Result of FASTA (omim) for
pF1KA0291
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0291, 1011 aa
1>>>pF1KA0291 1011 - 1011 aa - 1011 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0030+/-0.000499; mu= -3.0904+/- 0.031
mean_var=503.6395+/-104.510, 0's: 0 Z-trim(120.5): 177 B-trim: 275 in 1/54
Lambda= 0.057150
statistics sampled from 35717 (35924) to 35717 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.421), width: 16
Scan time: 14.590
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_115797 (OMIM: 603432) CAP-Gly domain-containing (1011) 6459 548.6 6.4e-155
NP_003379 (OMIM: 603432) CAP-Gly domain-containing (1046) 3562 309.7 5.2e-83
XP_016875281 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly dom (1355) 2197 197.3 4.7e-49
XP_016875279 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly dom (1392) 2016 182.4 1.5e-44
NP_937883 (OMIM: 179838) CAP-Gly domain-containing (1392) 2016 182.4 1.5e-44
XP_016875277 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly dom (1394) 2016 182.4 1.5e-44
XP_016875278 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly dom (1394) 2016 182.4 1.5e-44
NP_001234926 (OMIM: 179838) CAP-Gly domain-contain (1438) 1549 143.9 5.9e-33
XP_005253650 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly dom (1440) 1549 143.9 5.9e-33
NP_002947 (OMIM: 179838) CAP-Gly domain-containing (1427) 1542 143.3 8.7e-33
XP_016875275 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly dom (1427) 1542 143.3 8.7e-33
XP_006719615 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly dom (1429) 1542 143.3 8.7e-33
XP_016875280 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly dom (1390) 1510 140.7 5.3e-32
XP_016875276 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly dom (1401) 879 88.7 2.5e-16
NP_001128512 (OMIM: 105400,168605,601143,607641) d (1253) 401 49.2 0.00017
NP_001177765 (OMIM: 105400,168605,601143,607641) d (1236) 394 48.6 0.00025
NP_001186499 (OMIM: 607382) CAP-Gly domain-contain ( 547) 350 44.5 0.0018
NP_056341 (OMIM: 607382) CAP-Gly domain-containing ( 547) 350 44.5 0.0018
>>NP_115797 (OMIM: 603432) CAP-Gly domain-containing lin (1011 aa)
initn: 6459 init1: 6459 opt: 6459 Z-score: 2902.3 bits: 548.6 E(85289): 6.4e-155
Smith-Waterman score: 6459; 100.0% identity (100.0% similar) in 1011 aa overlap (1-1011:1-1011)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAAAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 PEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVGKN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQNLSLHSGTATPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 DGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQNLSLHSGTATPPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TSRVIPLRESVLNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDRVLVGGTKTGVVRYVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 TSRVIPLRESVLNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDRVLVGGTKTGVVRYVGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHKVIRIGFPSTSPAKAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 TDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHKVIRIGFPSTSPAKAKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TKRMAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLTETSSRYARKISGTTALQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 TKRMAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLTETSSRYARKISGTTALQEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKAQHEQYVAEAEEKLQRARLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 LKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKAQHEQYVAEAEEKLQRARLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLELTTVAEKSRVLQLEEELTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 VESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLELTTVAEKSRVLQLEEELTLR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAAEILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 RGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAAEILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 AEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 AEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 NSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALREKLQEAQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 NSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALREKLQEAQEE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 LAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 ISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAENRLQAVEALCSSQHTHMIESNDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 ISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAENRLQAVEALCSSQHTHMIESNDIS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 EETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 EETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 RLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 RLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 KAEWRIKEQKLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQRRYSLIDPSSAPELLRLQHQLMSTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 KAEWRIKEQKLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQRRYSLIDPSSAPELLRLQHQLMSTED
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KA0 ALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_115 ALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
970 980 990 1000 1010
>>NP_003379 (OMIM: 603432) CAP-Gly domain-containing lin (1046 aa)
initn: 3492 init1: 3492 opt: 3562 Z-score: 1611.2 bits: 309.7 E(85289): 5.2e-83
Smith-Waterman score: 6359; 96.6% identity (96.6% similar) in 1043 aa overlap (4-1011:4-1046)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAAAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAAAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVGKN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQNLSLHSGTATPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQNLSLHSGTATPPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TSRVIPLRESVLNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDRVLVGGTKTGVVRYVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TSRVIPLRESVLNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDRVLVGGTKTGVVRYVGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 TDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHKVIRIGFPSTSPAKAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHKVIRIGFPSTSPAKAKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TKRMAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLTETSSRYARKISGTTALQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TKRMAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLTETSSRYARKISGTTALQEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKAQHEQYVAEAEEKLQRARLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKAQHEQYVAEAEEKLQRARLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KA0 VESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLE--------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQTQLEHARIGELEQSLLLE
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500
pF1KA0 ---------------LTTVAEKSRVLQLEEELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KAQAERLLRELADNRLTTVAEKSRVLQLEEELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 EILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQ
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 QATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEH
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 QLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALREKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALREKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQE
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 AQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEV
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 ESLREKLLVAENRLQAVEALCSSQHTHMIESNDISEETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ESLREKLLVAENRLQAVEALCSSQHTHMIESNDISEETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVT
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 ALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKRRLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKRRLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQ
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 ELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVHKAEWRIKEQKLKDDIRGLREKLTGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVHKAEWRIKEQKLKDDIRGLREKLTGL
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 DKEKSLSDQRRYSLIDPSSAPELLRLQHQLMSTEDALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DKEKSLSDQRRYSLIDPSSAPELLRLQHQLMSTEDALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDK
970 980 990 1000 1010 1020
990 1000 1010
pF1KA0 AQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
1030 1040
>>XP_016875281 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly domain- (1355 aa)
initn: 1980 init1: 814 opt: 2197 Z-score: 1001.7 bits: 197.3 E(85289): 4.7e-49
Smith-Waterman score: 2671; 44.4% identity (72.7% similar) in 1042 aa overlap (1-1008:3-1019)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAA
: :::::: : . : .: .: : :.:: : : .: :: :::
XP_016 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-----
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AAPEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVG
:. ..:. :: ::::::::: ::: .:.:::::::::::::.:::.:.:
XP_016 -----------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIG
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KNDGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGT
::::.:.:::::.: :.:::::::::::. :: .. ... . : . : : .
XP_016 KNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KA0 ATPPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDR
.. : : :: . : ... .::..:: ::::..::.:.::..:..:::
XP_016 SSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDR
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VLVGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHK
:::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::.::
XP_016 VLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHK
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VIRIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLT
: .::::::.::::: . .: :: ..: .:::.::.::.:::::::..::::.::::
XP_016 VTKIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLT
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:.:: .
XP_016 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARD
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QHEQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLEL
:.:.: : : :... : .::.. .:::.: ::::::.:::::::::::::::::::::.
XP_016 GHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEV
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KA0 TTVAEKSRVLQLEEELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLS
.::.::::...::..:.:: :. ::.. :.:. : : : . :: :.:.:
XP_016 ATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEV
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMD
. .:::: :.... ...: :. : .:.:: ..: .::.:...:..:: ..
XP_016 TRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIA
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 NWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKH
:::::.. ..::...:.::.....: :.. :..:::. .: .....: :. ::: ..
XP_016 LWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQ
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 DLETAMHVKEKEALREKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELR
: : : :.:: :::: ::... .: . . :..:. .:: .:.... .. ..::..
XP_016 DSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIK
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 VHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAE
:.::: :... :...:. . :.. .:.:.:: . :..: ..::.:...::..: .::
XP_016 VKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAE
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 NRLQAVEALCSSQHTHMIESNDISEETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRA
.... .: ... .. . . :::.. ...... .::...... . :.:. : ::
XP_016 KQIKHLEIEKNAESSKKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRE
760 770 780 790 800 810
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 QVSALESKCKSGEKKVDALLKEKRRLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQELLRKERSLNE
... .:.: . ... . :.: :..:: .. . . . : :.::. ...:: :::...:
XP_016 NLADMEAKFREKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEE
820 830 840 850 860 870
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 LRVLLLEANRHSPGPERDLSREVHKAEWRIKE--QKLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQ
:.. : .::... .... . ::: .: .: ... . :..::. :.:. : .
XP_016 LQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHN
880 890 900 910 920 930
940 950 960 970 980
pF1KA0 R------RYSLIDPSSAP---ELLR-LQHQLMSTEDALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPD
. :: . :.:. ::. :..::: :. : .. . . . .: .:. :
XP_016 QCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTEDKLKGAREENSGLLQELEELRKQAD
940 950 960 970 980 990
990 1000 1010
pF1KA0 KAQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
::.. .. .: : .: .: :
XP_016 KAKAAQTAEDAMQIMEQMTKEKTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNLKNVEELNKS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
>>XP_016875279 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly domain- (1392 aa)
initn: 2176 init1: 814 opt: 2016 Z-score: 920.9 bits: 182.4 E(85289): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 2578; 43.7% identity (70.8% similar) in 1060 aa overlap (1-987:3-1037)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAA
: :::::: : . : .: .: : :.:: : : .: :: :::
XP_016 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-----
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AAPEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVG
:. ..:. :: ::::::::: ::: .:.:::::::::::::.:::.:.:
XP_016 -----------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIG
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KNDGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGT
::::.:.:::::.: :.:::::::::::. :: .. ... . : . : : .
XP_016 KNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KA0 ATPPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDR
.. : : :: . : ... .::..:: ::::..::.:.::..:..:::
XP_016 SSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDR
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VLVGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHK
:::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::.::
XP_016 VLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHK
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VIRIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLT
: .::::::.::::: . .: :: ..: .:::.::.::.:::::::..::::.::::
XP_016 VTKIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLT
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:.:: .
XP_016 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARD
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QHEQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLEL
:.:.: : : :... : .::.. .:::.: ::::::.:::::::::::::::::::::.
XP_016 GHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEV
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KA0 TTVAEKSRVLQLEEELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLS
.::.::::...::..:.:: :. ::.. :.:. : : : . :: :.:.:
XP_016 ATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEV
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMD
. .:::: :.... ...: :. : .:.:: ..: .::.:...:..:: ..
XP_016 TRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIA
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 NWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKH
:::::.. ..::...:.::.....: :.. :..:::. .: .....: :. ::: ..
XP_016 LWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQ
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 DLETAMHVKEKEALREKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELR
: : : :.:: :::: ::... .: . . :..:. .:: .:.... .. ..::..
XP_016 DSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIK
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 VHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAE
:.::: :... :...:. . :.. .:.:.:: . :..: ..::.:...::..: .::
XP_016 VKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAE
700 710 720 730 740 750
760 770
pF1KA0 NRLQAVE----ALCS--------------------------SQHTHMIESN---------
.... .: : : :: . .:..
XP_016 KQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFA
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 DISEETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLK
. :::.. ...... .::...... . :.:. : :: ... .:.: . ... . :.:
XP_016 EASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIK
820 830 840 850 860 870
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 EKRRLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSR
:..:: .. . . . : :.::. ...:: :::...::.. : .::... ....
XP_016 AKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIED
880 890 900 910 920 930
900 910 920 930 940
pF1KA0 EVHKAEWRIKE--QKLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQR------RYSLIDPSSAP---
. ::: .: .: ... . :..::. :.:. : .. :: .
XP_016 MTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHE
940 950 960 970 980 990
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 ELLR-LQHQLMSTEDALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQ
:.:. ::. :..::: :. : .. . . . .: .:. :::.
XP_016 EILQNLQKTLLDTEDKLKGAREENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010
pF1KA0 KQEDKH
XP_016 KTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
>>NP_937883 (OMIM: 179838) CAP-Gly domain-containing lin (1392 aa)
initn: 2176 init1: 814 opt: 2016 Z-score: 920.9 bits: 182.4 E(85289): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 2578; 43.7% identity (70.8% similar) in 1060 aa overlap (1-987:3-1037)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAA
: :::::: : . : .: .: : :.:: : : .: :: :::
NP_937 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-----
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AAPEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVG
:. ..:. :: ::::::::: ::: .:.:::::::::::::.:::.:.:
NP_937 -----------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIG
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KNDGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGT
::::.:.:::::.: :.:::::::::::. :: .. ... . : . : : .
NP_937 KNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KA0 ATPPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDR
.. : : :: . : ... .::..:: ::::..::.:.::..:..:::
NP_937 SSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDR
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VLVGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHK
:::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::.::
NP_937 VLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHK
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VIRIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLT
: .::::::.::::: . .: :: ..: .:::.::.::.:::::::..::::.::::
NP_937 VTKIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLT
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:.:: .
NP_937 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARD
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QHEQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLEL
:.:.: : : :... : .::.. .:::.: ::::::.:::::::::::::::::::::.
NP_937 GHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEV
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KA0 TTVAEKSRVLQLEEELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLS
.::.::::...::..:.:: :. ::.. :.:. : : : . :: :.:.:
NP_937 ATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEV
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMD
. .:::: :.... ...: :. : .:.:: ..: .::.:...:..:: ..
NP_937 TRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIA
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 NWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKH
:::::.. ..::...:.::.....: :.. :..:::. .: .....: :. ::: ..
NP_937 LWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQ
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 DLETAMHVKEKEALREKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELR
: : : :.:: :::: ::... .: . . :..:. .:: .:.... .. ..::..
NP_937 DSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIK
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 VHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAE
:.::: :... :...:. . :.. .:.:.:: . :..: ..::.:...::..: .::
NP_937 VKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAE
700 710 720 730 740 750
760 770
pF1KA0 NRLQAVE----ALCS--------------------------SQHTHMIESN---------
.... .: : : :: . .:..
NP_937 KQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFA
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 DISEETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLK
. :::.. ...... .::...... . :.:. : :: ... .:.: . ... . :.:
NP_937 EASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIK
820 830 840 850 860 870
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 EKRRLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSR
:..:: .. . . . : :.::. ...:: :::...::.. : .::... ....
NP_937 AKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIED
880 890 900 910 920 930
900 910 920 930 940
pF1KA0 EVHKAEWRIKE--QKLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQR------RYSLIDPSSAP---
. ::: .: .: ... . :..::. :.:. : .. :: .
NP_937 MTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHE
940 950 960 970 980 990
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 ELLR-LQHQLMSTEDALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQ
:.:. ::. :..::: :. : .. . . . .: .:. :::.
NP_937 EILQNLQKTLLDTEDKLKGAREENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010
pF1KA0 KQEDKH
NP_937 KTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
>>XP_016875277 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly domain- (1394 aa)
initn: 2176 init1: 814 opt: 2016 Z-score: 920.9 bits: 182.4 E(85289): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 2578; 43.7% identity (70.8% similar) in 1060 aa overlap (1-987:3-1037)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAA
: :::::: : . : .: .: : :.:: : : .: :: :::
XP_016 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-----
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AAPEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVG
:. ..:. :: ::::::::: ::: .:.:::::::::::::.:::.:.:
XP_016 -----------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIG
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KNDGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGT
::::.:.:::::.: :.:::::::::::. :: .. ... . : . : : .
XP_016 KNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KA0 ATPPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDR
.. : : :: . : ... .::..:: ::::..::.:.::..:..:::
XP_016 SSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDR
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VLVGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHK
:::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::.::
XP_016 VLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHK
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VIRIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLT
: .::::::.::::: . .: :: ..: .:::.::.::.:::::::..::::.::::
XP_016 VTKIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLT
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:.:: .
XP_016 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARD
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QHEQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLEL
:.:.: : : :... : .::.. .:::.: ::::::.:::::::::::::::::::::.
XP_016 GHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEV
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KA0 TTVAEKSRVLQLEEELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLS
.::.::::...::..:.:: :. ::.. :.:. : : : . :: :.:.:
XP_016 ATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEV
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMD
. .:::: :.... ...: :. : .:.:: ..: .::.:...:..:: ..
XP_016 TRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIA
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 NWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKH
:::::.. ..::...:.::.....: :.. :..:::. .: .....: :. ::: ..
XP_016 LWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQ
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 DLETAMHVKEKEALREKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELR
: : : :.:: :::: ::... .: . . :..:. .:: .:.... .. ..::..
XP_016 DSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIK
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 VHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAE
:.::: :... :...:. . :.. .:.:.:: . :..: ..::.:...::..: .::
XP_016 VKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAE
700 710 720 730 740 750
760 770
pF1KA0 NRLQAVE----ALCS--------------------------SQHTHMIESN---------
.... .: : : :: . .:..
XP_016 KQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFA
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 DISEETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLK
. :::.. ...... .::...... . :.:. : :: ... .:.: . ... . :.:
XP_016 EASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIK
820 830 840 850 860 870
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 EKRRLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSR
:..:: .. . . . : :.::. ...:: :::...::.. : .::... ....
XP_016 AKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIED
880 890 900 910 920 930
900 910 920 930 940
pF1KA0 EVHKAEWRIKE--QKLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQR------RYSLIDPSSAP---
. ::: .: .: ... . :..::. :.:. : .. :: .
XP_016 MTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHE
940 950 960 970 980 990
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 ELLR-LQHQLMSTEDALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQ
:.:. ::. :..::: :. : .. . . . .: .:. :::.
XP_016 EILQNLQKTLLDTEDKLKGAREENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010
pF1KA0 KQEDKH
XP_016 KTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
>>XP_016875278 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly domain- (1394 aa)
initn: 2176 init1: 814 opt: 2016 Z-score: 920.9 bits: 182.4 E(85289): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 2578; 43.7% identity (70.8% similar) in 1060 aa overlap (1-987:3-1037)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAA
: :::::: : . : .: .: : :.:: : : .: :: :::
XP_016 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-----
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AAPEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVG
:. ..:. :: ::::::::: ::: .:.:::::::::::::.:::.:.:
XP_016 -----------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIG
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KNDGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGT
::::.:.:::::.: :.:::::::::::. :: .. ... . : . : : .
XP_016 KNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KA0 ATPPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDR
.. : : :: . : ... .::..:: ::::..::.:.::..:..:::
XP_016 SSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDR
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VLVGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHK
:::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::.::
XP_016 VLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHK
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VIRIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLT
: .::::::.::::: . .: :: ..: .:::.::.::.:::::::..::::.::::
XP_016 VTKIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLT
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:.:: .
XP_016 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARD
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QHEQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLEL
:.:.: : : :... : .::.. .:::.: ::::::.:::::::::::::::::::::.
XP_016 GHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEV
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KA0 TTVAEKSRVLQLEEELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLS
.::.::::...::..:.:: :. ::.. :.:. : : : . :: :.:.:
XP_016 ATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAELRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEV
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMD
. .:::: :.... ...: :. : .:.:: ..: .::.:...:..:: ..
XP_016 TRTDHQREITSLKEHFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIA
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 NWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKH
:::::.. ..::...:.::.....: :.. :..:::. .: .....: :. ::: ..
XP_016 LWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQ
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 DLETAMHVKEKEALREKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELR
: : : :.:: :::: ::... .: . . :..:. .:: .:.... .. ..::..
XP_016 DSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIK
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 VHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAE
:.::: :... :...:. . :.. .:.:.:: . :..: ..::.:...::..: .::
XP_016 VKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAE
700 710 720 730 740 750
760 770
pF1KA0 NRLQAVE----ALCS--------------------------SQHTHMIESN---------
.... .: : : :: . .:..
XP_016 KQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFA
760 770 780 790 800 810
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 DISEETIRTKETVEGLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLK
. :::.. ...... .::...... . :.:. : :: ... .:.: . ... . :.:
XP_016 EASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIK
820 830 840 850 860 870
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 EKRRLEAELETVSRKTHDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSR
:..:: .. . . . : :.::. ...:: :::...::.. : .::... ....
XP_016 AKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIED
880 890 900 910 920 930
900 910 920 930 940
pF1KA0 EVHKAEWRIKE--QKLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQR------RYSLIDPSSAP---
. ::: .: .: ... . :..::. :.:. : .. :: .
XP_016 MTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHE
940 950 960 970 980 990
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 ELLR-LQHQLMSTEDALRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQ
:.:. ::. :..::: :. : .. . . . .: .:. :::.
XP_016 EILQNLQKTLLDTEDKLKGAREENSGLLQELEELRKQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010
pF1KA0 KQEDKH
XP_016 KTETLASLEDTKQTNAKLQNELDTLKENNLKNVEELNKSKELLTVENQKMEEFRKEIETL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
>>NP_001234926 (OMIM: 179838) CAP-Gly domain-containing (1438 aa)
initn: 2021 init1: 715 opt: 1549 Z-score: 712.7 bits: 143.9 E(85289): 5.9e-33
Smith-Waterman score: 2426; 42.8% identity (68.7% similar) in 1041 aa overlap (1-932:3-1018)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAA
: :::::: : . : .: .: : :.:: : : .: :: :::
NP_001 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-----
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AAPEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVG
:. ..:. :: ::::::::: ::: .:.:::::::::::::.:::.:.:
NP_001 -----------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIG
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KNDGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGT
::::.:.:::::.: :.:::::::::::. :: .. ... . : . : : .
NP_001 KNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KA0 ATPPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDR
.. : : :: . : ... .::..:: ::::..::.:.::..:..:::
NP_001 SSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDR
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VLVGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHK
:::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::.::
NP_001 VLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHK
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VIRIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLT
: .::::::.::::: . .: :: ..: .:::.::.::.:::::::..::::.::::
NP_001 VTKIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLT
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:.:: .
NP_001 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARD
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QHEQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLE-
:.:.: : : :... : .::.. .:::.: ::::::.:::::::::::::::::::::
NP_001 GHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEQ
400 410 420 430 440 450
470
pF1KA0 ---------------------------------------------LTTVAEKSRVLQLEE
..::.::::...::.
NP_001 KSQISEDPENTQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEK
460 470 480 490 500 510
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 ELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLSASKEHQRESGVLRD
.:.:: :. ::.. :.:. : : : . :: :.:.: . .:::: :..
NP_001 DLALRVQEVAELRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREITSLKE
520 530 540 550 560 570
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 KYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQ
.. ...: :. : .:.:: ..: .::.:...:..:: .. :::::.. ..::
NP_001 HFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQ
580 590 600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 KSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEAL
...:.::.....: :.. :..:::. .: .....: :. ::: ..: : : :.:: :::
NP_001 QAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEAL
640 650 660 670 680 690
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 REKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQ
: ::... .: . . :..:. .:: .:.... .. ..::..:.::: :... :
NP_001 RAKLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQ
700 710 720 730 740 750
720 730 740 750 760
pF1KA0 AQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAENRLQAVE----ALC
...:. . :.. .:.:.:: . :..: ..::.:...::..: .::.... .: :
NP_001 TKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAES
760 770 780 790 800 810
770 780 790
pF1KA0 S--------------------------SQHTHMIESN---------DISEETIRTKETVE
: :: . .:.. . :::.. ......
NP_001 SKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQ
820 830 840 850 860 870
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 GLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKRRLEAELETVSR
.::...... . :.:. : :: ... .:.: . ... . :.: :..:: .. . .
NP_001 ETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMK
880 890 900 910 920 930
860 870 880 890 900
pF1KA0 KTHDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVHKAEWRIKE--Q
. : :.::. ...:: :::...::.. : .::... .... . ::: .: .
NP_001 MSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQEAAK
940 950 960 970 980 990
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 KLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQRRYSLIDPSSAPELLRLQHQLMSTEDALRDALDQA
: ... . :..::. :.:. :
NP_001 KHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
>>XP_005253650 (OMIM: 179838) PREDICTED: CAP-Gly domain- (1440 aa)
initn: 2021 init1: 715 opt: 1549 Z-score: 712.7 bits: 143.9 E(85289): 5.9e-33
Smith-Waterman score: 2426; 42.8% identity (68.7% similar) in 1041 aa overlap (1-932:3-1018)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAA
: :::::: : . : .: .: : :.:: : : .: :: :::
XP_005 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-----
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AAPEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVG
:. ..:. :: ::::::::: ::: .:.:::::::::::::.:::.:.:
XP_005 -----------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIG
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KNDGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGT
::::.:.:::::.: :.:::::::::::. :: .. ... . : . : : .
XP_005 KNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KA0 ATPPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDR
.. : : :: . : ... .::..:: ::::..::.:.::..:..:::
XP_005 SSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDR
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VLVGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHK
:::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::.::
XP_005 VLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHK
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VIRIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLT
: .::::::.::::: . .: :: ..: .:::.::.::.:::::::..::::.::::
XP_005 VTKIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLT
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:.:: .
XP_005 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARD
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QHEQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLE-
:.:.: : : :... : .::.. .:::.: ::::::.:::::::::::::::::::::
XP_005 GHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEQ
400 410 420 430 440 450
470
pF1KA0 ---------------------------------------------LTTVAEKSRVLQLEE
..::.::::...::.
XP_005 KSQISEDPENTQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEK
460 470 480 490 500 510
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 ELTLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLSASKEHQRESGVLRD
.:.:: :. ::.. :.:. : : : . :: :.:.: . .:::: :..
XP_005 DLALRVQEVAELRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREITSLKE
520 530 540 550 560 570
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 KYEKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQ
.. ...: :. : .:.:: ..: .::.:...:..:: .. :::::.. ..::
XP_005 HFGAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQ
580 590 600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 KSLEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEAL
...:.::.....: :.. :..:::. .: .....: :. ::: ..: : : :.:: :::
XP_005 QAMEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEAL
640 650 660 670 680 690
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 REKLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQ
: ::... .: . . :..:. .:: .:.... .. ..::..:.::: :... :
XP_005 RAKLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQ
700 710 720 730 740 750
720 730 740 750 760
pF1KA0 AQAIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAENRLQAVE----ALC
...:. . :.. .:.:.:: . :..: ..::.:...::..: .::.... .: :
XP_005 TKVIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAES
760 770 780 790 800 810
770 780 790
pF1KA0 S--------------------------SQHTHMIESN---------DISEETIRTKETVE
: :: . .:.. . :::.. ......
XP_005 SKASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQ
820 830 840 850 860 870
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 GLQDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKRRLEAELETVSR
.::...... . :.:. : :: ... .:.: . ... . :.: :..:: .. . .
XP_005 ETVNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMK
880 890 900 910 920 930
860 870 880 890 900
pF1KA0 KTHDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVHKAEWRIKE--Q
. : :.::. ...:: :::...::.. : .::... .... . ::: .: .
XP_005 MSGDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQEAAK
940 950 960 970 980 990
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 KLKDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQRRYSLIDPSSAPELLRLQHQLMSTEDALRDALDQA
: ... . :..::. :.:. :
XP_005 KHEEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
>>NP_002947 (OMIM: 179838) CAP-Gly domain-containing lin (1427 aa)
initn: 1993 init1: 766 opt: 1542 Z-score: 709.6 bits: 143.3 E(85289): 8.7e-33
Smith-Waterman score: 2448; 43.3% identity (69.4% similar) in 1030 aa overlap (1-932:3-1007)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAA
: :::::: : . : .: .: : :.:: : : .: :: :::
NP_002 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-----
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 AAPEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVG
:. ..:. :: ::::::::: ::: .:.:::::::::::::.:::.:.:
NP_002 -----------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIG
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KNDGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGT
::::.:.:::::.: :.:::::::::::. :: .. ... . : . : : .
NP_002 KNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KA0 ATPPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDR
.. : : :: . : ... .::..:: ::::..::.:.::..:..:::
NP_002 SSSPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDR
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 VLVGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHK
:::::::.::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::.::
NP_002 VLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHK
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VIRIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLT
: .::::::.::::: . .: :: ..: .:::.::.::.:::::::..::::.::::
NP_002 VTKIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLT
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.:.:.:: .
NP_002 ETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARD
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 QHEQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLE-
:.:.: : : :... : .::.. .:::.: ::::::.:::::::::::::::::::::
NP_002 GHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLET
400 410 420 430 440 450
470 480
pF1KA0 ----------------------------------LTTVAEKSRVLQLEEELTLRRGEIEE
..::.::::...::..:.:: :. :
NP_002 QTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEKDLALRVQEVAE
460 470 480 490 500 510
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKYEKALKAYQA
:.. :.:. : : : . :: :.:.: . .:::: :.... ...:
NP_002 LRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREITSLKEHFGAREETHQK
520 530 540 550 560 570
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKSLEDLKATLN
:. : .:.:: ..: .::.:...:..:: .. :::::.. ..::...:.::....
NP_002 EIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFS
580 590 600 610 620 630
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALREKLQEAQEEL
.: :.. :..:::. .: .....: :. ::: ..: : : :.:: :::: ::... .:
NP_002 KGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRAKLMKVIKEK
640 650 660 670 680 690
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 AGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQAIEFLKEQI
. . :..:. .:: .:.... .. ..::..:.::: :... :...:. . :.
NP_002 ENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTKVIDNFTSQL
700 710 720 730 740 750
730 740 750 760
pF1KA0 SLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAENRLQAVE----ALCS----------
. .:.:.:: . :..: ..::.:...::..: .::.... .: : :
NP_002 KATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSKASSITRELQ
760 770 780 790 800 810
770 780 790 800
pF1KA0 ----------------SQHTHMIESN---------DISEETIRTKETVEGLQDKLNKRDK
:: . .:.. . :::.. ...... .::.....
NP_002 GRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQETVNKLHQKEE
820 830 840 850 860 870
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 EVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKRRLEAELETVSRKTHDASGQLVL
. . :.:. : :: ... .:.: . ... . :.: :..:: .. . . . : :.::.
NP_002 QFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTK
880 890 900 910 920 930
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 ISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVHKAEWRIKE--QKLKDDIRGLRE
...:: :::...::.. : .::... .... . ::: .: .: ... . :..
NP_002 MNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQEAAKKHEEEKKELER
940 950 960 970 980 990
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 KLTGLDKEKSLSDQRRYSLIDPSSAPELLRLQHQLMSTEDALRDALDQAQQVEKLMEAMR
::. :.:. :
NP_002 KLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTEDKLKGAREENS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1011 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 00:37:25 2016 done: Fri Nov 4 00:37:27 2016
Total Scan time: 14.590 Total Display time: 0.380
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]