Result of FASTA (omim) for
pF1KA0256
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0256, 1056 aa
1>>>pF1KA0256 1056 - 1056 aa - 1056 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1951+/-0.000391; mu= 9.1560+/- 0.025
mean_var=147.9338+/-29.317, 0's: 0 Z-trim(117.1): 23 B-trim: 458 in 1/55
Lambda= 0.105449
statistics sampled from 28763 (28785) to 28763 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16
Scan time: 13.140
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055516 (OMIM: 615756) selenocysteine insertion (1056) 6908 1063.3 0
NP_001180418 (OMIM: 615756) selenocysteine inserti (1101) 4575 708.4 5.5e-203
NP_076982 (OMIM: 607693,609698) selenocysteine ins ( 854) 1077 176.2 6.9e-43
NP_001269617 (OMIM: 607693,609698) selenocysteine ( 853) 1075 175.9 8.5e-43
XP_005252253 (OMIM: 607693,609698) PREDICTED: sele ( 815) 1050 172.1 1.1e-41
XP_016870612 (OMIM: 607693,609698) PREDICTED: sele ( 816) 1048 171.8 1.4e-41
XP_016870611 (OMIM: 607693,609698) PREDICTED: sele ( 824) 1039 170.4 3.7e-41
XP_016870613 (OMIM: 607693,609698) PREDICTED: sele ( 785) 1034 169.7 6e-41
XP_005252259 (OMIM: 607693,609698) PREDICTED: sele ( 555) 1030 169.0 6.8e-41
XP_016870614 (OMIM: 607693,609698) PREDICTED: sele ( 559) 1030 169.0 6.8e-41
XP_011517303 (OMIM: 607693,609698) PREDICTED: sele ( 756) 1031 169.2 7.9e-41
XP_011517305 (OMIM: 607693,609698) PREDICTED: sele ( 747) 1030 169.0 8.7e-41
XP_011517304 (OMIM: 607693,609698) PREDICTED: sele ( 748) 1030 169.0 8.7e-41
NP_001269618 (OMIM: 607693,609698) selenocysteine ( 781) 1030 169.1 9.1e-41
XP_006717345 (OMIM: 607693,609698) PREDICTED: sele ( 781) 1030 169.1 9.1e-41
NP_001269619 (OMIM: 607693,609698) selenocysteine ( 786) 1030 169.1 9.1e-41
XP_011517302 (OMIM: 607693,609698) PREDICTED: sele ( 786) 1030 169.1 9.1e-41
>>NP_055516 (OMIM: 615756) selenocysteine insertion sequ (1056 aa)
initn: 6908 init1: 6908 opt: 6908 Z-score: 5683.6 bits: 1063.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6908; 100.0% identity (100.0% similar) in 1056 aa overlap (1-1056:1-1056)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDRAPTEQNVKLSAEVEPFIPQKKSPDTFMIPMALPNDNGSVSGVEPTPIPSYLITCYPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MDRAPTEQNVKLSAEVEPFIPQKKSPDTFMIPMALPNDNGSVSGVEPTPIPSYLITCYPF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VQENQSNRQFPLYNNDIRWQQPNPNPTGPYFAYPIISAQPPVSTEYTYYQLMPAPCAQVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VQENQSNRQFPLYNNDIRWQQPNPNPTGPYFAYPIISAQPPVSTEYTYYQLMPAPCAQVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 GFYHPFPTPYSNTFQAANTVNAITTECTERPSQLGQVFPLSSHRSRNSNRGSVVPKQQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GFYHPFPTPYSNTFQAANTVNAITTECTERPSQLGQVFPLSSHRSRNSNRGSVVPKQQLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QQHIKSKRPLVKNVATQKETNAAGPDSRSKIVLLVDASQQTDFPSDIANKSLSETTATML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QQHIKSKRPLVKNVATQKETNAAGPDSRSKIVLLVDASQQTDFPSDIANKSLSETTATML
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 WKSKGRRRRASHPTAESSSEQGASEADIDSDSGYCSPKHSNNQPAAGALRNPDSGTMNHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 WKSKGRRRRASHPTAESSSEQGASEADIDSDSGYCSPKHSNNQPAAGALRNPDSGTMNHV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ESSMCAGGVNWSNVTCQATQKKPWMEKNQTFSRGGRQTEQRNNSQDEDGFQELNENGNAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ESSMCAGGVNWSNVTCQATQKKPWMEKNQTFSRGGRQTEQRNNSQDEDGFQELNENGNAK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 DENIQQKLSSKVLDDLPENSPINIVQTPIPITTSVPKRAKSQKKKALAAALATAQEYSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DENIQQKLSSKVLDDLPENSPINIVQTPIPITTSVPKRAKSQKKKALAAALATAQEYSEI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SMEQKKLQEALSKAAGKKNKTPVQLDLGDMLAALEKQQQAMKARQITNTRPLSYTVVTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SMEQKKLQEALSKAAGKKNKTPVQLDLGDMLAALEKQQQAMKARQITNTRPLSYTVVTAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SFHTKDSTNRKPLTKSQPCLTSFNSVDIASSKAKKGKEKEIAKLKRPTALKKVILKEREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SFHTKDSTNRKPLTKSQPCLTSFNSVDIASSKAKKGKEKEIAKLKRPTALKKVILKEREE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KKGRLTVDHNLLGSEEPTEMHLDFIDDLPQEIVSQEDTGLSMPSDTSLSPASQNSPYCMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KKGRLTVDHNLLGSEEPTEMHLDFIDDLPQEIVSQEDTGLSMPSDTSLSPASQNSPYCMT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PVSQGSPASSGIGSPMASSTITKIHSKRFREYCNQVLCKEIDECVTLLLQELVSFQERIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PVSQGSPASSGIGSPMASSTITKIHSKRFREYCNQVLCKEIDECVTLLLQELVSFQERIY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 QKDPVRAKARRRLVMGLREVTKHMKLNKIKCVIISPNCEKIQSKGGLDEALYNVIAMARE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QKDPVRAKARRRLVMGLREVTKHMKLNKIKCVIISPNCEKIQSKGGLDEALYNVIAMARE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QEIPFVFALGRKALGRCVNKLVPVSVVGIFNYFGAESLFNKLVELTEEARKAYKDMVAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QEIPFVFALGRKALGRCVNKLVPVSVVGIFNYFGAESLFNKLVELTEEARKAYKDMVAAM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EQEQAEEALKNVKKVPHHMGHSRNPSAASAISFCSVISEPISEVNEKEYETNWRNMVETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EQEQAEEALKNVKKVPHHMGHSRNPSAASAISFCSVISEPISEVNEKEYETNWRNMVETS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 DGLEASENEKEVSCKHSTSEKPSKLPFDTPPIGKQPSLVATGSTTSATSAGKSTASDKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DGLEASENEKEVSCKHSTSEKPSKLPFDTPPIGKQPSLVATGSTTSATSAGKSTASDKEE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 VKPDDLEWASQQSTETGSLDGSCRDLLNSSITSTTSTLVPGMLEEEEDEDEEEEEDYTHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VKPDDLEWASQQSTETGSLDGSCRDLLNSSITSTTSTLVPGMLEEEEDEDEEEEEDYTHE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 PISVEVQLNSRIESWVSETQRTMETLQLGKTLNGSEEDNVEQSGEEEAEAPEVLEPGMDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PISVEVQLNSRIESWVSETQRTMETLQLGKTLNGSEEDNVEQSGEEEAEAPEVLEPGMDS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050
pF1KA0 EAWTADQQASPGQQKSSNCSSLNKEHSDSNYTTQTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EAWTADQQASPGQQKSSNCSSLNKEHSDSNYTTQTT
1030 1040 1050
>>NP_001180418 (OMIM: 615756) selenocysteine insertion s (1101 aa)
initn: 4555 init1: 4555 opt: 4575 Z-score: 3765.2 bits: 708.4 E(85289): 5.5e-203
Smith-Waterman score: 6725; 95.9% identity (95.9% similar) in 1088 aa overlap (14-1056:14-1101)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDRAPTEQNVKLSAEVEPFIPQKKSPDTFMIPMALPNDNGSVSGVEPTPIPSYLITCYPF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDRAPTEQNVKLSAEVEPFIPQKKSPDTFMIPMALPNDNGSVSGVEPTPIPSYLITCYPF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VQENQSNRQFPLYNNDIRWQQPNPNPTGPYFAYPIISAQPPVSTEYTYYQLMPAPCAQVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQENQSNRQFPLYNNDIRWQQPNPNPTGPYFAYPIISAQPPVSTEYTYYQLMPAPCAQVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 GFYHPFPTPYSNTFQAANTVNAITTECTERPSQLGQVFPLSSHRSRNSNRGSVVPKQQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFYHPFPTPYSNTFQAANTVNAITTECTERPSQLGQVFPLSSHRSRNSNRGSVVPKQQLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QQHIKSKRPLVKNVATQKETNAAGPDSRSKIVLLVDASQQTDFPSDIANKSLSETTATML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQHIKSKRPLVKNVATQKETNAAGPDSRSKIVLLVDASQQTDFPSDIANKSLSETTATML
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 WKSKGRRRRASHPTAESSSEQGASEADIDSDSGYCSPKHSNNQPAAGALRNPDSGTMNHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WKSKGRRRRASHPTAESSSEQGASEADIDSDSGYCSPKHSNNQPAAGALRNPDSGTMNHV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KA0 ESSMCAGGVNWSNVTCQATQKKPWMEKNQTFSRGGRQTEQRNNSQ---------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESSMCAGGVNWSNVTCQATQKKPWMEKNQTFSRGGRQTEQRNNSQVGFRCRGHSTSSERR
310 320 330 340 350 360
350 360 370
pF1KA0 ------------------------------DEDGFQELNENGNAKDENIQQKLSSKVLDD
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNLQKRPDNKHLSSSQSHRSDPNSESLYFEDEDGFQELNENGNAKDENIQQKLSSKVLDD
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 LPENSPINIVQTPIPITTSVPKRAKSQKKKALAAALATAQEYSEISMEQKKLQEALSKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPENSPINIVQTPIPITTSVPKRAKSQKKKALAAALATAQEYSEISMEQKKLQEALSKAA
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 GKKNKTPVQLDLGDMLAALEKQQQAMKARQITNTRPLSYTVVTAASFHTKDSTNRKPLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKKNKTPVQLDLGDMLAALEKQQQAMKARQITNTRPLSYTVVTAASFHTKDSTNRKPLTK
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 SQPCLTSFNSVDIASSKAKKGKEKEIAKLKRPTALKKVILKEREEKKGRLTVDHNLLGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQPCLTSFNSVDIASSKAKKGKEKEIAKLKRPTALKKVILKEREEKKGRLTVDHNLLGSE
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 EPTEMHLDFIDDLPQEIVSQEDTGLSMPSDTSLSPASQNSPYCMTPVSQGSPASSGIGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPTEMHLDFIDDLPQEIVSQEDTGLSMPSDTSLSPASQNSPYCMTPVSQGSPASSGIGSP
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 MASSTITKIHSKRFREYCNQVLCKEIDECVTLLLQELVSFQERIYQKDPVRAKARRRLVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MASSTITKIHSKRFREYCNQVLCKEIDECVTLLLQELVSFQERIYQKDPVRAKARRRLVM
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 GLREVTKHMKLNKIKCVIISPNCEKIQSKGGLDEALYNVIAMAREQEIPFVFALGRKALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLREVTKHMKLNKIKCVIISPNCEKIQSKGGLDEALYNVIAMAREQEIPFVFALGRKALG
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 RCVNKLVPVSVVGIFNYFGAESLFNKLVELTEEARKAYKDMVAAMEQEQAEEALKNVKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCVNKLVPVSVVGIFNYFGAESLFNKLVELTEEARKAYKDMVAAMEQEQAEEALKNVKKV
790 800 810 820 830 840
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 PHHMGHSRNPSAASAISFCSVISEPISEVNEKEYETNWRNMVETSDGLEASENEKEVSCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PHHMGHSRNPSAASAISFCSVISEPISEVNEKEYETNWRNMVETSDGLEASENEKEVSCK
850 860 870 880 890 900
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 HSTSEKPSKLPFDTPPIGKQPSLVATGSTTSATSAGKSTASDKEEVKPDDLEWASQQSTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSTSEKPSKLPFDTPPIGKQPSLVATGSTTSATSAGKSTASDKEEVKPDDLEWASQQSTE
910 920 930 940 950 960
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 TGSLDGSCRDLLNSSITSTTSTLVPGMLEEEEDEDEEEEEDYTHEPISVEVQLNSRIESW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGSLDGSCRDLLNSSITSTTSTLVPGMLEEEEDEDEEEEEDYTHEPISVEVQLNSRIESW
970 980 990 1000 1010 1020
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 VSETQRTMETLQLGKTLNGSEEDNVEQSGEEEAEAPEVLEPGMDSEAWTADQQASPGQQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSETQRTMETLQLGKTLNGSEEDNVEQSGEEEAEAPEVLEPGMDSEAWTADQQASPGQQK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1040 1050
pF1KA0 SSNCSSLNKEHSDSNYTTQTT
:::::::::::::::::::::
NP_001 SSNCSSLNKEHSDSNYTTQTT
1090 1100
>>NP_076982 (OMIM: 607693,609698) selenocysteine inserti (854 aa)
initn: 1130 init1: 764 opt: 1077 Z-score: 890.9 bits: 176.2 E(85289): 6.9e-43
Smith-Waterman score: 1122; 30.5% identity (59.8% similar) in 896 aa overlap (3-860:7-848)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MDRAPTEQNVKLSAEVEPFIPQKKSPDTFMIPMALPNDNGSVSGVEPTPIPSYLIT
: : ...::::.:.::.:. . .. . . : .:: :
NP_076 MASEGPREPESEGIKLSADVKPFVPRFAGLNVAWLESS-----------EACVFPSSAAT
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 CYPFVQENQSNRQFPLYNNDIRWQQPNPNPTGPYFAYPIISAQPPVSTEYTY---YQLMP
:::::: ..: .:..:. . . . : . :. .: . . :: ...
NP_076 YYPFVQEPPVTEQ-KIYTEDMAF---GASTFPPQYLSSEITLHPYAYSPYTLDSTQNVYS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 APCAQVMGFYHPFPTPYSNTFQAANTVNAITTECTERPSQLGQVFPLSSHRSRNSNRGSV
.: .: . :. :. : . ::... : : : :... .: ... ... .
NP_076 VPGSQYL--YNQ-PSCYRG-FQTVKHRNENT--CPL-PQEMKALFKKKTYDEKKTYDQQK
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KA0 VPKQQ---LLQQHIKSKRPLVK-NVATQKETNAAG----PDSRSKIVLL-VDASQQT---
... ....::: : . .. ... .. : : .:.:. :..:.
NP_076 FDSERADGTISSEIKSARGSHHLSIYAENSLKSDGYHKRTDRKSRIIAKNVSTSKPEFEF
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260
pF1KA0 ---DFPS-DIANKSLSETTATMLW-------KSKGRRRRASHPTAE-SSSE---QGASEA
::: . :....:: : . . :.. .:.: :..: .. .
NP_076 TTLDFPELQGAENNMSEIQKQPKWGPVHSVSTDISLLREVVKPAAVLSKGEIVVKNNPNE
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 DIDSDSGYCSPKHSNN---QPAAGALRNPDSGTMNHVESSMCAGGVNWSNVTCQATQKKP
.. .... ::. . . : . ..:. : .. . ... .. .: .... .: :.
NP_076 SVTANAATNSPSCTRELSWTPMGYVVRQTLSTELSAAPKNV-TSMINLKTIASSADPKNV
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 WMEKNQTFSRGGRQTEQRNNSQDEDGFQELNENGNAKDENIQQKLSSKVLDDLPENSPIN
. .....: ..... . . . .:. ..: .. ..: . . .
NP_076 SIPSSEALSSDPSYNKEKHIIHPTQ--KSKASQGSDLEQNEASRKNKKKKEKSTSKYEVL
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 IVQTPIPITTSVPKRAKSQKKKALAAALATAQEYSEISMEQKKLQEALSKAAGKKNKTPV
:: : :. ... ::.: .. ....:. . : ::.. ::
NP_076 TVQEP-------PRIEDAEEFPNLAVASERRDRIETPKFQSKQQPQDNFKNNVKKSQLPV
400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 QLDLGDMLAALEKQQQAMKARQITNTRPLSYTVVTAASFHTKDSTNRKPLTKSQPCLTSF
::::: ::.::::.:....:.: ...:. .: .. . . ..... :: :
NP_076 QLDLGGMLTALEKKQHSQHAKQ--SSKPVVVSVGAVPVLSKECASGERGRRMSQ-MKTPH
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 NSVDIASSKAKKGKEKEIAKLKRPTALKKVILKEREEKKGRLTVD--HNLLGSEEPTEMH
: .: .. ::::..:: : :.::.:::.:::::.:.: :: . . :.. . .
NP_076 NPLDSSAPLMKKGKQREIPKAKKPTSLKKIILKERQERKQRLQENAVSPAFTSDDTQDGE
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
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:::::: ..: .:..:. . . . : . :. .: . . :: ...
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pF1KA0 APCAQVMGFYHPFPTPYSNTFQAANTVNAITTECTERPSQLGQVFPLSSHRSRNSNRGSV
.: .: . :. :. : . ::... : : : :... .: ... ... .
XP_016 VPGSQYL--YNQ-PSCYRG-FQTVKHRNENT--CPL-PQEMKALFKKKTYDEKKTYDQQK
110 120 130 140 150
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pF1KA0 VPKQQ---LLQQHIKSKRPLVKNVATQKETNAAGPDSRSKIVLLVDASQQTDFPSDIANK
... ....::: : .... : :. :. : .:: : : :
XP_016 FDSERADGTISSEIKSARG-SHHLSIYAE-NSLKSDGYHK---------RTDRKSRIIAK
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..: . . . . . . . : .. . . . : : : . .::: .:
XP_016 NVSTSKPEFEFTTLDFPELQGAENNMSEIQKQPKWGPVHSVSTDISLLREVVKPAA-VLS
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. . . :. . :. :.... : .: :.. : . . : .:: .. ..
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.:. ... : . . ::..:.. : :. .:. .. ... . :.:.:
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.. : .. : .... . : ::.. ::::::: ::.::::.:....:.:
XP_016 KKKEKSTSKYEVLTVQ-EPPRIEDNF-KNNVKKSQLPVQLDLGGMLTALEKKQHSQHAKQ
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...:. .: .. . . ..... :: : : .: .. ::::..:: : :
XP_016 --SSKPVVVSVGAVPVLSKECASGERGRRMSQ-MKTPHNPLDSSAPLMKKGKQREIPKAK
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.::.:::.:::::.:.: :: . . :.. . . :..:.. . :.. .
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: :. :.. : : ... . :: .: .:. ::::.:::.::.:.: ::.:
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::: ::.::: ::.:.::::::.::..::::.::::: ::.::.:.:::::::::::::
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::::::..:...: .: ::.:::::::.:::::: .:: :::::::::.: ::.. :.:.
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:::: ::.::: :. ..:: . : ..: . ...:: : . . :
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..: .: .: :.. .:. .: : : : . :::.
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: . . : :: : ..:... . ... ..:. ... . . . : :: :
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: . ..: . . ::..:.. : :. .:. .. ... . :.:.:
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:: ::.::: ::.:.::::::.::..::::.::::: ::.::.:.:::::::::::::::
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::::..:...: .: ::.:::::::.:::::: .:: :::::::::.: ::.. :.:.::
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Smith-Waterman score: 1046; 38.7% identity (64.7% similar) in 556 aa overlap (310-860:41-553)
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pF1KA0 SNNQPAAGALRNPDSGTMNHVESSMCAGGVNWSNVTCQATQKKPWMEKNQTFSRGGRQTE
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XP_016 DAEEFPNLAVASERRDRIETPKFQSKQQPQDNFKNNVKKSQLPVQLDLGGMLTALEKKQH
110 120 130 140 150 160
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pF1KA0 AMKARQITNTRPLSYTVVTAASFHTKDSTNRKPLTKSQPCLTSFNSVDIASSKAKKGKEK
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XP_016 SQHAKQ--SSKPVVVSVGAVPVLSKECASGERGRRMSQ-MKTPHNPLDSSAPLMKKGKQR
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1056 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]