Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0474
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0474, 681 aa
1>>>pF1KA0474 681 - 681 aa - 681 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7595+/-0.000924; mu= 13.8676+/- 0.056
mean_var=126.7601+/-24.876, 0's: 0 Z-trim(109.4): 36 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.113916
statistics sampled from 10843 (10876) to 10843 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 3.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 681) 4537 757.3 1.6e-218
CCDS81276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 748) 3380 567.2 2.9e-161
CCDS218.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 663) 3336 560.0 4e-159
CCDS53277.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 727) 3336 560.0 4.3e-159
CCDS82035.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 711) 1791 306.1 1.2e-82
CCDS45573.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 730) 1791 306.1 1.2e-82
CCDS45574.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 715) 1767 302.1 1.8e-81
CCDS69663.1 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 ( 991) 733 132.3 3.3e-30
CCDS6869.2 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 (1013) 733 132.3 3.3e-30
CCDS61491.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1782) 683 124.3 1.5e-27
CCDS61490.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1783) 683 124.3 1.5e-27
CCDS9807.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1804) 683 124.3 1.5e-27
CCDS41474.1 SIPA1L2 gene_id:57568|Hs108|chr1 (1722) 676 123.1 3.3e-27
CCDS33007.1 SIPA1L3 gene_id:23094|Hs108|chr19 (1781) 672 122.5 5.4e-27
CCDS8108.1 SIPA1 gene_id:6494|Hs108|chr11 (1042) 636 116.4 2.1e-25
>>CCDS53276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 (681 aa)
initn: 4537 init1: 4537 opt: 4537 Z-score: 4036.8 bits: 757.3 E(32554): 1.6e-218
Smith-Waterman score: 4537; 100.0% identity (100.0% similar) in 681 aa overlap (1-681:1-681)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 HEITSIPETEPLQSPTTKVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HEITSIPETEPLQSPTTKVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 IVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMEN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 PGKSASRFGRRGSAIGIGTVEESLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PGKSASRFGRRGSAIGIGTVEESLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 FASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPDAGKLGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPDAGKLGDP
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KA0 ACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
:::::::::::::::::::::
CCDS53 ACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
670 680
>>CCDS81276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 (748 aa)
initn: 4318 init1: 3377 opt: 3380 Z-score: 3008.6 bits: 567.2 E(32554): 2.9e-161
Smith-Waterman score: 4200; 91.7% identity (91.7% similar) in 711 aa overlap (1-652:1-711)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 HEITSIPETEPLQSPTTKVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HEITSIPETEPLQSPTTKVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 IVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMEN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLI
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KA0 PGKSASRFGRRGSAIGIGTVEE--------------------------------------
::::::::::::::::::::::
CCDS81 PGKSASRFGRRGSAIGIGTVEEVVVRGAAGSGGCLHALFSARSQDGGHIGDVAPLPPGQA
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540
pF1KA0 ---------------------SLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PGRAGWSGGSSDGTQHLLWGLSLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRES
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSF
610 620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPDAGKLGDPA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPGPSRSPHPD
670 680 690 700 710 720
670 680
pF1KA0 CPEIKIQLEASEQHMPQLGC
CCDS81 AGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
730 740
>>CCDS218.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 (663 aa)
initn: 4206 init1: 3265 opt: 3336 Z-score: 2970.2 bits: 560.0 E(32554): 4e-159
Smith-Waterman score: 4287; 95.1% identity (95.1% similar) in 689 aa overlap (1-681:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 HEITSIPETEPLQSPTTKVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 HEITSIPETEPLQSPTTKVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 IGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 IVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 IVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 GGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 NTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 NTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 FQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 FQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMEN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 GSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 GSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISL--
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 PGKSASRFGRRGSAIGIGTVEESLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ------------------------IVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRE
480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 SPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASS
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650
pF1KA0 FASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSP--------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 FASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPGPSRSPHP
580 590 600 610 620 630
660 670 680
pF1KA0 DAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 DAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
640 650 660
>>CCDS53277.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 (727 aa)
initn: 4206 init1: 3265 opt: 3336 Z-score: 2969.7 bits: 560.0 E(32554): 4.3e-159
Smith-Waterman score: 4287; 95.1% identity (95.1% similar) in 689 aa overlap (1-681:65-727)
10 20 30
pF1KA0 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HFPQALDLSRVNLVPSYTPSLYPKNTDLFEMIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTNHEITSIPETEPLQSPTTKVKLECNPTARIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTNHEITSIPETEPLQSPTTKVKLECNPTARIY
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 RKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEF
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 PNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEEL
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 FSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVST
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 KLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGP
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 LYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTR
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 AALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNK
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 KPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLIPGKSASRFGRRGSAIGIGTVEESLIVPGKS
:::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS53 KPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISL--------------------------IVPGKS
520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 PTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPE
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 MPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKR
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680
pF1KA0 DSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSP--------DAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPGPSRSPHPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
670 680 690 700 710 720
>>CCDS82035.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 (711 aa)
initn: 1993 init1: 1609 opt: 1791 Z-score: 1597.6 bits: 306.1 E(32554): 1.2e-82
Smith-Waterman score: 2138; 54.3% identity (76.3% similar) in 645 aa overlap (1-636:43-659)
10 20 30
pF1KA0 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
:.::::: ...::. : : :...:::::
CCDS82 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
pF1KA0 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSIPETEPLQ--SPTT-KVKL
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CCDS82 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL
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90 100 110 120 130 140
pF1KA0 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
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CCDS82 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK
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190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN
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CCDS82 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ
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CCDS82 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK
.: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..:
CCDS82 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS
:::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.:
CCDS82 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS
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450 460 470 480 490 500
pF1KA0 MDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLIPGKSASRFGRRGSAIGIGTVE
:..: ..:: ::::.. :.. ..::: . . : . . .::.
CCDS82 METMVGGQKK------SHSGGI-PGS----LSGGISHNSMEVTKTTF---SPPVVAATVK
490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 ESLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSE
.. ..:: ...:: : .. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::
CCDS82 NQ----SRSPIKRRSGLFPRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSE
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570 580 590 600 610 620
pF1KA0 NSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESV
.::. ::::. :. . . : . .::::::.:: .:.. : :... :.: :
CCDS82 TSSNPSSPEI--CPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQ
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630 640 650 660 670 680
pF1KA0 SSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
:. .: :.. :.::
CCDS82 PSTTSPFKQEVFVYSPSPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSH
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10 20 30
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CCDS45 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY
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40 50 60 70 80
pF1KA0 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSIPETEPLQ--SPTT-KVKL
::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : . ::.: ::
CCDS45 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL
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90 100 110 120 130 140
pF1KA0 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
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CCDS45 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
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150 160 170 180 190 200
pF1KA0 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK
::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.:::::::::
CCDS45 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN
:: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::.
CCDS45 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD
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270 280 290 300 310 320
pF1KA0 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ
.:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
CCDS45 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ
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330 340 350 360 370 380
pF1KA0 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK
.: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..:
CCDS45 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS
:::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.:
CCDS45 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS
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450 460 470 480 490 500
pF1KA0 MDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLIPGKSASRFGRRGSAIGIGTVE
:..: ..:: ::::.. :.. ..::: . . : . . .::.
CCDS45 METMVGGQKK------SHSGGI-PGS----LSGGISHNSMEVTKTTF---SPPVVAATVK
510 520 530 540 550
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 ESLIVPGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSE
.. ..:: ...:: : .. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::
CCDS45 NQ----SRSPIKRRSGLFPRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSE
560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 NSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESV
.::. ::::. :. . . : . .::::::.:: .:.. : :... :.: :
CCDS45 TSSNPSSPEI--CPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQ
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 SSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
:. .: :.. :.::
CCDS45 PSTTSPFKQEVFVYSPSPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSH
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>>CCDS45574.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 (715 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KA0 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQF
: ..:::::::. ::. . ::.: ..::::
CCDS45 SDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQDDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQF
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60 70 80 90 100
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:::::: :: . .:: : : . ::.: ::::. :: ::.:::::.:.:.
CCDS45 GGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNF
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: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :. ::.. :...:.: :.:: :.
CCDS45 YCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCD
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170 180 190 200 210 220
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:. :: ::::::::..::..::: ..:.::::::::: :: :::::..::::::: :
CCDS45 DAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKE
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 FLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQL
::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::..:::::::::::.:.::::::
CCDS45 FLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQL
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::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::.: : . : ::::::::.::
CCDS45 QRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDV
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: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..::::::.:::::::..:..:::
CCDS45 PTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELH
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410 420 430 440 450 460
pF1KA0 IHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGS
:.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.::..: ..:: ::::.
CCDS45 AHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKK------SHSGG
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470 480 490 500 510 520
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. :.. : : : . . .... .: .. ..:: ...:: :
CCDS45 I-PGS-----------LSGGISHNSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLFPRL
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530 540 550 560 570 580
pF1KA0 RSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAETAA
.. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. .
CCDS45 HT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEKPFM
560 570 580 590 600 610
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 QRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWLEDS
. : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : :. .: :.. :.::
CCDS45 KLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSPSPSSE
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650 660 670 680
pF1KA0 VSTTSGGSSPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
CCDS45 SPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH
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CCDS69 GCRRGDFSRKHYGSVELLISSDADGAIQRAGRFRVENGSSDENATALPGTWR----RTDV
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pF1KA0 KLECNPT--ARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQE--HLRLLLRTKC
.:: :: .: : :.:::. : :: . :: . . .:. . ..:. . : .: :
CCDS69 HLE-NPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYIGNDAEKSPFFLSVTLSDQNNQRVPQYRAILWRKT
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pF1KA0 RTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFY--P--VLYPKASRLIVTFDEHVISN
: . .: : :. . .: . .:.:.: : ...:. .. .....:. :
CCDS69 GTQKICLPYS-----PTKTLSVKSILSAMNLDKFEKGPREIFHPEIQKDLLVLEEQEGSV
130 140 150 160 170
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pF1KA0 NFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTG
::::::.. : :: ...:.::.. : : .::..::. . :. . :.:::::. . ::
CCDS69 NFKFGVLFAKDGQLTDDEMFSNEIGSEPFQKFLNLLGDTITLKGWTGYRGGLDTKNDTTG
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pF1KA0 TESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQD--ENTP-FVPDM
.::: ....:::::::: :::.. . ::..::::::::::..:::. :..: : :.:
CCDS69 IHSVYTVYQGHEIMFHVSTMLPYSKENKQQVERKRHIGNDIVTIVFQEGEESSPAFKPSM
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 IASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTK
: :.: : ...:. . . . :.... ....::.:::::: : :: ::..:::.:
CCDS69 IRSHFTHIFALVRYNQQNDN---YRLKIFSEESVPLFGPPLPTPPVFTDHQEFRDFLLVK
300 310 320 330 340 350
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pF1KA0 LINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFF
:::.: : .. ::. ..:: :...:...:
CCDS69 LINGEKATLETPTFAQKRRRTLDMLIRSLHQDLMPDLHKNMLNRRSFSDVLPESPKSARK
360 370 380 390 400 410
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pF1KA0 ESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLIPGKSASRF
CCDS69 KEEARQAEFVRIGQALKLKSIVRGDAPSSLAASGICKKEPWEPQCFCSNFPHEAVCADPW
420 430 440 450 460 470
>>CCDS6869.2 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 (1013 aa)
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Smith-Waterman score: 733; 37.7% identity (67.5% similar) in 363 aa overlap (52-401:62-411)
30 40 50 60 70
pF1KA0 KTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-GTNHE-ITSIPETEPLQSPTTKV
: . .: :.. : :..: : : :
CCDS68 GCRRGDFSRKHYGSVELLISSDADGAIQRAGRFRVENGSSDENATALPGTWR----RTDV
40 50 60 70 80
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pF1KA0 KLECNPT--ARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQE--HLRLLLRTKC
.:: :: .: : :.:::. : :: . :: . . .:. . ..:. . : .: :
CCDS68 HLE-NPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYIGNDAEKSPFFLSVTLSDQNNQRVPQYRAILWRKT
90 100 110 120 130 140
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pF1KA0 RTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFY--P--VLYPKASRLIVTFDEHVISN
: . .: : :. . .: . .:.:.: : ...:. .. .....:. :
CCDS68 GTQKICLPYS-----PTKTLSVKSILSAMNLDKFEKGPREIFHPEIQKDLLVLEEQEGSV
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 NFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTG
::::::.. : :: ...:.::.. : : .::..::. . :. . :.:::::. . ::
CCDS68 NFKFGVLFAKDGQLTDDEMFSNEIGSEPFQKFLNLLGDTITLKGWTGYRGGLDTKNDTTG
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300
pF1KA0 TESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQD--ENTP-FVPDM
.::: ....:::::::: :::.. . ::..::::::::::..:::. :..: : :.:
CCDS68 IHSVYTVYQGHEIMFHVSTMLPYSKENKQQVERKRHIGNDIVTIVFQEGEESSPAFKPSM
270 280 290 300 310 320
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pF1KA0 IASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTK
: :.: : ...:. . . . :.... ....::.:::::: : :: ::..:::.:
CCDS68 IRSHFTHIFALVRYNQQNDN---YRLKIFSEESVPLFGPPLPTPPVFTDHQEFRDFLLVK
330 340 350 360 370
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pF1KA0 LINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFF
:::.: : .. ::. ..:: :...:...:
CCDS68 LINGEKATLETPTFAQKRRRTLDMLIRSLHQDLMPDLHKNMLNRRSFSDVLPESPKSARK
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLLIPGKSASRF
CCDS68 KEEARQAEFVRIGQALKLKSIVRGDAPSSLAASGICKKEPWEPQCFCSNFPHEAVCADPW
440 450 460 470 480 490
>>CCDS61491.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1782 aa)
initn: 761 init1: 423 opt: 683 Z-score: 607.9 bits: 124.3 E(32554): 1.5e-27
Smith-Waterman score: 751; 39.8% identity (68.4% similar) in 332 aa overlap (87-400:489-819)
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 EGTNHEITSIPETEPLQSPTTKVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSL
: ::: : :::.::.. : :: .. :.
CCDS61 GVAVLEVPKENLVLHLDRVKRYIVEHVDLGAYYYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSI
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