Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0456
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0456, 1071 aa
1>>>pF1KA0456 1071 - 1071 aa - 1071 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2768+/-0.00133; mu= -1.6959+/- 0.079
mean_var=253.4518+/-52.467, 0's: 0 Z-trim(108.2): 132 B-trim: 13 in 1/49
Lambda= 0.080561
statistics sampled from 9926 (10048) to 9926 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16
Scan time: 5.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73017.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 (1071) 7020 830.4 0
CCDS76262.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 (1070) 7001 828.2 0
CCDS76261.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 ( 789) 5141 612.0 1.7e-174
CCDS33689.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1075) 3353 404.2 7.7e-112
CCDS81364.1 SRGAP2C gene_id:653464|Hs108|chr1 ( 459) 2871 348.0 2.8e-95
CCDS8967.1 SRGAP1 gene_id:57522|Hs108|chr12 (1085) 2320 284.2 1.1e-75
CCDS81365.1 SRGAP2B gene_id:647135|Hs108|chr1 ( 305) 1894 234.3 3e-61
CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1099) 1375 174.3 1.3e-42
CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX ( 946) 1082 140.2 2e-32
CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX ( 986) 1082 140.3 2.1e-32
>>CCDS73017.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 (1071 aa)
initn: 7020 init1: 7020 opt: 7020 Z-score: 4424.7 bits: 830.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7020; 99.9% identity (99.9% similar) in 1071 aa overlap (1-1071:1-1071)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTPVEDSTQDVTAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS73 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDVTAE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 YIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 PESGSIRKTFRSDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PESGSIRKTFRSDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELREL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 ERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIAC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 AFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQSTDKSCTV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQSTDKSCTV
1030 1040 1050 1060 1070
>>CCDS76262.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 (1070 aa)
initn: 5250 init1: 5250 opt: 7001 Z-score: 4412.8 bits: 828.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7001; 99.8% identity (99.8% similar) in 1071 aa overlap (1-1071:1-1070)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS76 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTPVEDSTQDVTAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS76 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDVTAE
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 YIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKR
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 PESGSIRKTFRSDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PESGSIRKTFRSDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGS
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELREL
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 ERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIAC
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 AFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQSTDKSCTV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPTVFPKTNATSPGVNSSTSPQSTDKSCTV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>>CCDS76261.1 SRGAP2 gene_id:23380|Hs108|chr1 (789 aa)
initn: 3390 init1: 3390 opt: 5141 Z-score: 3246.4 bits: 612.0 E(32554): 1.7e-174
Smith-Waterman score: 5141; 99.7% identity (99.7% similar) in 787 aa overlap (1-787:1-786)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS76 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALH
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSC
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTPVEDSTQDVTAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS76 QAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDYCDSPHGETTSVEDSTQDVTAE
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQ
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 YIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKR
:::::::
CCDS76 YIVVQDTLIS
780
>>CCDS33689.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1075 aa)
initn: 2974 init1: 1036 opt: 3353 Z-score: 2121.3 bits: 404.2 E(32554): 7.7e-112
Smith-Waterman score: 4211; 59.8% identity (83.9% similar) in 1094 aa overlap (1-1071:1-1075)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:.: .::::::::::::..:.::::.::.::.:::.:: : :.:::::::.:::.:::::
CCDS33 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
..:::.:::::::: .: ::....:::::: .::::::: :.:.:..::::::.::.::.
CCDS33 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQFKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDIF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
.::.: :. :.::: ::::::::.: :....:.:: ::::.::::::::.:.::::.::
CCDS33 MNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAESK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANV-RIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::..:: : . :. : :.. :::::::::::::::::::
CCDS33 LKEAEKQEEKQFNKS-----------GDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
.::::: ::::.::: : ::::.. ::::::.::::: :::::.:::: :..::.::::
CCDS33 SENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLID-CCDLGFHASLARTFRTYLSAE
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
::: :.:::::.:::::.:::. :::. .:.: :.:::::.:::::::::: . :. ::
CCDS33 YNLETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 QPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
::::.::..: .::::::.:::::::::.::..::.::.::..::::::::: ::.: :
CCDS33 QPVQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRST
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLG
:::::..:::.::: .::::::::::::.:::::.:::..: :::::::::::::..:::
CCDS33 ESVKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 ESQRTDCSLAR--RSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVND
:..:..:. .: :.. .:.:::.::::::::::::.:. .:::..::::: ::::::::
CCDS33 EGERAECGTTRGRRNARTRNQDSGQAIPLVVESCIRYINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVND
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 IKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQER
:::.::::::::. :::..:..:.::::::::::::.:::::. :.::.. . ..: ::
CCDS33 IKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLENPLFPKERFQDLISTIKLENPAER
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 ALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQ
. .:...:..::......:::::::::::::.:.:::::::::::::::.:: .:.:.:
CCDS33 VHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDENMMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDP
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 VSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSR---GGSMEDYCDSPHGETTPVEDST
::::::.::.::::::.:: ::::::::::::: . :: :.::::::.: ...
CCDS33 VSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGG--EEYCDSPHSEPGAIDEVD
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 QDVTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGID
.: .: ::::.: : :::::::::.::. ::::::::::::::.:::.:::::::::.:
CCDS33 HDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFKKGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVD
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 GLIPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPP-EEKVTARAGASCPSGGHVADIYLAN
:::::::::::: .:. . : :.. :. : : ..:.... . :. :..: ...
CCDS33 GLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLDDKASSKNDLQSPTE-HISDYGFGG
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880
pF1KA0 I-NKQRKRPESGSI-RKTFRSDSHGLSSSLTDS-SSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPK-EG
. .. : : ....: :. .:.:. .: : ..: .:.: ::: . . . :.
CCDS33 VMGRVRLRSDGAAIPRRRSGGDTHSPPRGLGPSIDTPPRAAAC-PSSPHKIPLTRGRIES
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 PDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEAT
:.: .. :: .::. . . : .. ..:.: . : .:...:. .. :..:.::: :
CCDS33 PEKRRMATFGSAGSIN-YPDKKALSEGHSMRSTCGSTRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEKT
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 MNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPVVAP-TSEPSSPLHTQLLKDPEPAF
:..::.::::::::..::..::::::::::::. : .: .:::.::::: ...::. :.
CCDS33 MSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPP--GPVSSEPASPLHTIVIRDPDAAM
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 QRSASTAGDIACAFRPVKSVKMA-APVKPPATRP-KPTVFPKTNATSP-GVNS-STSP--
.::.:.. .. .:.:. :...: : ..:: :: .:.: .....: ::.: ...:
CCDS33 RRSSSSSTEMMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVRPVVQHRSSSSSSSGVGSPAVTPTE
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1070
pF1KA0 -----QSTDKSCTV
.:.::: :.
CCDS33 KMFPNSSADKSGTM
1070
>>CCDS81364.1 SRGAP2C gene_id:653464|Hs108|chr1 (459 aa)
initn: 2870 init1: 2870 opt: 2871 Z-score: 1824.0 bits: 348.0 E(32554): 2.8e-95
Smith-Waterman score: 2871; 98.0% identity (98.9% similar) in 457 aa overlap (1-457:1-457)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS81 MDYSRNLEKLAEHFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKWESRDHTTLSDIY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYT
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS81 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPCSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKHQAKYT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 ENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ENKLKAIKAQNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSME
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGE
:::::::::::::::::::::::::::::::: . :
CCDS81 SVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTVRECYGF
430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SQRTDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKN
>>CCDS8967.1 SRGAP1 gene_id:57522|Hs108|chr12 (1085 aa)
initn: 3871 init1: 1604 opt: 2320 Z-score: 1472.4 bits: 284.2 E(32554): 1.1e-75
Smith-Waterman score: 4732; 66.6% identity (84.0% similar) in 1108 aa overlap (1-1071:1-1085)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:..:..:::::::::::..:::::::::.::.:::.:: :.:::::::::::::::::::
CCDS89 MSTPSRFKKDKEIIAEYESQVKEIRAQLVEQQKCLEQQTEMRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKD-QQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDI
.::::::::::::.:::::::: ::.:::::.::::::: ::::::.:::.::.:::::
CCDS89 TEYSRNLEKLAERFMAKTRSTKDHQQYKKDQNLLSPVNCWYLLLNQVRRESKDHATLSDI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 YLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQS
::::.: ::.:.:::: :.::::::.. ::..::::::::::.::::::::.:.::::.:
CCDS89 YLNNVIMRFMQISEDSTRMFKKSKEIAFQLHEDLMKVLNELYTVMKTYHMYHAESISAES
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 KLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::::: :: : . ..:.::.: :::::::::::::::::::
CCDS89 KLKEAEKQEEKQIG-----------RSGDPVFHIRLEERHQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
.:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::
CCDS89 SENKLKSIKARNEYLLTLEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTYLSAE
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
::: :.::::: :::::.::. :::::.:::: .:::::::::: :::: . :. ::
CCDS89 YNLETSRHEGLDIIENAVDNLEPRSDKQRFMEMYPAAFCPPMKFEFQSHMGDEVCQVSAQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 QPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
::::.::. : :::::::.:::::::::::: :::::::::.::.::.:::.:::.: :
CCDS89 QPVQAELMLRYQQLQSRLATLKIENEEVKKTTEATLQTIQDMVTIEDYDVSECFQHSRST
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLG
::::::::::..:::::::::::::::::::: :..::::: ::::::::::::::.:::
CCDS89 ESVKSTVSETYLSKPSIAKRRANQQETEQFYFMKLREYLEGSNLITKLQAKHDLLQRTLG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510
pF1KA0 ESQRTDCSLAR-----------RSSTVRKQ---------------DSSQAIPLVVESCIR
:..:.. .: :.: :.: ::.:.:::.::::::
CCDS89 EGHRAEYMTTRPPNVPPKPQKHRKSRPRSQYNTKLFNGDLETFVKDSGQVIPLIVESCIR
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 FISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLE
::. .::::.:::::::::::::::::.:::::.::: ::..::..:.::::::::::::
CCDS89 FINLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLE
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 HPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEEN
.:::::. :.::..:. .::: ::::::::.::.::...::.:::::::::::::.:.::
CCDS89 NPLFPKERFNDLISCIRIDNLYERALHIRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDEN
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 MMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRG
:::::::::::::.:: ::: .:::::::::::.::::::.::.:::. .::.:::: .
CCDS89 MMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQVSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVYEKC
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 GSMEDYCDSPHGETTPVEDSTQDVTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFKKGA
. .::::::..: .:. ::. .: :::.:::::::::::::::::.::::::::::
CCDS89 MAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFKKGA
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 SLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPPEEKVT
:::::.:::.:::::::::::::.::::::::: .: . : :.. :. : : : .
CCDS89 SLLLYHRASEDWWEGRHNGIDGLVPHQYIVVQDMDDTFSDTLSQKADSEASSGPVTEDKS
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860
pF1KA0 ARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRKRPESGS-IRKTFR-SDSH-------GLSSSLTDS
. . :. : : ::: .:::: : .:. : ::.: .::.: .:
CCDS89 SSKDMNSPTDRH-PDGYLA---RQRKRGEPPPPVRRPGRTSDGHCPLHPPHALSNSSVDL
830 840 850 860 870 880
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 SSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTAT
.::.... : : ...: ...:.. :::::..::::.::: ..::: ::....
CCDS89 GSPSLASHPRGLLQ---NRGLNNDSPERRRRPGHGSLTNISRHDSLK-KIDSPPIRRSTS
890 900 910 920 930 940
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 AGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSP
.:. .::.:.:.:::.:::::: :::.::::::::::::..::.::::::::: .:.::
CCDS89 SGQYTGFNDHKPLDPETIAQDIEETMNTALNELRELERQSTAKHAPDVVLDTLEQVKNSP
950 960 970 980 990 1000
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 VVAPTSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIACAFRPVKSVKMAAPVKPPATRPKPT
. : ..: ::::. :.. :: ..::.:...: .:.:. . .:.. .:::: ::::.
CCDS89 TPATSTESLSPLHNVALRSSEPQIRRSTSSSSDTMSTFKPMVAPRMGVQLKPPALRPKPA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1050 1060 1070
pF1KA0 VFPKTNATSPGVNSSTSPQS-TDKSCTV
:.:::: : .. . ::. ::::::.
CCDS89 VLPKTN---PTIGPAPPPQGPTDKSCTM
1070 1080
>>CCDS81365.1 SRGAP2B gene_id:647135|Hs108|chr1 (305 aa)
initn: 1137 init1: 1137 opt: 1894 Z-score: 1213.0 bits: 234.3 E(32554): 3e-61
Smith-Waterman score: 1894; 98.0% identity (98.7% similar) in 304 aa overlap (154-457:1-303)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSKLKE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSKLKE
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 AEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYTENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKYTENK
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAELNLE
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLID-CCDLGYHASLNRALRTFLSAELNLE
100 110 120 130 140
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 QSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQPVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQPVQ
150 160 170 180 190 200
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSMESVK
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SELLQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSMESVK
210 220 230 240 250 260
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 STVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGESQR
::::::::::::::::::::::::::::: . :
CCDS81 STVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTVRECYGF
270 280 290 300
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 TDCSLARRSSTVRKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFE
>>CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3 (1099 aa)
initn: 3666 init1: 1032 opt: 1375 Z-score: 878.7 bits: 174.3 E(32554): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 4142; 58.7% identity (82.5% similar) in 1102 aa overlap (1-1062:1-1083)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:.: .::::::::::::..:.::::.::.::.:::.:: : :.:::::::.:::.:::::
CCDS25 MSSQTKFKKDKEIIAEYEAQIKEIRTQLVEQFKCLEQQSESRLQLLQDLQEFFRRKAEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKTRSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTLSDIY
..:::.:::::::: .: ::....:::::: .::::::: :.:.:..::::::.::.::.
CCDS25 LEYSRSLEKLAERFSSKIRSSREHQFKKDQYLLSPVNCWYLVLHQTRRESRDHATLNDIF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSISAQSK
.::.: :. :.::: ::::::::.: :....:.:: ::::.::::::::.:.::::.::
CCDS25 MNNVIVRLSQISEDVIRLFKKSKEIGLQMHEELLKVTNELYTVMKTYHMYHAESISAESK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KA0 LKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANV-RIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
:::::::::::..:: : . :. : :.. :::::::::::::::::::
CCDS25 LKEAEKQEEKQFNKS-----------GDLSMNLLRHEDRPQRRSSVKKIEKMKEKRQAKY
190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 TENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAE
.::::: ::::.::: : ::::.. ::::::.::::: :::::.:::: :..::.::::
CCDS25 SENKLKCTKARNDYLLNLAATNAAISKYYIHDVSDLID-CCDLGFHASLARTFRTYLSAE
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 LNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQ
::: :.:::::.:::::.:::. :::. .:.: :.:::::.:::::::::: . :. ::
CCDS25 YNLETSRHEGLDVIENAVDNLDSRSDKHTVMDMCNQVFCPPLKFEFQPHMGDEVCQVSAQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 QPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSM
::::.::..: .::::::.:::::::::.::..::.::.::..::::::::: ::.: :
CCDS25 QPVQTELLMRYHQLQSRLATLKIENEEVRKTLDATMQTLQDMLTVEDFDVSDAFQHSRST
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLG
:::::..:::.::: .::::::::::::.:::::.:::..: :::::::::::::..:::
CCDS25 ESVKSAASETYMSKINIAKRRANQQETEMFYFTKFKEYVNGSNLITKLQAKHDLLKQTLG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510
pF1KA0 ESQRTDCSLAR------RSSTVRK--------------------QDSSQAIPLVVESCIR
:..:..:. .: . . .:. .::.::::::::::::
CCDS25 EGERAECGTTRPPCLPPKPQKMRRPRPLSVYSHKLFNGSMEAFIKDSGQAIPLVVESCIR
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 FISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLE
.:. .:::..::::: :::::::::::.::::::::. :::..:..:.::::::::::::
CCDS25 YINLYGLQQQGIFRVPGSQVEVNDIKNSFERGEDPLVDDQNERDINSVAGVLKLYFRGLE
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 HPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEEN
.:::::. :.::.. . ..: ::. .:...:..::......:::::::::::::.:.::
CCDS25 NPLFPKERFQDLISTIKLENPAERVHQIQQILVTLPRVVIVVMRYLFAFLNHLSQYSDEN
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 MMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSR-
:::::::::::::.:: .:.:.: ::::::.::.::::::.:: ::::::::::::: .
CCDS25 MMDPYNLAICFGPTLMHIPDGQDPVSCQAHINEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKC
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 --GGSMEDYCDSPHGETTPVEDSTQDVTAEHHTSDDECEPIEAIAKFDYVGRTARELSFK
:: :.::::::.: ... .: .: ::::.: : :::::::::.::. ::::::
CCDS25 MAGG--EEYCDSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPHTSDEEVEQIEAIAKFDYMGRSPRELSFK
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800
pF1KA0 KGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQYIVVQDTEDGVVERSSPKSEIEVISEPP-E
::::::::.:::.:::::::::.::::::::::::: .:. . : :.. :. : : .
CCDS25 KGASLLLYHRASEDWWEGRHNGVDGLIPHQYIVVQDMDDAFSDSLSQKADSEASSGPLLD
770 780 790 800 810 820
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 EKVTARAGASCPSGGHVADIYLANI-NKQRKRPESGSI-RKTFRSDSHGLSSSLTDS-SS
.:.... . :. :..: .... .. : : ....: :. .:.:. .: : ..
CCDS25 DKASSKNDLQSPTE-HISDYGFGGVMGRVRLRSDGAAIPRRRSGGDTHSPPRGLGPSIDT
830 840 850 860 870 880
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 PGVGASCRPSSQPIMSQSLPK-EGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATA
: .:.: ::: . . . :.:.: .. :: .::. . . : .. ..:.: .
CCDS25 PPRAAAC-PSSPHKIPLTRGRIESPEKRRMATFGSAGSIN-YPDKKALSEGHSMRSTCGS
890 900 910 920 930 940
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 GRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELRELERQSSVKHTPDVVLDTLEPLKTSPV
: .:...:. .. :..:.::: ::..::.::::::::..::..::::::::::::. :
CCDS25 TRHSSLGDHKSLEAEALAEDIEKTMSTALHELRELERQNTVKQAPDVVLDTLEPLKNPP-
950 960 970 980 990 1000
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 VAP-TSEPSSPLHTQLLKDPEPAFQRSASTAGDIACAFRPVKSVKMA-APVKPPATRP-K
.: .:::.::::: ...::. :..::.:.. .. .:.:. :...: : ..:: :: .
CCDS25 -GPVSSEPASPLHTIVIRDPDAAMRRSSSSSTEMMTTFKPALSARLAGAQLRPPPMRPVR
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1050 1060 1070
pF1KA0 PTVFPKTNATSP-GVNS-STSPQSTDKSCTV
:.: .....: ::.: ...:
CCDS25 PVVQHRSSSSSSSGVGSPAVTPTEKMFPNSSADKSGTM
1070 1080 1090
>>CCDS14736.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX (946 aa)
initn: 2343 init1: 801 opt: 1082 Z-score: 695.6 bits: 140.2 E(32554): 2e-32
Smith-Waterman score: 2481; 43.0% identity (72.3% similar) in 942 aa overlap (1-890:1-925)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
:.. .:..... . :::.:::::.: ::.::..::. : ::: .:::.: .:.:..::.:
CCDS14 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKT----RSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTL
..:::.:::::::: .. : . :.:.:. ..:::..:: .::......::. ..:
CCDS14 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 SDIYLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSIS
:.. . . :. ...:: ::: :::... :::::.:..:..:: .. :::. :. .:..
CCDS14 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 AQSKLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKKIEKMKEKRQ
:..::.:::.::::. :.:: : .::.. : .:.::.:: .. ::::
CCDS14 AEAKLREAERQEEKRAGRSV----------PTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKRQ
190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 AKYTENKLKAIKARNEYLLALEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFL
::. :.::: ::::::::.: ..::.: .::.::. ::.: ::: :.: .:...::..
CCDS14 AKFMEHKLKCTKARNEYLLSLASVNAAVSNYYLHDVLDLMD-CCDTGFHLALGQVLRSYT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SAELNLEQSKHEGLDAIENAVENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQL
.:: . :. .:: ..:.::: :: .:: ...:.. .:::::..:...:: :: ....
CCDS14 AAESRTQASQVQGLGSLEEAVEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 CAQQPVQSELVQRCQQLQSRLSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYS
:... ...:.. : :..::::. ::.:::.::..::::.. ..:. .: :: : :: :
CCDS14 CVEMELRDEILPRAQNIQSRLDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTS
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 NSMESVKSTVSETFMSKPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQK
: ::.::: :. .. . ..::..::::: ::.::..::: ::....::::::. ::.
CCDS14 PSTESLKSTSSDP--GSRQAGRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510
pF1KA0 TLGESQRTDCSLARRSSTVRK--------------------------QDSSQAIPLVVES
.: .... . .. . : :: :.:.: .::::::
CCDS14 ALQRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVES
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 CIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFR
:::::. .::::::::::::.:..:..:..:::::::::. . ::.::.:::::::::
CCDS14 CIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFR
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 GLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFS
.:: :::: :.: .:.: .. ::. :. ..: :: .:...::::.:::::.:.:
CCDS14 SLEPPLFPPDLFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYS
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 EENMMDPYNLAICFGPSLMSVPEGHDQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVY
.::::::::::.::::.:. :: :.: :. :..::.:..:.:.: . .:: : ::::
CCDS14 DENMMDPYNLAVCFGPTLLPVPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVY
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740
pF1KA0 SRGGSMEDY-CDSPHGETTPVEDSTQDVTAEHHTSDDECEPI-EAIAKFDYVGRTARELS
. . . : . . :. .. :: ...:. : . ::.: : :.::::.:::
CCDS14 EKCMAPPSASCLGDAQLESLGADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELS
710 720 730 740 750 760
750 760 770 780 790
pF1KA0 FKKGASLLLYQRASDDWWEGRHNGIDGLIPHQYIVVQ-DTEDGVV---------ERSSPK
:..: : :..:::.:::.:.:::. :::::.::.. :: :: :::.
CCDS14 FRRGDVLRLHERASSDWWRGEHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPE
770 780 790 800 810 820
800 810 820 830 840 850
pF1KA0 SEI--EVISEPPEEKVTARAGASCPSGGHVADIYLANINKQRK--RPESGSIRKTFR---
. . :.. .: : :. : ::: . . :. ... . . . .. ..:.
CCDS14 GLLASELVHRP--EPCTSPE-AMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELL
830 840 850 860 870 880
860 870 880 890 900
pF1KA0 ---SDSHGLSSSLTDSSSPGVGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGSLNSISRHS
: .::. . : : ::: . : :. . .. ..::
CCDS14 GKTSVRQGLGPASTTSPSPGPRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTP
890 900 910 920 930 940
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 SLKNRLDSPQIRKTATAGRSKSFNNHRPMDPEVIAQDIEATMNSALNELRELERQSSVKH
CCDS14 KPH
>>CCDS55540.1 ARHGAP4 gene_id:393|Hs108|chrX (986 aa)
initn: 2287 init1: 801 opt: 1082 Z-score: 695.4 bits: 140.3 E(32554): 2.1e-32
Smith-Waterman score: 2321; 41.2% identity (69.1% similar) in 958 aa overlap (25-890:25-965)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSPAKFKKDKEIIAEYDTQVKEIRAQLTEQMKCLDQQCELRVQLLQDLQDFFRKKAEIE
: ::.::..::. : ::: .:::.: .:.:..::.:
CCDS55 MAAHGKLRRERGLQAEYETQVKEMRWQLSEQLRCLELQGELRRELLQELAEFMRRRAEVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA0 MDYSRNLEKLAERFLAKT----RSTKDQQFKKDQNVLSPVNCWNLLLNQVKRESRDHTTL
..:::.:::::::: .. : . :.:.:. ..:::..:: .::......::. ..:
CCDS55 LEYSRGLEKLAERFSSRGGRLGSSREHQSFRKEPSLLSPLHCWAVLLQHTRQQSRESAAL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 SDIYLNNIIPRFVQVSEDSGRLFKKSKEVGQQLQDDLMKVLNELYSVMKTYHMYNADSIS
:.. . . :. ...:: ::: :::... :::::.:..:..:: .. :::. :. .:..
CCDS55 SEVLAGPLAQRLSHIAEDVGRLVKKSRDLEQQLQDELLEVVSELQTAKKTYQAYHMESVN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 AQSKLKEAEKQEEKQIGKSVKQEDRQTPRSPDSTANVRIEEKHVRRSSVKK----IEKM-
:..::.:::.::::. :.:: : .::.. : .:.::.:: .::.
CCDS55 AEAKLREAERQEEKRAGRSV----------PTTTAGAT-EAGPLRKSSLKKGGRLVEKLW
190 200 210 220
240 250
pF1KA0 -----------------------------------KEKRQAKYTENKLKAIKARNEYLLA
..::::. :.::: ::::::::.
CCDS55 PPQRPVAASSCAPVCWLQAGFLVHPPWWGAMCAPSTHQRQAKFMEHKLKCTKARNEYLLS
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 LEATNASVFKYYIHDLSDLIDQCCDLGYHASLNRALRTFLSAELNLEQSKHEGLDAIENA
: ..::.: .::.::. ::.: ::: :.: .:...::.. .:: . :. .:: ..:.:
CCDS55 LASVNAAVSNYYLHDVLDLMD-CCDTGFHLALGQVLRSYTAAESRTQASQVQGLGSLEEA
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 VENLDATSDKQRLMEMYNNVFCPPMKFEFQPHMGDMASQLCAQQPVQSELVQRCQQLQSR
:: :: .:: ...:.. .:::::..:...:: :: ....:... ...:.. : :..:::
CCDS55 VEALDPPGDKAKVLEVHATVFCPPLRFDYHPHDGDEVAEICVEMELRDEILPRAQNIQSR
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 LSTLKIENEEVKKTMEATLQTIQDIVTVEDFDVSDCFQYSNSMESVKSTVSETFMSKPSI
:. ::.:::.::..::::.. ..:. .: :: : :: : : ::.::: :. .. .
CCDS55 LDRQTIETEEVNKTLKATLQALLEVVASDDGDVLDSFQTSPSTESLKSTSSDP--GSRQA
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 AKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGESQRTDCSLARRSSTVR
..::..::::: ::.::..::: ::....::::::. ::..: .... . .. . : :
CCDS55 GRRRGQQQETETFYLTKLQEYLSGRSILAKLQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSWTQYTQR
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530
pF1KA0 K--------------------------QDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSG
: :.:.: .:::::::::::. .::::::::::::
CCDS55 KFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSSGQPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSG
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 SQVEVNDIKNAFERGEDPLAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVT
.:..:..:..:::::::::. . ::.::.:::::::::.:: :::: :.: .:.:
CCDS55 AQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLDSVAGVLKLYFRSLEPPLFPPDLFGELLASSE
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 MDNLQERALHIRKVLLVLPKTTLIIMRYLFAFLNHLSQFSEENMMDPYNLAICFGPSLMS
.. ::. :. ..: :: .:...::::.:::::.:.:.::::::::::.::::.:.
CCDS55 LEATAERVEHVSRLLWRLPAPVLVVLRYLFTFLNHLAQYSDENMMDPYNLAVCFGPTLLP
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700
pF1KA0 VPEGHDQVSCQAHVNELIKTIIIQHENIFPSPRELEGPVYSRGGSMEDY-CDSPHGETTP
:: :.: :. :..::.:..:.:.: . .:: : :::: . . . : . .
CCDS55 VPAGQDPVALQGRVNQLVQTLIVQPDRVFPPLTSLPGPVYEKCMAPPSASCLGDAQLESL
710 720 730 740 750 760
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 VEDSTQDVTAEHHTSDDECEPI-EAIAKFDYVGRTARELSFKKGASLLLYQRASDDWWEG
:. .. :: ...:. : . ::.: : :.::::.::::..: : :..:::.:::.:
CCDS55 GADNEPELEAEMPAQEDDLEGVVEAVACFAYTGRTAQELSFRRGDVLRLHERASSDWWRG
770 780 790 800 810 820
770 780 790 800 810
pF1KA0 RHNGIDGLIPHQYIVVQ-DTEDGVV---------ERSSPKSEI--EVISEPPEEKVTARA
.:::. :::::.::.. :: :: :::.. . :.. .: : :.
CCDS55 EHNGMRGLIPHKYITLPAGTEKQVVGAGLQTAGESGSSPEGLLASELVHRP--EPCTS-P
830 840 850 860 870 880
820 830 840 850 860
pF1KA0 GASCPSGGHVADIYLANINKQRK--RPESGSIRKTFR------SDSHGLSSSLTDSSSPG
: ::: . . :. ... . . . .. ..:. : .::. . : : :::
CCDS55 EAMGPSGHRRRCLVPASPEQHVEVDKAVAQNMDSVFKELLGKTSVRQGLGPASTTSPSPG
890 900 910 920 930 940
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 VGASCRPSSQPIMSQSLPKEGPDKCSISGHGSLNSISRHSSLKNRLDSPQIRKTATAGRS
. : :. . .. ..::
CCDS55 PRSPKAPPSSRLGRNKGFSRGPGAPASPSASHPQGLDTTPKPH
950 960 970 980
1071 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 00:42:56 2016 done: Fri Nov 4 00:42:57 2016
Total Scan time: 5.110 Total Display time: 0.430
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]