Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0336
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0336, 1583 aa
1>>>pF1KA0336 1583 - 1583 aa - 1583 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2876+/-0.00196; mu= -16.2093+/- 0.114
mean_var=609.9420+/-132.026, 0's: 0 Z-trim(105.8): 258 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.051931
statistics sampled from 8415 (8615) to 8415 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 4.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33268.1 GCC2 gene_id:9648|Hs108|chr2 (1684) 9807 752.1 3.4e-216
CCDS46388.1 RGPD6 gene_id:729540|Hs108|chr2 (1765) 766 74.8 2.8e-12
CCDS2082.1 RGPD5 gene_id:84220|Hs108|chr2 (1765) 766 74.8 2.8e-12
CCDS46394.1 RGPD8 gene_id:727851|Hs108|chr2 (1765) 760 74.3 3.9e-12
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 715 71.1 5.3e-11
CCDS46381.1 RGPD4 gene_id:285190|Hs108|chr2 (1758) 704 70.1 7.1e-11
>>CCDS33268.1 GCC2 gene_id:9648|Hs108|chr2 (1684 aa)
initn: 9807 init1: 9807 opt: 9807 Z-score: 3994.9 bits: 752.1 E(32554): 3.4e-216
Smith-Waterman score: 9807; 99.9% identity (100.0% similar) in 1583 aa overlap (1-1583:102-1684)
10 20 30
pF1KA0 MKQEVEDSVTKMGDAHKELEQSHINYVKEI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KALTERLDALLLEKAETEQQCLSLKKENIKMKQEVEDSVTKMGDAHKELEQSHINYVKEI
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 ENLKNELMAVRSKYSEDKANLQKQLEEAMNTQLELSEQLKFQNNSEDNVKKLQEEIEKIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ENLKNELMAVRSKYSEDKANLQKQLEEAMNTQLELSEQLKFQNNSEDNVKKLQEEIEKIR
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 PGFEEQILYLQKQLDATTDEKKETVTQLQNIIEANSQHYQKNINSLQEELLQLKAIHQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PGFEEQILYLQKQLDATTDEKKETVTQLQNIIEANSQHYQKNINSLQEELLQLKAIHQEE
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 VKELMCQIEASAKEHEAEINKLNELKENLVKQCEASEKNIQKKYECELENLRKATSNANQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VKELMCQIEASAKEHEAEINKLNELKENLVKQCEASEKNIQKKYECELENLRKATSNANQ
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 DNQICSILLQENTFVEQVVNEKVKHLEDTLKELESQHSILKDEVTYMNNLKLKLEMDAQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DNQICSILLQENTFVEQVVNEKVKHLEDTLKELESQHSILKDEVTYMNNLKLKLEMDAQH
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 IKDEFFHEREDLEFKINELLLAKEEQGCVIEKLKSELAGLNKQFCYTVEQHNREVQSLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IKDEFFHEREDLEFKINELLLAKEEQGCVIEKLKSELAGLNKQFCYTVEQHNREVQSLKE
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 QHQKEISELNETFLSDSEKEKLTLMFEIQGLKEQCENLQQEKQEAILNYESLREIMEILQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QHQKEISELNETFLSDSEKEKLTLMFEIQGLKEQCENLQQEKQEAILNYESLREIMEILQ
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TELGESAGKISQEFESMKQQQASDVHELQQKLRTAFTEKDALLETVNRLQGENEKLLSQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TELGESAGKISQEFESMKQQQASDVHELQQKLRTAFTEKDALLETVNRLQGENEKLLSQQ
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 ELVPELENTIKNLQEKNGVYLLSLSQRDTMLKELEGKINSLTEEKDDFINKLKNSHEEMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ELVPELENTIKNLQEKNGVYLLSLSQRDTMLKELEGKINSLTEEKDDFINKLKNSHEEMD
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 NFHKKCEREERLILELGKKVEQTIQYNSELEQKVNELTGGLEETLKEKDQNDQKLEKLMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NFHKKCEREERLILELGKKVEQTIQYNSELEQKVNELTGGLEETLKEKDQNDQKLEKLMV
620 630 640 650 660 670
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 QMKVLSEDKEVLSAEVKSLYEENNKLSSEKKQLSRDLEVFLSQKEDVILKEHITQLEKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QMKVLSEDKEVLSAEVKSLYEENNKLSSEKKQLSRDLEVFLSQKEDVILKEHITQLEKKL
680 690 700 710 720 730
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 QLMVEEQDNLNKLLENEQVQKLFVKTQLYGFLKEMGSEVSEDSEEKDVVNVLQAVGESLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QLMVEEQDNLNKLLENEQVQKLFVKTQLYGFLKEMGSEVSEDSEEKDVVNVLQAVGESLA
740 750 760 770 780 790
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 KINEEKCNLAFQRDEKVLELEKEIKCLQEESVVQCEELKSLLRDYEQEKVLLRKELEEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KINEEKCNLAFQRDEKVLELEKEIKCLQEESVVQCEELKSLLRDYEQEKVLLRKELEEIQ
800 810 820 830 840 850
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 SEKEALQSDLLEMKNANEKTRLENQNLLIQVEEVSQTCSKSEIHNEKEKCFIKEHENLKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SEKEALQSDLLEMKNANEKTRLENQNLLIQVEEVSQTCSKSEIHNEKEKCFIKEHENLKP
860 870 880 890 900 910
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 LLEQKELRDRRAELILLKDSLAKSPSVKNDPLSSVKELEEKIENLEKECKEKEEKINKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLEQKELRDRRAELILLKDSLAKSPSVKNDPLSSVKELEEKIENLEKECKEKEEKINKIK
920 930 940 950 960 970
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 LVAVKAKKELDSSRKETQTVKEELESLRSEKDQLSASMRDLIQGAESYKNLLLEYEKQSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LVAVKAKKELDSSRKETQTVKEELESLRSEKDQLSASMRDLIQGAESYKNLLLEYEKQSE
980 990 1000 1010 1020 1030
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 QLDVEKERANNFEHRIEDLTRQLRNSTLQCETINSDNEDLLARIETLQSNAKLLEVQILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QLDVEKERANNFEHRIEDLTRQLRNSTLQCETINSDNEDLLARIETLQSNAKLLEVQILE
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 VQRAKAMVDKELEAEKLQKEQKIKEHATTVNELEELQVQLQKEKKQLQKTMQELELVKKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS33 VQRAKAMVDKELEAEKLQKEQKIKEHATTVNELEELQVQLQKQKKQLQKTMQELELVKKD
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 AQQTTLMNMEIADYERLMKELNQKLTNKNNKIEDLEQEIKIQKQKQETLQEEITSLQSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AQQTTLMNMEIADYERLMKELNQKLTNKNNKIEDLEQEIKIQKQKQETLQEEITSLQSSV
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 QQYEEKNTKIKQLLVKTKKELADSKQAETDHLILQASLKGELEASQQQVEVYKIQLAEIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QQYEEKNTKIKQLLVKTKKELADSKQAETDHLILQASLKGELEASQQQVEVYKIQLAEIT
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 SEKHKIHEHLKTSAEQHQRTLSAYQQRVTALQEECRAAKAEQATVTSEFESYKVRVHNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SEKHKIHEHLKTSAEQHQRTLSAYQQRVTALQEECRAAKAEQATVTSEFESYKVRVHNVL
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA0 KQQKNKSMSQAETEGAKQEREHLEMLIDQLKIKLQDSQNNLQINVSELQTLQSEHDTLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQQKNKSMSQAETEGAKQEREHLEMLIDQLKIKLQDSQNNLQINVSELQTLQSEHDTLLE
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA0 RHNKMLQETVSKEAELREKLCSIQSENMMMKSEHTQTVSQLTSQNEVLRNSFRDQVRHLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RHNKMLQETVSKEAELREKLCSIQSENMMMKSEHTQTVSQLTSQNEVLRNSFRDQVRHLQ
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA0 EEHRKTVETLQQQLSKMEAQLFQLKNEPTTRSPVSSQQSLKNLRERRNTDLPLLDMHTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EEHRKTVETLQQQLSKMEAQLFQLKNEPTTRSPVSSQQSLKNLRERRNTDLPLLDMHTVT
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA0 REEGEGMETTDTESVSSASTYTQSLEQLLNSPETKLEPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 REEGEGMETTDTESVSSASTYTQSLEQLLNSPETKLEPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKS
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA0 ADHLNGLLRETEATNAILMEQIKLLKSEIRRLERNQEREKSAANLEYLKNVLLQFIFLKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ADHLNGLLRETEATNAILMEQIKLLKSEIRRLERNQEREKSAANLEYLKNVLLQFIFLKP
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1540 1550 1560 1570 1580
pF1KA0 GSERERLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQGEEENASRSSGWASYLHSWSGLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSERERLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQGEEENASRSSGWASYLHSWSGLR
1640 1650 1660 1670 1680
>>CCDS46388.1 RGPD6 gene_id:729540|Hs108|chr2 (1765 aa)
initn: 789 init1: 753 opt: 766 Z-score: 333.8 bits: 74.8 E(32554): 2.8e-12
Smith-Waterman score: 809; 29.7% identity (59.1% similar) in 750 aa overlap (851-1571:1065-1765)
830 840 850 860 870
pF1KA0 RAELILLKDSLAKSPSVKNDPLSSVKELEEKIENLEKECKE-KEEKINKIKLVAVKAKKE
:. .. : .. ::. ....:.. ... .
CCDS46 IHFEPVVQMPEKVELVTGEEGEKVLYSQGVKLFRFDAEVRQWKERGLGNLKILKNEVNGK
1040 1050 1060 1070 1080 1090
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 LDSSRKETQTVK---EELESLRSEKDQLSASMRDLIQGAESYKNLLLEYEKQSEQLDVEK
: .. :..: .. . . ::.: : . .: .... . :. . .. .
CCDS46 LRMLMRREQVLKVCANHWITTTMNLKPLSGSDRAWMWSASDFSDGDAKLERLAAKFKTP-
1100 1110 1120 1130 1140 1150
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 ERANNFEHRIEDLTRQLRNSTLQCETINSDN---EDLLARIETLQSNAKLLEVQILEVQR
: :..:....:. : : . :: :. :. : : ..:. : ... .: ..
CCDS46 ELAEEFKQKFEECQRLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAKLIQRAEEMKSGLKDFKT-FLTNDQ
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 AKAMVDKELEAEKLQKEQKIKEHATTVN-ELEELQVQLQKEKKQLQKTMQELELVKKDAQ
.:. : .: . ::.. . :. :. .. .:.. . . .....
CCDS46 TKV----TEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNAENTGPTLEWDNYDLREDALDDSVSSSSVH
1220 1230 1240 1250 1260
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 QTTLMNMEIADYERLMKELNQKLTNKNNKIEDLEQEIKIQKQKQETLQEEITSLQSSVQQ
. : . . .. . ..... :..: .... . : . ... :. .: : :
CCDS46 ASPLASSPV---RKNLFRFDESTTGSNFSFKSALSLSKSPAKLNQSGTSVGTDEESVVTQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 YEEKNTKIKQLLVKTKKELADSKQAETDHLILQASLKGELEASQQQVEVYKIQLAEITSE
::.. . . .: . :. :....... ...:.:. . .. .
CCDS46 EEERDGQYFEPVVPLPDLVEVSSGEENEQVVFS-----------HRAEIYRYD-KDVGQW
1330 1340 1350 1360 1370
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 KHKIHEHLKTSAEQHQRTLSAYQQRVTALQEECRAAKAEQATVTSEFESYKVRVHNVLKQ
:.. .: . .. . ..: .:. : . .: . . ..:.
CCDS46 KERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKL-CANHR-----ITPD-----MSLQNMKGT
1380 1390 1400 1410 1420
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA0 QKNKSMSQAETEGAKQEREHLEMLIDQLKIKLQDSQNNLQINVSELQTLQSEHDTLLERH
.. . . .... ::: . ..:::: .... .: .: : :.:.:. :
CCDS46 ERVWVWTACDFADGERKVEHLAV-----RFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQ-EKDSLITPH
1430 1440 1450 1460 1470
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA0 NKMLQETVSKEAELREKLCSIQSENMMMKSEHTQTVSQLTSQNEVLRNSFRDQVRHLQEE
::. . ::. :. . .. : :. ... . ..: . . .: .:
CCDS46 -------VSRSSTPRESPCGKIAVAIL--EETTRERTDVIQGDDVADAASEVEVSSTSET
1480 1490 1500 1510 1520
1360 1370 1380 1390
pF1KA0 HRKTV----------ETLQQQLSKMEAQLFQLKNEPTTRS--------PVSSQQSLKNLR
:.: :.... .:. ... : . : .: : :..:..: .
CCDS46 TTKAVVSPPKFVFVSESVKRIFSSEKSKPFVFGNSSATGSLFGFSFNAPLKSNNSETSSV
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA0 ERRNTDLPLLDMHTVTREEGEGMETTDTESVS-SASTYTQ--SLEQLLNSPETKLEPPLW
. ... . . .... ...:.. . ::: :. :.. ...:: :::::
CCDS46 AQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDSKVKNLSASFPTEESSINYTFKTPEK--EPPLW
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KA0 HAEFTKEELVQKLSSTTKSADHLNGLLRETEATNAILMEQIKLLKSEIRRLERNQEREKS
::::::::::::: ::::::::::::::: :::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HAEFTKEELVQKLRSTTKSADHLNGLLREIEATNAVLMEQIKLLKSEIRRLERNQEREKS
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KA0 AANLEYLKNVLLQFIFLKPGSERERLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQGEEENASRSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS46 AANLEYLKNVLLQFIFLKPGSERERLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQDEEENASRSSG
1710 1720 1730 1740 1750 1760
1580
pF1KA0 WASYLHSWSGLR
>>CCDS2082.1 RGPD5 gene_id:84220|Hs108|chr2 (1765 aa)
initn: 789 init1: 753 opt: 766 Z-score: 333.8 bits: 74.8 E(32554): 2.8e-12
Smith-Waterman score: 809; 29.7% identity (59.1% similar) in 750 aa overlap (851-1571:1065-1765)
830 840 850 860 870
pF1KA0 RAELILLKDSLAKSPSVKNDPLSSVKELEEKIENLEKECKE-KEEKINKIKLVAVKAKKE
:. .. : .. ::. ....:.. ... .
CCDS20 IHFEPVVQMPEKVELVTGEEGEKVLYSQGVKLFRFDAEVRQWKERGLGNLKILKNEVNGK
1040 1050 1060 1070 1080 1090
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 LDSSRKETQTVK---EELESLRSEKDQLSASMRDLIQGAESYKNLLLEYEKQSEQLDVEK
: .. :..: .. . . ::.: : . .: .... . :. . .. .
CCDS20 LRMLMRREQVLKVCANHWITTTMNLKPLSGSDRAWMWSASDFSDGDAKLERLAAKFKTP-
1100 1110 1120 1130 1140 1150
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 ERANNFEHRIEDLTRQLRNSTLQCETINSDN---EDLLARIETLQSNAKLLEVQILEVQR
: :..:....:. : : . :: :. :. : : ..:. : ... .: ..
CCDS20 ELAEEFKQKFEECQRLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAKLIQRAEEMKSGLKDFKT-FLTNDQ
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 AKAMVDKELEAEKLQKEQKIKEHATTVN-ELEELQVQLQKEKKQLQKTMQELELVKKDAQ
.:. : .: . ::.. . :. :. .. .:.. . . .....
CCDS20 TKV----TEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNAENTGPTLEWDNYDLREDALDDSVSSSSVH
1220 1230 1240 1250 1260
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 QTTLMNMEIADYERLMKELNQKLTNKNNKIEDLEQEIKIQKQKQETLQEEITSLQSSVQQ
. : . . .. . ..... :..: .... . : . ... :. .: : :
CCDS20 ASPLASSPV---RKNLFRFDESTTGSNFSFKSALSLSKSPAKLNQSGTSVGTDEESVVTQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 YEEKNTKIKQLLVKTKKELADSKQAETDHLILQASLKGELEASQQQVEVYKIQLAEITSE
::.. . . .: . :. :....... ...:.:. . .. .
CCDS20 EEERDGQYFEPVVPLPDLVEVSSGEENEQVVFS-----------HRAEIYRYD-KDVGQW
1330 1340 1350 1360 1370
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 KHKIHEHLKTSAEQHQRTLSAYQQRVTALQEECRAAKAEQATVTSEFESYKVRVHNVLKQ
:.. .: . .. . ..: .:. : . .: . . ..:.
CCDS20 KERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKL-CANHR-----ITPD-----MSLQNMKGT
1380 1390 1400 1410 1420
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA0 QKNKSMSQAETEGAKQEREHLEMLIDQLKIKLQDSQNNLQINVSELQTLQSEHDTLLERH
.. . . .... ::: . ..:::: .... .: .: : :.:.:. :
CCDS20 ERVWVWTACDFADGERKVEHLAV-----RFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQ-EKDSLITPH
1430 1440 1450 1460 1470
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA0 NKMLQETVSKEAELREKLCSIQSENMMMKSEHTQTVSQLTSQNEVLRNSFRDQVRHLQEE
::. . ::. :. . .. : :. ... . ..: . . .: .:
CCDS20 -------VSRSSTPRESPCGKIAVAIL--EETTRERTDVIQGDDVADAASEVEVSSTSET
1480 1490 1500 1510 1520
1360 1370 1380 1390
pF1KA0 HRKTV----------ETLQQQLSKMEAQLFQLKNEPTTRS--------PVSSQQSLKNLR
:.: :.... .:. ... : . : .: : :..:..: .
CCDS20 TTKAVVSPPKFVFVSESVKRIFSSEKSKPFVFGNSSATGSLFGFSFNAPLKSNNSETSSV
1530 1540 1550 1560 1570 1580
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pF1KA0 ERRNTDLPLLDMHTVTREEGEGMETTDTESVS-SASTYTQ--SLEQLLNSPETKLEPPLW
. ... . . .... ...:.. . ::: :. :.. ...:: :::::
CCDS20 AQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDSKVKNLSASFPTEESSINYTFKTPEK--EPPLW
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pF1KA0 HAEFTKEELVQKLSSTTKSADHLNGLLRETEATNAILMEQIKLLKSEIRRLERNQEREKS
::::::::::::: ::::::::::::::: :::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS20 HAEFTKEELVQKLRSTTKSADHLNGLLREIEATNAVLMEQIKLLKSEIRRLERNQEREKS
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1520 1530 1540 1550 1560 1570
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS20 AANLEYLKNVLLQFIFLKPGSERERLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQDEEENASRSSG
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1580
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: .. :..: .. . . ::.: : . .: .... . :. . .. .
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: :..:....:. : : . :: :. :. : : ..:. : ... . . :
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: : :. . . . ::.. . :. :. .. .:.. . . ....
CCDS46 ------KVTEEENKGSGTGVAGASDTTIKPNAENTGPTLEWDNYDLREDALDDSVSSSSV
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. . : . . .. . ..... :..: .... . : . ... :. .: :
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: ::.. . . .: . :. :....... ...:.:. . .. .
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:.. .: . .. . ..: .:. : . .: . . ..:.
CCDS46 WKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKL-CANHR-----ITPD-----MSLQNMKG
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.. . . .... ::: . ..:::: .... .: .: : :.:.:.
CCDS46 TERVWVWTACDFADGERKVEHLAV-----RFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQ-EKDSLITP
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: ::. . ::. :. . .. : :. ... . ..: . . .: .:
CCDS46 H-------VSRSSTPRESPCGKIAVAVL--EEITRERTDVIQGDDVADAASEVEVSSTSE
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:.: :.... .:. ... : . : .: : :..:..: .
CCDS46 TTTKAVVSPPKFVFVSESVKRIFSSEKSKPFAFGNSSATGSLFGFSFNAPLKSNNSETSS
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. ... . . .... ...:.. . ::: :. :.. ...:: ::::
CCDS46 VAQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDSKVKNLSASFPTEESSINYTFKTPEK--EPPL
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pF1KA0 WHAEFTKEELVQKLSSTTKSADHLNGLLRETEATNAILMEQIKLLKSEIRRLERNQEREK
:::::::::::::: ::::::::::::::: :::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS46 WHAEFTKEELVQKLRSTTKSADHLNGLLREIEATNAVLMEQIKLLKSEIRRLERNQEREK
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: ::::
CCDS46 SAANLEYLKNVLLQFIFLKPGSERERLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQDEEENPSRSS
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pF1KA0 GWASYLHSWSGLR
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CCDS46 G
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: :. ..: .. .:.::::: ...:. . : :: . .: ..:.: :.::.. :
CCDS68 E--ALLKRYRKEIMDLKKQLEEVSLETRAQAMEKDQLAQLLEEKDLLQKVQNEKIENLTR
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. : ::..: : ..:. :: : .: . ....: ..: .. . .:.
CCDS68 MLVTSSSLTLQQELKA---KRKRRVTWCLGKINKMKNSNYADQFNIPTNITTKTHKLSIN
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.:. : .:. : .. : :. :.: .. :.. :.. : ::..::
CCDS68 LLREIDESVCS------ESDVFSNTLDTLSE--IEWNPATKLLNQENIESELNSLR----
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:. :: . . ::. .:: ...: ::: :... .. :. : .
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: .. : :...:.:: :..: . ... .:..: .:. ..:. ..
CCDS68 DQENELSSKVELLREKEDQIKKLQEYIDSQK-----LENIKMDLS----YSLESIEDPKQ
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:.: . . .. :. :: . . : : :. .: :: : : . ...
CCDS68 MKQTLFDAETVALDAKRESAFLRSENLELKEKMKELATTYKQMENDIQLYQSQLEAKKKM
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. .: ::. ..: . ::. ... . ... . .::..: :..:: :
CCDS68 QVDLEKELQSAFNEITKLTSLIDGKVPKDLLCNLELEGK-ITDLQKELNKEVEENEALRE
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: :::. . .: :.: :..:.:. . :..: ...:. :.....
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: :: :::. .. :.. .:..:: : :.. ...:: .....: : :.
CCDS68 LLEEIGKTKDDLATTQSNYKSTDQEFQNFKTLHMDFEQKYKMVLEENERMNQEIVNLSKE
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:: . :.:. :. : :. :. ... . .:. :.:. : .. .... .:.. .
CCDS68 AQKFDSSLGALKTELSYKTQELQEKTREVQERLNEMEQLKEQLENRDSTLQTVEREKTLI
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. . .: ...... ..:.:. .. :.:. :: . .:..: ... ::... :
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: .. . :..::. .. ... . .::. ..... .. ..: ... :
CCDS68 LKQHQETINTLKSKISEEVSRN--LHMEENTGETKDEFQQKMVGIDKKQDLEAKNTQTLT
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..: ..: . : ... ::. ::: :.. :: . .::: :..:: .:: :
CCDS68 ADVK--DNEIIEQQRKIFSLI----QEKNELQQMLESVIAEKEQLKTDLKENIEMTIENQ
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:. :: ...: : : :.: ... :..: : : . . .:.:: ....:....
CCDS68 EELRLLGDELKKQQEIVAQEKNHA-IKKEGELSRTCDRLAEVEEKLKE--KSQQLQEKQQ
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.:. ... ... . :. . .::..: .::. :. : .:.. . .:. :
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:: ...:: .:...:.:.: . .:.. : .. ..: . . . .:. .: ..
CCDS68 ITKERKVLKELQKSFETERDHLRGYIREIEATGLQTKEELKIAHIHLKEH----QETIDE
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... . . : :. :. . ..... : .: .:. . .:: .. ::.... .. :
CCDS68 LRRSVSEKTAQIINT----QDLEKSHTKLQEEIPVLHEEQELLP-NVKEVSETQETMN-E
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:: : ::. . .::. ..: ...:... .. :. .. : ..: .: .:.
CCDS68 LE---LLTEQSTTKDSTTLARIEMERLRLNEKFQESQEEIKSLTK-ERDNLKTIKEALEV
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CCDS68 LETEEELKVAHCCLKEQEETINELRVNLSEKETEISTIQKQLEAINDKLQNKIQEIYEKE
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: : :..: : ... :: .:: .: . .: .::.::...:: ..:
CCDS68 EQFNIKQISEVQEKVNELKQFKEHRKAKDSALQSIESKMLELTNRLQESQEEIQIMIKEK
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CCDS68 EEMKRVQEALQIERDQLKENTKEIVAKMKE---SQEKEYQFLKMTAVNETQEKMCEIEHL
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CCDS68 KEQFETQKLNLENIETENIRLTQILHENLEEMRSVTKERDDLRSVEETLKVERDQLKENL
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pF1KA0 RE------RRNTDLPLLDMHTVTREEG----EGMETTDTESVSSASTYTQSLEQLLNSPE
:: ... .: .. :: ..: .:. . :. .:. . . .. :.. .
CCDS68 RETITRDLEKQEELKIVHMHLKEHQETIDKLRGIVSEKTNEISNMQKDLEHSNDALKAQD
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pF1KA0 TKLEPPLWHAEF---TKEELVQKLSS-TTKSADHLNGLLRETEATNAILMEQIKLLKS--
:.. : :.. ..: ..:: . .....:.:... .. : .:: :.:.:. ::.
CCDS68 LKIQEELRIAHMHLKEQQETIDKLRGIVSEKTDKLSNMQKDLENSNAKLQEKIQELKANE
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pF1KA0 -EIRRLERN-QEREKSAANLEYLKNVLLQFIFLKPGSERERLLPVINTMLQLSPEEKGKL
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CCDS68 HQLITLKKDVNETQKKVSEMEQLKKQIKDQSLTLSKLEIENLNLAQKLHENLEEMKSVMK
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CCDS46 LCANHTITPDMSLQNMKGTERVWVWTACDFADGERKVEHLA-----VRFKLQDVADSFKK
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.: .: : :.:.:. : ::. . ::. :. . .. : :. ... .
CCDS46 IFDEAKTAQ-EKDSLITPH-------VSRSSTPRESPCGKIAVAVL--EETTRERTDVIQ
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CCDS46 GDDVADAASEVEVSSTSETTTKAVVSPPKFVFGSESVKRIFSSEKSKPFAFGNSSATGSL
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CCDS46 FGFSFNASLKSNNSETSSVAQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDSKVKNLSASFPMEE
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pF1KA0 -SLEQLLNSPETKLEPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKSADHLNGLLRETEATNAILMEQI
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CCDS46 SSINYTFKTPEK--EPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKSADHLNGLLREAEATSAVLMEQI
1630 1640 1650 1660 1670 1680
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CCDS46 GKLAAVAQGEE
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