FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0308, 2012 aa 1>>>pF1KA0308 2012 - 2012 aa - 2012 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5957+/-0.00122; mu= 0.5719+/- 0.074 mean_var=272.6237+/-57.071, 0's: 0 Z-trim(109.6): 98 B-trim: 179 in 1/53 Lambda= 0.077677 statistics sampled from 10880 (10974) to 10880 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16 Scan time: 5.980 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 13244 1499.5 0 CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 9601 1091.3 0 CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 4742 546.8 5e-154 CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 4722 544.5 1.9e-153 CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 4722 544.5 2.1e-153 CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 4418 510.4 3.9e-143 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CCDS47 KDEIDEFANSPSEDKEESMEIHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAYQRSY 1870 1880 1890 1900 1910 1920 920 930 940 950 960 pF1KA0 KNRQIQQIQPTFSVPTSVMQPIYEEATLNPKMAAKI-ERQQRWTRREEADFYRVVSTFGV : .:..: . ... .: : .:. . : : :..:.:::::::::::::::::: CCDS47 KRQQMRQ-EALMKTDRRRRRPREEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVSTFGV 1930 1940 1950 1960 1970 1980 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 VFDPDRGQFDWTKFRAMARLHKKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEELVDPNI--FI .::: . ::::..:::.::: ::.:.:::::. :..:::::::.: : . :.. .: CCDS47 IFDPVKQQFDWNQFRAFARLDKKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLSSII 1990 2000 2010 2020 2030 2040 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA0 QPITEERASRTLYRIELLRKVREQALRHPQLFERLKLCHPNPDLPVWWECGPHDRDLLIG .:::::::::::::::::::.:::.:.:::: ::::::.:. ::: ::::: ::::::.: CCDS47 EPITEERASRTLYRIELLRKIREQVLHHPQLGERLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRDLLVG 2050 2060 2070 2080 2090 2100 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 AAKHGVSRTDYHILRDPELSFMAAQRNYSQSKMAHSRTSTPLLQQYQVALSASPLTSLPR :::::::::::::: ::::::. :..:..:.. : . .: .:: CCDS47 AAKHGVSRTDYHILNDPELSFLDAHKNFAQNRGAGNTSSL------------NPL----- 2110 2120 2130 2140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 LLDAKGIILEEMKVKSENLKEEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVSPKNGVLPQATGDQK : :.. ..: ....: :.: ..: CCDS47 ---AVGFVQTPPVISSAHIQDE--------------RVLEQAE----------------- 2150 2160 2170 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA0 SGGKCETDRRMVAARTEPLTPNPASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSSSSSSS :: : :: :::.:. . .:.: ..:.....:. .. .:: . CCDS47 --GKVE----------EP--ENPAAKE---KCEGKEEEEETDGSGKESKQECEAEASSVK 2180 2190 2200 2210 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA0 SSCSHSRSGSSSSSSSSCSSASSSSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKRAESTTHM . . . :....:.: : ..: . . :..:..:: .: .: .... CCDS47 NELKGVEVGADTGSKSI----------SEKGSEEDEEEKLEDDDKSEESSQPEAGAVSRG 2220 2230 2240 2250 2260 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA0 KAYDEESVASLSTTQDETQDSFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSIC : .:::: ::.::..:::.:.: :..: : : .:. .: :.::::::::::::.:: CCDS47 KNFDEESNASMSTARDETRDGFYMEDGDPSVAQLLHE-RTFAFSFWPKDRVMINRLDNIC 2270 2280 2290 2300 2310 2320 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA0 QTVLKGKWPSARRS-YDANTVASFYTTKLLDSPGAATEYSEPSVPTPPGAGVKEEHDQST ..::::::: ::. .: . . :: .::: ..: :. . . .:. : CCDS47 EAVLKGKWPVNRRQMFDFQGLIPGYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSP 2330 2340 2350 2360 2370 2380 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KA0 QMSK-------VKKHVREKEFTVKIKDEGGLKLTFQKQGLAQKRPFD--GEDGALGQQQY :.:: : .. :... ..:. : . : . .:: : . .:.: :. CCDS47 QLSKEDALNLSVPRQRRRRRRKIEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENG----QEK 2390 2400 2410 2420 2430 2440 1500 1510 1520 1530 pF1KA0 LTRLRELQSASETSLVNF---------PK-SIPVS------------GTSIQPTLGA-NG .. : . . . .: :: :. : ::: : : :: :: CCDS47 VVDLSKASREATSSTSNFSSLSSKFILPNVSTPVSDAFKTQMELLQAGLSRTPTRHLLNG 2450 2460 2470 2480 2490 2500 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KA0 VILDNQPIVKKRRGRRKNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQG ..:..: .:.::::::::::.:..:..... .::. ..... ... . .. CCDS47 SLVDGEPPMKRRRGRRKNVEGLDLLFMSHKR----TSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRN 2510 2520 2530 2540 2550 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KA0 IP-----DTESPVPVINLKDGTRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQ--L :: : .. .:::::.:::::.:.:::: ::: .::: :: :. :. ...:. : CCDS47 IPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTRLVGEDAPKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVL 2560 2570 2580 2590 2600 2610 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KA0 HEG--RPKQKRHRCRNPNKLDVNSLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKEN . .:::::::::::::::.:.::::::: ..:.::..:.:::.:::.::: :.:.:: CCDS47 FSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDINTLTGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEEN 2620 2630 2640 2650 2660 2670 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KA0 SEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESMYERILTGPVVREE-VSRRGRRPKSGIAKATAAAAAAS :..:::.: :.::::::.::::..:.::::::: : .::::::::: ::.:.:::::.. CCDS47 PEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMFDRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVA 2680 2690 2700 2710 2720 2730 1770 1780 1790 1800 1810 1820 pF1KA0 ATSVSGNPLLANGLLPGVDLTTLQALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPS----GGEAK .:: . ::::.:.:. :.:::.:: :::::::::. :::::.: :: . ::.:: CCDS47 STS-GINPLLVNSLFAGMDLTSLQ----NLQNLQSLQL-AGLMGFPPGLATAATAGGDAK 2740 2750 2760 2770 2780 2790 1830 1840 1850 1860 1870 pF1KA0 NMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMGGLLTKPTESGTEDKKGSDSK-ESEGKTERTESQSSEN : ::..:..: :::::::..:.::::..: ..: . ..:. : : .: . : ...:: CCDS47 NPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLNNPLSAATGNTTTASSQGEPEDSTSKGEEKGNEN 2800 2810 2820 2830 2840 2850 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KA0 GGEN--------SVSSSPSTSSTAALNTAAA---ANPLALNPLLLSNI----LYPGMLLT :: .::.. :...... :: : .::::.::.:::.. .::.:.: CCDS47 EDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAATAPAGLPSNPLAFNPFLLSTMAPGLFYPSMFLP 2860 2870 2880 2890 2900 2910 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KA0 PGLN-LHIPTLS-----QSNTFDVQNKNSDLGSSKSVEVKE--EDSRIKDQEDKGGTEPS :::. : .: . :. . . ..: .: . . . : : : ... :: : : CCDS47 PGLGGLTLPGFPALAGLQNAVGSSEEKAADKAEGGPFKDGETLEGSDAEESLDK--TAES 2920 2930 2940 2950 2960 1980 1990 2000 2010 pF1KA0 PLNENSTDEGSEKADASSGSDSTSSSSEDSDSSNED : :. .: :. :. .:.: .. .: CCDS47 SLLEDEIAQG-EELDSLDGGDEIENNENDE 2970 2980 2990 >>CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302 aa) initn: 5065 init1: 3889 opt: 4722 Z-score: 2868.3 bits: 544.5 E(32554): 1.9e-153 Smith-Waterman score: 6213; 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CCDS45 REQMK-IE---AAERGDRRRRRCEAAFKLKEIARREKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEY 1490 1500 1510 1520 1530 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 DPDRGQFDWTKFRAMARLHKKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLP--SKEELVDPNIFIQP ::: :: : .::..::: ::::.:: ::...:..:::.::::: . .: :::.::.: CCDS45 DPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEP 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA0 ITEERASRTLYRIELLRKVREQALRHPQLFERLKLCHP-NPDLPVWWECGPHDRDLLIGA :::::::::::::::::..:::.: :: : .:: ::.: .:.:: ::: :: .:: :: CCDS45 ITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGA 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 AKHGVSRTDYHILRDPELSFMAAQRNYSQSKMAH------SRTSTPLLQQYQVALSASPL :.::::.:: .:..::..::.::. :: :...: :: :::::.: .. .:::: CCDS45 ARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPL 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 TSLPRLLDAKGIILEEMKVKSENLKEEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVSPKNGVLPQA : :: ... :. . . . :.:. :: . : .. :: CCDS45 PLRP---DAP-------------VEKSPEETATQ-VPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQ- 1720 1730 1740 1750 1760 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA0 TGDQKSGGKCETDRRMVAARTEPLTPNPASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSS . . :. . : ::. . . : :. :. .::::. . :. : CCDS45 ----------DYEMRVSPSDTTPLV---SRSVPPVKL---EDEDDSDSELDLSKLSP--- 1770 1780 1790 1800 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA0 SSSSSSSCSHSRSGSSSSSSSSCSSASSSSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKRAE :::.::::::::::..::. ::.: . . CCDS45 ------------------------------SSSSSSSSSSSSSSTDESE-DEKEEKLTDQ 1810 1820 1830 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA0 STTHMKAYDEESVASLSTTQD--ETQDSFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMI : . : :::::. ::. .:: ..:. :: ::: .:: :: ::::::.: CCDS45 SRS--KLYDEESLLSLTMSQDGFPNEDGEQM---TPE-LLLLQ--ERQRASEWPKDRVLI 1840 1850 1860 1870 1880 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KA0 NRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDANTVASFYT-TKLLDSPGAAT-EYSEPSVPTP---PG ::.: .::.::.:::::.::: . : . . ..:::::. . ::.. :::: . CCDS45 NRIDLVCQAVLSGKWPSSRRSQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSSA 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KA0 AGVKEEHDQST-----QMSKVKKHVREKEFTVKIKDEGGLKLTFQKQGLAQKRPFDGEDG :.. ::. ... :..:... . ::::::.:::: ::::::::. : CCDS45 ASMAEEEASAVSTAAAQFTKLRRGMDEKEFTVQIKDEEGLKLTFQKHKLM---------- 1950 1960 1970 1980 1990 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KA0 ALGQQQYLTRLRELQSASETSLVNFPKSIPVSGTSIQPTLGANGVILDNQPIVKKRRGRR ::::. :..:. .:..: : CCDS45 -----------------------------------------ANGVMGDGHPLFHKKKGNR 2000 2010 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KA0 KNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQGIPDTESPVPVINLKDG :.. ... . . :::... : :. .:::: :: CCDS45 KKLVELEVECM---EEPNHLDV------------------------DLETRIPVINKVDG 2020 2030 2040 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KA0 TRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPR-MQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVNS : :.:.:::.: .:: ::. :: .. : :: . : : ::: .::.. :: ..: CCDS45 TLLVGEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVD-----PRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAELNC 2050 2060 2070 2080 2090 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KA0 LTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESMY : : : :: : ::..: : :... CCDS45 L-GMEPVQTANSRNGKK-----------------------------------GHHTETVF 2100 2110 2120 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KA0 ERILTGPVVREEVSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSGNPLLANGLLPGVDLTTLQA .:.: ::.. : ..:.:: . ..: : ..:. :.: . . .. . : .... CCDS45 NRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTFQHS---SSGLQSVSS 2130 2140 2150 2160 2170 2180 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KA0 LQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPSGGEAKNMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMGGLLTKP : .. . :: .:: : :: CCDS45 LGHSSATSASLPFMPFVMG---GAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPHPHHHHHHHPGLRAPGY 2190 2200 2210 2220 2230 >>CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581 aa) initn: 5065 init1: 3889 opt: 4722 Z-score: 2867.6 bits: 544.5 E(32554): 2.1e-153 Smith-Waterman score: 6213; 56.4% identity (73.8% similar) in 1856 aa overlap (1-1815:838-2482) 10 20 30 pF1KA0 MGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFLIIAP ::::::::::.:: :. .::.::::.::: CCDS53 RNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLGKTIQSIAFLQEVYNVGIHGPFLVIAP 810 820 830 840 850 860 40 50 60 70 80 90 pF1KA0 LSTIANWEREFRTWTDINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTF ::::.:::::: :::..:..:::::: ::::::::::: .::.::.: :::.:.:.:::: CCDS53 LSTITNWEREFNTWTEMNTIVYHGSLASRQMIQQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTF 870 880 890 900 910 920 100 110 120 130 140 150 pF1KA0 EMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEEL ::::. : :: ::::::::::::::::.:::::..:: :.::::::::::::::::::: CCDS53 EMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCKLLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEEL 930 940 950 960 970 980 160 170 180 190 200 210 pF1KA0 FSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEET ::::::::: .::::: :...:::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:: CCDS53 FSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQET 990 1000 1010 1020 1030 1040 220 230 240 250 260 270 pF1KA0 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEK ::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::.::::::::::::::::.::::: CCDS53 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEK 1050 1060 1070 1080 1090 1100 280 290 300 310 320 330 pF1KA0 ILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED :: :::.. . :::::::..::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS53 ILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED 1110 1120 1130 1140 1150 1160 340 350 360 370 380 390 pF1KA0 YLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF :::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 YLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF 1170 1180 1190 1200 1210 1220 400 410 420 430 440 450 pF1KA0 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSG :::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::: CCDS53 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSG 1230 1240 1250 1260 1270 1280 460 470 480 490 500 510 pF1KA0 RESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTKTITIESEG :..:. ::::.::::::::::.:::.:::::.::::::::::::::::::: :::::::: CCDS53 RDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEG 1290 1300 1310 1320 1330 1340 520 530 540 550 560 570 pF1KA0 RGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRP .:::::::::::: ::::::::::::::::::::..:.. ....:.:::::::.::::: CCDS53 KGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRH 1350 1360 1370 1380 1390 1400 580 590 600 610 620 pF1KA0 FSATKDE-LAELSEAESEGDEKPKLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREILS ::. ::. :.:.:. ::: ::.:. :: :: ..::::.::::::.::::::::::.::: CCDS53 FSTLKDDDLVEFSDLESEDDERPRSRRH-DRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILS 1410 1420 1430 1440 1450 1460 630 640 650 660 670 680 pF1KA0 HGRFKRQLNEHDVEIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLS ::::::...:.::: ::::.:.:::.::::::.:::::::::.:.:.:.:.::::: ::: CCDS53 HGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLS 1470 1480 1490 1500 1510 1520 690 700 710 720 730 740 pF1KA0 APVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLY ::::::::::::.: :.:::.::.:.:::::. :.:::.::::.::.:::::::::::: CCDS53 IPVPRGRKGKKVKSQ-STFDIHKADWIRKYNPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLY 1530 1540 1550 1560 1570 1580 750 760 770 780 790 800 pF1KA0 YLKQEVIGNECQKVFDGVDASDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEKY ::.:::::.. .::. :. ::.::.: : :. :::. ::: .::::::::::::::::: CCDS53 YLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKY 1590 1600 1610 1620 1630 1640 810 820 830 840 850 860 pF1KA0 NTIRADPALCFLERVGKPDEKAVAAEQRA----NDYMDG-----DVEDPEYKPAPAIFKD ::.::::::::::..:.::.::.:::.:. .: ..: : ::::::: . :: CCDS53 NTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKD 1650 1660 1670 1680 1690 1700 870 880 890 900 910 pF1KA0 DIEDDVSSPGDLVIADGDGQLMEGDK---------VYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNK .:: ..: :.. : . ....::. ..:: ::::.:::::.:::::. : CCDS53 --QDDEGDP--LMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYK 1710 1720 1730 1740 1750 1760 920 930 940 950 960 970 pF1KA0 NRQIQQIQPTFSVPTSVMQPIYEEATLNPKMAAKIERQQRWTRREEADFYRVVSTFGVVF .:.. :. .. . . ::... : :. :.::::::::..::::::::::: . CCDS53 REQMK-IE---AAERGDRRRRRCEAAFKLKEIARREKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEY 1770 1780 1790 1800 1810 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 DPDRGQFDWTKFRAMARLHKKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLP--SKEELVDPNIFIQP ::: :: : .::..::: ::::.:: ::...:..:::.::::: . .: :::.::.: CCDS53 DPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEP 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA0 ITEERASRTLYRIELLRKVREQALRHPQLFERLKLCHP-NPDLPVWWECGPHDRDLLIGA :::::::::::::::::..:::.: :: : .:: ::.: .:.:: ::: :: .:: :: CCDS53 ITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGA 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 AKHGVSRTDYHILRDPELSFMAAQRNYSQSKMAH------SRTSTPLLQQYQVALSASPL :.::::.:: .:..::..::.::. :: :...: :: :::::.: .. .:::: CCDS53 ARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPL 1940 1950 1960 1970 1980 1990 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 TSLPRLLDAKGIILEEMKVKSENLKEEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVSPKNGVLPQA : :: ... :. . . . :.:. :: . : .. :: CCDS53 PLRP---DAP-------------VEKSPEETATQ-VPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQ- 2000 2010 2020 2030 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA0 TGDQKSGGKCETDRRMVAARTEPLTPNPASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSS . . :. . : ::. . . : :. :. .::::. . :. : CCDS53 ----------DYEMRVSPSDTTPLV---SRSVPPVKL---EDEDDSDSELDLSKLSP--- 2040 2050 2060 2070 2080 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA0 SSSSSSSCSHSRSGSSSSSSSSCSSASSSSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKRAE :::.::::::::::..::. ::.: . . CCDS53 ------------------------------SSSSSSSSSSSSSSTDESE-DEKEEKLTDQ 2090 2100 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA0 STTHMKAYDEESVASLSTTQD--ETQDSFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMI : . : :::::. ::. .:: ..:. :: ::: .:: :: ::::::.: CCDS53 SRS--KLYDEESLLSLTMSQDGFPNEDGEQM---TPE-LLLLQ--ERQRASEWPKDRVLI 2110 2120 2130 2140 2150 2160 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KA0 NRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDANTVASFYT-TKLLDSPGAAT-EYSEPSVPTP---PG ::.: .::.::.:::::.::: . : . . ..:::::. . ::.. :::: . CCDS53 NRIDLVCQAVLSGKWPSSRRSQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSSA 2170 2180 2190 2200 2210 2220 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KA0 AGVKEEHDQST-----QMSKVKKHVREKEFTVKIKDEGGLKLTFQKQGLAQKRPFDGEDG :.. ::. ... :..:... . ::::::.:::: ::::::::. : CCDS53 ASMAEEEASAVSTAAAQFTKLRRGMDEKEFTVQIKDEEGLKLTFQKHKLM---------- 2230 2240 2250 2260 2270 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KA0 ALGQQQYLTRLRELQSASETSLVNFPKSIPVSGTSIQPTLGANGVILDNQPIVKKRRGRR ::::. :..:. .:..: : CCDS53 -----------------------------------------ANGVMGDGHPLFHKKKGNR 2280 2290 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KA0 KNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQGIPDTESPVPVINLKDG :.. ... . . :::... : :. .:::: :: CCDS53 KKLVELEVECM---EEPNHLDV------------------------DLETRIPVINKVDG 2300 2310 2320 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KA0 TRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPR-MQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVNS : :.:.:::.: .:: ::. :: .. : :: . : : ::: .::.. :: ..: CCDS53 TLLVGEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVD-----PRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAELNC 2330 2340 2350 2360 2370 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KA0 LTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESMY : : : :: : ::..: : :... CCDS53 L-GMEPVQTANSRNGKK-----------------------------------GHHTETVF 2380 2390 2400 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KA0 ERILTGPVVREEVSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSGNPLLANGLLPGVDLTTLQA .:.: ::.. : ..:.:: . ..: : ..:. :.: . . .. . : .... CCDS53 NRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTFQHS---SSGLQSVSS 2410 2420 2430 2440 2450 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KA0 LQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPSGGEAKNMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMGGLLTKP : .. . :: .:: : :: CCDS53 LGHSSATSASLPFMPFVMG---GAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPHPHHHHHHHPGLRAPGY 2460 2470 2480 2490 2500 2510 >>CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715 aa) initn: 4741 init1: 2547 opt: 4418 Z-score: 2683.1 bits: 510.4 E(32554): 3.9e-143 Smith-Waterman score: 5673; 48.1% identity (67.1% similar) in 2123 aa overlap (1-1839:488-2531) 10 20 30 pF1KA0 MGLGKTIQSITFLYEILLTGIRGPFLIIAP ::::::::::::: ::.: ::.:::::::: CCDS13 SNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLSEIFLRGIHGPFLIIAP 460 470 480 490 500 510 40 50 60 70 80 90 pF1KA0 LSTIANWEREFRTWTDINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYRFQAIITTF ::::.::::::::::..:..::::: ::::::::::: .::.:: . :...:...:::: CCDS13 LSTITNWEREFRTWTEMNAIVYHGSQISRQMIQQYEMVYRDAQGNPLSGVFKFHVVITTF 520 530 540 550 560 570 100 110 120 130 140 150 pF1KA0 EMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTGTPLQNTVEEL ::::. : ::. :.: ::::::::::::.::::::::::: ::::::::::::::.:::: CCDS13 EMILADCPELKKIHWSCVIIDEAHRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEEL 580 590 600 610 620 630 160 170 180 190 200 210 pF1KA0 FSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKKLAPKEET ::::.:::: .::::..:..:::::::::::.:::.:::::::::::.::::.::::.:: CCDS13 FSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFGDLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQET 640 650 660 670 680 690 220 230 240 250 260 270 pF1KA0 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNHPYLIKGAEEK :::::::::::::::::::::::::.:::.: :.:::.::::::::::::::::.::::: CCDS13 IIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYLINGAEEK 700 710 720 730 740 750 280 290 300 310 320 330 pF1KA0 ILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQMVRCLDILED :: .:: :..: : ::.::::::.:::::::::::::. ::::::::::::::::::::: CCDS13 ILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILED 760 770 780 790 800 810 340 350 360 370 380 390 pF1KA0 YLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF :::..:: :::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 YLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIF 820 830 840 850 860 870 400 410 420 430 440 450 pF1KA0 DSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGLDKAVLQSMSG :::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::.:::::::::::::... 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CCDS13 KGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKH 1000 1010 1020 1030 1040 1050 580 590 600 610 620 pF1KA0 FSA-TKDELAELSEAESEGDEKP-KLRRPCDRSNGYGRTECFRVEKNLLVYGWGRWREIL ... .::: :.:: .:..::.: . :: :.. : :.::::::::::..:::::..:: CCDS13 YNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWGRWKDIL 1060 1070 1080 1090 1100 1110 630 640 650 660 670 680 pF1KA0 SHGRFKRQLNEHDVEIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGL .::::: .:::.:.:.::::::.::. ::.::::::.:::.:::::.:::.. :::: :: CCDS13 THGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQNHSGL 1120 1130 1140 1150 1160 1170 690 700 710 720 730 740 pF1KA0 SAPVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRML ::::::::::::.:.: ... :.:: ::: .:.:.:::::.:.:::::::::::: CCDS13 SAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLLRVRML 1180 1190 1200 1210 1220 1230 750 760 770 780 790 800 pF1KA0 YYLKQEVIGNECQKVFDGVDASDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEK :::: :..:. .:.:.: : ..:: .:. :. :.:..::: .:::::::::::::::. CCDS13 YYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIPVDWWDAEADKSLLIGVFKHGYER 1240 1250 1260 1270 1280 1290 810 820 830 840 850 860 pF1KA0 YNTIRADPALCFLERVGKPDEKAVAAEQRANDYMDGDVEDPEYKPAPAIFKDDIEDDV-- ::..::::::::::.:: ::::...::: .. :: . :: . .:. :: : CCDS13 YNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVT---DGTSDIPERGNTDK--EDNAEDKVDG 1300 1310 1320 1330 1340 1350 870 880 890 900 910 pF1KA0 --------SSPGDLVIA---DGDGQLMEG---DKVYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNKN :. :: :.. : . ..: :: ::..::::.:::::.:.::: :.. CCDS13 LQKQTESSSDGGDGVFSEKKDDSRAAQDGSDPDKSPWPVSSALTARLRRLVTVYQRCNRK 1360 1370 1380 1390 1400 1410 920 930 940 950 960 pF1KA0 RQIQQIQPTFSVPTSVMQPIYEEA---TLNPKMAAKIERQQRWTRREEADFYRVVSTFGV . .: . : . . :: : . . : : :.::::::.:::::.::.::: CCDS13 ---ELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINK-EAQKRWTRREQADFYRTVSSFGV 1420 1430 1440 1450 1460 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 VFDPDRGQFDWTKFRAMARLHKKTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLPSKEELVDPN--IFI :.: .. ::::.:: ..:: ::.:.:::.:.:.:..::: :::::. .. :. :.. CCDS13 VYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNVCRLPTWKDGGPPDTTIYV 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA0 QPITEERASRTLYRIELLRKVREQALRHPQLFERLKLCHPNPDLPVWWECGPHDRDLLIG .:::::::.:::::::::::::::.:. ::: :::.::.:. :::::::: :::::::: CCDS13 EPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRPSLYLPVWWECGKHDRDLLIG 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 AAKHGVSRTDYHILRDPELSFMAAQRNYSQSKMAHSRTSTPLLQQYQV------ALSASP .::::..::: .:. ::.:::. : :::.: : . ... : ::. .:. : CCDS13 TAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGNLCCLYQTNSKLYESLTYSQ 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1150 1160 pF1KA0 LT-----------------------SLP---------RLLDAKGII---------LEEMK .. ::: .. :. .: :: : CCDS13 MSRTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQDVISINHDESLLPESLESMM 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 VKSENLKEEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVS---------PKNGVL--PQATGDQKSG .. :..::.: .: ...:.: . . .: :. . : :. ..: CCDS13 YGKKVLSQEPSSFQESPSTNTESRKDVITISISKDGNCQSGGPEAEIASGPTFMGSLEAG 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1210 1220 1230 1240 pF1KA0 GKCETDRR------MVAARTEPLTPNPASKKP----RVHKR---------GSESS----- : ... . : .. : . :...: ... . :.::. CCDS13 GVAQANIKNGKHLLMSISKEGELCCSEAGQRPENIGQLEAKCLASPSLNPGNESGFVDMC 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1250 1260 1270 pF1KA0 SDSDSDSERSSCS---------SRSSSSSSSSSCSHS----------------------- : : ::.:. : ..: :. : .:: CCDS13 SLSVCDSKRNLSSDQQLIDLLENKSLESKLILSQNHSDEEEEEEENEEENLAMAVGMGER 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1280 pF1KA0 -------------------------RSGS--------------SSSSSSSC--------- ..:: . .. .: CCDS13 PEVLHLTEPTTNISREKNQGFQDETKKGSLEVANQTPGLQRAFPAPAACQCHCKHMERWM 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1290 1300 pF1KA0 ----------------------SSASSSSSSSTSSSSSS--------------------- :.... . . .. : CCDS13 HGLENDEFEIEKPKAYIPDLFKSKTNTIAMEGEPTAIPSQPFKVKHELLKEPWKESAEGQ 1950 1960 1970 1980 1990 2000 1310 1320 1330 1340 pF1KA0 ----------SSSSSEESDSDEEEAQKRAESTTHMKAY-----DEESVASLSTTQDETQD : .::. : .... : ... : . : .::: .: : . : CCDS13 NVFPTYPLEGSELKSEDMDFENKDDYDR-DGNCHSQDYPGKYSEEESKSSTSGITGDIGD 2010 2020 2030 2040 2050 2060 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KA0 SFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARRSYDANTV .: . : : .:: . . : ::::::.:::::.::..::::::::... ..:. CCDS13 ELQEARA-PTIAQLLQEKTLYSFSEWPKDRVIINRLDNICHVVLKGKWPSSQQYEPSGTL 2070 2080 2090 2100 2110 2120 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KA0 ASFYTTKLLDSPGAATEYSEPSVPTPP---GAGVKEEHDQSTQMSKV-----KKHVREKE : : .: :. : ::: . ::.. . . . .. : .:: : : CCDS13 P---TPVLTSSAGSRTSLSEPEAAEHSFSNGAALAAQIHKESFLAPVFTKDEQKHRRPYE 2130 2140 2150 2160 2170 2180 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KA0 FTVKIKDEGGLKLTFQKQGLAQKRPFDGEDGALGQQQYLTRLRELQSASETS---LVNFP : :. .: . .:: : :. . . . .:. .:: : :: CCDS13 FEVE-RDA-------KARGLEQFSATHGHTPIILNGWHGESAMDLSCSSEGSPGATSPFP 2190 2200 2210 2220 2230 1520 1530 1540 1550 pF1KA0 --KSIPVSG--TSIQPTLG-------------------ANGVILDNQPIVKKRRGRRKNV : : : .:.: .:: .:: . .. ...::::::.: CCDS13 VSASTPKIGAISSLQGALGMDLSGILQAGLIHPVTGQIVNGSLRRDDAATRRRRGRRKHV 2240 2250 2260 2270 2280 2290 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KA0 EG-VDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQGI-PDTESPVPVINLKDGT :: .:..:.... .. :. . . : . .:: :.:.: : : .: :. .. CCDS13 EGGMDLIFLKEQT----LQAGILEVHEDPG-QATLSTTHPEGPGPATSAPEPATA---AS 2300 2310 2320 2330 2340 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KA0 RLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPRMQLHEGRPKQKRHRCRNPNKLDVNSLT : . :. :.: ::... : .. .: .. .:::.: ::..:.::::.::. CCDS13 SQAEKSIPS-KSLLDWLRQQADYSLEVPGFGANFS---DKPKQRRPRCKEPGKLDVSSLS 2350 2360 2370 2380 2390 2400 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KA0 GEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPEWGDVVKQSGFLPESMYER ::::: : .. : :. :::::. ... CCDS13 GEERVPAIPKE----------PGLR-------------------------GFLPENKFNH 2410 2420 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KA0 ILTGPVVREE-VSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSG-NPLLANGLLPGVDLTTLQA :. :..:. ::::::.: . :: . .: : :: .::. :::. :.::. :: CCDS13 TLAEPILRDTGPRRRGRRPRSELLKAPSIVA----DSPSGMGPLFMNGLIAGMDLVGLQ- 2430 2440 2450 2460 2470 2480 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KA0 LQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTG---LPSGGEAKNMAAMFPMLLSGMAGLPNLLGMGGLL :..:. .. .: ::.:.:.: .:.: :.:. .:.::.: :::..:.. CCDS13 ---NMRNMPGIPLT-GLVGFPAGFATMPTGEEVKSTLSMLPMMLPGMAAVPQMFGVGGLL 2490 2500 2510 2520 2530 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KA0 TKPTESGTEDKKGSDSKESEGKTERTESQSSENGGENSVSSSPSTSSTAALNTAAAANPL CCDS13 SPPMATTCTSTAPASLSSTTKSGTAVTEKTAEDKPSSHDVKTDTLAEDKPGPGPFSDQSE 2540 2550 2560 2570 2580 2590 >>CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905 aa) initn: 1353 init1: 630 opt: 1464 Z-score: 896.3 bits: 179.3 E(32554): 1.3e-43 Smith-Waterman score: 1493; 38.8% identity (64.5% similar) in 739 aa overlap (1-677:746-1467) 10 20 pF1KA0 MGLGKTIQSITFLYEILLTG-IRGPFLIIA ::::::.:. .::: . : .::::. : CCDS76 GGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSA 720 730 740 750 760 770 30 40 50 60 70 80 pF1KA0 PLSTIANWEREFRTWT-DINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYR------ ::::: ::::::. :. :. ::.: :. :: .:.. :. :.:. : . : : CCDS76 PLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEAS 780 790 800 810 820 830 90 100 110 120 130 140 pF1KA0 --FQAIITTFEMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTG :....:..:.: . :..:.: :.:.::::::::.. :... :. ..:.::.:::: CCDS76 VKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTG 840 850 860 870 880 890 150 160 170 180 190 200 pF1KA0 TPLQNTVEELFSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDV :::::..:::: ::.:: : :: . :..::.:. :.:..::. .: : :::::: :: CCDS76 TPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADV 900 910 920 930 940 950 210 220 230 240 250 260 pF1KA0 EKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNH :.. : : :..:::. .:::::. :: .:: :. .: ..: .:.:..:.:.::::: CCDS76 FKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQV-SLLNVVMDLKKCCNH 960 970 980 990 1000 1010 270 280 290 300 310 320 pF1KA0 PYLIKGAEEKILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQ :::. : . :. .: .:...:::.:..:.: ..: :::.:::::: CCDS76 PYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSA-------LIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQ 1020 1030 1040 1050 1060 330 340 350 360 370 380 pF1KA0 MVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGIN :.. ::.:::.: :. : :::::: . ::.:: :::::. : ...: ::: ::::::::: CCDS76 MTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGIN 1070 1080 1090 1100 1110 1120 390 400 410 420 430 440 pF1KA0 LTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGL :..::: ::.::::::.::.:: .: ::::::: : .::.::: : :... . :. :. : CCDS76 LATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMML 1130 1140 1150 1160 1170 1180 450 460 470 480 490 pF1KA0 DKAVLQSMSGRESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDID------ . :.. : :..:. .::.:..:.:. :. . .: .:. .: : CCDS76 THLVVR--PGLGSKTGS---MSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHY 1190 1200 1210 1220 1230 1240 500 510 520 530 pF1KA0 -----QILLRRTKTITIESEGRG-----STFAKASFVAS----GNRTDISLD-------- . :: :.. : ..: .: :.: :..:. :.. .. . CCDS76 DDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESV 1250 1260 1270 1280 1290 1300 540 550 560 570 580 pF1KA0 DPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRPFSATK----------DELAELS ::..:.: .. . . .:: . :::::. .... :. .. : CCDS76 DPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARN--LGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYS 1310 1320 1330 1340 1350 1360 590 600 610 620 630 pF1KA0 EAESEGDE-----KPKLRRPCDRSNGYGRTECF-----RVEKNLLVYGWG-RWREILSHG : :::: . ::: .. . . . :: :. : :.. : :. . .. CCDS76 VASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNA 1370 1380 1390 1400 1410 1420 640 650 660 670 680 pF1KA0 RFKRQLNEHDV---EIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGL .. . .:. . . : : . .... .. :. : : :: CCDS76 IMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKA--YVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPRE 1430 1440 1450 1460 1470 690 700 710 720 730 740 pF1KA0 SAPVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRML CCDS76 GLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPST 1480 1490 1500 1510 1520 1530 >>CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912 aa) initn: 1353 init1: 630 opt: 1464 Z-score: 896.3 bits: 179.3 E(32554): 1.3e-43 Smith-Waterman score: 1493; 38.8% identity (64.5% similar) in 739 aa overlap (1-677:753-1474) 10 20 pF1KA0 MGLGKTIQSITFLYEILLTG-IRGPFLIIA ::::::.:. .::: . : .::::. : CCDS85 GGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSA 730 740 750 760 770 780 30 40 50 60 70 80 pF1KA0 PLSTIANWEREFRTWT-DINVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYR------ ::::: ::::::. :. :. ::.: :. :: .:.. :. :.:. : . : : CCDS85 PLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEAS 790 800 810 820 830 840 90 100 110 120 130 140 pF1KA0 --FQAIITTFEMILGGCGELNAIEWRCVIIDEAHRLKNKNCKLLEGLKLMNLEHKVLLTG :....:..:.: . :..:.: :.:.::::::::.. :... :. ..:.::.:::: CCDS85 VKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLLTG 850 860 870 880 890 900 150 160 170 180 190 200 pF1KA0 TPLQNTVEELFSLLHFLEPLRFPSESTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDV :::::..:::: ::.:: : :: . :..::.:. :.:..::. .: : :::::: :: CCDS85 TPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHMLRRLKADV 910 920 930 940 950 960 210 220 230 240 250 260 pF1KA0 EKKLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGQTNVPNLVNTMMELRKCCNH :.. : : :..:::. .:::::. :: .:: :. .: ..: .:.:..:.:.::::: CCDS85 FKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQV-SLLNVVMDLKKCCNH 970 980 990 1000 1010 1020 270 280 290 300 310 320 pF1KA0 PYLIKGAEEKILGEFRDTYNPAASDFHLQAMIQSAGKLVLIDKLLPKMKAGGHKVLIFSQ :::. : . :. .: .:...:::.:..:.: ..: :::.:::::: CCDS85 PYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSA-------LIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQ 1030 1040 1050 1060 1070 330 340 350 360 370 380 pF1KA0 MVRCLDILEDYLIHKRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGIN :.. ::.:::.: :. : :::::: . ::.:: :::::. : ...: ::: ::::::::: CCDS85 MTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGIN 1080 1090 1100 1110 1120 1130 390 400 410 420 430 440 pF1KA0 LTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQNKAVKVYRLVTRNSYEREMFDRASLKLGL :..::: ::.::::::.::.:: .: ::::::: : .::.::: : :... . :. :. : CCDS85 LATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMML 1140 1150 1160 1170 1180 1190 450 460 470 480 490 pF1KA0 DKAVLQSMSGRESNVGGIQQLSKKEIEDLLRRGAYGAIMEEEDEGSKFCEEDID------ . :.. : :..:. .::.:..:.:. :. . .: .:. .: : CCDS85 THLVVR--PGLGSKTGS---MSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHY 1200 1210 1220 1230 1240 500 510 520 530 pF1KA0 -----QILLRRTKTITIESEGRG-----STFAKASFVAS----GNRTDISLD-------- . :: :.. : ..: .: :.: :..:. :.. .. . CCDS85 DDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESV 1250 1260 1270 1280 1290 1300 540 550 560 570 580 pF1KA0 DPNFWQKWAKKAEIDIEAISGRNSLVIDTPRIRKQTRPFSATK----------DELAELS ::..:.: .. . . .:: . :::::. .... :. .. : CCDS85 DPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARN--LGKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYS 1310 1320 1330 1340 1350 1360 590 600 610 620 630 pF1KA0 EAESEGDE-----KPKLRRPCDRSNGYGRTECF-----RVEKNLLVYGWG-RWREILSHG : :::: . ::: .. . . . :: :. : :.. : :. . .. CCDS85 VASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNA 1370 1380 1390 1400 1410 1420 640 650 660 670 680 pF1KA0 RFKRQLNEHDV---EIICRALLAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGL .. . .:. . . : : . .... .. :. : : :: CCDS85 IMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKA--YVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPRE 1430 1440 1450 1460 1470 1480 690 700 710 720 730 740 pF1KA0 SAPVPRGRKGKKVKTQTSSFDIQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRML CCDS85 GLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPST 1490 1500 1510 1520 1530 1540 >>CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966 aa) initn: 1304 init1: 604 opt: 1449 Z-score: 887.0 bits: 177.6 E(32554): 4.3e-43 Smith-Waterman score: 1498; 38.8% identity (65.7% similar) in 770 aa overlap (1-715:763-1512) 10 20 pF1KA0 MGLGKTIQSITFLYEILLTG-IRGPFLIIA ::::::::.:.::: . : .::::. : CCDS32 GGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGPFLVSA 740 750 760 770 780 790 30 40 50 60 70 80 pF1KA0 PLSTIANWEREFRTWTD-INVVVYHGSLISRQMIQQYEMYFRDSQGRIIRGAYR------ ::::: ::::::. :. . ::.: :. :: .:.. :. :.:. . . :.. 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