Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0229
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0229, 1134 aa
1>>>pF1KA0229 1134 - 1134 aa - 1134 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1596+/-0.00112; mu= 7.2637+/- 0.068
mean_var=309.9147+/-63.046, 0's: 0 Z-trim(113.2): 185 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.072854
statistics sampled from 13696 (13886) to 13696 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.427), width: 16
Scan time: 4.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4798.1 ANKS1A gene_id:23294|Hs108|chr6 (1134) 7530 806.3 0
CCDS55872.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 (1248) 1377 159.6 4.2e-38
CCDS55869.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 ( 460) 1037 123.4 1.2e-27
CCDS55865.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 ( 357) 1026 122.1 2.3e-27
CCDS55864.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 ( 254) 1005 119.7 8.5e-27
CCDS55870.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 ( 510) 715 89.6 2e-17
CCDS11723.1 CASKIN2 gene_id:57513|Hs108|chr17 (1202) 672 85.5 8.2e-16
CCDS55866.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 ( 414) 658 83.5 1.1e-15
CCDS55867.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 ( 426) 658 83.5 1.1e-15
CCDS55868.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 ( 450) 658 83.5 1.2e-15
CCDS55871.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 ( 394) 654 83.1 1.4e-15
CCDS42103.1 CASKIN1 gene_id:57524|Hs108|chr16 (1431) 621 80.2 3.8e-14
CCDS45775.1 CASKIN2 gene_id:57513|Hs108|chr17 (1120) 548 72.4 6.6e-12
>>CCDS4798.1 ANKS1A gene_id:23294|Hs108|chr6 (1134 aa)
initn: 7530 init1: 7530 opt: 7530 Z-score: 4293.3 bits: 806.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7530; 99.9% identity (99.9% similar) in 1134 aa overlap (1-1134:1-1134)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGKEQELLEAARTGHLPAVEKLLSGKRLSSGFGGGGGGGSGGGGGGSGGGGGGLGSSSHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGKEQELLEAARTGHLPAVEKLLSGKRLSSGFGGGGGGGSGGGGGGSGGGGGGLGSSSHP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LSSLLSMWRGPNVNCVDSTGYTPLHHAALNGHKDVVEVLLRNDALTNVADSKGCYPLHLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSSLLSMWRGPNVNCVDSTGYTPLHHAALNGHKDVVEVLLRNDALTNVADSKGCYPLHLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 AWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQNNDNETALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQNNDNETALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SNYQTEMGSALHEAALFGKTDVVQILLAAGTDVNIKDNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SNYQTEMGSALHEAALFGKTDVVQILLAAGTDVNIKDNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLISSMDSISQKSQGDVEKAVTELIIDFDANAEEEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LIEDHMTGKRSTKEVDKTPPPQPPLISSMDSISQKSQGDVEKAVTELIIDFDANAEEEGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 YEALYNAISCHSLDSMASGRSSDQDSTNKEAEAAGVKPAGVRPRERPPPPAKPPPDEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YEALYNAISCHSLDSMASGRSSDQDSTNKEAEAAGVKPAGVRPRERPPPPAKPPPDEEEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DHIDKKYFPLTASEVLSMRPRIHGSAAREEDEHPYELLLTAETKKVVLVDGKTKDHRRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DHIDKKYFPLTASEVLSMRPRIHGSAAREEDEHPYELLLTAETKKVVLVDGKTKDHRRSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SSRSQDSAEGQDGQVPEQFSGLLHGSSPVCEVGQDPFQLLCTAGQSHPDGSPQQGACHKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSRSQDSAEGQDGQVPEQFSGLLHGSSPVCEVGQDPFQLLCTAGQSHPDGSPQQGACHKA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SMQLEETGVHAPGASQPSALDQSKRVGYLTGLPTTNSRSHPETLTHTASPHPGGAEEGDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SMQLEETGVHAPGASQPSALDQSKRVGYLTGLPTTNSRSHPETLTHTASPHPGGAEEGDR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SGARSRAPPTSKPKAELKLSRSLSKSDSDLLTCSPTEDATMGSRSESLSNCSIGKKRLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SGARSRAPPTSKPKAELKLSRSLSKSDSDLLTCSPTEDATMGSRSESLSNCSIGKKRLEK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SPSFASEWDEIEKIMSSIGEGIDFSQERQKISGSRTLEQSVGEWLESIGLQQYESKLLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SPSFASEWDEIEKIMSSIGEGIDFSQERQKISGLRTLEQSVGEWLESIGLQQYESKLLLN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GFDDVHFLGSNVMEEQDLRDIGISDPQHRRKLLQAARSLPKVKALGYDGNSPPSVPSWLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GFDDVHFLGSNVMEEQDLRDIGISDPQHRRKLLQAARSLPKVKALGYDGNSPPSVPSWLD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 SLGLQDYVHSFLSSGYSSIDTVKNLWELELVNVLKVQLLGHRKRIIASLADRPYEEPPQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLGLQDYVHSFLSSGYSSIDTVKNLWELELVNVLKVQLLGHRKRIIASLADRPYEEPPQK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 PPRFSQLRCQDLLSQTSSPLSQNDSCTGRSADLLLPPGDTGRRRHDSLHDPAAPSRAERF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPRFSQLRCQDLLSQTSSPLSQNDSCTGRSADLLLPPGDTGRRRHDSLHDPAAPSRAERF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RIQEEHREAKLTLRPPSLAAPYAPVQSWQHQPEKLIFESCGYEANYLGSMLIKDLRGTES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RIQEEHREAKLTLRPPSLAAPYAPVQSWQHQPEKLIFESCGYEANYLGSMLIKDLRGTES
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 TQDACAKMRKSTEHMKKIPTIILSITYKGVKFIDASNKNVIAEHEIRNISCAAQDPEDLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TQDACAKMRKSTEHMKKIPTIILSITYKGVKFIDASNKNVIAEHEIRNISCAAQDPEDLC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 TFAYITKDLQTSHHYCHVFSTVDVNLTYEIILTLGQAFEVAYQLALQAQKSRATGASAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TFAYITKDLQTSHHYCHVFSTVDVNLTYEIILTLGQAFEVAYQLALQAQKSRATGASAAE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 MIETKSSKPVPKPRVGVRKSALEPPDMDQDAQSHASVSWVVDPKPDSKRSLSTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MIETKSSKPVPKPRVGVRKSALEPPDMDQDAQSHASVSWVVDPKPDSKRSLSTN
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS55872.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 (1248 aa)
initn: 3090 init1: 1310 opt: 1377 Z-score: 797.6 bits: 159.6 E(32554): 4.2e-38
Smith-Waterman score: 2838; 46.3% identity (65.4% similar) in 1172 aa overlap (1-1021:1-1145)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGKEQELLEAARTGHLPAVEKLLSGKRLSSGFGGGGGGGSGGGGGGSGGGGGGLGSSSHP
:::.::::::::::.. :::::::.. :: :::.: : :
CCDS55 MGKDQELLEAARTGNVALVEKLLSGRK----------------GGILGGGSGPL-----P
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LSSLLSMWRGPNVNCVDSTGYTPLHHAALNGHKDVVEVLLRNDALTNVADSKGCYPLHLA
::.:::.::::::::.::.::: :::::::::::.: ::. .: :::::.:: .:.:::
CCDS55 LSNLLSIWRGPNVNCTDSSGYTALHHAALNGHKDIVLKLLQYEASTNVADNKGYFPIHLA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 AWKGDAQIVRLLIHQGPSHTRVNEQNNDNETALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNN
:::::..::..:::.::::.:::::::.:::::::::::::.::: ::::::::::.::.
CCDS55 AWKGDVEIVKILIHHGPSHSRVNEQNNENETALHCAAQYGHSEVVAVLLEELTDPTIRNS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 KFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAHPNLLSCNTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMD
:.:::::::::::::.::::...:::::.::::.:::::::::::::::::::::.::::
CCDS55 KLETPLDLAALYGRLRVVKMIISAHPNLMSCNTRKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLEAGMD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SNYQTEMGSALHEAALFGKTDVVQILLAAGTDVNIKDNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAA
. ::: ::::::::::::.:::..:: .: :.::::. : :.:: ..: ::::: :::.
CCDS55 VSCQTEKGSALHEAALFGKVDVVRVLLETGIDANIKDSLGRTVLDILKEHPSQKSLQIAT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KA0 LIEDHMTG-KRST--KEVDKTPPPQPPLISS-MDSISQKSQGD-VEKAVTELIIDFDANA
:..... : ::: .: . : ::: ..: :::.... : ...:. ..
CCDS55 LLQEYLEGVGRSTVLEEPVQEDATQETHISSPVESPSQKTKSETVTGELSKLLDEIKLCQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390
pF1KA0 EEEGPYEALYNAISCHSLDSMAS------GRSSDQ------------------DSTNKEA
:.. .: : ..:: : ::.... :....: :. ..
CCDS55 EKDYSFEDLCHTISDHYLDNLSKISEEELGKNGSQSVRTSSTINLSPGEVEEEDDDENTC
340 350 360 370 380 390
400 410 420
pF1KA0 EAAGVKPA-----GVR------------PRER-------PPPPAKPPPDEEEE---DHID
.:. : : : :..: : :.:.:. : .:
CCDS55 GPSGLWEALTPCNGCRNLGFPMLAQESYPKKRNYTMEIVPSASLDTFPSENENFLCDLMD
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460
pF1KA0 ----KKYFPL-----------TASEVLSMRP-----RIHGSAAREEDEHPYELLLTAETK
:: : .:::: : : ... . : .
CCDS55 TAVTKKPCSLEIARAPSPRTDNASEVAVTTPGTSNHRNSSTGPTPDCSPPSPDTALKNIV
460 470 480 490 500 510
470 480
pF1KA0 KVVLVDGKTKD--------HR----------------------------RSSSSRSQDSA
::. . : . :: :: . .. .
CCDS55 KVIRPQPKQRTSIVSSLDFHRMNHNQEYFEINTSTGCTSFTASPPASPPTSSVGTTEVKN
520 530 540 550 560 570
490 500 510 520
pF1KA0 EG---------QDGQVPE------QFSGLLHGSSPVCEVGQDPFQLL-----CTAGQSHP
:: :: . : ::.::::::::.:: ..::.: : ::..
CCDS55 EGTNHTDDLSRQDDNDPPKEYDPGQFAGLLHGSSPACESPENPFHLYGKREQCEKGQDEV
580 590 600 610 620 630
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 D--GSP---QQGACHKASMQLEETGVHAPGASQPSALDQSKRVGYLTGLPTTNSRSHPET
. .:: .:. .. : : . .. .:. .:... : . : ..:: ..
CCDS55 SLANSPLPFKQSPIENNSEPLVKK-IKPKVVSRTIFHKKSNQLENHTIVGTRSTRSGSRN
640 650 660 670 680 690
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 LTHTASPHPGGAEEGDRSGARSRAPPTSKPKAELKLSRSLSKSDSDLLTCSPTEDATMGS
. . . :: : . .: :. : : ...::.:.:::::::.. .: .. .
CCDS55 GDQWVM-NAGGFVERACTLGRIRSLP--KALIDMHLSKSVSKSDSDLIAYPSNEKTSRVN
700 710 720 730 740 750
650 660 670 680 690
pF1KA0 RSESLSNCSIGKKRLEKSPSFASEWDEIEKIMSSIGEGIDFSQERQKISGSRTLE----Q
::: . .: :..:::.:::.::.:::::: ::. .: ....: : :
CCDS55 WSESSTAEHSSKGNSERTPSFTSEWEEIDKIMSSIDVGIN--NELKEMNGETTRPRCPVQ
760 770 780 790 800 810
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 SVGEWLESIGLQQYESKLLLNGFDDVHFLGSNVMEEQDLRDIGISDPQHRRKLLQAARSL
.::.::::::: :::..:. ::::.:.:.::::::.::: .::: . ::...::: . :
CCDS55 TVGQWLESIGLPQYENHLMANGFDNVQFMGSNVMEDQDLLEIGILNSGHRQRILQAIQLL
820 830 840 850 860 870
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 PKVKALGYDGNSPPSVPSWLDSLGLQDYVHSFLSSGYSSIDTVKNLWELELVNVLKVQLL
::.. .:.:: : :: ::::. : ::...:: .::.:.: .:..::.::.::::..:.
CCDS55 PKMRPIGHDGYHPTSVAEWLDSIELGDYTKAFLINGYTSMDLLKKIWEVELINVLKINLI
880 890 900 910 920 930
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 GHRKRIIASLADRPYEEPPQKPPRFSQLRCQD---LLSQTSSPLSQNDSCTGRSADL--L
::::::.:::.:: ...::::::: :: . : : :::. :: : :. .
CCDS55 GHRKRILASLGDRLHDDPPQKPPRSITLREPSGNHTPPQLSPSLSQSTYTTGGSLDVPHI
940 950 960 970 980 990
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 LPPGDTGRRRHDSLHDPAAPSRAERFRIQE-EHREAKLTLRPPSLAAPYAPVQSWQHQPE
. ::. :::... : :. :: : . : ..:::::. :. .::: :::.::
CCDS55 IMQGDARRRRNENYFDDIPRSKLERQMAQTGDWGEPSITLRPPNEATASTPVQYWQHHPE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
940 950 960 970 980
pF1KA0 KLIFESCGYEANYLGSMLIKDLRGTESTQDACAKMR----KSTEHMKKIPTIILSITYKG
::::.:: :.: ::::::::.::::::::::::::: ::::.:::.::::::..:::
CCDS55 KLIFQSCDYKAFYLGSMLIKELRGTESTQDACAKMRANCQKSTEQMKKVPTIILSVSYKG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 VKFIDASNKNVIAEHEIRNISCAAQDPEDLCTFAYITKDLQTSHHYCHVFSTVDVNLTYE
::::::.:::.::::::::::::::::::: :
CCDS55 VKFIDATNKNIIAEHEIRNISCAAQDPEDLSTFAYITKDLKSNHHYCHVFTAFDVNLAYE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 IILTLGQAFEVAYQLALQAQKSRATGASAAEMIETKSSKPVPKPRVGVRKSALEPPDMDQ
CCDS55 IILTLGQAFEVAYQLALQARKGGHSSTLPESFENKPSKPIPKPRVSIRKSVDLLHASHTG
1180 1190 1200 1210 1220 1230
>>CCDS55869.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 (460 aa)
initn: 1642 init1: 643 opt: 1037 Z-score: 609.7 bits: 123.4 E(32554): 1.2e-27
Smith-Waterman score: 1663; 61.0% identity (81.0% similar) in 420 aa overlap (691-1100:31-449)
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SPSFASEWDEIEKIMSSIGEGIDFSQERQKISGSRTLEQSVGEWLESIGLQQYESKLLLN
..: : :.::.::::::: :::..:. :
CCDS55 MMWQCHLSAQDYRYYPVDGYSLLKRFPLHPLTGPRCPVQTVGQWLESIGLPQYENHLMAN
10 20 30 40 50 60
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GFDDVHFLGSNVMEEQDLRDIGISDPQHRRKLLQAARSLPKVKALGYDGNSPPSVPSWLD
:::.:.:.::::::.::: .::: . ::...::: . :::.. .:.:: : :: :::
CCDS55 GFDNVQFMGSNVMEDQDLLEIGILNSGHRQRILQAIQLLPKMRPIGHDGYHPTSVAEWLD
70 80 90 100 110 120
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 SLGLQDYVHSFLSSGYSSIDTVKNLWELELVNVLKVQLLGHRKRIIASLADRPYEEPPQK
:. : ::...:: .::.:.: .:..::.::.::::..:.::::::.:::.:: ...::::
CCDS55 SIELGDYTKAFLINGYTSMDLLKKIWEVELINVLKINLIGHRKRILASLGDRLHDDPPQK
130 140 150 160 170 180
850 860 870 880 890
pF1KA0 PPRFSQLRCQD---LLSQTSSPLSQNDSCTGRSADL--LLPPGDTGRRRHDSLHDPAAPS
::: :: . : : :::. :: : :. .. ::. :::... : :
CCDS55 PPRSITLREPSGNHTPPQLSPSLSQSTYTTGGSLDVPHIIMQGDARRRRNENYFDDIPRS
190 200 210 220 230 240
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 RAERFRIQE-EHREAKLTLRPPSLAAPYAPVQSWQHQPEKLIFESCGYEANYLGSMLIKD
. :: : . : ..:::::. :. .::: :::.::::::.:: :.: ::::::::.
CCDS55 KLERQMAQTGDWGEPSITLRPPNEATASTPVQYWQHHPEKLIFQSCDYKAFYLGSMLIKE
250 260 270 280 290 300
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 LRGTESTQDACAKMR----KSTEHMKKIPTIILSITYKGVKFIDASNKNVIAEHEIRNIS
::::::::::::::: ::::.:::.::::::..:::::::::.:::.::::::::::
CCDS55 LRGTESTQDACAKMRANCQKSTEQMKKVPTIILSVSYKGVKFIDATNKNIIAEHEIRNIS
310 320 330 340 350 360
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 CAAQDPEDLCTFAYITKDLQTSHHYCHVFSTVDVNLTYEIILTLGQAFEVAYQLALQAQK
::::::::: :::::::::...:::::::.. ::::.:::::::::::::::::::::.:
CCDS55 CAAQDPEDLSTFAYITKDLKSNHHYCHVFTAFDVNLAYEIILTLGQAFEVAYQLALQARK
370 380 390 400 410 420
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 SRATGASAAEMIETKSSKPVPKPRVGVRKSALEPPDMDQDAQSHASVSWVVDPKPDSKRS
. . ... : .:.: :::.:::::..:::
CCDS55 G-GHSSTLPESFENKPSKPIPKPRVSIRKSVPFCFKADRPI
430 440 450 460
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CCDS55 MANGFDNVQFMGSNVMEDQDLLEIGILNSG
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CCDS55 HRQRILQAIQLLPKMRPIGHDGYHPTSVAEWLDSIELGDYTKAFLINGYTSMDLLKKIWE
40 50 60 70 80 90
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CCDS55 YWQHHPEKLIFQSCDYKAFYLGSMLIKELRGTESTQDACAKMRANCQKSTEQMKKVPTII
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CCDS55 LSVSYKGVKFIDATNKNIIAEHEIRNISCAAQDPEDLSTFAYITKDLKSNHHYCHVFTAF
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CCDS55 DVNLAYEIILTLGQAFEVAYQLALQARKG-GHSSTLPESFENKPSKPIPKPRVSIRKSVI
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1110 1120 1130
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CCDS55 DPSEQ----KTLANLPWIVEPGQEAKRGINTKYETTIF
330 340 350
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CCDS55 MQGDARRRRNENYFDDIPRSKLERQMAQTGDW
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CCDS55 GEPSITLRPPNEATASTPVQYWQHHPEKLIFQSCDYKAFYLGSMLIKELRGTESTQDACA
40 50 60 70 80 90
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CCDS55 KMRANCQKSTEQMKKVPTIILSVSYKGVKFIDATNKNIIAEHEIRNISCAAQDPEDLSTF
100 110 120 130 140 150
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CCDS55 AYITKDLKSNHHYCHVFTAFDVNLAYEIILTLGQAFEVAYQLALQARKG-GHSSTLPESF
160 170 180 190 200 210
1090 1100 1110 1120 1130
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:.: :::.:::::..:::
CCDS55 ENKPSKPIPKPRVSIRKSVDLLHASHTGQEPSERHTEEALRKF
220 230 240 250
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CCDS55 MMWQCHLSAQDYRYYPVDGYSLLKRFPLHPLTGPRCPVQTVGQWLESIGLPQYENHLMAN
10 20 30 40 50 60
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CCDS55 GFDNVQFMGSNVMEDQDLLEIGILNSGHRQRILQAIQLLPKMRPIGHDGYHPTSVAEWLD
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CCDS55 SIELGDYTKAFLINGYTSMDLLKKIWEVELINVLKINLIGHRKRILASLGDRLHDDPPQK
130 140 150 160 170 180
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CCDS55 PPRSITLREPSGNHTPPQLSPSLSQSTYTTGGSLDVPHIIMQGDARRRRNENYFDDIPRS
190 200 210 220 230 240
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CCDS55 KLERQMAQSSVCEIWTNQNAGFPFSAIHQVHNTGDWGEPSITLRPPNEATASTPVQYWQH
250 260 270 280 290 300
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CCDS55 HPEKLIFQSCDYKAFYLGSMLIKELRGTESTQDACAKMRANCQKSTEQMKKVPTIILSVS
310 320 330 340 350 360
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 YKGVKFIDASNKNVIAEHEIRNISCAAQDPEDLCTFAYITKDLQTSHHYCHVFSTVDVNL
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CCDS55 YKGVKFIDATNKNIIAEHEIRNISCAAQDPEDLSTFAYITKDLKSNHHYCHVFTAFDVNL
370 380 390 400 410 420
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CCDS55 AYEIILTLGQAFEVAYQLALQARKG-GHSSTLPESFENKPSKPIPKPRVSIRKSVQIDP-
430 440 450 460 470
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.. .. :.. :.:.: ..::...:
CCDS55 --SEQKTLANLPWIVEPGQEAKRGINTKYETTIF
480 490 500 510
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..::. . ::: :. :.. ::::::.:
CCDS11 MGREQDLILAVKNGDVTGVQKLVAKVKATKTKLLGSTKRLNVNYQDADGFSALHHAALGG
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
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... .::. .: ... ::.: ::: :::.: . ::::.. . . :: . :..
CCDS11 SLELIALLLEAQATVDIKDSNGMRPLHYAAWQGRLEPVRLLLRASAA---VNAASLDGQI
70 80 90 100 110
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pF1KA0 ALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVKMLLNAH--PNLL
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CCDS11 PLHLAAQYGHYEVSEMLLQHQSNPCLVNKAKKTPLDLACEFGRLKVAQLLLNSHLCVALL
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 S------CNTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMGSALHEAALFGKTDVV
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CCDS11 EGEAKDPCDPNYTTPLHLAAKNGHREVIRQLLRAGIEINRQTKTGTALHEAALYGKTEVV
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 QILLAAGTDVNIKDNHGLTALDTVRELP-SQKSQQIAALIEDH--MTGKRSTKEVDKTPP
..:: .:.::::..... :::: : .. :: :..: :... . :. :. .
CCDS11 RLLLEGGVDVNIRNTYNQTALDIVNQFTTSQASREIKQLLREASGILKVRALKDFWNLHD
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 PQPPLISSMDSIS---QKSQGDVEKAVTELIIDFDANAEEEGPYEALYNAISCHSLDSMA
: . . : :. :. .: . . : ..: . : .. ..
CCDS11 PTALNVRAGDVITVLEQHPDGRWKGHIHE---------SQRGTDRIGYFP---PGIVEVV
300 310 320 330 340
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pF1KA0 SGRSSDQDSTNKEAEAAGVKPAGVRP--RERPPPPAKPPPDEEEEDHIDKKYFPLTASEV
: : .. : :. .:: . : :::. :: : ::: :..
CCDS11 SKR------VGIPAARLPSAPTPLRPGFSRTPQPPAEEPP------H------PLTYSQL
350 360 370 380
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pF1KA0 LSMRPRIHGSAAREEDEHPYELLLTAETKKVVLVDGKTKDHRRSSSSRSQDSAEGQDGQV
::. : . : : .. : .:.. . : :. : .:.:: .:.
CCDS11 ----PRVGLSP-----DSP------AGDRNSVGSEGSVGSIR---SAGSGQSSEGTNGHG
390 400 410 420
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pF1KA0 PEQFSGLL-HGSSPVCEVGQDPFQLLCTAGQSHPDGSPQQGACHKASMQLEETGVHAPGA
: ::: ....:. .:.: :.: ::
CCDS11 P----GLLIENAQPLPSAGED--QVL-------------------------------PGL
430 440 450
560 570 580 590 600 610
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:: :. :. : .: :: . .:. . :. :: . :.. :. .
CCDS11 HPPSLADN------LSHRPLANCRSGEQIFTQDVRPEQ--LLEG--KDAQAIHNWLSEFQ
460 470 480 490 500
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pF1KA0 AELKLSRSLSKS-DSDLLTCSPTEDATMGSRSESLSNCSIGKKRLEKSPSFASEWDEIEK
: .. :. . : .. :: : .:: . . ..::: ..
CCDS11 LEGYTAHFLQAGYDVPTISRMTPEDLT-----------AIGVTKPGHRKKIASEIAQL--
510 520 530 540
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pF1KA0 IMSSIGEGIDFSQERQKISGSRTLEQSVGEWLESIGLQQYESKLLLNGFDDVHFLGSNVM
::.: . . .. ::: ..:: ::...:. .:.:.. .... .
CCDS11 ---SIAEWLP-----------SYIPTDLLEWLCALGLPQYHKQLVSSGYDSMGLVADLTW
550 560 570 580 590
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pF1KA0 EEQDLRDIGISDPQHRRKLLQAARSLPKVKALGYDGNSPPSVPSWLDSLGLQDYVHSFLS
:: :..::.. :..::. ... : ...
CCDS11 EE--LQEIGVNKLGHQKKLMLGVKRLAELRRGLLQGEALSEGGRRLAKGPELMAIEGLEN
600 610 620 630 640 650
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pF1KA0 SPSFASEWDEIEKIMSSIGEGIDFSQERQKISGSRTLEQSVGEWLESIGLQQYESKLLLN
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CCDS55 MMWQCHLSAQDYRYYPVDGYSLLKRFPLHPLTGPRCPVQTVGQWLESIGLPQYENHLMAN
10 20 30 40 50 60
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GFDDVHFLGSNVMEEQDLRDIGISDPQHRRKLLQAARSLPKVKALGYDGNSPPSVPSWLD
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CCDS55 GFDNVQFMGSNVMEDQDLLEIGILNSGHRQRILQAIQLLPKMRPIGHDGYHPTSVAEWLD
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 SLGLQDYVHSFLSSGYSSIDTVKNLWELELVNVLKVQLLGHRKRIIASLADRPYEEPPQK
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CCDS55 SIELGDYTKAFLINGYTSMDLLKKIWEVELINVLKINLIGHRKRILASLGDRLHDDPPQK
130 140 150 160 170 180
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CCDS55 PPRSITLRT----------------------------GDWGE-----------PS-----
190
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pF1KA0 RIQEEHREAKLTLRPPSLAAPYAPVQSWQHQPEKLIFESCGYEANYLGSMLIKDLRGTES
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CCDS55 ----------ITLRPPNEATASTPVQYWQHHPEKLIFQSCDYKAFYLGSMLIKELRGTES
200 210 220 230 240
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CCDS55 TQDACAKMRANCQKSTEQMKKVPTIILSVSYKGVKFIDATNKNIIAEHEIRNISCAAQDP
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pF1KA0 EDLCTFAYITKDLQTSHHYCHVFSTVDVNLTYEIILTLGQAFEVAYQLALQAQKSRATGA
::: :::::::::...:::::::.. ::::.:::::::::::::::::::::.:. . ..
CCDS55 EDLSTFAYITKDLKSNHHYCHVFTAFDVNLAYEIILTLGQAFEVAYQLALQARKG-GHSS
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 SAAEMIETKSSKPVPKPRVGVRKSALEPPDMDQDAQSHASVSWVVDPKPDSKRSLSTN
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CCDS55 TLPESFENKPSKPIPKPRVSIRKSVDLLHASHTGQEPSERHTEEALRKF
370 380 390 400 410
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CCDS55 MMWQCHLSAQDYRYYPVDGYSLLKRFPLHPLTGPRCPVQTVGQWLESIGLPQYENHLMAN
10 20 30 40 50 60
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GFDDVHFLGSNVMEEQDLRDIGISDPQHRRKLLQAARSLPKVKALGYDGNSPPSVPSWLD
:::.:.:.::::::.::: .::: . ::...::: . :::.. .:.:: : :: :::
CCDS55 GFDNVQFMGSNVMEDQDLLEIGILNSGHRQRILQAIQLLPKMRPIGHDGYHPTSVAEWLD
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790 800 810 820 830 840
pF1KA0 SLGLQDYVHSFLSSGYSSIDTVKNLWELELVNVLKVQLLGHRKRIIASLADRPYEEPPQK
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CCDS55 SIELGDYTKAFLINGYTSMDLLKKIWEVELINVLKINLIGHRKRILASLGDRLHDDPPQK
130 140 150 160 170 180
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pF1KA0 PPRFSQLRCQDLLSQTSSPLSQNDSCTGRSADLLLPPGDTGRRRHDSLHDPAAPSRAERF
::: :: :: :. ::
CCDS55 PPRSITLRT----------------------------GDWGE-----------PS-----
190
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RIQEEHREAKLTLRPPSLAAPYAPVQSWQHQPEKLIFESCGYEANYLGSMLIKDLRGTES
.:::::. :. .::: :::.::::::.:: :.: ::::::::.::::::
CCDS55 ----------ITLRPPNEATASTPVQYWQHHPEKLIFQSCDYKAFYLGSMLIKELRGTES
200 210 220 230 240
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pF1KA0 TQDACAKMR----KSTEHMKKIPTIILSITYKGVKFIDASNKNVIAEHEIRNISCAAQDP
::::::::: ::::.:::.::::::..:::::::::.:::.::::::::::::::::
CCDS55 TQDACAKMRANCQKSTEQMKKVPTIILSVSYKGVKFIDATNKNIIAEHEIRNISCAAQDP
250 260 270 280 290 300
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 EDLCTFAYITKDLQTSHHYCHVFSTVDVNLTYEIILTLGQAFEVAYQLALQAQKSRATGA
::: :::::::::...:::::::.. ::::.:::::::::::::::::::::.:. . ..
CCDS55 EDLSTFAYITKDLKSNHHYCHVFTAFDVNLAYEIILTLGQAFEVAYQLALQARKG-GHSS
310 320 330 340 350 360
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 SAAEMIETKSSKPVPKPRVGVRKSALEPPDMDQDAQSHASVSWVVDPKPDSKRSLSTN
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CCDS55 TLPESFENKPSKPIPKPRVSIRKSVQIDP---SEQKTLANLPWIVEPGQEAKRGINTKYE
370 380 390 400 410 420
CCDS55 TTIF
>>CCDS55868.1 ANKS1B gene_id:56899|Hs108|chr12 (450 aa)
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CCDS55 MMWQCHLSAQDYRYYPVDGYSLLKRFPLHPLTGPRCPVQTVGQWLESIGLPQYENHLMAN
10 20 30 40 50 60
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GFDDVHFLGSNVMEEQDLRDIGISDPQHRRKLLQAARSLPKVKALGYDGNSPPSVPSWLD
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CCDS55 GFDNVQFMGSNVMEDQDLLEIGILNSGHRQRILQAIQLLPKMRPIGHDGYHPTSVAEWLD
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 SLGLQDYVHSFLSSGYSSIDTVKNLWELELVNVLKVQLLGHRKRIIASLADRPYEEPPQK
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CCDS55 SIELGDYTKAFLINGYTSMDLLKKIWEVELINVLKINLIGHRKRILASLGDRLHDDPPQK
130 140 150 160 170 180
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::: :: :. .:... :.: . . :: :. ::
CCDS55 PPRSITLRSSVCEIWTNQNAGFPFS--------AIHQVHNTGDWGE-----------PS-
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pF1KA0 AERFRIQEEHREAKLTLRPPSLAAPYAPVQSWQHQPEKLIFESCGYEANYLGSMLIKDLR
.:::::. :. .::: :::.::::::.:: :.: ::::::::.::
CCDS55 --------------ITLRPPNEATASTPVQYWQHHPEKLIFQSCDYKAFYLGSMLIKELR
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CCDS55 GTESTQDACAKMRANCQKSTEQMKKVPTIILSVSYKGVKFIDATNKNIIAEHEIRNISCA
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::::::: :::::::::...:::::::.. ::::.:::::::::::::::::::::.:.
CCDS55 AQDPEDLSTFAYITKDLKSNHHYCHVFTAFDVNLAYEIILTLGQAFEVAYQLALQARKG-
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390 400 410 420 430 440
pF1KA0 TN
:
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450
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]