Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0407
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0407, 2135 aa
1>>>pF1KA0407 2135 - 2135 aa - 2135 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0008+/-0.00134; mu= -15.6428+/- 0.080
mean_var=527.0645+/-108.393, 0's: 0 Z-trim(112.4): 45 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.055865
statistics sampled from 13129 (13161) to 13129 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.404), width: 16
Scan time: 7.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135) 14586 1192.5 0
CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909) 3067 264.0 4.4e-69
CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932) 3067 264.0 4.4e-69
CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838) 1671 151.5 3.2e-35
CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896) 1243 117.0 7.9e-25
CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871) 1178 111.8 2.9e-23
CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925) 1144 109.0 2e-22
CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894) 902 89.5 1.5e-16
CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (1894) 892 88.7 2.6e-16
CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12 (1568) 696 72.9 1.3e-11
>>CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135 aa)
initn: 14586 init1: 14586 opt: 14586 Z-score: 6370.5 bits: 1192.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 14586; 100.0% identity (100.0% similar) in 2135 aa overlap (1-2135:1-2135)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQLSP
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CCDS27 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQLSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQPTNNPNQLLLVSPGALVVCGSVHQGVCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQPTNNPNQLLLVSPGALVVCGSVHQGVCE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQGLAGEPLLFVGRGYTSRGVGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQGLAGEPLLFVGRGYTSRGVGGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 IPPITTRALWPPDPQAAFSYEETAKLAVGRLSEYSHHFVSAFARGASAYFLFLRRDLQAQ
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CCDS27 IPPITTRALWPPDPQAAFSYEETAKLAVGRLSEYSHHFVSAFARGASAYFLFLRRDLQAQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACEGGRYGLIQAAAVATSREVAHGEVLFAAFSSA
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CCDS27 SRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACEGGRYGLIQAAAVATSREVAHGEVLFAAFSSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 APPTVGRPPSAAAGASGASALCAFPLDEVDRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 APPTVGRPPSAAAGASGASALCAFPLDEVDRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NSDCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 NSDCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSIQQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSIQQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PANISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHFGEHQSPALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 PANISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHFGEHQSPALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RGADYVSVSVELRFGAVVIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLC
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CCDS27 RGADYVSVSVELRFGAVVIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 THKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTAT
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CCDS27 THKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTAT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 ASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRP
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CCDS27 ASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 SATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALD
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CCDS27 SATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 WLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGL
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CCDS27 WLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 WELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLE
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CCDS27 WELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 VVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQPELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQPELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 DCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTREACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLTG
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CCDS27 DCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTREACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLTG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 PVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 PVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAGA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 TAVEVPGRGRGVSEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 TAVEVPGRGRGVSEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVVVG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 DQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERRLQRGQFKYTLDPNITSAGPT
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CCDS27 DQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERRLQRGQFKYTLDPNITSAGPT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 KSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPETACSLGPSCSS
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CCDS27 KSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPETACSLGPSCSS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 QQFEEPCHVNSSQLITCRTPALPGLPEDPWVRVEFILDNLVFDFATLNPTPFSYEADPTL
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CCDS27 QQFEEPCHVNSSQLITCRTPALPGLPEDPWVRVEFILDNLVFDFATLNPTPFSYEADPTL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 QPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHLYCEPP
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CCDS27 QPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHLYCEPP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 VEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESPGAFPVAAQVGLGVGTSLL
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CCDS27 VEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESPGAFPVAAQVGLGVGTSLL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 ALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLTSDLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLTSDLLG
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 SGIPFLDYKVYAERIFFPGHRESPLHRDLGVPESRRPTVEQGLGQLSNLLNSKLFLTKFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SGIPFLDYKVYAERIFFPGHRESPLHRDLGVPESRRPTVEQGLGQLSNLLNSKLFLTKFI
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 HTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQYVAKNPKLMLRRTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQYVAKNPKLMLRRTE
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 TVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 TVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 REDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKVLDCDTISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 REDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKVLDCDTISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDP
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 RTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCLTKHVLRE
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CCDS27 RTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCLTKHVLRE
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 NQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 NQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLT
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 RLLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSRPVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RLLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSRPVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNS
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 LPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYAR
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 DIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYD
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130
pF1KA0 QIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL
2110 2120 2130
>>CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909 aa)
initn: 4747 init1: 1242 opt: 3067 Z-score: 1353.7 bits: 264.0 E(32554): 4.4e-69
Smith-Waterman score: 5826; 47.0% identity (66.1% similar) in 2164 aa overlap (2-2135:23-1909)
10 20 30
pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTA---FTPNGTYLQ
: .: :: : :. ::: :. :. .: :.
CCDS14 MCHAAQETPLLHHFMAPVMARWPPFGLCLLLLL-----LSPPPLPLTGAHRFSAPNTTLN
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 HLARDPTSGTLYLGATNFLFQLSPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQPTNN
::: : ::::.::.: :::::: :::::.. ::::.:: ::.: : :::::: :.:
CCDS14 HLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQLEAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQAQLTDN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 PNQLLLVSPGA--LVVCGSVHQGVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVG
::::::: : ::.::.:.::::: ::::.. ..: . : ::: :.:::: :.:.:::
CCDS14 ANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVATVG
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 LVAQGLAGEPLLFVGRGYTSRGVGGGIPPITTRALWPPDPQAAFSYEETAKLAVGRLSEY
::. : :. ::.:.:: ... ...:.::.. : : .: :: : ..:.:: .:.:
CCDS14 LVVP-LPGRDLLLVARGLAGK-LSAGVPPLAIRQLAGSQP---FSSEGLGRLVVGDFSDY
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 SHHFVSAFARGASAYFLFLRRDLQAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACEGGRYG
.. .:.::: . ::::.: :: .::.. .:.::.:::: : . :::::.::::.: :
CCDS14 NNSYVGAFADARSAYFVFRRRGARAQAE-YRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQG--QG
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 LIQAAAVATSREVAHGEVLFAAFSSAAPPTVGRPPSAAAGASGA-SALCAFPLDEVDRLA
::::: .: . .:...: ::: :. .::::::. :.
CCDS14 LIQAAFLAPG-------TLLGVF--------------AAGPRGTQAALCAFPMVELGASM
290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 NRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDVNSDCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLE
...: ::: ::. .:.: : .:: :.: :. ::.:. ..::::..:::::.:.: :::
CCDS14 EQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTLPLDSPESYPCGDEHTPSPIAGRQPLE
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 ATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSI-QQGSA
. :.:. : ..:::. . ::: ::::::.::::..:.: ::.:. : .:.. :::
CCDS14 VQPLLKL-GQPVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKVFLH-GSQGQVYHSQQVGPPGSA
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRS
.: :: .:.. ::::.: . ..:::.: : :::::: .:: :::::: :::.:..
CCDS14 ISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDCASCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKG
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPANISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHF
.:.:. .:::::.. . ::.. .. :.. :.: .: :::: :: : : . : :
CCDS14 QCGRAGQLNQWLWSYEEDSHCLHIQSLLPGHHPRQEQGQVTLSVPRLPILDADEYFHCAF
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 GEHQSPALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLPRGADYVSVSVELRFGAVVIAKTSLSFYDCVAV
:...: : . : : : .: ...:. : :.:.:.: . : : :..: :..::::: ::
CCDS14 GDYDSLAHVEGPHVACVTPPQDQVPLNPPGTDHVTVPLALMFEDVTVAATNFSFYDCSAV
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 TELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLCTHKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSP
:. .: :.:::.: : :.:: . :.. :
CCDS14 QALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEHC--------------------------
630 640 650
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 SPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTG
CCDS14 ------------------------------------------------------------
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 SPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRPSATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHP
::
CCDS14 -------------------------------PE---------------------------
660
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 TVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDWLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGD
:. .:.. .
CCDS14 ---------------------------------------------GERTIYSAQEV----
670
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: : :: .:: ::.. : :.:: : .
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. : :::. :. :.. .: .:: : . : .: : :. . :: ::. :
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:: : ... .. :.:....:.:.::::..:: :::.::.: . ::.:: .: :
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: . :: :::: : .::::::: .:: .:: :::::. :: :.::. :
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: . . :..:. .::.:. . . ..: . : . .. :.: . :.:::: . :. : :
CCDS14 CNPEPSLYRTSARIVCVTSPAPNGTTGPVRVAIKSQPPGISSQHFTYQDPVLLSLSPRWG
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:.::::.::. :..: :: . . :: ::: .: : . :.: :. .:. : :
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:: ..: : . :.:: .:....: :. :: .::: : ::: .::::: : . :
CCDS14 VFGHAQRTLLASPFRYTANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWLEAD
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: . ::.. :: .: . :: .:: . : : ::::.:. ::.::.
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: . : :: : :::. :::. . : :. .: : ::. : :. :.: ::: :..
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::::.:.:..::::: . :: : :.:::::: :::::::.. : : . . .::.:
CCDS14 VEGEGLNLGISKEEVRVHIGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPANGS------GLPQF
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.:::::....:: :::..: : .:::: ::.:.:.:...: .:....::::.:::::::
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::.:: .:::.::..: :.:.:::::::::::::.::: :::::::::..:::: :::::
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CCDS14 SLLSLALHGKLEYLTDIMRTLLGDLAAHYVHRNPKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAF
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.:. .:::::::::.:..::::::::.:::::: ::::.::::::::..:::: .: ::
CCDS14 LREVAGEPLYMLFRAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLTLMVL--VG
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:::: : : ::..::: :::.:.:::.:::.:::.:..:::. ..::.:::::.:
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::: :::::.:: .:. :.::::::::::::::::.::: : . . . . : ::
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: ::: .:::. ::::: ..::: . : .::: : ::::::::::::::::::::
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:::::: ::.:::..::.:.::::.:::::: :..::: : :.:::::::: ::::.:
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10 20
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.:.: :::. :.:. : ..:::. . ::: ::::::.::::..:.: ::.:. : .:
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:. .:
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CCDS55 PGEAAVLVVFGHAQRTLLASPFRYTANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPL
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CCDS55 LMVL--VGPGAGGAAGSSEMQRVPARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALD
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CCDS55 LEWRSGLAGHLTLSDEDLTSVTQNHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLVPQLHRGSTISQSLA
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. : :: : ::: .:::. ::::: ..::: . : .::: : ::::::::::::
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:::::::::::::: ::.:::..::.:.::::.:::::: :..::: : :.::::::::
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1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 PLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARD
::::.: .::::..:::..:::.::.: ::::::.:.:: ..::.:::::.:::::::.
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.:: :.: . : : . :.: :
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. .: . . : : : ::
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.:: :::.::.:: :..::: :..: :.: :.:: :. ::: . :. ....
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CCDS43 MDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISR
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:::: : : . . .. ..:: ::. . . .:.. : . :.
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CCDS33 QYTSCELCLGSRDPHCGWCVLHSICSRRDACERADEPQRFAADL---LQCVQLT-VQPRN
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.: .. . :.. ..: : : .: : . .: ..: . . : ::. :. . :
CCDS33 VSVTMSQVPLVLQAWNVPDLSAG--VNCSFEDFTESESVLEDGRIHCRSPSAREVAPITR
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: .: :.. :. . .:.... ::.: .: . .: .::.. . :.:: ..:
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.:::. :.:
CCDS33 VCTHNVADC---------------------------------------------------
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:: : : . .: : ::::. :
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.:: : . : : .::: :.: ::....
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. :: : . . .:. : : :.. : :: .:: :: :. :. .:. ...:
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: .. : . ::: : :..: . :.. : . . :.::: .::: . ..
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::.: .: :. : :: .:: . ..:...:: : : .:.. :. . .. .. .
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:. : : .. ..::.:.. : : : : .. :.
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.:: : .. .:: : : : ::.:.::.: : .. ::.: . ..:.:: . :.
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.::.:..:::.:..::.:.:.:....:.:....:. :::: :.: .: ::::
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:::::..:::::.:: ::::: .::: .:.:::.: ...::.:::::..... :.
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::::: ::.: ::..::::: .:: . : :.. . . ::::
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. :.: . ::::: :. . . ::: : . ::::::::. :::::::
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::::::: . :::.:.. ::: : . ..... ::::.:.::.:: :.:..:::.:
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CCDS14 PYSQRPKAEDMDLEWRQGRMTRIILQDEDVTTKIECDWKRLNSLAHYQVTDGSLVALVPK
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1860 1870 1880 1890
pF1KA0 ---------------CLTKH--VLRE--NQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDE
:... .:: . : . . :.::. .: : . ::::: :.
CCDS14 QVSAYNMANSFTFTRSLSRYESLLRTASSPDSLRS-RAPMITPDQETGTKLWHLVKNHDH
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1900 1910 1920 1930 1940
pF1KA0 PEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSR---PVPL
. . ::: : . ::::::::. ::::::::::::....::.. .::
CCDS14 ADHREGDRGS---------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETVFSTAHRGSALPL
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1950 1960 1970 1980 1990 2000
pF1KA0 AVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVL
:.::.::.:::::.:. ::: :. : ::.: ::::::.:.:::::::::.. .. :: :
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2010 2020 2030 2040 2050 2060
pF1KA0 LVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNS
:.::::::.:. ..:.::.::: ::::::.::: :: ::::: :: . . :::.:..
CCDS14 SVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYRDIAKMASISDQDMDA
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pF1KA0 VLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVE
:.: : ...:... ::.::: :..:: ..:.:::..:.. .: .: .:.:: . :
CCDS14 YLVEQSRLHASDFSVLSALNELYFYVTKYRQEILTALDRDASCRKHKLRQKLEQIISLVS
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pF1KA0 NKVTDL
CCDS14 SDS
1870
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10 20 30
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40 50 60 70 80
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.... : : ..::.::.:.: :.::: .:.::: ...::: :: : : .:. :
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. . :.: :..: ..:: .:::::..:: :. :: :.. . .: : .:
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140 150 160 170
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180 190 200 210 220
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::. ...:. .. .: .:. : : . ::. :..:. :.: ..:.. :
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: ..: .:.. . :. : . .: .. : .: . :.:.: . .: ..
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pF1KA0 VIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLC-THKASCDAGPMVASHQ
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. : :.: .: : : : . .: :::: ::..:::.::.:::: .:::: :
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::....:: : ..:: : ..: :: .::.:: . ..:...:.. .:. :.
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CCDS33 -------NESLGAAVGQLP-ITIQVGNFNQTIATLQLGGSE-----TAIIVSIVICSVLL
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CCDS33 SQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESC
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::..:.:.. .:.:::.: :: :.:.::.:. :..::: .:::::.::::::::.:.:
CCDS33 RPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSI
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.. :: ::. .::::::::::::.::::.::::::::.:. .:..::::...:. .::
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CCDS33 QQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLRENIEAKPRNLNVSFQ---GCG-MDSLSVRAMDTD
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pF1KA0 TISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNT
:..:.:::.:. . :.:: .: : . .:.:: .. . :: : : :: :. ..:::
CCDS33 TLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTSVVEDGRKKLNT
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: :::.:.::..:. : ...: . :. ..:.: . .::: :.:: :
CCDS33 LAHYKIPEGASLAM-------SLIDKKDNTLGR----VKDLDTE--KYFHLVLPTDELAE
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CCDS33 PKKSHRQS------HRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKP-PLAVK
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pF1KA0 YFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVI
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CCDS33 YFFDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVI
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pF1KA0 AQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLA
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CCDS33 AQAFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLA
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CCDS33 EESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNI
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CCDS33 YECYSEA
1920
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pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPT--------
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CCDS31 MEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLA---PPAAGMPQFSTFHSENRDWTFNHLTVHQ
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pF1KA0 -SGTLYLGATNFLFQLSPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQP-TNNPNQLL
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CCDS31 GTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTNNVNKLL
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pF1KA0 LV--SPGALVVCGSVHQGVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQG
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CCDS31 IIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLF-ILVEPSHKKE-HYLSSVNKTGTMYGVIVRS
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. . ::.: . : .: ...: : : ::. : ..:: :.
CCDS31 EGEDGKLFIGTAVD--GKQDYFPTLSSRKL-PRDPESSAMLDYELHSDFVSSLIKIPSDT
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pF1KA0 LSEYSHH---FVSAFARGASAYFLFLRRDL-------QAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYS
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CCDS31 LALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFHS
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CCDS31 YVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQ-YHHPPD
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CCDS31 D-------SALCAFPIRAINLQIKERLQSCYQGEGNLELN---WLLGKDVQ--CTKAPVP
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CCDS31 IDDNF-CGLD-INQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKK
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. :: : : :. ..:: . ::..:. ..::::.. . .::: :: :. :
CCDS31 IRADGPPHGGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTC
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pF1KA0 ASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPANIS-RE
. ::. ::.::::.: . ::::..:... :... :.. :...: . :..:: :
CCDS31 GECLSSGDPHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQ---CVSLA-VHPSSISVSE
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