Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0371
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0371, 1198 aa
1>>>pF1KA0371 1198 - 1198 aa - 1198 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9576+/-0.000925; mu= 16.0662+/- 0.056
mean_var=122.9106+/-24.017, 0's: 0 Z-trim(110.1): 76 B-trim: 2 in 1/51
Lambda= 0.115686
statistics sampled from 11286 (11362) to 11286 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.349), width: 16
Scan time: 5.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13870.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1198) 8237 1386.6 0
CCDS13871.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1170) 7370 1241.9 0
CCDS46682.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1161) 7362 1240.6 0
CCDS11608.1 MTMR4 gene_id:9110|Hs108|chr17 (1195) 3770 641.1 4.8e-183
CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 571) 966 172.9 2e-42
CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 643) 966 172.9 2.2e-42
CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX ( 603) 910 163.6 1.3e-39
CCDS14695.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 665) 885 159.4 2.6e-38
CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 673) 885 159.4 2.7e-38
CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX ( 704) 802 145.6 4.1e-34
CCDS34851.1 MTMR7 gene_id:9108|Hs108|chr8 ( 660) 787 143.1 2.2e-33
CCDS9313.1 MTMR6 gene_id:9107|Hs108|chr13 ( 621) 762 138.9 3.8e-32
CCDS5979.1 MTMR9 gene_id:66036|Hs108|chr8 ( 549) 669 123.3 1.6e-27
CCDS31427.1 SBF2 gene_id:81846|Hs108|chr11 (1849) 474 91.1 2.7e-17
CCDS14091.2 SBF1 gene_id:6305|Hs108|chr22 (1893) 473 91.0 3.1e-17
CCDS45204.1 MTMR10 gene_id:54893|Hs108|chr15 ( 777) 440 85.2 6.8e-16
CCDS77998.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 693) 375 74.3 1.1e-12
CCDS34138.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 747) 374 74.2 1.4e-12
CCDS72901.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 640) 372 73.8 1.5e-12
CCDS72902.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 709) 372 73.8 1.6e-12
>>CCDS13870.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1198 aa)
initn: 8237 init1: 8237 opt: 8237 Z-score: 7429.0 bits: 1386.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8237; 100.0% identity (100.0% similar) in 1198 aa overlap (1-1198:1-1198)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 HIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWDRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWDRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWSLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPTTPVDDSCAPYPAPGTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPTTPVDDSCAPYPAPGTSP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DDPPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAGPGEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DDPPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAGPGEDP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LSADSLGKPTRVPGGAELSVAAGVAEGQMENILQEATKEESGVEEPAHRAGIEIQEGKED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSADSLGKPTRVPGGAELSVAAGVAEGQMENILQEATKEESGVEEPAHRAGIEIQEGKED
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PLLEKESRRKTPEASAIGLHQDPELGDAALRSHLDMSWPLFSQGISEQQSGLSVLLSSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PLLEKESRRKTPEASAIGLHQDPELGDAALRSHLDMSWPLFSQGISEQQSGLSVLLSSLQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 VPPRGEDSLEVPVEQFRIEEIAEGREEAVLPIPVDAKVGYGTSQSCSLLPSQVPFETRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VPPRGEDSLEVPVEQFRIEEIAEGREEAVLPIPVDAKVGYGTSQSCSLLPSQVPFETRGP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 NVDSSTDMLVEDKVKSVSGPQGHHRSCLVNSGKDRLPQTMEPSPSETSLVERPQVGSVVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NVDSSTDMLVEDKVKSVSGPQGHHRSCLVNSGKDRLPQTMEPSPSETSLVERPQVGSVVH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RTSLGSTLSLTRSPCALPLAECKEGLVCNGAPETENRASEQPPGLSTLQMYPTPNGHCAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RTSLGSTLSLTRSPCALPLAECKEGLVCNGAPETENRASEQPPGLSTLQMYPTPNGHCAN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 GEAGRSKDSLSRQLSAMSCSSAHLHSRNLHHKWLHSHSGRPSATSSPDQPSRSHLDDDGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GEAGRSKDSLSRQLSAMSCSSAHLHSRNLHHKWLHSHSGRPSATSSPDQPSRSHLDDDGM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 SVYTDTIQQRLRQIESGHQQEVETLKKQVQELKSRLESQYLTSSLHFNGDFGDEVTSIPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SVYTDTIQQRLRQIESGHQQEVETLKKQVQELKSRLESQYLTSSLHFNGDFGDEVTSIPD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SESNLDQNCLSRCSTEIFSEASWEQVDKQDTEMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SESNLDQNCLSRCSTEIFSEASWEQVDKQDTEMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 CRNCGNVFCSSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPTSSSIDLELDKPIAATSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CRNCGNVFCSSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPTSSSIDLELDKPIAATSN
1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS13871.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1170 aa)
initn: 7973 init1: 7352 opt: 7370 Z-score: 6647.1 bits: 1241.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7876; 96.2% identity (96.2% similar) in 1207 aa overlap (1-1198:1-1170)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 HIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWDRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWDRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWSLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPTTPVDDSCAPYPAPGTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPTTPVDDSCAPYPAPGTSP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DDPPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAGPGEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DDPPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAGPGEDP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LSADSLGKPTRVPGGAELSVAAGVAEGQMENILQEATKEESGVEEPAHRAGIEIQEGKED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSADSLGKPTRVPGGAELSVAAGVAEGQMENILQEATKEESGVEEPAHRAGIEIQEGKED
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PLLEKESRRKTPEASAIGLHQDPELGDAALRSHLDMSWPLFSQGISEQQSGLSVLLSSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PLLEKESRRKTPEASAIGLHQDPELGDAALRSHLDMSWPLFSQGISEQQSGLSVLLSSLQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 VPPRGEDSLEVPVEQFRIEEIAEGREEAVLPIPVDAKVGYGTSQSCSLLPSQVPFETRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VPPRGEDSLEVPVEQFRIEEIAEGREEAVLPIPVDAKVGYGTSQSCSLLPSQVPFETRGP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 NVDSSTDMLVEDKVKSVSGPQGHHRSCLVNSGKDRLPQTMEPSPSETSLVERPQVGSVVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NVDSSTDMLVEDKVKSVSGPQGHHRSCLVNSGKDRLPQTMEPSPSETSLVERPQVGSVVH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RTSLGSTLSLTRSPCALPLAECKEGLVCNGAPETENRASEQPPGLSTLQMYPTPNGHCAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RTSLGSTLSLTRSPCALPLAECKEGLVCNGAPETENRASEQPPGLSTLQMYPTPNGHCAN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 GEAGRSKDSLSRQLSAMSCSSAHLHSRNLHHKWLHSHSGRPSATSSPDQPSRSHLDDDGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GEAGRSKDSLSRQLSAMSCSSAHLHSRNLHHKWLHSHSGRPSATSSPDQPSRSHLDDDGM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 SVYTDTIQQRLRQIESGHQQEVETLKKQVQELKSRLESQYLTSSLHFNGDFGDEVTSIPD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SVYTDTIQQRLRQIESGHQQEVETLKKQVQELKSRLESQYLTSSLHFNGDFGDEV-----
1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SESNLDQNCLSRCSTEIFSEASWEQVDKQDTEMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHH
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 --------------------------------MTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHH
1080 1090 1100
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 CR---------NCGNVFCSSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPTSSSIDLELDK
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CRDTDRVDQTWNCGNVFCSSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPTSSSIDLELDK
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 PIAATSN
:::::::
CCDS13 PIAATSN
1170
>>CCDS46682.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1161 aa)
initn: 7352 init1: 7352 opt: 7362 Z-score: 6639.9 bits: 1240.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7904; 96.9% identity (96.9% similar) in 1198 aa overlap (1-1198:1-1161)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 HIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWDRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWDRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWSLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPTTPVDDSCAPYPAPGTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPTTPVDDSCAPYPAPGTSP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 DDPPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAGPGEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DDPPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAGPGEDP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 LSADSLGKPTRVPGGAELSVAAGVAEGQMENILQEATKEESGVEEPAHRAGIEIQEGKED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSADSLGKPTRVPGGAELSVAAGVAEGQMENILQEATKEESGVEEPAHRAGIEIQEGKED
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PLLEKESRRKTPEASAIGLHQDPELGDAALRSHLDMSWPLFSQGISEQQSGLSVLLSSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PLLEKESRRKTPEASAIGLHQDPELGDAALRSHLDMSWPLFSQGISEQQSGLSVLLSSLQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 VPPRGEDSLEVPVEQFRIEEIAEGREEAVLPIPVDAKVGYGTSQSCSLLPSQVPFETRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VPPRGEDSLEVPVEQFRIEEIAEGREEAVLPIPVDAKVGYGTSQSCSLLPSQVPFETRGP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 NVDSSTDMLVEDKVKSVSGPQGHHRSCLVNSGKDRLPQTMEPSPSETSLVERPQVGSVVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NVDSSTDMLVEDKVKSVSGPQGHHRSCLVNSGKDRLPQTMEPSPSETSLVERPQVGSVVH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 RTSLGSTLSLTRSPCALPLAECKEGLVCNGAPETENRASEQPPGLSTLQMYPTPNGHCAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RTSLGSTLSLTRSPCALPLAECKEGLVCNGAPETENRASEQPPGLSTLQMYPTPNGHCAN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 GEAGRSKDSLSRQLSAMSCSSAHLHSRNLHHKWLHSHSGRPSATSSPDQPSRSHLDDDGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GEAGRSKDSLSRQLSAMSCSSAHLHSRNLHHKWLHSHSGRPSATSSPDQPSRSHLDDDGM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 SVYTDTIQQRLRQIESGHQQEVETLKKQVQELKSRLESQYLTSSLHFNGDFGDEVTSIPD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SVYTDTIQQRLRQIESGHQQEVETLKKQVQELKSRLESQYLTSSLHFNGDFGDEV-----
1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SESNLDQNCLSRCSTEIFSEASWEQVDKQDTEMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHH
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 --------------------------------MTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHH
1080 1090 1100
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 CRNCGNVFCSSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPTSSSIDLELDKPIAATSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CRNCGNVFCSSCCNQKVPVPSQQLFEPSRVCKSCYSSLHPTSSSIDLELDKPIAATSN
1110 1120 1130 1140 1150 1160
>>CCDS11608.1 MTMR4 gene_id:9110|Hs108|chr17 (1195 aa)
initn: 2844 init1: 1557 opt: 3770 Z-score: 3399.8 bits: 641.1 E(32554): 4.8e-183
Smith-Waterman score: 3787; 49.5% identity (71.8% similar) in 1240 aa overlap (1-1198:1-1195)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDEETRHSLECIQANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRL
: :: ::: :::...:: :.:..:.::::::: :.::..::.::: ::.::.:::::
CCDS11 MGEEGPPSLEYIQAKDLFPPKELVKEEENLQVPFTVLQGEGVEFLGRAADALIAISNYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 HIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRP
:::::.:..::::..:.::: ::.::::..::: ::.::.::::.::::::.::. :
CCDS11 HIKFKDSVINVPLRMIDSVESRDMFQLHISCKDSKVVRCHFSTFKQCQEWLSRLSRATAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
::: ::::.:::::::. . .:..:: ::.::::. : . :. :::::..:.::.:.
CCDS11 PAKPEDLFAFAYHAWCLGL--TEEDQHTHLCQPGEHIRCRQEAELARMGFDLQNVWRVSH
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
:: .:::: ::::.:.::.::::::::.:.:::::::::.:.::: :::.::::.:::.
CCDS11 INSNYKLCPSYPQKLLVPVWITDKELENVASFRSWKRIPVVVYRHLRNGAAIARCSQPEI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KA0 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASD--SRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSN
:::::::::::.:: :.::::: : .:..:..::: :. . .. :..:::::.
CCDS11 SWWGWRNADDEYLVTSIAKACALDPGTRATGGSLSTGNN-----DTSEACDADFDSSLTA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ASGAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRS
::.:: : ::::::::::::.:::::::::::::: :::::::::::::::::.:: :
CCDS11 CSGVESTAA-PQKLLILDARSYTAAVANRAKGGGCECEEYYPNCEVVFMGMANIHAIRNS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 FQSLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWD
:: :: .:.:::::.::::::::::::.::::.::.:.::...::.. ::::::::::::
CCDS11 FQYLRAVCSQMPDPSNWLSALESTKWLQHLSVMLKAAVLVANTVDREGRPVLVHCSDGWD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 RTPQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQ
::::::::::.::::::::.:::::::: .::::::::.::::: :: .: ::.::::::
CCDS11 RTPQIVALAKILLDPYYRTLEGFQVLVESDWLDFGHKFGDRCGHQENVEDQNEQCPVFLQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 WLDCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWS
::: :::: .:::: :::::::::::::::::::.:::: :: :: ... .::::::.
CCDS11 WLDSVHQLLKQFPCLFEFNEAFLVKLVQHTYSCLYGTFLANNPCEREKRNIYKRTCSVWA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 LLRAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPTTPVDDSCAPYPAPGT
::::::: :.:.::. .:. ::.:::::: : ::.::::: :: : ... : .: .
CCDS11 LLRAGNKNFHNFLYTPSSDMVLHPVCHVRALHLWTAVYLPASSPCTLGEENMDLYLSPVA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 SPDD---PPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAG
. .. :.:::::::.:.: .:::.. :: .: :::.::.. :: : .::
CCDS11 QSQEFSGRSLDRLPKTRSMDDLLSACDTSSPL-TRTSSDPNLNNHCQEVRVGLEPWHSNP
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 PGEDPLSADS-LGKPTRVPGGAELSVAAGVAEGQMENILQEATKEESGVEEPAHR---AG
: . .:: .: : .. : :... . .: . . .. : ... :... ..
CCDS11 EGSETSFVDSGVGGPQQTVG--EVGLPPPLPSSQKDYLSNKPFKSHKSCS-PSYKLLNTA
660 670 680 690 700
720 730 740 750 760
pF1KA0 I--EIQEGKEDPLLE--KESRRKTPEASA---IGLHQDPELGDAALRSHLDMSWPLFSQG
. :.. . :: .. .:.. .:. :: .: : .:. . . .:.
CCDS11 VPREMKSNTSDPEIKVLEETKGPAPDPSAQDELGRTLDG-IGEPPEHCPETEAVSALSKV
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 ISEQQSGLSVLLSSLQVPPRGEDSLEVPVEQFRIEEIAEGREEAVLPIPVDAKVGYGTSQ
::.. .:. . : : : : . : ...: .: . .. :
CCDS11 ISNKCDGVCNFPESSQNSPTGTPQQAQP--------------DSMLGVPSKCVLDHSLST
770 780 790 800 810
830 840 850 860 870
pF1KA0 SCSLLPSQVPFETRGPNVDSSTDMLVED---KVKSVSGPQG--------HHRSCLVNSGK
:. : .. .: : .: :::.: .: .: :.: . : . . . :.
CCDS11 VCN--PPSAACQT--P-LDPSTDFLNQDPSGSVASISHQEQLSSVPDLTHGEEDIGKRGN
820 830 840 850 860
880 890 900 910 920
pF1KA0 DRLPQTME-PSPSETSL--VERPQVGSVVHRTS-LGSTL-SLTRSPCALPLAECK-EGLV
.: : .: : .. : :..: : . . : :::. :. ..: .: . :.
CCDS11 NRNGQLLENPRFGKMPLELVRKPISQSQISEFSFLGSNWDSFQGMVTSFPSGEATPRRLL
870 880 890 900 910 920
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 CNGAPETENRASEQPPGLSTLQMYPTPNGHCANGEAGRSKDSLSRQLSAMSCSSAHLHSR
: :..: .. :: : : : .:. .. . : : : :..: .
CCDS11 SYGC------CSKRP---NSKQMRAT--GPCFGGQWAQREGVKSPVCS--SHSNGHCTGP
930 940 950 960 970
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 NLHHK-WLHSH-----SGRPSATSSPDQPSRSHLDDDGMSVYTDTIQQRLRQIESGHQQE
. ... :: :: : .: . :. .:::::. ::.::.::::::.:..::
CCDS11 GGKNQMWLSSHPKQVSSTKPVPLNCPSPVPPLYLDDDGLPFPTDVIQHRLRQIEAGYKQE
980 990 1000 1010 1020 1030
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 VETLKKQVQELKSRLESQYLTSS-LHFNGDFGDEVTSIPDSESNLDQNCLSRCSTEIFSE
:: :..::.::. ::. .. . . :. :. : . .:... .. : : . .::
CCDS11 VEQLRRQVRELQMRLDIRHCCAPPAEPPMDYEDDFTCLKESDGSDTEDFGSDHSEDCLSE
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 ASWEQVDKQDTEMTRWLPDHLAAHCYACDSAFWLASRKHHCRNCGNVFCSSCCNQKVPVP
:::: :::..::.:::.:::.:.::: :: ::::.:.:::::::::::..::. :.:.:
CCDS11 ASWEPVDKKETEVTRWVPDHMASHCYNCDCEFWLAKRRHHCRNCGNVFCAGCCHLKLPIP
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1170 1180 1190
pF1KA0 SQQLFEPSRVCKSCYSSLHPTSSS--IDLELDKPIAATSN
.:::..: ::.::: .. . . .. .: ::::..:.
CCDS11 DQQLYDPVLVCNSCYEHIQVSRARELMSQQLKKPIATASS
1160 1170 1180 1190
>>CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 (571 aa)
initn: 1199 init1: 934 opt: 966 Z-score: 875.2 bits: 172.9 E(32554): 2e-42
Smith-Waterman score: 1178; 38.3% identity (62.2% similar) in 561 aa overlap (44-588:25-523)
20 30 40 50 60
pF1KA0 ANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRLHIKFKES----LV
:.: : . ....::::..: : ..
CCDS83 MEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTG-AVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NVPLQLIESVEC--------RDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWL-KRLNNAIRP
.. : .:. :: .. . :. .::: . .: . . .. . . : . :
CCDS83 DASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
.. ::.: :. ::. :. : : : .:.:. :..:::..
CCDS83 VSNNLPLFAFEYK----EVFP---ENGWKLYDP--------LLEYRRQGIP-NESWRITK
120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
:::.:.:: .:: :.::: : :.::. :.:::: :::.. . : . :.:.::.:: :
CCDS83 INERYELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNAS
. : :. .::. .:.. :::
CCDS83 GVSGKRSKEDEKYLQAIMD-------------------------------------SNA-
220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQ
: .:..:.::: . ::::.::::: : . : : :.::. . ::: .:.:..
CCDS83 -------QSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLR
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWDRT
.:. . . .::: ::::.::.:....: .:: .. :.. . :.::::::::::
CCDS83 KLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRT
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWL
:...:: :.:: :::::.::.:::: :::.:::.: : :::... .: :::::..
CCDS83 AQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFI
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWSLL
::: :. :::: .::::: ::. ...: :::::::::::. ..::... .:: :.:: .
CCDS83 DCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLPKRTVSLWSYI
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590
pF1KA0 RAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYL---PCPSPTTPVDDSCAPYPAPG
. . : : ::.: :. ::::: .:.: :: . :. : .: :. .
CCDS83 NSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPIHNRYKELLAKR
480 490 500 510 520 530
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 TSPDDPPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAGPG
CCDS83 AELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
540 550 560 570
>>CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 (643 aa)
initn: 1199 init1: 934 opt: 966 Z-score: 874.5 bits: 172.9 E(32554): 2.2e-42
Smith-Waterman score: 1178; 38.3% identity (62.2% similar) in 561 aa overlap (44-588:97-595)
20 30 40 50 60
pF1KA0 ANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRLHIKFKES----LV
:.: : . ....::::..: : ..
CCDS83 SNKLAEMEEPPLLPGENIKDMAKDVTYICPFTG-AVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVL
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NVPLQLIESVEC--------RDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWL-KRLNNAIRP
.. : .:. :: .. . :. .::: . .: . . .. . . : . :
CCDS83 DASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFP
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISN
.. ::.: :. ::. :. : : : .:.:. :..:::..
CCDS83 VSNNLPLFAFEYK----EVFP---ENGWKLYDP--------LLEYRRQGIP-NESWRITK
190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 INEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEV
:::.:.:: .:: :.::: : :.::. :.:::: :::.. . : . :.:.::.:: :
CCDS83 INERYELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMV
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SWWGWRNADDEHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNAS
. : :. .::. .:.. :::
CCDS83 GVSGKRSKEDEKYLQAIMD-------------------------------------SNA-
290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQ
: .:..:.::: . ::::.::::: : . : : :.::. . ::: .:.:..
CCDS83 -------QSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLR
320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWDRT
.:. . . .::: ::::.::.:....: .:: .. :.. . :.::::::::::
CCDS83 KLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWL
:...:: :.:: :::::.::.:::: :::.:::.: : :::... .: :::::..
CCDS83 AQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWSLL
::: :. :::: .::::: ::. ...: :::::::::::. ..::... .:: :.:: .
CCDS83 DCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLPKRTVSLWSYI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KA0 RAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYL---PCPSPTTPVDDSCAPYPAPG
. . : : ::.: :. ::::: .:.: :: . :. : .: :. .
CCDS83 NSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEPIHNRYKELLAKR
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 TSPDDPPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAGPG
CCDS83 AELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
610 620 630 640
>>CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX (603 aa)
initn: 1178 init1: 904 opt: 910 Z-score: 824.4 bits: 163.6 E(32554): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 1125; 37.1% identity (63.6% similar) in 539 aa overlap (53-577:63-539)
30 40 50 60 70
pF1KA0 LIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRLHIKFKES----LVNVPLQLIES
. ..::::... :. ...::: .:
CCDS14 EAVPRLPGETLITDKEVIYICPFNGPIKGRVYITNYRLYLRSLETDSSLILDVPLGVISR
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 VEC--------RDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWLKRLNNAIRPPAKIEDLFSF
.: .. . : .:::: . .: :. ::. ... : .: ..:
CCDS14 IEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLR--FA--------LKQEGHSRRDMFEILTRYAF
100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 AYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRISNINEKYKLCGS
: . ..: .:.. .. : : . . : .:.:. :. :::. ::. :.:: .
CCDS14 PL-AHSLPLFAFLNEEKFNV--DGWTVYNPVE-EYRRQGLP-NHHWRITFINKCYELCDT
150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 YPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQPEVSWWGWRNADD
:: :.:: .: .:. :..::: .:::.. . : : .::.::.:: :. : :: ::
CCDS14 YPALLVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDD
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 EHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSNASGAESLAIQPQ
:. .. . :.:.. : .
CCDS14 EKYLDVI-----------------RETNK----------------------------QIS
260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 KLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRSFQSLRLLCTQMP
:: : ::: . ::::.: ::: : . : : :. :. . ::: .:.:..... .
CCDS14 KLTIYDARPSVNAVANKATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIVYPNV
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 DPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWDRTPQIVALAKLL
. ..:::.::::.::.:....: .:. :. :.. . :::::::::::: :...:: :.
CCDS14 EESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSLAMLM
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 LDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQWLDCVHQLQRQF
:: .::.::::..::. ::..::::::.: :::... .: :.:::..::: :...::
CCDS14 LDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFASRIGHGDKNHTDADRSPIFLQFIDCVWQMSKQF
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540
pF1KA0 PCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFL--CNNAKERGEKHTQERTCSVWSLLRAGNKAFK
: .::::: ::. ...: ::: ::::: :..:.:: ... ::: :.:::. .... ::
CCDS14 PTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFGTFLFNCESARER--QKVTERTVSLWSLINSNKEKFK
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 NLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPTTPVDDSCAPYPAPGTSPDDPPLSRL
: .:... . ::::: .:.: :: :.
CCDS14 NPFYTKEINRVLYPVASMRHLELWVNYYIRWNPRIKQQQPNPVEQRYMELLALRDEYIKR
520 530 540 550 560 570
>>CCDS14695.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (665 aa)
initn: 1098 init1: 870 opt: 885 Z-score: 801.2 bits: 159.4 E(32554): 2.6e-38
Smith-Waterman score: 1069; 34.4% identity (60.8% similar) in 561 aa overlap (44-586:119-614)
20 30 40 50 60
pF1KA0 ANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRLHIKFKES----LV
:.: : .. .......:..: : ..
CCDS14 GNKLAQMEEAPLFPGESIKAIVKDVMYICPFMG-AVSGTLTVTDFKLYFKNVERDPHFIL
90 100 110 120 130 140
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NVPLQLIESVECRDIFQLH--------LTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWL-KRLNNAIRP
.::: .: :: . : : ..::: . .: .. :: . . . ::. :
CCDS14 DVPLGVISRVE-KIGAQSHGDNSCGIEIVCKDMRNLRLAYKQEEQSKLGIFENLNKHAFP
150 160 170 180 190 200
130 140 150 160 170
pF1KA0 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRP--GEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRI
.. . ::.:.: ::. : : .: . .: .:.:. :..:.:
CCDS14 LSNGQALFAFSY-----------KEKF-----PINGWKVYDPV-SEYKRQGLP-NESWKI
210 220 230 240
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 SNINEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQP
:.:: .:..: .:: ..::. . : .: .:..::. :.:.. . : . :.:.::.::
CCDS14 SKINSNYEFCDTYPAIIVVPTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSWIHPESQATITRCSQP
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 EVSWWGWRNADDEHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSN
:. : .::. .:.. : :
CCDS14 LVGPNDKRCKEDEKYLQTIMDANA------------------------------------
310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ASGAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRS
: .::.:.:::. ..: .:..:::: : ::: :.::. . ::: .:.:
CCDS14 ---------QSHKLIIFDARQNSVADTNKTKGGGYESESAYPNAELVFLEIHNIHVMRES
340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 FQSLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWD
...:. . : . ::: ...:.::... .:: .:. .. ... . :.::::::::
CCDS14 LRKLKEIVYPSIDEARWLSNVDGTHWLEYIRMLLAGAVRIADKIESGKTSVVVHCSDGWD
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 RTPQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQ
:: :...:: :.:: :::::.::..::: ::..:::.:: : :::... .: :.:::
CCDS14 RTAQLTSLAMLMLDSYYRTIKGFETLVEKEWISFGHRFALRVGHGNDNHADADRSPIFLQ
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 WLDCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWS
..::: :. :::: .::::: ::. ...: ::::::::::: ..: .. . .: :.::
CCDS14 FVDCVWQMTRQFPSAFEFNELFLITILDHLYSCLFGTFLCNCEQQRFKEDVYTKTISLWS
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 LLRAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYL---PCPSPTTPVDDSCAPYPA
. . :.: .. . . ::::: . .: :: :. : : :.
CCDS14 YINSQLDEFSNPFFVNYENHVLYPVASLSHLELWVNYYVRWNPRMRPQMPIHQNLKELLA
570 580 590 600 610 620
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 PGTSPDDPPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAG
CCDS14 VRAELQKRVEGLQREVATRAVSSSSERGSSPSHSATSVHTSV
630 640 650 660
>>CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (673 aa)
initn: 1098 init1: 870 opt: 885 Z-score: 801.1 bits: 159.4 E(32554): 2.7e-38
Smith-Waterman score: 1069; 34.4% identity (60.8% similar) in 561 aa overlap (44-586:127-622)
20 30 40 50 60
pF1KA0 ANQIFPRKQLIREDENLQVPFLELHGESTEFVGRAEDAIIALSNYRLHIKFKES----LV
:.: : .. .......:..: : ..
CCDS78 GNKLAQMEEAPLFPGESIKAIVKDVMYICPFMG-AVSGTLTVTDFKLYFKNVERDPHFIL
100 110 120 130 140 150
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 NVPLQLIESVECRDIFQLH--------LTCKDCKVIRCQFSTFEQCQEWL-KRLNNAIRP
.::: .: :: . : : ..::: . .: .. :: . . . ::. :
CCDS78 DVPLGVISRVE-KIGAQSHGDNSCGIEIVCKDMRNLRLAYKQEEQSKLGIFENLNKHAFP
160 170 180 190 200 210
130 140 150 160 170
pF1KA0 PAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRP--GEHVTSRFKNEVERMGFDMNNAWRI
.. . ::.:.: ::. : : .: . .: .:.:. :..:.:
CCDS78 LSNGQALFAFSY-----------KEKF-----PINGWKVYDPV-SEYKRQGLP-NESWKI
220 230 240 250
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 SNINEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRHQSNGAVIARCGQP
:.:: .:..: .:: ..::. . : .: .:..::. :.:.. . : . :.:.::.::
CCDS78 SKINSNYEFCDTYPAIIVVPTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSWIHPESQATITRCSQP
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 EVSWWGWRNADDEHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGGDLSDVEFDSSLSN
:. : .::. .:.. : :
CCDS78 LVGPNDKRCKEDEKYLQTIMDANA------------------------------------
320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ASGAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVVFMGMANIHSIRRS
: .::.:.:::. ..: .:..:::: : ::: :.::. . ::: .:.:
CCDS78 ---------QSHKLIIFDARQNSVADTNKTKGGGYESESAYPNAELVFLEIHNIHVMRES
350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 FQSLRLLCTQMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQDQRPVLVHCSDGWD
...:. . : . ::: ...:.::... .:: .:. .. ... . :.::::::::
CCDS78 LRKLKEIVYPSIDEARWLSNVDGTHWLEYIRMLLAGAVRIADKIESGKTSVVVHCSDGWD
400 410 420 430 440 450
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 RTPQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGENSDDLNERCPVFLQ
:: :...:: :.:: :::::.::..::: ::..:::.:: : :::... .: :.:::
CCDS78 RTAQLTSLAMLMLDSYYRTIKGFETLVEKEWISFGHRFALRVGHGNDNHADADRSPIFLQ
460 470 480 490 500 510
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 WLDCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKERGEKHTQERTCSVWS
..::: :. :::: .::::: ::. ...: ::::::::::: ..: .. . .: :.::
CCDS78 FVDCVWQMTRQFPSAFEFNELFLITILDHLYSCLFGTFLCNCEQQRFKEDVYTKTISLWS
520 530 540 550 560 570
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 LLRAGNKAFKNLLYSSQSEAVLYPVCHVRNLMLWSAVYL---PCPSPTTPVDDSCAPYPA
. . :.: .. . . ::::: . .: :: :. : : :.
CCDS78 YINSQLDEFSNPFFVNYENHVLYPVASLSHLELWVNYYVRWNPRMRPQMPIHQNLKELLA
580 590 600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 PGTSPDDPPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQEHRRSLELSSLAG
CCDS78 VRAELQKRVEGLQREVATRAVSSSSERGSSPSHSATSVHTSV
640 650 660 670
>>CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX (704 aa)
initn: 969 init1: 370 opt: 802 Z-score: 726.0 bits: 145.6 E(32554): 4.1e-34
Smith-Waterman score: 975; 34.8% identity (62.0% similar) in 503 aa overlap (76-576:63-500)
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 GRAEDAIIALSNYRLHIKFKESLVNVPLQLIESVECRDIFQLHLTCKDCKVIRCQFSTFE
: :. : : : ::. .: . ...
CCDS14 THLIYVEASGAARKETWIALHHIATVEKLPITSLGC----PLTLRCKNFRVAHFVLDSDL
40 50 60 70 80
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 QCQEWLKRLNNAIRPPAKIEDLFSFAYHAWCMEVYASEKEQHGDLCRPGEHVTSRFKNEV
:.: : . . :: :::..:.:. . .:. : : : :
CCDS14 VCHEVYISLLK-LSQPALPEDLYAFSYNP---KSSKEMRESGWKLIDP----ISDFG---
90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 ERMGFDMNNAWRISNINEKYKLCGSYPQELIVPAWITDKELESVSSFRSWKRIPAVIYRH
:::. : : :.. :..:..:..:: :..:: .: . . :.::: .:.:.. : .
CCDS14 -RMGIP-NRNWTITDANRNYEICSTYPPEIVVPKSVTLGTVVGSSKFRSKERVPVLSYLY
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 QSNGAVIARCGQPEVSWWGWRNADDEHLVQSVAKACASDSRSSGSKLSTRNTSRDFPNGG
. :.:.: ::.:: .: . : .::: :....... . ::..
CCDS14 KENNAAICRCSQP-LSGFYTRCVDDELLLEAISQT------NPGSQF-------------
200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 DLSDVEFDSSLSNASGAESLAIQPQKLLILDARSYAAAVANRAKGGGCECPEYYPNCEVV
. ..:.: :.:::: : : : . : : .
CCDS14 --------------------------MYVVDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYANIRFR
240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 FMGMANIHSIRRSFQSLRLLCT-QMPDPGNWLSALESTKWLHHLSVLLKSALLVVHAVDQ
:::. ::: .: :.:.: .: . : ...::.:::. ::.:..... .......::
CCDS14 FMGIENIHVMRSSLQKLLEVCELKTPTMSEFLSGLESSGWLRHIKAIMDAGIFITKAVKV
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 DQRPVLVHCSDGWDRTPQIVALAKLLLDPYYRTIEGFQVLVEMEWLDFGHKFADRCGHGE
.. :::::::::::: :. ..:..::::.:::..:...:.: ::...::::..:::: .
CCDS14 EKASVLVHCSDGWDRTAQVCSVASILLDPFYRTFKGLMILIEKEWISMGHKFSQRCGHLD
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 NSDDLNERCPVFLQWLDCVHQLQRQFPCSFEFNEAFLVKLVQHTYSCLFGTFLCNNAKER
. : .: :.: :.:::. ::..::::.::::: ::... .:..:: ::.:: : :.:
CCDS14 G--DSKEVSPIFTQFLDCIWQLMEQFPCAFEFNENFLLEIHDHVFSCQFGNFLGNCQKDR
390 400 410 420 430 440
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 GEKHTQERTCSVWSLLRAGNKAFKNLLYSSQSE-AVLYPVCHVRNLMLWSAVYLPCPSPT
. .. :.: ::: .: . :.: ::.. . .:: : :...: ..:
CCDS14 EDLRVYEKTHSVWPFLVQRKPDFRNPLYKGFTMYGVLNPSTVPYNIQFWCGMYNRFDKGL
450 460 470 480 490 500
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 TPVDDSCAPYPAPGTSPDDPPLSRLPKTRSYDNLTTACDNTVPLASRRCSDPSLNEKWQE
CCDS14 QPKQSMLESLLEIKKQRAMLETDVHELEKKLKVRDEPPEEICTCSQLGNILSQHLGSPLT
510 520 530 540 550 560
1198 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 09:30:24 2016 done: Thu Nov 3 09:30:25 2016
Total Scan time: 5.610 Total Display time: 0.380
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]