Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0476
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0476, 1496 aa
1>>>pF1KA0476 1496 - 1496 aa - 1496 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8964+/-0.000941; mu= 3.3498+/- 0.057
mean_var=259.3940+/-51.926, 0's: 0 Z-trim(114.4): 67 B-trim: 3 in 1/52
Lambda= 0.079633
statistics sampled from 14904 (14962) to 14904 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.755), E-opt: 0.2 (0.46), width: 16
Scan time: 6.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44228.1 DENND4B gene_id:9909|Hs108|chr1 (1496) 10250 1191.9 0
CCDS45285.1 DENND4A gene_id:10260|Hs108|chr15 (1863) 3530 420.0 3.4e-116
CCDS53949.1 DENND4A gene_id:10260|Hs108|chr15 (1906) 3530 420.0 3.5e-116
CCDS6491.3 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9 (1909) 2476 298.9 9.9e-80
CCDS83349.1 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9 (1958) 2470 298.2 1.6e-79
>>CCDS44228.1 DENND4B gene_id:9909|Hs108|chr1 (1496 aa)
initn: 10250 init1: 10250 opt: 10250 Z-score: 6373.3 bits: 1191.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10250; 100.0% identity (100.0% similar) in 1496 aa overlap (1-1496:1-1496)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPESVPVFCLPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPESVPVFCLPM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIHN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLTE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSYF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGPE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EEASLEFLLTDYEAVCGRRARLEREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGARDVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEASLEFLLTDYEAVCGRRARLEREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGARDVD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 NLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKVHPEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKVHPEQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EKPEPTPLVELEELSGSELTVFITPPEEPALPEGSESTPQYCYDGFPELRAELFESLQEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EKPEPTPLVELEELSGSELTVFITPPEEPALPEGSESTPQYCYDGFPELRAELFESLQEQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PGALPVPGPSRSAPSSPAPRRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWARCLLGHCYGLWFLCLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PGALPVPGPSRSAPSSPAPRRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWARCLLGHCYGLWFLCLP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 AYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCSHYGQPVLSVRVMLEMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCSHYGQPVLSVRVMLEMR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 QAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRERQQQQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRERQQQQQQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 QQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWAGRSLRDPASPPGRLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWAGRSLRDPASPPGRLVK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 SGSLGSARGAQPTVEAGVAHMIEALGVLEPRGSPVPWHDGSLSDLSLTGEEPLPGGSPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGSLGSARGAQPTVEAGVAHMIEALGVLEPRGSPVPWHDGSLSDLSLTGEEPLPGGSPGG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 SGSALSAQSTEALEGLSGRGPKAGGRQDEAGTPRRGLGARLQQLLTPSRHSPASRIPPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGSALSAQSTEALEGLSGRGPKAGGRQDEAGTPRRGLGARLQQLLTPSRHSPASRIPPPE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 LPPDLPPPARRSPMDSLLHPRERPGSTASESSASLGSEWDLSESSLSNLSLRRSSERLSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LPPDLPPPARRSPMDSLLHPRERPGSTASESSASLGSEWDLSESSLSNLSLRRSSERLSD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 TPGSFQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMAGWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TPGSFQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMAGWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 QTLDSRPSVPSPKSAGASGSKDAPVPGGPGPVLSDRRLCLALDEPQLCNGHMGGASRRVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QTLDSRPSVPSPKSAGASGSKDAPVPGGPGPVLSDRRLCLALDEPQLCNGHMGGASRRVE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 SGAWAYLSPLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLLWYFQRLRLPSILPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGAWAYLSPLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLLWYFQRLRLPSILPGL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 VLASCDGPSHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLYVLWRVHSQIPQRVVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VLASCDGPSHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLYVLWRVHSQIPQRVVW
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 PGPVPASLSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHLQRGIYREILFLTMAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PGPVPASLSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHLQRGIYREILFLTMAA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 LGKDHVDIVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAIDCRKCFGAPPEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LGKDHVDIVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAIDCRKCFGAPPEC
1450 1460 1470 1480 1490
>>CCDS45285.1 DENND4A gene_id:10260|Hs108|chr15 (1863 aa)
initn: 2484 init1: 1137 opt: 3530 Z-score: 2199.5 bits: 420.0 E(32554): 3.4e-116
Smith-Waterman score: 3530; 57.0% identity (80.1% similar) in 906 aa overlap (1-899:1-896)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
: :.. ::..::::::::. . :. :: . . .: ::::::.:: ..::::
CCDS45 MIEDKGPRVADYFVVAGLTDVSKPLEEEIHFNDACHKV--AKPKEPITDVSVIIKSLGEE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
::: : ::... : .:. : : : : .:::::::::::..:::::. ::: : : .
CCDS45 VPQDYICIDVTPTGLSADLNNGSLVGPQIYLCYRRGRDKPPLTDLGVLYDWKERLKQGCE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
....:::.. ::.. .. : :.:::::.:. ..:..::.:...:::::. :::.:
CCDS45 IIQSTPYGRPANISGSTSSQ-RIYITYRRASENMTQNTLAVTDICIIIPSKGESPPHTFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPESVPVFCLPM
.. .::: .::: ::::::: ..::.::. :.: :. :::.:: :.: ::::::.:::::
CCDS45 KVDKNLNNSMWGSAVYLCYKKSVAKTNTVSYKAGLICRYPQEDYESFSLPESVPLFCLPM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLSA
::::::::...:::.:::::::::::...::::::.:::: . . :.:.: ::: ::
CCDS45 GATIECWPSNSKYPLPVFSTFVLTGASAEKVYGAAIQFYEPYSEENLTEKQRLLLGLTSA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIHN
:.. ....... . : .::.:: : ::: :::::::::.:::: ::.: :::::.:.
CCDS45 --DGKSDSSKTIHTNKCICLLSHWPFFDAFRKFLTFLYRYSISGPHVLPIEKHISHFMHK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLTE
::::::::::::::.::.:::.: :::::::::::..: :::.:::: :.:::. ..::
CCDS45 VPFPSPQRPRILVQLSPHDNLILSQPVSSPLPLSGGKFSTLLQNLGPENAVTLLVFAVTE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSYF
::.:.:::::..:::: :::::::::.:: :::.:::::.:::::::: :::::: : ::
CCDS45 HKILIHSLRPSVLTSVTEALVSMIFPFHWPCPYVPLCPLALADVLSAPCPFIVGIDSRYF
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGPE
::.::: :: :::.::::. : .:: .. . ::..: : :. ::.::.::: . :.
CCDS45 DLYDPPPDVSCVDVDTNTISQIGDKKNVAWKILPKKPCKNLMNTLNNLHQQLAKLQQRPR
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KA0 EEASLEFLLTDYEAVCGRRARL-EREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGARDV
... ... ..::. :.: .. . :.: ::: ::: .::::: .:::.:::::: : :.
CCDS45 DDGLMDLAINDYDFNSGKRLHMIDLEIQEAFLFFMASILKGYRSYLRPITQAPSETATDA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 DNLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKVHPE
.:: ::.::.::.:: .:.:... .:::: .::::::: : . :.: :::.::.:: .
CCDS45 ASLFALQAFLRSRDRSHQKFYNMMTKTQMFIRFIEECSFVSDKDASLAFFDDCVDKV--D
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 QEKPEPTPLVELEELSGSELTVFITPPEEPALPEGSESTPQYCYDGFPELRAELFES---
..: . :.::.: :: :::.:::: : ::.: : :: :.::: :: .:::
CCDS45 MDKSGEVRLIELDESFKSEHTVFVTPPEIPHLPNGEEPPLQYSYNGFPVLRNNLFERPEG
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 -LQEQPGALPVPGPSRSAPSSPAP--RRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWARCLLGHCYG
:: . . :: . :.:.:: : ::::::.: :...:.. ...:..:.:::: ::::
CCDS45 FLQAKKNKLP---SKSSSPNSPLPMFRRTKQEIKSAHKIAKRYSSIPQMWSRCLLRHCYG
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 LWFLCLPAYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCSHYGQPVLSV
:::.::::::. :.:.::.::: ::..:.: :. :::::::.:::::..: ::::.:
CCDS45 LWFICLPAYVKVCHSKVRALKTAYDVLKKMQSKKMDPPDEVCYRILMQLCGQYDQPVLAV
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 RVMLEMRQAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRE
::..::..::: ::.::::::::::::: ::: . .: . :.:.::::::..::.. :..
CCDS45 RVLFEMQKAGIDPNAITYGYYNKAVLESTWPSRSRSGYFLWTKVRNVVLGVTQFKRALKK
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 RQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWAGRSLRDPAS
. . .:
CCDS45 HAHLSQTTLSGGQSDLGYNSLSKDEVRRGDTSTEDIQEEKDKKGSDCSSLSESESTKGSA
900 910 920 930 940 950
>--
initn: 925 init1: 410 opt: 614 Z-score: 388.9 bits: 85.0 E(32554): 2.4e-15
Smith-Waterman score: 816; 28.8% identity (54.0% similar) in 698 aa overlap (896-1493:1178-1861)
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 GTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRERQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAE
.:::..............:. . . :
CCDS45 RMNSSFSVKPFEKTDVATGFDPLSLLVAETEQQQKEEEEEDEDDSKSISTPSARRDLAEE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 PYLERPSPTRPLQRQTTWAG--RSLRDP---ASPPGRLVKSGSLGSARGAQPTVEAGVAH
. . . :: .: :. : ::: :::. :.. : ..
CCDS45 IVMYMNNMSSPLTSRTPSIDLQRACDDKLNKKSPP--LVKA----CRRSSLPPNSPKPVR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 MIEALGVLEPRGSPVP--WHDGSLSDLSLTGEEPLPGGSPGGSGSALSAQSTEALEGLSG
. .. . . . .: : . ..: :: . .. . :.. . :. : .
CCDS45 LTKSKSYTKSEEKPRDRLWSSPAFSPTCPFREESQDTLTHSSPSFNLDTLLVPKLDVLRN
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 RGPKAGGRQDEAGTPRRGLGARLQQLLTPSRHSPASRIPPPELPPDLPPPARRSPMDSLL
:: : .. .:. . : :. . ..: . . . . : .
CCDS45 SMFTAGKGVAEKASKWY---SRFTMYTTSSKDQSSDRTSLSSVGAQDSESTSLTDED-VC
1330 1340 1350 1360 1370
1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 HPRERPGSTASESSASLGSEW-DLS----------ESSLSNLSLRRSSERLSDTPGS---
: : : :. .:.::. :.. ::: :.:::...: .:: :. .:
CCDS45 HELEGPISS-QETSATSGTKRIDLSRISLESSASLEGSLSKFALPGKSEVTSSFNASNTN
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 -FQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMAGWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSVQTL
::. ..:.:.:::: ::.:: ::.::::::::. ::::::::::::. :.:.:...
CCDS45 IFQNYAMEVLISSCSRCRTCDCLVHDEEIMAGWTADDSNLNTTCPFCGNIFLPFLNIEIR
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1210
pF1KA0 D-SRP------SVPSPK-----------------SAGASG--------------------
: :: : :: . :..:::
CCDS45 DLRRPGRYFLKSSPSTENMHFPSSISSQTRQSCISTSASGLDTSALSVQGNFDLNSKSKL
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 -----SKDAPVPGGPGPVLSDRRLCLALDEPQLCNGHMG----GASRRVESGA-------
... .:.. . . .. . . . .: . : .. . .:.
CCDS45 QENFCTRSIQIPANRSKTAMSKCPIFPMARSISTSGPLDKEDTGRQKLISTGSLPATLQG
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1270 1280 1290 1300
pF1KA0 --------W----------AYLSPLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLL
: ::::::. ::::::.::::...... .. . :::.::::.
CCDS45 ATDSLGLEWHLPSPDPVTVPYLSPLVVWKELESLLENEGDHAITVADFVDHHPIVFWNLV
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA0 WYFQRLRLPSILPGLVLASCDGPSHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLY
:::.:: ::: ::::.:.: ..:. : .. : : ...::: . . :::
CCDS45 WYFRRLDLPSNLPGLILSSEHCNKYSKIPRHCMSEDSKYVLIQMLWDNMKLHQDPGQPLY
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KA0 VLWRVHSQIPQRVVWPGPVPASLSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHL
.:: .:.: : :.. ::.:... . .:.:. .. .::::. : ..
CCDS45 ILWNAHTQKYPMVHLLQKSDNSFNQELLKSMVKSIKMNDVYGPMSQILETLNKCPH-FKR
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KA0 QRGIYREILFLTMAALGKDHVDIVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAID
::..:::::::...:::....:: ::::.:: :...:. :. : : . :. ...
CCDS45 QRSLYREILFLSLVALGRENIDIDAFDKEYKMAYDRLTPSQVKS--THNCDRPPSTGVME
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1490
pF1KA0 CRKCFGAPPEC
::: :: :
CCDS45 CRKTFGEPYL
1860
>>CCDS53949.1 DENND4A gene_id:10260|Hs108|chr15 (1906 aa)
initn: 2484 init1: 1137 opt: 3530 Z-score: 2199.3 bits: 420.0 E(32554): 3.5e-116
Smith-Waterman score: 3530; 57.0% identity (80.1% similar) in 906 aa overlap (1-899:1-896)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
: :.. ::..::::::::. . :. :: . . .: ::::::.:: ..::::
CCDS53 MIEDKGPRVADYFVVAGLTDVSKPLEEEIHFNDACHKV--AKPKEPITDVSVIIKSLGEE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
::: : ::... : .:. : : : : .:::::::::::..:::::. ::: : : .
CCDS53 VPQDYICIDVTPTGLSADLNNGSLVGPQIYLCYRRGRDKPPLTDLGVLYDWKERLKQGCE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
....:::.. ::.. .. : :.:::::.:. ..:..::.:...:::::. :::.:
CCDS53 IIQSTPYGRPANISGSTSSQ-RIYITYRRASENMTQNTLAVTDICIIIPSKGESPPHTFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPESVPVFCLPM
.. .::: .::: ::::::: ..::.::. :.: :. :::.:: :.: ::::::.:::::
CCDS53 KVDKNLNNSMWGSAVYLCYKKSVAKTNTVSYKAGLICRYPQEDYESFSLPESVPLFCLPM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLSA
::::::::...:::.:::::::::::...::::::.:::: . . :.:.: ::: ::
CCDS53 GATIECWPSNSKYPLPVFSTFVLTGASAEKVYGAAIQFYEPYSEENLTEKQRLLLGLTSA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIHN
:.. ....... . : .::.:: : ::: :::::::::.:::: ::.: :::::.:.
CCDS53 --DGKSDSSKTIHTNKCICLLSHWPFFDAFRKFLTFLYRYSISGPHVLPIEKHISHFMHK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 VPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLTE
::::::::::::::.::.:::.: :::::::::::..: :::.:::: :.:::. ..::
CCDS53 VPFPSPQRPRILVQLSPHDNLILSQPVSSPLPLSGGKFSTLLQNLGPENAVTLLVFAVTE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 HKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSYF
::.:.:::::..:::: :::::::::.:: :::.:::::.:::::::: :::::: : ::
CCDS53 HKILIHSLRPSVLTSVTEALVSMIFPFHWPCPYVPLCPLALADVLSAPCPFIVGIDSRYF
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 DLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGPE
::.::: :: :::.::::. : .:: .. . ::..: : :. ::.::.::: . :.
CCDS53 DLYDPPPDVSCVDVDTNTISQIGDKKNVAWKILPKKPCKNLMNTLNNLHQQLAKLQQRPR
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KA0 EEASLEFLLTDYEAVCGRRARL-EREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGARDV
... ... ..::. :.: .. . :.: ::: ::: .::::: .:::.:::::: : :.
CCDS53 DDGLMDLAINDYDFNSGKRLHMIDLEIQEAFLFFMASILKGYRSYLRPITQAPSETATDA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 DNLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKVHPE
.:: ::.::.::.:: .:.:... .:::: .::::::: : . :.: :::.::.:: .
CCDS53 ASLFALQAFLRSRDRSHQKFYNMMTKTQMFIRFIEECSFVSDKDASLAFFDDCVDKV--D
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 QEKPEPTPLVELEELSGSELTVFITPPEEPALPEGSESTPQYCYDGFPELRAELFES---
..: . :.::.: :: :::.:::: : ::.: : :: :.::: :: .:::
CCDS53 MDKSGEVRLIELDESFKSEHTVFVTPPEIPHLPNGEEPPLQYSYNGFPVLRNNLFERPEG
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 -LQEQPGALPVPGPSRSAPSSPAP--RRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWARCLLGHCYG
:: . . :: . :.:.:: : ::::::.: :...:.. ...:..:.:::: ::::
CCDS53 FLQAKKNKLP---SKSSSPNSPLPMFRRTKQEIKSAHKIAKRYSSIPQMWSRCLLRHCYG
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 LWFLCLPAYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCSHYGQPVLSV
:::.::::::. :.:.::.::: ::..:.: :. :::::::.:::::..: ::::.:
CCDS53 LWFICLPAYVKVCHSKVRALKTAYDVLKKMQSKKMDPPDEVCYRILMQLCGQYDQPVLAV
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 RVMLEMRQAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRE
::..::..::: ::.::::::::::::: ::: . .: . :.:.::::::..::.. :..
CCDS53 RVLFEMQKAGIDPNAITYGYYNKAVLESTWPSRSRSGYFLWTKVRNVVLGVTQFKRALKK
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 RQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWAGRSLRDPAS
. . .:
CCDS53 HAHLSQTTLSDGSDLDAVSHGSMDSGHGTHTVEQAPFNTGLIKVYATDDRSSTGGQSDLG
900 910 920 930 940 950
>--
initn: 925 init1: 410 opt: 614 Z-score: 388.8 bits: 85.0 E(32554): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 816; 28.8% identity (54.0% similar) in 698 aa overlap (896-1493:1221-1904)
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 GTPGGRLRWAKLRNVVLGAAQFRQPLRERQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAE
.:::..............:. . . :
CCDS53 RMNSSFSVKPFEKTDVATGFDPLSLLVAETEQQQKEEEEEDEDDSKSISTPSARRDLAEE
1200 1210 1220 1230 1240 1250
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 PYLERPSPTRPLQRQTTWAG--RSLRDP---ASPPGRLVKSGSLGSARGAQPTVEAGVAH
. . . :: .: :. : ::: :::. :.. : ..
CCDS53 IVMYMNNMSSPLTSRTPSIDLQRACDDKLNKKSPP--LVKA----CRRSSLPPNSPKPVR
1260 1270 1280 1290 1300
990 1000 1010 1020 1030
pF1KA0 MIEALGVLEPRGSPVP--WHDGSLSDLSLTGEEPLPGGSPGGSGSALSAQSTEALEGLSG
. .. . . . .: : . ..: :: . .. . :.. . :. : .
CCDS53 LTKSKSYTKSEEKPRDRLWSSPAFSPTCPFREESQDTLTHSSPSFNLDTLLVPKLDVLRN
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA0 RGPKAGGRQDEAGTPRRGLGARLQQLLTPSRHSPASRIPPPELPPDLPPPARRSPMDSLL
:: : .. .:. . : :. . ..: . . . . : .
CCDS53 SMFTAGKGVAEKASKWY---SRFTMYTTSSKDQSSDRTSLSSVGAQDSESTSLTDED-VC
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 HPRERPGSTASESSASLGSEW-DLS----------ESSLSNLSLRRSSERLSDTPGS---
: : : :. .:.::. :.. ::: :.:::...: .:: :. .:
CCDS53 HELEGPISS-QETSATSGTKRIDLSRISLESSASLEGSLSKFALPGKSEVTSSFNASNTN
1430 1440 1450 1460 1470
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 -FQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMAGWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSVQTL
::. ..:.:.:::: ::.:: ::.::::::::. ::::::::::::. :.:.:...
CCDS53 IFQNYAMEVLISSCSRCRTCDCLVHDEEIMAGWTADDSNLNTTCPFCGNIFLPFLNIEIR
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1210
pF1KA0 D-SRP------SVPSPK-----------------SAGASG--------------------
: :: : :: . :..:::
CCDS53 DLRRPGRYFLKSSPSTENMHFPSSISSQTRQSCISTSASGLDTSALSVQGNFDLNSKSKL
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 -----SKDAPVPGGPGPVLSDRRLCLALDEPQLCNGHMG----GASRRVESGA-------
... .:.. . . .. . . . .: . : .. . .:.
CCDS53 QENFCTRSIQIPANRSKTAMSKCPIFPMARSISTSGPLDKEDTGRQKLISTGSLPATLQG
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1270 1280 1290 1300
pF1KA0 --------W----------AYLSPLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLL
: ::::::. ::::::.::::...... .. . :::.::::.
CCDS53 ATDSLGLEWHLPSPDPVTVPYLSPLVVWKELESLLENEGDHAITVADFVDHHPIVFWNLV
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA0 WYFQRLRLPSILPGLVLASCDGPSHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLY
:::.:: ::: ::::.:.: ..:. : .. : : ...::: . . :::
CCDS53 WYFRRLDLPSNLPGLILSSEHCNKYSKIPRHCMSEDSKYVLIQMLWDNMKLHQDPGQPLY
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KA0 VLWRVHSQIPQRVVWPGPVPASLSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHL
.:: .:.: : :.. ::.:... . .:.:. .. .::::. : ..
CCDS53 ILWNAHTQKYPMVHLLQKSDNSFNQELLKSMVKSIKMNDVYGPMSQILETLNKCPH-FKR
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KA0 QRGIYREILFLTMAALGKDHVDIVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAID
::..:::::::...:::....:: ::::.:: :...:. :. : : . :. ...
CCDS53 QRSLYREILFLSLVALGRENIDIDAFDKEYKMAYDRLTPSQVKS--THNCDRPPSTGVME
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1490
pF1KA0 CRKCFGAPPEC
::: :: :
CCDS53 CRKTFGEPYL
1900
>>CCDS6491.3 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9 (1909 aa)
initn: 3253 init1: 1029 opt: 2476 Z-score: 1544.9 bits: 298.9 E(32554): 9.9e-80
Smith-Waterman score: 3209; 48.4% identity (73.3% similar) in 1029 aa overlap (1-1013:1-1015)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
: :.. ::..::::::::. ... . .: . : ::::.:.: .. ::
CCDS64 MIEDKGPRVTDYFVVAGLTDTSTLLDQEI----NRLDTKSTGPKAPITDIAIIIKSAGET
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
::.::::..:. .. .:. : : . . .::.::::::::...::::::::: :: .
CCDS64 VPEGYTCVEATPSALQANLNYGSLKSPELFLCYKRGRDKPPLTDIGVLYEGKERLIPGCE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
:. .:::.. ::. . : ..::::: ..:..::.:... :::: :::.:
CCDS64 VILATPYGRCANVNNSSTTSQRIFITYRRAPPVRPQNSLAVTDICVIVTSKGETPPHTFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KA0 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPES-VPVFCLP
.. .::: :::: .:.:::: .. .:...:.: :. :::::: :.::: :: ::.::::
CCDS64 KVDKNLNCGMWGSSVFLCYKKSVPASNAIAYKAGLIFRYPEEDYESFPLSESDVPLFCLP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 MGATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLS
:::::::: .::::.::::::::::... ::::::.:::: . : :::.: ::::.
CCDS64 MGATIECWDPETKYPLPVFSTFVLTGSSAKKVYGAAIQFYEPYSRELLSEKQLMHLGLLT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 AVERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIH
:: : . .... . . : .::.:: : ::: :: :.:. :::::: ::.: :::::..
CCDS64 PVE--RKMVSKSINTNKCICLLSHWPFFEAFRKFLMFIYKLSVSGPHPLPIEKHISHFMQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 NVPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLT
:.:::::::::::::.: .: :.: ::::.:::::::.: ::..:::: :::: ::
CCDS64 NIPFPSPQRPRILVQLSVHDALILSQPVSTPLPLSGANFSTLLMNLGPENCATLLLFVLL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 EHKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSY
: :.:.::::: .::.: ::.:.::::..::::::::::: :: :::::.:::::. : :
CCDS64 ESKILLHSLRPAVLTGVAEAVVAMIFPFQWQCPYIPLCPLSLAAVLSAPLPFIVGVDSRY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 FDLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGP
::::::: ::.:.::::: :. ..::: .. . ::..: : ::.:: .:: ::....
CCDS64 FDLHDPPQDVVCIDLDTNMLYVSDEKKNMNWKQLPKKPCKNLLSTLKKLYPQLSSVHQKT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 EEEASLEFLLTDYEAVCG---RRARLEREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGA
.: .... .: :: . . ..:: :.: ::::::: .:::::..:::.:.:::. :
CCDS64 QEGSAID--MTPIEADFSWQKKMTQLEMEIQEAFLRFMASILKGYRTYLRPITEAPSNKA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 RDVDNLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKV
.:.:: :::::::.:. :.:. : .::.: .::::::: : . ..: :::.:.::.
CCDS64 TAADSLFDRQGFLKSRDRAYAKFYTLLSKTQIFIRFIEECSFVSDKDTGLAFFDDCIEKL
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KA0 HPEQ--EKP--------EPTPLVELEELSGSELTVFITPPEEPALPEGSESTPQYCYDGF
:.. :: : : :.::.. . :: :::: ::: : .:.. .:.: : :
CCDS64 FPDKGTEKTDKVDFDSAEDTRLIELDDSQKSEHTVFIMPPEPPP-DDGKDLSPKYSYKYF
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 PELRAELFESLQEQPGALPVPGPSRSAPSSPA--PRRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWA
:.: .::. :: . . : .:: .:::::.:.:...:.. . : ::
CCDS64 PRLDLKLFDRPQELKLCFSRHPTGNSITKSPPLMAKRTKQEIKTAHKLAKRCYTNPPQWA
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 RCLLGHCYGLWFLCLPAYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCS
.::..:::.:::.::::::: . .:.::. :: :: .:.. : :::::::.::::.
CCDS64 KCLFSHCYSLWFICLPAYVRVSHPKVRALQQAYDVLIKMRKTDVDPLDEVCYRVVMQLCG
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 HYGQPVLSVRVMLEMRQAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGA
.:.:::.:::..::. : : ::.::::::::.:::: :::.: .: . :.:.:::: :
CCDS64 LWGHPVLAVRVLFEMKTARIKPNAITYGYYNKVVLESPWPSSTRSGIFLWTKVRNVVRGL
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 AQFRQPLRERQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWA
:::::::.. :..: .. . :..: ....: ...:: .. . . .: : .:
CCDS64 AQFRQPLKKTVQRSQVSSISGGQSDQ-GYGSKDELIKDDAEIHVPEEQAARELITKTKMQ
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 GRSLRDPASPPGRLVKSGSLGSARGAQPTVEAGVAHMIEALGVLEPRGSPVPWHDGSLSD
. . : .. .. . . . :. ...... .. .. : : . ::.:.
CCDS64 TEEVCDASAIVAKHSQPSPEPHSPTEPPAWGSSIVKVPSGIFDVNSRKSST----GSISN
960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 LSLTGEEPLPGGSPGGSGSALSAQSTEALEGLSGRGPKAGGRQDEAGTPRRGLGARLQQL
. .. ..:.
CCDS64 VLFSTQDPVEDAVFGEATNLKKNGDRGEKRQKHFPERSCSFSSESRAGMLLKKSSLDSNS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
>--
initn: 839 init1: 358 opt: 580 Z-score: 367.7 bits: 81.1 E(32554): 3.7e-14
Smith-Waterman score: 731; 35.2% identity (55.1% similar) in 437 aa overlap (1145-1493:1480-1907)
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 LGSEWDLSESSLSNLSLRRSSERLSDTPGSFQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMA
.:. ..:.:.:::: :::: .:::::::::
CCDS64 GEVPFPRGMKGQDFEKSDHGSSQNTSMSSIYQNCAMEVLMSSCSQCRACGALVYDEEIMA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 GWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSVQTLDSRPSVP---SPKSAG---ASGS---KDAPV
::. :::::::.:::: :.:::... : : :. .:...: ::: . .
CCDS64 GWTADDSNLNTACPFCKSNFLPLLNIEFKDLRGSASFFLKPSTSGDSLQSGSIPLANESL
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1230 1240
pF1KA0 PGGPGPVLSDRRLCLALDEPQ---------------------------------------
: :.. : .: :.
CCDS64 EHKPVSSLAEPDLINFMDFPKHNQIITEETGSAVEPSDEIKRASGDVQTMKISSVPNSLS
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1250 1260
pF1KA0 -----LCNGH-MGGA------SRRVESG--------------------------AWAYLS
: .: .:: ..: : . :::
CCDS64 KRNVSLTRSHSVGGPLQNIDFTQRPFHGISTVSLPNSLQEVVDPLGKRPNPPPVSVPYLS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 PLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLLWYFQRLRLPSILPGLVLASCDGP
:::::::::::.::::..:. . . ::::::::.:::.:: ::: ::::.:.:
CCDS64 PLVLRKELESLLENEGDQVIHTSSFINQHPIIFWNLVWYFRRLDLPSNLPGLILTSEHCN
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 SHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLYVLWR-VHSQIPQRVVWPGPVPAS
: : :. : : ..:::: .. . :::: :: .:. . .. .:
CCDS64 EGVQLPLSSLSQDSKLVYIQLLWDNINLHQEPREPLYVSWRNFNSEKKSSLLSEEQQETS
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 LSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHLQRGIYREILFLTMAALGKDHVD
.:.:.. . . :.: : ..:: . . : :.. ::..:::::::....::....:
CCDS64 ---TLVETIRQSIQHNNVLKPINLLSQQMKP---GMKRQRSLYREILFLSLVSLGRENID
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 IVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAID-CRKCFGAPPEC
: :::..: :.:.:.: . . : .. . : ... ::::::::
CCDS64 IEAFDNEYGIAYNSLSSEILE---RLQKIDAPPSASVEWCRKCFGAPLI
1870 1880 1890 1900
>>CCDS83349.1 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9 (1958 aa)
initn: 3249 init1: 1029 opt: 2470 Z-score: 1541.0 bits: 298.2 E(32554): 1.6e-79
Smith-Waterman score: 3190; 52.7% identity (75.5% similar) in 915 aa overlap (1-899:1-906)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MAEERPPRLVDYFVVAGLAGNGAPIPEETWVPEPSGPLRPPRPAEPITDVAVIARALGEE
: :.. ::..::::::::. ... . .: . : ::::.:.: .. ::
CCDS83 MIEDKGPRVTDYFVVAGLTDTSTLLDQEI----NRLDTKSTGPKAPITDIAIIIKSAGET
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VPQGYTCIQASAGGHPLELSAGLLGGTQPVICYRRGRDKPPLVELGVLYEGKERPKPGFQ
::.::::..:. .. .:. : : . . .::.::::::::...::::::::: :: .
CCDS83 VPEGYTCVEATPSALQANLNYGSLKSPELFLCYKRGRDKPPLTDIGVLYEGKERLIPGCE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VLDTTPYSHSANLAPPGPGHPRTYLTYRRAAEGAGLHALGITDLCLVLPSKGEGTPHTYC
:. .:::.. ::. . : ..::::: ..:..::.:... :::: :::.:
CCDS83 VILATPYGRCANVNNSSTTSQRIFITYRRAPPVRPQNSLAVTDICVIVTSKGETPPHTFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KA0 RLPRNLNPGMWGPAVYLCYKVGLAKANTLVYEAELLGRYPEEDNEAFPLPES-VPVFCLP
.. .::: :::: .:.:::: .. .:...:.: :. :::::: :.::: :: ::.::::
CCDS83 KVDKNLNCGMWGSSVFLCYKKSVPASNAIAYKAGLIFRYPEEDYESFPLSESDVPLFCLP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 MGATIECWPAQTKYPVPVFSTFVLTGAAGDKVYGAALQFYEAFPRARLSERQARALGLLS
:::::::: .::::.::::::::::... ::::::.:::: . : :::.: ::::.
CCDS83 MGATIECWDPETKYPLPVFSTFVLTGSSAKKVYGAAIQFYEPYSRELLSEKQLMHLGLLT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 AVERGRALGGRAVRSRRAIAVLSRWPAFPAFRAFLTFLYRYSVSGPHRLPLEAHISHFIH
:: : . .... . . : .::.:: : ::: :: :.:. :::::: ::.: :::::..
CCDS83 PVE--RKMVSKSINTNKCICLLSHWPFFEAFRKFLMFIYKLSVSGPHPLPIEKHISHFMQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 NVPFPSPQRPRILVQMSPYDNLLLCQPVSSPLPLSGASFLQLLQSLGPELAITLLLAVLT
:.:::::::::::::.: .: :.: ::::.:::::::.: ::..:::: :::: ::
CCDS83 NIPFPSPQRPRILVQLSVHDALILSQPVSTPLPLSGANFSTLLMNLGPENCATLLLFVLL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 EHKLLVHSLRPDLLTSVCEALVSMIFPLHWQCPYIPLCPLVLADVLSAPVPFIVGIHSSY
: :.:.::::: .::.: ::.:.::::..::::::::::: :: :::::.:::::. : :
CCDS83 ESKILLHSLRPAVLTGVAEAVVAMIFPFQWQCPYIPLCPLSLAAVLSAPLPFIVGVDSRY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 FDLHDPPADVICVDLDTNTLFQTEEKKLLSPRTLPRRPYKVLLATLTNLYQQLDQTYTGP
::::::: ::.:.::::: :. ..::: .. . ::..: : ::.:: .:: ::....
CCDS83 FDLHDPPQDVVCIDLDTNMLYVSDEKKNMNWKQLPKKPCKNLLSTLKKLYPQLSSVHQKT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 EEEASLEFLLTDYEAVCG---RRARLEREVQGAFLRFMACLLKGYRVFLRPLTQAPSEGA
.: .... .: :: . . ..:: :.: ::::::: .:::::..:::.:.:::. :
CCDS83 QEGSAID--MTPIEADFSWQKKMTQLEMEIQEAFLRFMASILKGYRTYLRPITEAPSNKA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 RDVDNLFFLQGFLKSRERSSHKLYSQLLHTQMFSQFIEECSFGSARHAALEFFDSCVEKV
.:.:: :::::::.:. :.:. : .::.: .::::::: : . ..: :::.:.::.
CCDS83 TAADSLFDRQGFLKSRDRAYAKFYTLLSKTQIFIRFIEECSFVSDKDTGLAFFDDCIEKL
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KA0 HPEQ--EKP--------EPTPLVELEELSGSELTVFITPPEEPALPEGSESTPQYCYDGF
:.. :: : : :.::.. . :: :::: ::: : .:.. .:.: : :
CCDS83 FPDKGTEKTDKVDFDSAEDTRLIELDDSQKSEHTVFIMPPEPPP-DDGKDLSPKYSYKYF
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 PELRAELFESLQEQPGALPVPGPSRSAPSSPA--PRRTKQEMKVAQRMAQKSAAVPELWA
:.: .::. :: . . : .:: .:::::.:.:...:.. . : ::
CCDS83 PRLDLKLFDRPQELKLCFSRHPTGNSITKSPPLMAKRTKQEIKTAHKLAKRCYTNPPQWA
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 RCLLGHCYGLWFLCLPAYVRSAPSRVQALHTAYHVLRQMESGKVVLPDEVCYRVLMQLCS
.::..:::.:::.::::::: . .:.::. :: :: .:.. : :::::::.::::.
CCDS83 KCLFSHCYSLWFICLPAYVRVSHPKVRALQQAYDVLIKMRKTDVDPLDEVCYRVVMQLCG
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 HYGQPVLSVRVMLEMRQAGIVPNTITYGYYNKAVLESKWPSGTPGGRLRWAKLRNVVLGA
.:.:::.:::..::. : : ::.::::::::.:::: :::.: .: . :.:.:::: :
CCDS83 LWGHPVLAVRVLFEMKTARIKPNAITYGYYNKVVLESPWPSSTRSGIFLWTKVRNVVRGL
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 AQFRQPLRERQQQQQQQQQQQQQQQQEQVSAHQEAGSSQAEPYLERPSPTRPLQRQTTWA
:::::::.. :..:
CCDS83 AQFRQPLKKTVQRSQVSSISALQNVTGGSDGDTVSHGSVDSSNDANNGEHTVFVRDLIRL
900 910 920 930 940 950
>--
initn: 892 init1: 358 opt: 580 Z-score: 367.5 bits: 81.1 E(32554): 3.8e-14
Smith-Waterman score: 731; 35.2% identity (55.1% similar) in 437 aa overlap (1145-1493:1529-1956)
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 LGSEWDLSESSLSNLSLRRSSERLSDTPGSFQSPSLEILLSSCSLCRACDSLVYDEEIMA
.:. ..:.:.:::: :::: .:::::::::
CCDS83 GEVPFPRGMKGQDFEKSDHGSSQNTSMSSIYQNCAMEVLMSSCSQCRACGALVYDEEIMA
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 GWAPDDSNLNTTCPFCACPFVPLLSVQTLDSRPSVP---SPKSAG---ASGS---KDAPV
::. :::::::.:::: :.:::... : : :. .:...: ::: . .
CCDS83 GWTADDSNLNTACPFCKSNFLPLLNIEFKDLRGSASFFLKPSTSGDSLQSGSIPLANESL
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1230 1240
pF1KA0 PGGPGPVLSDRRLCLALDEPQ---------------------------------------
: :.. : .: :.
CCDS83 EHKPVSSLAEPDLINFMDFPKHNQIITEETGSAVEPSDEIKRASGDVQTMKISSVPNSLS
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1250 1260
pF1KA0 -----LCNGH-MGGA------SRRVESG--------------------------AWAYLS
: .: .:: ..: : . :::
CCDS83 KRNVSLTRSHSVGGPLQNIDFTQRPFHGISTVSLPNSLQEVVDPLGKRPNPPPVSVPYLS
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 PLVLRKELESLVENEGSEVLALPELPSAHPIIFWNLLWYFQRLRLPSILPGLVLASCDGP
:::::::::::.::::..:. . . ::::::::.:::.:: ::: ::::.:.:
CCDS83 PLVLRKELESLLENEGDQVIHTSSFINQHPIIFWNLVWYFRRLDLPSNLPGLILTSEHCN
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 SHSQAPSPWLTPDPASVQVRLLWDVLTPDPNSCPPLYVLWR-VHSQIPQRVVWPGPVPAS
: : :. : : ..:::: .. . :::: :: .:. . .. .:
CCDS83 EGVQLPLSSLSQDSKLVYIQLLWDNINLHQEPREPLYVSWRNFNSEKKSSLLSEEQQETS
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 LSLALLESVLRHVGLNEVHKAVGLLLETLGPPPTGLHLQRGIYREILFLTMAALGKDHVD
.:.:.. . . :.: : ..:: . . : :.. ::..:::::::....::....:
CCDS83 ---TLVETIRQSIQHNNVLKPINLLSQQMKP---GMKRQRSLYREILFLSLVSLGRENID
1860 1870 1880 1890 1900 1910
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 IVAFDKKYKSAFNKLASSMGKEELRHRRAQMPTPKAID-CRKCFGAPPEC
: :::..: :.:.:.: . . : .. . : ... ::::::::
CCDS83 IEAFDNEYGIAYNSLSSEILE---RLQKIDAPPSASVEWCRKCFGAPLI
1920 1930 1940 1950
1496 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 19:07:31 2016 done: Wed Nov 2 19:07:32 2016
Total Scan time: 6.320 Total Display time: 0.410
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]