNLRDRRSQKIQELKGLMKTLRKETDLKQIQTLIQGTQTRLKYSQNELEMIKKKHLVAFY 640 650 660 670 680 690 740 750 760 770 780 790 pF1KA0 QEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEFCREIGVRNIRE ::.:.:.::: :. . ... :. :.:..:...::...:::..:..::.::::.:::: XP_011 QEQSQLQSELLNIESQCIMLSEGIKERQRRIKEFQEKIDKVEDDIFQHFCEEIGVENIRE 700 710 720 730 740 750 800 810 820 830 840 850 pF1KA0 FEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQTVKKDENEIEK ::...::::.:: .::::::.:::::..::.. ...::. .:.. ..:..: ..:.. XP_011 FENKHVKRQQEIDQKRLEFEKQKTRLNVQLEYSRSHLKKKLNKINTLKETIQKGSEDIDH 760 770 780 790 800 810 860 870 880 890 900 910 pF1KA0 LKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGGANKEMTHLQKE ::: :. .. ..: ::. :.::. .....: .. . ..:: :::. ....:. .:::: XP_011 LKKAEENCLQTVNELMAKQQQLKDIRVTQNSSAEKVQTQIEEERKKFLAVDREVGKLQKE 820 830 840 850 860 870 920 930 940 950 960 970 pF1KA0 VTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGEDSVSGSQRISS :..:.:.::::: ..:::: ::.:::.. : .:..::: . : ....:.. : . XP_011 VVSIQTSLEQKRLEKHNLLLDCKVQDIEIILLSGSLDDIIEVEMGTEAEST----QATID 880 890 900 910 920 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KA0 IYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRIAAPNMKAMEKL :: .: .::::..: :::: :...::. .. : :.. :...: . ::::..:.:.: XP_011 IYEKEEAFEIDYSSLKEDLKALQSDQEIEAHLRLLLQQVASQEDILLKTAAPNLRALENL 930 940 950 960 970 980 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA0 ESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATNIDEIYKALSRN ..:::::::..: :::.::.:. .: :::.::.:.: :. ::: :. .::.::: : :: XP_011 KTVRDKFQESTDAFEASRKEARLCRQEFEQVKKRRYDLFTQCFEHVSISIDQIYKKLCRN 990 1000 1010 1020 1030 1040 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KA0 SSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHSYKPAP .::::::.:::::::::.::.:::::::::: :::::::::: :::::::::.::..::: XP_011 NSAQAFLSPENPEEPYLEGISYNCVAPGKRFMPMDNLSGGEKCVAALALLFAVHSFRPAP 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KA0 FFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPEQGDCV ::::::.::::::::::::..:::::. .:: ::::::::::..:..:::.::: ::. XP_011 FFVLDEVDAALDNTNIGKVSSYIKEQTQDQFQMIVISLKEEFYSRADALIGIYPEYDDCM 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1220 1230 pF1KA0 ISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ .:.:::.::..::: XP_011 FSRVLTLDLSQYPDTEGQESSKRHGESR 1170 1180 1190 >>XP_011528447 (OMIM: 608685) PREDICTED: structural main (1101 aa) initn: 3744 init1: 3317 opt: 3741 Z-score: 1339.1 bits: 259.7 E(85289): 7.5e-68 Smith-Waterman score: 3741; 50.9% identity (82.8% similar) in 1095 aa overlap (1-1095:1-1091) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKT :. :.:. .:::::..:::.::::.::: :::::::::::.:::.:::.::: .:::::. XP_011 MAHLELLLVENFKSWRGRQVIGPFRRFTCIIGPNGSGKSNVMDALSFVMGEKIANLRVKN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 LRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEE ...::::: .::: .. : :...: ::..:..::::.: :: ::...:...:. : : XP_011 IQELIHGAHIGKPISSSASVKIIYVEESGEEKTFARIIRGGCSEFRFNDNLVSRSVYIAE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 LEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEE :::.::..::.: :::::.::::..:.::::: .::::: :::: ::...:... :::: XP_011 LEKIGIIVKAQNCLVFQGTVESISVKKPKERTQFFEEISTSGELIGEYEEKKRKLQKAEE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 DTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNK :.:::...::::::::..:: :::::.::: : .:. ..:::::.::::: .:. :: XP_011 DAQFNFNKKKNIAAERRQAKLEKEEAERYQSLLEELKMNKIQLQLFQLYHNEKKIHLLNT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KA0 ELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIK .: :... .. ... :. .: .::: : . :. :: :::.: .. :::::::::: XP_011 KLEHVNRDLSVKRESLSHHENIVKARKKEHGMLTRQLQQTEKELKSVETLLNQKRPQYIK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA0 AKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQS :::::::..:::..::::.....:. .:.. :. :: :. ... : . ::...::: XP_011 AKENTSHHLKKLDVAKKSIKDSEKQCSKQEDDIKALETELADLDAAWRSFEKQIEEEILH 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 QGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAK . ::. :: .:. .:..:::.. :..::..:.:::.. .::.:..:: .:.:.. :.... XP_011 KKRDIELEASQLDRYKELKEQVRKKVATMTQQLEKLQWEQKTDEERLAFEKRRHGEVQGN 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 IKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQV .:: ..::...::::::::: : . :.:.:. : :..:.: .: :..:.:.::: . XP_011 LKQIKEQIEDHKKRIEKLEEYTKTCMDCLKEKKQQEETLVDEIEKTKSRMSEVNEELNLI 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 MEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGK .: .: :: .:..:::..::..: .::::: ::.:::.:::.: .::::.:::::.:. XP_011 RSELQNAGIDTHEGKRQQKRAEVLEHLKRLYPDSVFGRLFDLCHPIHKKYQLAVTKVFGR 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 NMDAIIVDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRY . ::.: :::...:::...::.:.:::::: ::::..:: .:.:::::: :.:::::. XP_011 FITAIVVASEKVAKDCIRFLKEERAEPETFLALDYLDIKPINERLRELKGCKMVIDVIKT 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 EPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLK . :..::..:..:::.:::...:.::.::..: .:.:::::::::: ::::::::.:::: XP_011 QFPQLKKVIQFVCGNGLVCETMEEARHIALSGPERQKTVALDGTLFLKSGVISGGSSDLK 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 AKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLE ::: :::: . .:.... . .::: ::. :::..:.:.:. .: : ::::::..:: XP_011 YKARCWDEKELKNLRDRRSQKIQELKGLMKTLRKETDLKQIQTLIQGTQTRLKYSQNELE 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 QTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEF . : .::. ::.:.:.::: :. . ... :. :.:..:...::...:::..:..: XP_011 MIKKKHLVAFYQEQSQLQSELLNIESQCIMLSEGIKERQRRIKEFQEKIDKVEDDIFQHF 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 CREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQ :.::::.::::::...::::.:: .::::::.:::::..::.. ...::. .:.. .. XP_011 CEEIGVENIREFENKHVKRQQEIDQKRLEFEKQKTRLNVQLEYSRSHLKKKLNKINTLKE 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KA0 TVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGG :..: ..:..::: :. .. ..: ::. :.::. .....: .. . ..:: :::. . XP_011 TIQKGSEDIDHLKKAEENCLQTVNELMAKQQQLKDIRVTQNSSAEKVQTQIEEERKKFLA 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KA0 ANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGE ...:. .:::::..:.:.::::: ..:::: ::.:::.. : .:..::: . : ....: XP_011 VDREVGKLQKEVVSIQTSLEQKRLEKHNLLLDCKVQDIEIILLSGSLDDIIEVEMGTEAE 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 DSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRI .. : .:: .: .::::..: :::: :...::. .. : :.. :...: . XP_011 ST----QATIDIYEKEEAFEIDYSSLKEDLKALQSDQEIEAHLRLLLQQVASQEDILLKT 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA0 AAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATN ::::..:.:.:..:::::::..: :::.::.:. .: :::.::.:.: :. ::: :. . XP_011 AAPNLRALENLKTVRDKFQESTDAFEASRKEARLCRQEFEQVKKRRYDLFTQCFEHVSIS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 IDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALAL ::.::: : ::.::: XP_011 IDQIYKKLCRNNSAQFSSCPILCFR 1080 1090 1100 >>NP_001278430 (OMIM: 608685) structural maintenance of (1161 aa) initn: 3744 init1: 3317 opt: 3741 Z-score: 1338.8 bits: 259.7 E(85289): 7.8e-68 Smith-Waterman score: 3838; 48.4% identity (78.2% similar) in 1225 aa overlap (1-1225:1-1147) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKT :. :.:. .:::::..:::.::::.::: :::::::::::.:::.:::.::: .:::::. NP_001 MAHLELLLVENFKSWRGRQVIGPFRRFTCIIGPNGSGKSNVMDALSFVMGEKIANLRVKN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 LRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEE ...::::: .::: .. : :...: ::..:..::::.: :: ::...:...:. : : NP_001 IQELIHGAHIGKPISSSASVKIIYVEESGEEKTFARIIRGGCSEFRFNDNLVSRSVYIAE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 LEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEE :::.::..::.: :::::.::::..:.::::: .::::: :::: ::...:... :::: NP_001 LEKIGIIVKAQNCLVFQGTVESISVKKPKERTQFFEEISTSGELIGEYEEKKRKLQKAEE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 DTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNK :.:::...::::::::..:: :::::.::: : .:. ..:::::.::::: .:. :: NP_001 DAQFNFNKKKNIAAERRQAKLEKEEAERYQSLLEELKMNKIQLQLFQLYHNEKKIHLLNT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KA0 ELASKNKEIEKDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIK .: :... .. ... :. .: .::: : . :. :: :::.: .. :::::::::: NP_001 KLEHVNRDLSVKRESLSHHENIVKARKKEHGMLTRQLQQTEKELKSVETLLNQKRPQYIK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA0 AKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQS :::::::..:::..::::.....:. .:.. :. :: :. ... : . ::...::: NP_001 AKENTSHHLKKLDVAKKSIKDSEKQCSKQEDDIKALETELADLDAAWRSFEKQIEEEILH 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 QGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAK . ::. :: .:. .:..:::.. :..::..:.:::.. .::.:..:: .:.:.. :.... 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NP_001 FITAIVVASEKVAKDCIRFLKEERAEPETFLALDYLDIKPINERLRELKGCKMVIDVIKT 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 EPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSGVISGGASDLK . :..::..:..:::.:::...:.::.::..: .:.:::::::::: ::::::::.:::: NP_001 QFPQLKKVIQFVCGNGLVCETMEEARHIALSGPERQKTVALDGTLFLKSGVISGGSSDLK 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 AKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYSQSDLE ::: :::: . .:.... . .::: ::. :::..:.:.:. .: : ::::::..:: NP_001 YKARCWDEKELKNLRDRRSQKIQELKGLMKTLRKETDLKQIQTLIQGTQTRLKYSQNELE 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 QTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEF . : .::. ::.:.:.::: :. . ... :. :.:..:...::...:::..:..: NP_001 MIKKKHLVAFYQEQSQLQSELLNIESQCIMLSEGIKERQRRIKEFQEKIDKVEDDIFQHF 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 CREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQ :.::::.::::::...::::.:: .::::::.:::::..::.. ...::. .:.. .. NP_001 CEEIGVENIREFENKHVKRQQEIDQKRLEFEKQKTRLNVQLEYSRSHLKKKLNKINTLKE 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KA0 TVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGG :..: ..:..::: :. .. ..: ::. :.::. .....: .. . ..:: :::. . NP_001 TIQKGSEDIDHLKKAEENCLQTVNELMAKQQQLKDIRVTQNSSAEKVQTQIEEERKKFLA 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KA0 ANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGE ...:. .:::::..:.:.::::: ..:::: ::.:::.. : .:..::: . : ....: NP_001 VDREVGKLQKEVVSIQTSLEQKRLEKHNLLLDCKVQDIEIILLSGSLDDIIEVEMGTEAE 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 DSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRI . .: .:: .: .::::..: :::: :...::. .. : :.. :...: . NP_001 S----TQATIDIYEKEEAFEIDYSSLKEDLKALQSDQEIEAHLRLLLQQVASQEDILLKT 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA0 AAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATN ::::..:.:.:..:::::::..: :::.::.:. .: :::.::.:.: :. ::: :. . NP_001 AAPNLRALENLKTVRDKFQESTDAFEASRKEARLCRQEFEQVKKRRYDLFTQCFEHVSIS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 IDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALAL ::.::: : ::.::: NP_001 IDQIYKKLCRNNSAQ--------------------------------------------- 1080 1090 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 LFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESL :..:::::. .:: ::::::::::..:..: NP_001 -----------------------------VSSYIKEQTQDQFQMIVISLKEEFYSRADAL 1100 1110 1120 1210 1220 1230 pF1KA0 IGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ ::.::: ::..:.:::.::..::: NP_001 IGIYPEYDDCMFSRVLTLDLSQYPDTEGQESSKRHGESR 1130 1140 1150 1160 >>XP_011516455 (OMIM: 605576) PREDICTED: structural main (1099 aa) initn: 375 init1: 151 opt: 610 Z-score: 242.4 bits: 56.8 E(85289): 9.2e-07 Smith-Waterman score: 880; 25.8% identity (58.3% similar) in 1196 aa overlap (4-1133:3-1090) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQR-FTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLG-EKTSNLRV .: : .:.:::: : .. :. :.:: : :::::::..:.: :.:: . :..:. 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XP_011 GLSSNEDGAEATLAGQMMACKNDISKAQTEAKQAQMKLKHAQQELKNKQAEVKKMDSGYR 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KA0 TSKQSLEEQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGDARIDRQESSRQQRKAEI ....:: :.:. .: :.:: : .: ::: :.: . : :: : : : XP_011 KDQEALEAVKRLKEKL--EAEMKKLNYEE-NKE-----ESLLEKR--RQLSRDIGRLKET 450 460 470 480 490 510 520 530 540 pF1KA0 MESIKRLYPG---------------SVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAIIVD .:.. .:. : : . .: . . . :. : :. . ..:: XP_011 YEALLARFPNLRFAYKDPEKNWNRNCVKGLVASLISVKDTSATTALELVAGERLYNVVVD 500 510 520 530 540 550 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 SEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVK-PTDEKLR---ELKG---AKLVIDVIRYE .: ::. .. . .: :..::. . .. . : :: .: : .........:. 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XP_011 DLLQTKLQQSSYHKQQE------------ELDALKKTIEESEETLKNTKEIQRKAEEKY- 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KA0 EEFCREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHM :. .... : :. .:. . :.:.:. . :. : ....:: : XP_011 -----EVLENKMKNAEAER-ERELKDAQKKLDCAKTKA------DASSKKMKEKQ----- 780 790 800 810 840 850 860 870 880 890 pF1KA0 WEQTVKKDENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKK : :. :.:.::.:. . . .. . ... ..: . .:: ::.: . XP_011 --QEVEAITLELEELKREHTSYKQQLEAVNEAIKSYESQIEVMAAEVA-KNKE------S 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 pF1KA0 LGGANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMD-DISQEEGS .. :..:.:. .. .:: .: .. : .. . : :. :. .: .::... XP_011 VNKAQEEVTKQKEVITAQDTVIKAKYAE----VAKHKEQNNDSQLKIKELDHNISKHK-- 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA0 SQGEDSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSV ..:: :. ..:.. :. . . . . . . . .: . :::.:.. XP_011 REAED---GAAKVSKMLKDYDWINAERHLFGQPNSAYDFKTNNPKEAGQRLQKLQEMKEK 930 940 950 960 970 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA0 LQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFES : : . ::.::. : ....... . . ... .: ..:.. ... . .: ... XP_011 LGRNV--NMRAMNVLTEAEERYNDLMKKKRIVENDKSKILTTIEDLDQKKNQALNIAWQK 980 990 1000 1010 1020 1030 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KA0 VATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPE-EPYLDGINYNCVAPGKRFRP-MDNLSGGEKT : .. :...: .:.:.:.: :: . :::.... :: :. .. . .::::.. 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XP_011 REAED---GAAKVSKMLKDYDWINAERHLFGQPNSAYDFKTNNPKEAGQRLQKLQEMKEK 930 940 950 960 970 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA0 LQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFES : : . ::.::. : ....... . . ... .: ..:.. ... . .: ... XP_011 LGRNV--NMRAMNVLTEAEERYNDLMKKKRIVENDKSKILTTIEDLDQKKNQALNIAWQK 980 990 1000 1010 1020 1030 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KA0 VATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPE-EPYLDGINYNCVAPGKRFRP-MDNLSGGEKT : .. :...: .:.:.:.: :: . :::.... :: :. .. . .::::.. XP_011 VNKDFGSIFSTLL--PGANAMLAP--PEGQTVLDGLEFK-VALGNTWKENLTELSGGQRQ 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KA0 VAALALLFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFY XP_011 YEYFSDKNSRTILQVKGSSQAKGK 1100 1110 >>XP_011510614 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural main (1216 aa) initn: 535 init1: 243 opt: 603 Z-score: 239.3 bits: 56.4 E(85289): 1.4e-06 Smith-Waterman score: 1252; 26.6% identity (58.7% similar) in 1299 aa overlap (10-1228:18-1207) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPF-QRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGE .::::: :..:.::: .::. :::::::::::..:.. ::.: XP_011 MTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCIIGPNGSGKSNVIDSMLFVFGY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KA0 KTSNLRVKTLRDLIHGAPVGKPAAN---RAFVSMVYSEEGAE-----DRTF--ARVIV-G .....: : : :::.. : . .. . . ..:: . . .: .:. 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