Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0389
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0389, 1285 aa
1>>>pF1KA0389 1285 - 1285 aa - 1285 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5400+/-0.00178; mu= -14.9688+/- 0.105
mean_var=578.3643+/-120.467, 0's: 0 Z-trim(107.7): 115 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.053330
statistics sampled from 9697 (9770) to 9697 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 5.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34487.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1285) 8521 672.5 1.9e-192
CCDS75481.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1262) 6810 540.9 8e-153
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939) 980 92.5 1.2e-17
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs108|chr17 (1939) 979 92.4 1.2e-17
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939) 969 91.6 2.1e-17
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848) 930 88.6 1.6e-16
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1028) 874 84.1 2.1e-15
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044) 874 84.1 2.1e-15
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063) 874 84.1 2.2e-15
CCDS53826.1 MYO1H gene_id:283446|Hs108|chr12 (1022) 812 79.3 5.7e-14
CCDS10239.1 MYO9A gene_id:4649|Hs108|chr15 (2548) 784 77.5 4.9e-13
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 760 75.3 8.8e-13
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 760 75.3 9.1e-13
CCDS46405.1 MYO7B gene_id:4648|Hs108|chr2 (2116) 759 75.5 1.6e-12
CCDS34629.1 MYO1G gene_id:64005|Hs108|chr7 (1018) 749 74.5 1.6e-12
CCDS53685.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (1178) 744 74.1 2.4e-12
CCDS53684.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2175) 744 74.4 3.7e-12
CCDS53683.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2215) 744 74.4 3.8e-12
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 728 73.0 7e-12
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960) 722 72.6 1.1e-11
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1828) 714 72.0 1.6e-11
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855) 714 72.0 1.6e-11
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs108|chr15 (1742) 712 71.8 1.7e-11
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108) 688 69.8 4.5e-11
>>CCDS34487.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1285 aa)
initn: 8521 init1: 8521 opt: 8521 Z-score: 3568.5 bits: 672.5 E(32554): 1.9e-192
Smith-Waterman score: 8521; 100.0% identity (100.0% similar) in 1285 aa overlap (1-1285:1-1285)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYVANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYVANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 GTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIHFNEKSSVVGGFVSHYLLEKSRICVQGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIHFNEKSSVVGGFVSHYLLEKSRICVQGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EERNYHIFYRLCAGASEDIREKLHLSSPDNFRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EERNYHIFYRLCAGASEDIREKLHLSSPDNFRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDFEEAGSTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDFEEAGSTSG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 GCNLKNKSAQSLEYCAELLGLDQDDLRVSLTTRVMLTTAGGTKGTVIKVPLKVEQANNAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GCNLKNKSAQSLEYCAELLGLDQDDLRVSLTTRVMLTTAGGTKGTVIKVPLKVEQANNAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DALAKTVYSHLFDHVVNRVNQCFPFETSSYFIGVLDIAGFEYFEHNSFEQFCINYCNEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DALAKTVYSHLFDHVVNRVNQCFPFETSSYFIGVLDIAGFEYFEHNSFEQFCINYCNEKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QQFFNERILKEEQELYQKEGLGVNEVHYVDNQDCIDLIEAKLVGILDILDEENRLPQPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQFFNERILKEEQELYQKEGLGVNEVHYVDNQDCIDLIEAKLVGILDILDEENRLPQPSD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 QHFTSAVHQKHKDHFRLTIPRKSKLAVHRNIRDDEGFIIRHFAGAVCYETTQFVEKNNDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QHFTSAVHQKHKDHFRLTIPRKSKLAVHRNIRDDEGFIIRHFAGAVCYETTQFVEKNNDA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LHMSLESLICESRDKFIRELFESSTNNNKDTKQKAGKLSFISVGNKFKTQLNLLLDKLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LHMSLESLICESRDKFIRELFESSTNNNKDTKQKAGKLSFISVGNKFKTQLNLLLDKLRS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 TGASFIRCIKPNLKMTSHHFEGAQILSQLQCSGMVSVLDLMQGGYPSRASFHELYNMYKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TGASFIRCIKPNLKMTSHHFEGAQILSQLQCSGMVSVLDLMQGGYPSRASFHELYNMYKK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 YMPDKLARLDPRLFCKALFKALGLNENDYKFGLTKVFFRPGKFAEFDQIMKSDPDHLAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YMPDKLARLDPRLFCKALFKALGLNENDYKFGLTKVFFRPGKFAEFDQIMKSDPDHLAEL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 VKRVNHWLTCSRWKKVQWCSLSVIKLKNKIKYRAEACIKMQKTIRMWLCKRRHKPRIDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VKRVNHWLTCSRWKKVQWCSLSVIKLKNKIKYRAEACIKMQKTIRMWLCKRRHKPRIDGL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 VKVGTLKKRLDKFNEVVSVLKDGKPEMNKQIKNLEISIDTLMAKIKSTMMTQEQIQKEYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VKVGTLKKRLDKFNEVVSVLKDGKPEMNKQIKNLEISIDTLMAKIKSTMMTQEQIQKEYD
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910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ALVKSSEELLSALQKKKQQEEEAERLRRIQEEMEKERKRREEDEKRRRKEEEERRMKLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALVKSSEELLSALQKKKQQEEEAERLRRIQEEMEKERKRREEDEKRRRKEEEERRMKLEM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 EAKRKQEEEERKKREDDEKRIQAEVEAQLARQKEEESQQQAVLEQERRDRELALRIAQSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EAKRKQEEEERKKREDDEKRIQAEVEAQLARQKEEESQQQAVLEQERRDRELALRIAQSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 AELISDEAQADLALRRNDGTRPKMTPEQMAKEMSEFLSRGPAVLATKAAAGTKKYDLSKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AELISDEAQADLALRRNDGTRPKMTPEQMAKEMSEFLSRGPAVLATKAAAGTKKYDLSKW
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 KYAELRDTINTSCDIELLAACREEFHRRLKVYHAWKSKNKKRNTETEQRAPKSVTDYDFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KYAELRDTINTSCDIELLAACREEFHRRLKVYHAWKSKNKKRNTETEQRAPKSVTDYDFA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 PFLNNSPQQNPAAQIPARQREIEMNRQQRFFRIPFIRPADQYKDPQSKKKGWWYAHFDGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PFLNNSPQQNPAAQIPARQREIEMNRQQRFFRIPFIRPADQYKDPQSKKKGWWYAHFDGP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 WIARQMELHPDKPPILLVAGKDDMEMCELNLEETGLTRKRGAEILPRQFEEIWERCGGIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WIARQMELHPDKPPILLVAGKDDMEMCELNLEETGLTRKRGAEILPRQFEEIWERCGGIQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280
pF1KA0 YLQNAIESRQARPTYATAMLQSLLK
:::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YLQNAIESRQARPTYATAMLQSLLK
1270 1280
>>CCDS75481.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1262 aa)
initn: 6810 init1: 6810 opt: 6810 Z-score: 2857.1 bits: 540.9 E(32554): 8e-153
Smith-Waterman score: 8312; 98.2% identity (98.2% similar) in 1285 aa overlap (1-1285:1-1262)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MEDGKPVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYVANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYVANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSL
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 GTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GTRPPHVFAIADKAFRDMKVLKMSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDD
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190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIHFNEKSSVVGGFVSHYLLEKSRICVQGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIHFNEKSSVVGGFVSHYLLEKSRICVQGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EERNYHIFYRLCAGASEDIREKLHLSSPDNFRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EERNYHIFYRLCAGASEDIREKLHLSSPDNFRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDFEEAGSTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDFEEAGSTSG
310 320 330 340 350 360
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pF1KA0 GCNLKNKSAQSLEYCAELLGLDQDDLRVSLTTRVMLTTAGGTKGTVIKVPLKVEQANNAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GCNLKNKSAQSLEYCAELLGLDQDDLRVSLTTRVMLTTAGGTKGTVIKVPLKVEQANNAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 DALAKTVYSHLFDHVVNRVNQCFPFETSSYFIGVLDIAGFEYFEHNSFEQFCINYCNEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DALAKTVYSHLFDHVVNRVNQCFPFETSSYFIGVLDIAGFEYFEHNSFEQFCINYCNEKL
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pF1KA0 QQFFNERILKEEQELYQKEGLGVNEVHYVDNQDCIDLIEAKLVGILDILDEENRLPQPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QQFFNERILKEEQELYQKEGLGVNEVHYVDNQDCIDLIEAKLVGILDILDEENRLPQPSD
490 500 510 520 530 540
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pF1KA0 QHFTSAVHQKHKDHFRLTIPRKSKLAVHRNIRDDEGFIIRHFAGAVCYETTQFVEKNNDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QHFTSAVHQKHKDHFRLTIPRKSKLAVHRNIRDDEGFIIRHFAGAVCYETTQFVEKNNDA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LHMSLESLICESRDKFIRELFESSTNNNKDTKQKAGKLSFISVGNKFKTQLNLLLDKLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LHMSLESLICESRDKFIRELFESSTNNNKDTKQKAGKLSFISVGNKFKTQLNLLLDKLRS
610 620 630 640 650 660
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pF1KA0 TGASFIRCIKPNLKMTSHHFEGAQILSQLQCSGMVSVLDLMQGGYPSRASFHELYNMYKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TGASFIRCIKPNLKMTSHHFEGAQILSQLQCSGMVSVLDLMQGGYPSRASFHELYNMYKK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 YMPDKLARLDPRLFCKALFKALGLNENDYKFGLTKVFFRPGKFAEFDQIMKSDPDHLAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YMPDKLARLDPRLFCKALFKALGLNENDYKFGLTKVFFRPGKFAEFDQIMKSDPDHLAEL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 VKRVNHWLTCSRWKKVQWCSLSVIKLKNKIKYRAEACIKMQKTIRMWLCKRRHKPRIDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VKRVNHWLTCSRWKKVQWCSLSVIKLKNKIKYRAEACIKMQKTIRMWLCKRRHKPRIDGL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 VKVGTLKKRLDKFNEVVSVLKDGKPEMNKQIKNLEISIDTLMAKIKSTMMTQEQIQKEYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VKVGTLKKRLDKFNEVVSVLKDGKPEMNKQIKNLEISIDTLMAKIKSTMMTQEQIQKEYD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 ALVKSSEELLSALQKKKQQEEEAERLRRIQEEMEKERKRREEDEKRRRKEEEERRMKLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ALVKSSEELLSALQKKKQQEEEAERLRRIQEEMEKERKRREEDEKRRRKEEEERRMKLEM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 EAKRKQEEEERKKREDDEKRIQAEVEAQLARQKEEESQQQAVLEQERRDRELALRIAQSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EAKRKQEEEERKKREDDEKRIQAEVEAQLARQKEEESQQQAVLEQERRDRELALRIAQSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 AELISDEAQADLALRRNDGTRPKMTPEQMAKEMSEFLSRGPAVLATKAAAGTKKYDLSKW
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS75 AELISDEAQADLALRR-----------------------GPAVLATKAAAGTKKYDLSKW
1030 1040 1050
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 KYAELRDTINTSCDIELLAACREEFHRRLKVYHAWKSKNKKRNTETEQRAPKSVTDYDFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KYAELRDTINTSCDIELLAACREEFHRRLKVYHAWKSKNKKRNTETEQRAPKSVTDYDFA
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 PFLNNSPQQNPAAQIPARQREIEMNRQQRFFRIPFIRPADQYKDPQSKKKGWWYAHFDGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PFLNNSPQQNPAAQIPARQREIEMNRQQRFFRIPFIRPADQYKDPQSKKKGWWYAHFDGP
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 WIARQMELHPDKPPILLVAGKDDMEMCELNLEETGLTRKRGAEILPRQFEEIWERCGGIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WIARQMELHPDKPPILLVAGKDDMEMCELNLEETGLTRKRGAEILPRQFEEIWERCGGIQ
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1270 1280
pF1KA0 YLQNAIESRQARPTYATAMLQSLLK
:::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YLQNAIESRQARPTYATAMLQSLLK
1240 1250 1260
>>CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939 aa)
initn: 1216 init1: 400 opt: 980 Z-score: 430.5 bits: 92.5 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 1556; 30.2% identity (60.9% similar) in 1193 aa overlap (36-1169:65-1180)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 PVWAPHPTDGFQMGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVEDNCSL
. : : . .:::: . . .:: .
CCDS11 KTSVFVVDPKESFVKATVQSREGGKVTAKTEAGATVTVKDDQVFPMNPPKYDKIEDMAMM
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 MYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYVANILIAVNPYFDIPKIYSSEAIKSYQGKSLGTRPP
.:.: ..:.:.: ::. :::: . . ..:::: .: .:..:.. .:.::. ::
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130 140 150 160 170
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:.:.:.:.:.. : . . .:::...:::::::: ::: :..:.. ::.
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..:.:. ::::::::::::::::.::::::::..:::. ...... . :::::
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240 250 260 270 280 290
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::. : : ::.:::::.. .. . :. : : ... : .. ....:
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. : .::. ... .:.. .:. ..:..........:.: ::.
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:. : . : .. .:.: : .:.. :: .: :: . . ::: .
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.::.: :. . ...::.: :. .. .: .: : . :: ..:. . .. .:.::
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. . . :.::: :.:.. :.. . . .: . . :. .. .....::::
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:::::. : .. ... :... .::.:. :.. : . :. .. .. .. :
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:. . .: ..: .. . .: : . :. : : . .:.... .. : :. :
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CCDS11 KLCMDLERAKRKLEGDLKLAQESTMDTENDKQQLNEKLK--KKEFEMSNLQ-GKIEDEQA
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CCDS11 LAIQLQKKIKELQARIEELEEEIEAERASRAKAEK------QRSDLSRELEEISERLEEA
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CCDS11 GGAT-SAQIEMNKKREAEFQKMRRDLEESTLQHEATAAALRKKHADSVAELGEQIDSLQR
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CCDS96 RTECFVPDDKEEFVKAKILSREGGKVIAETENGKTVTVKEDQVLQQNPPKFDKIEDMAML
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CCDS96 TFLHEPAVLFNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLP-VYNAEVVAAYRGKKRSEAPP
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CCDS96 HIFSISDNAYQYMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFASIAAIGDRGKKDNANA
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CCDS96 NKGTLEDQIIQANPALEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLASADIETYLLEKS
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CCDS96 RVIFQLKAERNYHIFYQILSNKKPELLDMLLVTNNPYDYAFVSQG---------------
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CCDS96 -------EVSVASI-----DDSEELMATDSAFDVLGFTSEEKAGVYKLTGAIMHYGNMKF
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pF1KA0 E----EAGSTSGGCNLKNKSAQSLEYCAELLGLDQDDLRVSLT-TRVMLTTAGGTKGTVI
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CCDS96 KQKQREEQAEPDGTEDADKSAY-------LMGLNSADLLKGLCHPRVKVGNEYVTKGQ--
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CCDS96 ----SVQQVYYSIGALAKAVYEKMFNWMVTRINATLETKQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFN
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CCDS96 SFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLQACIDLIE-KPMGI
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CCDS96 MSILEEECMFPKATDMTFKAKLYDNH-------LGKSNNFQKPRNIKGKQEAHFSLIHYA
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pF1KA0 GAVCYETTQFVEKNNDALHMSLESLICESRDKFIRELFES-STNNNKDT-KQKAGKL---
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CCDS96 GTVDYNILGWLEKNKDPLNETVVALYQKSSLKLMATLFSSYATADTGDSGKSKGGKKKGS
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pF1KA0 SFISVGNKFKTQLNLLLDKLRSTGASFIRCIKPNLKMTSHHFEGAQILSQLQCSGMVSVL
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CCDS96 SFQTVSALHRENLNKLMTNLRTTHPHFVRCIIPNERKAPGVMDNPLVMHQLRCNGVLEGI
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pF1KA0 DLMQGGYPSRASFHELYNMYKKYMPDKLAR---LDPRLFCKALFKALGLNENDYKFGLTK
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CCDS96 RICRKGFPNRILYGDFRQRYRILNPVAIPEGQFIDSRKGTEKLLSSLDIDHNQYKFGHTK
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:::. : .. ... :.. ..:.... :.. . .: . : :..: :: : .
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: . .: .:: .. .. : .: :.: . .:.. ..: . .:. . .
CCDS96 ALLVIQWNIRAFM-GVKNWPWMKLYFKIKPLLKSAETEKEMATMKEEFGRIKETLEKSEA
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pF1KA0 QIKNLEISIDTLMAKIKSTMMTQEQIQKEYDALVKSSEELLSALQKKKQQ-----EEEAE
. :.:: .. .:. . :. . : :.: : : : ...:: . : :.: : .: :
CCDS96 RRKELEEKMVSLLQE-KNDL--QLQVQAEQDNL-NDAEERCDQLIKNKIQLEAKVKEMNE
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CCDS96 RLED-EEEMNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEMA
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:. :.:...:. .:..:::. . : ..:. .: .. . : :. ...: ..
CCDS96 GLDEIIAKLTKEKKALQEAHQQALDDLQVEEDKVNSLSKSKVKLEQQVDDLEGSLEQEK-
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. .: :. ... .: :. .. .. :. : : :. : . .
CCDS96 ---KVRMDLERAKRKL-----EGDLKLTQESIMDLENDKLQLEEKLKKKEF-DINQQNSK
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pF1KA0 IELLAACREEFHRRLKVYHAWKSKNKKRNTETEQRAPKSVTDY--DFAPFLNNSPQQNPA
:: . .....:: .: . .. ... :.:. : .: :.. :.. ..
CCDS96 IEDEQVLALQLQKKLKENQA-RIEELEEELEAERTARAKVEKLRSDLSRELEEISERLEE
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: : . .::::...
CCDS96 AG-GATSVQIEMNKKREAEFQKMRRDLEEATLQHEATAAALRKKHADSVAELGEQIDNLQ
1160 1170 1180 1190 1200 1210
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CCDS42 FATVGGSASETNIEEKVLASSPIMEAIGNAKTTRNDNSSRFGKYIQIGFDKRYHIIGANM
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CCDS42 YVKT-MSLQQVINARNALAKHIYAQLFGWIVEHINKALHTSLKQHSFIGVLDIYGFETFE
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. . . ::.:.:.. ::.. . .:. ::. .. . ..... ::..: ..:
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CCDS42 QRYDNLRDEMTIIKQTPGHRRNPSNQSSLESDSNYPSISTSEIGDTEDALQQVEEIGLEK
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::: .:. : . : : . :.:: : : .: :..:::: : .:. .: :.. ..
CCDS11 -HKLADQRT-RKSLGRGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMS
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. :. : ..: . .:...:: .: :.. :.: ...::::::
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.:. . : :.. :.. : . ..:. : ... . . ::. :. :.
CCDS11 RFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAYRRKYEAFLQRYKSLCPETWPTWAGRPQDGVA
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.: . :: . ..::.: ::.:.: : . .. .. . :: .. : ::
CCDS11 VLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFL
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CCDS11 RVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGFVL--RHAPRCPENAFFLDHVR
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CCDS11 TSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPALREASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQ
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CCDS45 VNPYRDL-QIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMISGESGAG
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pF1KA0 KTENTKFVLRYLTESYGT---GQDIDDRIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIH
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CCDS45 KTEATKRLLQFYAETCPAPERGGAVRDRLLQSNPVLEAFGNAKTLRNDNSSRFGKYMDVQ
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CCDS45 FDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLEGGEEETLRRLGLERNPQSYL
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pF1KA0 YLNRG-CTRYFANKETDKQILQNRKSPEYLKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDD
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CCDS45 YLVKGQCA----------------------KVSSI-----NDKSDWKVVRKALTVIDFTE
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CCDS45 DEVEDLLSIVASVLHLGNIHFAANEESNAQVTTENQ----LKYLTRLLSVEGSTLREALT
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: ... :: . ::..::: :::::::.:::. : .:...:. . :
CCDS45 HRKIIA-----KGEELLSPLNLEQAAYARDALAKAVYSRTFTWLVGKINRSLASKDVESP
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CCDS45 SWRSTTVLGLLDIYGFEVFQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWE
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:.: .:. ::.: :. ::..::::: : . .: : ... ::. :: ::
CCDS45 PVQYFNNKIICDLVEEKFKGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHF-LT---
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pF1KA0 KSKLAVHRNIRDDEG---FIIRHFAGAVCYETTQFVEKNNDALHMSLESLICESRDKFIR
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CCDS45 -HKLADQRT-RKSLGRGEFRLLHYAGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMS
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pF1KA0 ELFESSTNNNKDTKQKAGKLSFISVGNKFKTQLNLLLDKLRSTGASFIRCIKPNLKMTSH
. :. : ..: . .:...:: .: :.. :.: ...::::::
CCDS45 QCFDRSELSDKKRPE--------TVATQFKMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPG
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CCDS53 NSSLVNKDFTRKTVIGLLDIYGFEVFDKNGFEQFCINYCNEKLQQLLIERTLKAEQAEYE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]