FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0363, 1469 aa 1>>>pF1KA0363 1469 - 1469 aa - 1469 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8440+/-0.00131; mu= -15.0229+/- 0.079 mean_var=499.4726+/-103.918, 0's: 0 Z-trim(114.1): 69 B-trim: 157 in 1/53 Lambda= 0.057388 statistics sampled from 14640 (14693) to 14640 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.451), width: 16 Scan time: 6.170 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47582.1 NACAD gene_id:23148|Hs108|chr7 (1562) 9664 816.0 0 CCDS44925.2 NACA gene_id:4666|Hs108|chr12 ( 925) 936 93.3 3.7e-18 CCDS31837.1 NACA gene_id:4666|Hs108|chr12 ( 215) 790 80.7 5.1e-15 CCDS11630.1 NACA2 gene_id:342538|Hs108|chr17 ( 215) 722 75.1 2.5e-13 >>CCDS47582.1 NACAD gene_id:23148|Hs108|chr7 (1562 aa) initn: 9664 init1: 9664 opt: 9664 Z-score: 4341.5 bits: 816.0 E(32554): 0 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CCDS44 MPGEATETV-PATEQELPQPQAETA--VLPMSS 10 20 30 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 EEETDSTAGQESAAMAMPQPSQEGISEILGQESVTAEKLPTPQEETSLTLCPDSPQNLKE . .. :: . .. : : . . .. . . : .:.:. .: : ::. CCDS44 ALSVTAALGQPGPTL--PPPCSPAPQQCPLSAANQASPFPSPSTIASTPLEVPFPQS--- 40 50 60 70 80 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 EGGLDLPSGRKPVAAATIVPRQAKEDLTLPQDSAMTPPL--P-LQDTDLSSAPKPVAAAT .: :: : : : :..: .. : :.. :. : :. : ::: :.: .. CCDS44 SSGTALPLGTAP-EAPTFLPNLIGPPIS-PAALALASPMIAPTLKGTPSSSA--PLALVA 90 100 110 120 130 140 540 550 560 570 580 pF1KA0 IVSQQAEEGLTLPQDSVMTPP-LPLQDT----ELSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQD .. ...... ..: . . .:: . . .. ::. : : ... : . :. CCDS44 LAPHSVQKSSAFPPNLLTSPPSVAVAESGSVITLSAPIAPSEPKTNLNKVPSEVVPNPKG 150 160 170 180 190 200 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 SAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQDS-AMTPPLPLQDTDLSSAPK . .:: .. . . :.: .. : : : : . :.. : ..:: .::. CCDS44 TP-SPPCIVSTVPYHCVT-PMA--SIQSGVASLPQTTPTTTLAIASP-QVKDTTISSV-- 210 220 230 240 250 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 PVAAATLVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATIVSQQAEEGLTLPQ :.: : .:.: . ..:: :. ::. :: ..:.: : . : CCDS44 ------LISPQNPGSLSL--KGPVSPPAALS---LSTQSLPV----VTSSQKTAGPNTPP 260 270 280 290 710 720 730 740 750 pF1KA0 D---SAMTPPLPLQDTDLSSA-------PKPVAAATIVS---QQAEEGLTLPQDSAMTPP : : . ::......:. :. .. :. . ... : . :.. .. :: CCDS44 DFPISLGSHLAPLHQSSFGSVQLLGQTGPSALSDPTVKTISVDHSSTGASYPSQRSVIPP 300 310 320 330 340 350 760 770 780 790 800 810 pF1KA0 LPLQDTDLSSAPKPVAAATPVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPK-PVAAAT :: .. .: ::: :. ....: : .... .:. . .:: CCDS44 LPSRNE---VVPATVAAFPVVAPSVDKG-------------PSTISSITCSPSGSLNVAT 360 370 380 390 400 820 830 840 850 860 pF1KA0 PVSQQAEEGLTLPQDSAMTAPLPLQDTGPTS--GPEPLAVATPQTLQAEAGCAPGTEPVA : . .: : .. : :: :.: : ::.:..: :. .. :.. CCDS44 SFSLSPTTSLILKSSPNATYHYPLVAQMPVSSVGTTPLVVTNP--------CTIAAAPTT 410 420 430 440 450 870 880 890 900 910 920 pF1KA0 TMAQQEVGEALGPRPAPEEKNAALPTVPEPAALDQVQQDDP-QPAAEAGTPWAAQEDADS :. ::. ..: : . ... .: .::: . .: : .: : CCDS44 TF---EVATCVSP----------------PMSSGPISNIEPTSPAALVMAPVAPKE--PS 460 470 480 490 930 940 950 960 970 980 pF1KA0 TLGMEALSLPEPASGAGEEIAEALSRPGREACLEARAHTGDGAKPDSPQKETLEVENQQE : .: .: .. : : : . . . : ::. : . : CCDS44 TQVATTLRIP---------VSPPLPDPEDLKNLPSSVLV---KFP--TQKDLQTVPASLE 500 510 520 530 540 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KA0 GGLKLLAQEHGPRS-ALGGAREVPDAPPAACPEVSQARLLSPAREERGLSGKSTPE-PTL :. : : : .: : :.. : :. : ::. . : .:.:: : CCDS44 GA---------PFSPAQAGLTTKKD--PTVLPLVQAAPKNSPSFQ----STSSSPEIPLS 550 560 570 580 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KA0 PSAVATEASLDSCPESSVGAVSSLDRGCPDAPAPTSAPTSQQPEPVLGLGSVEQPHEVPS : :. .. :: : :.: :. . : . :::.: .. : :: CCDS44 PEATLAKKSLGE-PLPIVAAFP-LESADPAGVAPTTAKAAAF-EKVL------------- 590 600 610 620 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KA0 VLGTPLLQPPENLAKGQPSTPVDRPLGPDPSAPGTLAGAALPPLE---PPAPCLCQDPQE : .: ... :: ::. ::.:.: .: .::: . : .: : . 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CCDS44 KPLAPADEDELLPLIPPE----PISGGV----------PFQSVLVNMP--TPKSAGI--- 680 690 700 710 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KA0 DLALQILPPCQVPPPSGPQSPAGPQGLSAPEQQEDEDSLEEDSPRALGSGQHSDSHGESS : :: ::. : : .... ::: .::: :: CCDS44 -------P---VPTPSAKQ----------PVTKNNK-----------GSGTESDSD-ESV 720 730 740 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KA0 AELDEQDILAPQTVQCPAQAPAGGSEETIAKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQIQGVTRIT ::.::: : : : : .:: ..::::::::::::::::::::::. ::::.: CCDS44 PELEEQDSTQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVT 750 760 770 780 790 800 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KA0 IQKSKNILFVIAKPDVFKSPASDTYVVFGEAKIEDLSQQVHKAAAEKFKVPSEPSALVPE :.:::::::::.::::.::::::::.:::::::::::::.. :::::::: .: . . : CCDS44 IRKSKNILFVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQE 810 820 830 840 850 860 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KA0 SAPRPRVRLECKEEEEEEEEEVDEAGLELRDIELVMAQANVSRAKAVRALRDNHSDIVNA .. : : .:: :::::::.:.:..::::::.:::::::::::::..: .::::: CCDS44 NTQTPTV------QEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNA 870 880 890 900 910 pF1KA0 IMELTM :::::: CCDS44 IMELTM 920 >>CCDS31837.1 NACA gene_id:4666|Hs108|chr12 (215 aa) initn: 587 init1: 546 opt: 790 Z-score: 383.1 bits: 80.7 E(32554): 5.1e-15 Smith-Waterman score: 790; 66.3% identity (80.3% similar) in 208 aa overlap (1263-1469:15-215) 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KA0 CQVPPPSGPQSPAGPQGLSAPEQQEDEDSLEEDSPRA-LGSGQHSDSHGESSAELDEQDI : .:.: ::: .::: :: ::.::: CCDS31 MPGEATETVPATEQELPQPQAETGSGTESDSD-ESVPELEEQDS 10 20 30 40 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KA0 LAPQTVQCPAQAPAGGSEETIAKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQIQGVTRITIQKSKNIL : : : : .:: ..::::::::::::::::::::::. ::::.::.:::::: CCDS31 TQATTQQAQLAAAAEIDEEPVSKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQVTGVTRVTIRKSKNIL 50 60 70 80 90 100 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA0 FVIAKPDVFKSPASDTYVVFGEAKIEDLSQQVHKAAAEKFKVPSEPSALVPESAPRPRVR :::.::::.::::::::.:::::::::::::.. :::::::: .: . . :.. : : CCDS31 FVITKPDVYKSPASDTYIVFGEAKIEDLSQQAQLAAAEKFKVQGEAVSNIQENTQTPTV- 110 120 130 140 150 160 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KA0 LECKEEEEEEEEEVDEAGLELRDIELVMAQANVSRAKAVRALRDNHSDIVNAIMELTM .:: :::::::.:.:..::::::.:::::::::::::..: .::::::::::: CCDS31 -----QEESEEEEVDETGVEVKDIELVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDIVNAIMELTM 170 180 190 200 210 >>CCDS11630.1 NACA2 gene_id:342538|Hs108|chr17 (215 aa) initn: 764 init1: 489 opt: 722 Z-score: 352.7 bits: 75.1 E(32554): 2.5e-13 Smith-Waterman score: 722; 58.4% identity (76.3% similar) in 219 aa overlap (1254-1469:4-215) 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KA0 DLALQILPPCQVPPPSGPQSPAGPQGLSAPEQQEDEDSLEEDSPRA---LGSGQHSDSHG : : . :.. :.. ::: ::: : CCDS11 MPGEATETVPATEQELPQSQAETGSGTASDS-G 10 20 30 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KA0 ESSAELDEQDILAPQTVQCPAQAPAGGSEETIAKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQIQGVT :: ..::: : . : : .:: ..:::::::::.:::::::::: :. ::: CCDS11 ESVPGIEEQDSTQTTTQKAWLVAAAEIDEEPVGKAKQSRSEKRARKAMSKLGLLQVTGVT 40 50 60 70 80 90 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KA0 RITIQKSKNILFVIAKPDVFKSPASDTYVVFGEAKIEDLSQQVHKAAAEKFKVPSEPSAL :.:: :::::::::.: ::.::::::.:.:::::::.:::::.. ::::::.: .: . CCDS11 RVTIWKSKNILFVITKLDVYKSPASDAYIVFGEAKIQDLSQQAQLAAAEKFRVQGEAVGN 100 110 120 130 140 150 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KA0 VPESAPRPRVRLECKEEEEEEEEEVDEAGLELRDIELVMAQANVSRAKAVRALRDNHSDI . :.. : : .:: :::::::.:.:..:..:::.:::::::::::::..: .:: CCDS11 IQENTQTPTV------QEESEEEEVDETGVEVKDVKLVMSQANVSRAKAVRALKNNSNDI 160 170 180 190 200 pF1KA0 VNAIMELTM ::::::::. CCDS11 VNAIMELTV 210 1469 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 2 18:43:58 2016 done: Wed Nov 2 18:43:59 2016 Total Scan time: 6.170 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]