FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0284, 1519 aa 1>>>pF1KA0284 1519 - 1519 aa - 1519 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8535+/-0.000417; mu= -4.5949+/- 0.026 mean_var=441.2529+/-88.717, 0's: 0 Z-trim(123.0): 80 B-trim: 0 in 0/62 Lambda= 0.061056 statistics sampled from 42020 (42110) to 42020 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.77), E-opt: 0.2 (0.494), width: 16 Scan time: 21.270 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001035863 (OMIM: 613023) centrosomal protein of (1486) 960 100.3 1.2e-19 XP_016858425 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1584) 960 100.3 1.3e-19 NP_055627 (OMIM: 613023) centrosomal protein of 17 (1584) 960 100.3 1.3e-19 XP_011542639 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1646) 960 100.3 1.3e-19 XP_011542642 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1610) 944 98.9 3.5e-19 XP_011542641 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1620) 879 93.2 1.8e-17 XP_011542640 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1629) 766 83.2 1.8e-14 XP_011542644 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1593) 612 69.7 2.2e-10 XP_016858431 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1531) 607 69.2 2.9e-10 XP_016858432 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1531) 607 69.2 2.9e-10 XP_016858439 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1408) 511 60.7 9.6e-08 XP_016858434 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1469) 511 60.7 9.9e-08 XP_016858424 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1567) 511 60.8 1e-07 XP_016858428 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1567) 511 60.8 1e-07 XP_016858429 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1567) 511 60.8 1e-07 XP_016858438 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1433) 490 58.9 3.5e-07 XP_016858437 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1450) 455 55.8 3e-06 XP_016858436 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1450) 455 55.8 3e-06 XP_016858427 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1548) 455 55.8 3.1e-06 XP_016858440 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1337) 407 51.5 5.3e-05 XP_016858435 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1435) 407 51.6 5.6e-05 XP_016858433 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1496) 407 51.6 5.7e-05 XP_011542646 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1496) 407 51.6 5.7e-05 XP_011542645 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1497) 407 51.6 5.7e-05 XP_011542643 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1594) 407 51.6 6e-05 XP_016858422 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1594) 407 51.6 6e-05 XP_016858423 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1594) 407 51.6 6e-05 XP_016858421 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1656) 407 51.6 6.2e-05 XP_011542637 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1656) 407 51.6 6.2e-05 XP_011542636 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1656) 407 51.6 6.2e-05 XP_011542638 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1656) 407 51.6 6.2e-05 XP_006711906 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1656) 407 51.6 6.2e-05 NP_001035864 (OMIM: 613023) centrosomal protein of (1460) 400 51.0 8.6e-05 XP_016858426 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1558) 400 51.0 9e-05 XP_016858430 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal (1558) 400 51.0 9e-05 XP_011522643 (OMIM: 114000,120150,130000,130060,16 (1398) 323 44.2 0.0092 >>NP_001035863 (OMIM: 613023) centrosomal protein of 170 (1486 aa) initn: 1657 init1: 356 opt: 960 Z-score: 473.5 bits: 100.3 E(85289): 1.2e-19 Smith-Waterman score: 1763; 30.7% identity (56.1% similar) in 1578 aa overlap (1-1515:71-1478) 10 20 30 pF1KA0 MRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLER .:::.: :.::::.: .:::::.:.... . 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NP_001 -PVINEKHKDLIKDWALSSAAAVMEERKPLTTSGFHHSEEGTSSSGSKRWVSQWASLAA- 440 450 460 470 480 490 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 SRLAQDFMAQCLRESSPAARPSPEKVPPVLPAPLTPHGTSPVGPPTPPPAPTDPQLTKAR .. .: . .. :.: . .. . . ... .. : ::: . . NP_001 NHTRHDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQGERRRRTLPQLPNEE 500 510 520 530 540 550 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 KQEEDDSLSDAGTYTIETEAQDTEVEEARKMIDQVFGVLESPELSRASSATFRPVIRGDR :. :. . . . : ::::..: .. ::. .. NP_001 KSLESHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQE-KETPTQVY----------------------QK 560 570 580 590 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 DESDDGGVAQRMALLQEFASRPLGAAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLADSYSDPG :..: :.:::. .: . : . . : .: . . .: : :: NP_001 DKQD--------------ADRPLSKMNRAVN-GETLK-TGGDNKTLLHLGS-----SAPG 600 610 620 630 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 LTEDGLGRRGGEPEGSLPVRMRRRLPQLPSERADSPAGPES-SRRSGPGPPELDSEQPSR .. . : :: . .: : .: .. : . : .. : . :. 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NP_001 STQKRKSFTSLYKDRCSTGSP--SKDVTKSSSSGAREKMEKKTKSR--STDVGSRADGRK 860 870 880 890 900 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA0 SAIRRGHRPRGSLDWPSEERGPVLAHLPSSDVMASNHETPEATGAGRLGSRRKPAAPPPS . :. . :.: .... . : ::.:.:..:: :: : . NP_001 FVQSSGRIRQPSVDLTDDDQTSSVPHSAISDIMSSDQETYSCKPHGRT-----PLTSADE 910 920 930 940 950 960 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA0 PAAREEQSRSSASSQKGP---QALTRSNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAADGERG . . .. . ..:. .: . ..:..: :::::.: :::::::.:::.: ::.... NP_001 HVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSKSTTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELADADKA 970 980 990 1000 1010 1020 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KA0 SLGNP----EPVGRPAAEQAKKLSRLDILAMPRK-RAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSV :... ...: . . ...::.:.::.::. : ::... :: ::. .:.: :.:.. NP_001 SVASEVSTTSSTSKPPTGR-RNISRIDLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASSRTA 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA0 ELCCASRKPTMAEARAVSRKAANTATTTGPRQPFSRARS-GSARYTSNTRRRQQGSDYTS : : . . : ::. . . . : . . ::: . :.: :. .::.: NP_001 EAIIRSGARLVPSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSA--SVNSRWRRFPTDYAS 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA0 TSEEEYGSRHGSPKHTRSHTSTATQTPRAGSSSRARSRAPGPRDTDDDEEEPDPYGFIVQ :::.:.:: ..:::::: .:: : .: : :.. : . . . ..:. .: . NP_001 TSEDEFGSNRNSPKHTRLRTSPALKTTRLQSAGSAMPTSSSFKHRIKEQED-----YIRD 1150 1160 1170 1180 1190 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA0 -TAEIAEIARLSQTLVKDVAILAQEIHDVAGDGDTLGSSEPAHSASLSNMPSTPASTISA ::. ::::.:: :.:..:.::.::::. :.. :: : :...:. .::.:.:.. NP_001 WTAHREEIARISQ----DLALIAREINDVAGEIDSVTSSGTAPSTTVSTAATTPGSAIDT 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KA0 REELVQRIPEASLNFQKVPPGSLNSRDFDQNMNDSCE---------DALA-NKTRPRNRE :::::.:. . ::::.:.:: ..:. . : . : . : :. .. : .:. 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NP_001 SMEISSILQELKRVEKQLQAINAMIDPDGTLEALN-NMGFPSAMLPSPPKQKSSPVNNHH 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1480 1490 1500 1510 pF1KA0 SP-PSPA----SAEALLPAL--PLRNFPQRASCGPPSLPDPTFLPDAERFLI :: .:. :.:: :: .: . : . :. : ::.: NP_001 SPGQTPTLGQPEARALHPAAVSAAAEFENAESEADFSIHFNRFNPDGEEEDVTVQE 1440 1450 1460 1470 1480 >>XP_016858425 (OMIM: 613023) PREDICTED: centrosomal pro (1584 aa) initn: 1728 init1: 356 opt: 960 Z-score: 473.1 bits: 100.3 E(85289): 1.3e-19 Smith-Waterman score: 2058; 32.7% identity (57.6% similar) in 1652 aa overlap (1-1515:71-1576) 10 20 30 pF1KA0 MRIPDQKYVTLKLNDVIRFGYDSNMYVLER .:::.: :.::::.: .:::::.:.... . XP_016 KQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQ 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 pF1KA0 VQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKRSEALPEHTPYCEASNPRPE---------KG . :::::::::::.: :::.: :. . :.. .. .... : :. 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XP_016 -EKDNDDDQSDKGTYTIELENPNSEEVEARKMIDKVFGVDDNQDYNR-------PVINEK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 DRDESDDGGVAQRMALLQEFASRPLGAAPQAEHQGLPVPGSPGGQKWVSRWASLADS--- .: : .... :...: .:: .. . :.. .: :...:::.::::: . XP_016 HKDLIKDWALSSAAAVMEE--RKPLTTS--GFHHSEEGTSSSGSKRWVSQWASLAANHTR 550 560 570 580 590 610 620 630 640 pF1KA0 ---------YSDP-------GLTEDGLGRRGGEPEGSLPV---RMRRRLPQLPSERA--D .: : ..:.:. :. :: : :: :::::.:. . XP_016 HDQEERIMEFSAPLPLENETEISESGMTVRSTGSATSLASQGERRRRTLPQLPNEEKSLE 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 pF1KA0 SPAGPESSRRSGPGPP---EL-DSEQPSRLFGQEELDPD--------SLSDASGSDGGRG : . ..:: : :: ..: :.... ... : : ... . . :: . XP_016 SHRAKVVTQRSEIGEKQDTELQEKETPTQVYQKDKQDADRPLSKMNRAVNGETLKTGGDN 660 670 680 690 700 710 690 700 710 720 730 pF1KA0 PE--------PGVEPQDSRRRSPQEGPTWSR-GRRSPRAPGEPTPASFFIGDQNGDAVLS :: : ... ... : .. .. : .. ::... . .:.. XP_016 KTLLHLGSSAPGKEKSETDKETSLVKQTLAKLQQQEQREEAQWTPTKLSSKNVSGQTDKC 720 730 740 750 760 770 740 750 760 770 780 pF1KA0 RKPLAAPGDGEGLGQTAQPSPPARDGVYVSANGRMVIQLRPGR--------SPEPDG--- :. : . : .: :: ... . ...: : : . : : : : XP_016 RE--------ETFKQESQ--PPEKNSGHSTSKGDRVAQSESKRRKAEEILKSQTPKGGDK 780 790 800 810 820 790 800 810 820 830 pF1KA0 --PAPAFLRQESFTKEPASGPPAPGKP----PHI----SSHPLLQDLAATRAARMDFHSQ . ...:: ::: : :.:. : ::: :: : ..:: : :.:. .:. XP_016 KESSKSLVRQGSFTIEK----PSPNIPIELIPHINKQTSSTP--SSLALTSASRIRERSE 830 840 850 860 870 880 840 850 860 870 880 pF1KA0 --------DTHLILKETETALAALEARLL-SNSVDAECEGGSTPRPPED-ALSGDSDVDT :: ::::.::...: :::.: .:..: :: .:: .: ..: .::::: XP_016 SLDPDSSMDTTLILKDTEAVMAFLEAKLREDNKTD---EGPDTPSYNRDNSISPESDVDT 890 900 910 920 930 890 900 910 920 930 940 pF1KA0 ASTVSLRSG----KSGPSPTTPQPLRAQKEMSPSPPAAQDPGGTALVSAREQSSERQHHP :::.:: .: :: . . : .. . :: ..: .. .:::. .. . 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XP_011 KQHAVINYDASTDEHLVKDLGSLNGTFVNDVRIPEQTYITLKLEDKLRFGYDTNLFTVVQ 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 pF1KA0 VQHRVPEEALKHEKYTSQLQVSVKGLAPKRSEALPEHTPYCEASNPRPE---------KG . :::::::::::.: :::.: :. . :.. .. .... : :. XP_011 GEMRVPEEALKHEKFTIQLQLSQKSSESELSKSASAKSIDSKVADAATEVQHKTTEALKS 110 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 pF1KA0 DRRPGTEAASYR-TPLYGQPSWWGEDDGSTLPDAQRQGEPYPERPKGPVQQDG----ELH ... .: : :::::::::::.:. . . .:.: . .. .. : ... XP_011 EEKAMDISAMPRGTPLYGQPSWWGDDEVDEKRAFKTNGKPEEKNHEAGTSGCGIDAKQVE 170 180 190 200 210 220 140 150 160 170 180 190 pF1KA0 GFRAPA-EPQGCSFRREPSYFEIPTKETPQPSQPPEVPAHEMPTKDAEAGGGGAAPVVQS : : : : :::::::::::: :::: : ::.::::. .. .: . 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XP_011 P---TSSSFKHRIKEQEDYIRD-----------WTAHREEIARISQ----DLALIAREIN 1310 1320 1330 1340 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KA0 DVAGDGDTLGSSEPAHSASLSNMPSTPASTISAREELVQRIPEASLNFQKVPPGSLNSRD ::::. :.. :: : :...:. .::.:.:..:::::.:. . ::::.:.:: ..:. 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XP_011 SAISDIMSSDQETYSCKPHGRT-----PLTSADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSK 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA0 SNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNP----EPVGRPAAEQAKKLSRL :..: :::::.: :::::::.:::.: ::....:... ...: . . ...::. XP_011 STTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELADADKASVASEVSTTSSTSKPPTGR-RNISRI 1160 1170 1180 1190 1200 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KA0 DILAMPRK-RAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPTMAEARAVSRKAANTAT :.::.::. : ::... :: ::. .:.: :.:..: : . . : ::. . 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XP_011 SAISDIMSSDQETYSCKPHGR-----TPLTSADEHVHSKLEGSKVTKSKTSPVVSGSSSK 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA0 SNSLSTPRPTRASRLRRARLGDASDTEAADGERGSLGNP----EPVGRPAAEQAKKLSRL :..: :::::.: :::::::.:::.: ::....:... ...: . . ...::. XP_011 STTLPRPRPTRTSLLRRARLGEASDSELADADKASVASEVSTTSSTSKPPTGR-RNISRI 1160 1170 1180 1190 1200 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KA0 DILAMPRK-RAGSFTGTSDPEAAPARTSFSGRSVELCCASRKPTMAEARAVSRKAANTAT :.::.::. : ::... :: ::. .:.: :.:..: :. :..: . XP_011 DLLAQPRRTRLGSLSARSDSEATISRSSASSRTAE--------------AIIRSGARLV- 1210 1220 1230 1240 1250 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KA0 TTGPRQPFS-RARSGSARYTSNTRRRQQGSDYTSTSEEEYGSRHGSPKHTRSHTSTATQT : . :: : :..: :... ... : . :.: . : :: . :... XP_011 ---PSDKFSPRIRANSISRLSDSKVKSMTSAHGSAS---------ALKTTRLQ-SAGSAM 1260 1270 1280 1290 1300 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KA0 PRAGSSSRARSRAPGPRDTDDDEEEPDPYGFIVQTAEIAEIARLSQTLVKDVAILAQEIH : .:: . : .: : ::. ::::.:: :.:..:.::. 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