Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0284
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0284, 1519 aa
1>>>pF1KA0284 1519 - 1519 aa - 1519 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6004+/-0.00104; mu= -3.1154+/- 0.063
mean_var=370.1754+/-75.423, 0's: 0 Z-trim(115.2): 37 B-trim: 169 in 1/55
Lambda= 0.066661
statistics sampled from 15769 (15799) to 15769 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.485), width: 16
Scan time: 7.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45176.2 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14 (1519) 10255 1001.4 0
CCDS45175.1 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14 (1554) 8046 788.9 0
CCDS44337.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1486) 960 107.5 3.3e-22
CCDS44339.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1584) 960 107.5 3.5e-22
>>CCDS45176.2 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14 (1519 aa)
initn: 10255 init1: 10255 opt: 10255 Z-score: 5343.1 bits: 1001.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10255; 100.0% identity (100.0% similar) in 1519 aa overlap (1-1519:1-1519)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLERVQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLERVQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SEALPEHTPYCEASNPRPEKGDRRPGTEAASYRTPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SEALPEHTPYCEASNPRPEKGDRRPGTEAASYRTPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 YPERPKGPVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFRREPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YPERPKGPVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFRREPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGKMKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATPGEMVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGKMKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATPGEMVSA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKSDLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKSDLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SAAGVPLEASGEQVRLQRQIKRDPQELLHNQQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SAAGVPLEASGEQVRLQRQIKRDPQELLHNQQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 KADKRRGPTPADRDRPSVPAPVQAGGRSSGPQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KADKRRGPTPADRDRPSVPAPVQAGGRSSGPQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GSVGRRSRLAQDFMAQCLRESSPAARPSPEKVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSVGRRSRLAQDFMAQCLRESSPAARPSPEKVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QLTKARKQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTEVEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QLTKARKQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTEVEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 VIRGDRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLGAAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VIRGDRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLGAAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLAD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SYSDPGLTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRRLPQLPSERADSPAGPESSRRSGPGPPELDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SYSDPGLTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRRLPQLPSERADSPAGPESSRRSGPGPPELDS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EQPSRLFGQEELDPDSLSDASGSDGGRGPEPGVEPQDSRRRSPQEGPTWSRGRRSPRAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQPSRLFGQEELDPDSLSDASGSDGGRGPEPGVEPQDSRRRSPQEGPTWSRGRRSPRAPG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 EPTPASFFIGDQNGDAVLSRKPLAAPGDGEGLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EPTPASFFIGDQNGDAVLSRKPLAAPGDGEGLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 GRSPEPDGPAPAFLRQESFTKEPASGPPAPGKPPHISSHPLLQDLAATRAARMDFHSQDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GRSPEPDGPAPAFLRQESFTKEPASGPPAPGKPPHISSHPLLQDLAATRAARMDFHSQDT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 HLILKETETALAALEARLLSNSVDAECEGGSTPRPPEDALSGDSDVDTASTVSLRSGKSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HLILKETETALAALEARLLSNSVDAECEGGSTPRPPEDALSGDSDVDTASTVSLRSGKSG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 PSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTALVSAREQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTALVSAREQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRRSA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 IRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDVMASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDVMASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPSPA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 AREEQSRSSASSQKGPQALTRSNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AREEQSRSSASSQKGPQALTRSNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 EPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRKRAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRKRAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 MAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARSGSARYTSNTRRRQQGSDYTSTSEEEYGSRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARSGSARYTSNTRRRQQGSDYTSTSEEEYGSRHG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 SPKHTRSHTSTATQTPRAGSSSRARSRAPGPRDTDDDEEEPDPYGFIVQTAEIAEIARLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPKHTRSHTSTATQTPRAGSSSRARSRAPGPRDTDDDEEEPDPYGFIVQTAEIAEIARLS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 QTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPAHSASLSNMPSTPASTISAREELVQRIPEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPAHSASLSNMPSTPASTISAREELVQRIPEAS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 LNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCEDALANKTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIREN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCEDALANKTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIREN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 TEHLAEKMKILFQNTGRAWEDLEARINAENEVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TEHLAEKMKILFQNTGRAWEDLEARINAENEVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVIN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 AIVDPSGSLDLLTGNRSLASSAQPGLGKGRVAAQSPPSPASAEALLPALPLRNFPQRASC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AIVDPSGSLDLLTGNRSLASSAQPGLGKGRVAAQSPPSPASAEALLPALPLRNFPQRASC
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510
pF1KA0 GPPSLPDPTFLPDAERFLI
:::::::::::::::::::
CCDS45 GPPSLPDPTFLPDAERFLI
1510
>>CCDS45175.1 CEP170B gene_id:283638|Hs108|chr14 (1554 aa)
initn: 8046 init1: 8046 opt: 8046 Z-score: 4194.9 bits: 788.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9937; 97.6% identity (97.7% similar) in 1519 aa overlap (1-1519:71-1554)
10 20 30
pF1KA0 MRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLER
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KQHAVINYDQDRDEHWVKDLGSLNGTFVNDMRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLER
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 VQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKRSEALPEHTPYCEASNPRPEKGDRRPGTEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKRSEALPEHTPYCEASNPRPEKGDRRPGTEAA
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 SYRTPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEPYPERPKGPVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SYRTPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEPYPERPKGPVQQDGELHGFRAPAEPQGCSFR
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 REPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTKDAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 REPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTKDAEAGGGGAAPVVQSHASFTIEFDDCSPGK
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 MKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATPGEMVSAETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MKIKDHITKFSLRQRRPPGKEATPGEMVSAETKVADWLVQNDPSLLHRVGPGDDRHSTKS
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 DLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAASAAGVPLEASGEQVRLQRQIKRDPQELLHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DLPVHTRTLKGHKHEDGTQSDSEDPLAKAASAAGVPLEASGEQVRLQRQIKRDPQELLHN
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 QQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDPKADKRRGPTPADRDRPSVPAPVQAGGRSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QQAFVIEFFDEDTPRKKRSQSFTHSPSGDPKADKRRGPTPADRDRPSVPAPVQAGGRSSG
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 PQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPFGSVGRRSRLAQDFMAQCLRESSPAARPSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PQRAGSLKREKTEERLGSPSPASRTPARPFGSVGRRSRLAQDFMAQCLRESSPAARPSPE
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 KVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDPQLTKARKQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDPQLTKARKQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTE
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 VEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRPVIRGDRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRPVIRGDRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLG
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 AAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLADSYSDPGLTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLADSYSDPGLTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRR
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 LPQLPSERADSPAGPESSRRSGPGPPELDSEQPSRLFGQEELDPDSLSDASGSDGGRGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPQLPSERADSPAGPESSRRSGPGPPELDSEQPSRLFGQEELDPDSLSDASGSDGGRGPE
710 720 730 740 750 760
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 PGVEPQDSRRRSPQEGPTWSRGRRSPRAPGEPTPASFFIGDQNGDAVLSRKPLAAPGDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGVEPQDSRRRSPQEGPTWSRGRRSPRAPGEPTPASFFIGDQNGDAVLSRKPLAAPGDGE
770 780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 GLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRPGRSPEPDGPAPAFLRQESFTKEPASGPPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRPGRSPEPDGPAPAFLRQESFTKEPASGPPAP
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 GKPPHISSHPLLQDLAATRAARMDFHSQDTHLILKETETALAALEARLLSNSVDAECEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GKPPHISSHPLLQDLAATRAARMDFHSQDTHLILKETETALAALEARLLSNSVDAECEGG
890 900 910 920 930 940
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 STPRPPEDALSGDSDVDTASTVSLRSGKSGPSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 STPRPPEDALSGDSDVDTASTVSLRSGKSGPSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTAL
950 960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 VSAREQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRRSAIRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VSAREQSSERQHHPLGPTDMGRGEPVRRSAIRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDV
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 MASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPSPAAREEQSRSSASSQKGPQALTRSNSLSTPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPSPAAREEQSRSSASSQKGPQALTRSNSLSTPRP
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 TRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNPEPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRKRAGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNPEPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRKRAGSF
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 TGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPTMAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPTMAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARSG
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 SARYTSNTRRRQQGSDYTSTSEEEYGSRHGSPKHTRSHTSTATQTPRAGSSSRARSRAPG
::::::.: :::::::::::::::::
CCDS45 SARYTSTT-----------------------------------QTPRAGSSSRARSRAPG
1250 1260
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA0 PRDTDDDEEEPDPYGFIVQTAEIAEIARLSQTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PRDTDDDEEEPDPYGFIVQTAEIAEIARLSQTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA0 HSASLSNMPSTPASTISAREELVQRIPEASLNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCEDALAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HSASLSNMPSTPASTISAREELVQRIPEASLNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCEDALAN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA0 KTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIRENTEHLAEKMKILFQNTGRAWEDLEARINAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KTRPRNREEVIFDNLMLNPVSQLSQAIRENTEHLAEKMKILFQNTGRAWEDLEARINAEN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA0 EVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVINAIVDPSGSLDLLTGNRSLASSAQPGLGKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EVPILKTSNKEISSILKELRRVQKQLEVINAIVDPSGSLDLLTGNRSLASSAQPGLGKGR
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1480 1490 1500 1510
pF1KA0 VAAQSPPSPASAEALLPALPLRNFPQRASCGPPSLPDPTFLPDAERFLI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VAAQSPPSPASAEALLPALPLRNFPQRASCGPPSLPDPTFLPDAERFLI
1510 1520 1530 1540 1550
>>CCDS44337.1 CEP170 gene_id:9859|Hs108|chr1 (1486 aa)
initn: 1657 init1: 356 opt: 960 Z-score: 512.2 bits: 107.5 E(32554): 3.3e-22
Smith-Waterman score: 1763; 30.7% identity (56.1% similar) in 1578 aa overlap (1-1515:71-1478)
10 20 30
pF1KA0 MRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLER
.:::.: :.::::.: .:::::.:.... .
CCDS44 KQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQ
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80
pF1KA0 VQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKRSEALPEHTPYCEASNPRPE---------KG
. :::::::::::.: :::.: :. . :.. .. .... : :.
CCDS44 GEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKS
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... .: : :::::::::::.:. . . .:.: . .. .. : ...
CCDS44 EEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCGIDAKQVE
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: : : : :::::::::::: :::: : ::.::::. .. .: .
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