Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0256
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0256, 1056 aa
1>>>pF1KA0256 1056 - 1056 aa - 1056 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4440+/- 0.001; mu= 7.5809+/- 0.061
mean_var=139.2510+/-27.458, 0's: 0 Z-trim(109.1): 12 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.108686
statistics sampled from 10677 (10684) to 10677 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.328), width: 16
Scan time: 4.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32234.1 SECISBP2L gene_id:9728|Hs108|chr15 (1056) 6908 1095.3 0
CCDS53942.1 SECISBP2L gene_id:9728|Hs108|chr15 (1101) 4575 729.5 9.5e-210
CCDS6683.1 SECISBP2 gene_id:79048|Hs108|chr9 ( 854) 1077 181.0 9.8e-45
CCDS65076.1 SECISBP2 gene_id:79048|Hs108|chr9 ( 781) 1030 173.6 1.5e-42
CCDS65077.1 SECISBP2 gene_id:79048|Hs108|chr9 ( 786) 1030 173.6 1.5e-42
>>CCDS32234.1 SECISBP2L gene_id:9728|Hs108|chr15 (1056 aa)
initn: 6908 init1: 6908 opt: 6908 Z-score: 5856.4 bits: 1095.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6908; 100.0% identity (100.0% similar) in 1056 aa overlap (1-1056:1-1056)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDRAPTEQNVKLSAEVEPFIPQKKSPDTFMIPMALPNDNGSVSGVEPTPIPSYLITCYPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDRAPTEQNVKLSAEVEPFIPQKKSPDTFMIPMALPNDNGSVSGVEPTPIPSYLITCYPF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VQENQSNRQFPLYNNDIRWQQPNPNPTGPYFAYPIISAQPPVSTEYTYYQLMPAPCAQVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VQENQSNRQFPLYNNDIRWQQPNPNPTGPYFAYPIISAQPPVSTEYTYYQLMPAPCAQVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 GFYHPFPTPYSNTFQAANTVNAITTECTERPSQLGQVFPLSSHRSRNSNRGSVVPKQQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GFYHPFPTPYSNTFQAANTVNAITTECTERPSQLGQVFPLSSHRSRNSNRGSVVPKQQLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QQHIKSKRPLVKNVATQKETNAAGPDSRSKIVLLVDASQQTDFPSDIANKSLSETTATML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QQHIKSKRPLVKNVATQKETNAAGPDSRSKIVLLVDASQQTDFPSDIANKSLSETTATML
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 WKSKGRRRRASHPTAESSSEQGASEADIDSDSGYCSPKHSNNQPAAGALRNPDSGTMNHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WKSKGRRRRASHPTAESSSEQGASEADIDSDSGYCSPKHSNNQPAAGALRNPDSGTMNHV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ESSMCAGGVNWSNVTCQATQKKPWMEKNQTFSRGGRQTEQRNNSQDEDGFQELNENGNAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ESSMCAGGVNWSNVTCQATQKKPWMEKNQTFSRGGRQTEQRNNSQDEDGFQELNENGNAK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 DENIQQKLSSKVLDDLPENSPINIVQTPIPITTSVPKRAKSQKKKALAAALATAQEYSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DENIQQKLSSKVLDDLPENSPINIVQTPIPITTSVPKRAKSQKKKALAAALATAQEYSEI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SMEQKKLQEALSKAAGKKNKTPVQLDLGDMLAALEKQQQAMKARQITNTRPLSYTVVTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SMEQKKLQEALSKAAGKKNKTPVQLDLGDMLAALEKQQQAMKARQITNTRPLSYTVVTAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SFHTKDSTNRKPLTKSQPCLTSFNSVDIASSKAKKGKEKEIAKLKRPTALKKVILKEREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SFHTKDSTNRKPLTKSQPCLTSFNSVDIASSKAKKGKEKEIAKLKRPTALKKVILKEREE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KKGRLTVDHNLLGSEEPTEMHLDFIDDLPQEIVSQEDTGLSMPSDTSLSPASQNSPYCMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KKGRLTVDHNLLGSEEPTEMHLDFIDDLPQEIVSQEDTGLSMPSDTSLSPASQNSPYCMT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PVSQGSPASSGIGSPMASSTITKIHSKRFREYCNQVLCKEIDECVTLLLQELVSFQERIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PVSQGSPASSGIGSPMASSTITKIHSKRFREYCNQVLCKEIDECVTLLLQELVSFQERIY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 QKDPVRAKARRRLVMGLREVTKHMKLNKIKCVIISPNCEKIQSKGGLDEALYNVIAMARE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QKDPVRAKARRRLVMGLREVTKHMKLNKIKCVIISPNCEKIQSKGGLDEALYNVIAMARE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QEIPFVFALGRKALGRCVNKLVPVSVVGIFNYFGAESLFNKLVELTEEARKAYKDMVAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QEIPFVFALGRKALGRCVNKLVPVSVVGIFNYFGAESLFNKLVELTEEARKAYKDMVAAM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EQEQAEEALKNVKKVPHHMGHSRNPSAASAISFCSVISEPISEVNEKEYETNWRNMVETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EQEQAEEALKNVKKVPHHMGHSRNPSAASAISFCSVISEPISEVNEKEYETNWRNMVETS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 DGLEASENEKEVSCKHSTSEKPSKLPFDTPPIGKQPSLVATGSTTSATSAGKSTASDKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DGLEASENEKEVSCKHSTSEKPSKLPFDTPPIGKQPSLVATGSTTSATSAGKSTASDKEE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 VKPDDLEWASQQSTETGSLDGSCRDLLNSSITSTTSTLVPGMLEEEEDEDEEEEEDYTHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VKPDDLEWASQQSTETGSLDGSCRDLLNSSITSTTSTLVPGMLEEEEDEDEEEEEDYTHE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 PISVEVQLNSRIESWVSETQRTMETLQLGKTLNGSEEDNVEQSGEEEAEAPEVLEPGMDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PISVEVQLNSRIESWVSETQRTMETLQLGKTLNGSEEDNVEQSGEEEAEAPEVLEPGMDS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050
pF1KA0 EAWTADQQASPGQQKSSNCSSLNKEHSDSNYTTQTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EAWTADQQASPGQQKSSNCSSLNKEHSDSNYTTQTT
1030 1040 1050
>>CCDS53942.1 SECISBP2L gene_id:9728|Hs108|chr15 (1101 aa)
initn: 4555 init1: 4555 opt: 4575 Z-score: 3879.1 bits: 729.5 E(32554): 9.5e-210
Smith-Waterman score: 6725; 95.9% identity (95.9% similar) in 1088 aa overlap (14-1056:14-1101)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDRAPTEQNVKLSAEVEPFIPQKKSPDTFMIPMALPNDNGSVSGVEPTPIPSYLITCYPF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MDRAPTEQNVKLSAEVEPFIPQKKSPDTFMIPMALPNDNGSVSGVEPTPIPSYLITCYPF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VQENQSNRQFPLYNNDIRWQQPNPNPTGPYFAYPIISAQPPVSTEYTYYQLMPAPCAQVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VQENQSNRQFPLYNNDIRWQQPNPNPTGPYFAYPIISAQPPVSTEYTYYQLMPAPCAQVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 GFYHPFPTPYSNTFQAANTVNAITTECTERPSQLGQVFPLSSHRSRNSNRGSVVPKQQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GFYHPFPTPYSNTFQAANTVNAITTECTERPSQLGQVFPLSSHRSRNSNRGSVVPKQQLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QQHIKSKRPLVKNVATQKETNAAGPDSRSKIVLLVDASQQTDFPSDIANKSLSETTATML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QQHIKSKRPLVKNVATQKETNAAGPDSRSKIVLLVDASQQTDFPSDIANKSLSETTATML
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 WKSKGRRRRASHPTAESSSEQGASEADIDSDSGYCSPKHSNNQPAAGALRNPDSGTMNHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 WKSKGRRRRASHPTAESSSEQGASEADIDSDSGYCSPKHSNNQPAAGALRNPDSGTMNHV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KA0 ESSMCAGGVNWSNVTCQATQKKPWMEKNQTFSRGGRQTEQRNNSQ---------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ESSMCAGGVNWSNVTCQATQKKPWMEKNQTFSRGGRQTEQRNNSQVGFRCRGHSTSSERR
310 320 330 340 350 360
350 360 370
pF1KA0 ------------------------------DEDGFQELNENGNAKDENIQQKLSSKVLDD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QNLQKRPDNKHLSSSQSHRSDPNSESLYFEDEDGFQELNENGNAKDENIQQKLSSKVLDD
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 LPENSPINIVQTPIPITTSVPKRAKSQKKKALAAALATAQEYSEISMEQKKLQEALSKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LPENSPINIVQTPIPITTSVPKRAKSQKKKALAAALATAQEYSEISMEQKKLQEALSKAA
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 GKKNKTPVQLDLGDMLAALEKQQQAMKARQITNTRPLSYTVVTAASFHTKDSTNRKPLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GKKNKTPVQLDLGDMLAALEKQQQAMKARQITNTRPLSYTVVTAASFHTKDSTNRKPLTK
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 SQPCLTSFNSVDIASSKAKKGKEKEIAKLKRPTALKKVILKEREEKKGRLTVDHNLLGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SQPCLTSFNSVDIASSKAKKGKEKEIAKLKRPTALKKVILKEREEKKGRLTVDHNLLGSE
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 EPTEMHLDFIDDLPQEIVSQEDTGLSMPSDTSLSPASQNSPYCMTPVSQGSPASSGIGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EPTEMHLDFIDDLPQEIVSQEDTGLSMPSDTSLSPASQNSPYCMTPVSQGSPASSGIGSP
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 MASSTITKIHSKRFREYCNQVLCKEIDECVTLLLQELVSFQERIYQKDPVRAKARRRLVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MASSTITKIHSKRFREYCNQVLCKEIDECVTLLLQELVSFQERIYQKDPVRAKARRRLVM
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 GLREVTKHMKLNKIKCVIISPNCEKIQSKGGLDEALYNVIAMAREQEIPFVFALGRKALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GLREVTKHMKLNKIKCVIISPNCEKIQSKGGLDEALYNVIAMAREQEIPFVFALGRKALG
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 RCVNKLVPVSVVGIFNYFGAESLFNKLVELTEEARKAYKDMVAAMEQEQAEEALKNVKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RCVNKLVPVSVVGIFNYFGAESLFNKLVELTEEARKAYKDMVAAMEQEQAEEALKNVKKV
790 800 810 820 830 840
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 PHHMGHSRNPSAASAISFCSVISEPISEVNEKEYETNWRNMVETSDGLEASENEKEVSCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PHHMGHSRNPSAASAISFCSVISEPISEVNEKEYETNWRNMVETSDGLEASENEKEVSCK
850 860 870 880 890 900
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 HSTSEKPSKLPFDTPPIGKQPSLVATGSTTSATSAGKSTASDKEEVKPDDLEWASQQSTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HSTSEKPSKLPFDTPPIGKQPSLVATGSTTSATSAGKSTASDKEEVKPDDLEWASQQSTE
910 920 930 940 950 960
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 TGSLDGSCRDLLNSSITSTTSTLVPGMLEEEEDEDEEEEEDYTHEPISVEVQLNSRIESW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TGSLDGSCRDLLNSSITSTTSTLVPGMLEEEEDEDEEEEEDYTHEPISVEVQLNSRIESW
970 980 990 1000 1010 1020
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 VSETQRTMETLQLGKTLNGSEEDNVEQSGEEEAEAPEVLEPGMDSEAWTADQQASPGQQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VSETQRTMETLQLGKTLNGSEEDNVEQSGEEEAEAPEVLEPGMDSEAWTADQQASPGQQK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1040 1050
pF1KA0 SSNCSSLNKEHSDSNYTTQTT
:::::::::::::::::::::
CCDS53 SSNCSSLNKEHSDSNYTTQTT
1090 1100
>>CCDS6683.1 SECISBP2 gene_id:79048|Hs108|chr9 (854 aa)
initn: 1130 init1: 764 opt: 1077 Z-score: 916.6 bits: 181.0 E(32554): 9.8e-45
Smith-Waterman score: 1122; 30.5% identity (59.8% similar) in 896 aa overlap (3-860:7-848)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MDRAPTEQNVKLSAEVEPFIPQKKSPDTFMIPMALPNDNGSVSGVEPTPIPSYLIT
: : ...::::.:.::.:. . .. . . : .:: :
CCDS66 MASEGPREPESEGIKLSADVKPFVPRFAGLNVAWLESS-----------EACVFPSSAAT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 CYPFVQENQSNRQFPLYNNDIRWQQPNPNPTGPYFAYPIISAQPPVSTEYTY---YQLMP
:::::: ..: .:..:. . . . : . :. .: . . :: ...
CCDS66 YYPFVQEPPVTEQ-KIYTEDMAF---GASTFPPQYLSSEITLHPYAYSPYTLDSTQNVYS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 APCAQVMGFYHPFPTPYSNTFQAANTVNAITTECTERPSQLGQVFPLSSHRSRNSNRGSV
.: .: . :. :. : . ::... : : : :... .: ... ... .
CCDS66 VPGSQYL--YNQ-PSCYRG-FQTVKHRNENT--CPL-PQEMKALFKKKTYDEKKTYDQQK
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KA0 VPKQQ---LLQQHIKSKRPLVK-NVATQKETNAAG----PDSRSKIVLL-VDASQQT---
... ....::: : . .. ... .. : : .:.:. :..:.
CCDS66 FDSERADGTISSEIKSARGSHHLSIYAENSLKSDGYHKRTDRKSRIIAKNVSTSKPEFEF
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260
pF1KA0 ---DFPS-DIANKSLSETTATMLW-------KSKGRRRRASHPTAE-SSSE---QGASEA
::: . :....:: : . . :.. .:.: :..: .. .
CCDS66 TTLDFPELQGAENNMSEIQKQPKWGPVHSVSTDISLLREVVKPAAVLSKGEIVVKNNPNE
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 DIDSDSGYCSPKHSNN---QPAAGALRNPDSGTMNHVESSMCAGGVNWSNVTCQATQKKP
.. .... ::. . . : . ..:. : .. . ... .. .: .... .: :.
CCDS66 SVTANAATNSPSCTRELSWTPMGYVVRQTLSTELSAAPKNV-TSMINLKTIASSADPKNV
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 WMEKNQTFSRGGRQTEQRNNSQDEDGFQELNENGNAKDENIQQKLSSKVLDDLPENSPIN
. .....: ..... . . . .:. ..: .. ..: . . .
CCDS66 SIPSSEALSSDPSYNKEKHIIHPTQ--KSKASQGSDLEQNEASRKNKKKKEKSTSKYEVL
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 IVQTPIPITTSVPKRAKSQKKKALAAALATAQEYSEISMEQKKLQEALSKAAGKKNKTPV
:: : :. ... ::.: .. ....:. . : ::.. ::
CCDS66 TVQEP-------PRIEDAEEFPNLAVASERRDRIETPKFQSKQQPQDNFKNNVKKSQLPV
400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 QLDLGDMLAALEKQQQAMKARQITNTRPLSYTVVTAASFHTKDSTNRKPLTKSQPCLTSF
::::: ::.::::.:....:.: ...:. .: .. . . ..... :: :
CCDS66 QLDLGGMLTALEKKQHSQHAKQ--SSKPVVVSVGAVPVLSKECASGERGRRMSQ-MKTPH
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 NSVDIASSKAKKGKEKEIAKLKRPTALKKVILKEREEKKGRLTVD--HNLLGSEEPTEMH
: .: .. ::::..:: : :.::.:::.:::::.:.: :: . . :.. . .
CCDS66 NPLDSSAPLMKKGKQREIPKAKKPTSLKKIILKERQERKQRLQENAVSPAFTSDDTQDGE
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 LDFIDDLPQEIVSQEDTGLS-MPSDTSLSPASQNSPYCMTPVSQGSPASSGIGSPMASST
:..:.. . :.. . : :. :.. : : ... . :: .: .:
CCDS66 SGGDDQFPEQAELSGPEGMDELISTPSVEDKSEEPPG--TELQRDTEASHL--AP-NHTT
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 ITKIHSKRFREYCNQVLCKEIDECVTLLLQELVSFQERIYQKDPVRAKARRRLVMGLREV
. ::::.:::.::.:.: ::.: ::: ::.::: ::.:.::::::.::..::::.:::::
CCDS66 FPKIHSRRFRDYCSQMLSKEVDACVTDLLKELVRFQDRMYQKDPVKAKTKRRLVLGLREV
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 TKHMKLNKIKCVIISPNCEKIQSKGGLDEALYNVIAMAREQEIPFVFALGRKALGRCVNK
::.::.:.:::::::::::::::::::..:...: .: ::.:::::::.:::::: .::
CCDS66 LKHLKLKKLKCVIISPNCEKIQSKGGLDDTLHTIIDYACEQNIPFVFALNRKALGRSLNK
690 700 710 720 730 740
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 LVPVSVVGIFNYFGAESLFNKLVELTEEARKAYKDMVAAMEQEQAEEALKNVKKVPHHMG
:::::::::.: ::.. :.:.:::: ::.::: :. ..:: . : ..: .
CCDS66 AVPVSVVGIFSYDGAQDQFHKMVELTVAARQAYKTMLENVQQELVGEPR---PQAPPSLP
750 760 770 780 790
810 820 830 840 850
pF1KA0 HSRNPSAASAISFCSVISEP--ISEVNEKEYETNWRNMVETSDGLEASENEKEVSCKHST
...:: : . . : ..: .: .: :.. .:. .: : : : . ::
CCDS66 -TQGPS-------CPAEDGPPALKEKEEPHYIEIWKKHLEAYSGCTL---ELEESLEAST
800 810 820 830 840
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 SEKPSKLPFDTPPIGKQPSLVATGSTTSATSAGKSTASDKEEVKPDDLEWASQQSTETGS
:.
CCDS66 SQMMNLNL
850
>>CCDS65076.1 SECISBP2 gene_id:79048|Hs108|chr9 (781 aa)
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. . .. . : . : ... . .. . :.... .::. .: .. :
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..:.. . . :.. . :: : : :: .. :... ..: .:: .
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::.::.:.:::::::::::::::::::..:...: .: ::.:::::::.:::::: .::
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:.
CCDS65 SQMMNLNL
780
>>CCDS65077.1 SECISBP2 gene_id:79048|Hs108|chr9 (786 aa)
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CCDS65 MAFGASTFPPQYLSSEITLHPYAYSPYTLDSTQNVYSVPGSQYLYNQPSCYR-
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CCDS65 -GFQTVKHRNENTCPLPQEMKALFKKKTYDEKKTYDQQKFDSERADGTISSEIKSARGSH
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. :. ...: .. : .. : ..:::.:.: :. :. .. . . ..:
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CCDS65 PKWGPVHSVSTDISLLREVVKPAAVLSKGEIVVKNNPNESVTANAATNSPSCTRELSWTP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]