FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0231, 803 aa
1>>>pF1KA0231 803 - 803 aa - 803 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6077+/-0.00117; mu= 13.8184+/- 0.070
mean_var=103.1632+/-21.569, 0's: 0 Z-trim(104.2): 172 B-trim: 73 in 1/50
Lambda= 0.126273
statistics sampled from 7570 (7768) to 7570 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 3.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1 ( 803) 5285 974.4 0
CCDS35155.1 LRRC8A gene_id:56262|Hs108|chr9 ( 810) 3188 592.4 9.9e-169
CCDS725.1 LRRC8C gene_id:84230|Hs108|chr1 ( 803) 2778 517.7 3e-146
CCDS12189.1 LRRC8E gene_id:80131|Hs108|chr19 ( 796) 2494 466.0 1.1e-130
CCDS726.1 LRRC8D gene_id:55144|Hs108|chr1 ( 858) 2402 449.2 1.3e-125
CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 536) 414 87.0 9.4e-17
CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 582) 414 87.0 1e-16
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6 ( 524) 407 85.7 2.2e-16
CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1258) 386 82.1 6.5e-15
CCDS11192.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1269) 386 82.1 6.6e-15
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 907) 346 74.7 7.8e-13
CCDS46951.1 LRRIQ4 gene_id:344657|Hs108|chr3 ( 560) 339 73.3 1.3e-12
CCDS34844.1 MFHAS1 gene_id:9258|Hs108|chr8 (1052) 331 72.0 5.8e-12
CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 ( 545) 324 70.6 8.2e-12
CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 915) 322 70.3 1.6e-11
CCDS66873.1 LRRC28 gene_id:123355|Hs108|chr15 ( 312) 307 67.3 4.4e-11
CCDS10380.1 LRRC28 gene_id:123355|Hs108|chr15 ( 367) 307 67.4 5e-11
CCDS44508.1 PIDD1 gene_id:55367|Hs108|chr11 ( 893) 310 68.1 7.2e-11
CCDS7716.1 PIDD1 gene_id:55367|Hs108|chr11 ( 910) 310 68.1 7.3e-11
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 310 68.1 7.7e-11
>>CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1 (803 aa)
initn: 5285 init1: 5285 opt: 5285 Z-score: 5207.4 bits: 974.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5285; 100.0% identity (100.0% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-803)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV
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CCDS72 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EFDNHCAVPWDILKASMNTSSNPGTPLPLPLRIQNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EFDNHCAVPWDILKASMNTSSNPGTPLPLPLRIQNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 FPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAEQSVRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAEQSVRP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LKLSKSKILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDKKEGEQAKAIFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LKLSKSKILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDKKEGEQAKAIFEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDVQAFTGYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDVQAFTGYK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREKSNYSDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREKSNYSDIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 DVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKNAQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKNAQD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDHP
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CCDS72 KIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDHP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIV
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KA0 EENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC
:::::::::::::::::::::::
CCDS72 EENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC
790 800
>>CCDS35155.1 LRRC8A gene_id:56262|Hs108|chr9 (810 aa)
initn: 3161 init1: 2464 opt: 3188 Z-score: 3142.7 bits: 592.4 E(32554): 9.9e-169
Smith-Waterman score: 3188; 59.0% identity (82.8% similar) in 803 aa overlap (1-796:1-802)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV
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CCDS35 MIPVTELRYFADTQPAYRILKPWWDVFTDYISIVMLMIAVFGGTLQVTQDKMIC-LPCKW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA0 EFDNHCAVPWDILKASMNTSSNPGT---PLPL--PLRIQNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLH
. : . : . :.. : : : :. :: :.::.:.::::::..::
CCDS35 VTKDSCNDSFRGWAAPGPEPTYPNSTILPTPDTGPTGIKYDLDRHQYNYVDAVCYENRLH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 WFAKFFPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAE
::::.:::::::::::: ::::::...: :::.:::::.:: ::::::::::::::::.:
CCDS35 WFAKYFPYLVLLHTLIFLACSNFWFKFPRTSSKLEHFVSILLKCFDSPWTTRALSETVVE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 QSVRPLKLSK--SKILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDKKEGEQ
.: .:: ... .:: : :... : . .:.. .. ..:::::::::
CCDS35 ESDPKPAFSKMNGSMDKKSSTVSEDVEATVPMLQRTKSRIEQGIVDRSETGVLDKKEGEQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 AKAIFEKVKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDV
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CCDS35 AKALFEKVKKFRTHVEEGDIVYRLYMRQTIIKVIKFILIICYTVYYVHNIKFDVDCTVDI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 QAFTGYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREK
...:::. :.:.. :: .::.:::::. :::.::: :.:::::: :::.::::..::.
CCDS35 ESLTGYRTYRCAHPLATLFKILASFYISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESIREE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SNYSDIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSK
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CCDS35 SSYSDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 LVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHS
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CCDS35 LTKNAQDKLELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 SLVVDHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEG
. .. ::::::.:::. :..:::.. .:: :.. ::.:.::.:.: . :. . ..:
CCDS35 AAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 FQDLKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELI
...:: :..: :::.::..::::::. :::::..:::.::.:::.::::.:: ::::
CCDS35 LRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 SCDLERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIG
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CCDS35 RCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIG
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 ALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNN
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CCDS35 NLTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANR
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 IEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSL
:: :: ::::.::. : ::.: :..: .::::.:::..:: :: :: :: :: : :
CCDS35 IETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLL
720 730 740 750 760 770
780 790 800
pF1KA0 KRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC
::. :.:::.:.:::: : :::
CCDS35 KRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA
780 790 800 810
>>CCDS725.1 LRRC8C gene_id:84230|Hs108|chr1 (803 aa)
initn: 3098 init1: 2168 opt: 2778 Z-score: 2739.1 bits: 517.7 E(32554): 3e-146
Smith-Waterman score: 2778; 50.2% identity (80.9% similar) in 810 aa overlap (1-798:1-802)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV
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CCDS72 MIPVTEFRQFSEQQPAFRVLKPWWDVFTDYLSVAMLMIGVFGCTLQVMQDKIIC-LPKRV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA0 E-FDNHCAVPWDILKASMNTSS------NPGTPLPLPLR-IQNDLHRQQYSYIDAVCYEK
. .:: .. .. .: .:. .:..:. . .. ...:: ::::.:. .:::.
CCDS72 QPAQNHSSLS-NVSQAVASTTPLPPPKPSPANPITVEMKGLKTDLDLQQYSFINQMCYER
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 QLHWFAKFFPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSET
:::.::.::::::.:::.: :::::...:..::..:::..:: ::::::::::::::.
CCDS72 ALHWYAKYFPYLVLIHTLVFMLCSNFWFKFPGSSSKIEHFISILGKCFDSPWTTRALSEV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KA0 VAEQSV----RPLKLSKSKILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDK
.:.: : ....:. . :. : ... .:.: :. ... :...:::
CCDS72 SGEDSEEKDNRKNNMNRSNTIQSGPEDSLVNSQSLKSIP------EKFVVDKSTAGALDK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 KEGEQAKAIFEKVKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEID
::::::::.:::::.::.:::. ::.: .:..: ..::: :..::.: ..... . .:
CCDS72 KEGEQAKALFEKVKKFRLHVEEGDILYAMYVRQTVLKVIKFLIIIAYNSALVSKVQFTVD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 CSVDVQAFTGYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFE
:.::.: .:::: ..: ...:..:. :. :. .: .:::: :.:.:.. ::..::::
CCDS72 CNVDIQDMTGYKNFSCNHTMAHLFSKLSFCYLCFVSIYGLTCLYTLYWLFYRSLREYSFE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 ALREKSNYSDIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVE
.:.... .:::::::::::.::. :::::::::::..::::::::::::.::::::: .
CCDS72 YVRQETGIDDIPDVKNDFAFMLHMIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLKQLNLNNEWTPD
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 KLKSKLVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKEL
::..:: ::....:: :.::.::::.:::.::.. :.::.: .: .:....:: ::.::
CCDS72 KLRQKLQTNAHNRLELPLIMLSGLPDTVFEITELQSLKLEIIKNVMIPATIAQLDNLQEL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 RVYHSSLVVDHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLST
... :. . ::.::.::::.: .:: .: ..: :.. :.::.:::: : . . .
CCDS72 SLHQCSVKIHSAALSFLKENLKVLSVKFDDMRELPPWMYGLRNLEELYLVGSLSHDISRN
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 MQLEGFQDLKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLK
. ::...:::.:. : .::..:.:::.:.:. :::. . :.:.:::.:::::::.::
CCDS72 VTLESLRDLKSLKILSIKSNVSKIPQAVVDVSSHLQKMCIHNDGTKLVMLNNLKKMTNLT
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 SLELISCDLERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYI
:::. ::::::::..::: .:.::::.:::::..:::.:::::..:. ::::::.:.::
CCDS72 ELELVHCDLERIPHAVFSLLSLQELDLKENNLKSIEEIVSFQHLRKLTVLKLWHNSITYI
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 PAQIGALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFA
: .: :..::.::..::.:: :: .::::.:..::::::: . ::: :: :..::::.
CCDS72 PEHIKKLTSLERLSFSHNKIEVLPSHLFLCNKIRYLDLSYNDIRFIPPEIGVLQSLQYFS
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 VTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELE
.: :..: ::: :. ::::. : .::::: :::..:.: :..:.. ::..: :::::
CCDS72 ITCNKVESLPDELYFCKKLKTLKIGKNSLSVLSPKIGNLLFLSYLDVKGNHFEILPPELG
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800
pF1KA0 GCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC
:..::: :.::. :..::: : :...:
CCDS72 DCRALKRAGLVVEDALFETLPSDVREQMKTE
780 790 800
>>CCDS12189.1 LRRC8E gene_id:80131|Hs108|chr19 (796 aa)
initn: 2832 init1: 2320 opt: 2494 Z-score: 2459.6 bits: 466.0 E(32554): 1.1e-130
Smith-Waterman score: 2494; 47.1% identity (76.9% similar) in 801 aa overlap (1-797:1-794)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV
:: ..:.: ... : ....:::::::. :.:. ::...:.. .::.::....: :: .
CCDS12 MIPVAEFKQFTEQQPAFKVLKPWWDVLAEYLTVAMLMIGVFGCTLQVTQDKIIC-LPNHE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EFDNHCAVPWDILKASMNTSSNPGTPLPLPLRIQNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKF
.: .: . : . . :. : ..:.: ::::.:. .::: :::.::.
CCDS12 LQENLSEAPCQQL-LPRGIPEQIGA-LQEVKGLKNNLDLQQYSFINQLCYETALHWYAKY
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CCDS12 FPYLVVIHTLIFMVCTSFWFKFPGTSSKIEHFISILGKCFDSPWTTRALSEVSGENQKGP
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pF1KA0 LKLSKSK---ILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDKKEGEQAKAI
.. . ....: . :.. .: :.. : :. ..:::::::::::.
CCDS12 AATERAAATIVAMAGTG-PGKAGEGEKEKVLAEP--EKVVTEPPVVTLLDKKEGEQAKAL
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CCDS12 FEKVKKFRMHVEEGDILYTMYIRQTVLKVCKFLAILVYNLVYVEKISFLVACRVETSEVT
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pF1KA0 GYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREKSNYS
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CCDS12 GYASFCCNHTKAHLFSKLAFCYISFVCIYGLTCIYTLYWLFHRPLKEYSFRSVREETGMG
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CCDS12 AAGRLELALCMLPGLPDTVFELSEVESLRLEAICDITFPPGLSQLVHLQELSLLHSPARL
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.::...::..:.: :. ..: ::: :..:.::.: : ..:..:. . ::....
CCDS12 PFSLQVFLRDHLKVMRVKCEELREVPLWVFGLRGLEELHLEG-LFPQELARAATLESLRE
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::.:..: :.:. ...: :::. ::.::: :.:..::.::.:::.. :. :::..:
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pF1KA0 LERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALS
::::::..:::. :.::::..:.:...:::.:::: ..: :.::::.:::.: .. :
CCDS12 LERIPHAVFSLGALQELDLKDNHLRSIEEILSFQHCRKLVTLRLWHNQIAYVPEHVRKLR
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.:::: :..:..:.:: :: ::. :. ::.:.: : .: :. :.:::..:.. : .:
CCDS12 SLEQLYLSYNKLETLPSQLGLCSGLRLLDVSHNGLHSLPPEVGLLQNLQHLALSYNALEA
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pF1KA0 LPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRN
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CCDS12 LPEELFFCRKLRTLLLGDNQLSQLSPHVGALRALSRLELKGNRLEALPEELGNCGGLKKA
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pF1KA0 CLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC
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CCDS12 GLLVEDTLYQGLPAEVRDKMEEE
780 790
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CCDS72 PVNSKAHTPPGNAEVTTNIPKMEAATNQDQDGRTTNDISFGTSAVTPDIPLRATYPRTDF
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100 110 120 130
pF1KA0 -----------------QNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKFFPYLVLLHTLIFAACS
...: ::: .:. .::. : :..:.::::.:.::.:. . :
CCDS72 ALPNQEAKKEKKDPTGRKTNLDFQQYVFINQMCYHLALPWYSKYFPYLALIHTIILMVSS
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:::..::.: :..::::.:: :::.:::::.:::::. :.: . ... .. : . .
CCDS72 NFWFKYPKTCSKVEHFVSILGKCFESPWTTKALSETACEDSEENKQRITGAQTLPKHVST
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:.: : . : :. . :. :. :: :. ..::::.::::::.::::..:: :::.
CCDS72 SSDEGSPSASTPMINKTGFKFSAEKPVIEVPSMTILDKKDGEQAKALFEKVRKFRAHVED
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pF1KA0 KDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDVQAFTGYKRYQCVYSLAE
.:.::..:. : ..:. :..:. :. :.. :..: :. :. . ::. ..:....:
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..: : :. .. .::. :.:.:..: ::.:::: .::.:..::::::::::::.:
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..:. .::. : : :: . :.:.::.:::.::::.:. ::: .:.::::::.::::.::
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CCDS72 EVKEALNQDINIPFANGI
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. :.: :... :: ....: .:: : :..: ...:: : ::. ::: :.: .
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CCDS58 PNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELY
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CCDS58 LNDNPNLHSLPFELALCSKL--SIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAM
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CCDS58 V
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:.. .. . .. .:... .::.. .::. ...: :: : : :..: .: :
CCDS75 LRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNLITLDVAHNQL--EHLPKE
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CCDS75 IGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLA--KCSALEEL-N
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:.. ...: .:. . . : .:..:.: . .: ... ... .. ::.. ...
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CCDS75 IPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLP--LDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSL
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CCDS75 EVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLP
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pF1KA0 DGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGN-YLETLPPELEGCQSLKRNC
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CCDS75 RGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKL--SI
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CCDS75 MSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV
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CCDS49 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEEL-LLDANQLRELPE
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: .:. : :. .:. ..: . .. .: :: .: .:: .... : :.
CCDS49 QFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISF-----CKALQ
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pF1KA0 TLYLKSS-LSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERI
. .... :.:.:. .: .: ::. :. : . .:. .. :: :::: : .
CCDS49 VADFSGNPLTRLPESFPEL-QNLTCLSV-NDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYL
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CCDS49 PDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKDL---WLDGNQLSELPQEIGNLKNLL
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CCDS49 CLDVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPE
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.. .:..: :.: .:.:..: .:.:..:..:. : : .:: :. :: :: :
CCDS49 AVGECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFC--
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pF1KA0 VEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC
:..: :. .: :..
CCDS49 VRDNRLTRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTD
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CCDS58 MDLRGLRPVPGGYFPENVKAMTSLRWLKLNRTGLCYLPEELAALQKLEHLSVSHNN
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pF1KA0 EVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDH-PALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLK
. : . .:.: .:. . . .:: . : : ..:..: :. ... . :: . . :
CCDS58 LTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSHNQLTECPRELENAK
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