FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0302, 2390 aa
1>>>pF1KA0302 2390 - 2390 aa - 2390 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3820+/-0.00137; mu= 2.9971+/- 0.082
mean_var=275.5896+/-55.966, 0's: 0 Z-trim(109.4): 124 B-trim: 43 in 1/50
Lambda= 0.077258
statistics sampled from 10751 (10863) to 10751 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 8.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8150.1 SPTBN2 gene_id:6712|Hs108|chr11 (2390) 15689 1764.2 0
CCDS33198.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2 (2364) 9418 1065.2 0
CCDS33199.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2 (2155) 9162 1036.7 0
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CCDS32100.1 SPTB gene_id:6710|Hs108|chr14 (2137) 7724 876.4 0
CCDS12559.1 SPTBN4 gene_id:57731|Hs108|chr19 (2564) 2952 344.6 3.7e-93
CCDS42569.1 SPTBN4 gene_id:57731|Hs108|chr19 ( 678) 1779 213.5 2.9e-54
CCDS6905.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2472) 1729 208.2 3.9e-52
CCDS48036.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2477) 1729 208.2 3.9e-52
CCDS75914.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2452) 1664 201.0 5.9e-50
CCDS61599.1 SPTBN5 gene_id:51332|Hs108|chr15 (3674) 1663 201.0 8.9e-50
CCDS12518.1 ACTN4 gene_id:81|Hs108|chr19 ( 911) 1435 175.2 1.3e-42
CCDS1613.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1 ( 894) 1411 172.5 8.1e-42
CCDS45129.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 887) 1405 171.8 1.3e-41
CCDS9792.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 892) 1405 171.8 1.3e-41
CCDS60455.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1 ( 894) 1405 171.8 1.3e-41
CCDS45130.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 914) 1405 171.9 1.3e-41
CCDS76439.1 ACTN3 gene_id:89|Hs108|chr11 ( 944) 1374 168.4 1.5e-40
CCDS43769.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4574) 1230 152.8 3.6e-35
CCDS43771.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4525) 1228 152.6 4.1e-35
CCDS47936.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4515) 1223 152.0 6.1e-35
CCDS43770.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4533) 1219 151.6 8.3e-35
CCDS43773.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4547) 1216 151.2 1e-34
CCDS43775.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4547) 1216 151.2 1e-34
CCDS43774.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4551) 1216 151.2 1e-34
CCDS43772.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4684) 1216 151.3 1.1e-34
CCDS75474.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (5537) 876 113.4 3.1e-23
CCDS435.1 MACF1 gene_id:23499|Hs108|chr1 (5430) 853 110.8 1.8e-22
CCDS55395.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (3681) 767 101.1 1e-19
CCDS34547.1 UTRN gene_id:7402|Hs108|chr6 (3433) 762 100.6 1.4e-19
CCDS14233.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (3685) 758 100.1 2.1e-19
CCDS73053.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1 ( 686) 636 86.1 6.6e-16
CCDS41423.1 SPTA1 gene_id:6708|Hs108|chr1 (2419) 519 73.4 1.5e-11
>>CCDS8150.1 SPTBN2 gene_id:6712|Hs108|chr11 (2390 aa)
initn: 15689 init1: 15689 opt: 15689 Z-score: 9458.8 bits: 1764.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 15689; 100.0% identity (100.0% similar) in 2390 aa overlap (1-2390:1-2390)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSTLSPTDFDSLEIQGQYSDINNRWDLPDSDWDNDSSSARLFERSRIKALADEREAVQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MSSTLSPTDFDSLEIQGQYSDINNRWDLPDSDWDNDSSSARLFERSRIKALADEREAVQK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KTFTKWVNSHLARVTCRVGDLYSDLRDGRNLLRLLEVLSGEILPKPTKGRMRIHCLENVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KTFTKWVNSHLARVTCRVGDLYSDLRDGRNLLRLLEVLSGEILPKPTKGRMRIHCLENVD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KALQFLKEQKVHLENMGSHDIVDGNHRLTLGLVWTIILRFQIQDISVETEDNKEKKSAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KALQFLKEQKVHLENMGSHDIVDGNHRLTLGLVWTIILRFQIQDISVETEDNKEKKSAKD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 ALLLWCQMKTAGYPNVNVHNFTTSWRDGLAFNAIVHKHRPDLLDFESLKKCNAHYNLQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ALLLWCQMKTAGYPNVNVHNFTTSWRDGLAFNAIVHKHRPDLLDFESLKKCNAHYNLQNA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 FNLAEKELGLTKLLDPEDVNVDQPDEKSIITYVATYYHYFSKMKALAVEGKRIGKVLDHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FNLAEKELGLTKLLDPEDVNVDQPDEKSIITYVATYYHYFSKMKALAVEGKRIGKVLDHA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 MEAERLVEKYESLASELLQWIEQTIVTLNDRQLANSLSGVQNQLQSFNSYRTVEKPPKFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MEAERLVEKYESLASELLQWIEQTIVTLNDRQLANSLSGVQNQLQSFNSYRTVEKPPKFT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EKGNLEVLLFTIQSKLRANNQKVYTPREGRLISDINKAWERLEKAEHERELALRTELIRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EKGNLEVLLFTIQSKLRANNQKVYTPREGRLISDINKAWERLEKAEHERELALRTELIRQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 EKLEQLAARFDRKAAMRETWLSENQRLVSQDNFGLELAAVEAAVRKHEAIETDIVAYSGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EKLEQLAARFDRKAAMRETWLSENQRLVSQDNFGLELAAVEAAVRKHEAIETDIVAYSGR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VQAVDAVAAELAAERYHDIKRIAARQHNVARLWDFLRQMVAARRERLLLNLELQKVFQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VQAVDAVAAELAAERYHDIKRIAARQHNVARLWDFLRQMVAARRERLLLNLELQKVFQDL
490 500 510 520 530 540
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pF1KA0 LYLMDWMEEMKGRLQSQDLGRHLAGVEDLLQLHELVEADIAVQAERVRAVSASALRFCNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LYLMDWMEEMKGRLQSQDLGRHLAGVEDLLQLHELVEADIAVQAERVRAVSASALRFCNP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 GKEYRPCDPQLVSERVAKLEQSYEALCELAAARRARLEESRRLWRFLWEVGEAEAWVREQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GKEYRPCDPQLVSERVAKLEQSYEALCELAAARRARLEESRRLWRFLWEVGEAEAWVREQ
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pF1KA0 QHLLASADTGRDLTGALRLLNKHTALRGEMSGRLGPLKLTLEQGQQLVAEGHPGASQASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QHLLASADTGRDLTGALRLLNKHTALRGEMSGRLGPLKLTLEQGQQLVAEGHPGASQASA
670 680 690 700 710 720
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pF1KA0 RAAELQAQWERLEALAEERAQRLAQAASLYQFQADANDMEAWLVDALRLVSSPELGHDEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RAAELQAQWERLEALAEERAQRLAQAASLYQFQADANDMEAWLVDALRLVSSPELGHDEF
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pF1KA0 STQALARQHRALEEEIRSHRPTLDALREQAAALPPTLSRTPEVQGRVPTLERHYEELQAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS81 STQALARQHRALEEEIRSHRPTLDALREQAAALPPTLSRTPEVQSRVPTLERHYEELQAR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 AGERARALEAALALYTMLSEAGACGLWVEEKEQWLNGLALPERLEDLEVVQQRFETLEPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AGERARALEAALALYTMLSEAGACGLWVEEKEQWLNGLALPERLEDLEVVQQRFETLEPE
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pF1KA0 MNTLAAQITAVNDIAEQLLKANPPGKDRIVNTQEQLNHRWQQFRRLADGKKAALTSALSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MNTLAAQITAVNDIAEQLLKANPPGKDRIVNTQEQLNHRWQQFRRLADGKKAALTSALSI
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pF1KA0 QNYHLECTETQAWMREKTKVIESTQGLGNDLAGVLALQRKLAGTERDLEAIAARVGELTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QNYHLECTETQAWMREKTKVIESTQGLGNDLAGVLALQRKLAGTERDLEAIAARVGELTR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 EANALAAGHPAQAVAINARLREVQTGWEDLRATMRRREESLGEARRLQDFLRSLDDFQAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EANALAAGHPAQAVAINARLREVQTGWEDLRATMRRREESLGEARRLQDFLRSLDDFQAW
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 LGRTQTAVASEEGPATLPEAEALLAQHAALRGEVERAQSEYSRLRALGEEVTRDQADPQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LGRTQTAVASEEGPATLPEAEALLAQHAALRGEVERAQSEYSRLRALGEEVTRDQADPQC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 LFLRQRLEALGTGWEELGRMWESRQGRLAQAHGFQGFLRDARQAEGVLSSQEYVLSHTEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LFLRQRLEALGTGWEELGRMWESRQGRLAQAHGFQGFLRDARQAEGVLSSQEYVLSHTEM
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 PGTLQAADAAIKKLEDFMSTMDANGERIHGLLEAGRQLVSEGNIHADKIREKADSIERRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PGTLQAADAAIKKLEDFMSTMDANGERIHGLLEAGRQLVSEGNIHADKIREKADSIERRH
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1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 KKNQDAAQQFLGRLRDNREQQHFLQDCHELKLWIDEKMLTAQDVSYDEARNLHTKWQKHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KKNQDAAQQFLGRLRDNREQQHFLQDCHELKLWIDEKMLTAQDVSYDEARNLHTKWQKHQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 AFMAELAANKDWLDKVDKEGRELTLEKPELKALVSEKLRDLHRRWDELETTTQAKARSLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AFMAELAANKDWLDKVDKEGRELTLEKPELKALVSEKLRDLHRRWDELETTTQAKARSLF
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pF1KA0 DANRAELFAQSCCALESWLESLQAQLHSDDYGKDLTSVNILLKKQQMLEWEMAVREKEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DANRAELFAQSCCALESWLESLQAQLHSDDYGKDLTSVNILLKKQQMLEWEMAVREKEVE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KA0 AIQAQAKALAQEDQGAGEVERTSRAVEEKFRALCQPMRERCRRLQASREQHQFHRDVEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AIQAQAKALAQEDQGAGEVERTSRAVEEKFRALCQPMRERCRRLQASREQHQFHRDVEDE
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pF1KA0 ILWVTERLPMASSMEHGKDLPSVQLLMKKNQTLQKEIQGHEPRIADLRERQRALGAAAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ILWVTERLPMASSMEHGKDLPSVQLLMKKNQTLQKEIQGHEPRIADLRERQRALGAAAAG
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pF1KA0 PELAELQEMWKRLGHELELRGKRLEDALRAQQFYRDAAEAEAWMGEQELHMMGQEKAKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PELAELQEMWKRLGHELELRGKRLEDALRAQQFYRDAAEAEAWMGEQELHMMGQEKAKDE
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pF1KA0 LSAQAEVKKHQVLEQALADYAQTIHQLAASSQDMIDHEHPESTRISIRQAQVDKLYAGLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LSAQAEVKKHQVLEQALADYAQTIHQLAASSQDMIDHEHPESTRISIRQAQVDKLYAGLK
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pF1KA0 ELAGERRERLQEHLRLCQLRRELDDLEQWIQEREVVAASHELGQDYEHVTMLRDKFREFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELAGERRERLQEHLRLCQLRRELDDLEQWIQEREVVAASHELGQDYEHVTMLRDKFREFS
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pF1KA0 RDTSTIGQERVDSANALANGLIAGGHAARATVAEWKDSLNEAWADLLELLDTRGQVLAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RDTSTIGQERVDSANALANGLIAGGHAARATVAEWKDSLNEAWADLLELLDTRGQVLAAA
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pF1KA0 YELQRFLHGARQALARVQHKQQQLPDGTGRDLNAAEALQRRHCAYEHDIQALSPQVQQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YELQRFLHGARQALARVQHKQQQLPDGTGRDLNAAEALQRRHCAYEHDIQALSPQVQQVQ
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pF1KA0 DDGHRLQKAYAGDKAEEIGRHMQAVAEAWAQLQGSSAARRQLLLDTTDKFRFFKAVRELM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DDGHRLQKAYAGDKAEEIGRHMQAVAEAWAQLQGSSAARRQLLLDTTDKFRFFKAVRELM
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 LWMDEVNLQMDAQERPRDVSSADLVIKNQQGIKAEIEARADRFSSCIDMGKELLARSHYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LWMDEVNLQMDAQERPRDVSSADLVIKNQQGIKAEIEARADRFSSCIDMGKELLARSHYA
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 AEEISEKLSQLQARRQETAEKWQEKMDWLQLVLEVLVFGRDAGMAEAWLCSQEPLVRSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AEEISEKLSQLQARRQETAEKWQEKMDWLQLVLEVLVFGRDAGMAEAWLCSQEPLVRSAE
1990 2000 2010 2020 2030 2040
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pF1KA0 LGCTVDEVESLIKRHEAFQKSAVAWEERFCALEKLTALEEREKERKRKREEEERRKQPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LGCTVDEVESLIKRHEAFQKSAVAWEERFCALEKLTALEEREKERKRKREEEERRKQPPA
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA0 PEPTASVPPGDLVGGQTASDTTWDGTQPRPPPSTQAPSVNGVCTDGEPSQPLLGQQRLEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PEPTASVPPGDLVGGQTASDTTWDGTQPRPPPSTQAPSVNGVCTDGEPSQPLLGQQRLEH
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA0 SSFPEGPGPGSGDEANGPRGERQTRTRGPAPSAMPQSRSTESAHAATLPPRGPEPSAQEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSFPEGPGPGSGDEANGPRGERQTRTRGPAPSAMPQSRSTESAHAATLPPRGPEPSAQEQ
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA0 MEGMLCRKQEMEAFGKKAANRSWQNVYCVLRRGSLGFYKDAKAASAGVPYHGEVPVSLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MEGMLCRKQEMEAFGKKAANRSWQNVYCVLRRGSLGFYKDAKAASAGVPYHGEVPVSLAR
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KA0 AQGSVAFDYRKRKHVFKLGLQDGKEYLFQAKDEAEMSSWLRVVNAAIATASSASGEPEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AQGSVAFDYRKRKHVFKLGLQDGKEYLFQAKDEAEMSSWLRVVNAAIATASSASGEPEEP
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390
pF1KA0 VVPSTTRGMTRAMTMPPVSPVGAEGPVVLRSKDGREREREKRFSFFKKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VVPSTTRGMTRAMTMPPVSPVGAEGPVVLRSKDGREREREKRFSFFKKNK
2350 2360 2370 2380 2390
>>CCDS33198.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2 (2364 aa)
initn: 9694 init1: 7012 opt: 9418 Z-score: 5681.4 bits: 1065.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9959; 62.2% identity (84.6% similar) in 2402 aa overlap (1-2390:1-2364)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSTLSPTDFDSLEIQGQYSDINNRWDLPDSDWDNDSSSARLFERSRIKALADEREAVQK
:..:.. ::.:..::: ::::.:::::. .::::..:::::::::::::::::::::::
CCDS33 MTTTVA-TDYDNIEIQQQYSDVNNRWDV--DDWDNENSSARLFERSRIKALADEREAVQK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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CCDS33 KALQFLKEQRVHLENMGSHDIVDGNHRLTLGLIWTIILRFQIQDISVETEDNKEKKSAKD
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:::::::::::::::::.::::::::::.::::..:::::::.::..::: :::::::::
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.:.:...::::::::.::.::::::. ::.:..:::: :::.:::.::.:::::::::::
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:::: ::: :: :: :::::::.::. :: :::..: ... :::.:: .:: :::.::..
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: .. :: :: :. : .:: .:. :.::::::.:..::..: :..::: ..::::.
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:::.:...:. . ::: ..:::::.:.:::.::: ...:.:.::. .:..:.:.
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::. : . :: :: :: .:: :.. ::....:.. :: ::::: .::.:::.:::::.:
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::.:::::: .: ::.::.:.:::::: :.::.::::::::. ::..:......::.
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CCDS12 IHSLENVDKALQFLKEQRVHLENVGSHDIVDGNHRLTLGLVWTIILRFQIQVIKIETEDN
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CCDS12 ANYNLQRAFRTAEQHLGLARLLDPEDVNMEAPDEKSIITYVVSFYHYFSKMKALAVEGKR
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.:: :: . . :: :: ::... ..:::: :.. :::::::: :...:: ...::.:
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..::::::...... .::.:.:.:::. ....: ..:. :: . :.::. .:..: .
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. .:: :: :.. : :. .: : . : .. :. . ::: : :: .:
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CCDS12 ERQESVD------QSEEAARRRRPERQESAEHEAAHSLTLGRYEQMERRRERRERRLERQ
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CCDS12 ESSEQEMPIRGDLVKGKATLADIVEQLQEKEAGPGLPAGPSLPQPRELPPGRLPNGLELP
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: : :.. ::.. ::: : .: .: . :.:.:..:.:.
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::: . : .. ...:.: : :. :.:: ...::::.: ..:.:. ::. .:... .
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..:: ... ..::.. .. . .::..: . :. : :. : ::.. :.:: :
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.. . ....: .::..:. ... .: ..::.::: :.. ..:..:::..:::.
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