Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0291
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0291, 1011 aa
1>>>pF1KA0291 1011 - 1011 aa - 1011 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3038+/-0.00119; mu= 0.3984+/- 0.071
mean_var=354.3670+/-77.791, 0's: 0 Z-trim(112.5): 132 B-trim: 746 in 2/50
Lambda= 0.068131
statistics sampled from 13142 (13259) to 13142 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.407), width: 16
Scan time: 4.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5570.1 CLIP2 gene_id:7461|Hs108|chr7 (1011) 6446 648.6 1.8e-185
CCDS5569.1 CLIP2 gene_id:7461|Hs108|chr7 (1046) 3549 363.9 9.8e-100
CCDS9233.1 CLIP1 gene_id:6249|Hs108|chr12 (1392) 2016 213.3 2.7e-54
CCDS58285.1 CLIP1 gene_id:6249|Hs108|chr12 (1438) 1549 167.5 1.8e-40
CCDS9232.1 CLIP1 gene_id:6249|Hs108|chr12 (1427) 1542 166.8 3e-40
>>CCDS5570.1 CLIP2 gene_id:7461|Hs108|chr7 (1011 aa)
initn: 6446 init1: 6446 opt: 6446 Z-score: 3443.2 bits: 648.6 E(32554): 1.8e-185
Smith-Waterman score: 6446; 99.9% identity (99.9% similar) in 1011 aa overlap (1-1011:1-1011)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAAAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVGKN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQNLSLHSGTATPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQNLSLHSGTATPPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TSRVIPLRESVLNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDRVLVGGTKTGVVRYVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TSRVIPLRESVLNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDRVLVGGTKTGVVRYVGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHKVIRIGFPSTSPAKAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHKVIRIGFPSTSPAKAKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TKRMAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLTETSSRYARKISGTTALQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TKRMAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLTETSSRYARKISGTTALQEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKAQHEQYVAEAEEKLQRARLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKAQHEQYVAEAEEKLQRARLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLELTTVAEKSRVLQLEEELTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLELTTVAEKSRVLQLEEELTLR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAAEILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAAEILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 AEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 NSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALREKLQEAQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALREKLQEAQEE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 ISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAENRLQAVEALCSSQHTHMIESNDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAENRLQAVEALCSSQHTHMIESNDIS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 RLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 KAEWRIKEQKLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQRRYSLIDPSSAPELLRLQHQLMSTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS55 KAEWRIKEQKLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQRRYSLIDRSSAPELLRLQHQLMSTED
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KA0 ALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
970 980 990 1000 1010
>>CCDS5569.1 CLIP2 gene_id:7461|Hs108|chr7 (1046 aa)
initn: 3479 init1: 3479 opt: 3549 Z-score: 1904.0 bits: 363.9 E(32554): 9.8e-100
Smith-Waterman score: 6346; 96.5% identity (96.5% similar) in 1043 aa overlap (4-1011:4-1046)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAAAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAAAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVGKN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQNLSLHSGTATPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQNLSLHSGTATPPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TSRVIPLRESVLNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDRVLVGGTKTGVVRYVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TSRVIPLRESVLNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDRVLVGGTKTGVVRYVGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHKVIRIGFPSTSPAKAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHKVIRIGFPSTSPAKAKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TKRMAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLTETSSRYARKISGTTALQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TKRMAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLTETSSRYARKISGTTALQEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKAQHEQYVAEAEEKLQRARLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKAQHEQYVAEAEEKLQRARLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KA0 VESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLE--------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTQLEHARIGELEQSLLLE
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500
pF1KA0 ---------------LTTVAEKSRVLQLEEELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KAQAERLLRELADNRLTTVAEKSRVLQLEEELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 EILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQ
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 QATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEH
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 QLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALREKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALREKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQE
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 AQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEV
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 ESLREKLLVAENRLQAVEALCSSQHTHMIESNDISEETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ESLREKLLVAENRLQAVEALCSSQHTHMIESNDISEETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVT
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 ALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKRRLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKRRLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQ
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 ELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVHKAEWRIKEQKLKDDIRGLREKLTGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVHKAEWRIKEQKLKDDIRGLREKLTGL
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 DKEKSLSDQRRYSLIDPSSAPELLRLQHQLMSTEDALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDK
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DKEKSLSDQRRYSLIDRSSAPELLRLQHQLMSTEDALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDK
970 980 990 1000 1010 1020
990 1000 1010
pF1KA0 AQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
1030 1040
>>CCDS9233.1 CLIP1 gene_id:6249|Hs108|chr12 (1392 aa)
initn: 2176 init1: 814 opt: 2016 Z-score: 1088.1 bits: 213.3 E(32554): 2.7e-54
Smith-Waterman score: 2578; 43.7% identity (70.8% similar) in 1060 aa overlap (1-987:3-1037)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAA
: :::::: : . : .: .: : :.:: : : .: :: :::
CCDS92 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-----
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AAPEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVG
:. ..:. :: ::::::::: ::: .:.:::::::::::::.:::.:.:
CCDS92 -----------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIG
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KNDGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGT
::::.:.:::::.: :.:::::::::::. :: .. ... . : . : : .
CCDS92 KNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KA0 ATPPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDR
.. : : :: . : ... .::..:: ::::..::.:.::..:..:::
CCDS92 SSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDR
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VLVGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHK
:::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::.::
CCDS92 VLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHK
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VIRIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLT
: .::::::.::::: . .: :: ..: .:::.::.::.:::::::..::::.::::
CCDS92 VTKIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLT
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:.:: .
CCDS92 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARD
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QHEQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLEL
:.:.: : : :... : .::.. .:::.: ::::::.:::::::::::::::::::::.
CCDS92 GHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEV
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KA0 TTVAEKSRVLQLEEELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLS
.::.::::...::..:.:: :. ::.. :.:. : : : . :: :.:.:
CCDS92 ATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEV
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMD
. .:::: :.... ...: :. : .:.:: ..: .::.:...:..:: ..
CCDS92 TRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIA
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 NWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKH
:::::.. ..::...:.::.....: :.. :..:::. .: .....: :. ::: ..
CCDS92 LWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQ
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 DLETAMHVKEKEALREKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELR
: : : :.:: :::: ::... .: . . :..:. .:: .:.... .. ..::..
CCDS92 DSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIK
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 VHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAE
:.::: :... :...:. . :.. .:.:.:: . :..: ..::.:...::..: .::
CCDS92 VKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAE
700 710 720 730 740 750
760 770
pF1KA0 NRLQAVE----ALCS--------------------------SQHTHMIESN---------
.... .: : : :: . .:..
CCDS92 KQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFA
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 DISEETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLK
. :::.. ...... .::...... . :.:. : :: ... .:.: . ... . :.:
CCDS92 EASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIK
820 830 840 850 860 870
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 EKRRLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSR
:..:: .. . . . : :.::. ...:: :::...::.. : .::... ....
CCDS92 AKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIED
880 890 900 910 920 930
900 910 920 930 940
pF1KA0 EVHKAEWRIKE--QKLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQR------RYSLIDPSSAP---
. ::: .: .: ... . :..::. :.:. : .. :: .
CCDS92 MTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHE
940 950 960 970 980 990
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 ELLR-LQHQLMSTEDALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQ
:.:. ::. :..::: :. : .. . . . .: .:. :::.
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: ::... .: . . :..:. .:: .:.... .. ..::..:.::: :... :
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pF1KA0 AQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAENRLQAVE----ALC
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CCDS58 TKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAES
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: :: . .:.. . :::.. ......
CCDS58 SKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]