Result of FASTA (ccds) for pF1KA0231
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0231, 803 aa
  1>>>pF1KA0231 803 - 803 aa - 803 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6077+/-0.00117; mu= 13.8184+/- 0.070
 mean_var=103.1632+/-21.569, 0's: 0 Z-trim(104.2): 172  B-trim: 73 in 1/50
 Lambda= 0.126273
 statistics sampled from 7570 (7768) to 7570 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.239), width:  16
 Scan time:  3.440

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1          ( 803) 5285 974.4       0
CCDS35155.1 LRRC8A gene_id:56262|Hs108|chr9        ( 810) 3188 592.4 9.9e-169
CCDS725.1 LRRC8C gene_id:84230|Hs108|chr1          ( 803) 2778 517.7  3e-146
CCDS12189.1 LRRC8E gene_id:80131|Hs108|chr19       ( 796) 2494 466.0 1.1e-130
CCDS726.1 LRRC8D gene_id:55144|Hs108|chr1          ( 858) 2402 449.2 1.3e-125
CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10         ( 536)  414 87.0 9.4e-17
CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10          ( 582)  414 87.0   1e-16
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6          ( 524)  407 85.7 2.2e-16
CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17          (1258)  386 82.1 6.5e-15
CCDS11192.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17          (1269)  386 82.1 6.6e-15
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12           ( 907)  346 74.7 7.8e-13
CCDS46951.1 LRRIQ4 gene_id:344657|Hs108|chr3       ( 560)  339 73.3 1.3e-12
CCDS34844.1 MFHAS1 gene_id:9258|Hs108|chr8         (1052)  331 72.0 5.8e-12
CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3           ( 545)  324 70.6 8.2e-12
CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1           ( 915)  322 70.3 1.6e-11
CCDS66873.1 LRRC28 gene_id:123355|Hs108|chr15      ( 312)  307 67.3 4.4e-11
CCDS10380.1 LRRC28 gene_id:123355|Hs108|chr15      ( 367)  307 67.4   5e-11
CCDS44508.1 PIDD1 gene_id:55367|Hs108|chr11        ( 893)  310 68.1 7.2e-11
CCDS7716.1 PIDD1 gene_id:55367|Hs108|chr11         ( 910)  310 68.1 7.3e-11
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1          ( 967)  310 68.1 7.7e-11


>>CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1               (803 aa)
 initn: 5285 init1: 5285 opt: 5285  Z-score: 5207.4  bits: 974.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5285; 100.0% identity (100.0% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-803)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 EFDNHCAVPWDILKASMNTSSNPGTPLPLPLRIQNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EFDNHCAVPWDILKASMNTSSNPGTPLPLPLRIQNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 FPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAEQSVRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAEQSVRP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LKLSKSKILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDKKEGEQAKAIFEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LKLSKSKILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDKKEGEQAKAIFEK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 VKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDVQAFTGYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDVQAFTGYK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 RYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREKSNYSDIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREKSNYSDIP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 DVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKNAQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKNAQD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 KIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDHP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 ALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 RTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 PHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 LSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 LFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIV
              730       740       750       760       770       780

              790       800   
pF1KA0 EENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC
       :::::::::::::::::::::::
CCDS72 EENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC
              790       800   

>>CCDS35155.1 LRRC8A gene_id:56262|Hs108|chr9             (810 aa)
 initn: 3161 init1: 2464 opt: 3188  Z-score: 3142.7  bits: 592.4 E(32554): 9.9e-169
Smith-Waterman score: 3188; 59.0% identity (82.8% similar) in 803 aa overlap (1-796:1-802)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV
       :: .:::. .::.: .:.:::::::::  ::...::..::..:.::.::....: :::: 
CCDS35 MIPVTELRYFADTQPAYRILKPWWDVFTDYISIVMLMIAVFGGTLQVTQDKMIC-LPCKW
               10        20        30        40        50          

               70        80             90       100       110     
pF1KA0 EFDNHCAVPWDILKASMNTSSNPGT---PLPL--PLRIQNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLH
          . :   .    :     . :..   : :   :  :. :: :.::.:.::::::..::
CCDS35 VTKDSCNDSFRGWAAPGPEPTYPNSTILPTPDTGPTGIKYDLDRHQYNYVDAVCYENRLH
      60        70        80        90       100       110         

         120       130       140       150       160       170     
pF1KA0 WFAKFFPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAE
       ::::.:::::::::::: ::::::...: :::.:::::.:: ::::::::::::::::.:
CCDS35 WFAKYFPYLVLLHTLIFLACSNFWFKFPRTSSKLEHFVSILLKCFDSPWTTRALSETVVE
     120       130       140       150       160       170         

         180         190       200       210       220       230   
pF1KA0 QSVRPLKLSK--SKILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDKKEGEQ
       .:     .::  ...  .::  : :...    :   .  .:.. ..   ..:::::::::
CCDS35 ESDPKPAFSKMNGSMDKKSSTVSEDVEATVPMLQRTKSRIEQGIVDRSETGVLDKKEGEQ
     180       190       200       210       220       230         

           240       250       260       270       280       290   
pF1KA0 AKAIFEKVKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDV
       :::.:::::.:: :::. ::.::.:..: :.::: :.::: :. :.. .: ...::.::.
CCDS35 AKALFEKVKKFRTHVEEGDIVYRLYMRQTIIKVIKFILIICYTVYYVHNIKFDVDCTVDI
     240       250       260       270       280       290         

           300       310       320       330       340       350   
pF1KA0 QAFTGYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREK
       ...:::. :.:.. :: .::.:::::. :::.:::   :.:::::: :::.::::..::.
CCDS35 ESLTGYRTYRCAHPLATLFKILASFYISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESIREE
     300       310       320       330       340       350         

           360       370       380       390       400       410   
pF1KA0 SNYSDIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSK
       :.:::::::::::::.::: :::::::::::..::::::::::.:.:::::::..::...
CCDS35 SSYSDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQR
     360       370       380       390       400       410         

           420       430       440       450       460       470   
pF1KA0 LVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHS
       :.::::::.:::::::.:.::.::.:.:.:::.:::::.: .: ...::..:::: .::.
CCDS35 LTKNAQDKLELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHT
     420       430       440       450       460       470         

           480       490       500       510       520       530   
pF1KA0 SLVVDHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEG
       .  .. ::::::.:::. :..:::.. .:: :.. ::.:.::.:.: .  :.   . ..:
CCDS35 AAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDG
     480       490       500       510       520       530         

           540       550       560       570       580       590   
pF1KA0 FQDLKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELI
       ...:: :..: :::.::..::::::.   :::::..:::.::.:::.::::.::  ::::
CCDS35 LRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELI
     540       550       560       570       580       590         

           600       610       620       630       640       650   
pF1KA0 SCDLERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIG
        :::::::::::::.::.:.::..:::::.:::::::::. :.:::::.:.::::: :::
CCDS35 RCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIG
     600       610       620       630       640       650         

           660       670       680       690       700       710   
pF1KA0 ALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNN
        :.:::.: :..:.::..: ::: : ::.:::::.:.:::.: .:  :.::: .:.: : 
CCDS35 NLTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANR
     660       670       680       690       700       710         

           720       730       740       750       760       770   
pF1KA0 IEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSL
       :: ::  ::::.::. : ::.: :..:  .::::.:::..:: :: :: :: ::  :  :
CCDS35 IETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLL
     720       730       740       750       760       770         

           780       790       800    
pF1KA0 KRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC 
       ::. :.:::.:.::::  : :::        
CCDS35 KRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA
     780       790       800       810

>>CCDS725.1 LRRC8C gene_id:84230|Hs108|chr1               (803 aa)
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               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV
       :: .::.. ... : ....::::::::  :... ::...:.. .::. :....: :: .:
CCDS72 MIPVTEFRQFSEQQPAFRVLKPWWDVFTDYLSVAMLMIGVFGCTLQVMQDKIIC-LPKRV
               10        20        30        40        50          

                70        80              90        100       110  
pF1KA0 E-FDNHCAVPWDILKASMNTSS------NPGTPLPLPLR-IQNDLHRQQYSYIDAVCYEK
       .  .:: ..  .. .:  .:.       .:..:. . .. ...::  ::::.:. .:::.
CCDS72 QPAQNHSSLS-NVSQAVASTTPLPPPKPSPANPITVEMKGLKTDLDLQQYSFINQMCYER
      60         70        80        90       100       110        

            120       130       140       150       160       170  
pF1KA0 QLHWFAKFFPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSET
        :::.::.::::::.:::.:  :::::...:..::..:::..:: ::::::::::::::.
CCDS72 ALHWYAKYFPYLVLIHTLVFMLCSNFWFKFPGSSSKIEHFISILGKCFDSPWTTRALSEV
      120       130       140       150       160       170        

                180       190       200       210       220        
pF1KA0 VAEQSV----RPLKLSKSKILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDK
        .:.:     :  ....:. . :.   :   ... .:.:      :.  ... :...:::
CCDS72 SGEDSEEKDNRKNNMNRSNTIQSGPEDSLVNSQSLKSIP------EKFVVDKSTAGALDK
      180       190       200       210             220       230  

      230       240       250       260       270       280        
pF1KA0 KEGEQAKAIFEKVKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEID
       ::::::::.:::::.::.:::. ::.: .:..: ..::: :..::.:   ..... . .:
CCDS72 KEGEQAKALFEKVKKFRLHVEEGDILYAMYVRQTVLKVIKFLIIIAYNSALVSKVQFTVD
            240       250       260       270       280       290  

      290       300       310       320       330       340        
pF1KA0 CSVDVQAFTGYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFE
       :.::.: .:::: ..: ...:..:. :.  :. .: .::::  :.:.:..  ::..::::
CCDS72 CNVDIQDMTGYKNFSCNHTMAHLFSKLSFCYLCFVSIYGLTCLYTLYWLFYRSLREYSFE
            300       310       320       330       340       350  

      350       360       370       380       390       400        
pF1KA0 ALREKSNYSDIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVE
        .:.... .:::::::::::.::. :::::::::::..::::::::::::.::::::: .
CCDS72 YVRQETGIDDIPDVKNDFAFMLHMIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLKQLNLNNEWTPD
            360       370       380       390       400       410  

      410       420       430       440       450       460        
pF1KA0 KLKSKLVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKEL
       ::..::  ::....:: :.::.::::.:::.::.. :.::.: .: .:....:: ::.::
CCDS72 KLRQKLQTNAHNRLELPLIMLSGLPDTVFEITELQSLKLEIIKNVMIPATIAQLDNLQEL
            420       430       440       450       460       470  

      470       480       490       500       510       520        
pF1KA0 RVYHSSLVVDHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLST
        ... :. .   ::.::.::::.: .:: .: ..: :.. :.::.:::: : .  .   .
CCDS72 SLHQCSVKIHSAALSFLKENLKVLSVKFDDMRELPPWMYGLRNLEELYLVGSLSHDISRN
            480       490       500       510       520       530  

      530       540       550       560       570       580        
pF1KA0 MQLEGFQDLKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLK
       . ::...:::.:. : .::..:.:::.:.:.   :::. . :.:.:::.:::::::.:: 
CCDS72 VTLESLRDLKSLKILSIKSNVSKIPQAVVDVSSHLQKMCIHNDGTKLVMLNNLKKMTNLT
            540       550       560       570       580       590  

      590       600       610       620       630       640        
pF1KA0 SLELISCDLERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYI
        :::. ::::::::..::: .:.::::.:::::..:::.:::::..:. ::::::.:.::
CCDS72 ELELVHCDLERIPHAVFSLLSLQELDLKENNLKSIEEIVSFQHLRKLTVLKLWHNSITYI
            600       610       620       630       640       650  

      650       660       670       680       690       700        
pF1KA0 PAQIGALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFA
       : .:  :..::.::..::.:: :: .::::.:..::::::: . ::: ::  :..::::.
CCDS72 PEHIKKLTSLERLSFSHNKIEVLPSHLFLCNKIRYLDLSYNDIRFIPPEIGVLQSLQYFS
            660       670       680       690       700       710  

      710       720       730       740       750       760        
pF1KA0 VTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELE
       .: :..: ::: :. ::::. : .:::::  :::..:.:  :..:.. ::..: ::::: 
CCDS72 ITCNKVESLPDELYFCKKLKTLKIGKNSLSVLSPKIGNLLFLSYLDVKGNHFEILPPELG
            720       730       740       750       760       770  

      770       780       790       800   
pF1KA0 GCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC
        :..:::  :.::. :..:::  : :...:     
CCDS72 DCRALKRAGLVVEDALFETLPSDVREQMKTE    
            780       790       800       

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Smith-Waterman score: 2494; 47.1% identity (76.9% similar) in 801 aa overlap (1-797:1-794)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV
       :: ..:.: ... : ....:::::::.  :.:. ::...:.. .::.::....: :: . 
CCDS12 MIPVAEFKQFTEQQPAFKVLKPWWDVLAEYLTVAMLMIGVFGCTLQVTQDKIIC-LPNHE
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 EFDNHCAVPWDILKASMNTSSNPGTPLPLPLRIQNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKF
         .:   .: . :    .   . :. :     ..:.:  ::::.:. .:::  :::.::.
CCDS12 LQENLSEAPCQQL-LPRGIPEQIGA-LQEVKGLKNNLDLQQYSFINQLCYETALHWYAKY
      60        70         80         90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 FPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAEQSVRP
       :::::..::::: .:..::...:.:::..:::..:: ::::::::::::::. .:..  :
CCDS12 FPYLVVIHTLIFMVCTSFWFKFPGTSSKIEHFISILGKCFDSPWTTRALSEVSGENQKGP
       120       130       140       150       160       170       

                 190       200       210       220       230       
pF1KA0 LKLSKSK---ILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDKKEGEQAKAI
           ..    . ....:  .    :..     .:  :..  : :. ..:::::::::::.
CCDS12 AATERAAATIVAMAGTG-PGKAGEGEKEKVLAEP--EKVVTEPPVVTLLDKKEGEQAKAL
       180       190        200       210         220       230    

       240       250       260       270       280       290       
pF1KA0 FEKVKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDVQAFT
       :::::.::::::. ::.: .:..: ..::  :. :..:   .. .:.. . : :...  :
CCDS12 FEKVKKFRMHVEEGDILYTMYIRQTVLKVCKFLAILVYNLVYVEKISFLVACRVETSEVT
          240       250       260       270       280       290    

       300       310       320       330       340       350       
pF1KA0 GYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREKSNYS
       ::  . : .. :..:. ::  :. .: .::::  :.:.:...  ::.:::...::.....
CCDS12 GYASFCCNHTKAHLFSKLAFCYISFVCIYGLTCIYTLYWLFHRPLKEYSFRSVREETGMG
          300       310       320       330       340       350    

       360       370       380       390       400       410       
pF1KA0 DIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKN
       :::::::::::.::: :::: ::::::..:::::::..:::.:::.::: :::..:: .:
CCDS12 DIPDVKNDFAFMLHLIDQYDSLYSKRFAVFLSEVSESRLKQLNLNHEWTPEKLRQKLQRN
          360       370       380       390       400       410    

       420       430       440       450       460       470       
pF1KA0 AQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVV
       :  ..:: : :: ::::.::::.:.: : :: : .. .: ..::::.:.:: . ::   .
CCDS12 AAGRLELALCMLPGLPDTVFELSEVESLRLEAICDITFPPGLSQLVHLQELSLLHSPARL
          420       430       440       450       460       470    

       480       490       500       510       520        530      
pF1KA0 DHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLS-TMQLEGFQD
            .::...::..:.:  :. ..: ::: :..:.::.: : ..:..:. .  ::....
CCDS12 PFSLQVFLRDHLKVMRVKCEELREVPLWVFGLRGLEELHLEG-LFPQELARAATLESLRE
          480       490       500       510        520       530   

        540       550       560       570       580       590      
pF1KA0 LKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCD
       ::.:..: :.:. ...:  :::.   ::.::: :.:..::.::.:::.. :. :::..: 
CCDS12 LKQLKVLSLRSNAGKVPASVTDVAGHLQRLSLHNDGARLVALNSLKKLAALRELELVACG
           540       550       560       570       580       590   

        600       610       620       630       640       650      
pF1KA0 LERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALS
       ::::::..:::. :.::::..:.:...:::.:::: ..:  :.::::.:::.: ..  : 
CCDS12 LERIPHAVFSLGALQELDLKDNHLRSIEEILSFQHCRKLVTLRLWHNQIAYVPEHVRKLR
           600       610       620       630       640       650   

        660       670       680       690       700       710      
pF1KA0 NLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEM
       .:::: :..:..:.:: :: ::. :. ::.:.: :  .: :.  :.:::..:.. : .: 
CCDS12 SLEQLYLSYNKLETLPSQLGLCSGLRLLDVSHNGLHSLPPEVGLLQNLQHLALSYNALEA
           660       670       680       690       700       710   

        720       730       740       750       760       770      
pF1KA0 LPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRN
       ::. :: :.::. :::: :.: .:::::: :  :..::: :: ::.:: :: .: .::. 
CCDS12 LPEELFFCRKLRTLLLGDNQLSQLSPHVGALRALSRLELKGNRLEALPEELGNCGGLKKA
           720       730       740       750       760       770   

        780       790       800   
pF1KA0 CLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC
        :.::..: . ::  : ....      
CCDS12 GLLVEDTLYQGLPAEVRDKMEEE    
           780       790          

>>CCDS726.1 LRRC8D gene_id:55144|Hs108|chr1               (858 aa)
 initn: 2960 init1: 2052 opt: 2402  Z-score: 2368.5  bits: 449.2 E(32554): 1.3e-125
Smith-Waterman score: 2502; 46.9% identity (75.8% similar) in 828 aa overlap (19-796:19-846)

               10        20        30        40        50          
pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLC--CLPC
                         :::::::::  :....::.::..::..:::...:.:   :: 
CCDS72 MFTLAEVASLNDIQPTYRILKPWWDVFMDYLAVVMLMVAIFAGTMQLTKDQVVCLPVLPS
               10        20        30        40        50        60

       60             70        80                     90          
pF1KA0 KVEFDNHCA-----VPWDILKASMNTSSNP----------GTP--LP-LPLRI-------
        :.   :       :  .: :    :...           ::    : .:::        
CCDS72 PVNSKAHTPPGNAEVTTNIPKMEAATNQDQDGRTTNDISFGTSAVTPDIPLRATYPRTDF
               70        80        90       100       110       120

                            100       110       120       130      
pF1KA0 -----------------QNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKFFPYLVLLHTLIFAACS
                        ...:  ::: .:. .::.  : :..:.::::.:.::.:. . :
CCDS72 ALPNQEAKKEKKDPTGRKTNLDFQQYVFINQMCYHLALPWYSKYFPYLALIHTIILMVSS
              130       140       150       160       170       180

        140       150       160       170        180       190     
pF1KA0 NFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAEQSVR-PLKLSKSKILLSSSGC
       :::..::.: :..::::.:: :::.:::::.:::::. :.: .   ... .. : .  . 
CCDS72 NFWFKYPKTCSKVEHFVSILGKCFESPWTTKALSETACEDSEENKQRITGAQTLPKHVST
              190       200       210       220       230       240

         200        210           220       230       240       250
pF1KA0 SADIDSGKQSLPY-PQPGL----ESAGIESPTSSVLDKKEGEQAKAIFEKVKRFRMHVEQ
       :.:  : . : :.  . :.    :.  :: :. ..::::.::::::.::::..:: :::.
CCDS72 SSDEGSPSASTPMINKTGFKFSAEKPVIEVPSMTILDKKDGEQAKALFEKVRKFRAHVED
              250       260       270       280       290       300

              260       270       280       290       300       310
pF1KA0 KDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDVQAFTGYKRYQCVYSLAE
       .:.::..:. : ..:.  :..:. :.  :.. :..:  :.  :. . ::. ..:....: 
CCDS72 SDLIYKLYVVQTVIKTAKFIFILCYTANFVNAISFEHVCKPKVEHLIGYEVFECTHNMAY
              310       320       330       340       350       360

              320       330       340       350       360       370
pF1KA0 IFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREKSNYSDIPDVKNDFAFIL
       ..: :   :. .. .::.   :.:.:..:  ::.:::: .::.:..::::::::::::.:
CCDS72 MLKKLLISYISIICVYGFICLYTLFWLFRIPLKEYSFEKVREESSFSDIPDVKNDFAFLL
              370       380       390       400       410       420

              380       390       400       410       420       430
pF1KA0 HLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKNAQDKIELHLFMLN
       :..:::: ::::::..::::::::::..:.::.::: :::.... .::::: :::::::.
CCDS72 HMVDQYDQLYSKRFGVFLSEVSENKLREISLNHEWTFEKLRQHISRNAQDKQELHLFMLS
              430       440       450       460       470       480

              440       450       460       470       480       490
pF1KA0 GLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDHPALAFLEENLK
       :.:: ::.::...::.::::::.:.:. .::..::.::.. :    :.. :..::...:.
CCDS72 GVPDAVFDLTDLDVLKLELIPEAKIPAKISQMTNLQELHLCHCPAKVEQTAFSFLRDHLR
              490       500       510       520       530       540

              500       510       520       530       540       550
pF1KA0 ILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNLRTLYLKSSLS
        :..:::....:: ::. ::::.:::: : .  :. . . ::....:..:. :..::.:.
CCDS72 CLHVKFTDVAEIPAWVYLLKNLRELYLIGNLNSENNKMIGLESLRELRHLKILHVKSNLT
              550       560       570       580       590       600

              560       570       580       590       600       610
pF1KA0 RIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERIPHSIFSLNNL
       ..:. .::. : : :: . :.:.::.:::.::::.:.  ::: .:.::::::.::::.::
CCDS72 KVPSNITDVAPHLTKLVIHNDGTKLLVLNSLKKMMNVAELELQNCELERIPHAIFSLSNL
              610       620       630       640       650       660

              620       630       640       650       660       670
pF1KA0 HELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQLSLDHNNIEN
       .::::. ::..:.:::::::::. :.:::::::.:. :: .:  ..:::.: ...:..:.
CCDS72 QELDLKSNNIRTIEEIISFQHLKRLTCLKLWHNKIVTIPPSITHVKNLESLYFSNNKLES
              670       680       690       700       710       720

              680       690       700       710       720       730
pF1KA0 LPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCL
       ::. .:   ::. ::.:::....:: ::  :.:::.. .:.:....::  ::.: ::. :
CCDS72 LPVAVFSLQKLRCLDVSYNNISMIPIEIGLLQNLQHLHITGNKVDILPKQLFKCIKLRTL
              730       740       750       760       770       780

              740       750       760       770       780       790
pF1KA0 LLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPL
        ::.: . .:  .::.::.::.::: :: :. :: .:  :. ::.. :.::..:..::::
CCDS72 NLGQNCITSLPEKVGQLSQLTQLELKGNCLDRLPAQLGQCRMLKKSGLVVEDHLFDTLPL
              790       800       810       820       830       840

              800        
pF1KA0 PVTERLQTCLDKC     
        : : :            
CCDS72 EVKEALNQDINIPFANGI
              850        

>>CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10              (536 aa)
 initn: 457 init1: 230 opt: 414  Z-score: 414.3  bits: 87.0 E(32554): 9.4e-17
Smith-Waterman score: 425; 28.6% identity (62.7% similar) in 426 aa overlap (393-789:100-511)

            370       380       390       400       410       420  
pF1KA0 KNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKNAQDKI
                                     ::... ..:... ... : :. .:.  .  
CCDS58 NTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKR-SIHILPSS-IKELTQLT
      70        80        90       100        110         120      

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 ELHLFM--LNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDHP
       ::.:.   :..:: .:  :... .:.:     ..::.....: .:. : . :..:  . :
CCDS58 ELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLR-EIP
        130       140       150       160       170       180      

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 ALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNL
       ....  ..:  : :.:...  . .    .:::..: . . .  .... .  : . .:..:
CCDS58 SVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEK---DIKNLSKLSMLS-IRENKIKQLPAE-IGNLSSL
         190       200          210       220        230        240

               550       560       570                580          
pF1KA0 RTLYLK-SSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEG---------SKLVVLNNL---------
         : :. . :: ::. ..    .:..:.:.:..         :.:: ::.:         
CCDS58 SRLGLRYNRLSAIPRSLAKC-SALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQL
              250       260        270       280       290         

                   590       600        610       620       630    
pF1KA0 ------KKMVNLKSLELISCDLERIPHSIFSLNN-LHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQN
             ... .. ::..    ...:: .:::  . : .:....:.: ..   ..:    .
CCDS58 YPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLP--LDFGTWTS
     300       310       320       330       340         350       

          640       650       660       670       680       690    
pF1KA0 LSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFI
       .  :.:  :... :: ....: .:: : :..: ...::  :    ::. :::  :.:  .
CCDS58 MVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESL
       360       370       380       390       400       410       

          700       710       720       730       740       750    
pF1KA0 PEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLE
       :.:: ::..:: ...:::..  :: :. .  .:  : ::.: : .:  ..: : :: .: 
CCDS58 PNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELY
       420       430       440       450       460       470       

           760       770       780       790       800             
pF1KA0 LIGN-YLETLPPELEGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC          
       :  :  :..:: ::  :..:  . . .:.  :. ::                        
CCDS58 LNDNPNLHSLPFELALCSKL--SIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAM
       480       490         500       510       520       530     

CCDS58 V
        

>>CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10               (582 aa)
 initn: 674 init1: 230 opt: 414  Z-score: 413.8  bits: 87.0 E(32554): 1e-16
Smith-Waterman score: 414; 27.4% identity (62.9% similar) in 402 aa overlap (395-789:170-557)

          370       380       390       400       410        420   
pF1KA0 DFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVK-NAQDKIE
                                     ::....: ..  .... : . . ..   . 
CCDS75 AEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHN-KLREIPSVVYRLDSLTTLY
     140       150       160       170        180       190        

           430       440       450       460       470        480  
pF1KA0 LHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDH-PAL
       :..  .. .  .. .:... .::..     .::. ...: ::  : : :..:  .: :  
CCDS75 LRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNLITLDVAHNQL--EHLPKE
      200       210       220       230       240       250        

            490       500       510          520       530         
pF1KA0 AFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKEL---YLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKN
            ..  : :. .:.  .:  . .:..:..:   :    ..:..:.  .  ....: :
CCDS75 IGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLA--KCSALEEL-N
        260       270       280       290       300         310    

     540       550       560       570       580       590         
pF1KA0 LRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLER
       :..    ...: .:. . . : .:..:.:  .  .:  ... ... .. ::..    ...
CCDS75 LEN----NNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINK
               320       330       340       350       360         

     600        610       620       630       640       650        
pF1KA0 IPHSIFSLNN-LHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNL
       :: .:::  . : .:....:.: ..   ..:    ..  :.:  :... :: ....: .:
CCDS75 IPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLP--LDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSL
     370       380       390         400       410       420       

      660       670       680       690       700       710        
pF1KA0 EQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLP
       : : :..: ...::  :    ::. :::  :.:  .:.:: ::..:: ...:::..  ::
CCDS75 EVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLP
       430       440       450       460       470       480       

      720       730       740       750        760       770       
pF1KA0 DGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGN-YLETLPPELEGCQSLKRNC
        :. .  .:  : ::.: : .:  ..: : :: .: :  :  :..:: ::  :..:  . 
CCDS75 RGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKL--SI
       490       500       510       520       530       540       

       780       790       800              
pF1KA0 LIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC           
       . .:.  :. ::                         
CCDS75 MSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV
         550       560       570       580  

>>CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6               (524 aa)
 initn: 281 init1: 281 opt: 407  Z-score: 407.5  bits: 85.7 E(32554): 2.2e-16
Smith-Waterman score: 414; 30.4% identity (61.7% similar) in 345 aa overlap (453-794:25-356)

            430       440       450       460        470       480 
pF1KA0 ELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLV-NLKELRVYHSSLVVDHPA
                                     : .:  . . . .:.:: .  .. . . : 
CCDS49       MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEEL-LLDANQLRELPE
                     10        20        30        40         50   

             490       500       510       520       530       540 
pF1KA0 LAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNLR
         :   .:. : :. .:. ..:  . .. .: :: .:   .::   ....      : :.
CCDS49 QFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISF-----CKALQ
            60        70        80        90       100             

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 TLYLKSS-LSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERI
       .  .... :.:.:.   .:  .:  ::. :. :   . .:. .. :: ::::    :  .
CCDS49 VADFSGNPLTRLPESFPEL-QNLTCLSV-NDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYL
      110       120        130        140       150       160      

              610       620        630       640       650         
pF1KA0 PHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEII-SFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLE
       : :. .:  :.:::: .:.. .. : : .. ::..:    :  :... .: .:: :.:: 
CCDS49 PDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKDL---WLDGNQLSELPQEIGNLKNLL
        170       180       190       200          210       220   

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pF1KA0 QLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPD
        :....: .: :: ..   :.:  : .: : :  ::. :  :..:. . : .: . .::.
CCDS49 CLDVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPE
           230       240       250       260       270       280   

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pF1KA0 GLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLI
       .. .:..:  :.: .:.:..:   .:.:..:..:.   : : .:: :. :: ::   :  
CCDS49 AVGECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFC--
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pF1KA0 VEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC                                    
       :..: :. .:  :..                                             
CCDS49 VRDNRLTRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTD
             350       360       370       380       390       400 

>>CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17               (1258 aa)
 initn: 501 init1: 162 opt: 386  Z-score: 381.2  bits: 82.1 E(32554): 6.5e-15
Smith-Waterman score: 386; 29.5% identity (59.9% similar) in 352 aa overlap (422-766:27-370)

             400       410       420       430       440       450 
pF1KA0 SENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIP
                                     ..:.   :  ::...  : ..: ::.    
CCDS58     MDLRGLRPVPGGYFPENVKAMTSLRWLKLNRTGLCYLPEELAALQKLEHLSVSHNN
                   10        20        30        40        50      

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pF1KA0 EVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDH-PALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLK
        . : . .:.: .:. . .  .::  .  :   :  ..:..: :. ... . :: . . :
CCDS58 LTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSHNQLTECPRELENAK
         60        70        80        90       100       110      

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pF1KA0 NLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDL--LPSLQKLSL
       :.  : ::     ....:.  . : .: .:  :::  : .:. ..  ..  :  :: : :
CCDS58 NMLVLNLS----HNSIDTIPNQLFINLTDL--LYLDLSENRLESLPPQMRRLVHLQTLVL
        120           130       140         150       160       170

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pF1KA0 DNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLER--IPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEI
       ...    . : .:  :. :..:.: : .  .  .: :. .:.:: ..::  :.:  : : 
CCDS58 NGNPLLHAQLRQLPAMTALQTLHLRSTQRTQSNLPTSLEGLSNLADVDLSCNDLTRVPEC
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pF1KA0 ISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDL
       .    : .:  :.:  :.:. .   :    ..: :.:..:.. .::  .   .::. : :
CCDS58 L--YTLPSLRRLNLSSNQITELSLCIDQWVHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLSKLKKLYL
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pF1KA0 SYNHLTF--IPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHV
       . :.: :  .:  :  :.::. : ..:::.:..:..: .: ::. :.:.:: :..:   .
CCDS58 NSNKLDFDGLPSGIGKLTNLEEFMAANNNLELVPESLCRCPKLRKLVLNKNHLVTLPEAI
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pF1KA0 GELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC 
         :...  :..  :   ..::.                                      
CCDS58 HFLTEIEVLDVRENPNLVMPPKPADRAAEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAAGSG
      350       360       370       380       390       400        

>>CCDS11192.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17               (1269 aa)
 initn: 511 init1: 162 opt: 386  Z-score: 381.1  bits: 82.1 E(32554): 6.6e-15
Smith-Waterman score: 386; 29.5% identity (59.9% similar) in 352 aa overlap (422-766:38-381)

             400       410       420       430       440       450 
pF1KA0 SENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIP
                                     ..:.   :  ::...  : ..: ::.    
CCDS11 PFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNRTGLCYLPEELAALQKLEHLSVSHNN
        10        20        30        40        50        60       

             460       470        480       490       500       510
pF1KA0 EVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDH-PALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLK
        . : . .:.: .:. . .  .::  .  :   :  ..:..: :. ... . :: . . :
CCDS11 LTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSHNQLTECPRELENAK
        70        80        90       100       110       120       

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pF1KA0 NLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDL--LPSLQKLSL
       :.  : ::     ....:.  . : .: .:  :::  : .:. ..  ..  :  :: : :
CCDS11 NMLVLNLS----HNSIDTIPNQLFINLTDL--LYLDLSENRLESLPPQMRRLVHLQTLVL
       130           140       150         160       170       180 

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pF1KA0 DNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLER--IPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEI
       ...    . : .:  :. :..:.: : .  .  .: :. .:.:: ..::  :.:  : : 
CCDS11 NGNPLLHAQLRQLPAMTALQTLHLRSTQRTQSNLPTSLEGLSNLADVDLSCNDLTRVPEC
             190       200       210       220       230       240 

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pF1KA0 ISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDL
       .    : .:  :.:  :.:. .   :    ..: :.:..:.. .::  .   .::. : :
CCDS11 L--YTLPSLRRLNLSSNQITELSLCIDQWVHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLSKLKKLYL
               250       260       270       280       290         

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pF1KA0 SYNHLTF--IPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHV
       . :.: :  .:  :  :.::. : ..:::.:..:..: .: ::. :.:.:: :..:   .
CCDS11 NSNKLDFDGLPSGIGKLTNLEEFMAANNNLELVPESLCRCPKLRKLVLNKNHLVTLPEAI
     300       310       320       330       340       350         

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pF1KA0 GELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC 
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CCDS11 HFLTEIEVLDVRENPNLVMPPKPADRAAEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAAGSG
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803 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Wed Nov  2 18:23:18 2016 done: Wed Nov  2 18:23:19 2016
 Total Scan time:  3.440 Total Display time:  0.200

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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