FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0382, 1544 aa 1>>>pF1KA0382 1544 - 1544 aa - 1544 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9437+/-0.00122; mu= 12.1761+/- 0.074 mean_var=172.8320+/-34.539, 0's: 0 Z-trim(107.8): 131 B-trim: 156 in 1/50 Lambda= 0.097558 statistics sampled from 9693 (9833) to 9693 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.302), width: 16 Scan time: 3.780 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1544) 10158 1443.5 0 CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1525) 9750 1386.1 0 CCDS76487.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1441) 9491 1349.6 0 CCDS1162.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1522) 1687 251.3 1.8e-65 CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1562) 1682 250.6 2.9e-65 CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 879) 1259 190.8 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 QLLVQQLGLTEKSVQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTG 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA0 DIATCYSPRTSTESFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 DIATCYSPRTSTESFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEH 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA0 FFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 FFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQ 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KA0 PMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 PMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQ 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1510 1520 1530 1540 pF1KA0 SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS 1490 1500 1510 1520 >>CCDS76487.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1441 aa) initn: 9491 init1: 9491 opt: 9491 Z-score: 7225.5 bits: 1349.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9491; 100.0% identity (100.0% similar) in 1441 aa overlap (104-1544:1-1441) 80 90 100 110 120 130 pF1KA0 IIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVVKL :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 MRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVVKL 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KA0 IKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPGASGNMERITSPVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 IKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPGASGNMERITSPVL 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 250 pF1KA0 MGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQEAKKHIPQLQEQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 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CCDS76 NDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRDLFVAER 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KA0 QFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQLGLTEKS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 QFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQLGLTEKS 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KA0 VQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTGDIATCYSPRTSTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 VQEDWQHFPRYRTASQGPQTDSVIQNSENIKAYHSGEGHMPFRTGTGDIATCYSPRTSTE 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KA0 SFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDENP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 SFAPRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDENP 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KA0 SEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQPMTGIPAVESTHQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 SEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQPMTGIPAVESTHQ 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KA0 QQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQSQIMEYIHKIEAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 QQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQSQIMEYIHKIEAD 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1520 1530 1540 pF1KA0 LEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 LEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS 1420 1430 1440 >>CCDS1162.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1522 aa) initn: 1744 init1: 621 opt: 1687 Z-score: 1289.0 bits: 251.3 E(32554): 1.8e-65 Smith-Waterman score: 2308; 33.2% identity (61.6% similar) in 1570 aa overlap (34-1533:7-1455) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 TQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTDSSSKKTKSSSEESR- :...:..: .. .:. . :: :.. . CCDS11 MSVRLPQSIDRLSS--LSSLGDSAPERKSPSHHRQP 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KA0 ---SEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNG :: ::::::::::::..:::.::::: :.::::. ::::.:::. ::::::::: CCDS11 SDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNG 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 TLVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSP :.::.:.:::::::::::.:::::. : :.: : ... :. ... .. :: : CCDS11 TMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPP 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 GASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEI .:::.: . .. :... ..:::.::..:...:: . :. : .:: CCDS11 PPLPPPQRITGPKPL--QDPEVQKHATQILRNMLRQEEKELQDILPLYGDT-SQR----P 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 QEAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDA .:.. . :. :. :.. : : ..::. . ..:: CCDS11 SEGRLSLD------SQEGDSGLDSG--TERFP-----SLSESLMNRNSVL---------- 210 220 230 240 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 SRPSSDNADSPKSGP--KERIYLEENPEKSET-IQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDD :. . :::...: :. .. . :.. . .: :.. ::. : ::: :.: CCDS11 ---SDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK----PLIIGPEED 250 260 270 280 290 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 -DFGTEHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNS : : ... . ::..: ::::::::.:::... :: ::. :: :: ...:.... CCDS11 YDPGYFNNESD---IIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASP 300 310 320 330 340 350 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 KETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPE :..: . .. ..::...: :.:..:. ..:....: . :: : . :: . :: CCDS11 KDSRSLGKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN--SEDA-RGVLCEAQEAAMPE 360 370 380 390 400 410 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 VQRHLEDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQA .:....:.: ::..:: .: :: . : : :: ::. .: . ..: . CCDS11 IQEQIHDYRTKRTLGLGSLYGENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAALGDIL---SK 420 430 440 450 460 540 550 560 570 580 pF1KA0 VEEDKSSTMQYVILMYMKHLGVKVKE--PRNLEHKRGR-------IGFLPKIKQSM--KK :::.:. :.... ::.: :....: : : .: . :.:: :.: :: CCDS11 YEEDRSAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKK 470 480 490 500 510 520 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 DKEGEEKGKRRGFPSILGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLSTPSSV-SPEP .:.. : :: . . .: :. :. .:.. ..:. .:. . .. .::: CCDS11 EKDALEDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEP 530 540 550 560 570 580 650 660 670 680 pF1KA0 QDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGASFSQEGGKE--------------NDTG . .: ... .. .. .: : . : : : .: .: .:. CCDS11 -GTQRLSTGSFPEDLLESD----SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVD 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KA0 SKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDS ..:.. .. ... .:.: .. : ::. . .. ... .: : . CCDS11 MDAAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSIESPSLGFCT 640 650 660 670 680 750 760 770 780 790 800 pF1KA0 VAFGESQSEDEQFE-NDLETDPP--NWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVINELFYTERAH .. ::. . .::: .: :::. :...:. :: :: ::::::::: :: .: CCDS11 DTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASH 690 700 710 720 730 740 810 820 830 840 850 860 pF1KA0 VRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVRKRNETSVID .:::.::: .::::...:... :: ..: :: .....: . : :: .:. : .: CCDS11 LRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLRE--EGPIIK 750 760 770 780 790 800 870 880 890 900 910 920 pF1KA0 QIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCR .:.. .:. :.::..:.:...:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.:.:::.: :: CCDS11 EISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCR 810 820 830 840 850 860 930 940 950 960 970 980 pF1KA0 RLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPT-EREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEA ::::.:.: ..:::::::::::..: :.:: : :.::. .: :.::.::.:::.:::.. CCDS11 RLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQT 870 880 890 900 910 920 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KA0 ENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTL ::..::: ::.:::...:. . : . :...:::: :::::::::.:....:::.::..: CCDS11 ENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVL 930 940 950 960 970 980 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KA0 LLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVIS ::::.::::::::..:.:.:::: ....:::.:::::.::..::.:.::::..:.:.: CCDS11 LLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIIC 990 1000 1010 1020 1030 1040 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KA0 MSDNGA-QIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMA-ASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDP : : ::::::: : :.:..:..:. . . .... .. :.:. :: . .. : CCDS11 TSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGP 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KA0 SKLKEEQHGISVT-GLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSL----STSGKSEVRDLFVAERQ . . : .: : :.. : .. . . . : :..: ..: : CCDS11 TPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLP-- 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KA0 FAKEQHTDGTLKEVG--EDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQL--GLT :: . . . ..:.: :. : : .::... :..:.. .: : : CCDS11 -CPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHT 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA0 --EKSVQE---DWQHFPRYRTASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EGHMPFRTGTG ...:: : : .... : . .. ..:. .. .: ::. : . CCDS11 METQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQE--- 1230 1240 1250 1260 1270 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KA0 DIATC----YSPRTSTESF--APRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGL :.. : ::: . .. .:. . .:: .:..... ... :. . .: CCDS11 DMGLCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPAL 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KA0 DDSGEHFFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQESSTDEEVA .::. :. .: : .:.. . .:: . .. . .::::. : CCDS11 PESGQ---------SEPGPPEVEGGT---------KATGNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEA 1340 1350 1360 1370 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KA0 SSLTLQPMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPS ::. : .: : :: . : .: : .:: CCDS11 ------PMSP-PQPDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS-----------------RSPP 1380 1390 1400 1410 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA0 SCADSQ-SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS : : . ..:.. :... :..:: .: .. : . :.: CCDS11 SLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWT 1420 1430 1440 1450 1460 1470 CCDS11 DGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASPGP 1480 1490 1500 1510 1520 >>CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1562 aa) initn: 1880 init1: 621 opt: 1682 Z-score: 1285.1 bits: 250.6 E(32554): 2.9e-65 Smith-Waterman score: 2441; 33.9% identity (62.4% similar) in 1579 aa overlap (34-1533:7-1495) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 TQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTDSSSKKTKSSSEESR- :...:..: .. .:. . :: :.. . CCDS11 MSVRLPQSIDRLSS--LSSLGDSAPERKSPSHHRQP 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KA0 ---SEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNG :: ::::::::::::..:::.::::: :.::::. ::::.:::. ::::::::: CCDS11 SDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNG 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 TLVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSP :.::.:.:::::::::::.:::::. : :.: : ... :. ... .. :: : CCDS11 TMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPP 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 GASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEI .:::.: . .. :... ..:::.::..:...:: . : :.:.::. : ..: CCDS11 PPLPPPQRITGPKPL--QDPEVQKHATQILRNMLRQEEKELQRICEVYSRNPASLLEEQI 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 QEAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVV---TPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSS . :.... ::: .... ::.. : . : .:: :... : : : : : CCDS11 EGARRRVTQLQLKIQQETGGSVDILPLYGDTSQRPSEGRLSLDSQEGDSGLDSGTERFPS 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KA0 GDAS---RPS--SDNA-DSPKSGP--KERIYLEENPEKSET-IQDTDTQSLVGSPSTRIA . : : : :: . :::...: :. .. . :.. . .: :.. ::. CCDS11 LSESLMNRNSVLSDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK---- 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 PHIIGAEDD-DFGTEHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLY : ::: :.: : : ... . ::..: ::::::::.:::... :: ::. :: :: CCDS11 PLIIGPEEDYDPGYFNNESD---IIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLC 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 SDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQ ...:.... :..: . .. ..::...: :.:..:. ..:....: . :: : . CCDS11 AEVYQQASPKDSRSLGKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN--SEDA-RGVLC 390 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 TMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKI :: . ::.:....:.: ::..:: .: :: . : : :: ::. .: . CCDS11 EAQEAAMPEIQEQIHDYRTKRTLGLGSLYGENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAAL 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 pF1KA0 EEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHLGVKVKE--PRNLEHKRGR-------IGFLPK ..: . :::.:. :.... ::.: :....: : : .: . :.:: CCDS11 GDIL---SKYEEDRSAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPK 500 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 630 pF1KA0 IKQSM--KKDKEGEEKGKRRGFPSILGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLST :.: ::.:.. : :: . . .: :. :. .:.. ..:. .:. . CCDS11 TKKSSNSKKEKDALEDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFEN 560 570 580 590 600 610 640 650 660 670 680 pF1KA0 PSSV-SPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGASFSQEGGKE--------- .. .::: . .: ... .. .. .: : . : : : .: .: CCDS11 NQQYDAPEP-GTQRLSTGSFPEDLLESD----SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAEN 620 630 640 650 660 690 700 710 720 730 pF1KA0 -----NDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGT .:. ..:.. .. ... .:.: .. : ::. . .. ... CCDS11 VPRSRSDVDMDAAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSI 670 680 690 700 710 720 740 750 760 770 780 790 pF1KA0 PKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFE-NDLETDPP--NWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVIN .: : . .. ::. . .::: .: :::. :...:. :: :: :::::: CCDS11 ESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVIN 730 740 750 760 770 780 800 810 820 830 840 850 pF1KA0 ELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVR ::: :: .:.:::.::: .::::...:... :: ..: :: .....: . : :: .: CCDS11 ELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLR 790 800 810 820 830 840 860 870 880 890 900 910 pF1KA0 KRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQ . : .: .:.. .:. :.::..:.:...:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.: CCDS11 E--EGPIIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQ 850 860 870 880 890 920 930 940 950 960 970 pF1KA0 DAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPT-EREKVKKAADHCRQILN .:::.: ::::::.:.: ..:::::::::::..: :.:: : :.::. .: :.::.::. CCDS11 EAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILK 900 910 920 930 940 950 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KA0 YVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNR :::.:::..::..::: ::.:::...:. . : . :...:::: :::::::::.:.... CCDS11 YVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISK 960 970 980 990 1000 1010 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA0 DKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVAT :::.::..:::::.::::::::..:.:.:::: ....:::.:::::.::..::.:.::: CCDS11 DKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVAT 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KA0 DNKALFVISMSDNGA-QIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMA-ASVKEQSTKPIPLPQSTPG :..:.:.: : : ::::::: : :.:..:..:. . . .... .. :.:. :: CCDS11 DKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPG 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 EGDNDEEDPSKLKEEQHGISVT-GLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSL----STSGKSEV . .. :. . : .: : :.. : .. . . . : :..: CCDS11 PREPAQQGPTPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEE 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA0 RDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVG--EDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLL ..: : :: . . . ..:.: :. : : .::... :..:. CCDS11 EELGVLP---CPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLI 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KA0 VQQL--GLT--EKSVQE---DWQHFPRYRTASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EG . .: : : ...:: : : .... : . .. ..:. .. .: :: CCDS11 LWSLLPGHTMETQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEG 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KA0 HMPFRTGTGDIATC----YSPRTSTESF--APRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEM . : . :.. : ::: . .. .:. . .:: .:..... ... :. CCDS11 ERPEQE---DMGLCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEV 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KA0 PTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGNYLILDGYDPVQ . .: .::. :. .: : .:.. . .:: . .. . CCDS11 AGSKVVPALPESGQ---------SEPGPPEVEGGT---------KATGNCFYVSMPSGPP 1370 1380 1390 1400 1410 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA0 ESSTDEEVASSLTLQPMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEY .::::. : ::. : .: : :: . : .: : CCDS11 DSSTDHSEA------PMSP-PQPDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS------------ 1420 1430 1440 1450 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA0 SCFEIQSPSSCADSQ-SQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS .:: : : . ..:.. :... :..:: .: .. : . :.: CCDS11 -----RSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGS 1460 1470 1480 1490 1500 CCDS11 FHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASPGP 1510 1520 1530 1540 1550 1560 >>CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 (879 aa) initn: 1606 init1: 1008 opt: 1259 Z-score: 966.8 bits: 190.8 E(32554): 1.6e-47 Smith-Waterman score: 1647; 39.2% identity (65.9% similar) in 812 aa overlap (350-1149:23-744) 320 330 340 350 360 370 pF1KA0 LEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGTEHEQING-QCSCFQSIELL ::::::.:: .: : . : : :::.: . CCDS12 MEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQV 10 20 30 40 50 380 390 400 410 420 430 pF1KA0 KSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKV : ::::: ..:.::. ::.:. :. :.: CCDS12 KRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLV---------------------------------LRV 60 70 440 450 460 470 480 490 pF1KA0 SVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAESEL :: ... .:.. : .:: ::..:...: . . . : :.:::::.:: ::.: :.:: CCDS12 PVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQEL 80 90 100 110 120 130 500 510 520 530 540 550 pF1KA0 TKLDAERDKDRLTLE-KERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHLGV ..:.: .:: . : .:: ::... ..::. : ...:.::... .: .::.:::: CCDS12 AQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTI-STDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGV 140 150 160 170 180 190 560 570 580 590 600 pF1KA0 KVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSIL-------GPPRRPS-R ..: ..: :: : :. . ..:. .. : .:. ::: : :. :. : CCDS12 RTKSG---DKKSGRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTK---KGLSSILDAARWNRGEPQVPDFR 200 210 220 230 240 250 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 HDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSV : .. . :..: . ..:. :. :. ... : :. :. :. . CCDS12 HLKAEVD-------AEKPGATDRKGGVG-MPS-----RDRNIGAPGQDT---PGVSLHPL 260 270 280 290 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 ASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVE : : ..: : . ..:..: : : .:... :: :. : : CCDS12 -SLDSPDREPGADAPL---ELGDSSPQG------PMSLESL--APPESTDEGAETE---- 300 310 320 330 340 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 RVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQ .:.: : :.: : : : ::.:..:: ..: .: ..::: CCDS12 ------SPEP---GDEGEPGRSGLELEPEE------PPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQ 350 360 370 380 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 EVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSP-SELRKIFSNLEDILQLH-IGLNE :::.::. :: :::: :.:: ..:.: .. : .. : ::..:: .:......: . :.. CCDS12 EVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMA-ECLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDR 390 400 410 420 430 440 850 860 870 880 890 900 pF1KA0 QMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSR :: :... .:..::. ::. :.: ... .. ::: : ::::..:..:.:: : CCDS12 LMK--RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPR 450 460 470 480 490 500 910 920 930 940 950 960 pF1KA0 FQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHC : .:::.::: : ::::::::.:::.:::::::::::..:.. :: :::::::. ::. : CCDS12 FCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECC 510 520 530 540 550 560 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 RQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLV :.::..:::::.. :. ::.::::::: : :. : : . :..:::.::.:..:::::. CCDS12 REILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLT 570 580 590 600 610 620 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA0 WKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLV :.:..::......:::.:.:.:::.::.::.:. ::. :. : :.: . ::..:..... CCDS12 WRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMT 630 640 650 660 670 680 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 RQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQS :.::::.::..:. :. :::::::::::::. : :: . :.:.: . : :. CCDS12 REVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRP 690 700 710 720 730 740 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 TPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRD .: CCDS12 SPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLK 750 760 770 780 790 800 >>CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 (912 aa) initn: 1755 init1: 1008 opt: 1259 Z-score: 966.6 bits: 190.9 E(32554): 1.6e-47 Smith-Waterman score: 1811; 40.6% identity (68.8% similar) in 812 aa overlap (350-1149:23-777) 320 330 340 350 360 370 pF1KA0 LEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGTEHEQING-QCSCFQSIELL ::::::.:: .: : . : : :::.: . CCDS12 MEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQV 10 20 30 40 50 380 390 400 410 420 430 pF1KA0 KSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKV : ::::: ..:.::. ::.:. ::: :..:. . ::... ::.:.. ::...: :.: CCDS12 KRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLEKTAVLRV 60 70 80 90 100 110 440 450 460 470 480 490 pF1KA0 SVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAESEL :: ... .:.. : .:: ::..:...: . . . : :.:::::.:: ::.: :.:: CCDS12 PVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQEL 120 130 140 150 160 170 500 510 520 530 540 550 pF1KA0 TKLDAERDKDRLTLE-KERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHLGV ..:.: .:: . : .:: ::... ..::. : ...:.::... .: .::.:::: CCDS12 AQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTI-STDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGV 180 190 200 210 220 230 560 570 580 590 600 pF1KA0 KVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEGEEKGKRRGFPSIL-------GPPRRPS-R ..: ..: :: : :. . ..:. .. : .:. ::: : :. :. : CCDS12 RTKSG---DKKSGRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTK---KGLSSILDAARWNRGEPQVPDFR 240 250 260 270 280 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 HDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSV : .. . :..: . ..:. :. :. ... : :. :. :. . CCDS12 HLKAEVD-------AEKPGATDRKGGVG-MPS-----RDRNIGAPGQDT---PGVSLHPL 290 300 310 320 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 ASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVE : : ..: : . ..:..: : : .:... :: :. : : CCDS12 -SLDSPDREPGADAPL---ELGDSSPQG------PMSLESL--APPESTDEGAETE---- 330 340 350 360 370 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 RVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQ .:.: : :.: : : : ::.:..:: ..: .: ..::: CCDS12 ------SPEP---GDEGEPGRSGLELEPEE------PPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQ 380 390 400 410 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 EVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSP-SELRKIFSNLEDILQLH-IGLNE :::.::. :: :::: :.:: ..:.: .. : .. : ::..:: .:......: . :.. CCDS12 EVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMA-ECLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDR 420 430 440 450 460 470 850 860 870 880 890 900 pF1KA0 QMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSR :: :... .:..::. ::. :.: ... .. ::: : ::::..:..:.:: : CCDS12 LMK--RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPR 480 490 500 510 520 530 910 920 930 940 950 960 pF1KA0 FQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHC : .:::.::: : ::::::::.:::.:::::::::::..:.. :: :::::::. ::. : CCDS12 FCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECC 540 550 560 570 580 590 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 RQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLV :.::..:::::.. :. ::.::::::: : :. : : . :..:::.::.:..:::::. CCDS12 REILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLT 600 610 620 630 640 650 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA0 WKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLV :.:..::......:::.:.:.:::.::.::.:. ::. :. : :.: . ::..:..... CCDS12 WRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMT 660 670 680 690 700 710 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 RQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQS :.::::.::..:. :. :::::::::::::. : :: . :.:.: . : :. CCDS12 REVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRP 720 730 740 750 760 770 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 TPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRD .: CCDS12 SPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLK 780 790 800 810 820 830 >>CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 (927 aa) initn: 1755 init1: 1008 opt: 1259 Z-score: 966.5 bits: 190.9 E(32554): 1.6e-47 Smith-Waterman score: 1818; 40.0% identity (67.9% similar) in 841 aa overlap (323-1149:9-792) 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 DCSSGDASRPSSDNADSPKSGPKERIYLEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTR-IAP-HI .: . . ..: . .:: ..: : CCDS12 MASLSTWSSPAEPREMEDFARGAASPGPSRPGLVPVSI 10 20 30 360 370 380 390 400 pF1KA0 IGAEDDDFGTEHEQING-QCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDL :::::.:: .: : . : : :::.: .: ::::: ..:.::. ::.:. ::: :..:. CCDS12 IGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADM 40 50 60 70 80 90 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 YKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQ . ::... ::.:.. ::...: :.: :: ... .:.. : .:: ::..:...: . CCDS12 LGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLEKTAVLRVPVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVV 100 110 120 130 140 150 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 ERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLE-KERTCAEQIVAKIEE . . : :.:::::.:: ::.: :.::..:.: .:: . : .:: ::... ..:: CCDS12 QSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEE 160 170 180 190 200 210 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 VLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHLGVKVKEPRNLEHKRGRIGFLPKIKQSMKKDKEG . : ...:.::... .: .::.::::..: ..: :: : :. . ..:. . CCDS12 MQHTI-STDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSG---DKKSGRNFFRKKVMGNRRSDEPA 220 230 240 250 260 270 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 EEKGKRRGFPSIL-------GPPRRPS-RHDNSAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEP . : .:. ::: : :. :. :: .. . :..: . ..:. CCDS12 KTK---KGLSSILDAARWNRGEPQVPDFRHLKAEVD-------AEKPGATDRKGGVGMPS 280 290 300 310 320 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 QDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTL .: :. : : :. :. :. . : : ..: : . ..:..: : CCDS12 RD----RNIG--APGQDT---PGVSLHPL-SLDSPDREPGADAPL---ELGDSSPQG--- 330 340 350 360 710 720 730 740 750 760 pF1KA0 DGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFEN : .:... :: :. : : .:.: : :.: : : : CCDS12 ---PMSLESL--APPESTDEGAETE----------SPEPG---DEGEPGRSGLELEPEE- 370 380 390 400 770 780 790 800 810 820 pF1KA0 DLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSRE ::.:..:: ..: .: ..::::::.::. :: :::: :.:: ..:.: .. : CCDS12 -----PPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMA-E 410 420 430 440 450 460 830 840 850 860 870 pF1KA0 GILSP-SELRKIFSNLEDILQLH-IGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEE .. : ::..:: .:......: . :.. :: :... .:..::. ::. :.: CCDS12 CLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMK--RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGS 470 480 490 500 510 520 880 890 900 910 920 930 pF1KA0 KLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLT ... .. ::: : ::::..:..:.:: :: .:::.::: : ::::::::.:::.::::: CCDS12 WFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLT 530 540 550 560 570 580 940 950 960 970 980 990 pF1KA0 KYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSS ::::::..:.. :: :::::::. ::. ::.::..:::::.. :. ::.::::::: : CCDS12 KYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSH 590 600 610 620 630 640 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KA0 LKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLV :. : : . :..:::.::.:..:::::.:.:..::......:::.:.:.:::.::.::. CCDS12 LRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLL 650 660 670 680 690 700 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KA0 LRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVS :. ::. :. : :.: . ::..:.....:.::::.::..:. :. :::::::::::: CCDS12 LKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVS 710 720 730 740 750 760 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KA0 EKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPD :. : :: . :.:.: . : :. .: CCDS12 ERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRPSPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTER 770 780 790 800 810 820 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KA0 RDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVGEDYQIAIPD CCDS12 ILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSPAR 830 840 850 860 870 880 >>CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 (958 aa) initn: 420 init1: 203 opt: 519 Z-score: 403.4 bits: 86.7 E(32554): 3.8e-16 Smith-Waterman score: 592; 25.5% identity (57.3% similar) in 546 aa overlap (643-1181:80-576) 620 630 640 650 660 670 pF1KA0 SAIGRAMELQKARHPKHLSTPSSVSPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASG :..::.. : ... :..:. . : CCDS11 NRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIRERPSSAIYPSDSFRQSLLG 50 60 70 80 90 100 680 690 700 710 720 730 pF1KA0 ASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVERVT . . :. . . .:.:. :. : : .: : ... :. .... :: . CCDS11 S----RRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRRILSQSTDSLN-MRNRTLSVESLI 110 120 130 140 150 160 740 750 760 770 780 790 pF1KA0 EHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVI . . : ..: .:. :. :.:. .: .:. :. : : .:.:.:: CCDS11 D----------EEVIYSELMSDFEMDEKDFAAD--SWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVI 170 180 190 200 210 800 810 820 830 840 850 pF1KA0 NELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAV ::. :: ::::::.. ..: . .: : :. .. .: .... ..: . :. CCDS11 YELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLER 220 230 240 250 260 270 860 870 880 890 900 pF1KA0 RKR------NETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDS :.. ... :: ..:. :.. ::::. :.. .. . ::: . ::.. : .:. CCDS11 RRQALCPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDK 280 290 300 310 320 330 910 920 930 940 950 960 pF1KA0 RFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEW-PTEREKVKKAAD ::: :.. . . .: ... : ::.::::::.. : .... ::. . : CCDS11 RFQQFIRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALG 340 350 360 370 380 390 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 HCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGP ...:. :.... . :. ::.. :.: . . :. . .: .::.::.: CCDS11 LVKELLSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQ--TPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGC 400 410 420 430 440 450 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA0 LVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTV :.::. . :. .::. :.::.::..:.. .. : :. :..:... 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CCDS53 S----RRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRRILSQSTDSLN-MRNRTLSVESLI 140 150 160 170 180 190 740 750 760 770 780 790 pF1KA0 EHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVI . . : ..: .:. :. :.:. .: .:. :. : : .:.:.:: CCDS53 D----------EEVIYSELMSDFEMDEKDFAAD--SWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVI 200 210 220 230 800 810 820 830 840 850 pF1KA0 NELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAV ::. :: ::::::.. ..: . .: : :. .. .: .... ..: . :. CCDS53 YELIQTELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLER 240 250 260 270 280 290 860 870 880 890 900 pF1KA0 RKR------NETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDS :.. ... :: ..:. :.. ::::. :.. .. . ::: . ::.. : .:. 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