Result of FASTA (ccds) for pF1KA0249
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0249, 896 aa
  1>>>pF1KA0249 896 - 896 aa - 896 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6382+/-0.000946; mu= 10.9917+/- 0.057
 mean_var=128.6180+/-25.419, 0's: 0 Z-trim(109.2): 27  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.113090
 statistics sampled from 10729 (10742) to 10729 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.33), width:  16
 Scan time:  4.790

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11829.1 LPIN2 gene_id:9663|Hs108|chr18         ( 896) 6021 994.1       0
CCDS1682.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2          ( 890) 2214 373.0 1.3e-102
CCDS58701.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2         ( 896) 2214 373.0 1.4e-102
CCDS58699.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2         ( 975) 2172 366.2 1.7e-100
CCDS33469.2 LPIN3 gene_id:64900|Hs108|chr20        ( 852) 1385 237.7 6.7e-62
CCDS58700.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2         ( 459)  712 127.8 4.5e-29


>>CCDS11829.1 LPIN2 gene_id:9663|Hs108|chr18              (896 aa)
 initn: 6021 init1: 6021 opt: 6021  Z-score: 5312.2  bits: 994.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6021; 100.0% identity (100.0% similar) in 896 aa overlap (1-896:1-896)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGKLGVLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGKLGVLRS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 KEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 PLVKSGGDETPSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDSKKEEQAASAAAEDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PLVKSGGDETPSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDSKKEEQAASAAAEDT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 CDVGVSSDDDKGAQAARGSSNASLKEEECKEPLLFHSGDHYPLSDGDWSPLETTYPQTAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CDVGVSSDDDKGAQAARGSSNASLKEEECKEPLLFHSGDHYPLSDGDWSPLETTYPQTAC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 PKSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERSDHHPRTATITPSENTHFRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PKSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERSDHHPRTATITPSENTHFRV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 IPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTSVAELLEPPLESTQISSMLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTSVAELLEPPLESTQISSMLD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 ADHLPNAALAEAPSESKPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQGPDDIYLDDLKGLEPEVAALYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADHLPNAALAEAPSESKPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQGPDDIYLDDLKGLEPEVAALYF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 PKSESEPGSRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTECLSDSAMDLPDVTLSLCGGLSEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PKSESEPGSRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTECLSDSAMDLPDVTLSLCGGLSEN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 GEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRYYNWALAAPMILSLQVFQKSLPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRYYNWALAAPMILSLQVFQKSLPK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 ATVESWVKDKMPKKSGRWWFWRKRESMTKQLPESKEGKSEAPPASDLPSSSKEPAGARPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ATVESWVKDKMPKKSGRWWFWRKRESMTKQLPESKEGKSEAPPASDLPSSSKEPAGARPA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 ENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTTSYKKSLRLSSDQIAKLKLHDGPNDVVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTTSYKKSLRLSSDQIAKLKLHDGPNDVVF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 SITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGTITKSDALGQILPQLGKDWTHQGIAKLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGTITKSDALGQILPQLGKDWTHQGIAKLY
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 HSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNDKGTILPRGPLMLSPSSLFSAFHREVIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNDKGTILPRGPLMLSPSSLFSAFHREVIE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 KKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRPNDVYAYTQVGVPDCRIFTVNPKGELIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRPNDVYAYTQVGVPDCRIFTVNPKGELIQ
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890      
pF1KA0 ERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFPCPEFSSFCYWRDPIPEVDLDDLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFPCPEFSSFCYWRDPIPEVDLDDLS
              850       860       870       880       890      

>>CCDS1682.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2               (890 aa)
 initn: 2887 init1: 1347 opt: 2214  Z-score: 1955.4  bits: 373.0 E(32554): 1.3e-102
Smith-Waterman score: 2960; 51.4% identity (74.9% similar) in 917 aa overlap (1-895:1-885)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGKLGVLRS
       :::::::::::.:::::::::.: ::::::::.::..: .:. :::::::::::.:::::
CCDS16 MNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 KEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDT
       .:::.:::::: .::::::::::::::::.::... : .: .:::::: .:    . .. 
CCDS16 REKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGA--SRMEC
               70        80        90       100       110          

              130           140       150       160        170     
pF1KA0 PLVKSGGDET----PSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDS-KKEEQAASA
        : ... :.     ::  ...  .  .::  . : :::...::.: . :: :....  ..
CCDS16 QLKRGSVDRMRGLDPSTPAQV--IAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTS
      120       130         140       150       160       170      

         180       190        200             210       220        
pF1KA0 AAEDTCDVGVSSDDD-KGAQAARGSSNA------SLKEEECKEPLLFHSGDHYPLSDGDW
         ::   . .:::.  .  ...:   :       .. ::. .  ... ..  :: :: .:
CCDS16 EDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDREW
        180       190       200       210       220       230      

      230        240       250       260       270       280       
pF1KA0 SPLET-TYPQTACPKSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERSDHHPRT
       ::  . .  . . :::::::  : .:   ... .: : :: .:...: :. ..  .    
CCDS16 SPTPSPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPL
        240       250       260       270       280       290      

       290       300       310       320       330       340       
pF1KA0 ATITPSENTHFRVIPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTSVAELLE
       ..    ...::..: ::.   :.. .: :      :.:     ::  : .  : .  . :
CCDS16 SSRKICDKSHFQAIHSES---SDTFSDQSP-----TLVGG---ALLDQNKPQTEMQFVNE
        300       310          320               330       340     

       350       360       370         380       390       400     
pF1KA0 PPLESTQISSMLDADHLPNAALAEAPSES--KPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQGPDDIYL
         ::.   .. :    ::     . :: :  . : :.::::.:.   :::.: : : .::
CCDS16 EDLETLGAAAPL----LPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKR--DKRSRHLGADGVYL
         350           360       370       380         390         

         410       420        430       440       450       460    
pF1KA0 DDLKGLEPEVAALYFPKSESEPG-SRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTECLSDSAM
       :::  ..::::::::::. .  : ...  .. . :..::::::::...:::.:  ::.  
CCDS16 DDLTDMDPEVAALYFPKNGDPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVESTSDGLR
     400       410       420       430       440       450         

          470       480       490       500       510       520    
pF1KA0 DLPDVTLSLCGGLSENGEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRYYNWALA
       :::....:::::::.. ::.:. :.:. ..:..:..::..::.::::..: ..::::. :
CCDS16 DLPSIAISLCGGLSDHREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKYYNWTTA
     460       470       480       490       500       510         

          530       540       550       560        570       580   
pF1KA0 APMILSLQVFQKSLPKATVESWVKDKMPKKSGRWWF-WRKRESMTKQLPESKEGKSEAPP
       ::..:..:.::: :::::::: ..::::::.::::: :: :..  :.     :.: :   
CCDS16 APLLLAMQAFQKPLPKATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKE-----ESKPEQCL
     520       530       540       550       560            570    

           590           600       610       620       630         
pF1KA0 ASDLPSSSKEPA----GARPAENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTTSYKKSL
       :.   :....:     ..:  ...:::::     . : ..  .:  :     ..::::.:
CCDS16 AGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHESSSSDEERAAAKPS-NAGHLPLLP-----NVSYKKTL
          580       590       600       610        620             

     640       650       660       670       680       690         
pF1KA0 RLSSDQIAKLKLHDGPNDVVFSITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGTITKSDA
       ::.:.:. .:::..::::::::.:::::::::: ::::::::.::.::::::::::.::.
CCDS16 RLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGTITRSDT
      630       640       650       660       670       680        

     700       710       720       730       740       750         
pF1KA0 LGQILPQLGKDWTHQGIAKLYHSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNDKGTILP
       ::.::: :::::::::::::::....:::::::::::::::::::::::::::..::.::
CCDS16 LGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNERGTVLP
      690       700       710       720       730       740        

     760       770       780       790       800       810         
pF1KA0 RGPLMLSPSSLFSAFHREVIEKKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRPNDVYAY
       .:::.:::::::::.:::::::::::::..::.:::::: :. .:::::::::: :::.:
CCDS16 QGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRPADVYSY
      750       760       770       780       790       800        

     820       830       840       850       860       870         
pF1KA0 TQVGVPDCRIFTVNPKGELIQERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFPCPE-FS
        ::::   :::::::::::.::..: : ::: :: :.:.::::::.. ..: ::: . ::
CCDS16 KQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFPCSDTFS
      810       820       830       840       850       860        

      880       890          
pF1KA0 SFCYWRDPIPEVDLDDLS    
       .: .::.:.:  . .:.     
CCDS16 NFTFWREPLPPFENQDIHSASA
      870       880       890

>>CCDS58701.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2              (896 aa)
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Smith-Waterman score: 2960; 51.4% identity (74.9% similar) in 917 aa overlap (1-895:7-891)

                     10        20        30        40        50    
pF1KA0       MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGCIDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGK
             :::::::::::.:::::::::.: ::::::::.::..: .:. :::::::::::
CCDS58 MSRVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGK
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KA0 LGVLRSKEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQF
       .:::::.:::.:::::: .::::::::::::::::.::... : .: .:::::: .:   
CCDS58 MGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGA-
               70        80        90       100       110          

          120       130           140       150       160          
pF1KA0 FKDIDTPLVKSGGDET----PSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDS-KKE
        . ..  : ... :.     ::  ...  .  .::  . : :::...::.: . :: :..
CCDS58 -SRMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQV--IAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRD
      120       130       140         150       160       170      

     170       180       190        200             210       220  
pF1KA0 EQAASAAAEDTCDVGVSSDDD-KGAQAARGSSNA------SLKEEECKEPLLFHSGDHYP
       ..  ..  ::   . .:::.  .  ...:   :       .. ::. .  ... ..  ::
CCDS58 DNMNTSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYP
        180       190       200       210       220       230      

            230        240       250       260       270       280 
pF1KA0 LSDGDWSPLET-TYPQTACPKSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERS
        :: .:::  . .  . . :::::::  : .:   ... .: : :: .:...: :. .. 
CCDS58 NSDREWSPTPSPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKM
        240       250       260       270       280       290      

             290       300       310       320       330       340 
pF1KA0 DHHPRTATITPSENTHFRVIPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTS
        .    ..    ...::..: ::.   :.. .: :      :.:     ::  : .  : 
CCDS58 KESSPLSSRKICDKSHFQAIHSES---SDTFSDQSP-----TLVGG---ALLDQNKPQTE
        300       310       320               330          340     

             350       360       370         380       390         
pF1KA0 VAELLEPPLESTQISSMLDADHLPNAALAEAPSES--KPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQG
       .  . :  ::.   .. :    ::     . :: :  . : :.::::.:.   :::.: :
CCDS58 MQFVNEEDLETLGAAAPL----LPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKR--DKRSRHLG
         350       360           370       380       390           

     400       410       420        430       440       450        
pF1KA0 PDDIYLDDLKGLEPEVAALYFPKSESEPG-SRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTEC
        : .:::::  ..::::::::::. .  : ...  .. . :..::::::::...:::.: 
CCDS58 ADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNGDPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVES
     400       410       420       430       440       450         

      460       470       480       490       500       510        
pF1KA0 LSDSAMDLPDVTLSLCGGLSENGEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRY
        ::.  :::....:::::::.. ::.:. :.:. ..:..:..::..::.::::..: ..:
CCDS58 TSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKY
     460       470       480       490       500       510         

      520       530       540       550       560        570       
pF1KA0 YNWALAAPMILSLQVFQKSLPKATVESWVKDKMPKKSGRWWF-WRKRESMTKQLPESKEG
       :::. :::..:..:.::: :::::::: ..::::::.::::: :: :..  :.     :.
CCDS58 YNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKE-----ES
     520       530       540       550       560       570         

       580       590           600       610       620       630   
pF1KA0 KSEAPPASDLPSSSKEPA----GARPAENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTT
       : :   :.   :....:     ..:  ...:::::     . : ..  .:  :     ..
CCDS58 KPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHESSSSDEERAAAKPS-NAGHLPLLP-----NV
          580       590       600       610        620             

           640       650       660       670       680       690   
pF1KA0 SYKKSLRLSSDQIAKLKLHDGPNDVVFSITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGT
       ::::.:::.:.:. .:::..::::::::.:::::::::: ::::::::.::.::::::::
CCDS58 SYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGT
      630       640       650       660       670       680        

           700       710       720       730       740       750   
pF1KA0 ITKSDALGQILPQLGKDWTHQGIAKLYHSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVND
       ::.::.::.::: :::::::::::::::....:::::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 ITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNE
      690       700       710       720       730       740        

           760       770       780       790       800       810   
pF1KA0 KGTILPRGPLMLSPSSLFSAFHREVIEKKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRP
       .::.::.:::.:::::::::.:::::::::::::..::.:::::: :. .::::::::::
CCDS58 RGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRP
      750       760       770       780       790       800        

           820       830       840       850       860       870   
pF1KA0 NDVYAYTQVGVPDCRIFTVNPKGELIQERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFP
        :::.: ::::   :::::::::::.::..: : ::: :: :.:.::::::.. ..: ::
CCDS58 ADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFP
      810       820       830       840       850       860        

            880       890          
pF1KA0 CPE-FSSFCYWRDPIPEVDLDDLS    
       : . ::.: .::.:.:  . .:.     
CCDS58 CSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
      870       880       890      

>>CCDS58699.1 LPIN1 gene_id:23175|Hs108|chr2              (975 aa)
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                                             10        20        30
pF1KA0                               MNYVGQLAGQVIVTVKELYKGINQATLSGC
                                     :::::::::::.:::::::::.: ::::::
CCDS58 SPDSAWSWIPIMRDPGWIRNVWSSNINVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGC
      20        30        40        50        60        70         

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 IDVIVVQQQDGSYQCSPFHVRFGKLGVLRSKEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVE
       ::.::..: .:. :::::::::::.:::::.:::.:::::: .::::::::::::::::.
CCDS58 IDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGKMGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQ
      80        90       100       110       120       130         

              100       110       120       130           140      
pF1KA0 ETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDTPLVKSGGDET----PSQSSDISHVLETETI
       ::... : .: .:::::: .:    . ..  : ... :.     ::  ...  .  .:: 
CCDS58 ETDNDQEVIPMHLATSPILSEGA--SRMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQV--IAPSETP
     140       150       160         170       180         190     

        150       160        170       180       190        200    
pF1KA0 FTPSSVKKKKRRRKKYKQDS-KKEEQAASAAAEDTCDVGVSSDDD-KGAQAARGSSNA--
        . : :::...::.: . :: :....  ..  ::   . .:::.  .  ...:   :   
CCDS58 SSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRDDNMNTSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIP
         200       210       220       230       240       250     

                210       220       230                        240 
pF1KA0 ----SLKEEECKEPLLFHSGDHYPLSDGDWSPLET-------TYPQTA----------CP
           .. ::. .  ... ..  :: :: .:::  .       : :. :          ::
CCDS58 PFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYPNSDREWSPTPSSLVDCKRTAPHLAVAAEGGLSSSCP
         260       270       280       290       300       310     

                                 250       260       270       280 
pF1KA0 --------------------KSDSELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERS
                           ::::::  : .:   ... .: : :: .:...: :. .. 
CCDS58 PQSSLFHPSESPSGSRPSTPKSDSELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKM
         320       330       340       350       360       370     

             290       300       310       320       330       340 
pF1KA0 DHHPRTATITPSENTHFRVIPSEDNLISEVEKDASMEDTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTS
        .    ..    ...::..: ::.   :.. .: :      :.:     ::  : .  : 
CCDS58 KESSPLSSRKICDKSHFQAIHSES---SDTFSDQSP-----TLVGG---ALLDQNKPQTE
         380       390          400            410          420    

             350       360       370         380       390         
pF1KA0 VAELLEPPLESTQISSMLDADHLPNAALAEAPSES--KPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQG
       .  . :  ::.   .. :    ::     . :: :  . : :.::::.:.   :::.: :
CCDS58 MQFVNEEDLETLGAAAPL----LPMIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKR--DKRSRHLG
          430       440           450       460       470          

     400       410       420        430       440       450        
pF1KA0 PDDIYLDDLKGLEPEVAALYFPKSESEPG-SRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTEC
        : .:::::  ..::::::::::. .  : ...  .. . :..::::::::...:::.: 
CCDS58 ADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKNGDPSGLAKHASDNGARSANQSPQSVGSSGVDSGVES
      480       490       500       510       520       530        

      460       470       480       490       500       510        
pF1KA0 LSDSAMDLPDVTLSLCGGLSENGEISKEKFMEHIITYHEFAENPGLIDNPNLVIRIYNRY
        ::.  :::....:::::::.. ::.:. :.:. ..:..:..::..::.::::..: ..:
CCDS58 TSDGLRDLPSIAISLCGGLSDHREITKDAFLEQAVSYQQFVDNPAIIDDPNLVVKIGSKY
      540       550       560       570       580       590        

      520       530       540       550       560        570       
pF1KA0 YNWALAAPMILSLQVFQKSLPKATVESWVKDKMPKKSGRWWF-WRKRESMTKQLPESKEG
       :::. :::..:..:.::: :::::::: ..::::::.::::: :: :..  :.     :.
CCDS58 YNWTTAAPLLLAMQAFQKPLPKATVESIMRDKMPKKGGRWWFSWRGRNTTIKE-----ES
      600       610       620       630       640       650        

       580       590           600       610       620       630   
pF1KA0 KSEAPPASDLPSSSKEPA----GARPAENDSSSDEGSQELEESITVDPIPTEPLSHGSTT
       : :   :.   :....:     ..:  ...:::::     . : ..  .:  :     ..
CCDS58 KPEQCLAGKAHSTGEQPPQLSLATRVKHESSSSDEERAAAKPS-NAGHLPLLP-----NV
           660       670       680       690        700            

           640       650       660       670       680       690   
pF1KA0 SYKKSLRLSSDQIAKLKLHDGPNDVVFSITTQYQGTCRCAGTIYLWNWNDKIIISDIDGT
       ::::.:::.:.:. .:::..::::::::.:::::::::: ::::::::.::.::::::::
CCDS58 SYKKTLRLTSEQLKSLKLKNGPNDVVFSVTTQYQGTCRCEGTIYLWNWDDKVIISDIDGT
       710       720       730       740       750       760       

           700       710       720       730       740       750   
pF1KA0 ITKSDALGQILPQLGKDWTHQGIAKLYHSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVND
       ::.::.::.::: :::::::::::::::....:::::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 ITRSDTLGHILPTLGKDWTHQGIAKLYHKVSQNGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNE
       770       780       790       800       810       820       

           760       770       780       790       800       810   
pF1KA0 KGTILPRGPLMLSPSSLFSAFHREVIEKKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRP
       .::.::.:::.:::::::::.:::::::::::::..::.:::::: :. .::::::::::
CCDS58 RGTVLPQGPLLLSPSSLFSALHREVIEKKPEKFKVQCLTDIKNLFFPNTEPFYAAFGNRP
       830       840       850       860       870       880       

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pF1KA0 NDVYAYTQVGVPDCRIFTVNPKGELIQERTKGNKSSYHRLSELVEHVFPLLSKEQNSAFP
        :::.: ::::   :::::::::::.::..: : ::: :: :.:.::::::.. ..: ::
CCDS58 ADVYSYKQVGVSLNRIFTVNPKGELVQEHAKTNISSYVRLCEVVDHVFPLLKRSHSSDFP
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            880       890          
pF1KA0 CPE-FSSFCYWRDPIPEVDLDDLS    
       : . ::.: .::.:.:  . .:.     
CCDS58 CSDTFSNFTFWREPLPPFENQDIHSASA
       950       960       970     

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       ::::::::  :. ::::::.:.: ::::: :::.::.: :::..::::::::::::::::
CCDS33 MNYVGQLAETVFGTVKELYRGLNPATLSGGIDVLVVKQVDGSFRCSPFHVRFGKLGVLRS
               10        20        30        40        50        60

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pF1KA0 KEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQFFKDIDT
       .:::.:::.::  :::::::::.::::::.: : . :..:  : :::::           
CCDS33 REKVVDIELNGEPVDLHMKLGDSGEAFFVQELESDDEHVPPGLCTSPIPW----------
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            ::     ..:... . : : .    : :. ..:.:::.: ::   ::. .:. ..
CCDS33 -----GGLSGFPSDSQLGTASEPEGLVMAGTASTGRRKRRRRRKPKQ---KEDAVATDSS
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        .  ..:. :. .   .  :    .:.. :: :  :  .  : :: :::.: :  . .  
CCDS33 PEELEAGAESELSL-PEKLRPEPPGSVQLEE-KSSL--QPKDIYPYSDGEWPPQASLSAG
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pF1KA0 QTACPKSDSELEVK-PAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERS---------DHHPR
       . . :::::::::. :  : ::.::::.:.:: .:. ... . : :            ::
CCDS33 ELTSPKSDSELEVRTPEPSPLRAESHMQWAWGRLPKVARAERPESSVVLEGRAGATSPPR
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pF1KA0 TATITPSENTHFRVIPSEDNL-ISEVEKDASME-DTVCTIVKPKPRALGTQMSDPTSVAE
        .  ::: ..   : :   .: :...:  :... ::        :  .:  .  :    :
CCDS33 GGPSTPSTSVAGGVDPL--GLPIQQTEAGADLQPDT------EDPTLVGPPLHTP----E
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pF1KA0 LLEPPLESTQISSMLDADHLPNAALAEAPSESKPAAKVDSPSKKKGVHKRSQHQGPDDIY
         :   .:.   ..  :..  . :  :.:    :... .  :. ::  ::::: ::.:::
CCDS33 TEESKTQSSGDMGLPPASKSWSWATLEVPV---PTGQPERVSRGKGSPKRSQHLGPSDIY
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pF1KA0 LDDLKGLEPEVAALYFPKSESEPGSRQWPESDTLSGSQSPQSVGSAAADSGTECLSDSAM
       :::: .:. : ::::::.:.:  :.:.: :         :.:  :   : . :   . ..
CCDS33 LDDLPSLDSENAALYFPQSDSGLGARRWSE---------PSSQKSLR-DPNPEHEPEPTL
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       :  : ..:::::::... .:: ::: .: ..:.....::::.:.::::..: ...::::.
CCDS33 DTVDTIALSLCGGLADSRDISLEKFNQHSVSYQDLTKNPGLLDDPNLVVKINGKHYNWAV
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       :::::::::.:::.:::.:...  ..:::.:.::::: ::.:. ....   .::      
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             ...::  : . .:  ::.:..     .: ..  ::. : :   :: .:::::::
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       ::::: .:.:..: ::::::.:::::::::: .:::::.:.::..:::::::::::::::
CCDS33 SSDQIRRLNLQEGANDVVFSVTTQYQGTCRCKATIYLWKWDDKVVISDIDGTITKSDALG
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pF1KA0 QILPQLGKDWTHQGIAKLYHSINENGYKFLYCSARAIGMADMTRGYLHWVNDKGTILPRG
       .::::::::::::::..:::.:. :::::::::::::::::.:.:::.::.. :  ::.:
CCDS33 HILPQLGKDWTHQGITSLYHKIQLNGYKFLYCSARAIGMADLTKGYLQWVSEGGCSLPKG
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pF1KA0 PLMLSPSSLFSAFHREVIEKKPEKFKIECLNDIKNLFAPSKQPFYAAFGNRPNDVYAYTQ
       :..:::::::::.:::::::::: ::. ::.::..:: :  ::::::::::::::.:: :
CCDS33 PILLSPSSLFSALHREVIEKKPEVFKVACLSDIQQLFLPHGQPFYAAFGNRPNDVFAYRQ
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       ::.:. :::::::.::::::  :..::.:.::.:.:: .:: ...  .. .  ::.:.::
CCDS33 VGLPESRIFTVNPRGELIQELIKNHKSTYERLGEVVELLFPPVARGPSTDLANPEYSNFC
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pF1KA0 YWRDPIPEVDLDDLS
       :::.:.: :::: : 
CCDS33 YWREPLPAVDLDTLD
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CCDS58 MSRVQTMNYVGQLAGQVFVTVKELYKGLNPATLSGCIDIIVIRQPNGNLQCSPFHVRFGK
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pF1KA0 LGVLRSKEKVIDIEINGSAVDLHMKLGDNGEAFFVEETEEEYEKLPAYLATSPIPTEDQF
       .:::::.:::.:::::: .::::::::::::::::.::... : .: .:::::: .:   
CCDS58 MGVLRSREKVVDIEINGESVDLHMKLGDNGEAFFVQETDNDQEVIPMHLATSPILSEGA-
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pF1KA0 FKDIDTPLVKSGGDET----PSQSSDISHVLETETIFTPSSVKKKKRRRKKYKQDS-KKE
        . ..  : ... :.     ::  ...  .  .::  . : :::...::.: . :: :..
CCDS58 -SRMECQLKRGSVDRMRGLDPSTPAQV--IAPSETPSSSSVVKKRRKRRRKSQLDSLKRD
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pF1KA0 EQAASAAAEDTCDVGVSSDDD-KGAQAARGSSNA------SLKEEECKEPLLFHSGDHYP
       ..  ..  ::   . .:::.  .  ...:   :       .. ::. .  ... ..  ::
CCDS58 DNMNTSEDEDMFPIEMSSDEAMELLESSRTLPNDIPPFQDDIPEENLSLAVIYPQSASYP
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            230                        240                         
pF1KA0 LSDGDWSPLET-------TYPQTA----------CP--------------------KSDS
        :: .:::  .       : :. :          ::                    ::::
CCDS58 NSDREWSPTPSSLVDCKRTAPHLAVAAEGGLSSSCPPQSSLFHPSESPSGSRPSTPKSDS
        240       250       260       270       280       290      

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pF1KA0 ELEVKPAESLLRSESHMEWTWGGFPESTKVSKRERSDHHPRTATITPSENTHFRVIPSED
       ::  : .:   ... .: : :: .:...: :. ..  .    ..    ...::..: ::.
CCDS58 ELVSKSTERTGQKNPEMLWLWGELPQAAKSSSPHKMKESSPLSSRKICDKSHFQAIHSES
        300       310       320       330       340       350      

         310       320       330       340       350       360     
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          :.. .: :      :.:     ::  : .  : .  . :  ::.   .. :    ::
CCDS58 ---SDTFSDQSP-----TLVGG---ALLDQNKPQTEMQFVNEEDLETLGAAAPL----LP
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CCDS58 MIEELKPPSASVVQTANKTDSPSRKR--DKRSRHLGADGVYLDDLTDMDPEVAALYFPKK
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896 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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