Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0519
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0519, 919 aa
1>>>pF1KA0519 919 - 919 aa - 919 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4311+/-0.000923; mu= 16.1333+/- 0.056
mean_var=90.0474+/-18.036, 0's: 0 Z-trim(107.4): 19 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.135157
statistics sampled from 9566 (9582) to 9566 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 3.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6070.1 EXTL3 gene_id:2137|Hs108|chr8 ( 919) 6245 1228.3 0
CCDS7908.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 ( 718) 915 189.0 2.8e-47
CCDS53619.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 ( 728) 915 189.0 2.9e-47
CCDS53618.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 ( 751) 915 189.0 2.9e-47
CCDS6324.1 EXT1 gene_id:2131|Hs108|chr8 ( 746) 711 149.2 2.8e-35
CCDS271.1 EXTL1 gene_id:2134|Hs108|chr1 ( 676) 546 117.0 1.2e-25
CCDS775.1 EXTL2 gene_id:2135|Hs108|chr1 ( 330) 418 91.9 2.1e-18
>>CCDS6070.1 EXTL3 gene_id:2137|Hs108|chr8 (919 aa)
initn: 6245 init1: 6245 opt: 6245 Z-score: 6577.4 bits: 1228.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6245; 100.0% identity (100.0% similar) in 919 aa overlap (1-919:1-919)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTGYTMLRNGGAGNGGQTCMLRWSNRIRLTWLSFTLFVILVFFPLIAHYYLTTLDEADEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MTGYTMLRNGGAGNGGQTCMLRWSNRIRLTWLSFTLFVILVFFPLIAHYYLTTLDEADEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GKRIFGPRVGNELCEVKHVLDLCRIRESVSEELLQLEAKRQELNSEIAKLNLKIEACKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GKRIFGPRVGNELCEVKHVLDLCRIRESVSEELLQLEAKRQELNSEIAKLNLKIEACKKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 IENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSLPIRLLPEKDDAGLPPPKATRGCRLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSLPIRLLPEKDDAGLPPPKATRGCRLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 NCFDYSRCPLTSGFPVYVYDSDQFVFGSYLDPLVKQAFQATARANVYVTENADIACLYVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NCFDYSRCPLTSGFPVYVYDSDQFVFGSYLDPLVKQAFQATARANVYVTENADIACLYVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIINLSRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIINLSRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 STFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVKRKYLFTFQGEKIESLRSSLQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 STFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVKRKYLFTFQGEKIESLRSSLQEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 RSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWALCGERED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWALCGERED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALEVGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALEVGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 AALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLWETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLWETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 YRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 YRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 EQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPKLPSEDLLWPDIGVPIMVVRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPKLPSEDLLWPDIGVPIMVVRT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 EKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 PHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCPQALSHDDSHFHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCPQALSHDDSHFHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVD
850 860 870 880 890 900
910
pF1KA0 SVLFKTRLPHDKTKCFKFI
:::::::::::::::::::
CCDS60 SVLFKTRLPHDKTKCFKFI
910
>>CCDS7908.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 (718 aa)
initn: 1126 init1: 496 opt: 915 Z-score: 962.2 bits: 189.0 E(32554): 2.8e-47
Smith-Waterman score: 1218; 32.9% identity (57.2% similar) in 794 aa overlap (140-916:48-712)
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 LNLKIEACKKSIENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSL---PIRLLPEKDDA
:: . : : :. :. :: :.
CCDS79 MKTKHRIYYITLFSIVLLGLIATGMFQFWPHSIESSNDWNVEKRSIRDVPVVRLPA--DS
20 30 40 50 60 70
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 GLPPPKATRGCRLHNCFDYSRCPLT--SGFPVYVYDSDQFV--FGSYLDPLVKQAFQATA
.: .. .::.:.::: :: .. . . ::.: ..: :: .. ... ..
CCDS79 PIPE-RGDLSCRMHTCFDVYRCGFNPKNKIKVYIYALKKYVDDFGVSVSNTISREYNELL
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270
pF1KA0 RA---NVYVTENADIACLYVILVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIIN-L
: . : :.. . :::.: . ... . :: : . . .: .: : ::...: :
CCDS79 MAISDSDYYTDDINRACLFVPSIDVLNQNT-LRIKETAQAMAQLSRW-DRGTNHLLFNML
140 150 160 170 180 190
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 SRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQSTFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVK
: .: ::..: . : : :: :.:. . :. .: ...: . :
CCDS79 PGGPPDYNTALDVPRDRALLAGGGFSTWTYRQGYDVSI-PVYSPLSAE--VDLPEKGPGP
200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 RKYLFTFQGEKIESLRSSLQEARSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEF
:.:.. : :.. : : .: :.:.: .. ..:::
CCDS79 RQYFL---------LSSQV-----------GLHPEYRED-----LEALQVKHGESVLVLD
250 260 270 280
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TCKNQPKPSLPTEWALCGERE--DRLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALE
: : . : .. : ... : ..:. .:: ... :: : :. : ..:.
CCDS79 KCTNLSEGVLSVR-KRCHKHQVFDYPQVLQEATFCVVLR--GARL----GQAV-LSDVLQ
290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNEAALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLW
.: ::::.... ::....:.:..:..:::. ....:. .:.:. . .. :.::.:..:
CCDS79 AGCVPVVIADSYILPFSEVLDWKRASVVVPEEKMSDVYSILQSIPQRQIEEMQRQARWFW
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQIPAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLG
:.::.. .: ..: .: :: : : : :
CCDS79 EAYFQSIKAIALATLQIINDRIY-PYAAISYEEW--------------------------
400 410 420
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 PVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDFYRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGF
..:: .. :. . .:. : :..:
CCDS79 ---NDPPAVK-----------------WGSVSNPLFL-------PLIP------------
430 440 450
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPREQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVW
: . : ::...:::.: : :. . ... .: :.:..:::
CCDS79 -PQSQG--------------------FTAIVLTYDRVESLFRVITEVSKVPSLSKLLVVW
460 470 480
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 NSP-KLPSEDLLWPDIGVPIMVVRTEKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDA-HLRHDEI
:. : : :: ::: : ::. :::: .:.:.:::.:..::::::.:.:::: : ::.
CCDS79 NNQNKNPPEDSLWPKIRVPLKVVRTAENKLSNRFFPYDEIETEAVLAIDDDIIMLTSDEL
490 500 510 520 530 540
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 MFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDIPHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYS
.::..:::: ::.::.::: : :: ..: :.:... :.:::::::::.:::. :::.
CCDS79 QFGYEVWREFPDRLVGYPGRLHLWDHEMNKWKYESEWTNEVSMVLTGAAFYHKYFNYLYT
550 560 570 580 590 600
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 YVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLVSHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCP--QALSHDDSH
: :: :.. :: ..:::::::::::...: : :::: : :.:: : ..:: :..:
CCDS79 YKMPGDIKNWVDAHMNCEDIAMNFLVANVTGKAVIKVTPRKKFKCPECTAIDGLSLDQTH
610 620 630 640 650 660
880 890 900 910
pF1KA0 FHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVDSVLFKTRLPHDKTKCFKFI
. :: .::: :..:.: ::: .. :.: ::.: .: .: : :
CCDS79 MVERSECINKFASVFGTMPLKVVEHRADPVLYKDDFP-EKLKSFPNIGSL
670 680 690 700 710
>>CCDS53619.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 (728 aa)
initn: 1052 init1: 496 opt: 915 Z-score: 962.1 bits: 189.0 E(32554): 2.9e-47
Smith-Waterman score: 1158; 32.2% identity (56.9% similar) in 794 aa overlap (140-916:48-722)
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 LNLKIEACKKSIENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSL---PIRLLPEKDDA
:: . : : :. :. :: :.
CCDS53 MKTKHRIYYITLFSIVLLGLIATGMFQFWPHSIESSNDWNVEKRSIRDVPVVRLPA--DS
20 30 40 50 60 70
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 GLPPPKATRGCRLHNCFDYSRCPLT--SGFPVYVYDSDQFV--FGSYLDPLVKQAFQATA
.: .. .::.:.::: :: .. . . ::.: ..: :: .. ... ..
CCDS53 PIPE-RGDLSCRMHTCFDVYRCGFNPKNKIKVYIYALKKYVDDFGVSVSNTISREYNELL
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270
pF1KA0 RA---NVYVTENADIACLYVILVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIIN-L
: . : :.. . :::.: . ... . :: : . . .: .: : ::...: :
CCDS53 MAISDSDYYTDDINRACLFVPSIDVLNQNT-LRIKETAQAMAQLSRW-DRGTNHLLFNML
140 150 160 170 180 190
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 SRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQSTFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVK
: .: ::..: . : : :: :.:. . :. .: ...: . :
CCDS53 PGGPPDYNTALDVPRDRALLAGGGFSTWTYRQGYDVSI-PVYSPLSAE--VDLPEKGPGP
200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 RKYLFTFQGEKIESLRSSLQEARSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEF
:.:.. : :.. : : .: :.:.: .. ..:::
CCDS53 RQYFL---------LSSQV-----------GLHPEYRED-----LEALQVKHGESVLVLD
250 260 270 280
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TCKNQPKPSLPTEWALCGERE--DRLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALE
: : . : .. : ... : ..:. .:: ... :: : :. : ..:.
CCDS53 KCTNLSEGVLSVR-KRCHKHQVFDYPQVLQEATFCVVLR--GARL----GQAV-LSDVLQ
290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNEAALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLW
.: ::::.... ::....:.:..:..:::. ....:. .:.:. . .. :.:: :.
CCDS53 AGCVPVVIADSYILPFSEVLDWKRASVVVPEEKMSDVYSILQSIPQRQIEEMQRQ-LFME
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQIPAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLG
. . .. . . ..: : : . : .. :. :: . . :
CCDS53 PARRENWSAANHQMNSLIWPREQWDSQIINDRI---YPY----AAISYEEWND-------
400 410 420 430 440
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 PVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDFYRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGF
:: .. :. . .:. : :..:
CCDS53 -----PPAVK-----------------WGSVSNPLFL-------PLIP------------
450 460
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPREQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVW
: . : ::...:::.: : :. . ... .: :.:..:::
CCDS53 -PQSQG--------------------FTAIVLTYDRVESLFRVITEVSKVPSLSKLLVVW
470 480 490
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 NSP-KLPSEDLLWPDIGVPIMVVRTEKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDA-HLRHDEI
:. : : :: ::: : ::. :::: .:.:.:::.:..::::::.:.:::: : ::.
CCDS53 NNQNKNPPEDSLWPKIRVPLKVVRTAENKLSNRFFPYDEIETEAVLAIDDDIIMLTSDEL
500 510 520 530 540 550
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 MFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDIPHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYS
.::..:::: ::.::.::: : :: ..: :.:... :.:::::::::.:::. :::.
CCDS53 QFGYEVWREFPDRLVGYPGRLHLWDHEMNKWKYESEWTNEVSMVLTGAAFYHKYFNYLYT
560 570 580 590 600 610
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 YVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLVSHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCP--QALSHDDSH
: :: :.. :: ..:::::::::::...: : :::: : :.:: : ..:: :..:
CCDS53 YKMPGDIKNWVDAHMNCEDIAMNFLVANVTGKAVIKVTPRKKFKCPECTAIDGLSLDQTH
620 630 640 650 660 670
880 890 900 910
pF1KA0 FHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVDSVLFKTRLPHDKTKCFKFI
. :: .::: :..:.: ::: .. :.: ::.: .: .: : :
CCDS53 MVERSECINKFASVFGTMPLKVVEHRADPVLYKDDFP-EKLKSFPNIGSL
680 690 700 710 720
>>CCDS53618.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 (751 aa)
initn: 1126 init1: 496 opt: 915 Z-score: 961.9 bits: 189.0 E(32554): 2.9e-47
Smith-Waterman score: 1218; 32.9% identity (57.2% similar) in 794 aa overlap (140-916:81-745)
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 LNLKIEACKKSIENAKQDLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSL---PIRLLPEKDDA
:: . : : :. :. :: :.
CCDS53 MKTKHRIYYITLFSIVLLGLIATGMFQFWPHSIESSNDWNVEKRSIRDVPVVRLPA--DS
60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 GLPPPKATRGCRLHNCFDYSRCPLT--SGFPVYVYDSDQFV--FGSYLDPLVKQAFQATA
.: .. .::.:.::: :: .. . . ::.: ..: :: .. ... ..
CCDS53 PIPE-RGDLSCRMHTCFDVYRCGFNPKNKIKVYIYALKKYVDDFGVSVSNTISREYNELL
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270
pF1KA0 RA---NVYVTENADIACLYVILVGEMQEPVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIIN-L
: . : :.. . :::.: . ... . :: : . . .: .: : ::...: :
CCDS53 MAISDSDYYTDDINRACLFVPSIDVLNQNT-LRIKETAQAMAQLSRW-DRGTNHLLFNML
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 SRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQSTFYTVQYRPGFDLVVSPLVHAMSEPNFMEIPPQVPVK
: .: ::..: . : : :: :.:. . :. .: ...: . :
CCDS53 PGGPPDYNTALDVPRDRALLAGGGFSTWTYRQGYDVSI-PVYSPLSAE--VDLPEKGPGP
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 RKYLFTFQGEKIESLRSSLQEARSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEF
:.:.. : :.. : : .: :.:.: .. ..:::
CCDS53 RQYFL---------LSSQV-----------GLHPEYRED-----LEALQVKHGESVLVLD
290 300 310
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 TCKNQPKPSLPTEWALCGERE--DRLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALE
: : . : .. : ... : ..:. .:: ... :: : :. : ..:.
CCDS53 KCTNLSEGVLSVR-KRCHKHQVFDYPQVLQEATFCVVLR--GARL----GQAV-LSDVLQ
320 330 340 350 360
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNEAALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLW
.: ::::.... ::....:.:..:..:::. ....:. .:.:. . .. :.::.:..:
CCDS53 AGCVPVVIADSYILPFSEVLDWKRASVVVPEEKMSDVYSILQSIPQRQIEEMQRQARWFW
370 380 390 400 410 420
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 ETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQIPAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLG
:.::.. .: ..: .: :: : : : :
CCDS53 EAYFQSIKAIALATLQIINDRIY-PYAAISYEEW--------------------------
430 440 450 460
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 PVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDFYRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGF
..:: .. :. . .:. : :..:
CCDS53 ---NDPPAVK-----------------WGSVSNPLFL-------PLIP------------
470 480
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPREQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVW
: . : ::...:::.: : :. . ... .: :.:..:::
CCDS53 -PQSQG--------------------FTAIVLTYDRVESLFRVITEVSKVPSLSKLLVVW
490 500 510 520
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 NSP-KLPSEDLLWPDIGVPIMVVRTEKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDA-HLRHDEI
:. : : :: ::: : ::. :::: .:.:.:::.:..::::::.:.:::: : ::.
CCDS53 NNQNKNPPEDSLWPKIRVPLKVVRTAENKLSNRFFPYDEIETEAVLAIDDDIIMLTSDEL
530 540 550 560 570 580
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 MFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDIPHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYS
.::..:::: ::.::.::: : :: ..: :.:... :.:::::::::.:::. :::.
CCDS53 QFGYEVWREFPDRLVGYPGRLHLWDHEMNKWKYESEWTNEVSMVLTGAAFYHKYFNYLYT
590 600 610 620 630 640
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 YVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLVSHITRKPPIKVTSRWTFRCPGCP--QALSHDDSH
: :: :.. :: ..:::::::::::...: : :::: : :.:: : ..:: :..:
CCDS53 YKMPGDIKNWVDAHMNCEDIAMNFLVANVTGKAVIKVTPRKKFKCPECTAIDGLSLDQTH
650 660 670 680 690 700
880 890 900 910
pF1KA0 FHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVDSVLFKTRLPHDKTKCFKFI
. :: .::: :..:.: ::: .. :.: ::.: .: .: : :
CCDS53 MVERSECINKFASVFGTMPLKVVEHRADPVLYKDDFP-EKLKSFPNIGSL
710 720 730 740 750
>>CCDS6324.1 EXT1 gene_id:2131|Hs108|chr8 (746 aa)
initn: 1068 init1: 554 opt: 711 Z-score: 747.0 bits: 149.2 E(32554): 2.8e-35
Smith-Waterman score: 1047; 31.2% identity (59.5% similar) in 775 aa overlap (157-908:78-733)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 DLLQLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSLPIRLLP-EKDDAGLPPPKATRGCRLHNCFDY
... : .: ::. :. . ::...:::.
CCDS63 HPSPDHFWPRFPDALRPFVPWDQLENEDSSVHISPRQKRDANSSIYKGKK-CRMESCFDF
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 SRCPLTSGFPVYVYDSDQFVFGSYLDPLVKQAFQATARANVYVTENADIACLYVILVGEM
. : .:: :::: ... : . : . :. ... . : . . :::.:. . .
CCDS63 TLCK-KNGFKVYVYPQQK---GEKIAESY-QNILAAIEGSRFYTSDPSQACLFVLSLDTL
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290
pF1KA0 QEPVVLRPA---ELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIINLSRKS--D-TQNLLYNVSTGRAMVA
.. : : .:.... :: : ..:.::.:.:: . : :... ... :.::.:
CCDS63 DRDQ-LSPQYVHNLRSKVQSLHLW-NNGRNHLIFNLYSGTWPDYTEDVGFDI--GQAMLA
170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 QSTFYTVQYRPGFDLVVSPLV---HAMS--EPNFMEIPPQVPVKRKYLFTFQGEK-IESL
.... : ..::.::. . :: : . : .:... .: :::...:.:.. . ..
CCDS63 KASISTENFRPNFDVSI-PLFSKDHPRTGGERGFLKFNT-IPPLRKYMLVFKGKRYLTGI
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 RSSLQEARSFEEEMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWA
:. ..: . . .:. : ...: : .: . . . : . ::.
CCDS63 GSDTRNA--LYHVHNGE-----DVVLLTTCKHGKDWQKHK---DSRCDRDN-----TEY-
280 290 300 310
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 LCGEREDRLELLKLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALEVGAVPVVLGEQVQLPYQ
:. : :.:. .:: :. : :: : . :..:::... :::.:.. .::..
CCDS63 ---EKYDYREMLHNATFCLV--PRGRRL----G-SFRFLEALQAACVPVMLSNGWELPFS
320 330 340 350 360
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 DMLQWNEAALVVPKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLWETYFSTADSIFNTVLAM
....::.::.. . . .. .::. .. .::.:.: .::::.:::....: :.: .
CCDS63 EVINWNQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFLWEAYFSSVEKIVLTTLEI
370 380 390 400 410 420
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 IRTRIQIPAAPIREEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPRYLRNF
:. :: . : : ::
CCDS63 IQDRI--------------FKHIS---------------------------------RNS
430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 TLTVTDFYRSWNCAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAA
. :: :: :: :::. ...::. : : . :
CCDS63 LI--------WNKHPG--GLF-------VLPQYSSYLGD---F-PY----------YYAN
450 460 470
660 670 680 690 700
pF1KA0 LGGNVPREQFTVVM-----LTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPK-LPSEDLL
:: . : .::.:. :. . . :: . : : ...:.:: : ::..
CCDS63 LGLK-PPSKFTAVIHAVTPLVSQSQPVL-KLLVAAAKSQYCAQIIVLWNCDKPLPAKHR-
480 490 500 510 520
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 WPDIGVPIMVVRTEKNSLNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDR
:: .::..:.. :.. ...::::...: :.:.::.:.:. : :. :.: ::. .:
CCDS63 WPATAVPVVVIEGESKVMSSRFLPYDNIITDAVLSLDEDTVLSTTEVDFAFTVWQSFPER
530 540 550 560 570 580
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 IVGFPGRYHAWDIPHQSWLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDE
:::.:.: : :: .. : :.:... . ::::::::..:::: ::::. .: ....:::.
CCDS63 IVGYPARSHFWDNSKERWGYTSKWTNDYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQ
590 600 610 620 630 640
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 YINCEDIAMNFLVSHITRKPPIKVTSRWTFRCP--GCPQALSH--DDSHFHERHKCINFF
::::: :::::: .:. ::::::.. .. : . :. : .:: .:..:.: :
CCDS63 LANCEDILMNFLVSAVTKLPPIKVTQKKQYKETMMGQTSRASRWADPDHFAQRQSCMNTF
650 660 670 680 690 700
890 900 910
pF1KA0 VKVYGYMPLLYTQFRVDSVLFKTRLPHDKTKCFKFI
.. .:::::...:.:.: :::: ..
CCDS63 ASWFGYMPLIHSQMRLDPVLFKDQVSILRKKYRDIERL
710 720 730 740
>>CCDS271.1 EXTL1 gene_id:2134|Hs108|chr1 (676 aa)
initn: 795 init1: 401 opt: 546 Z-score: 573.8 bits: 117.0 E(32554): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 756; 26.3% identity (52.3% similar) in 753 aa overlap (160-905:64-660)
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QLKNVISQTEHSYKELMAQNQPKLSLPIRLLPEKDDAGLPPPKATRG--CRLHNCFDYSR
::: :: . ::.: .: : ..::: :.
CCDS27 LPPRPRPGASQGWPRWLDAELLQSFSQPGELPE--DA-VSPPQAPHGGSCNWESCFDTSK
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 CPLTSGFPVYVYDSDQFVFGSYLDPLVKQAFQATARANVYVTENADIACLYVILVGEMQE
: .:. :.:: . :. . ... . :. ... . : . ::: ..: . :
CCDS27 CR-GDGLKVFVYPA----VGTISE--THRRILASIEGSRFYTFSPAGACLLLLLSLDAQT
100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 PVVLRPAELEKQLYSLPHWRTDGHNHVIINLSRKSDTQNLLYNVSTGRAMVAQSTFYTVQ
. :.: . :.::... : ... . :.::::... . .
CCDS27 G----------ECSSMPLQWNRGRNHLVLRLHPAPCPRTF----QLGQAMVAEASPTVDS
150 160 170 180
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 YRPGFDLVVS--PLVHAMSEPNFMEIPPQVPVKRKYLFTFQGEKIESLRSSLQEARSFEE
.:::::... : .: . .. . : :.... : :.. . : .
CCDS27 FRPGFDVALPFLPEAHPLRGGAPGQLRQHSPQPGVALLALEEE-----RGGWRTADT---
190 200 210 220 230 240
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 EMEGDPPADYDDRIIATLKAVQDSKLDQVLVEFTCKNQPKPSLPTEWALCGEREDRLELL
:. .: : :...: : :. . : : :
CCDS27 ---GSSACPWDGR---------------------CEQDPGP---------GQTQ-RQETL
250 260
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KLSTFALIITPGDPRLVISSGCATRLFEALEVGAVPVVLGEQVQLPYQDMLQWNEAALVV
.:: :: . :. :.:...::..: .::.:. . .::......:..::.:.
CCDS27 PNATFCLI-SGHRPE------AASRFLQALQAGCIPVLLSPRWELPFSEVIDWTKAAIVA
270 280 290 300 310 320
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 PKPRVTEVHFLLRSLSDSDLLAMRRQGRFLWETYFSTADSIFNTVLAMIRTRIQIPAAPI
. .: :. .: . .::.:.: .:::..:::.......:.: .:. ::
CCDS27 DERLPLQVLAALQEMSPARVLALRQQTQFLWDAYFSSVEKVIHTTLEVIQDRI-------
330 340 350 360 370
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 REEAAAEIPHRSGKAAGTDPNMADNGDLDLGPVETEPPYASPRYLRNFTLTVTDFYRSWN
::. : : : ::
CCDS27 ---------------FGTS--------------------AHPSLL-------------WN
380
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 CAPGPFHLFPHTPFDPVLPSEAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPREQFTV
:: :. . :. :.. : : :: : .:..
CCDS27 SPPGA--LLALSTFSTS-PQDFPFYYLQQGSRPEG---------------------RFSA
390 400 410 420
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 VMLTYEREEVLMNSLERLNGLPYLNKVVVVWNSPK-LPSEDLLWPDIGVPIMVVRTEKNS
.. . . .. .. . : . ...:.:.. . :::. ::. .::. :. ...
CCDS27 LIWVGPPGQPPLKLIQAVAGSQHCAQILVLWSNERPLPSR---WPETAVPLTVIDGHRK-
430 440 450 460 470
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LNNRFLPWNEIETEAILSIDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDIPHQS
...:: :.. :.:.::::.: . : .:. :.: ::. .:.::: : :: : .
CCDS27 VSDRFYPYSTIRTDAILSLDARSSLSTSEVDFAFLVWQSFPERMVGFLTSSHFWDEAHGG
480 490 500 510 520 530
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 WLYNSNYSCELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLVSHIT
: :... . :.::::: :::.:.:: :... .:.:.: ..:: .: :. :::.:. .:
CCDS27 WGYTAERTNEFSMVLTTAAFYHRYYHTLFTHSLPKALRTLADEAPTCVDVLMNFIVAAVT
540 550 560 570 580 590
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 RKPPIKVT--SRWTFRCPGCPQALSHDDSHFHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVDSV
. ::::: .. : : . . . ::: .. ..:.:::: ...:.: :
CCDS27 KLPPIKVPYGKQRQEAAPLAPGGPGPRPKPPAPAPDCINQIAAAFGHMPLLSSRLRLDPV
600 610 620 630 640 650
910
pF1KA0 LFKTRLPHDKTKCFKFI
:::
CCDS27 LFKDPVSVQRKKYRSLEKP
660 670
>>CCDS775.1 EXTL2 gene_id:2135|Hs108|chr1 (330 aa)
initn: 428 init1: 143 opt: 418 Z-score: 443.7 bits: 91.9 E(32554): 2.1e-18
Smith-Waterman score: 472; 31.7% identity (61.9% similar) in 268 aa overlap (656-904:59-321)
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 EAKFLGSGTGFRPIGGGAGGSGKEFQAALGGNVPREQFTVVMLTYEREEVLMNSLERLNG
:. ..::..: ::.: ..:.. :.. ..
CCDS77 LLLVAGALTALLPSVKEDKMLMLRREIKSQGKSTMDSFTLIMQTYNRTDLLLKLLNHYQA
30 40 50 60 70 80
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 LPYLNKVVVVWNSPKLPSEDLLWPDIG---VPIMVVRTEKNSLNNRFLPWNEIETEAILS
.: :.::.::::. . : :: ..: .:.. . : . ::. . :.::.:.:
CCDS77 VPNLHKVIVVWNNIGEKAPDELWNSLGPHPIPVIFKQQTANRMRNRLQVFPELETNAVLM
90 100 110 120 130 140
750 760 770 780 790
pF1KA0 IDDDAHLRHDEIMFGFRVWREARDRIVGFPGRYHAWDIPHQSWLYN----------SNYS
.:::. . ...:.: ::.. :.:::: : : . .: .:. :. .
CCDS77 VDDDTLISTPDLVFAFSVWQQFPDQIVGFVPRKH---VSTSSGIYSYGSFEMQAPGSGNG
150 160 170 180 190 200
800 810 820 830 840
pF1KA0 CELSMVLTGAAFFHKYYAYLYSYVMPQAIRDMVDEYINCEDIAMNFLVS-HITRKP----
. :::: ::.::.. : :.. .: :.. ..:. ::.::::::... :: .
CCDS77 DQYSMVLIGASFFNSKYLELFQR-QPAAVHALIDDTQNCDDIAMNFIIAKHIGKTSGIFV
210 220 230 240 250 260
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 -PIKVTSRWTFRCPGCPQALSHDDSHFHERHKCINFFVKVYGYMPLLYTQFRVDSVLFKT
:... . : ... : : .: ::: .:..: ::: :... ... :
CCDS77 KPVNMDNLEKETNSGY-SGMWHRAEHALQRSYCINKLVNIYDSMPLRYSNIMISQFGFPY
270 280 290 300 310 320
910
pF1KA0 RLPHDKTKCFKFI
CCDS77 ANYKRKI
330
919 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 19:10:55 2016 done: Wed Nov 2 19:10:56 2016
Total Scan time: 3.980 Total Display time: 0.170
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]