FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0249, 896 aa 1>>>pF1KA0249 896 - 896 aa - 896 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6382+/-0.000946; mu= 10.9917+/- 0.057 mean_var=128.6180+/-25.419, 0's: 0 Z-trim(109.2): 27 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.113090 statistics sampled from 10729 (10742) to 10729 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16 Scan time: 4.790 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11829.1 LPIN2 gene_id:9663|Hs108|chr18 ( 896) 6021 994.1 0 CCDS1682.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 ( 890) 2214 373.0 1.3e-102 CCDS58701.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 ( 896) 2214 373.0 1.4e-102 CCDS58699.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 ( 975) 2172 366.2 1.7e-100 CCDS33469.2 LPIN3 gene_id:64900|Hs108|chr20 ( 852) 1385 237.7 6.7e-62 CCDS58700.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 ( 459) 712 127.8 4.5e-29 >>CCDS11829.1 LPIN2 gene_id:9663|Hs108|chr18 (896 aa) initn: 6021 init1: 6021 opt: 6021 Z-score: 5312.2 bits: 994.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6021; 100.0% identity (100.0% similar) in 896 aa overlap (1-896:1-896) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGKLGVLRS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGKLGVLRS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 KEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 KEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 PLVKSGGDETPSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDSKKEEQAASAAAEDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 PLVKSGGDETPSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDSKKEEQAASAAAEDT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 CDVGVSSDDDKGAQAARGSSNASLKEEECKEPLLFHSGDHYPLSDGDWSPLETTYPQTAC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 CDVGVSSDDDKGAQAARGSSNASLKEEECKEPLLFHSGDHYPLSDGDWSPLETTYPQTAC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KA0 PKSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERSDHHPRTATITPSENTHFRV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 PKSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERSDHHPRTATITPSENTHFRV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA0 IPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTSVAELLEPPLESTQISSMLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 IPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTSVAELLEPPLESTQISSMLD 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 ADHLPNAALAEAPSESKPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQGPDDIYLDDLKGLEPEVAALYF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ADHLPNAALAEAPSESKPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQGPDDIYLDDLKGLEPEVAALYF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 PKSESEPGSRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTECLSDSAMDLPDVTLSLCGGLSEN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 PKSESEPGSRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTECLSDSAMDLPDVTLSLCGGLSEN 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 GEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRYYNWALAAPMILSLQVFQKSLPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 GEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRYYNWALAAPMILSLQVFQKSLPK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 ATVESWVKDKMPKKSGRWWFWRKRESMTKQLPESKEGKSEAPPASDLPSSSKEPAGARPA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ATVESWVKDKMPKKSGRWWFWRKRESMTKQLPESKEGKSEAPPASDLPSSSKEPAGARPA 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 ENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTTSYKKSLRLSSDQIAKLKLHDGPNDVVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTTSYKKSLRLSSDQIAKLKLHDGPNDVVF 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 SITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGTITKSDALGQILPQLGKDWTHQGIAKLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 SITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGTITKSDALGQILPQLGKDWTHQGIAKLY 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 HSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNDKGTILPRGPLMLSPSSLFSAFHREVIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 HSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNDKGTILPRGPLMLSPSSLFSAFHREVIE 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 KKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRPNDVYAYTQVGVPDCRIFTVNPKGELIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 KKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRPNDVYAYTQVGVPDCRIFTVNPKGELIQ 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KA0 ERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFPCPEFSSFCYWRDPIPEVDLDDLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFPCPEFSSFCYWRDPIPEVDLDDLS 850 860 870 880 890 >>CCDS1682.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 (890 aa) initn: 2887 init1: 1347 opt: 2214 Z-score: 1955.4 bits: 373.0 E(32554): 1.3e-102 Smith-Waterman score: 2960; 51.4% identity (74.9% similar) in 917 aa overlap (1-895:1-885) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGKLGVLRS :::::::::::.:::::::::.: ::::::::.::..: .:. :::::::::::.::::: CCDS16 MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 KEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDT .:::.:::::: .::::::::::::::::.::... : .: .:::::: .: . .. CCDS16 REKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGA--SRMEC 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KA0 PLVKSGGDET----PSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDS-KKEEQAASA : ... :. :: ... . .:: . : :::...::.: . :: :.... .. CCDS16 QLKRGSVDRMRGLDPSTPAQV--IAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 AAEDTCDVGVSSDDD-KGAQAARGSSNA------SLKEEECKEPLLFHSGDHYPLSDGDW :: . .:::. . ...: : .. ::. . ... .. :: :: .: CCDS16 EDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDREW 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 SPLET-TYPQTACPKSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERSDHHPRT :: . . . . ::::::: : .: ... .: : :: .:...: :. .. . CCDS16 SPTPSPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 ATITPSENTHFRVIPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTSVAELLE .. ...::..: ::. :.. .: : :.: :: : . : . . : CCDS16 SSRKICDKSHFQAIHSES---SDTFSDQSP-----TLVGG---ALLDQNKPQTEMQFVNE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 PPLESTQISSMLDADHLPNAALAEAPSES--KPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQGPDDIYL ::. .. : :: . :: : . : :.::::.:. :::.: : : .:: CCDS16 EDLETLGAAAPL----LPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKR--DKRSRHLGADGVYL 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 DDLKGLEPEVAALYFPKSESEPG-SRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTECLSDSAM ::: ..::::::::::. . : ... .. . :..::::::::...:::.: ::. CCDS16 DDLTDMDPEVAALYFPKNGDPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLR 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 DLPDVTLSLCGGLSENGEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRYYNWALA :::....:::::::.. ::.:. :.:. ..:..:..::..::.::::..: ..::::. : CCDS16 DLPSIAISLCGGLSDHREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTA 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 APMILSLQVFQKSLPKATVESWVKDKMPKKSGRWWF-WRKRESMTKQLPESKEGKSEAPP ::..:..:.::: :::::::: ..::::::.::::: :: :.. :. :.: : CCDS16 APLLLAMQAFQKPLPKATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKE-----ESKPEQCL 520 530 540 550 560 570 590 600 610 620 630 pF1KA0 ASDLPSSSKEPA----GARPAENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTTSYKKSL :. :....: ..: ...::::: . : .. .: : ..::::.: CCDS16 AGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHESSSSDEERAAAKPS-NAGHLPLLP-----NVSYKKTL 580 590 600 610 620 640 650 660 670 680 690 pF1KA0 RLSSDQIAKLKLHDGPNDVVFSITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGTITKSDA ::.:.:. .:::..::::::::.:::::::::: ::::::::.::.::::::::::.::. CCDS16 RLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDT 630 640 650 660 670 680 700 710 720 730 740 750 pF1KA0 LGQILPQLGKDWTHQGIAKLYHSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNDKGTILP ::.::: :::::::::::::::....:::::::::::::::::::::::::::..::.:: CCDS16 LGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLP 690 700 710 720 730 740 760 770 780 790 800 810 pF1KA0 RGPLMLSPSSLFSAFHREVIEKKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRPNDVYAY .:::.:::::::::.:::::::::::::..::.:::::: :. .:::::::::: :::.: CCDS16 QGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSY 750 760 770 780 790 800 820 830 840 850 860 870 pF1KA0 TQVGVPDCRIFTVNPKGELIQERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFPCPE-FS :::: :::::::::::.::..: : ::: :: :.:.::::::.. ..: ::: . :: CCDS16 KQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFS 810 820 830 840 850 860 880 890 pF1KA0 SFCYWRDPIPEVDLDDLS .: .::.:.: . .:. CCDS16 NFTFWREPLPPFENQDIHSASA 870 880 890 >>CCDS58701.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 (896 aa) initn: 2887 init1: 1347 opt: 2214 Z-score: 1955.4 bits: 373.0 E(32554): 1.4e-102 Smith-Waterman score: 2960; 51.4% identity (74.9% similar) in 917 aa overlap (1-895:7-891) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGK :::::::::::.:::::::::.: ::::::::.::..: .:. ::::::::::: CCDS58 MSRVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 LGVLRSKEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQF .:::::.:::.:::::: .::::::::::::::::.::... : .: .:::::: .: CCDS58 MGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGA- 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KA0 FKDIDTPLVKSGGDET----PSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDS-KKE . .. : ... :. :: ... . .:: . : :::...::.: . :: :.. CCDS58 -SRMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQV--IAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 EQAASAAAEDTCDVGVSSDDD-KGAQAARGSSNA------SLKEEECKEPLLFHSGDHYP .. .. :: . .:::. . ...: : .. ::. . ... .. :: CCDS58 DNMNTSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYP 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 LSDGDWSPLET-TYPQTACPKSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERS :: .::: . . . . ::::::: : .: ... .: : :: .:...: :. .. CCDS58 NSDREWSPTPSPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKM 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 DHHPRTATITPSENTHFRVIPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTS . .. ...::..: ::. :.. .: : :.: :: : . : CCDS58 KESSPLSSRKICDKSHFQAIHSES---SDTFSDQSP-----TLVGG---ALLDQNKPQTE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KA0 VAELLEPPLESTQISSMLDADHLPNAALAEAPSES--KPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQG . . : ::. .. : :: . :: : . : :.::::.:. :::.: : CCDS58 MQFVNEEDLETLGAAAPL----LPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKR--DKRSRHLG 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KA0 PDDIYLDDLKGLEPEVAALYFPKSESEPG-SRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTEC : .::::: ..::::::::::. . : ... .. . :..::::::::...:::.: CCDS58 ADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNGDPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVES 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KA0 LSDSAMDLPDVTLSLCGGLSENGEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRY ::. :::....:::::::.. ::.:. :.:. ..:..:..::..::.::::..: ..: CCDS58 TSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKY 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KA0 YNWALAAPMILSLQVFQKSLPKATVESWVKDKMPKKSGRWWF-WRKRESMTKQLPESKEG :::. :::..:..:.::: :::::::: ..::::::.::::: :: :.. :. :. CCDS58 YNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKE-----ES 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KA0 KSEAPPASDLPSSSKEPA----GARPAENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTT : : :. :....: ..: ...::::: . : .. .: : .. CCDS58 KPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHESSSSDEERAAAKPS-NAGHLPLLP-----NV 580 590 600 610 620 640 650 660 670 680 690 pF1KA0 SYKKSLRLSSDQIAKLKLHDGPNDVVFSITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGT ::::.:::.:.:. .:::..::::::::.:::::::::: ::::::::.::.:::::::: CCDS58 SYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGT 630 640 650 660 670 680 700 710 720 730 740 750 pF1KA0 ITKSDALGQILPQLGKDWTHQGIAKLYHSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVND ::.::.::.::: :::::::::::::::....:::::::::::::::::::::::::::. CCDS58 ITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNE 690 700 710 720 730 740 760 770 780 790 800 810 pF1KA0 KGTILPRGPLMLSPSSLFSAFHREVIEKKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRP .::.::.:::.:::::::::.:::::::::::::..::.:::::: :. .:::::::::: CCDS58 RGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRP 750 760 770 780 790 800 820 830 840 850 860 870 pF1KA0 NDVYAYTQVGVPDCRIFTVNPKGELIQERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFP :::.: :::: :::::::::::.::..: : ::: :: :.:.::::::.. ..: :: CCDS58 ADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFP 810 820 830 840 850 860 880 890 pF1KA0 CPE-FSSFCYWRDPIPEVDLDDLS : . ::.: .::.:.: . .:. CCDS58 CSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA 870 880 890 >>CCDS58699.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 (975 aa) initn: 2956 init1: 1347 opt: 2172 Z-score: 1917.8 bits: 366.2 E(32554): 1.7e-100 Smith-Waterman score: 2901; 49.8% identity (72.3% similar) in 953 aa overlap (1-895:50-970) 10 20 30 pF1KA0 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGC :::::::::::.:::::::::.: :::::: CCDS58 SPDSAWSWIPIMRDPGWIRNVWSSNINVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGC 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KA0 IDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGKLGVLRSKEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVE ::.::..: .:. :::::::::::.:::::.:::.:::::: .::::::::::::::::. CCDS58 IDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQ 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 pF1KA0 ETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDTPLVKSGGDET----PSQSSDISHVLETETI ::... : .: .:::::: .: . .. : ... :. :: ... . .:: CCDS58 ETDNDQEVIPMHLATSPILSEGA--SRMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQV--IAPSETP 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 pF1KA0 FTPSSVKKKKRRRKKYKQDS-KKEEQAASAAAEDTCDVGVSSDDD-KGAQAARGSSNA-- . : :::...::.: . :: :.... .. :: . .:::. . ...: : CCDS58 SSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIP 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 pF1KA0 ----SLKEEECKEPLLFHSGDHYPLSDGDWSPLET-------TYPQTA----------CP .. ::. . ... .. :: :: .::: . : :. : :: CCDS58 PFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDREWSPTPSSLVDCKRTAPHLAVAAEGGLSSSCP 260 270 280 290 300 310 250 260 270 280 pF1KA0 --------------------KSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERS :::::: : .: ... .: : :: .:...: :. .. CCDS58 PQSSLFHPSESPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKM 320 330 340 350 360 370 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 DHHPRTATITPSENTHFRVIPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTS . .. ...::..: ::. :.. .: : :.: :: : . : CCDS58 KESSPLSSRKICDKSHFQAIHSES---SDTFSDQSP-----TLVGG---ALLDQNKPQTE 380 390 400 410 420 350 360 370 380 390 pF1KA0 VAELLEPPLESTQISSMLDADHLPNAALAEAPSES--KPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQG . . : ::. .. : :: . :: : . : :.::::.:. :::.: : CCDS58 MQFVNEEDLETLGAAAPL----LPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKR--DKRSRHLG 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 450 pF1KA0 PDDIYLDDLKGLEPEVAALYFPKSESEPG-SRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTEC : .::::: ..::::::::::. . : ... .. . :..::::::::...:::.: CCDS58 ADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNGDPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVES 480 490 500 510 520 530 460 470 480 490 500 510 pF1KA0 LSDSAMDLPDVTLSLCGGLSENGEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRY ::. :::....:::::::.. ::.:. :.:. ..:..:..::..::.::::..: ..: CCDS58 TSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKY 540 550 560 570 580 590 520 530 540 550 560 570 pF1KA0 YNWALAAPMILSLQVFQKSLPKATVESWVKDKMPKKSGRWWF-WRKRESMTKQLPESKEG :::. :::..:..:.::: :::::::: ..::::::.::::: :: :.. :. :. CCDS58 YNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKE-----ES 600 610 620 630 640 650 580 590 600 610 620 630 pF1KA0 KSEAPPASDLPSSSKEPA----GARPAENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTT : : :. :....: ..: ...::::: . : .. .: : .. CCDS58 KPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHESSSSDEERAAAKPS-NAGHLPLLP-----NV 660 670 680 690 700 640 650 660 670 680 690 pF1KA0 SYKKSLRLSSDQIAKLKLHDGPNDVVFSITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGT ::::.:::.:.:. .:::..::::::::.:::::::::: ::::::::.::.:::::::: CCDS58 SYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGT 710 720 730 740 750 760 700 710 720 730 740 750 pF1KA0 ITKSDALGQILPQLGKDWTHQGIAKLYHSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVND ::.::.::.::: :::::::::::::::....:::::::::::::::::::::::::::. CCDS58 ITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNE 770 780 790 800 810 820 760 770 780 790 800 810 pF1KA0 KGTILPRGPLMLSPSSLFSAFHREVIEKKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRP .::.::.:::.:::::::::.:::::::::::::..::.:::::: :. .:::::::::: CCDS58 RGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRP 830 840 850 860 870 880 820 830 840 850 860 870 pF1KA0 NDVYAYTQVGVPDCRIFTVNPKGELIQERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFP :::.: :::: :::::::::::.::..: : ::: :: :.:.::::::.. ..: :: CCDS58 ADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFP 890 900 910 920 930 940 880 890 pF1KA0 CPE-FSSFCYWRDPIPEVDLDDLS : . ::.: .::.:.: . .:. CCDS58 CSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA 950 960 970 >>CCDS33469.2 LPIN3 gene_id:64900|Hs108|chr20 (852 aa) initn: 2624 init1: 1359 opt: 1385 Z-score: 1224.7 bits: 237.7 E(32554): 6.7e-62 Smith-Waterman score: 2731; 50.0% identity (71.4% similar) in 914 aa overlap (1-895:1-851) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGKLGVLRS :::::::: :. ::::::.:.: ::::: :::.::.: :::..:::::::::::::::: CCDS33 MNYVGQLAETVFGTVKELYRGLNPATLSGGIDVLVVKQVDGSFRCSPFHVRFGKLGVLRS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 KEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDT .:::.:::.:: :::::::::.::::::.: : . :..: : ::::: CCDS33 REKVVDIELNGEPVDLHMKLGDSGEAFFVQELESDDEHVPPGLCTSPIPW---------- 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KA0 PLVKSGGDETPSQSSDISHVLETETIF---TPSSVKKKKRRRKKYKQDSKKEEQAASAAA :: ..:... . : : . : :. ..:.:::.: :: ::. .:. .. CCDS33 -----GGLSGFPSDSQLGTASEPEGLVMAGTASTGRRKRRRRRKPKQ---KEDAVATDSS 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 EDTCDVGVSSDDDKGAQAARGSSNASLKEEECKEPLLFHSGDHYPLSDGDWSPLET-TYP . ..:. :. . . : .:.. :: : : . : :: :::.: : . . CCDS33 PEELEAGAESELSL-PEKLRPEPPGSVQLEE-KSSL--QPKDIYPYSDGEWPPQASLSAG 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 pF1KA0 QTACPKSDSELEVK-PAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERS---------DHHPR . . :::::::::. : : ::.::::.:.:: .:. ... . : : :: CCDS33 ELTSPKSDSELEVRTPEPSPLRAESHMQWAWGRLPKVARAERPESSVVLEGRAGATSPPR 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 TATITPSENTHFRVIPSEDNL-ISEVEKDASME-DTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTSVAE . ::: .. : : .: :...: :... :: : .: . : : CCDS33 GGPSTPSTSVAGGVDPL--GLPIQQTEAGADLQPDT------EDPTLVGPPLHTP----E 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 LLEPPLESTQISSMLDADHLPNAALAEAPSESKPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQGPDDIY : .:. .. :.. . : :.: :... . :. :: ::::: ::.::: CCDS33 TEESKTQSSGDMGLPPASKSWSWATLEVPV---PTGQPERVSRGKGSPKRSQHLGPSDIY 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 LDDLKGLEPEVAALYFPKSESEPGSRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTECLSDSAM :::: .:. : ::::::.:.: :.:.: : :.: : : . : . .. CCDS33 LDDLPSLDSENAALYFPQSDSGLGARRWSE---------PSSQKSLR-DPNPEHEPEPTL 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 DLPD-VTLSLCGGLSENGEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRYYNWAL : : ..:::::::... .:: ::: .: ..:.....::::.:.::::..: ...::::. CCDS33 DTVDTIALSLCGGLADSRDISLEKFNQHSVSYQDLTKNPGLLDDPNLVVKINGKHYNWAV 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 AAPMILSLQVFQKSLPKATVESWVKDKMPKKSGRWWF-WRKRESMTKQLPESKEGKSEAP :::::::::.:::.:::.:... ..:::.:.::::: ::.:. .... .:: CCDS33 AAPMILSLQAFQKNLPKSTMDKLEREKMPRKGGRWWFSWRRRDFLAEERSAQKE------ 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 PASDLPSSSKEPAGARPAENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHG-STTSYKKSLRL ...:: : . .: ::.:.. .: .. ::. : : :: .::::::: CCDS33 -----KTAAKEQQGEK-TEVLSSDDDAP----DSPVILEIPSLPPSTPPSTPTYKKSLRL 550 560 570 580 590 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 SSDQIAKLKLHDGPNDVVFSITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGTITKSDALG ::::: .:.:..: ::::::.:::::::::: .:::::.:.::..::::::::::::::: CCDS33 SSDQIRRLNLQEGANDVVFSVTTQYQGTCRCKATIYLWKWDDKVVISDIDGTITKSDALG 600 610 620 630 640 650 710 720 730 740 750 760 pF1KA0 QILPQLGKDWTHQGIAKLYHSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNDKGTILPRG .::::::::::::::..:::.:. :::::::::::::::::.:.:::.::.. : ::.: CCDS33 HILPQLGKDWTHQGITSLYHKIQLNGYKFLYCSARAIGMADLTKGYLQWVSEGGCSLPKG 660 670 680 690 700 710 770 780 790 800 810 820 pF1KA0 PLMLSPSSLFSAFHREVIEKKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRPNDVYAYTQ :..:::::::::.:::::::::: ::. ::.::..:: : ::::::::::::::.:: : CCDS33 PILLSPSSLFSALHREVIEKKPEVFKVACLSDIQQLFLPHGQPFYAAFGNRPNDVFAYRQ 720 730 740 750 760 770 830 840 850 860 870 880 pF1KA0 VGVPDCRIFTVNPKGELIQERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFPCPEFSSFC ::.:. :::::::.:::::: :..::.:.::.:.:: .:: ... .. . ::.:.:: CCDS33 VGLPESRIFTVNPRGELIQELIKNHKSTYERLGEVVELLFPPVARGPSTDLANPEYSNFC 780 790 800 810 820 830 890 pF1KA0 YWRDPIPEVDLDDLS :::.:.: :::: : CCDS33 YWREPLPAVDLDTLD 840 850 >>CCDS58700.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2 (459 aa) initn: 1073 init1: 631 opt: 712 Z-score: 635.5 bits: 127.8 E(32554): 4.5e-29 Smith-Waterman score: 927; 39.7% identity (61.1% similar) in 473 aa overlap (1-422:7-458) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGK :::::::::::.:::::::::.: ::::::::.::..: .:. ::::::::::: CCDS58 MSRVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 LGVLRSKEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQF .:::::.:::.:::::: .::::::::::::::::.::... : .: .:::::: .: CCDS58 MGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGA- 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KA0 FKDIDTPLVKSGGDET----PSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDS-KKE . .. : ... :. :: ... . .:: . : :::...::.: . :: :.. CCDS58 -SRMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQV--IAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 EQAASAAAEDTCDVGVSSDDD-KGAQAARGSSNA------SLKEEECKEPLLFHSGDHYP .. .. :: . .:::. . ...: : .. ::. . ... .. :: CCDS58 DNMNTSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYP 180 190 200 210 220 230 230 240 pF1KA0 LSDGDWSPLET-------TYPQTA----------CP--------------------KSDS :: .::: . : :. : :: :::: CCDS58 NSDREWSPTPSSLVDCKRTAPHLAVAAEGGLSSSCPPQSSLFHPSESPSGSRPSTPKSDS 240 250 260 270 280 290 250 260 270 280 290 300 pF1KA0 ELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERSDHHPRTATITPSENTHFRVIPSED :: : .: ... .: : :: .:...: :. .. . .. ...::..: ::. CCDS58 ELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSSRKICDKSHFQAIHSES 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KA0 NLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTSVAELLEPPLESTQISSMLDADHLP :.. .: : :.: :: : . : . . : ::. .. : :: CCDS58 ---SDTFSDQSP-----TLVGG---ALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPL----LP 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 NAALAEAPSES--KPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQGPDDIYLDDLKGLEPEVAALYFPKS . :: : . : :.::::.:. :::.: : : .::::: ..:::::::::: CCDS58 MIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKR--DKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKK 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 ESEPGSRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTECLSDSAMDLPDVTLSLCGGLSENGEI 896 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 00:35:05 2016 done: Fri Nov 4 00:35:05 2016 Total Scan time: 4.790 Total Display time: 0.190 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]