Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0397
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0397, 1006 aa
1>>>pF1KA0397 1006 - 1006 aa - 1006 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5153+/-0.000895; mu= 17.8189+/- 0.054
mean_var=124.5654+/-25.165, 0's: 0 Z-trim(110.8): 37 B-trim: 409 in 1/51
Lambda= 0.114915
statistics sampled from 11841 (11873) to 11841 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 4.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45570.1 SGSM2 gene_id:9905|Hs108|chr17 (1006) 6868 1150.4 0
CCDS32526.1 SGSM2 gene_id:9905|Hs108|chr17 (1051) 3968 669.7 8.8e-192
CCDS74834.1 SGSM1 gene_id:129049|Hs108|chr22 (1087) 1326 231.7 6.5e-60
CCDS46675.1 SGSM1 gene_id:129049|Hs108|chr22 (1093) 1326 231.7 6.5e-60
CCDS46674.1 SGSM1 gene_id:129049|Hs108|chr22 (1148) 1326 231.7 6.7e-60
CCDS53814.1 TBC1D15 gene_id:64786|Hs108|chr12 ( 674) 445 85.4 4.2e-16
CCDS55849.1 TBC1D15 gene_id:64786|Hs108|chr12 ( 682) 445 85.4 4.2e-16
CCDS31858.1 TBC1D15 gene_id:64786|Hs108|chr12 ( 691) 445 85.5 4.3e-16
CCDS62353.1 TBC1D16 gene_id:125058|Hs108|chr17 ( 392) 402 78.1 3.9e-14
CCDS62351.1 TBC1D16 gene_id:125058|Hs108|chr17 ( 405) 402 78.1 4e-14
CCDS11766.1 TBC1D16 gene_id:125058|Hs108|chr17 ( 767) 402 78.4 6.5e-14
CCDS54294.1 TBC1D17 gene_id:79735|Hs108|chr19 ( 615) 393 76.8 1.5e-13
CCDS12785.1 TBC1D17 gene_id:79735|Hs108|chr19 ( 648) 393 76.8 1.6e-13
CCDS35242.1 TBC1D25 gene_id:4943|Hs108|chrX ( 688) 390 76.3 2.4e-13
>>CCDS45570.1 SGSM2 gene_id:9905|Hs108|chr17 (1006 aa)
initn: 6868 init1: 6868 opt: 6868 Z-score: 6155.2 bits: 1150.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6868; 100.0% identity (100.0% similar) in 1006 aa overlap (1-1006:1-1006)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGSAEDAVKEKLLWNVKKEVKQIMEEAVTRKFVHEDSSHIIALCGAVEACLLHQLRRRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGSAEDAVKEKLLWNVKKEVKQIMEEAVTRKFVHEDSSHIIALCGAVEACLLHQLRRRAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GFLRSDKMAALFTKVGKTCPVAGEICHKVQELQQQAEGRKPSGVSQEALRRQGSASGKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GFLRSDKMAALFTKVGKTCPVAGEICHKVQELQQQAEGRKPSGVSQEALRRQGSASGKAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ALSPQALKHVWVRTALIEKVLDKVVQYLAENCSKYYEKEALLADPVFGPILASLLVGPCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ALSPQALKHVWVRTALIEKVLDKVVQYLAENCSKYYEKEALLADPVFGPILASLLVGPCA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LEYTKLKTADHYWTDPSADELVQRHRIRGPPTRQDSPAKRPALGIRKRHSSGSASEDRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LEYTKLKTADHYWTDPSADELVQRHRIRGPPTRQDSPAKRPALGIRKRHSSGSASEDRLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ACARECVESLHQNSRTRLLYGKNHVLVQPKEDMEAVPGYLSLHQSAESLTLKWTPNQLMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ACARECVESLHQNSRTRLLYGKNHVLVQPKEDMEAVPGYLSLHQSAESLTLKWTPNQLMN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GTLGDSELEKSVYWDYALVVPFSQVVCIHCHQQKSGGTLVLVSQDGIQRPPLHFPQGGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GTLGDSELEKSVYWDYALVVPFSQVVCIHCHQQKSGGTLVLVSQDGIQRPPLHFPQGGHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LSFLSCLENGLLPRGQLEPPLWTQQGKGKVFPKLRKRSSIRSVDMEEMGTGRATDYVFRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSFLSCLENGLLPRGQLEPPLWTQQGKGKVFPKLRKRSSIRSVDMEEMGTGRATDYVFRI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 IYPGHRHEHNAGDMIEMQGFGPSLPAWHLEPLCSQGSSCLSCSSSSSPHATPSHCSCIPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IYPGHRHEHNAGDMIEMQGFGPSLPAWHLEPLCSQGSSCLSCSSSSSPHATPSHCSCIPD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 RLPLRLLCESMKRQIVSRAFYGWLAHCRHLSTVRTHLSALVHHSVIPPDRPPGASAGLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RLPLRLLCESMKRQIVSRAFYGWLAHCRHLSTVRTHLSALVHHSVIPPDRPPGASAGLTK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 DVWSKYQKDKKNYKELELLRQVYYGGIEHEIRKDVWPFLLGHYKFGMSKKEMEQVDAVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DVWSKYQKDKKNYKELELLRQVYYGGIEHEIRKDVWPFLLGHYKFGMSKKEMEQVDAVVA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ARYQQVLAEWKACEVVVRQREREAHPATRTKFSSGSSIDSHVQRLIHRDSTISNDVFISV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ARYQQVLAEWKACEVVVRQREREAHPATRTKFSSGSSIDSHVQRLIHRDSTISNDVFISV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 DDLEPPEPQDPEDSRPKPEQEAGPGTPGTAVVEQQHSVEFDSPDSGLPSSRNYSVASGIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DDLEPPEPQDPEDSRPKPEQEAGPGTPGTAVVEQQHSVEFDSPDSGLPSSRNYSVASGIQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 SSLDEGQSVGFEEEDGGGEEGSSGPGPAAHTLREPQDPSQEKPQAGELEAGEELAAVCAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSLDEGQSVGFEEEDGGGEEGSSGPGPAAHTLREPQDPSQEKPQAGELEAGEELAAVCAA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 AYTIELLDTVALNLHRIDKDVQRCDRNYWYFTPPNLERLRDVMCSYVWEHLDVGYVQGMC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AYTIELLDTVALNLHRIDKDVQRCDRNYWYFTPPNLERLRDVMCSYVWEHLDVGYVQGMC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 DLLAPLLVTLDNDQLAYSCFSHLMKRMSQNFPNGGAMDTHFANMRSLIQILDSELFELMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DLLAPLLVTLDNDQLAYSCFSHLMKRMSQNFPNGGAMDTHFANMRSLIQILDSELFELMH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 QNGDYTHFYFCYRWFLLDFKRELLYEDVFAVWEVIWAARHISSEHFVLFIALALVEAYRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QNGDYTHFYFCYRWFLLDFKRELLYEDVFAVWEVIWAARHISSEHFVLFIALALVEAYRE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KA0 IIRDNNMDFTDIIKFFNERAEHHDAQEILRIARDLVHKVQMLIENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IIRDNNMDFTDIIKFFNERAEHHDAQEILRIARDLVHKVQMLIENK
970 980 990 1000
>>CCDS32526.1 SGSM2 gene_id:9905|Hs108|chr17 (1051 aa)
initn: 3968 init1: 3968 opt: 3968 Z-score: 3556.6 bits: 669.7 E(32554): 8.8e-192
Smith-Waterman score: 6686; 95.6% identity (95.7% similar) in 1038 aa overlap (14-1006:14-1051)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGSAEDAVKEKLLWNVKKEVKQIMEEAVTRKFVHEDSSHIIALCGAVEACLLHQLRRRAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGSAEDAVKEKLLWNVKKEVKQIMEEAVTRKFVHEDSSHIIALCGAVEACLLHQLRRRAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GFLRSDKMAALFTKVGKTCPVAGEICHKVQELQQQAEGRKPSGVSQEALRRQGSASGKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GFLRSDKMAALFTKVGKTCPVAGEICHKVQELQQQAEGRKPSGVSQEALRRQGSASGKAP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 ALSPQALKHVWVRTALIEKVLDKVVQYLAENCSKYYEKEALLADPVFGPILASLLVGPCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALSPQALKHVWVRTALIEKVLDKVVQYLAENCSKYYEKEALLADPVFGPILASLLVGPCA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LEYTKLKTADHYWTDPSADELVQRHRIRGPPTRQDSPAKRPALGIRKRHSSGSASEDRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEYTKLKTADHYWTDPSADELVQRHRIRGPPTRQDSPAKRPALGIRKRHSSGSASEDRLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ACARECVESLHQNSRTRLLYGKNHVLVQPKEDMEAVPGYLSLHQSAESLTLKWTPNQLMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ACARECVESLHQNSRTRLLYGKNHVLVQPKEDMEAVPGYLSLHQSAESLTLKWTPNQLMN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 GTLGDSELEKSVYWDYALVVPFSQVVCIHCHQQKSGGTLVLVSQDGIQRPPLHFPQGGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GTLGDSELEKSVYWDYALVVPFSQVVCIHCHQQKSGGTLVLVSQDGIQRPPLHFPQGGHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LSFLSCLENGLLPRGQLEPPLWTQQGKGKVFPKLRKRSSIRSVDMEEMGTGRATDYVFRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LSFLSCLENGLLPRGQLEPPLWTQQGKGKVFPKLRKRSSIRSVDMEEMGTGRATDYVFRI
370 380 390 400 410 420
430
pF1KA0 IYPGHRHEH---------------------------------------------NAGDMI
::::::::: .:::::
CCDS32 IYPGHRHEHITINYHHLAASRAASVDDDEEEEDKLHAMLSMICSRNLTAPNPMKDAGDMI
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 EMQGFGPSLPAWHLEPLCSQGSSCLSCSSSSSPHATPSHCSCIPDRLPLRLLCESMKRQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EMQGFGPSLPAWHLEPLCSQGSSCLSCSSSSSPHATPSHCSCIPDRLPLRLLCESMKRQI
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 VSRAFYGWLAHCRHLSTVRTHLSALVHHSVIPPDRPPGASAGLTKDVWSKYQKDKKNYKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VSRAFYGWLAHCRHLSTVRTHLSALVHHSVIPPDRPPGASAGLTKDVWSKYQKDKKNYKE
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 LELLRQVYYGGIEHEIRKDVWPFLLGHYKFGMSKKEMEQVDAVVAARYQQVLAEWKACEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LELLRQVYYGGIEHEIRKDVWPFLLGHYKFGMSKKEMEQVDAVVAARYQQVLAEWKACEV
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 VVRQREREAHPATRTKFSSGSSIDSHVQRLIHRDSTISNDVFISVDDLEPPEPQDPEDSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VVRQREREAHPATRTKFSSGSSIDSHVQRLIHRDSTISNDVFISVDDLEPPEPQDPEDSR
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 PKPEQEAGPGTPGTAVVEQQHSVEFDSPDSGLPSSRNYSVASGIQSSLDEGQSVGFEEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PKPEQEAGPGTPGTAVVEQQHSVEFDSPDSGLPSSRNYSVASGIQSSLDEGQSVGFEEED
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 GGGEEGSSGPGPAAHTLREPQDPSQEKPQAGELEAGEELAAVCAAAYTIELLDTVALNLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGGEEGSSGPGPAAHTLREPQDPSQEKPQAGELEAGEELAAVCAAAYTIELLDTVALNLH
790 800 810 820 830 840
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 RIDKDVQRCDRNYWYFTPPNLERLRDVMCSYVWEHLDVGYVQGMCDLLAPLLVTLDNDQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RIDKDVQRCDRNYWYFTPPNLERLRDVMCSYVWEHLDVGYVQGMCDLLAPLLVTLDNDQL
850 860 870 880 890 900
860 870 880 890 900 910
pF1KA0 AYSCFSHLMKRMSQNFPNGGAMDTHFANMRSLIQILDSELFELMHQNGDYTHFYFCYRWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AYSCFSHLMKRMSQNFPNGGAMDTHFANMRSLIQILDSELFELMHQNGDYTHFYFCYRWF
910 920 930 940 950 960
920 930 940 950 960 970
pF1KA0 LLDFKRELLYEDVFAVWEVIWAARHISSEHFVLFIALALVEAYREIIRDNNMDFTDIIKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLDFKRELLYEDVFAVWEVIWAARHISSEHFVLFIALALVEAYREIIRDNNMDFTDIIKF
970 980 990 1000 1010 1020
980 990 1000
pF1KA0 FNERAEHHDAQEILRIARDLVHKVQMLIENK
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FNERAEHHDAQEILRIARDLVHKVQMLIENK
1030 1040 1050
>>CCDS74834.1 SGSM1 gene_id:129049|Hs108|chr22 (1087 aa)
initn: 3377 init1: 1298 opt: 1326 Z-score: 1189.2 bits: 231.7 E(32554): 6.5e-60
Smith-Waterman score: 3530; 54.5% identity (73.3% similar) in 1050 aa overlap (48-1006:50-1087)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 KEVKQIMEEAVTRKFVHEDSSHIIALCGAVEACLLHQLRRRAAGFLRSDKMAALFTKVGK
:::.:: :::::::::::.:.:::: ::::
CCDS74 KEVKQIMEEAVTRKFVHEDSSHIISFCAAVEACVLHGLRRRAAGFLRSNKIAALFMKVGK
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 TCPVAGEICHKVQELQQQAEGRKPS--GVSQEALRRQGSASGKAPALSPQALKHVWVRTA
. : : .. .:::.:.: :. . . :. :: .:. : : ::: :.::.:.:::
CCDS74 NFPPAEDLSRKVQDLEQLIESARNQIQGL-QENVRKLP----KLPNLSPLAIKHLWIRTA
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 LIEKVLDKVVQYLAENCSKYYEKEALLADPVFGPILASLLVGPCALEYTKLKTADHYWTD
:.::::::.:.::.:: :::::::::: ::: ::::::::::::::::::.:::::.:::
CCDS74 LFEKVLDKIVHYLVENSSKYYEKEALLMDPVDGPILASLLVGPCALEYTKMKTADHFWTD
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 PSADELVQRHRIRGPPTRQDSPAKRPALGIRKRHSSGSASEDRLAACARECVESLHQNSR
::::::::::::.. .:::::.::::: :.::::::: .:: . ::. :::::::::
CCDS74 PSADELVQRHRIHSSHVRQDSPTKRPALCIQKRHSSGSM-DDRPSLSARDYVESLHQNSR
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 TRLLYGKNHVLVQPKEDMEAVPGYLSLHQSAESLTLKWTPNQLMNGTLGDSELEKSVYWD
. ::::::.:::::..:::::::::::::.:. .::::::::::::..:: . :::::::
CCDS74 ATLLYGKNNVLVQPRDDMEAVPGYLSLHQTADVMTLKWTPNQLMNGSVGDLDYEKSVYWD
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 YALVVPFSQVVCIHCHQQ-KSGGTLVLVSQDGIQRPPLHFPQGGHLLSFLSCLENGLLPR
::... . ..: .::::: ::::.::::::::::::..::.:::::.:::::::::::.
CCDS74 YAMTIRLEEIVYLHCHQQVDSGGTVVLVSQDGIQRPPFRFPKGGHLLQFLSCLENGLLPH
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 GQLEPPLWTQQGKGKVFPKLRKRSSIRSVDME--EMGTGRATDYVFRIIYPGHRHEHNAG
:::.::::.:.::::::::::::: :.. . .:::::::::::: . : :
CCDS74 GQLDPPLWSQRGKGKVFPKLRKRSPQGSAESTSSDKDDDEATDYVFRIIYPGMQSEFVAP
380 390 400 410 420 430
440 450
pF1KA0 DMIEMQGFGPSLPAWHLEP------LCSQGS-----------------------------
:.. . ::: . : . ..::
CCDS74 DFLGSTSSVSVGPAWMMVPAGRSMLVVARGSQWEPARWDTTLPTPSPKEQPPMPQDLMDV
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500
pF1KA0 ----------------SCLSCSSSSSPHATPSHCSCIPDRLPLRLLCESMKRQIVSRAFY
:: :::.:.: .. .. .: .: ::.:::..:: ::.:::::
CCDS74 SVSNLPSLWQPSPRKSSCSSCSQSGSADGSSTN-GCNHERAPLKLLCDNMKYQILSRAFY
500 510 520 530 540 550
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 GWLAHCRHLSTVRTHLSALVHHSVIPPDRPPGASAGLTKDVWSKYQKDKKNYKELELLRQ
::::.:::::::::::::::.: .. :: : :. ::: .: .: .:. .:.: ::::
CCDS74 GWLAYCRHLSTVRTHLSALVNHMIVSPDLPCDAGQGLTARIWEQYLHDSTSYEEQELLRL
560 570 580 590 600 610
570 580 590 600 610
pF1KA0 VYYGGIEHEIRKDVWPFLLGHYKFGMSKKEMEQVDAVVAARYQQVL------AEWKACEV
.:::::. :::: :::::::::.:::.. : .. . .. :.. . .. :
CCDS74 IYYGGIQPEIRKAVWPFLLGHYQFGMTETERKESSQSCSSGRQNIRLHSDSSSSTQVFES
620 630 640 650 660 670
620 630 640 650
pF1KA0 V--VRQREREAH-PATRTKFSSGS------SIDS-HVQRLI-------HRDSTISNDVFI
: :.: : :.. . :. .:. : :: : . : . ..:.. .
CCDS74 VDEVEQVEAEGRLEEKQPKIPNGNLVNGTCSPDSGHPSSHNFSSGLSEHSEPSLSTEDSV
680 690 700 710 720 730
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 SVDDLEPPEPQDPEDSRPKPEQEAGPGTPGTAVVEQQHSVEFDSPDSGLPSSRNYSVASG
. . : :.:. .: . : . ... .:. :: .: : ...... .
CCDS74 LDAQRNTPTVLRPRDGSVDDRQSSEATTSQDEAPREELAVQ-DSLESDLLANESMDEFMS
740 750 760 770 780 790
720 730 740 750 760
pF1KA0 IQSSLDEGQSVGFEEEDGGGEEGSSGPGPAAHTLREPQDPSQEKPQAGEL----------
: .::: ... :.: :: . : . .: .:.:. :
CCDS74 ITGSLD----MALPEKDDVVMEGWRSSETEKHGQADSEDNLSEEPEMESLFPALASLAVT
800 810 820 830 840
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...:.. : ... :. :::: ..:::::.::::::::::::::: :::.::..::::
CCDS74 TSANEVSPVSSSGVTYSPELLDLYTVNLHRIEKDVQRCDRNYWYFTPANLEKLRNIMCSY
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pF1KA0 VWEHLDVGYVQGMCDLLAPLLVTLDNDQLAYSCFSHLMKRMSQNFPNGGAMDTHFANMRS
.:.:...::::::::::::::: ::.. ::.:::..:::::.::::.:::::::::::::
CCDS74 IWQHIEIGYVQGMCDLLAPLLVILDDEALAFSCFTELMKRMNQNFPHGGAMDTHFANMRS
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pF1KA0 LIQILDSELFELMHQNGDYTHFYFCYRWFLLDFKRELLYEDVFAVWEVIWAARHISSEHF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::: :::.::::.:.:: :.
CCDS74 LIQILDSELFELMHQNGDYTHFYFCYRWFLLDFKRELVYDDVFLVWETIWAAKHVSSAHY
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CCDS74 VLFIALALVEVYRDIILENNMDFTDIIKFFNEMAERHNTKQVLKLARDLVYKVQTLIENK
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:::::::.:::::::::::::::.: .. :: : :. ::: .: .: .:. .:.: ::
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:: .:::::. :::: :::::::::.:::.. : ..:: . : : :..::: .::..::
CCDS46 LRLIYYGGIQPEIRKAVWPFLLGHYQFGMTETERKEVDEQIHACYAQTMAEWLGCEAIVR
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:::::.: :. .: :::.:.:::..:..::::::::.
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:: :::..: : . :...:: :. ..: :.. . . ..:: ...
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:: : ..:: .: ....: :.::
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.:. .. :.: :: . : . .: .:.:. : : ::..
CCDS46 FMSITGSLDMALPEKDDVVMEGWRSSETEKHGQADSEDNLSEEPEMESLFPALASLAVTT
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:.:...::::::::::::::: ::.. ::.:::..:::::.::::.::::::::::::::
CCDS46 WQHIEIGYVQGMCDLLAPLLVILDDEALAFSCFTELMKRMNQNFPHGGAMDTHFANMRSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::: :::.::::.:.:: :.:
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CCDS46 LFIALALVEVYRDIILENNMDFTDIIKFFNEMAERHNTKQVLKLARDLVYKVQTLIENK
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:::::::::::: :.. . .:::::::::::: . : : :.. .
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::: . : . ..::
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::.:.:::..:..::::::::. :: :::..: : .
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. :::: ..:::::.::::::::::::::: :::.::..::::.:.:...:::::::::
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CCDS46 LAPLLVILDDEALAFSCFTELMKRMNQNFPHGGAMDTHFANMRSLIQILDSELFELMHQN
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:::::::::::::::::::::.:.::: :::.::::.:.:: :.::::::::::.::.::
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:: ....:: .::::::::::::::::::::::::::..:.:::::.:: ::::
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CCDS46 AAGFLRSNKIAALFMKVGKNFPPAEDLSRKVQDLEQLIESARNQIQGL-QENVRKLPKLP
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.: :.. :..:. .. : .... :..:.: .:: . . :...::
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pF1KA0 IENK
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770 780 790 800 810 820
pF1KA0 ELEAGEELAAVCAAAYTIELLDTVALNLHRIDKDVQRCDRNYWYFTP---PNLERLRDVM
:.:::.: ::. .. :.: :.:..
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.: .:.:::::: :::.::: ...:. :. ::. : .: ::: . .: :..
CCDS55 MTYCMYDFDLGYVQGMSDLLSPLLYVMENEVDAFWCFASYMDQMHQNFEEQMQGMKTQLI
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pF1KA0 NMRSLIQILDSELFELMHQNGDYTHFYFCYRWFLLDFKRELLYEDVFAVWEVIWAARHIS
.. .:...::: . . .. : ..:::.::.:. ::::. . :.. .:::.:. ..
CCDS55 QLSTLLRLLDSGFCSYL-ESQDSGYLYFCFRWLLIRFKREFSFLDILRLWEVMWT--ELP
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.: :.. :..:. .. : .... :..:.: .:: . . :...::
CCDS55 CTNFHLLLCCAILESEKQQIMEKHYGFNEILKHINELSMKIDVEDILCKAEAISLQMVKC
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pF1KA0 IENK
CCDS55 KELPQAVCEILGLQGSEVTTPDSDVGEDENVVMTPCPTSAFQSNALPTLSASGARNDSPT
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.: .:.:::::: :::.::: ...:. :. ::. : .: ::: . .: :..
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.. .:...::: . . .. : ..:::.::.:. ::::. . :.. .:::.:. ..
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.: :.. :..:. .. : .... :..:.: .:: . . :...::
CCDS31 CTNFHLLLCCAILESEKQQIMEKHYGFNEILKHINELSMKIDVEDILCKAEAISLQMVKC
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:
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770 780 790 800 810 820
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.:::: : ::: .: ::.: .: ..
CCDS62 KRKEYSEIQQKRLSMTPEEHRAFWRNVQFTVDKDVVRTDRNNQFFRGEDNPNVESMRRIL
100 110 120 130 140 150
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pF1KA0 CSYVWEHLDVGYVQGMCDLLAPLLVTLDNDQLAYSCFSHLMKR-MSQNFPNGGAMDTHFA
.:. . ::: ::: ::.::.:. . ... .. :: ::. . . : :. ..
CCDS62 LNYAVYNPAVGYSQGMSDLVAPILAEVLDESDTFWCFVGLMQNTIFVSSPRDEDMEKQLL
160 170 180 190 200 210
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CCDS62 YLRELLRLTHVRFYQHLVSLGEDGLQMLFCHRWLLLCFKREFPEAEALRIWEACWA--HY
220 230 240 250 260 270
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 SSEHFVLFIALALVEAYREIIRDNNMDFTDIIKFFNERAEHHDAQEILRIARDLVHKVQM
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CCDS62 QTDYFHLFICVAIVAIYGDDVIEQQLATDQMLLHFGNLAMHMNGELVLRKARSLLYQFRL
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:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]