Result of FASTA (omim) for
pF1KA0233
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0233, 2521 aa
1>>>pF1KA0233 2521 - 2521 aa - 2521 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5541+/-0.000405; mu= 21.7418+/- 0.025
mean_var=122.7813+/-25.058, 0's: 0 Z-trim(115.7): 13 B-trim: 1082 in 2/51
Lambda= 0.115747
statistics sampled from 26263 (26276) to 26263 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 19.970
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001136336 (OMIM: 194380,611184,616843) piezo-ty (2521) 17013 2853.9 0
NP_071351 (OMIM: 108145,114300,248700,613629,61714 (2752) 3301 564.2 8.6e-159
XP_011524027 (OMIM: 108145,114300,248700,613629,61 (2766) 3301 564.2 8.7e-159
XP_011524026 (OMIM: 108145,114300,248700,613629,61 (2777) 3301 564.2 8.7e-159
XP_016881407 (OMIM: 108145,114300,248700,613629,61 (2783) 3301 564.2 8.7e-159
XP_011524025 (OMIM: 108145,114300,248700,613629,61 (2796) 3301 564.2 8.7e-159
XP_011524028 (OMIM: 108145,114300,248700,613629,61 (2735) 2609 448.6 5.2e-124
>>NP_001136336 (OMIM: 194380,611184,616843) piezo-type m (2521 aa)
initn: 17013 init1: 17013 opt: 17013 Z-score: 15347.0 bits: 2853.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 17013; 99.8% identity (99.9% similar) in 2521 aa overlap (1-2521:1-2521)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MEPHVLGAVLYWLLLPCALLAACLLRFSGLSLVYLLFLLLLPWFPGPTRCGLQGHTGRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEPHVLGAVLYWLLLPCALLAACLLRFSGLSLVYLLFLLLLPWFPGPTRCGLQGHTGRLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 RALLGLSLLFLVAHLALQICLHTVPRLDQLLGPSCSRWETLSRHIGVTRLDLKDIPNAIR
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RALLGLSLLFLVAHLALQICLHIVPRLDQLLGPSCSRWETLSRHIGVTRLDLKDIPNAIR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LVAPDLGILVVSSVCLGICGRLARNTRQSPHPRELDDDERDVDASPTAGLQEAATLAPTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVAPDLGILVVSSVCLGICGRLARNTRQSPHPRELDDDERDVDASPTAGLQEAATLAPTR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RSRLAARFRVTAHWLLVAAGRVLAVTLLALAGIAHPSALSSVYLLLFLALCTWWACHFPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSRLAARFRVTAHWLLVAAGRVLAVTLLALAGIAHPSALSSVYLLLFLALCTWWACHFPI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 STRGFSRLCAAVGCFGAGHLICLYCYQMPLAQALLPPAGIWARVLGLKDFVGPTNCSSPH
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STRGFSRLCVAVGCFGAGHLICLYCYQMPLAQALLPPAGIWARVLGLKDFVGPTNCSSPH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ALVLNTGLDWPVYASPGVLLLLCYATASLRKLRAYRPSGQRKEAAKGYEARELELAELDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALVLNTGLDWPVYASPGVLLLLCYATASLRKLRAYRPSGQRKEAAKGYEARELELAELDQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 WPQERESDQHVVPTAPDTEADNCIVHELTGQSSLLRRPVRPKRAEPGEASPLHSLGHLIM
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: :::::::::::::
NP_001 WPQERESDQHVVPTAPDTEADNCIVHELTGQSSVLRRPVRPKRAEPREASPLHSLGHLIM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DQSYVCALIAMMVWSITYHSWLTFVLLLWACLIWTVRSRHQLAMLCSPCILLYGMTLCCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQSYVCALIAMMVWSITYHSWLTFVLLLWACLIWTVRSRHQLAMLCSPCILLYGMTLCCL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RYVWAMDLRPELPTTLGPVSLRQLGLEHTRYPCLDLGAMLLYTLTFWLLLRQFVKEKLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RYVWAMDLRPELPTTLGPVSLRQLGLEHTRYPCLDLGAMLLYTLTFWLLLRQFVKEKLLK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 WAESPAALTEVTVADTEPTRTQTLLQSLGELVKGVYAKYWIYVCAGMFIVVSFAGRLVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WAESPAALTEVTVADTEPTRTQTLLQSLGELVKGVYAKYWIYVCAGMFIVVSFAGRLVVY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 KIVYMFLFLLCLTLFQVYYSLWRKLLKAFWWLVVAYTMLVLIAVYTFQFQDFPAYWRNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KIVYMFLFLLCLTLFQVYYSLWRKLLKAFWWLVVAYTMLVLIAVYTFQFQDFPAYWRNLT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GFTDEQLGDLGLEQFSVSELFSSILVPGFFLLACILQLHYFHRPFMQLTDMEHVSLPGTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFTDEQLGDLGLEQFSVSELFSSILVPGFFLLACILQLHYFHRPFMQLTDMEHVSLPGTR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LPRWAHRQDAVSGTPLLREEQQEHQQQQQEEEEEEEDSRDEGLGVATPHQATQVPEGAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPRWAHRQDAVSGTPLLREEQQEHQQQQQEEEEEEEDSRDEGLGVATPHQATQVPEGAAK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 WGLVAERLLELAAGFSDVLSRVQVFLRRLLELHVFKLVALYTVWVALKEVSVMNLLLVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WGLVAERLLELAAGFSDVLSRVQVFLRRLLELHVFKLVALYTVWVALKEVSVMNLLLVVL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 WAFALPYPRFRPMASCLSTVWTCVIIVCKMLYQLKVVNPQEYSSNCTEPFPNSTNLLPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WAFALPYPRFRPMASCLSTVWTCVIIVCKMLYQLKVVNPQEYSSNCTEPFPNSTNLLPTE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ISQSLLYRGPVDPANWFGVRKGFPNLGYIQNHLQVLLLLVFEAIVYRRQEHYRRQHQLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISQSLLYRGPVDPANWFGVRKGFPNLGYIQNHLQVLLLLVFEAIVYRRQEHYRRQHQLAP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 LPAQAVFASGTRQQLDQDLLGCLKYFINFFFYKFGLEICFLMAVNVIGQRMNFLVTLHGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPAQAVFASGTRQQLDQDLLGCLKYFINFFFYKFGLEICFLMAVNVIGQRMNFLVTLHGC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 WLVAILTRRHRQAIARLWPNYCLFLALFLLYQYLLCLGMPPALCIDYPWRWSRAVPMNSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WLVAILTRRHRQAIARLWPNYCLFLALFLLYQYLLCLGMPPALCIDYPWRWSRAVPMNSA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 LIKWLYLPDFFRAPNSTNLISDFLLLLCASQQWQVFSAERTEEWQRMAGVNTDRLEPLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIKWLYLPDFFRAPNSTNLISDFLLLLCASQQWQVFSAERTEEWQRMAGVNTDRLEPLRG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 EPNPVPNFIHCRSYLDMLKVAVFRYLFWLVLVVVFVTGATRISIFGLGYLLACFYLLLFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPNPVPNFIHCRSYLDMLKVAVFRYLFWLVLVVVFVTGATRISIFGLGYLLACFYLLLFG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 TALLQRDTRARLVLWDCLILYNVTVIISKNMLSLLACVFVEQMQTGFCWVIQLFSLVCTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TALLQRDTRARLVLWDCLILYNVTVIISKNMLSLLACVFVEQMQTGFCWVIQLFSLVCTV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 KGYYDPKEMMDRDQDCLLPVEEAGIIWDSVCFFFLLLQRRVFLSHYYLHVRADLQATALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGYYDPKEMMDRDQDCLLPVEEAGIIWDSVCFFFLLLQRRVFLSHYYLHVRADLQATALL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 ASRGFALYNAANLKSIDFHRRIEEKSLAQLKRQMERIRAKQEKHRQGRVDRSRPQDTLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASRGFALYNAANLKSIDFHRRIEEKSLAQLKRQMERIRAKQEKHRQGRVDRSRPQDTLGP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 KDPGLEPGPDSPGGSSPPRRQWWRPWLDHATVIHSGDYFLFESDSEEEEEAVPEDPRPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDPGLEPGPDSPGGSSPPRRQWWRPWLDHATVIHSGDYFLFESDSEEEEEAVPEDPRPSA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 QSAFQLAYQAWVTNAQAVLRRRQQEQEQARQEQAGQLPTGGGPSQEVEPAEGPEEAAAGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSAFQLAYQAWVTNAQAVLRRRQQEQEQARQEQAGQLPTGGGPSQEVEPAEGPEEAAAGR
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 SHVVQRVLSTAQFLWMLGQALVDELTRWLQEFTRHHGTMSDVLRAERYLLTQELLQGGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SHVVQRVLSTAQFLWMLGQALVDELTRWLQEFTRHHGTMSDVLRAERYLLTQELLQGGEV
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 HRGVLDQLYTSQAEATLPGPTEAPNAPSTVSSGLGAEEPLSSMTDDMGSPLSTGYHTRSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HRGVLDQLYTSQAEATLPGPTEAPNAPSTVSSGLGAEEPLSSMTDDMGSPLSTGYHTRSG
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 SEEAVTDPGEREAGASLYQGLMRTASELLLDRRLRIPELEEAELFAEGQGRALRLLRAVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEEAVTDPGEREAGASLYQGLMRTASELLLDRRLRIPELEEAELFAEGQGRALRLLRAVY
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 QCVAAHSELLCYFIIILNHMVTASAGSLVLPVLVFLWAMLSIPRPSKRFWMTAIVFTEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QCVAAHSELLCYFIIILNHMVTASAGSLVLPVLVFLWAMLSIPRPSKRFWMTAIVFTEIA
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 VVVKYLFQFGFFPWNSHVVLRRYENKPYFPPRILGLEKTDGYIKYDLVQLMALFFHRSQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVVKYLFQFGFFPWNSHVVLRRYENKPYFPPRILGLEKTDGYIKYDLVQLMALFFHRSQL
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 LCYGLWDHEEDSPSKEHDKSGEEEQGAEEGPGVPAATTEDHIQVEARVGPTDGTPEPQVE
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NP_001 LCYGLWDHEEDSPSKEHDKSGEEEQGAEEGPGVPAATTEDHIQVEARVGPTDGTPEPQVE
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 LRPRDTRRISLRFRRRKKEGPARKGAAAIEAEDREEEEGEEEKEAPTGREKRPSRSGGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRPRDTRRISLRFRRRKKEGPARKGAAAIEAEDREEEEGEEEKEAPTGREKRPSRSGGRV
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 RAAGRRLQGFCLSLAQGTYRPLRRFFHDILHTKYRAATDVYALMFLADVVDFIIIIFGFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAAGRRLQGFCLSLAQGTYRPLRRFFHDILHTKYRAATDVYALMFLADVVDFIIIIFGFW
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 AFGKHSAATDITSSLSDDQVPEAFLVMLLIQFSTMVVDRALYLRKTVLGKLAFQVALVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFGKHSAATDITSSLSDDQVPEAFLVMLLIQFSTMVVDRALYLRKTVLGKLAFQVALVLA
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 IHLWMFFILPAVTERMFNQNVVAQLWYFVKCIYFALSAYQIRCGYPTRILGNFLTKKYNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHLWMFFILPAVTERMFNQNVVAQLWYFVKCIYFALSAYQIRCGYPTRILGNFLTKKYNH
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA0 LNLFLFQGFRLVPFLVELRAVMDWVWTDTTLSLSSWMCVEDIYANIFIIKCSRETEKKYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNLFLFQGFRLVPFLVELRAVMDWVWTDTTLSLSSWMCVEDIYANIFIIKCSRETEKKYP
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA0 QPKGQKKKKIVKYGMGGLIILFLIAIIWFPLLFMSLVRSVVGVVNQPIDVTVTLKLGGYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QPKGQKKKKIVKYGMGGLIILFLIAIIWFPLLFMSLVRSVVGVVNQPIDVTVTLKLGGYE
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA0 PLFTMSAQQPSIIPFTAQAYEELSRQFDPQPLAMQFISQYSPEDIVTAQIEGSSGALWRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLFTMSAQQPSIIPFTAQAYEELSRQFDPQPLAMQFISQYSPEDIVTAQIEGSSGALWRI
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KA0 SPPSRAQMKRELYNGTADITLRFTWNFQRDLAKGGTVEYANEKHMLALAPNSTARRQLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPPSRAQMKRELYNGTADITLRFTWNFQRDLAKGGTVEYANEKHMLALAPNSTARRQLAS
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KA0 LLEGTSDQSVVIPNLFPKYIRAPNGPEANPVKQLQPNEEADYLGVRIQLRREQGAGATGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLEGTSDQSVVIPNLFPKYIRAPNGPEANPVKQLQPNEEADYLGVRIQLRREQGAGATGF
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KA0 LEWWVIELQECRTDCNLLPMVIFSDKVSPPSLGFLAGYGIMGLYVSIVLVIGKFVRGFFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEWWVIELQECRTDCNLLPMVIFSDKVSPPSLGFLAGYGIMGLYVSIVLVIGKFVRGFFS
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KA0 EISHSIMFEELPCVDRILKLCQDIFLVRETRELELEEELYAKLIFLYRSPETMIKWTREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EISHSIMFEELPCVDRILKLCQDIFLVRETRELELEEELYAKLIFLYRSPETMIKWTREK
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KA0 E
:
NP_001 E
>>NP_071351 (OMIM: 108145,114300,248700,613629,617146) p (2752 aa)
initn: 6038 init1: 1874 opt: 3301 Z-score: 2971.8 bits: 564.2 E(85289): 8.6e-159
Smith-Waterman score: 7048; 45.0% identity (69.6% similar) in 2585 aa overlap (180-2520:203-2750)
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 PHPRELDDDERDVDASPTAGLQEAATLAPTRRSRLAARFRVTAHWLLVAAGRVLAVTLLA
: . .:.... ....::.:... ::.
NP_071 EEALIYEEDFNGGDGVEGELEESTKLKMFRRLASVASKLKEFIGNMITTAGKVVVTILLG
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 LAGIAHPSALSSVYLLLFLALCTWWA-CHFPISTRGFSRLCAAVGCFGAGHLICLYCYQM
.:. :: ::::...::.:::::. :. .. :: ::. .. : ::::: :: ::.
NP_071 SSGMMLPSLTSSVYFFVFLGLCTWWSWCR-TFDPLLFSCLCVLLAIFTAGHLIGLYLYQF
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 PLAQALLPPAGIWARVLGLKDFVGPTNCSSPHALVLNTGLDWPVYASPGVLLLLCYATAS
. : .:: .::..:.:. . :.::: ...: :.: .:.: .::.. :. :.
NP_071 QFFQEAVPPNDYYARLFGIKSVI-QTDCSSTWKIIVNPDLSWYHHANPILLLVMYYTLAT
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360
pF1KA0 LRKLRAYRP----------------------SGQRKEA--AKGY---EARELELAELDQW
: .. .: .:.:. : : : . : ... :
NP_071 LIRIWLQEPLVQDEGTKEEDKALACSPIQITAGRRRSLWYATHYPTDERKLLSMTQDDYK
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400
pF1KA0 PQE--------RESDQHVV-PTAP--------DTEADNCIVHELTGQSSLLRRPVRPKRA
:.. : :.. :. : : . : . .:: :. . ..
NP_071 PSDGLLVTVNGNPVDYHTIHPSLPMENGPGKADLYSTPQYRWEPSDESSEKREEEEEEKE
420 430 440 450 460 470
410 420 430 440 450
pF1KA0 EPGEASP--------LH---SLGHLIMDQSYVCALIAMMVWSITYHSWLTFVLLLWACLI
: : .: :. ..:: :::.:::::::.::::::::::::::.:.: .
NP_071 EFEEERSREEKRSIKVHAMVSVFQFIMKQSYICALIAMMAWSITYHSWLTFVLLIWSCTL
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 WTVRSRHQLAMLCSPCILLYGMTLCCLRYVWAMDLRPELPTTLGPVSLRQLGLEHTRYPC
: .:.:.. ::. :: ...:: : :.:.:...: ::. . : . .. :
NP_071 WMIRNRRKYAMISSPFMVVYGNLLLILQYIWSFEL-PEIKKVPGFLEKKEPG--------
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>--
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]