Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0188
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0188, 890 aa
1>>>pF1KA0188 890 - 890 aa - 890 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5035+/-0.00103; mu= 11.3758+/- 0.062
mean_var=134.1007+/-26.940, 0's: 0 Z-trim(108.7): 29 B-trim: 291 in 1/50
Lambda= 0.110754
statistics sampled from 10397 (10409) to 10397 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16
Scan time: 4.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1682.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 ( 890) 5963 964.9 0
CCDS58701.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 ( 896) 5963 964.9 0
CCDS58699.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 ( 975) 4396 714.5 2.2e-205
CCDS11829.1 LPIN2 gene_id:9663|Hs108|chr18 ( 896) 2214 365.9 1.9e-100
CCDS33469.2 LPIN3 gene_id:64900|Hs108|chr20 ( 852) 1903 316.2 1.6e-85
CCDS58700.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 ( 459) 1633 272.9 9.5e-73
>>CCDS1682.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 (890 aa)
initn: 5963 init1: 5963 opt: 5963 Z-score: 5154.4 bits: 964.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5963; 100.0% identity (100.0% similar) in 890 aa overlap (1-890:1-890)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 REKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGASRMECQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 REKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGASRMECQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTSEDED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 KRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTSEDED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 MFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDREWSPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDREWSPTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSSRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPLLPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 ICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPLLPM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 IEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 IEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNGDP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREITK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREITK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATVES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 DAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATVES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 IMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHESSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 IMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHESSS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 CEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 CEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 YCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 YCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 TDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KA0 RLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
850 860 870 880 890
>>CCDS58701.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 (896 aa)
initn: 5963 init1: 5963 opt: 5963 Z-score: 5154.3 bits: 964.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5963; 100.0% identity (100.0% similar) in 890 aa overlap (1-890:7-896)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSRVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 MGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGAS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 RMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 TSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 EWSPTPSPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EWSPTPSPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 PLSSRKICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PLSSRKICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 APLLPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 APLLPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 PKNGDPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKNGDPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 HREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLP
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 KATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRV
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 KHESSSSDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KHESSSSDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQ
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 YQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQ
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 NGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEK
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 FKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKT
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 NISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
850 860 870 880 890
>>CCDS58699.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 (975 aa)
initn: 4381 init1: 4381 opt: 4396 Z-score: 3800.6 bits: 714.5 E(32554): 2.2e-205
Smith-Waterman score: 5854; 96.1% identity (96.1% similar) in 922 aa overlap (5-890:54-975)
10 20 30
pF1KA0 MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDII
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AWSWIPIMRDPGWIRNVWSSNINVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDII
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 VIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDN
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 DQEVIPMHLATSPILSEGASRMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DQEVIPMHLATSPILSEGASRMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKK
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 RRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPE
210 220 230 240 250 260
220 230 240
pF1KA0 ENLSLAVIYPQSASYPNSDREWSPTPS---------------------------------
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ENLSLAVIYPQSASYPNSDREWSPTPSSLVDCKRTAPHLAVAAEGGLSSSCPPQSSLFHP
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290
pF1KA0 ---PSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SESPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSS
330 340 350 360 370 380
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 RKICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RKICDKSHFQAIHSESSDTFSDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPLL
390 400 410 420 430 440
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 PMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNG
450 460 470 480 490 500
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 DPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREI
510 520 530 540 550 560
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 TKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATV
570 580 590 600 610 620
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 ESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKEESKPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHES
630 640 650 660 670 680
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 SSSDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSSDEERAAAKPSNAGHLPLLPNVSYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGT
690 700 710 720 730 740
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 CRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYK
750 760 770 780 790 800
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 FLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQ
810 820 830 840 850 860
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 CLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISS
870 880 890 900 910 920
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 YVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
930 940 950 960 970
>>CCDS11829.1 LPIN2 gene_id:9663|Hs108|chr18 (896 aa)
initn: 2887 init1: 1347 opt: 2214 Z-score: 1916.9 bits: 365.9 E(32554): 1.9e-100
Smith-Waterman score: 2960; 51.5% identity (74.9% similar) in 919 aa overlap (1-885:1-895)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRS
:::::::::::.:::::::::.: ::::::::.::..: .:. :::::::::::.:::::
CCDS11 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGKLGVLRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA0 REKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGA--SRMEC
.:::.:::::: .::::::::::::::::.::... : .: .:::::: .: . ..
CCDS11 KEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 QLKRGSVDRMRGLDPSTPAQV--IAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTS
: ... :. :: ... . .:: . : :::...::.: . :: :.... ..
CCDS11 PLVKSGGDET----PSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDS-KKEEQAASA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDREW
:: . .:::. . ...: : .. ::. . ... .. :: :: .:
CCDS11 AAEDTCDVGVSSDDD-KGAQAARGSSNA------SLKEEECKEPLLFHSGDHYPLSDGDW
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 SPTPSPSGSRPST--PKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESS
:: . . :.: ::::::: : .: ... .: : :: .:...: :. .. .
CCDS11 SPLET---TYPQTACPKSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERSDHHP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KA0 PLSSRKICDKSHFQAIHSES---SDTFSDQSP-----TLVGG---ALLDQNKPQTEMQFV
.. ...::..: ::. :.. .: : :.: :: : . : . .
CCDS11 RTATITPSENTHFRVIPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTSVAEL
290 300 310 320 330 340
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CCDS11 LEPPLESTQISSMLDADHLPNAALAEAPSES--KPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQGPDDI
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CCDS11 YLDDLKGLEPEVAALYFPKSESEPG-SRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTECLSDS
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460 470 480 490 500 510
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CCDS11 AMDLPDVTLSLCGGLSENGEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRYYNWA
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520 530 540 550 560 570
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CCDS11 LAAPMILSLQVFQKSLPKATVESWVKDKMPKKSGRWWF-WRKRESMTKQLPESKEGKSEA
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CCDS11 PPASDLPSSSKEPA----GARPAENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTTSYKK
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CCDS11 SLRLSSDQIAKLKLHDGPNDVVFSITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGTITKS
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CCDS11 DALGQILPQLGKDWTHQGIAKLYHSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNDKGTI
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CCDS11 LPRGPLMLSPSSLFSAFHREVIEKKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRPNDVY
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CCDS11 AYTQVGVPDCRIFTVNPKGELIQERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFPCPE-
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CCDS11 FSSFCYWRDPIPEVDLDDLS
880 890
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CCDS33 REKVVDIELNGEPVDLHMKLGDSGEAFFVQELESDDEHVPPGLCTSPIPWGGLSGFPSDS
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CCDS33 QLGTASEPEGL-------VMA-----GTASTGRRKRRRRRKPK----QKEDAVAT----D
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CCDS33 SSPEELEAGAESELSLPEKLRPE--PPGSVQL-EEKSSL---QPKDI-YPYSDGEWPPQA
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CCDS33 SLSAGELTSPKSDSELEVRTPEPSPLRAESHMQWAWGRLPKVARAERPESSVVLEGRAGA
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CCDS33 TSPPRGGPSTPSTSVAGGVDPLGLPIQQTEAGADLQPDTEDPTLVGPPLHTPETEESKTQ
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CCDS33 SSGDMGLPPASKSWSWATL--EVPVPTGQPERVSRGKGSP-----KRSQHLGPSDIYLDD
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CCDS33 LPSLDSENAALYFPQSD--SGL-------GARRWSEPSSQKSLRDPNPEHEPEPTLD---
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CCDS33 TVDTIALSLCGGLADSRDISLEKFNQHSVSYQDLTKNPGLLDDPNLVVKINGKHYNWAVA
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CCDS33 APMILSLQAFQKNLPKSTMDKLEREKMPRKGGRWWFSWRRRDFLAEERSAQKEKTAAKEQ
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CCDS33 Q-GEKTEVLS------SDDDAPDSPVILEIPSLPPSTP--PSTPTYKKSLRLSSDQIRRL
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CCDS33 NLQEGANDVVFSVTTQYQGTCRCKATIYLWKWDDKVVISDIDGTITKSDALGHILPQLGK
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CCDS33 DWTHQGITSLYHKIQLNGYKFLYCSARAIGMADLTKGYLQWVSEGGCSLPKGPILLSPSS
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CCDS33 LFSALHREVIEKKPEVFKVACLSDIQQLFLPHGQPFYAAFGNRPNDVFAYRQVGLPESRI
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CCDS33 FTVNPRGELIQELIKNHKSTYERLGEVVELLFPPVARGPSTDLA-NPEYSNFCYWREPLP
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pF1KA0 PFENQDIHSASA
CCDS33 AVDLDTLD
850
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CCDS58 MSRVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGK
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CCDS58 MGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGAS
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CCDS58 RMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQVIAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMN
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CCDS58 TSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDR
190 200 210 220 230 240
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pF1KA0 EWSPTPS------------------------------------PSGSRPSTPKSDSELVS
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CCDS58 EWSPTPSSLVDCKRTAPHLAVAAEGGLSSSCPPQSSLFHPSESPSGSRPSTPKSDSELVS
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CCDS58 KSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSSRKICDKSHFQAIHSESSDTF
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CCDS58 SDQSPTLVGGALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPLLPMIEELKPPSASVVQTANKT
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CCDS58 DSPSRKRDKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKK
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]