Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0384
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0384, 939 aa
1>>>pF1KA0384 939 - 939 aa - 939 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7940+/-0.000893; mu= 14.1391+/- 0.054
mean_var=97.4368+/-19.523, 0's: 0 Z-trim(107.8): 45 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.129931
statistics sampled from 9738 (9781) to 9738 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.656), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 4.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73290.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 939) 6255 1183.5 0
CCDS44604.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 968) 6244 1181.4 0
CCDS44606.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 933) 6184 1170.1 0
CCDS44605.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 962) 6173 1168.1 0
CCDS55764.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 885) 5925 1121.6 0
CCDS55763.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 914) 5914 1119.5 0
CCDS55766.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 879) 5854 1108.3 0
CCDS55765.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 908) 5843 1106.2 0
CCDS44607.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 941) 5794 1097.0 0
CCDS53632.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 838) 5605 1061.6 0
CCDS44608.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 867) 5594 1059.5 0
CCDS44609.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 832) 5534 1048.3 0
CCDS53633.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 861) 5523 1046.2 0
CCDS55767.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 887) 5464 1035.2 0
CCDS53634.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 ( 840) 5144 975.2 0
CCDS13771.1 ARVCF gene_id:421|Hs108|chr22 ( 962) 2050 395.2 3.1e-109
CCDS75227.1 CTNND2 gene_id:1501|Hs108|chr5 ( 888) 1617 314.0 7.9e-85
CCDS75228.1 CTNND2 gene_id:1501|Hs108|chr5 (1134) 1617 314.1 9.8e-85
CCDS3881.1 CTNND2 gene_id:1501|Hs108|chr5 (1225) 1617 314.1 1e-84
CCDS33306.1 PKP4 gene_id:8502|Hs108|chr2 (1149) 1514 294.8 6.4e-79
CCDS33305.1 PKP4 gene_id:8502|Hs108|chr2 (1192) 1509 293.9 1.3e-78
CCDS7695.1 PKP3 gene_id:11187|Hs108|chr11 ( 797) 844 169.1 3e-41
CCDS30966.1 PKP1 gene_id:5317|Hs108|chr1 ( 747) 622 127.5 9.5e-29
CCDS31771.1 PKP2 gene_id:5318|Hs108|chr12 ( 837) 617 126.6 2e-28
CCDS30967.1 PKP1 gene_id:5317|Hs108|chr1 ( 726) 556 115.1 4.9e-25
CCDS8731.1 PKP2 gene_id:5318|Hs108|chr12 ( 881) 422 90.0 2.1e-17
>>CCDS73290.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 (939 aa)
initn: 6255 init1: 6255 opt: 6255 Z-score: 6334.7 bits: 1183.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6255; 99.9% identity (99.9% similar) in 939 aa overlap (1-939:1-939)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 YRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 DYGTARRTGTPSDPRRRLMSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPP
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKGKDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKGKDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 QPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 NEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSL
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KA0 DNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQKI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQKI
910 920 930
>>CCDS44604.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 (968 aa)
initn: 6244 init1: 6244 opt: 6244 Z-score: 6323.3 bits: 1181.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6244; 99.9% identity (99.9% similar) in 937 aa overlap (1-937:1-937)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 YRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 DYGTARRTGTPSDPRRRLMSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPP
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKGKDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKGKDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 QPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 NEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSL
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KA0 DNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQKI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQDEGQESLEEELDVLVLDDEGGQV
910 920 930 940 950 960
CCDS44 SYPSMQKI
>>CCDS44606.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 (933 aa)
initn: 4220 init1: 4220 opt: 6184 Z-score: 6262.8 bits: 1170.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6184; 99.3% identity (99.3% similar) in 939 aa overlap (1-939:1-933)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 TRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 YRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 DYGTARRTGTPSDPRRRLMSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPP
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKGKDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLF
::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKGK------GKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLF
610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 QPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLT
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 NEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILN
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSL
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQKI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEER
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMS
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:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERY
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::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKGK------GKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLT
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pF1KA0 NEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILN
720 730 740 750 760 770
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pF1KA0 TINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLE
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSL
840 850 860 870 880 890
910 920 930
pF1KA0 DNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQKI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQDEGQESLEEELDVLVLDDEGGQV
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CCDS44 SYPSMQKI
960
>>CCDS55764.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 (885 aa)
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30 40 50 60 70 80
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::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MANGTLTRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPR
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pF1KA0 NFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVR
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS55 VGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDM
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pF1KA0 IGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIP
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pF1KA0 HSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQA
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pF1KA0 EIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKG
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pF1KA0 KDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEAS
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pF1KA0 AGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNK
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pF1KA0 ELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEK
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pF1KA0 LVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHS
760 770 780 790 800 810
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pF1KA0 YDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLG
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930
pF1KA0 DMEPLKGTTPLMQKI
:::::::::::::::
CCDS55 DMEPLKGTTPLMQKI
880
>>CCDS55763.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 (914 aa)
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30 40 50 60 70 80
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::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MANGTLTRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPR
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pF1KA0 NFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVR
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS55 VGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDM
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330 340 350 360 370 380
pF1KA0 IGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKS
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pF1KA0 NAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNK
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pF1KA0 IAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIP
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pF1KA0 HSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQA
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pF1KA0 EIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKG
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pF1KA0 KDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEAS
580 590 600 610 620 630
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNK
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pF1KA0 ELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEK
700 710 720 730 740 750
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pF1KA0 LVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHS
760 770 780 790 800 810
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pF1KA0 YDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLG
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930
pF1KA0 DMEPLKGTTPLMQKI
:::::::::::::
CCDS55 DMEPLKGTTPLMQDEGQESLEEELDVLVLDDEGGQVSYPSMQKI
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pF1KA0 KLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTLTRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MANGTLTRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLK
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 LNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKV
40 50 60 70 80 90
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pF1KA0 VKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPR
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pF1KA0 NFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVR
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pF1KA0 VGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTPSDPRRRLMSYEDM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS55 VGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDM
220 230 240 250 260 270
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pF1KA0 IGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNK
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450 460 470 480 490 500
pF1KA0 IAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIP
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pF1KA0 HSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQA
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 EIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKG
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 KDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEAS
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 K------GKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEAS
580 590 600 610 620
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 AGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNK
630 640 650 660 670 680
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 ELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEK
690 700 710 720 730 740
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 LVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHS
750 760 770 780 790 800
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 YDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLG
810 820 830 840 850 860
930
pF1KA0 DMEPLKGTTPLMQKI
:::::::::::::::
CCDS55 DMEPLKGTTPLMQKI
870
>>CCDS55765.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 (908 aa)
initn: 3890 init1: 3890 opt: 5843 Z-score: 5917.5 bits: 1106.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5843; 99.2% identity (99.2% similar) in 883 aa overlap (55-937:1-877)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 KLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTLTRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MANGTLTRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLK
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pF1KA0 LNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKV
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 VKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPR
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 NFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVR
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 VGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTPSDPRRRLMSYEDM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS55 VGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDM
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 IGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPPNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKS
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 NAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGALKNISFGRDQDNK
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 IAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIP
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 HSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLRECDGLVDALIFIVQA
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 EIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKG
520 530 540 550 560 570
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pF1KA0 KDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEAS
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 K------GKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISLLKESKTPAILEAS
580 590 600 610 620
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pF1KA0 AGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAASGALRNLAVDARNK
630 640 650 660 670 680
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 ELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLEAAKKLRETQGIEK
690 700 710 720 730 740
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 LVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHS
750 760 770 780 790 800
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 YDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLG
810 820 830 840 850 860
930
pF1KA0 DMEPLKGTTPLMQKI
:::::::::::::
CCDS55 DMEPLKGTTPLMQDEGQESLEEELDVLVLDDEGGQVSYPSMQKI
870 880 890 900
>>CCDS44607.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 (941 aa)
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Smith-Waterman score: 5985; 97.0% identity (97.0% similar) in 937 aa overlap (1-937:1-910)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDDSEVESTASILASVKEQEAQFEKLTRALEEERRHVSAQLERVRVSPQDANPLMANGTL
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 TRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TRRHQNGRFVGDADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSVVSVETSDDGTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 DFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DFRKNGNGGPGPYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 YRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YRPSMEGYRAPSRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 DYGTARRTGTPSDPRRRLMSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPP
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DYGTARRTGTPSDPRRRLRSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PNWRQPELPEVIAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KKEVHLGACGALKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SHDSIKMEIVDHALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSEARRKLRECDGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 QEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKGKDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLF
::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QEAAPNVANNTGPHAASCFGAKKGK------GKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLF
610 620 630 640 650
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pF1KA0 QPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QPEVVRIYISLLKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLT
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 NEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NEHERVVKAASGALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILN
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TINEVIAENLEAAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLE
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 KEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEGWKKSDFQVNLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSD--------------------
840 850 860 870
910 920 930
pF1KA0 DNNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 -NNYSTPNERGDHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQDEGQESLEEELDVLVLDDEGGQV
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CCDS44 SYPSMQKI
940
>>CCDS53632.1 CTNND1 gene_id:1500|Hs108|chr11 (838 aa)
initn: 5605 init1: 5605 opt: 5605 Z-score: 5677.0 bits: 1061.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5605; 99.9% identity (99.9% similar) in 838 aa overlap (102-939:1-838)
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 DADLERQKFSDLKLNGPQDHSHLLYSTIPRMQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MQEPGQIVETYTEEDPEGAMSVVSVETSDD
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 GTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GTTRRTETTVKKVVKTVTTRTVQPVAMGPDGLPVDASSVSNNYIQTLGRDFRKNGNGGPG
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 PYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PYVGQAGTATLPRNFHYPPDGYSRHYEDGYPGGSDNYGSLSRVTRIEERYRPSMEGYRAP
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 SRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SRQDVYGPQPQVRVGGSSVDLHRFHPEPYGLEDDQRSMGYDDLDYGMMSDYGTARRTGTP
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 SDPRRRLMSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPPNWRQPELPEV
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SDPRRRLRSYEDMIGEEVPSDQYYWAPLAQHERGSLASLDSLRKGGPPPPNWRQPELPEV
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 IAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IAMLGFRLDAVKSNAAAYLQHLCYRNDKVKTDVRKLKGIPVLVGLLDHPKKEVHLGACGA
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 LKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LKNISFGRDQDNKIAIKNCDGVPALVRLLRKARDMDLTEVITGTLWNLSSHDSIKMEIVD
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 HALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLREC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HALHALTDEVIIPHSGWEREPNEDCKPRHIEWESVLTNTAGCLRNVSSERSEARRKLREC
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 DGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPNVANNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DGLVDALIFIVQAEIGQKDSDSKLVENCVCLLRNLSYQVHREIPQAERYQEAAPNVANNT
460 470 480 490 500 510
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 GPHAASCFGAKKGKDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GPHAASCFGAKKGKDEWFSRGKKPIEDPANDTVDFPKRTSPARGYELLFQPEVVRIYISL
520 530 540 550 560 570
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 LKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LKESKTPAILEASAGAIQNLCAGRWTYGRYIRSALRQEKALSAIADLLTNEHERVVKAAS
580 590 600 610 620 630
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 GALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GALRNLAVDARNKELIGKHAIPNLVKNLPGGQQNSSWNFSEDTVISILNTINEVIAENLE
640 650 660 670 680 690
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 AAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AAKKLRETQGIEKLVLINKSGNRSEKEVRAAALVLQTIWGYKELRKPLEKEGWKKSDFQV
700 710 720 730 740 750
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 NLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NLNNASRSQSSHSYDDSTLPLIDRNQKSDKKPDREEIQMSNMGSNTKSLDNNYSTPNERG
760 770 780 790 800 810
920 930
pF1KA0 DHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQKI
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DHNRTLDRSGDLGDMEPLKGTTPLMQKI
820 830
939 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 09:31:07 2016 done: Thu Nov 3 09:31:08 2016
Total Scan time: 4.440 Total Display time: 0.380
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]