Result of FASTA (omim) for
pF1KA0473
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0473, 913 aa
1>>>pF1KA0473 913 - 913 aa - 913 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1219+/-0.000447; mu= -10.5838+/- 0.028
mean_var=399.2913+/-83.876, 0's: 0 Z-trim(121.0): 75 B-trim: 0 in 0/60
Lambda= 0.064184
statistics sampled from 37025 (37102) to 37025 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.435), width: 16
Scan time: 11.760
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055602 (OMIM: 608375,615528) putative tyrosine- ( 913) 6291 597.6 9.2e-170
NP_001243793 (OMIM: 608375,615528) putative tyrosi ( 970) 6249 593.7 1.4e-168
NP_001243794 (OMIM: 608375,615528) putative tyrosi ( 900) 6205 589.6 2.3e-167
XP_011511730 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1306) 1719 174.3 3.4e-42
XP_005272325 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1300) 1596 162.9 9.1e-39
XP_011511728 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1344) 1596 162.9 9.3e-39
XP_016863483 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1197) 1592 162.5 1.1e-38
XP_011511733 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1272) 1592 162.6 1.2e-38
NP_001305063 (OMIM: 602052) cyclin-G-associated ki (1232) 1589 162.3 1.4e-38
XP_016863480 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1281) 1589 162.3 1.4e-38
NP_005246 (OMIM: 602052) cyclin-G-associated kinas (1311) 1589 162.3 1.4e-38
XP_016863484 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1131) 1587 162.1 1.5e-38
XP_016863482 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1219) 1587 162.1 1.5e-38
XP_011511736 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1219) 1587 162.1 1.5e-38
XP_016863481 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1246) 1587 162.1 1.6e-38
XP_011511734 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1267) 1587 162.1 1.6e-38
XP_011511732 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1276) 1587 162.1 1.6e-38
XP_011511731 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1293) 1587 162.1 1.6e-38
XP_011511729 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1325) 1587 162.1 1.6e-38
XP_011511727 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1355) 1587 162.1 1.7e-38
XP_005272327 (OMIM: 602052) PREDICTED: cyclin-G-as (1236) 1584 161.8 1.9e-38
XP_016860296 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1802) 494 61.0 6.1e-08
XP_016860295 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1815) 494 61.0 6.2e-08
XP_011510017 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1831) 494 61.0 6.2e-08
XP_011510015 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1839) 494 61.0 6.2e-08
XP_011510014 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1844) 494 61.0 6.2e-08
XP_016860293 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1852) 494 61.0 6.2e-08
XP_016860292 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1867) 494 61.0 6.3e-08
XP_016860290 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1895) 494 61.0 6.4e-08
XP_016860299 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1896) 494 61.0 6.4e-08
XP_016860298 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1896) 494 61.0 6.4e-08
XP_016860294 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1824) 473 59.1 2.4e-07
XP_016860291 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1880) 458 57.7 6.4e-07
XP_011513781 (OMIM: 606825) PREDICTED: tensin-3 is (1488) 452 57.0 7.8e-07
XP_011513780 (OMIM: 606825) PREDICTED: tensin-3 is (1534) 452 57.1 8e-07
XP_016868026 (OMIM: 606825) PREDICTED: tensin-3 is (1548) 452 57.1 8.1e-07
XP_011513779 (OMIM: 606825) PREDICTED: tensin-3 is (1548) 452 57.1 8.1e-07
XP_016868027 (OMIM: 606825) PREDICTED: tensin-3 is (1559) 452 57.1 8.1e-07
XP_011513778 (OMIM: 606825) PREDICTED: tensin-3 is (1561) 452 57.1 8.1e-07
XP_011510025 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1714) 452 57.1 8.7e-07
NP_001294952 (OMIM: 600076) tensin-1 isoform 3 [Ho (1714) 452 57.1 8.7e-07
NP_001294951 (OMIM: 600076) tensin-1 isoform 2 [Ho (1721) 452 57.1 8.7e-07
XP_016860297 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1727) 452 57.1 8.8e-07
NP_072174 (OMIM: 600076) tensin-1 isoform 1 [Homo (1735) 452 57.1 8.8e-07
XP_016860301 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1808) 452 57.1 9.1e-07
XP_016860300 (OMIM: 600076) PREDICTED: tensin-1 is (1808) 452 57.1 9.1e-07
XP_011513782 (OMIM: 606825) PREDICTED: tensin-3 is (1445) 446 56.5 1.1e-06
XP_016868028 (OMIM: 606825) PREDICTED: tensin-3 is (1445) 446 56.5 1.1e-06
XP_011513785 (OMIM: 606825) PREDICTED: tensin-3 is (1445) 446 56.5 1.1e-06
XP_011513783 (OMIM: 606825) PREDICTED: tensin-3 is (1445) 446 56.5 1.1e-06
>>NP_055602 (OMIM: 608375,615528) putative tyrosine-prot (913 aa)
initn: 6291 init1: 6291 opt: 6291 Z-score: 3168.7 bits: 597.6 E(85289): 9.2e-170
Smith-Waterman score: 6291; 100.0% identity (100.0% similar) in 913 aa overlap (1-913:1-913)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKDSENKGASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MKDSENKGASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 FHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQNPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 FCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGYMCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGYMCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 IPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERMKEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 YHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDTTVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDTTVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSSHQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GQSGFFASLCWQDQKSEKSFCEEDHAALVNQESEQSDDELLTLSSPHGNANGDKPHGVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GQSGFFASLCWQDQKSEKSFCEEDHAALVNQESEQSDDELLTLSSPHGNANGDKPHGVKK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 PSKKQQEPAAPPPPEDVDLLGLEGSAMSNSFSPPAAPPTNSELLSDLFGGGGAAGPTQAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PSKKQQEPAAPPPPEDVDLLGLEGSAMSNSFSPPAAPPTNSELLSDLFGGGGAAGPTQAG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 QSGVEDVFHPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSKPSGQDLLGSFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QSGVEDVFHPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLRVGEGATFDPFGAPSKPSGQDLLGSFL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 NTSSASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPDVSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NTSSASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPDVSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GSSHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSSHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKPTTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GWQQGGAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNVSFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GWQQGGAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNVSFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKEMDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 HTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDA
850 860 870 880 890 900
910
pF1KA0 WSEFENQGQKPLY
:::::::::::::
NP_055 WSEFENQGQKPLY
910
>>NP_001243793 (OMIM: 608375,615528) putative tyrosine-p (970 aa)
initn: 6249 init1: 6249 opt: 6249 Z-score: 3147.3 bits: 593.7 E(85289): 1.4e-168
Smith-Waterman score: 6249; 99.7% identity (100.0% similar) in 909 aa overlap (5-913:62-970)
10 20 30
pF1KA0 MKDSENKGASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLF
...:::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGGVGGKQRVNAGAAARSPARQPPDRASTMDSSGASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLF
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 SNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYTKGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYTKGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDI
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 RSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKFHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAKFHSRVSECSWPIRQAPSLHNLFAVCRNMYNWLLQ
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 NPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFIFCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPKNVCVVHCLDGRAASSILVGAMFIFCNLYSTPGPAIRLLYAKRPGIGLSPSHRRYLGY
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 MCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSPIPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MCDLLADKPYRPHFKPLTIKSITVSPIPFFNKQRNGCRPYCDVLIGETKIYSTCTDFERM
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 KEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSMYHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEYRVQDGKIFIPLNITVQGDVVVSMYHLRSTIGSRLQAKVTNTQIFQLQFHTGFIPLDT
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 TVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTLDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVLKFTKPELDACDVPEKYPQLFQVTLDVELQPHDKVIDLTPPWEHYCTKDVNPSILFSS
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 HQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHYGQSGFFASLCWQDQKSEKSFCEEDHAALVNQESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HQEHQDTLALGGQAPIDIPPDNPRHYGQSGFFASLCWQDQKSEKSFCEEDHAALVNQESE
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 QSDDELLTLSSPHGNANGDKPHGVKKPSKKQQEPAAPPPPEDVDLLGLEGSAMSNSFSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSDDELLTLSSPHGNANGDKPHGVKKPSKKQQEPAAPPPPEDVDLLGLEGSAMSNSFSPP
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 AAPPTNSELLSDLFGGGGAAGPTQAGQSGVEDVFHPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAPPTNSELLSDLFGGGGAAGPTQAGQSGVEDVFHPSGPASTQSTPRRSATSTSASPTLR
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 VGEGATFDPFGAPSKPSGQDLLGSFLNTSSASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGEGATFDPFGAPSKPSGQDLLGSFLNTSSASSDPFLQPTRSPSPTVHASSTPAVNIQPD
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 VSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPTGSSHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSGGWDWHAKPGGFGMGSKSAATSPTGSSHGTPTHQSKPQTLDPFADLGTLGSSSFASKP
700 710 720 730 740 750
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 TTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGGGWQQGGAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTPTGLGGGFPPLSSPQKASPQPMGGGWQQGGAYNWQQPQPKPQPSMPHSSPQNRPNYNV
760 770 780 790 800 810
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 SFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAADFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFSAMPGGQNERGKGSSNLEGKQKAADFEDLLSGQGFNAHKDKKGPRTIAEMRKEEMAKE
820 830 840 850 860 870
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 MDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVL
880 890 900 910 920 930
880 890 900 910
pF1KA0 VVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVHPDKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQGQKPLY
940 950 960 970
>>NP_001243794 (OMIM: 608375,615528) putative tyrosine-p (900 aa)
initn: 6205 init1: 6205 opt: 6205 Z-score: 3125.8 bits: 589.6 E(85289): 2.3e-167
Smith-Waterman score: 6205; 100.0% identity (100.0% similar) in 900 aa overlap (14-913:1-900)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MKDSENKGASSPDMEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEPSYGGGLFDMVKGGAGRLFSNLKDNLKDTLKDTSSRVIQSVTSYT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 KGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGDLDFTYVTSRIIVMSFPLDNVDIGFRNQVDDIRSFLDSRHLDHYTVYNLSPKSYRTAK
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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.. :: : : .:..::: :.: :: :: . : :: . :. : :.::
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::: .. ..:.: : . : :.: :. ::.: :::..:.. : . ..:
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XP_005 KIEDGKAVIPLGVTVQGDVLIVIYHARSTLGGRLQAKMASMKMFQIQFHTGFVPRNATTV
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XP_005 KFAKYDLDACDIQEKYPDLFQVNLEVEVEPRDRPSREAPPWENSSMRGLNPKILFSSREE
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XP_005 ACTQPRPNYASNFSVI-GAREERGVRAPSFAQKPKVSENDFEDLLSNQGFSSRSDKKGPK
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XP_005 TIAEMRKQDLAKDTDPLKLKLLDWIEGKERNIRALLSTLHTVLWDGESRWTPVGMADLVA
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XP_005 PEQVKKHYRRAVLAVHPDKAAGQPYEQHAKMIFMELNDAWSEFENQGSRPLF
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XP_011 LDSKHPGHYAVYNLSPRTYRPSRFHNRVSECGWAARRAPHLHTLYNICRNMHAWLRQDHK
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XP_011 NVCVVHCMDGRAASAVAVCSFLCFCRLFSTAEAAVYMFSMKRCPPGIWPSHKRYIEYMCD
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XP_011 KIEDGKAVIPLGVTVQGDVLIVIYHARSTLGGRLQAKMASMKMFQIQFHTGFVPRNATTV
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NP_001 EAETGAENASSKESESALMEDRDESEVSDEGGSPISSEGQEPRADPEPPGLAAGLVQQDL
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NP_001 VFEVETPAVLPEPVPQEDGVDLLGLHSEVGAGPAVPPQACKAPSSNTDLLSCLLGPPEAA
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NP_001 SQGPPEDLLS--EDPLLLASPAPPLSVQSTPR-GGPPAAADPF-----GPLLPSSGNNSQ
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pF1KA0 P-SGQDLLGSFLNTSSASSDPFLQPTRS-PSPT-----VHASSTP-------AVNIQPDV
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NP_001 PCSNPDLFGEFLNSDSVTVPPSFPSAHSAPPPSCSADFLHLGDLPGEPSKMTASSSNPDL
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