Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0425
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0425, 1224 aa
1>>>pF1KA0425 1224 - 1224 aa - 1224 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9105+/-0.000916; mu= 16.5225+/- 0.055
mean_var=140.9704+/-28.674, 0's: 0 Z-trim(109.9): 24 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.108022
statistics sampled from 11227 (11248) to 11227 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.346), width: 16
Scan time: 4.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS389.1 ZMYM4 gene_id:9202|Hs108|chr1 (1548) 8305 1307.0 0
CCDS387.2 ZMYM6 gene_id:9204|Hs108|chr1 (1325) 3146 503.0 2.1e-141
CCDS41302.1 ZMYM1 gene_id:79830|Hs108|chr1 (1142) 1167 194.5 1.3e-48
CCDS55444.1 ZMYM3 gene_id:9203|Hs108|chrX (1358) 743 128.5 1.1e-28
CCDS45016.1 ZMYM2 gene_id:7750|Hs108|chr13 (1377) 736 127.4 2.5e-28
CCDS14409.1 ZMYM3 gene_id:9203|Hs108|chrX (1370) 733 126.9 3.4e-28
CCDS55443.1 ZMYM3 gene_id:9203|Hs108|chrX ( 495) 617 108.5 4.4e-23
CCDS2787.1 QRICH1 gene_id:54870|Hs108|chr3 ( 776) 539 96.5 2.8e-19
>>CCDS389.1 ZMYM4 gene_id:9202|Hs108|chr1 (1548 aa)
initn: 8305 init1: 8305 opt: 8305 Z-score: 6996.4 bits: 1307.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8305; 100.0% identity (100.0% similar) in 1224 aa overlap (1-1224:325-1548)
10 20 30
pF1KA0 MNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQKGQTA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 LKISAVFSVSGSPLAPQLTTGFQPSLASSGMNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQKGQTA
300 310 320 330 340 350
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 YQRKGSTQLFCSTLCLTGYTVPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 YQRKGSTQLFCSTLCLTGYTVPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSK
360 370 380 390 400 410
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 DFCSQSCLSTYELKKKPIVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 DFCSQSCLSTYELKKKPIVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSK
420 430 440 450 460 470
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 FRSANNLTMNCCENCGGYCYSGSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQKSAKITPCALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 FRSANNLTMNCCENCGGYCYSGSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQKSAKITPCALC
480 490 500 510 520 530
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 KSLRSSAEMIENTNSLGKTELFCSVNCLSAYRVKMVTSAGVQVQCNSCKTSAIPQYHLAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 KSLRSSAEMIENTNSLGKTELFCSVNCLSAYRVKMVTSAGVQVQCNSCKTSAIPQYHLAM
540 550 560 570 580 590
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 SDGSIRNFCSYSCVVAFQNLFNKPTGMNSSVVPLSQGQVIVSIPTGSTVSAGGGSTSAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 SDGSIRNFCSYSCVVAFQNLFNKPTGMNSSVVPLSQGQVIVSIPTGSTVSAGGGSTSAVS
600 610 620 630 640 650
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 PTSISSSAAAGLQRLAAQSQHVGFARSVVKLKCQHCNRLFATKPELLDYKGKMFQFCGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 PTSISSSAAAGLQRLAAQSQHVGFARSVVKLKCQHCNRLFATKPELLDYKGKMFQFCGKN
660 670 680 690 700 710
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 CSDEYKKINNVMAMCEYCKIEKIVKETVRFSGADKSFCSEGCKLLYKHDLAKRWGNHCKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 CSDEYKKINNVMAMCEYCKIEKIVKETVRFSGADKSFCSEGCKLLYKHDLAKRWGNHCKM
720 730 740 750 760 770
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 CSYCLQTSPKLVQNNLGGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQMAKCDACKRQGKLSESLKWRGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 CSYCLQTSPKLVQNNLGGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQMAKCDACKRQGKLSESLKWRGE
780 790 800 810 820 830
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 MKHFCNLLCILMFCNQQSVCDPPSQNNAANISMVQAASAGPPSLRKDSTPVIANVVSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MKHFCNLLCILMFCNQQSVCDPPSQNNAANISMVQAASAGPPSLRKDSTPVIANVVSLAS
840 850 860 870 880 890
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 APAAQPTVNSNSVLQGAVPTVTAKIIGDASTQTDALKLPPSQPPRLLKNKALLCKPITQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 APAAQPTVNSNSVLQGAVPTVTAKIIGDASTQTDALKLPPSQPPRLLKNKALLCKPITQT
900 910 920 930 940 950
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 KATSCKPHTQNKECQTEDTPSQPQIIVVPVPVPVFVPIPLHLYTQYAPVPFGIPVPMPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 KATSCKPHTQNKECQTEDTPSQPQIIVVPVPVPVFVPIPLHLYTQYAPVPFGIPVPMPVP
960 970 980 990 1000 1010
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 MLIPSSMDSEDKVTESIEDIKEKLPTHPFEADLLEMAEMIAEDEEKKTLSQGESQTSEHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MLIPSSMDSEDKVTESIEDIKEKLPTHPFEADLLEMAEMIAEDEEKKTLSQGESQTSEHE
1020 1030 1040 1050 1060 1070
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 LFLDTKIFEKDQGSTYSGDLESEAVSTPHSWEEELNHYALKSNAVQEADSELKQFSKGET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 LFLDTKIFEKDQGSTYSGDLESEAVSTPHSWEEELNHYALKSNAVQEADSELKQFSKGET
1080 1090 1100 1110 1120 1130
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 EQDLEADFPSDSFDPLNKGQGIQARSRTRRRHRDGFPQPRRRGRKKSIVAVEPRSLIQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 EQDLEADFPSDSFDPLNKGQGIQARSRTRRRHRDGFPQPRRRGRKKSIVAVEPRSLIQGA
1140 1150 1160 1170 1180 1190
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 FQGCSVSGMTLKYMYGVNAWKNWVQWKNAKEEQGDLKCGGVEQASSSPRSDPLGSTQDHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 FQGCSVSGMTLKYMYGVNAWKNWVQWKNAKEEQGDLKCGGVEQASSSPRSDPLGSTQDHA
1200 1210 1220 1230 1240 1250
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 LSQESSEPGCRVRSIKLKEDILSCTFAELSLGLCQFIQEVRRPNGEKYDPDSILYLCLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 LSQESSEPGCRVRSIKLKEDILSCTFAELSLGLCQFIQEVRRPNGEKYDPDSILYLCLGI
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 QQYLFENGRIDNIFTEPYSRFMIELTKLLKIWEPTILPNGYMFSRIEEEHLWECKQLGAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 QQYLFENGRIDNIFTEPYSRFMIELTKLLKIWEPTILPNGYMFSRIEEEHLWECKQLGAY
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 SPIVLLNTLLFFNTKYFQLKNVTEHLKLSFAHVMRRTRTLKYSTKMTYLRFFPPLQKQES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 SPIVLLNTLLFFNTKYFQLKNVTEHLKLSFAHVMRRTRTLKYSTKMTYLRFFPPLQKQES
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 EPDKLTVGKRKRNEDDEVPVGVEMAENTDNPLRCPVRLYEFYLSKCSESVKQRNDVFYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 EPDKLTVGKRKRNEDDEVPVGVEMAENTDNPLRCPVRLYEFYLSKCSESVKQRNDVFYLQ
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 PERSCVPNSPMWYSTFPIDPGTLDTMLTRILMVREVHEELAKAKSEDSDVELSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 PERSCVPNSPMWYSTFPIDPGTLDTMLTRILMVREVHEELAKAKSEDSDVELSD
1500 1510 1520 1530 1540
>>CCDS387.2 ZMYM6 gene_id:9204|Hs108|chr1 (1325 aa)
initn: 2048 init1: 1171 opt: 3146 Z-score: 2652.2 bits: 503.0 E(32554): 2.1e-141
Smith-Waterman score: 3150; 61.7% identity (79.3% similar) in 794 aa overlap (4-785:79-852)
10 20 30
pF1KA0 MNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQKGQTAYQR
.::::::.:..: ::::::.: ::::::..
CCDS38 GGVSSVNERPIAQQLNPGFQLSFASSGPSVLLPSVPAVAIKVFCSGCKKMLYKGQTAYHK
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 KGSTQLFCSTLCLTGYTVPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSKDFC
::::::::: :.: .. : :::: ::::..::::::::::::...:::. :::::
CCDS38 TGSTQLFCSTRCITRHSSPACLPPPP--KKTCTNCSKDILNPKDVITTRFENSYPSKDFC
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 SQSCLSTYELKKKPIVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSKFRS
::::::.:::::::.::: :.::::::::::::: : ::.:::::: ::::::::::.:
CCDS38 SQSCLSSYELKKKPVVTIYTKSISTKCSMCQKNADTRFEVKYQNVVHGLCSDACFSKFHS
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 ANNLTMNCCENCGGYCYSGSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQKSAKITPCALCKSL
.::::::::::::.::::.:: : ::.: ::. .:::::.::.: : :: :::
CCDS38 TNNLTMNCCENCGSYCYSSSGPC-------QSQKVFSSTSVTAYKQNSAQIPPYALGKSL
230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 RSSAEMIENTNSLGKTELFCSVNCLSAYRVKMVTSAGVQVQCNSCKTSAIPQYHLAMSDG
: ::::::.::. ::::::::.::::::::: :::.::::.:.:::::::::::::::.:
CCDS38 RPSAEMIETTNDSGKTELFCSINCLSAYRVKTVTSSGVQVSCHSCKTSAIPQYHLAMSNG
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 SIRNFCSYSCVVAFQNLFNKPTGMNSSVVPLSQGQVIVSIPTG-STVSAGGGSTSAVSPT
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CCDS38 TIYSFCSSSCVVAFQNVFSKPKGTNSSAVPLSQGQVVVSPPSSRSAVSIGGGNTSAVSPS
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 SISSSAAAGLQRLAAQSQHVGFARSVVKLKCQHCNRLFATKPELLDYKGKMFQFCGKNCS
:: .::::.:: :: :::.:.....::::::::::.::::::::: :::::: :::::::
CCDS38 SIRGSAAASLQPLAEQSQQVALTHTVVKLKCQHCNHLFATKPELLFYKGKMFLFCGKNCS
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 DEYKKINNVMAMCEYCKIEKIVKETVRFSGADKSFCSEGCKLLYKHDLAKRWGNHCKMCS
::::: :.:.:::.:::..::.::::::::.:: :::: ::.: .:...::::.:::::
CCDS38 DEYKKKNKVVAMCDYCKLQKIIKETVRFSGVDKPFCSEVCKFLSARDFGERWGNYCKMCS
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 YCLQTSPKLVQNNLGGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQMAKCDACKRQGKLSESLKWRGEMK
:: ::::.::.: : ::.::::::.::::.:::::::::::.::::::::::.::::..:
CCDS38 YCSQTSPNLVENRLEGKLEEFCCEDCMSKFTVLFYQMAKCDGCKRQGKLSESIKWRGNIK
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 HFCNLLCILMFCNQQSVCDPPSQNNAANISMVQAASAGPPSLRKDSTPVIANVVSLASAP
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CCDS38 HFCNLFCVLEFCHQQIMNDCLPQNKV-NISKAKTAVTELPSARTDTTPVITSVMSLAKIP
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620
pF1KA0 AAQPTVNSNSVLQGAVPTVTAKIIGDASTQTDALKLPPSQ---PPRLLKNKALLCKPITQ
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CCDS38 ATLSTGNTNSVLKGAVTKEAAKIIQDESTQEDAMKFPSSQSSQPSRLLKNKGISCKPVTQ
640 650 660 670 680 690
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 TKATSCKPHTQNKECQTEDTPSQPQIIVVPVPVPVFVPIPLHLY----TQYAPVPF----
:::::::::::.::::: : : . . . : : .. :.: : :
CCDS38 TKATSCKPHTQHKECQT-DLPMPNEKNDAELDSPPSKKKRLGFFQTYDTEYLKVGFIICP
700 710 720 730 740 750
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 GIPVPMPVPMLIPSSMDSEDKVTESIEDIKEKLPTHPFEADLLEMAEMIAEDEEKKTLSQ
: : :. . . .. : :..: .: ... :. . .. :.:.: .
CCDS38 GSKESSPRPQCVICG-----EILSS-ENMKPANLSHHLKTKHSELENKPVDFFEQKSLEM
760 770 780 790 800 810
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 GESQTSEHELFLDTKIFEKDQGSTYSGDLESEAVSTPHSWEEELNHYALKSNAVQEADSE
...: .. .: : . : ..: ... : . : : :::
CCDS38 ECQNSSLKKCLLVEKSLVK---ASYLIAFQTAASKKPFSIAEELIKPYLVEMCSEVLGSS
820 830 840 850 860
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 LKQFSKGETEQDLEADFPSDSFDPLNKGQGIQARSRTRRRHRDGFPQPRRRGRKKSIVAV
CCDS38 AGDKMKTIPLSNVTIQHRIDELSADIEDQLIQKVRESKWFALQIDESSEISNITLLLCYI
870 880 890 900 910 920
>>CCDS41302.1 ZMYM1 gene_id:79830|Hs108|chr1 (1142 aa)
initn: 1213 init1: 869 opt: 1167 Z-score: 986.3 bits: 194.5 E(32554): 1.3e-48
Smith-Waterman score: 1167; 46.9% identity (71.2% similar) in 437 aa overlap (1-431:73-499)
10 20 30
pF1KA0 MNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQKGQTA
.::::::: .::..:::.::::::::::::
CCDS41 QENELKINAVFSESASQLTAGIQLSLASSGVNKMLPSVSTTAIQVSCAGCKKILQKGQTA
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 YQRKGSTQLFCSTLCLTGYTVPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSK
::::::.::::: :.: : . : : : .:.:::.:::::::::::::.:.:.::. :
CCDS41 YQRKGSAQLFCSIPCITEY-ISSASSPVP-SKRTCSNCSKDILNPKDVISVQLEDTTSCK
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 DFCSQSCLSTYELKKKPIVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSK
::: ::::.:: :.::.::: :::: ::::::::.:.:..::.:::: :.:::.::.::
CCDS41 TFCSLSCLSSYEEKRKPFVTICTNSILTKCSMCQKTAIIQYEVKYQNVKHNLCSNACLSK
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 FRSANNLTMNCCENCGGYCYSGSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQKSAKITPCALC
:.::::. :::::::: :::..:. :.::.::::. : ::. ::::::: :: . :
CCDS41 FHSANNFIMNCCENCGTYCYTSSSLSHILQMEGQSHYFNSSKSITAYKQKPAKPLISVPC
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 KSLRSSAEMIENTNSLGKTELFCSVNCLSAYRVKMVTSAGVQVQCNSCKTSAIPQYHLAM
: :. : ::::.:..:::::::::.::.::: . :..:.: ::.
CCDS41 KPLKPSDEMIETTSDLGKTELFCSINCFSAYSKAKMESSSVSVVSVVHDTSTELLSPKKD
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320
pF1KA0 SDGSIRNFCSYSCVVAFQNLFNKPTGMN--SSVVPLSQGQVIVSIPTGSTVSAGGGSTSA
. : :. : . . . ..: . .. :::. .. : .: . : : . .:.:.
CCDS41 TTPVISNIVSLADTDVALPIMNTDVLQDTVSSVTATADVIVDLSKSSPSEPSNAVASSST
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 VSPTSISSSAAAGLQRLAAQSQHVGFAR-SVVKLKCQHCNRLFATKPELLDYKGKMFQFC
.: :.: :... :. ..: .: . .:.. . :. ..: . . :.. ..
CCDS41 EQP-SVSPSSSVFSQHAIGSSTEVQKDNMKSMKISDELCHPKCTSKVQKVKGKSRSIK--
410 420 430 440 450
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 GKNCSDEYKKINNV---MAMCEYCKIEKIVKETVRFSGADKSFCSEGCKLLYKHDLAKRW
:.: ... ..: .:.: :.. . .. :: . .:: ..:
CCDS41 -KSCCADFECLENSKKDVAFCYSCQL--FCQK--YFSCGRESFATHGTSNWKKTLEKFRK
460 470 480 490 500 510
450 460 470 480 490 500
pF1KA0 GNHCKMCSYCLQTSPKLVQNNLGGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQMAKCDACKRQGKLSES
CCDS41 HEKSEMHLKSLEFWREYQFCDGAVSDDLSIHSKQIEGNKKYLKLIIENILFLGKQCLPLR
520 530 540 550 560 570
>>CCDS55444.1 ZMYM3 gene_id:9203|Hs108|chrX (1358 aa)
initn: 2436 init1: 683 opt: 743 Z-score: 628.2 bits: 128.5 E(32554): 1.1e-28
Smith-Waterman score: 3013; 40.8% identity (66.1% similar) in 1222 aa overlap (10-1219:304-1358)
10 20 30
pF1KA0 MNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQKGQTAYQRKGSTQL
:......:. :. :::::::::::: ::
CCDS55 PNDEDFVPFRPRRSPRMSLRSSVSQRAGRSAVGTKMTCAHCRTPLQKGQTAYQRKGLPQL
280 290 300 310 320 330
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 FCSTLCLTGYTVPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSKDFCSQSCLS
:::. ::: .. :. ::::. :.:.: : :: . :: . . ..::.. :::
CCDS55 FCSSSCLTTFSKKPS------GKKTCTFCKKEIWNTKDSVVAQTGSGGSFHEFCTSVCLS
340 350 360 370 380
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 TYELKK-KPIVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSKFRSANNLT
:: .. .:: . . .:.::.:::.. . :::. .:::.::::.::::::. ..:
CCDS55 LYEAQQQRPIPQSGDPADATRCSICQKTGEVLHEVSNGSVVHRLCSDSCFSKFRANKGLK
390 400 410 420 430 440
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 MNCCENCGGYCYS--GSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQKSAKITPCALCKSLRSS
:::..::.: :. :: ..: :::.:.::...:. :::.:.... ::. ::.: ..
CCDS55 TNCCDQCGAYIYTKTGSPGPELLFHEGQQKRFCNTTCLGAYKKKNTRVYPCVWCKTLCKN
450 460 470 480 490 500
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 AEMIENTNSLGKTELFCSVNCLSAYRVKMVTSAGVQVQCNSCKTSAIPQYHLAMSDGSIR
::. ... ::: ::::. : ..:.::.. .: :. :. : . : ..
CCDS55 FEMLSHVDRNGKTSLFCSLCCTTSYKVKQAGLTGPPRPCSFCRRSLSDPCYYNKVDRTVY
510 520 530 540 550 560
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 NFCSYSCVVAFQNLFNKPTGMNSSVVPLSQGQVIVSIPTGSTVSAGGGSTSAVSPTSISS
.::: :: . :: .: ::
CCDS55 QFCSPSCWTKFQR-----------------------------TSPEGG------------
570 580
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 SAAAGLQRLAAQSQHVGFARSVVKLKCQHCNRLFATKPELLDYKGKMFQFCGKNCSDEYK
..:.:..:. ::. :::.::.. ..:::: ..: ...:
CCDS55 ----------------------IHLSCHYCHSLFSGKPEVLDWQDQVFQFCCRDCCEDFK
590 600 610 620
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 KINNVMAMCEYCKIEKIVKETVRFSGADKSFCSEGCKLLYKHDLAKRWGNHCKMCSYCLQ
.. .:...::.:. ::...: .::::..:::::::: ::::.:..:. : : :.:: :
CCDS55 RLRGVVSQCEHCRQEKLLHEKLRFSGVEKSFCSEGCVLLYKQDFTKKLGLCCITCTYCSQ
630 640 650 660 670 680
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 TSPKLVQNNLGGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQMAKCDACKRQGKLSESLKWRGEMKHFCN
: . : ..: :.. .:: :.: ::: . . . :.: :::::::: :...:::...::::
CCDS55 TCQRGVTEQLDGSTWDFCSEDCKSKYLLWYCKAARCHACKRQGKLLETIHWRGQIRHFCN
690 700 710 720 730 740
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LLCILMFCNQQSVCDPPSQNNAANISMVQAASAGPPSLRKDSTPVIANVVSLASAPAAQP
:.: : .:: : :.. ...:: :: ....: : ..:.
CCDS55 QQCLLRFYSQQ---------NQPNLD----TQSGPESLLNSQSPE-----SKPQTPSQTK
750 760 770 780
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 TVNSNSVLQGAVPTVTAKIIGDASTQTDALKLPPSQPPRLLKNKALLCKPITQTKATSCK
. :::.. :. : . : : :: :: :::: .:::. :....:::
CCDS55 VENSNTI-----PVKTRS----APTAPTPPPPPPPATPR--KNKAAMCKPLMQNRGVSCK
790 800 810 820 830
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 PHTQNKECQTEDTPSQPQIIVVPVPVPVFVPIPLHLYTQYAPVPFGIPVPMPVPMLIPSS
. ..: :::. .::.::.:.:::.:::.:.::: : .::::..:.:.::::..:..
CCDS55 VEMKSKGSQTEEW--KPQVIVLPIPVPIFVPVPMHLYCQKVPVPFSMPIPVPVPMFLPTT
840 850 860 870 880 890
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 MDSEDKVTESIEDIKEKLPTHPFEADLLEMAEMIAEDEEKKTLSQGESQTSEHELFLDTK
..: ::..:.::..: :.:..:.:::.: ::::::: :: :... :. .
CCDS55 LESTDKIVETIEELKVKIPSNPLEADILAMAEMIAEAEE---LDKASSDLCD--------
900 910 920 930 940
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 IFEKDQGSTYSGDLESEAVSTPHSWEEELNHYALKSNAVQEADSELKQFSKGETEQDLEA
. ..:.. : ::. . : .... .:.: : . : :::::
CCDS55 -LVSNQSAE--GLLEDCDLFGPA--RDDVLAMAVKMANVLD-----------EPGQDLEA
950 960 970 980
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 DFPSDSFDPLNKGQGIQ-----ARSRTRRRHRDGFPQPRRRGRKKSIVAVEPRSLIQGAF
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CCDS55 DFPKNPLD-INPSVDFLFDCGLVGPEDVSTEQD-LPRTMRKGQKR-LVLSESCSRDSMSS
990 1000 1010 1020 1030 1040
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 QGCSVSGMTLKYMYGVNAWKNWVQWKNAKEEQGDLKCGGVEQASSSPRSDPLGSTQDHAL
: : .: :.: ::::::: ::: : :. : . ..: :
CCDS55 QP-SCTG--LNYSYGVNAWKCWVQSKYANGE--------------TSKGDEL--------
1050 1060 1070
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 SQESSEPGCRVRSIKLKEDILSCTFAELSLGLCQFIQEVRRPNGEKYDPDSILYLCLGIQ
. . .: ...:::::.:. :::. :: ::..:. :::::.:.:::: :::::::
CCDS55 -RFGPKP------MRIKEDILACSAAELNYGLAQFVREITRPNGERYEPDSIYYLCLGIQ
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 QYLFENGRIDNIFTEPYS-RFMIELTKLLKIWEPTILPNGYMFSRIEEEHLWECKQLGAY
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CCDS55 QYLLENNRMVNIFTDLYYLTFVQELNKSLSTWQPTLLPNNTVFSRVEEEHLWECKQLGVY
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 SPIVLLNTLLFFNTKYFQLKNVTEHLKLSFAHVMRRTR---TLKYSTKMTYLRFFPPLQK
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CCDS55 SPFVLLNTLMFFNTKFFGLQTAEEHMQLSFTNVVRQSRKCTTPRGTTKVVSIRYYAPVRQ
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 QESEPDKLTVGKRKRNEDDEVPVGVEMAENTDNPLRCPVRLYEFYLSKCSESVKQRNDVF
.... ::::: .::.:. .:. :: :::::::..:::::::: ::.. :::::
CCDS55 RKGRDTG--PGKRKR--EDEAPI-LEQRENRMNPLRCPVKFYEFYLSKCPESLRTRNDVF
1260 1270 1280 1290 1300
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 YLQPERSCVPNSPMWYSTFPIDPGTLDTMLTRILMVREVHEELAKAKSEDSDVELSD
::::::::. .::.:::..:.: . :..::.::: :::..:::.. :: :
CCDS55 YLQPERSCIAESPLWYSVIPMDRSMLESMLNRILAVREIYEELGRPGEEDLD
1310 1320 1330 1340 1350
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10 20 30
pF1KA0 MNKMLPSV---PATAVRVSCSGCKKILQKGQTAYQ
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CCDS45 SQSASFPRNQKQPGVDSLSPVASLPKQIFQPSVQQQPTKPVKVTCANCKKPLQKGQTAYQ
290 300 310 320 330 340
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 RKGSTQLFCSTLCLTGYTVPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSKDF
::::..::::: ::.... :: : :: : :.::: . : .: :: ... . ..:
CCDS45 RKGSAHLFCSTTCLSSFSHKPA-P-----KKLCVMCKKDITTMKGTIVAQVDSSESFQEF
350 360 370 380 390 400
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pF1KA0 CSQSCLSTYELKKKPIVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSKFR
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CCDS45 CSTSCLSLYEDKQNPTKGALNKS---RCTICGKLTEIRHEVSFKNMTHKLCSDHCFNRYR
410 420 430 440 450
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pF1KA0 SANNLTMNCCENCGGYCYSGSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQ-------------
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CCDS45 MANGLIMNCCEQCGEYLPSKGAGNNVLVIDGQQKRFCCQSCVSEYKQVGSHPSFLKEVRD
460 470 480 490 500 510
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pF1KA0 -----------KSAKITPCALCKSLRSSAEMIENTNSLGKTELFCSVNCLSAYRVKMVTS
: .:.: :. :.. .: . . : : .::. :......:.. :
CCDS45 HMQDSFLMQPEKYGKLTTCTGCRTQCRFFDMTQCIGPNGYMEPYCSTACMNSHKTKYAKS
520 530 540 550 560 570
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 AGVQVQCNSCKTSAIPQYHLAMSDGSIRNFCSYSCVVAFQNLFNKPTGMNSSVVPLSQGQ
.. . :. :: ...:::. .: ::.. :::. :::. :: : .:.::
CCDS45 QSLGIICHFCKRNSLPQYQATMPDGKLYNFCNSSCVAKFQAL-----SMQSS--------
580 590 600 610 620
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pF1KA0 VIVSIPTGSTVSAGGGSTSAVSPTSISSSAAAGLQRLAAQSQHVGFARSVVKLKCQHCNR
:.:. :. :..: .:::..:.
CCDS45 -----PNGQFVA----------PSDI-------------------------QLKCNYCKN
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pF1KA0 LFATKPELLDYKGKMFQFCGKNCSDEYKKINNVMAMCEYCKIEKIVKETVRFSGADKSFC
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CCDS45 SFCSKPEILEWENKVHQFCSKTCSDDYKKLHCIVTYCEYCQEEKTLHETVNFSGVKRPFC
650 660 670 680 690 700
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pF1KA0 SEGCKLLYKHDLAKRWGNHCKMCSYCLQTSPKLVQNNLGGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQ
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CCDS45 SEGCKLLYKQDFARRLGLRCVTCNYCSQLCKKGATKELDGVVRDFCSEDCCKKFQDWYYK
710 720 730 740 750 760
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pF1KA0 MAKCDACKRQGKLSESLKWRGEMKHFCNLLCILMFCNQQSVCDPPSQNNAANISMVQAAS
:.:: :: :: :.: ..:::::::::. :.: : :: : :.. ..
CCDS45 AARCDCCKSQGTLKERVQWRGEMKHFCDQHCLLRFYCQQ---------NEPNMT----TQ
770 780 790 800 810
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pF1KA0 AGPPSLRKDSTPVIANVVSLASAPAAQPTVNSNSVLQGAVPTVTAKIIGDASTQTDALKL
:: .:. : : .: . . :..:
CCDS45 KGPENLHYD-----------------QGCQTSRTKMTGSAP-------------------
820 830
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PPSQPP-RLLKNKALLCKPITQTKATSCKPHTQNKECQTEDTPSQPQIIVVPVPVPVFVP
::: : . .::::.::::.:.:::: :::: :.: :::.:: . . . ::.::::..:
CCDS45 PPSPTPNKEMKNKAVLCKPLTMTKATYCKPHMQTKSCQTDDTW-RTEYVPVPIPVPVYIP
840 850 860 870 880 890
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pF1KA0 IPLHLYTQYAPVPFGIPVPMPVPMLIPSSMDSEDKVTESIEDIKEKLPTHPFEADLLEMA
.:.:.:.: ::: .:::.:::...:. .:: .:. .::..: :. . ....:: :.
CCDS45 VPMHMYSQNIPVPTTVPVPVPVPVFLPAPLDSSEKIPAAIEELKSKVSSDALDTELLTMT
900 910 920 930 940 950
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pF1KA0 EMIAEDEEKKTLSQGESQTSE-HELFLDTKIFEKDQGSTYSGDLESEAVSTPHSWEEELN
.:..::: :...:.. . ....: :. .: .. . . .: ..:. : .:
CCDS45 DMMSEDE-------GKTETTNINSVIIETDIIGSDLLKNSDPETQSSMPDVPY--EPDL-
960 970 980 990 1000
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pF1KA0 HYALKSNAVQEADSELKQFSKGETEQDLEADFPSDSFDPLNKGQGIQARSRTRRRHRDGF
: :. .: .. : :.: .: . : :. . . :
CCDS45 ------------DIEI-DFPRAAEELDMENEF----LLPPVFGEEYEEQPR---------
1010 1020 1030
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 PQPRRRGRKKSIVAVEPRSLIQGAFQGCSVSGMTLKYMYGVNAWKNWVQWKNAKEEQGDL
:. ...: :.. :. .. . :: . .:: :::::::.::. .. :. :
CCDS45 PRSKKKGAKRKAVSGYQSHDDSSDNSECS---FPFKYTYGVNAWKHWVKTRQLDEDLLVL
1040 1050 1060 1070 1080 1090
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 KCGGVEQASSSPRSDPLGSTQDHALSQESSEPGCRVRSIKLKEDILSCTFAELSLGLCQF
: : :. .:.:::::.:: : :::. :: .:
CCDS45 --------------DELKSS----------------KSVKLKEDLLSHTTAELNYGLAHF
1100 1110 1120
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 IQEVRRPNGEKYDPDSILYLCLGIQQYLFENGRIDNIFTEP-YSRFMIELTKLLKIWEPT
..:.::::::.: :::: :::::::.:: ..: :::: .: :. : ::.:.:. :.:.
CCDS45 VNEIRRPNGENYAPDSIYYLCLGIQEYLCGSNRKDNIFIDPGYQTFEQELNKILRSWQPS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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pF1KA0 ILPNGYMFSRIEEEHLWECKQLGAYSPIVLLNTLLFFNTKYFQLKNVTEHLKLSFAHVMR
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CCDS45 ILPDGSIFSRVEEDYLWRIKQLGSHSPVALLNTLFYFNTKYFGLKTVEQHLRLSFGTVFR
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 --RTRTLKYSTKMTYLRF-FPPLQKQESEPDKLTVGKRKRNEDDEVPVGVEMAENTDNPL
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CCDS45 HWKKNPLTMENKAC-LRYQVSSLCGTDNE-DKITTGKRK-HEDDE-PV-FEQIENTANPS
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 RCPVRLYEFYLSKCSESVKQRNDVFYLQPERSCVPNSPMWYSTFPIDPGTLDTMLTRILM
::::...: :::: ....:: :::::::: : .::.::.. .: .::..::.:.:.
CCDS45 RCPVKMFECYLSKSPQNLNQRMDVFYLQPECSSSTDSPVWYTSTSLDRNTLENMLVRVLL
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1210 1220
pF1KA0 VREVHEELAKAKSEDSDVELSD
:...... .::.:
CCDS45 VKDIYDKDNYELDEDTD
1370
>>CCDS14409.1 ZMYM3 gene_id:9203|Hs108|chrX (1370 aa)
initn: 2436 init1: 683 opt: 733 Z-score: 619.7 bits: 126.9 E(32554): 3.4e-28
Smith-Waterman score: 3025; 40.7% identity (66.1% similar) in 1223 aa overlap (10-1219:304-1370)
10 20 30
pF1KA0 MNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQKGQTAYQRKGSTQL
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CCDS14 PNDEDFVPFRPRRSPRMSLRSSVSQRAGRSAVGTKMTCAHCRTPLQKGQTAYQRKGLPQL
280 290 300 310 320 330
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 FCSTLCLTGYTVPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSKDFCSQSCLS
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CCDS14 FCSSSCLTTFSKKPS------GKKTCTFCKKEIWNTKDSVVAQTGSGGSFHEFCTSVCLS
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pF1KA0 TYELKK-KPIVTINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSKFRSANNLT
:: .. .:: . . .:.::.:::.. . :::. .:::.::::.::::::. ..:
CCDS14 LYEAQQQRPIPQSGDPADATRCSICQKTGEVLHEVSNGSVVHRLCSDSCFSKFRANKGLK
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160 170 180 190 200 210
pF1KA0 MNCCENCGGYCYS--GSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQKSAKITPCALCKSLRSS
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CCDS14 TNCCDQCGAYIYTKTGSPGPELLFHEGQQKRFCNTTCLGAYKKKNTRVYPCVWCKTLCKN
450 460 470 480 490 500
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 AEMIENTNSLGKTELFCSVNCLSAYRVKMVTSAGVQVQCNSCKTSAIPQYHLAMSDGSIR
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CCDS14 FEMLSHVDRNGKTSLFCSLCCTTSYKVKQAGLTGPPRPCSFCRRSLSDPCYYNKVDRTVY
510 520 530 540 550 560
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 NFCSYSCVVAFQNLFNKPTGMNSSVVPLSQGQVIVSIPTGSTVSAGGGSTSAVSPTSISS
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CCDS14 QFCSPSCWTKFQR-----------------------------TSPEGG------------
570 580
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 SAAAGLQRLAAQSQHVGFARSVVKLKCQHCNRLFATKPELLDYKGKMFQFCGKNCSDEYK
..:.:..:. ::. :::.::.. ..:::: ..: ...:
CCDS14 ----------------------IHLSCHYCHSLFSGKPEVLDWQDQVFQFCCRDCCEDFK
590 600 610 620
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 KINNVMAMCEYCKIEKIVKETVRFSGADKSFCSEGCKLLYKHDLAKRWGNHCKMCSYCLQ
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CCDS14 RLRGVVSQCEHCRQEKLLHEKLRFSGVEKSFCSEGCVLLYKQDFTKKLGLCCITCTYCSQ
630 640 650 660 670 680
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 TSPKLVQNNLGGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQMAKCDACKRQGKLSESLKWRGEMKHFCN
: . : ..: :.. .:: :.: ::: . . . :.: :::::::: :...:::...::::
CCDS14 TCQRGVTEQLDGSTWDFCSEDCKSKYLLWYCKAARCHACKRQGKLLETIHWRGQIRHFCN
690 700 710 720 730 740
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pF1KA0 LLCILMFCNQQSVCDPPSQNNAANISMVQAASAGPPSLRKDSTPVIANVVSLASAPAAQP
:.: : .:: : :.. ...:: :: ....: : ..:.
CCDS14 QQCLLRFYSQQ---------NQPNLD----TQSGPESLLNSQSPE-----SKPQTPSQTK
750 760 770 780
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 TVNSNSVLQGAVPTVTAKIIGDASTQTDALKLPPSQPPRL-LKNKALLCKPITQTKATSC
. :::.: .:: . . : :: :: :::: .:::. :....::
CCDS14 VENSNTVRTPEENGNLGKIPVKTRSAPTAPTPPPPPPPATPRKNKAAMCKPLMQNRGVSC
790 800 810 820 830 840
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 KPHTQNKECQTEDTPSQPQIIVVPVPVPVFVPIPLHLYTQYAPVPFGIPVPMPVPMLIPS
: . ..: :::. .::.::.:.:::.:::.:.::: : .::::..:.:.::::..:.
CCDS14 KVEMKSKGSQTEEW--KPQVIVLPIPVPIFVPVPMHLYCQKVPVPFSMPIPVPVPMFLPT
850 860 870 880 890 900
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pF1KA0 SMDSEDKVTESIEDIKEKLPTHPFEADLLEMAEMIAEDEEKKTLSQGESQTSEHELFLDT
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CCDS14 TLESTDKIVETIEELKVKIPSNPLEADILAMAEMIAEAEE---LDKASSDLCD-------
910 920 930 940 950
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. ..:.. : ::. . : .... .:.: : . : ::::
CCDS14 --LVSNQSAE--GLLEDCDLFGPA--RDDVLAMAVKMANVLD-----------EPGQDLE
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pF1KA0 ADFPSDSFDPLNKGQGIQ-----ARSRTRRRHRDGFPQPRRRGRKKSIVAVEPRSLIQGA
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CCDS14 ADFPKNPLD-INPSVDFLFDCGLVGPEDVSTEQD-LPRTMRKGQKR-LVLSESCSRDSMS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 FQGCSVSGMTLKYMYGVNAWKNWVQWKNAKEEQGDLKCGGVEQASSSPRSDPLGSTQDHA
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CCDS14 SQP-SCTG--LNYSYGVNAWKCWVQSKYANGE--------------TSKGDEL-------
1060 1070 1080 1090
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 LSQESSEPGCRVRSIKLKEDILSCTFAELSLGLCQFIQEVRRPNGEKYDPDSILYLCLGI
. . .: ...:::::.:. :::. :: ::..:. :::::.:.:::: ::::::
CCDS14 --RFGPKP------MRIKEDILACSAAELNYGLAQFVREITRPNGERYEPDSIYYLCLGI
1100 1110 1120 1130 1140
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 QQYLFENGRIDNIFTEPYS-RFMIELTKLLKIWEPTILPNGYMFSRIEEEHLWECKQLGA
::::.::.:. ::::. : :. ::.: :. :.::.:::. .:::.::::::::::::.
CCDS14 QQYLLENNRMVNIFTDLYYLTFVQELNKSLSTWQPTLLPNNTVFSRVEEEHLWECKQLGV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA0 YSPIVLLNTLLFFNTKYFQLKNVTEHLKLSFAHVMRRTR---TLKYSTKMTYLRFFPPLQ
:::.::::::.:::::.: :... ::..:::..:.:..: : . .::.. .:.. :..
CCDS14 YSPFVLLNTLMFFNTKFFGLQTAEEHMQLSFTNVVRQSRKCTTPRGTTKVVSIRYYAPVR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 KQESEPDKLTVGKRKRNEDDEVPVGVEMAENTDNPLRCPVRLYEFYLSKCSESVKQRNDV
..... ::::: .::.:. .:. :: :::::::..:::::::: ::.. ::::
CCDS14 QRKGRDTG--PGKRKR--EDEAPI-LEQRENRMNPLRCPVKFYEFYLSKCPESLRTRNDV
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pF1KA0 FYLQPERSCVPNSPMWYSTFPIDPGTLDTMLTRILMVREVHEELAKAKSEDSDVELSD
:::::::::. .::.:::..:.: . :..::.::: :::..:::.. :: :
CCDS14 FYLQPERSCIAESPLWYSVIPMDRSMLESMLNRILAVREIYEELGRPGEEDLD
1320 1330 1340 1350 1360 1370
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:......:. :. :::::::::::: ::
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:::. ::: .. :. ::::. :.:.: : :: . :: . . ..::.. :::
CCDS55 FCSSSCLTTFSKKPS------GKKTCTFCKKEIWNTKDSVVAQTGSGGSFHEFCTSVCLS
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CCDS27 QTPSLQSPSPSQLQAAQIQVQHVQAAQQ-IQAAEIPEEHIPHQQIQAQLVAGQSLAGGQQ
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:: ::. :::: :: . . : . .:. . :. . : :
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CCDS27 IPQGQQQSYVSLRPDLLTVDSAHLYSATGTITSPTGETWTIPVYSAQPRG-DPQQQSITH
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: .: . .. .: . ::...: .. . :: .. . .: .
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CCDS27 QQQQQLQVTCSAQTVQ---------------VAEVEPQSQPQPSPE--LLLPNSLKPEEG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]