FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0231, 803 aa 1>>>pF1KA0231 803 - 803 aa - 803 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6077+/-0.00117; mu= 13.8184+/- 0.070 mean_var=103.1632+/-21.569, 0's: 0 Z-trim(104.2): 172 B-trim: 73 in 1/50 Lambda= 0.126273 statistics sampled from 7570 (7768) to 7570 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16 Scan time: 3.440 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1 ( 803) 5285 974.4 0 CCDS35155.1 LRRC8A gene_id:56262|Hs108|chr9 ( 810) 3188 592.4 9.9e-169 CCDS725.1 LRRC8C gene_id:84230|Hs108|chr1 ( 803) 2778 517.7 3e-146 CCDS12189.1 LRRC8E gene_id:80131|Hs108|chr19 ( 796) 2494 466.0 1.1e-130 CCDS726.1 LRRC8D gene_id:55144|Hs108|chr1 ( 858) 2402 449.2 1.3e-125 CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 536) 414 87.0 9.4e-17 CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 582) 414 87.0 1e-16 CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6 ( 524) 407 85.7 2.2e-16 CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1258) 386 82.1 6.5e-15 CCDS11192.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1269) 386 82.1 6.6e-15 CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 907) 346 74.7 7.8e-13 CCDS46951.1 LRRIQ4 gene_id:344657|Hs108|chr3 ( 560) 339 73.3 1.3e-12 CCDS34844.1 MFHAS1 gene_id:9258|Hs108|chr8 (1052) 331 72.0 5.8e-12 CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 ( 545) 324 70.6 8.2e-12 CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 915) 322 70.3 1.6e-11 CCDS66873.1 LRRC28 gene_id:123355|Hs108|chr15 ( 312) 307 67.3 4.4e-11 CCDS10380.1 LRRC28 gene_id:123355|Hs108|chr15 ( 367) 307 67.4 5e-11 CCDS44508.1 PIDD1 gene_id:55367|Hs108|chr11 ( 893) 310 68.1 7.2e-11 CCDS7716.1 PIDD1 gene_id:55367|Hs108|chr11 ( 910) 310 68.1 7.3e-11 CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 310 68.1 7.7e-11 >>CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1 (803 aa) initn: 5285 init1: 5285 opt: 5285 Z-score: 5207.4 bits: 974.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5285; 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CCDS35 AKALFEKVKKFRTHVEEGDIVYRLYMRQTIIKVIKFILIICYTVYYVHNIKFDVDCTVDI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 QAFTGYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREK ...:::. :.:.. :: .::.:::::. :::.::: :.:::::: :::.::::..::. CCDS35 ESLTGYRTYRCAHPLATLFKILASFYISLVIFYGLICMYTLWWMLRRSLKKYSFESIREE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 SNYSDIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSK :.:::::::::::::.::: :::::::::::..::::::::::.:.:::::::..::... CCDS35 SSYSDIPDVKNDFAFMLHLIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLRQLNLNNEWTLDKLRQR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 LVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHS :.::::::.:::::::.:.::.::.:.:.:::.:::::.: .: ...::..:::: .::. CCDS35 LTKNAQDKLELHLFMLSGIPDTVFDLVELEVLKLELIPDVTIPPSIAQLTGLKELWLYHT 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 SLVVDHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEG . .. ::::::.:::. :..:::.. .:: :.. ::.:.::.:.: . :. . ..: CCDS35 AAKIEAPALAFLRENLRALHIKFTDIKEIPLWIYSLKTLEELHLTGNLSAENNRYIVIDG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KA0 FQDLKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELI ...:: :..: :::.::..::::::. :::::..:::.::.:::.::::.:: :::: CCDS35 LRELKRLKVLRLKSNLSKLPQVVTDVGVHLQKLSINNEGTKLIVLNSLKKMANLTELELI 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KA0 SCDLERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIG :::::::::::::.::.:.::..:::::.:::::::::. :.:::::.:.::::: ::: CCDS35 RCDLERIPHSIFSLHNLQEIDLKDNNLKTIEEIISFQHLHRLTCLKLWYNHIAYIPIQIG 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 ALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNN :.:::.: :..:.::..: ::: : ::.:::::.:.:::.: .: :.::: .:.: : CCDS35 NLTNLERLYLNRNKIEKIPTQLFYCRKLRYLDLSHNNLTFLPADIGLLQNLQNLAITANR 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 IEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSL :: :: ::::.::. : ::.: :..: .::::.:::..:: :: :: :: :: : : CCDS35 IETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQIELRGNRLECLPVELGECPLL 720 730 740 750 760 770 780 790 800 pF1KA0 KRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC ::. :.:::.:.:::: : ::: CCDS35 KRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA 780 790 800 810 >>CCDS725.1 LRRC8C gene_id:84230|Hs108|chr1 (803 aa) initn: 3098 init1: 2168 opt: 2778 Z-score: 2739.1 bits: 517.7 E(32554): 3e-146 Smith-Waterman score: 2778; 50.2% identity (80.9% similar) in 810 aa overlap (1-798:1-802) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV :: .::.. ... : ....:::::::: :... ::...:.. .::. :....: :: .: CCDS72 MIPVTEFRQFSEQQPAFRVLKPWWDVFTDYLSVAMLMIGVFGCTLQVMQDKIIC-LPKRV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KA0 E-FDNHCAVPWDILKASMNTSS------NPGTPLPLPLR-IQNDLHRQQYSYIDAVCYEK . .:: .. .. .: .:. .:..:. . .. ...:: ::::.:. .:::. CCDS72 QPAQNHSSLS-NVSQAVASTTPLPPPKPSPANPITVEMKGLKTDLDLQQYSFINQMCYER 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 QLHWFAKFFPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSET :::.::.::::::.:::.: :::::...:..::..:::..:: ::::::::::::::. CCDS72 ALHWYAKYFPYLVLIHTLVFMLCSNFWFKFPGSSSKIEHFISILGKCFDSPWTTRALSEV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 VAEQSV----RPLKLSKSKILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDK .:.: : ....:. . :. : ... .:.: :. ... :...::: CCDS72 SGEDSEEKDNRKNNMNRSNTIQSGPEDSLVNSQSLKSIP------EKFVVDKSTAGALDK 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 KEGEQAKAIFEKVKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEID ::::::::.:::::.::.:::. ::.: .:..: ..::: :..::.: ..... . .: CCDS72 KEGEQAKALFEKVKKFRLHVEEGDILYAMYVRQTVLKVIKFLIIIAYNSALVSKVQFTVD 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 CSVDVQAFTGYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFE :.::.: .:::: ..: ...:..:. :. :. .: .:::: :.:.:.. ::..:::: CCDS72 CNVDIQDMTGYKNFSCNHTMAHLFSKLSFCYLCFVSIYGLTCLYTLYWLFYRSLREYSFE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 ALREKSNYSDIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVE .:.... .:::::::::::.::. :::::::::::..::::::::::::.::::::: . CCDS72 YVRQETGIDDIPDVKNDFAFMLHMIDQYDPLYSKRFAVFLSEVSENKLKQLNLNNEWTPD 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 KLKSKLVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKEL ::..:: ::....:: :.::.::::.:::.::.. :.::.: .: .:....:: ::.:: CCDS72 KLRQKLQTNAHNRLELPLIMLSGLPDTVFEITELQSLKLEIIKNVMIPATIAQLDNLQEL 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 RVYHSSLVVDHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLST ... :. . ::.::.::::.: .:: .: ..: :.. :.::.:::: : . . . CCDS72 SLHQCSVKIHSAALSFLKENLKVLSVKFDDMRELPPWMYGLRNLEELYLVGSLSHDISRN 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 MQLEGFQDLKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLK . ::...:::.:. : .::..:.:::.:.:. :::. . :.:.:::.:::::::.:: CCDS72 VTLESLRDLKSLKILSIKSNVSKIPQAVVDVSSHLQKMCIHNDGTKLVMLNNLKKMTNLT 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 SLELISCDLERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYI :::. ::::::::..::: .:.::::.:::::..:::.:::::..:. ::::::.:.:: CCDS72 ELELVHCDLERIPHAVFSLLSLQELDLKENNLKSIEEIVSFQHLRKLTVLKLWHNSITYI 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 PAQIGALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFA : .: :..::.::..::.:: :: .::::.:..::::::: . ::: :: :..::::. CCDS72 PEHIKKLTSLERLSFSHNKIEVLPSHLFLCNKIRYLDLSYNDIRFIPPEIGVLQSLQYFS 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KA0 VTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELE .: :..: ::: :. ::::. : .::::: :::..:.: :..:.. ::..: ::::: CCDS72 ITCNKVESLPDELYFCKKLKTLKIGKNSLSVLSPKIGNLLFLSYLDVKGNHFEILPPELG 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 pF1KA0 GCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC :..::: :.::. :..::: : :...: CCDS72 DCRALKRAGLVVEDALFETLPSDVREQMKTE 780 790 800 >>CCDS12189.1 LRRC8E gene_id:80131|Hs108|chr19 (796 aa) initn: 2832 init1: 2320 opt: 2494 Z-score: 2459.6 bits: 466.0 E(32554): 1.1e-130 Smith-Waterman score: 2494; 47.1% identity (76.9% similar) in 801 aa overlap (1-797:1-794) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLCCLPCKV :: ..:.: ... : ....:::::::. :.:. ::...:.. .::.::....: :: . CCDS12 MIPVAEFKQFTEQQPAFKVLKPWWDVLAEYLTVAMLMIGVFGCTLQVTQDKIIC-LPNHE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 EFDNHCAVPWDILKASMNTSSNPGTPLPLPLRIQNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKF .: .: . : . . :. : ..:.: ::::.:. .::: :::.::. CCDS12 LQENLSEAPCQQL-LPRGIPEQIGA-LQEVKGLKNNLDLQQYSFINQLCYETALHWYAKY 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 FPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAEQSVRP :::::..::::: .:..::...:.:::..:::..:: ::::::::::::::. .:.. : CCDS12 FPYLVVIHTLIFMVCTSFWFKFPGTSSKIEHFISILGKCFDSPWTTRALSEVSGENQKGP 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KA0 LKLSKSK---ILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGLESAGIESPTSSVLDKKEGEQAKAI .. . ....: . :.. .: :.. : :. ..:::::::::::. CCDS12 AATERAAATIVAMAGTG-PGKAGEGEKEKVLAEP--EKVVTEPPVVTLLDKKEGEQAKAL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 FEKVKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDVQAFT :::::.::::::. ::.: .:..: ..:: :. :..: .. .:.. . : :... : CCDS12 FEKVKKFRMHVEEGDILYTMYIRQTVLKVCKFLAILVYNLVYVEKISFLVACRVETSEVT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 GYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREKSNYS :: . : .. :..:. :: :. .: .:::: :.:.:... ::.:::...::..... CCDS12 GYASFCCNHTKAHLFSKLAFCYISFVCIYGLTCIYTLYWLFHRPLKEYSFRSVREETGMG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 DIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKN :::::::::::.::: :::: ::::::..:::::::..:::.:::.::: :::..:: .: CCDS12 DIPDVKNDFAFMLHLIDQYDSLYSKRFAVFLSEVSESRLKQLNLNHEWTPEKLRQKLQRN 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 AQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVV : ..:: : :: ::::.::::.:.: : :: : .. .: ..::::.:.:: . :: . CCDS12 AAGRLELALCMLPGLPDTVFELSEVESLRLEAICDITFPPGLSQLVHLQELSLLHSPARL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 DHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLS-TMQLEGFQD .::...::..:.: :. ..: ::: :..:.::.: : ..:..:. . ::.... CCDS12 PFSLQVFLRDHLKVMRVKCEELREVPLWVFGLRGLEELHLEG-LFPQELARAATLESLRE 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KA0 LKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCD ::.:..: :.:. ...: :::. ::.::: :.:..::.::.:::.. :. :::..: CCDS12 LKQLKVLSLRSNAGKVPASVTDVAGHLQRLSLHNDGARLVALNSLKKLAALRELELVACG 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KA0 LERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALS ::::::..:::. :.::::..:.:...:::.:::: ..: :.::::.:::.: .. : CCDS12 LERIPHAVFSLGALQELDLKDNHLRSIEEILSFQHCRKLVTLRLWHNQIAYVPEHVRKLR 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 NLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEM .:::: :..:..:.:: :: ::. :. ::.:.: : .: :. :.:::..:.. : .: CCDS12 SLEQLYLSYNKLETLPSQLGLCSGLRLLDVSHNGLHSLPPEVGLLQNLQHLALSYNALEA 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 LPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRN ::. :: :.::. :::: :.: .:::::: : :..::: :: ::.:: :: .: .::. CCDS12 LPEELFFCRKLRTLLLGDNQLSQLSPHVGALRALSRLELKGNRLEALPEELGNCGGLKKA 720 730 740 750 760 770 780 790 800 pF1KA0 CLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC :.::..: . :: : .... CCDS12 GLLVEDTLYQGLPAEVRDKMEEE 780 790 >>CCDS726.1 LRRC8D gene_id:55144|Hs108|chr1 (858 aa) initn: 2960 init1: 2052 opt: 2402 Z-score: 2368.5 bits: 449.2 E(32554): 1.3e-125 Smith-Waterman score: 2502; 46.9% identity (75.8% similar) in 828 aa overlap (19-796:19-846) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAVLAGALQLTQSRVLC--CLPC ::::::::: :....::.::..::..:::...:.: :: CCDS72 MFTLAEVASLNDIQPTYRILKPWWDVFMDYLAVVMLMVAIFAGTMQLTKDQVVCLPVLPS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 pF1KA0 KVEFDNHCA-----VPWDILKASMNTSSNP----------GTP--LP-LPLRI------- :. : : .: : :... :: : .::: CCDS72 PVNSKAHTPPGNAEVTTNIPKMEAATNQDQDGRTTNDISFGTSAVTPDIPLRATYPRTDF 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 pF1KA0 -----------------QNDLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKFFPYLVLLHTLIFAACS ...: ::: .:. .::. : :..:.::::.:.::.:. . : CCDS72 ALPNQEAKKEKKDPTGRKTNLDFQQYVFINQMCYHLALPWYSKYFPYLALIHTIILMVSS 130 140 150 160 170 180 140 150 160 170 180 190 pF1KA0 NFWLHYPSTSSRLEHFVAILHKCFDSPWTTRALSETVAEQSVR-PLKLSKSKILLSSSGC :::..::.: :..::::.:: :::.:::::.:::::. :.: . ... .. : . . CCDS72 NFWFKYPKTCSKVEHFVSILGKCFESPWTTKALSETACEDSEENKQRITGAQTLPKHVST 190 200 210 220 230 240 200 210 220 230 240 250 pF1KA0 SADIDSGKQSLPY-PQPGL----ESAGIESPTSSVLDKKEGEQAKAIFEKVKRFRMHVEQ :.: : . : :. . :. :. :: :. ..::::.::::::.::::..:: :::. CCDS72 SSDEGSPSASTPMINKTGFKFSAEKPVIEVPSMTILDKKDGEQAKALFEKVRKFRAHVED 250 260 270 280 290 300 260 270 280 290 300 310 pF1KA0 KDIIYRVYLKQIIVKVILFVLIITYVPYFLTHITLEIDCSVDVQAFTGYKRYQCVYSLAE .:.::..:. : ..:. :..:. :. :.. :..: :. :. . ::. ..:....: CCDS72 SDLIYKLYVVQTVIKTAKFIFILCYTANFVNAISFEHVCKPKVEHLIGYEVFECTHNMAY 310 320 330 340 350 360 320 330 340 350 360 370 pF1KA0 IFKVLASFYVILVILYGLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREKSNYSDIPDVKNDFAFIL ..: : :. .. .::. :.:.:..: ::.:::: .::.:..::::::::::::.: CCDS72 MLKKLLISYISIICVYGFICLYTLFWLFRIPLKEYSFEKVREESSFSDIPDVKNDFAFLL 370 380 390 400 410 420 380 390 400 410 420 430 pF1KA0 HLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKNAQDKIELHLFMLN :..:::: ::::::..::::::::::..:.::.::: :::.... .::::: :::::::. CCDS72 HMVDQYDQLYSKRFGVFLSEVSENKLREISLNHEWTFEKLRQHISRNAQDKQELHLFMLS 430 440 450 460 470 480 440 450 460 470 480 490 pF1KA0 GLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDHPALAFLEENLK :.:: ::.::...::.::::::.:.:. .::..::.::.. : :.. :..::...:. CCDS72 GVPDAVFDLTDLDVLKLELIPEAKIPAKISQMTNLQELHLCHCPAKVEQTAFSFLRDHLR 490 500 510 520 530 540 500 510 520 530 540 550 pF1KA0 ILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNLRTLYLKSSLS :..:::....:: ::. ::::.:::: : . :. . . ::....:..:. :..::.:. CCDS72 CLHVKFTDVAEIPAWVYLLKNLRELYLIGNLNSENNKMIGLESLRELRHLKILHVKSNLT 550 560 570 580 590 600 560 570 580 590 600 610 pF1KA0 RIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERIPHSIFSLNNL ..:. .::. : : :: . :.:.::.:::.::::.:. ::: .:.::::::.::::.:: CCDS72 KVPSNITDVAPHLTKLVIHNDGTKLLVLNSLKKMMNVAELELQNCELERIPHAIFSLSNL 610 620 630 640 650 660 620 630 640 650 660 670 pF1KA0 HELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQLSLDHNNIEN .::::. ::..:.:::::::::. :.:::::::.:. :: .: ..:::.: ...:..:. CCDS72 QELDLKSNNIRTIEEIISFQHLKRLTCLKLWHNKIVTIPPSITHVKNLESLYFSNNKLES 670 680 690 700 710 720 680 690 700 710 720 730 pF1KA0 LPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCL ::. .: ::. ::.:::....:: :: :.:::.. .:.:....:: ::.: ::. : CCDS72 LPVAVFSLQKLRCLDVSYNNISMIPIEIGLLQNLQHLHITGNKVDILPKQLFKCIKLRTL 730 740 750 760 770 780 740 750 760 770 780 790 pF1KA0 LLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPL ::.: . .: .::.::.::.::: :: :. :: .: :. ::.. :.::..:..:::: CCDS72 NLGQNCITSLPEKVGQLSQLTQLELKGNCLDRLPAQLGQCRMLKKSGLVVEDHLFDTLPL 790 800 810 820 830 840 800 pF1KA0 PVTERLQTCLDKC : : : CCDS72 EVKEALNQDINIPFANGI 850 >>CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 (536 aa) initn: 457 init1: 230 opt: 414 Z-score: 414.3 bits: 87.0 E(32554): 9.4e-17 Smith-Waterman score: 425; 28.6% identity (62.7% similar) in 426 aa overlap (393-789:100-511) 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 KNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKNAQDKI ::... ..:... ... : :. .:. . CCDS58 NTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKR-SIHILPSS-IKELTQLT 70 80 90 100 110 120 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 ELHLFM--LNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDHP ::.:. :..:: .: :... .:.: ..::.....: .:. : . :..: . : CCDS58 ELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLR-EIP 130 140 150 160 170 180 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 ALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNL .... ..: : :.:... . . .:::..: . . . .... . : . .:..: CCDS58 SVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVEK---DIKNLSKLSMLS-IRENKIKQLPAE-IGNLSSL 190 200 210 220 230 240 550 560 570 580 pF1KA0 RTLYLK-SSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEG---------SKLVVLNNL--------- : :. . :: ::. .. .:..:.:.:.. :.:: ::.: CCDS58 SRLGLRYNRLSAIPRSLAKC-SALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQL 250 260 270 280 290 590 600 610 620 630 pF1KA0 ------KKMVNLKSLELISCDLERIPHSIFSLNN-LHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQN ... .. ::.. ...:: .::: . : .:....:.: .. ..: . CCDS58 YPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLP--LDFGTWTS 300 310 320 330 340 350 640 650 660 670 680 690 pF1KA0 LSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFI . :.: :... :: ....: .:: : :..: ...:: : ::. ::: :.: . CCDS58 MVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESL 360 370 380 390 400 410 700 710 720 730 740 750 pF1KA0 PEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLE :.:: ::..:: ...:::.. :: :. . .: : ::.: : .: ..: : :: .: CCDS58 PNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELY 420 430 440 450 460 470 760 770 780 790 800 pF1KA0 LIGN-YLETLPPELEGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC : : :..:: :: :..: . . .:. :. :: CCDS58 LNDNPNLHSLPFELALCSKL--SIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAM 480 490 500 510 520 530 CCDS58 V >>CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 (582 aa) initn: 674 init1: 230 opt: 414 Z-score: 413.8 bits: 87.0 E(32554): 1e-16 Smith-Waterman score: 414; 27.4% identity (62.9% similar) in 402 aa overlap (395-789:170-557) 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 DFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVK-NAQDKIE ::....: .. .... : . . .. . CCDS75 AEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHN-KLREIPSVVYRLDSLTTLY 140 150 160 170 180 190 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 LHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDH-PAL :.. .. . .. .:... .::.. .::. ...: :: : : :..: .: : CCDS75 LRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNLITLDVAHNQL--EHLPKE 200 210 220 230 240 250 490 500 510 520 530 pF1KA0 AFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKEL---YLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKN .. : :. .:. .: . .:..:..: : ..:..:. . ....: : CCDS75 IGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLA--KCSALEEL-N 260 270 280 290 300 310 540 550 560 570 580 590 pF1KA0 LRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLER :.. ...: .:. . . : .:..:.: . .: ... ... .. ::.. ... CCDS75 LEN----NNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINK 320 330 340 350 360 600 610 620 630 640 650 pF1KA0 IPHSIFSLNN-LHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNL :: .::: . : .:....:.: .. ..: .. :.: :... :: ....: .: CCDS75 IPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLP--LDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSL 370 380 390 400 410 420 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 EQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLP : : :..: ...:: : ::. ::: :.: .:.:: ::..:: ...:::.. :: CCDS75 EVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLP 430 440 450 460 470 480 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 DGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGN-YLETLPPELEGCQSLKRNC :. . .: : ::.: : .: ..: : :: .: : : :..:: :: :..: . CCDS75 RGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKL--SI 490 500 510 520 530 540 780 790 800 pF1KA0 LIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC . .:. :. :: CCDS75 MSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV 550 560 570 580 >>CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6 (524 aa) initn: 281 init1: 281 opt: 407 Z-score: 407.5 bits: 85.7 E(32554): 2.2e-16 Smith-Waterman score: 414; 30.4% identity (61.7% similar) in 345 aa overlap (453-794:25-356) 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 ELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLV-NLKELRVYHSSLVVDHPA : .: . . . .:.:: . .. . . : CCDS49 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEEL-LLDANQLRELPE 10 20 30 40 50 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 LAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNLR : .:. : :. .:. ..: . .. .: :: .: .:: .... : :. CCDS49 QFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISF-----CKALQ 60 70 80 90 100 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 TLYLKSS-LSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERI . .... :.:.:. .: .: ::. :. : . .:. .. :: :::: : . CCDS49 VADFSGNPLTRLPESFPEL-QNLTCLSV-NDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYL 110 120 130 140 150 160 610 620 630 640 650 pF1KA0 PHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEII-SFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLE : :. .: :.:::: .:.. .. : : .. ::..: : :... .: .:: :.:: CCDS49 PDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKDL---WLDGNQLSELPQEIGNLKNLL 170 180 190 200 210 220 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 QLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPD :....: .: :: .. :.: : .: : : ::. : :..:. . : .: . .::. CCDS49 CLDVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPE 230 240 250 260 270 280 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 GLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLI .. .:..: :.: .:.:..: .:.:..:..:. : : .:: :. :: :: : CCDS49 AVGECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFC-- 290 300 310 320 330 340 780 790 800 pF1KA0 VEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC :..: :. .: :.. CCDS49 VRDNRLTRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTD 350 360 370 380 390 400 >>CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1258 aa) initn: 501 init1: 162 opt: 386 Z-score: 381.2 bits: 82.1 E(32554): 6.5e-15 Smith-Waterman score: 386; 29.5% identity (59.9% similar) in 352 aa overlap (422-766:27-370) 400 410 420 430 440 450 pF1KA0 SENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIP ..:. : ::... : ..: ::. 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