FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0449, 1624 aa 1>>>pF1KA0449 1624 - 1624 aa - 1624 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5000+/-0.000681; mu= -13.6951+/- 0.042 mean_var=654.2219+/-134.679, 0's: 0 Z-trim(118.0): 311 B-trim: 0 in 0/58 Lambda= 0.050143 statistics sampled from 30229 (30540) to 30229 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.358), width: 16 Scan time: 19.790 The best scores are: opt bits E(85289) NP_060066 (OMIM: 608322) kinesin-like protein KIF2 (1624) 10526 778.9 0 NP_001239032 (OMIM: 608322) kinesin-like protein K (1610) 10329 764.6 0 NP_001239031 (OMIM: 608322) kinesin-like protein K (1623) 8105 603.7 4e-171 NP_001239029 (OMIM: 608322) kinesin-like protein K (1637) 8105 603.7 4.1e-171 XP_016856220 (OMIM: 608322) PREDICTED: kinesin-lik (1581) 6112 459.6 1e-127 XP_016856221 (OMIM: 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(1427) 575 59.0 3.5e-07 XP_011517152 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 575 59.0 3.5e-07 XP_011517151 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 575 59.0 3.5e-07 XP_016870390 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 575 59.0 3.5e-07 NP_036442 (OMIM: 300521,300923) chromosome-associa (1232) 552 57.2 1e-06 NP_940927 (OMIM: 200990,607131,611254,614120) kine (1343) 552 57.3 1.1e-06 >>NP_060066 (OMIM: 608322) kinesin-like protein KIF21B i (1624 aa) initn: 10526 init1: 10526 opt: 10526 Z-score: 4139.6 bits: 778.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 10526; 100.0% identity (100.0% similar) in 1624 aa overlap (1-1624:1-1624) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MAGQGDCCVKVAVRIRPQLSKEKIEGCHICTSVTPGEPQVLLGKDKAFTYDFVFDLDTWQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 MAGQGDCCVKVAVRIRPQLSKEKIEGCHICTSVTPGEPQVLLGKDKAFTYDFVFDLDTWQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 EQIYSTCVSKLIEGCFEGYNATVLAYGQTGAGKTYTMGTGFDMATSEEEQGIIPRAIAHL 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NP_001 SQKRLQTLKKQYEEKLMMLQHKIRDTQLERDQVLQNLGSVESYSEEKAKKVRSEYEKKLQ 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 EMNRDLQKLQAAQKEHARLLKNQSRYERELKKLQAEVAEMKKAKVALMKQMREEQQRRRL ::..::.::::::::::::::::.::..::::: .: ::::.:: :::::.:::.. :: NP_001 AMNKELQRLQAAQKEHARLLKNQSQYEKQLKKLQQDVMEMKKTKVRLMKQMKEEQEKARL 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KA0 VETKRNREIAQLKKEQRRQEFQIRALESQKRQQEMVLRRKTQEVSALRRLAKPMSERVAG .:..::::::::::.::... :.:::: ..:::..::: NP_001 TESRRNREIAQLKKDQRKRD-----------------------VTALRRQVRPMSDKVAG 780 790 800 810 840 850 860 870 880 890 pF1KA0 RAGLKPPMLDSGAEVSASTTSSEAESGARSVSSIVRQWNRKINHFLGDHPAPTVNGTRPA .. : :. :. ..:.... ...:. . .: : . :.:..::. NP_001 KVTRKLSSSDAPAQDTGSSAAAVETDASRTGA---QQKMRIPVARVQALPTPATNGN--- 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 pF1KA0 RKKFQKKGAS-QSF-SKAARLKWQSLERRIIDIVMQRMTIVNLEADMERLIKKREELFLL :::.:.:: . . : ::.::.::: ::::. ::.::.::: :.::::.::.:.:::: NP_001 RKKYQRKGLTGRVFISKTARMKWQLLERRVTDIIMQKMTISNMEADMNRLLKQREELTKR 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA0 QEALRRKRERLQAESPEEEKGLQELAEEIEVLAANIDYINDGITDCQATIVQLEETKEEL .: : ..::.. :. : .:.. .. ::.: :.::::::::.:.::::.:.:.::.::: NP_001 REKLSKRREKIVKENGEGDKNVANINEEMESLTANIDYINDSISDCQANIMQMEEAKEEG 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA0 DSTDTSVVISSCSLAEARLLLDNFLKASIDKGLQVAQKEAQIRLLEGRLRQTDMAGSSQN .. :...::..:.:.::: :::.::. .:.::::.:::::::..:::::.::......:: NP_001 ETLDVTAVINACTLTEARYLLDHFLSMGINKGLQAAQKEAQIKVLEGRLKQTEITSATQN 990 1000 1010 1020 1030 1040 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA0 HLLLDALREKAEAHPELQALIYNVQQ-------ENGYASTDEEI---SEFSEGSFSQSFT .::. :.:::: .:::.::. .. : :: ::::. : :::: .: NP_001 QLLFHMLKEKAELNPELDALLGHALQDLDSVPLENVEDSTDEDAPLNSPGSEGSTLSSDL 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KA0 MK--GSTSHDDFKFKSEPKLSAQMKAVSAECLGPPLDISTKNIT--KSLASLVEIKEDGV :: : .. : :.. . ..::. . :. : :: . . :. ..: .: :. NP_001 MKLCGEVKP---KNKARRRTTTQMELLYADSSELASDTSTGDASLPGPLTPVAEGQEIGM 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KA0 GFSVRDPYYRDR-VSRTVSLPTRGSTFPRQS-----RATETSPLTRRKSYDRGQPIRS-- . . :.. .: .::.. ... ::: . : ::.::::.:.... .. NP_001 NTETSGTSAREKELSPPPGLPSKIGSISRQSSLSEKKIPEPSPVTRRKAYEKAEKSKAKE 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KA0 ---TDVG-----FTPPSSPPTRPRNDRNVFSRLTSNQSQGSAL-DKGIISPVGGAKGART .: : ..::::::.::::. :::.::: .:.. :. :::::.: ..:: :. 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