Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0189
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0189, 1023 aa
1>>>pF1KA0189 1023 - 1023 aa - 1023 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8280+/-0.000949; mu= 6.7680+/- 0.057
mean_var=200.2301+/-40.638, 0's: 0 Z-trim(112.8): 122 B-trim: 198 in 1/51
Lambda= 0.090638
statistics sampled from 13411 (13533) to 13411 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16
Scan time: 4.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14390.1 STARD8 gene_id:9754|Hs108|chrX (1023) 6975 925.3 0
CCDS48134.1 STARD8 gene_id:9754|Hs108|chrX (1103) 6975 925.3 0
CCDS5990.1 DLC1 gene_id:10395|Hs108|chr8 (1091) 2333 318.3 5.5e-86
CCDS83253.1 DLC1 gene_id:10395|Hs108|chr8 (1125) 2333 318.3 5.7e-86
CCDS5989.1 DLC1 gene_id:10395|Hs108|chr8 (1528) 2333 318.4 7.2e-86
CCDS9350.1 STARD13 gene_id:90627|Hs108|chr13 ( 995) 2307 314.9 5.4e-85
CCDS9349.1 STARD13 gene_id:90627|Hs108|chr13 (1105) 2307 314.9 5.9e-85
CCDS9348.1 STARD13 gene_id:90627|Hs108|chr13 (1113) 2307 314.9 5.9e-85
CCDS55201.1 DLC1 gene_id:10395|Hs108|chr8 (1017) 2300 314.0 1e-84
>>CCDS14390.1 STARD8 gene_id:9754|Hs108|chrX (1023 aa)
initn: 6975 init1: 6975 opt: 6975 Z-score: 4938.1 bits: 925.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6975; 99.9% identity (99.9% similar) in 1023 aa overlap (1-1023:1-1023)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTLNNCASMKLEVHFQSKQNEDSEEEEQCTISSHWAFQQESKCWSPMGSSDLLAPPSPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MTLNNCASMKLEVHFQSKQNEDSEEEEQCTISSHWAFQQESKCWSPMGSSDLLAPPSPGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PATSSCESVLTELSATSLPVITVSLPPEPADLPLPGRAPSSSDRPLLSPTQGQEGPQDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PATSSCESVLTELSATSLPVITVSLPPEPADLPLPGRAPSSSDRPLLSPTQGQEGPQDKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KKRHRNRSFLKHLESLRRKEKSGSQQAEPKHSPATSEKVSKASSFRSCRGFLSAGFYRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KKRHRNRSFLKHLESLRRKEKSGSQQAEPKHSPATSEKVSKASSFRSCRGFLSAGFYRAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 NWAATSAGGSGANTRKAWEAWPVASFRHPQWTHRGDCLVHVPGDHKPGTFPRSLSIESLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NWAATSAGGSGANTRKAWEAWPVASFRHPQWTHRGDCLVHVPGDHKPGTFPRSLSIESLC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 PEDGHRLADWQPGRRWGCEGRRGSCGSTGSHASTYDNLPELYPAEPVMVGAEAEDEDDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PEDGHRLADWQPGRRWGCEGRRGSCGSTGSHASTYDNLPELYPAEPVMVGAEAEDEDDEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SGGSYAHLDDILQHVWGLQQRVELWSRAMYPDLGPGDEEEEEATSSVEIATVEVKCQAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SGGSYAHLDDILQHVWGLQQRVELWSRAMYPDLGPGDEEEEEATSSVEIATVEVKCQAEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LSQMEVPAHGESPAWAQAEVQPAVLAPAQAPAEAEPVAQEEAEAPAPAPAPAPAQDSEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LSQMEVPAHGESPAWAQAEVQPAVLAPAQAPAEAEPVAQEEAEAPAPAPAPAPAQDSEQE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 AHSGGEPTFASSLSVEEGHSISDTVASSSELDSSGNSMNEAEAAGSLAGLQASMPRERRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS14 AHSGGEPTFASSLSVEEGHSISDTVASSSELDSSGNSMNEAEAAGPLAGLQASMPRERRD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SGVGASLTRPCRKLRWHSFQNSHRPSLNSESLEINRQFAGQINLLHKGSLLRLTAFMEKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SGVGASLTRPCRKLRWHSFQNSHRPSLNSESLEINRQFAGQINLLHKGSLLRLTAFMEKY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 TVPHKQGWVWSMPKFMRRNKTPDYRGQHVFGVPPLIHVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRSQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVPHKQGWVWSMPKFMRRNKTPDYRGQHVFGVPPLIHVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRSQC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LDQVGIFRKSGVKSRIQNLRQMNETSPDNVCYEGQSAYDVADLLKQYFRDLPEPIFTSKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LDQVGIFRKSGVKSRIQNLRQMNETSPDNVCYEGQSAYDVADLLKQYFRDLPEPIFTSKL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 TTTFLQIYQLLPKDQWLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYFLSDIASAEENQMTAGNLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TTTFLQIYQLLPKDQWLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYFLSDIASAEENQMTAGNLAV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 CLAPSIFHLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGRPGPRDLSDNMAATQGLSHMISDCKKLFQVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CLAPSIFHLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGRPGPRDLSDNMAATQGLSHMISDCKKLFQVP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QDMVLQLCSSYSAAELSPPGPALAELRQAQAAGVSLSLYMEENIQDLLRDAAERFKGWMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QDMVLQLCSSYSAAELSPPGPALAELRQAQAAGVSLSLYMEENIQDLLRDAAERFKGWMS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 VPGPQHTELACRKAPDGHPLRLWKASTEVAAPPAVVLHRVLRERALWDEDLLRAQVLEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VPGPQHTELACRKAPDGHPLRLWKASTEVAAPPAVVLHRVLRERALWDEDLLRAQVLEAL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 MPGVELYHYVTDSMAPHPCRDFVVLRMWRSDLPRGGCLLVSQSLDPEQPVPESGVRALML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPGVELYHYVTDSMAPHPCRDFVVLRMWRSDLPRGGCLLVSQSLDPEQPVPESGVRALML
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 TSQYLMEPCGLGRSRLTHICRADLRGRSPDWYNKVFGHLCAMEVAKIRDSFPTLQAAGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TSQYLMEPCGLGRSRLTHICRADLRGRSPDWYNKVFGHLCAMEVAKIRDSFPTLQAAGPE
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 TKL
:::
CCDS14 TKL
>>CCDS48134.1 STARD8 gene_id:9754|Hs108|chrX (1103 aa)
initn: 6975 init1: 6975 opt: 6975 Z-score: 4937.6 bits: 925.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6975; 99.9% identity (99.9% similar) in 1023 aa overlap (1-1023:81-1103)
10 20 30
pF1KA0 MTLNNCASMKLEVHFQSKQNEDSEEEEQCT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EGSFPLDIGSVKKNHGFLDEDSLGALCRRLMTLNNCASMKLEVHFQSKQNEDSEEEEQCT
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 ISSHWAFQQESKCWSPMGSSDLLAPPSPGLPATSSCESVLTELSATSLPVITVSLPPEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ISSHWAFQQESKCWSPMGSSDLLAPPSPGLPATSSCESVLTELSATSLPVITVSLPPEPA
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 DLPLPGRAPSSSDRPLLSPTQGQEGPQDKAKKRHRNRSFLKHLESLRRKEKSGSQQAEPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DLPLPGRAPSSSDRPLLSPTQGQEGPQDKAKKRHRNRSFLKHLESLRRKEKSGSQQAEPK
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 HSPATSEKVSKASSFRSCRGFLSAGFYRAKNWAATSAGGSGANTRKAWEAWPVASFRHPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HSPATSEKVSKASSFRSCRGFLSAGFYRAKNWAATSAGGSGANTRKAWEAWPVASFRHPQ
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 WTHRGDCLVHVPGDHKPGTFPRSLSIESLCPEDGHRLADWQPGRRWGCEGRRGSCGSTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WTHRGDCLVHVPGDHKPGTFPRSLSIESLCPEDGHRLADWQPGRRWGCEGRRGSCGSTGS
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 HASTYDNLPELYPAEPVMVGAEAEDEDDEESGGSYAHLDDILQHVWGLQQRVELWSRAMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HASTYDNLPELYPAEPVMVGAEAEDEDDEESGGSYAHLDDILQHVWGLQQRVELWSRAMY
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 PDLGPGDEEEEEATSSVEIATVEVKCQAEALSQMEVPAHGESPAWAQAEVQPAVLAPAQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PDLGPGDEEEEEATSSVEIATVEVKCQAEALSQMEVPAHGESPAWAQAEVQPAVLAPAQA
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 PAEAEPVAQEEAEAPAPAPAPAPAQDSEQEAHSGGEPTFASSLSVEEGHSISDTVASSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PAEAEPVAQEEAEAPAPAPAPAPAQDSEQEAHSGGEPTFASSLSVEEGHSISDTVASSSE
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 LDSSGNSMNEAEAAGSLAGLQASMPRERRDSGVGASLTRPCRKLRWHSFQNSHRPSLNSE
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LDSSGNSMNEAEAAGPLAGLQASMPRERRDSGVGASLTRPCRKLRWHSFQNSHRPSLNSE
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 SLEINRQFAGQINLLHKGSLLRLTAFMEKYTVPHKQGWVWSMPKFMRRNKTPDYRGQHVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SLEINRQFAGQINLLHKGSLLRLTAFMEKYTVPHKQGWVWSMPKFMRRNKTPDYRGQHVF
600 610 620 630 640 650
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 GVPPLIHVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRSQCLDQVGIFRKSGVKSRIQNLRQMNETSPDNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GVPPLIHVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRSQCLDQVGIFRKSGVKSRIQNLRQMNETSPDNV
660 670 680 690 700 710
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 CYEGQSAYDVADLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQLLPKDQWLAAAQAATLLLPDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CYEGQSAYDVADLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQLLPKDQWLAAAQAATLLLPDE
720 730 740 750 760 770
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 NREVLQTLLYFLSDIASAEENQMTAGNLAVCLAPSIFHLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NREVLQTLLYFLSDIASAEENQMTAGNLAVCLAPSIFHLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGR
780 790 800 810 820 830
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 PGPRDLSDNMAATQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVLQLCSSYSAAELSPPGPALAELRQAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PGPRDLSDNMAATQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVLQLCSSYSAAELSPPGPALAELRQAQ
840 850 860 870 880 890
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 AAGVSLSLYMEENIQDLLRDAAERFKGWMSVPGPQHTELACRKAPDGHPLRLWKASTEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AAGVSLSLYMEENIQDLLRDAAERFKGWMSVPGPQHTELACRKAPDGHPLRLWKASTEVA
900 910 920 930 940 950
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 APPAVVLHRVLRERALWDEDLLRAQVLEALMPGVELYHYVTDSMAPHPCRDFVVLRMWRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 APPAVVLHRVLRERALWDEDLLRAQVLEALMPGVELYHYVTDSMAPHPCRDFVVLRMWRS
960 970 980 990 1000 1010
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 DLPRGGCLLVSQSLDPEQPVPESGVRALMLTSQYLMEPCGLGRSRLTHICRADLRGRSPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DLPRGGCLLVSQSLDPEQPVPESGVRALMLTSQYLMEPCGLGRSRLTHICRADLRGRSPD
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1000 1010 1020
pF1KA0 WYNKVFGHLCAMEVAKIRDSFPTLQAAGPETKL
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WYNKVFGHLCAMEVAKIRDSFPTLQAAGPETKL
1080 1090 1100
>>CCDS5990.1 DLC1 gene_id:10395|Hs108|chr8 (1091 aa)
initn: 2150 init1: 1061 opt: 2333 Z-score: 1657.2 bits: 318.3 E(32554): 5.5e-86
Smith-Waterman score: 2416; 41.4% identity (62.6% similar) in 1132 aa overlap (2-1022:68-1089)
10 20 30
pF1KA0 MTLNNCASMKLEVHFQSKQNEDSEEEEQCTI
:::.:: ::::. . :...::.:.: :.:
CCDS59 FLFPIDISLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAI
40 50 60 70 80 90
40 50 60
pF1KA0 SSHWAFQQESKCWSPMGSSDLLAP-----------------PSPG-----LPATSSCESV
:..:.::..:: :: . :...: :::: : . ::
CCDS59 SGKWTFQRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSHPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSV
100 110 120 130 140 150
70 80 90 100 110
pF1KA0 LTELSATSLPVITVSLPPEPADLP-------------LPGRAPS----SSDRPLLSPTQG
. :. ::: . . : : : : : : : : . : : . .
CCDS59 RSLSSTGSLP--SHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFS
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160
pF1KA0 QEGPQDKAKKRHRNRSFLKHLESLRRKEKSGSQQAEPKH------SPATSEKVSKA----
..: . ::. ..::.::..:::. : . :.. :.. .: .: ...
CCDS59 MKGHEKTAKS--KTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQ
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200
pF1KA0 ------SSFRSCRGFLSAGFYRAK---NWAATSAGGSGANTRKAWEAW-PVASFRH----
:.. . : ... . : . : . ::...: ..: .: . ::. :
CCDS59 LNCVEISALNGNR--INVPMVRKRSVSNSTQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSAC
280 290 300 310 320 330
210 220 230 240
pF1KA0 ------------P--QWTHRG--------------DCLVHVPGDHKPGTFPRSLSIESLC
: : : . : . ..: ::::::::..:. :.
CCDS59 NKRVGMYLEGFDPFNQSTFNNVVEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFS
340 350 360 370 380 390
250 260 270 280
pF1KA0 PEDGHRLADWQ------PG----RRWGCEG------RRGSCGSTGSHASTYDNLPELYPA
: .. ..:. :: :: . ::.: .: .:. : :::.:
CCDS59 PSGNNGSVNWRTGSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVP-----
400 410 420 430 440
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 EPVMVGAEAEDEDDEESGGSYAHLDDILQHVWGLQQRVELWSRAMYPDLGPGDEEEEEAT
.. . . : : :. . .::::: :: :.:. :. ::. . : : .: :
CCDS59 -GSILYSSSGDLADLENEDIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEK-FSDEGDSD----SAL
450 460 470 480 490 500
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 SSVEIATVEVKCQAEALSQMEVPAHGESPAWAQAEVQPAVLAPAQAPAEAEPVAQEEAEA
.::
CCDS59 DSV---------------------------------------------------------
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 PAPAPAPAPAQDSEQEAHSGGEPTFASSLSVEEGHSISDTVASSSELDSSGNSMNEAEAA
.: :. : .. : :.:.. .. . :.:::.:::.:: :
CCDS59 ---SPCPS----SPKQIH----------LDVDNDRT------TPSDLDSTGNSLNEPEEP
510 520 530 540
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 GSLAGLQASMPRERRDSGVGASLTRPCR-KLRWHSFQNSHRPSLNSESLEINRQFAGQIN
. .: ::::::::::::: : .:::::::.:::::::: ::.:: : ..:.:
CCDS59 -------SEIP-ERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMN
550 560 570 580 590
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 LLHKGSLLRLTAFMEKYTVPHKQGWVWSMPKFMRRNKTPDYRGQHVFGVPPLIHVQRTGQ
::.: :::.:::..:::: .:.:. :..::::.: :.:::. . ::::: ..::::::
CCDS59 LLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQ
600 610 620 630 640 650
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 PLPQSIQQAMRYLRSQCLDQVGIFRKSGVKSRIQNLRQMNETSPDNVCYEGQSAYDVADL
::::::::::::::..::::::.::::::::::: :::::: . : : :::::::::::.
CCDS59 PLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQSAYDVADM
660 670 680 690 700 710
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 LKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQLLPKDQWLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYFLS
:::::::::::..:.::. ::::::: .:::: : : .:: .::::::::::::::::::
CCDS59 LKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLS
720 730 740 750 760 770
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 DIASA-EENQMTAGNLAVCLAPSIFHLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGRPGPRDLSDNMAA
:...: .::::: :::::::::.::::. :... :::. .... .:.: .::..:.::
CCDS59 DVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAA
780 790 800 810 820 830
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 TQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVLQLC-SSYSAAELSP-PGPALAELRQAQAAGVSLSLYM
::::.:::..::::::::..: . : .::. ::.: ::..: . ..: . . ..
CCDS59 TQGLAHMIAECKKLFQVPEEM--SRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSA--DYQHFL
840 850 860 870 880
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 EENIQDLLRDAAERFKGWMSVPGPQHTELACRKAPDGHPLRLWKASTEVAAPPAVVLHRV
.. .. :.... :.::::.: ...::. .:. .: :::::.. :: : : .:.:.
CCDS59 QDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEILKRL
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CCDS93 G-SPGGTGMRNTTSSESVLTDLSEPEVCSIHSESSGGSDSRSQPGQCCTDNPVMLDAPLV
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pF1KA0 ---QAEP----------------KHSPAT--------SEKVSKASS--FRSCRGFLSAGF
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CCDS93 KERKCHEANKRGGMYLEDLDVLAGTALPDAGDQSRMHEFHSQENLVVHIPKDHKPGTFPK
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240 250 260 270 280
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CCDS93 ALSIESLSPTDSSNGVNWRTGSISLGREQVPGAREPRLMASC-HRASRVSIYDNVPGSHL
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CCDS93 Y--------ASTGDLLDLEKDDLFPHLDDILQHVNGLQEVVDDWSKDVLPELQTHD----
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pF1KA0 EATSSVEIATVEVKCQAEALSQMEVPAHGESPAWAQAEVQPAVLAPAQAPAEAEPVAQEE
. : ::
CCDS93 ---TLV----------------------GE------------------------------
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CCDS93 ---PGLSTFPSPNQITLD---------F-------EGNSVSEGRTTPSDVERDVTSLNES
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pF1KA0 EAAGSLAGLQASMPRERRDSGVGASLTRPCRKLRWHSFQNSHRPSLNSESLEINRQFAGQ
: : :.::::::::::::: :.:::.::: ::.: : .:. : :.:
CCDS93 EPPGV---------RDRRDSGVGASLTRPNRRLRWNSFQLSHQPRPAPASPHISSQTASQ
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CCDS93 LSLLQRFSLLRLTAIMEKHSMSNKHGWTWSVPKFMKRMKVPDYKDKAVFGVPLIVHVQRT
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CCDS93 GQPLPQSIQQALRYLRSNCLDQVGLFRKSGVKSRIHALRQMNENFPENVNYEDQSAYDVA
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:..::.:::::::.::.::. :::.::: . :.: : :.::: ::: ::::::::::: :
CCDS93 DMVKQFFRDLPEPLFTNKLSETFLHIYQYVSKEQRLQAVQAAILLLADENREVLQTLLCF
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CCDS93 LNDVVNLVEENQMTPMNLAVCLAPSLFHLNLLKKES-SPRVIQKKYATGKPDQKDLNENL
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pF1KA0 AATQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVLQLCSSYSAAELSPPGPALAEL-RQAQAAGVSLSLY
::.:::.::: .: .::.::...: : .:: ::. :.: :: : . .:... :
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pF1KA0 MEENIQDLLRDAAERFKGWMSVPGPQHTELACRKAPDGHPLRLWKASTEVAAPPAVVLHR
... :: : ..: :.::::.. . ..:.:: .:. ::.::.:::::.:: :::.:::.:
CCDS93 LNHLIQGLQKEAKEKFKGWVTCSSTDNTDLAFKKVGDGNPLKLWKASVEVEAPPSVVLNR
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pF1KA0 VLRERALWDEDLLRAQVLEALMPGVELYHYVTDSMAPHPCRDFVVLRMWRSDLPRGGCLL
::::: :::::... .:.:.: .:.:.:: .:::::: ::::::: :..:::.: : :
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:: :.. :. .::::... ::::.:::: :.:::::::: ::.:.::.::.: ::::
CCDS93 VSLSVEHEEAQLLGGVRAVVMDSQYLIEPCGSGKSRLTHICRIDLKGHSPEWYSKGFGHL
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::..:.:: :.. :: : :: ..::
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: .. . . .::.: ::::::::..:::::: : :. ..:. : :
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: : .:: .:..: :::.: .:: : . : : :. . ::::::
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.:. ::.::.:::::.:: :::.:::.:::::: :::::... .:.:.: .:.:.::
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pF1KA0 MTLNNCASMKLEVHFQSKQNEDSEEEEQCTI
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. ::. : : ::.: . : :... : : .::
CCDS93 SESSGGSDSRSQPGQCCTDNPVMLDAPLVSSSLPQPPRDVLNHPFHPKNEKPTRARAKSF
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pF1KA0 LKHLESLR------RKEKSGSQ----------QAEP----------------KHSPAT--
::..:.:: :.. :: : :: ..::
CCDS93 LKRMETLRGKGAHGRHKGSGRTGGLVISGPMLQQEPESFKAMQCIQIPNGDLQNSPPPAC
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: : : :: .: : . . . : :.. :: . : : : :.
CCDS93 RKGLPCSGKSSGESSPSEHSSSGVSTPCLKERKCHEANKRGGMYLEDLDVLAGTALPDAG
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: .. . . .::.: ::::::::..:::::: : :. ..:. : :
CCDS93 DQSRMHEFHSQENLVVHIPKDHKPGTFPKALSIESLSPTDSSNGVNWRTGSISLGREQVP
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: : .:: .:..: :::.: .:: : . : : :. . ::::::
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pF1KA0 KSRIQNLRQMNETSPDNVCYEGQSAYDVADLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQLLP
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CCDS93 KSRIHALRQMNENFPENVNYEDQSAYDVADMVKQFFRDLPEPLFTNKLSETFLHIYQYVS
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pF1KA0 KDQWLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYFLSDIAS-AEENQMTAGNLAVCLAPSIFHLNV
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CCDS93 KEQRLQAVQAAILLLADENREVLQTLLCFLNDVVNLVEENQMTPMNLAVCLAPSLFHLNL
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pF1KA0 SKKDSPSPRIKSKRSLIGRPGPRDLSDNMAATQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVLQLCSSY
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CCDS93 LKKES-SPRVIQKKYATGKPDQKDLNENLAAAQGLAHMIMECDRLFEVPHELVAQSRNSY
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pF1KA0 SAAELSPPGPALAEL-RQAQAAGVSLSLYMEENIQDLLRDAAERFKGWMSVPGPQHTELA
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CCDS93 LNSMAPHPSRDFVVLRTWKTDLPKGMCTLVSLSVEHEEAQLLGGVRAVVMDSQYLIEPCG
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CCDS93 SGKSRLTHICRIDLKGHSPEWYSKGFGHLCAAEVARIRNSFQPLIAEGPETKI
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CCDS55 MKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLV
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CCDS55 PGSPDDSHPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSSTGSLP--SHAPPSEDAATPRTNSV
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CCDS55 ISVCSSSNLAGNDDSFGSLPSPKELSSFSFSMKGHEKTAKS--KTRSLLKRMESLKLKSS
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CCDS55 HHSKHKAPSKLGLIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALNGNR--INVPMVRKRSVSNS
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190 200 210
pF1KA0 AATSAGGSGANTRKAWEAW-PVASFRH----------------P--QWTHRG--------
. ::...: ..: .: . ::. : : : : .
CCDS55 TQTSSSSSQSETSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFDPFNQSTFNNVVEQNFKN
230 240 250 260 270 280
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pF1KA0 ------DCLVHVPGDHKPGTFPRSLSIESLCPEDGHRLADWQ------PG----RRWGCE
: . ..: ::::::::..:. :. : .. ..:. :: :: .
CCDS55 RESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRTGSFHGPGHISLRRENSS
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::.: .: .:. : :::.: .. . . : : :. . .:::::
CCDS55 DSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVP------GSILYSSSGDLADLENEDIFPELDDILY
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:: :.:. :. ::. . : : .: : .::
CCDS55 HVKGMQRIVNQWSEK-FSDEGDSDS----ALDSV--------------------------
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.: :. : .. : :
CCDS55 ------------------------------SPCPS--------SPKQIH----------L
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pF1KA0 SVEEGHSISDTVASSSELDSSGNSMNEAEAAGSLAGLQASMPRERRDSGVGASLTRPCR-
.:.. .. . :.:::.:::.:: : . .: ::::::::::::: :
CCDS55 DVDNDRT------TPSDLDSTGNSLNEPEEP-------SEIP-ERRDSGVGASLTRSNRH
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.:::::::.:::::::: ::.:: : ..:.:::.: :::.:::..:::: .:.:. :..
CCDS55 RLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAV
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::::.: :.:::. . ::::: ..::::::::::::::::::::..::::::.::::::
CCDS55 PKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGV
550 560 570 580 590 600
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pF1KA0 KSRIQNLRQMNETSPDNVCYEGQSAYDVADLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQLLP
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