Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0521
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0521, 1015 aa
1>>>pF1KA0521 1015 - 1015 aa - 1015 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6250+/-0.00108; mu= -3.9597+/- 0.065
mean_var=422.9841+/-86.657, 0's: 0 Z-trim(115.0): 59 B-trim: 14 in 1/55
Lambda= 0.062361
statistics sampled from 15466 (15520) to 15466 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.764), E-opt: 0.2 (0.477), width: 16
Scan time: 5.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12177.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1015) 6632 611.7 2.5e-174
CCDS45946.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1173) 6632 611.7 2.8e-174
CCDS58957.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1392) 1881 184.3 1.5e-45
CCDS54870.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1705) 1881 184.4 1.7e-45
CCDS47231.2 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1731) 1881 184.4 1.7e-45
CCDS73778.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (1434) 1768 174.2 1.7e-42
CCDS32319.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2813) 1768 174.5 2.8e-42
CCDS32320.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2817) 1768 174.5 2.8e-42
CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 958) 1448 145.2 6e-34
CCDS53375.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 985) 1448 145.3 6.1e-34
CCDS53376.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 986) 1438 144.4 1.1e-33
CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 879) 609 69.7 3e-11
CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 912) 609 69.7 3.1e-11
CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 927) 609 69.7 3.1e-11
>>CCDS12177.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1015 aa)
initn: 6632 init1: 6632 opt: 6632 Z-score: 3243.2 bits: 611.7 E(32554): 2.5e-174
Smith-Waterman score: 6632; 99.8% identity (100.0% similar) in 1015 aa overlap (1-1015:1-1015)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPITGEMDEADSAFLKFKQTADDSLSLTSPNTESIFVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPITGEMDEADSAFLKFKQTADDSLSLTSPNTESIFVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 DPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVKRQDVLYELMQTEVHHVRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVKRQDVLYELMQTEVHHVRTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLARLKERRQESLEEGSDRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLARLKERRQESLEEGSDRNYV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 IQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLLLQQNKKFQNLIKKIGNFSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLLLQQNKKFQNLIKKIGNFSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDLTQALNLIKDIISQVDAKVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDLTQALNLIKDIISQVDAKVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 ECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDMLQRQLHLEGMLCWKTTSGRLKDILAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDMLQRQLHLEGMLCWKTTSGRLKDILAI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVANEEKAMFLISASLQGPEMYEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVANEEKAMFLISASLQGPEMYEI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 YTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPFSLPEEERKVVEARATRLRDFQERLSMKDQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPFSLPEEERKVVEARATRLRDFQERLSMKDQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 IAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLPQPRGLFRGGDPSETLQGELILKSAMSEIEGIQSLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLPQPRGLFRGGDPSETLQGELILKSAMSEIEGIQSLI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 CRRLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGYDCTNSPTKNGSFKKKVSSTDPRPRDWRGPP
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CRQLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGYDCTNSPTKNGSFKKKVSSTDPRPRDWRGPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 NSPDLKLSDSDIPGSSEESPQVVEAPGTESDPRLPTVLESELVQRIQTLSQLLLNLQAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NSPDLKLSDSDIPGSSEESPQVVEAPGTESDPRLPTVLESELVQRIQTLSQLLLNLQAVI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 AHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQSTRGNLLLEQERQRNFEKQREERAALEKLQSQLRHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQSTRGNLLLEQERQRNFEKQREERAALEKLQSQLRHE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 QQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQLRERLEQERAELERQRQAYQHDLERLREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQLRERLEQERAELERQRQAYQHDLERLREA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QRAVERERERLELLRRLKKQNTAPGALPPDTLAEAQPPSHPPSFNGEGLEGPRVSMLPSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QRAVERERERLELLRRLKKQNTAPGALPPDTLAEAQPPSHPPSFNGEGLEGPRVSMLPSG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 VGPEYAERPEVARRDSAPTESRLAKSDVPIQLLSATNQFQRQAAVQQQIPTKLAASTKGG
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VGPEYAERPEVARRDSAPTENRLAKSDVPIQLLSATNQFQRQAAVQQQIPTKLAASTKGG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 KDKGGKSRGSQRWESSASFDLKQQLLLNKLMGKDESTSRNRRSLSPILPGRHSPAPPPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KDKGGKSRGSQRWESSASFDLKQQLLLNKLMGKDESTSRNRRSLSPILPGRHSPAPPPDP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KA0 GFPAPSPPPADSPSEGFSLKAGGTALLPGPPAPSPLPATPLSAKEDASKEDVIFF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GFPAPSPPPADSPSEGFSLKAGGTALLPGPPAPSPLPATPLSAKEDASKEDVIFF
970 980 990 1000 1010
>>CCDS45946.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1173 aa)
initn: 6632 init1: 6632 opt: 6632 Z-score: 3242.4 bits: 611.7 E(32554): 2.8e-174
Smith-Waterman score: 6632; 99.8% identity (100.0% similar) in 1015 aa overlap (1-1015:159-1173)
10 20 30
pF1KA0 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPITGEMD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VLASVTASLKEHPRGTLLSDGSPALSRNVGMTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPITGEMD
130 140 150 160 170 180
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 EADSAFLKFKQTADDSLSLTSPNTESIFVEDPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EADSAFLKFKQTADDSLSLTSPNTESIFVEDPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAA
190 200 210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 YAKKQKREVVKRQDVLYELMQTEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YAKKQKREVVKRQDVLYELMQTEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCAD
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 DLLETHSHFLARLKERRQESLEEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DLLETHSHFLARLKERRQESLEEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSG
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 HNEAVSHYKLLLQQNKKFQNLIKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HNEAVSHYKLLLQQNKKFQNLIKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQN
370 380 390 400 410 420
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 TEAGTEDYEDLTQALNLIKDIISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TEAGTEDYEDLTQALNLIKDIISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFR
430 440 450 460 470 480
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 KEDMLQRQLHLEGMLCWKTTSGRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KEDMLQRQLHLEGMLCWKTTSGRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISL
490 500 510 520 530 540
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 QKLIVREVANEEKAMFLISASLQGPEMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QKLIVREVANEEKAMFLISASLQGPEMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPF
550 560 570 580 590 600
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 SLPEEERKVVEARATRLRDFQERLSMKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLPQPRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLPEEERKVVEARATRLRDFQERLSMKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLPQPRGL
610 620 630 640 650 660
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 FRGGDPSETLQGELILKSAMSEIEGIQSLICRRLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGY
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FRGGDPSETLQGELILKSAMSEIEGIQSLICRQLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGY
670 680 690 700 710 720
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 DCTNSPTKNGSFKKKVSSTDPRPRDWRGPPNSPDLKLSDSDIPGSSEESPQVVEAPGTES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DCTNSPTKNGSFKKKVSSTDPRPRDWRGPPNSPDLKLSDSDIPGSSEESPQVVEAPGTES
730 740 750 760 770 780
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 DPRLPTVLESELVQRIQTLSQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQSTRGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DPRLPTVLESELVQRIQTLSQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQSTRGNL
790 800 810 820 830 840
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 LLEQERQRNFEKQREERAALEKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLEQERQRNFEKQREERAALEKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEAR
850 860 870 880 890 900
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 QLRERLEQERAELERQRQAYQHDLERLREAQRAVERERERLELLRRLKKQNTAPGALPPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QLRERLEQERAELERQRQAYQHDLERLREAQRAVERERERLELLRRLKKQNTAPGALPPD
910 920 930 940 950 960
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 TLAEAQPPSHPPSFNGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTESRLAKSDVPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS45 TLAEAQPPSHPPSFNGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTENRLAKSDVPI
970 980 990 1000 1010 1020
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 QLLSATNQFQRQAAVQQQIPTKLAASTKGGKDKGGKSRGSQRWESSASFDLKQQLLLNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QLLSATNQFQRQAAVQQQIPTKLAASTKGGKDKGGKSRGSQRWESSASFDLKQQLLLNKL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 MGKDESTSRNRRSLSPILPGRHSPAPPPDPGFPAPSPPPADSPSEGFSLKAGGTALLPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MGKDESTSRNRRSLSPILPGRHSPAPPPDPGFPAPSPPPADSPSEGFSLKAGGTALLPGP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1000 1010
pF1KA0 PAPSPLPATPLSAKEDASKEDVIFF
:::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PAPSPLPATPLSAKEDASKEDVIFF
1150 1160 1170
>>CCDS58957.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1392 aa)
initn: 1360 init1: 996 opt: 1881 Z-score: 931.4 bits: 184.3 E(32554): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 2152; 46.9% identity (73.5% similar) in 811 aa overlap (18-809:447-1232)
10 20 30 40
pF1KA0 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPI----TGEMDEADSAFLKFKQTA
::: : . :. .:.: . .. .
CCDS58 SLHPSSSVPVGLPTGRRETVGQVHPLSRSVPGTTLESFRRSATSLESESDHNSCRSRSHS
420 430 440 450 460 470
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 DDSL-SL-TSPNTESIFVEDPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVK
:. : :. .::.:::...:: .:: :.. ::..:::::::::.:: .. ..:...:.:
CCDS58 DELLQSMGSSPSTESFIMEDVVDSSLWSDLSSDAQEFEAESWSLVVDPSFCNRQEKDVIK
480 490 500 510 520 530
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 RQDVLYELMQTEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLA
::::..::::::.::..:: :: ... ....::::.. ... ..::: :.::: : ::.
CCDS58 RQDVIFELMQTEMHHIQTLFIMSEIFRKGMKEELQLDHSTVDKIFPCLDELLEIHRHFFY
540 550 560 570 580 590
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 RLKERRQESLEEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLL
.::::::: :::::.::..:::.:::::: ::. .::. :: :: :.:::. .: :
CCDS58 SMKERRQESCA-GSDRNFVIDRIGDILVQQFSEENASKMKKIYGEFCCHHKEAVNLFKEL
600 610 620 630 640 650
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 LQQNKKFQNLIKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDL
::::::::.:: .. ..:: :. ::::::::::::::::::::.: :. ::...::
CCDS58 -QQNKKFQNFIKLRNSNLLARRRGIPECILLVTQRITKYPVLVERILQYTKERTEEHKDL
660 670 680 690 700 710
290 300 310 320 330
pF1KA0 TQALNLIKDIISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDML--QRQL
.:: ::::.:. :: ::.: ::.:. :: .:.. :. .::::: .:::. .. .: :
CCDS58 RKALCLIKDMIATVDLKVNEYEKNQKWLEILNKIENKTYTKLKNGHVFRKQALMSEERTL
720 730 740 750 760 770
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 HLEGMLCWKTTSGRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVA
.:.. :::..::.:::::.:::::::.::::::::.::.::.:: ::::::::.::::
CCDS58 LYDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQKYIFAAVDQKPSVISLQKLIAREVA
780 790 800 810 820 830
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 NEEKAMFLISASLQGPEMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPFSLPEEERKV
:::..::::::: :::::::.:.:::.:: :: .::.::::::.:. : : .:...
CCDS58 NEERGMFLISASSAGPEMYEIHTNSKEERNNWMRRIQQAVESCPEEKGGRTSESDEDKRK
840 850 860 870 880 890
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VEARATRLRDFQERLSMKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLP-QPRGLFRGGDPSE
.:::...... :: :. .:: : : :: .:: :..:..:.::. .:. :.. ::.:
CCDS58 AEARVAKIQQCQEILTNQDQQICAYLEEKLHIYAELGELSGFEDVHLEPHLLIKP-DPGE
900 910 920 930 940 950
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 TLQGELILKSAMSEIEGIQSLI-CRRLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGYDCTNSPT
:. .: .:..: :..: . ..:... . :: : : :.:....: .:::
CCDS58 PPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGAVSQSCED---SCGDSVLADTLSSHDVPGSPT
960 970 980 990 1000 1010
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 KNGSFKKKVSSTDPRPRDWRGPPNSPDLKLSDSDIPG-SSEESPQVVEAPGTESDPR-LP
.: :. :: :: : :: .. . .: : . . : .:
CCDS58 ---------ASLVTGGREGRG--------CSDVD-PGIQGVVTDLAVSDAGEKVECRNFP
1020 1030 1040 1050
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 TVLESELVQRIQTLSQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQST-RGNLLLEQ
.::..: ::.:..:: .:::... :::..: .: ..:..: .: ::. : .:
CCDS58 GSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPLQDQ
1060 1070 1080 1090 1100 1110
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 ERQRNFEKQREERAALEKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQLRE
..:. ..:.:: : ...:: ::..::.:: :. . :.. . ::::: : .. .:
CCDS58 -KSRDADRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRESWLQERERECQSQEE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
760 770 780 790 800
pF1KA0 RLEQERAELERQRQAYQHDLERLREAQRAVERERERLE----LLRRLK--KQNTAPGALP
: . :.::. : : :::.::::::.:: ::::. :.. :: . : .: . :..:
CCDS58 LLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGHWKHGRQRSLPAVLL
1180 1190 1200 1210 1220 1230
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 PDTLAEAQPPSHPPSFNGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTESRLAKSDV
:
CCDS58 PGGPEVMELNRSESLCHENSFFINEALVQMSFNTFNKLNPSVIHQDATYPTTQSHSDLVR
1240 1250 1260 1270 1280 1290
>>CCDS54870.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1705 aa)
initn: 1360 init1: 996 opt: 1881 Z-score: 930.2 bits: 184.4 E(32554): 1.7e-45
Smith-Waterman score: 2152; 46.9% identity (73.5% similar) in 811 aa overlap (18-809:760-1545)
10 20 30 40
pF1KA0 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPI----TGEMDEADSAFLKFKQTA
::: : . :. .:.: . .. .
CCDS54 SLHPSSSVPVGLPTGRRETVGQVHPLSRSVPGTTLESFRRSATSLESESDHNSCRSRSHS
730 740 750 760 770 780
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 DDSL-SL-TSPNTESIFVEDPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVK
:. : :. .::.:::...:: .:: :.. ::..:::::::::.:: .. ..:...:.:
CCDS54 DELLQSMGSSPSTESFIMEDVVDSSLWSDLSSDAQEFEAESWSLVVDPSFCNRQEKDVIK
790 800 810 820 830 840
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 RQDVLYELMQTEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLA
::::..::::::.::..:: :: ... ....::::.. ... ..::: :.::: : ::.
CCDS54 RQDVIFELMQTEMHHIQTLFIMSEIFRKGMKEELQLDHSTVDKIFPCLDELLEIHRHFFY
850 860 870 880 890 900
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 RLKERRQESLEEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLL
.::::::: :::::.::..:::.:::::: ::. .::. :: :: :.:::. .: :
CCDS54 SMKERRQESCA-GSDRNFVIDRIGDILVQQFSEENASKMKKIYGEFCCHHKEAVNLFKEL
910 920 930 940 950 960
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 LQQNKKFQNLIKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDL
::::::::.:: .. ..:: :. ::::::::::::::::::::.: :. ::...::
CCDS54 -QQNKKFQNFIKLRNSNLLARRRGIPECILLVTQRITKYPVLVERILQYTKERTEEHKDL
970 980 990 1000 1010 1020
290 300 310 320 330
pF1KA0 TQALNLIKDIISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDML--QRQL
.:: ::::.:. :: ::.: ::.:. :: .:.. :. .::::: .:::. .. .: :
CCDS54 RKALCLIKDMIATVDLKVNEYEKNQKWLEILNKIENKTYTKLKNGHVFRKQALMSEERTL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 HLEGMLCWKTTSGRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVA
.:.. :::..::.:::::.:::::::.::::::::.::.::.:: ::::::::.::::
CCDS54 LYDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQKYIFAAVDQKPSVISLQKLIAREVA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 NEEKAMFLISASLQGPEMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPFSLPEEERKV
:::..::::::: :::::::.:.:::.:: :: .::.::::::.:. : : .:...
CCDS54 NEERGMFLISASSAGPEMYEIHTNSKEERNNWMRRIQQAVESCPEEKGGRTSESDEDKRK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VEARATRLRDFQERLSMKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLP-QPRGLFRGGDPSE
.:::...... :: :. .:: : : :: .:: :..:..:.::. .:. :.. ::.:
CCDS54 AEARVAKIQQCQEILTNQDQQICAYLEEKLHIYAELGELSGFEDVHLEPHLLIKP-DPGE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 TLQGELILKSAMSEIEGIQSLI-CRRLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGYDCTNSPT
:. .: .:..: :..: . ..:... . :: : : :.:....: .:::
CCDS54 PPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGAVSQSCED---SCGDSVLADTLSSHDVPGSPT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 KNGSFKKKVSSTDPRPRDWRGPPNSPDLKLSDSDIPG-SSEESPQVVEAPGTESDPR-LP
.: :. :: :: : :: .. . .: : . . : .:
CCDS54 ---------ASLVTGGREGRG--------CSDVD-PGIQGVVTDLAVSDAGEKVECRNFP
1330 1340 1350 1360
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 TVLESELVQRIQTLSQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQST-RGNLLLEQ
.::..: ::.:..:: .:::... :::..: .: ..:..: .: ::. : .:
CCDS54 GSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPLQDQ
1370 1380 1390 1400 1410 1420
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 ERQRNFEKQREERAALEKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQLRE
..:. ..:.:: : ...:: ::..::.:: :. . :.. . ::::: : .. .:
CCDS54 -KSRDADRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRESWLQERERECQSQEE
1430 1440 1450 1460 1470 1480
760 770 780 790 800
pF1KA0 RLEQERAELERQRQAYQHDLERLREAQRAVERERERLE----LLRRLK--KQNTAPGALP
: . :.::. : : :::.::::::.:: ::::. :.. :: . : .: . :..:
CCDS54 LLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGHWKHGRQRSLPAVLL
1490 1500 1510 1520 1530 1540
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 PDTLAEAQPPSHPPSFNGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTESRLAKSDV
:
CCDS54 PGGPEVMELNRSESLCHENSFFINEALVQMSFNTFNKLNPSVIHQDATYPTTQSHSDLVR
1550 1560 1570 1580 1590 1600
>>CCDS47231.2 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1731 aa)
initn: 1395 init1: 996 opt: 1881 Z-score: 930.1 bits: 184.4 E(32554): 1.7e-45
Smith-Waterman score: 2152; 46.9% identity (73.5% similar) in 811 aa overlap (18-809:760-1545)
10 20 30 40
pF1KA0 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPI----TGEMDEADSAFLKFKQTA
::: : . :. .:.: . .. .
CCDS47 SLHPSSSVPVGLPTGRRETVGQVHPLSRSVPGTTLESFRRSATSLESESDHNSCRSRSHS
730 740 750 760 770 780
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 DDSL-SL-TSPNTESIFVEDPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVK
:. : :. .::.:::...:: .:: :.. ::..:::::::::.:: .. ..:...:.:
CCDS47 DELLQSMGSSPSTESFIMEDVVDSSLWSDLSSDAQEFEAESWSLVVDPSFCNRQEKDVIK
790 800 810 820 830 840
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 RQDVLYELMQTEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLA
::::..::::::.::..:: :: ... ....::::.. ... ..::: :.::: : ::.
CCDS47 RQDVIFELMQTEMHHIQTLFIMSEIFRKGMKEELQLDHSTVDKIFPCLDELLEIHRHFFY
850 860 870 880 890 900
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 RLKERRQESLEEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLL
.::::::: :::::.::..:::.:::::: ::. .::. :: :: :.:::. .: :
CCDS47 SMKERRQESCA-GSDRNFVIDRIGDILVQQFSEENASKMKKIYGEFCCHHKEAVNLFKEL
910 920 930 940 950 960
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 LQQNKKFQNLIKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDL
::::::::.:: .. ..:: :. ::::::::::::::::::::.: :. ::...::
CCDS47 -QQNKKFQNFIKLRNSNLLARRRGIPECILLVTQRITKYPVLVERILQYTKERTEEHKDL
970 980 990 1000 1010 1020
290 300 310 320 330
pF1KA0 TQALNLIKDIISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDML--QRQL
.:: ::::.:. :: ::.: ::.:. :: .:.. :. .::::: .:::. .. .: :
CCDS47 RKALCLIKDMIATVDLKVNEYEKNQKWLEILNKIENKTYTKLKNGHVFRKQALMSEERTL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 HLEGMLCWKTTSGRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVA
.:.. :::..::.:::::.:::::::.::::::::.::.::.:: ::::::::.::::
CCDS47 LYDGLVYWKTATGRFKDILALLLTDVLLFLQEKDQKYIFAAVDQKPSVISLQKLIAREVA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 NEEKAMFLISASLQGPEMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPFSLPEEERKV
:::..::::::: :::::::.:.:::.:: :: .::.::::::.:. : : .:...
CCDS47 NEERGMFLISASSAGPEMYEIHTNSKEERNNWMRRIQQAVESCPEEKGGRTSESDEDKRK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VEARATRLRDFQERLSMKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLP-QPRGLFRGGDPSE
.:::...... :: :. .:: : : :: .:: :..:..:.::. .:. :.. ::.:
CCDS47 AEARVAKIQQCQEILTNQDQQICAYLEEKLHIYAELGELSGFEDVHLEPHLLIKP-DPGE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 TLQGELILKSAMSEIEGIQSLI-CRRLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGYDCTNSPT
:. .: .:..: :..: . ..:... . :: : : :.:....: .:::
CCDS47 PPQAASLLAAALKEAESLQVAVKASQMGAVSQSCED---SCGDSVLADTLSSHDVPGSPT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 KNGSFKKKVSSTDPRPRDWRGPPNSPDLKLSDSDIPG-SSEESPQVVEAPGTESDPR-LP
.: :. :: :: : :: .. . .: : . . : .:
CCDS47 ---------ASLVTGGREGRG--------CSDVD-PGIQGVVTDLAVSDAGEKVECRNFP
1330 1340 1350 1360
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 TVLESELVQRIQTLSQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQST-RGNLLLEQ
.::..: ::.:..:: .:::... :::..: .: ..:..: .: ::. : .:
CCDS47 GSSQSEIIQAIQNLTRLLYSLQAALTIQDSHIEIHRLVLQQQEGLSLGHSILRGGPLQDQ
1370 1380 1390 1400 1410 1420
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 ERQRNFEKQREERAALEKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQLRE
..:. ..:.:: : ...:: ::..::.:: :. . :.. . ::::: : .. .:
CCDS47 -KSRDADRQHEELANVHQLQHQLQQEQRRWLRRCEQQQRAQATRESWLQERERECQSQEE
1430 1440 1450 1460 1470 1480
760 770 780 790 800
pF1KA0 RLEQERAELERQRQAYQHDLERLREAQRAVERERERLE----LLRRLK--KQNTAPGALP
: . :.::. : : :::.::::::.:: ::::. :.. :: . : .: . :..:
CCDS47 LLLRSRGELDLQLQEYQHSLERLREGQRLVEREQARMRAQQSLLGHWKHGRQRSLPAVLL
1490 1500 1510 1520 1530 1540
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 PDTLAEAQPPSHPPSFNGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTESRLAKSDV
:
CCDS47 PGGPEVMELNRSESLCHENSFFINEALVQMSFNTFNKLNPSVIHQDATYPTTQSHSDLVR
1550 1560 1570 1580 1590 1600
>>CCDS73778.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (1434 aa)
initn: 1895 init1: 1346 opt: 1768 Z-score: 876.3 bits: 174.2 E(32554): 1.7e-42
Smith-Waterman score: 2015; 41.6% identity (69.1% similar) in 907 aa overlap (25-898:531-1393)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPITGE-MDEADSAFLKFKQTADDSL---SLT
::: :: : :: . . ::: : .
CCDS73 LVDETATTPIFANRRSQQSVSLSKSVSIQNITGVGNDENMSNTWKFLSHSTDSLNKISKV
510 520 530 540 550 560
60 70 80 90 100
pF1KA0 SPNTESIFVE----DPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVKRQDVL
. .:::. : : ..: ...: .....:::::: .:. . :.::..:::::.:.
CCDS73 NESTESLTDEGVGTDMNEGQLLGDFEIESKQLEAESWSRIIDSKFLKQQKKDVVKRQEVI
570 580 590 600 610 620
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 YELMQTEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLARLKER
::::::: ::::::::: :::.... .: : .. . .:::: :.:. ::.:. :. ::
CCDS73 YELMQTEFHHVRTLKIMSGVYSQGMMADLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILER
630 640 650 660 670 680
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 RQESLEEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLLLQQNK
..::: . :..:..:..:::.::.::::::.::.:. :: ::. ::..:...: : ..:
CCDS73 KKESLVDKSEKNFLIKRIGDVLVNQFSGENAERLKKTYGKFCGQHNQSVNYFKDLYAKDK
690 700 710 720 730 740
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 KFQNLIKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDLTQALN
.:: ..:: . :.:::::. :::::::::::::::: .::.: :. . . :::.:.:.
CCDS73 RFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRILQCTKDNEVEQEDLAQSLS
750 760 770 780 790 800
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 LIKDIISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDMLQRQLHLEGMLC
:.::.:. ::.::. :: :: :: : : :: ..:.: : :::. ...: .: .
CCDS73 LVKDVIGAVDSKVASYEKKVRLNEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFAKEDLKRKKLVRDGSVF
810 820 830 840 850 860
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 WKTTSGRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVANEEKAMF
:...::::.. :.::::.:..::::::::.:::.:.: ::::.::::::::.:::..:
CCDS73 LKNAAGRLKEVQAVLLTDILVFLQEKDQKYIFASLDQKSTVISLKKLIVREVAHEEKGLF
870 880 890 900 910 920
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LISASLQGPEMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCP-DEEEGPFSLPEEERKVVEARAT
::: .. ::: :...::::.::.:. :: .... ::.:: : :::.:....::
CCDS73 LISMGMTDPEMVEVHASSKEERNSWIQIIQDTINTLNRDEDEGIPSENEEEKKMLDTRA-
930 940 950 960 970
470 480 490 500 510
pF1KA0 RLRDFQERLSMKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLPQ-------PRGLFRGGDPSE
:...:.: .::: : : ::..:. .::: . ::. :: :::. . :
CCDS73 --RELKEQLHQKDQKILLLLEEKEMIFRDMAECS--TPLPEDCSPTHSPRVLFRS-NTEE
980 990 1000 1010 1020 1030
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 TLQGELILKSAMSEIEGIQSLICRRLGSANGQAEDGG---SSTGP---PRRAETFAGYDC
.:.: ..:::..:.: .:.:. ::.. : . .. . .:: :::::::.:.:
CCDS73 ALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGNLGGTLGPTVSSPIEQDVVGPVSLPRRAETFGGFDS
1040 1050 1060 1070 1080 1090
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 TNSPTKNGSFKKKVSSTDPRPRDWRGPPNSPDLKLSDSDIPGSSEESPQVVEAPGTESDP
. ...:. :.. : .. ::. ..:: .. . ..: .:.
CCDS73 HQMNASKGGEKEE------------GD-DGQDLRRTESDSGLKKGGNANLVFMLKRNSE-
1100 1110 1120 1130 1140
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RLPTVLESELVQRIQTLSQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQSTRGNLLL
..:: . : .:: ::.:. .::::.: :. ...:: : .: . :.
CCDS73 --------QVVQSVVHLYELLSALQGVVLQQDSYIEDQKLVLSERALTRSL--SRPSSLI
1150 1160 1170 1180 1190
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 EQERQRNFEKQREERAALEKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQL
:::.::..::::.. : :.: :.: .:..: ::: . ...::.. : : .:: :..:
CCDS73 EQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQYLEEKRRREREWEARERELREREALLAQREEEVQQG
1200 1210 1220 1230 1240 1250
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 RERLEQERAELERQRQAYQHDLERLREAQRAVERERERLEL-LRRLKKQNTAPGALPPDT
.. ::.:: ::.... .::.:::::: ::. .:::.:.:. .::....:
CCDS73 QQDLEKEREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLRREAERLSQRQT------ERD
1260 1270 1280 1290 1300
820 830 840 850 860
pF1KA0 LAEAQPPSHPPSFNGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTE----------S
: .. ::: . . .. : :..:: : : .:. : .: :
CCDS73 LCQV---SHPHT---KLMRIP--SFFPSPEEPPSPSAPSIAKSGSLDSELSVSPKRNSIS
1310 1320 1330 1340 1350
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 RLAKSDVPIQLLSATNQFQRQAAVQQQIPTKLAASTKGGKDKGGKSRGSQRWESSASFDL
: :. :...::.:.: .. :.: :.. .:::.
CCDS73 RTHKDKGPFHILSSTSQTNKGPEGQSQAPASTSASTRLFGLTKPKEKKEKKKKNKTSRSQ
1360 1370 1380 1390 1400 1410
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 KQQLLLNKLMGKDESTSRNRRSLSPILPGRHSPAPPPDPGFPAPSPPPADSPSEGFSLKA
CCDS73 PGDGPASEVSAEGEEIFC
1420 1430
>>CCDS32319.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2813 aa)
initn: 1864 init1: 1346 opt: 1768 Z-score: 872.5 bits: 174.5 E(32554): 2.8e-42
Smith-Waterman score: 2015; 41.6% identity (69.1% similar) in 907 aa overlap (25-898:1910-2772)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPITGE-MDEADSAFLKFKQTADDSL---SLT
::: :: : :: . . ::: : .
CCDS32 LVDETATTPIFANRRSQQSVSLSKSVSIQNITGVGNDENMSNTWKFLSHSTDSLNKISKV
1880 1890 1900 1910 1920 1930
60 70 80 90 100
pF1KA0 SPNTESIFVE----DPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVKRQDVL
. .:::. : : ..: ...: .....:::::: .:. . :.::..:::::.:.
CCDS32 NESTESLTDEGVGTDMNEGQLLGDFEIESKQLEAESWSRIIDSKFLKQQKKDVVKRQEVI
1940 1950 1960 1970 1980 1990
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 YELMQTEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLARLKER
::::::: ::::::::: :::.... .: : .. . .:::: :.:. ::.:. :. ::
CCDS32 YELMQTEFHHVRTLKIMSGVYSQGMMADLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILER
2000 2010 2020 2030 2040 2050
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 RQESLEEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLLLQQNK
..::: . :..:..:..:::.::.::::::.::.:. :: ::. ::..:...: : ..:
CCDS32 KKESLVDKSEKNFLIKRIGDVLVNQFSGENAERLKKTYGKFCGQHNQSVNYFKDLYAKDK
2060 2070 2080 2090 2100 2110
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 KFQNLIKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDLTQALN
.:: ..:: . :.:::::. :::::::::::::::: .::.: :. . . :::.:.:.
CCDS32 RFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRILQCTKDNEVEQEDLAQSLS
2120 2130 2140 2150 2160 2170
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 LIKDIISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDMLQRQLHLEGMLC
:.::.:. ::.::. :: :: :: : : :: ..:.: : :::. ...: .: .
CCDS32 LVKDVIGAVDSKVASYEKKVRLNEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFAKEDLKRKKLVRDGSVF
2180 2190 2200 2210 2220 2230
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 WKTTSGRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVANEEKAMF
:...::::.. :.::::.:..::::::::.:::.:.: ::::.::::::::.:::..:
CCDS32 LKNAAGRLKEVQAVLLTDILVFLQEKDQKYIFASLDQKSTVISLKKLIVREVAHEEKGLF
2240 2250 2260 2270 2280 2290
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LISASLQGPEMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCP-DEEEGPFSLPEEERKVVEARAT
::: .. ::: :...::::.::.:. :: .... ::.:: : :::.:....::
CCDS32 LISMGMTDPEMVEVHASSKEERNSWIQIIQDTINTLNRDEDEGIPSENEEEKKMLDTRA-
2300 2310 2320 2330 2340 2350
470 480 490 500 510
pF1KA0 RLRDFQERLSMKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLPQ-------PRGLFRGGDPSE
:...:.: .::: : : ::..:. .::: . ::. :: :::. . :
CCDS32 --RELKEQLHQKDQKILLLLEEKEMIFRDMAECS--TPLPEDCSPTHSPRVLFRS-NTEE
2360 2370 2380 2390 2400 2410
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 TLQGELILKSAMSEIEGIQSLICRRLGSANGQAEDGG---SSTGP---PRRAETFAGYDC
.:.: ..:::..:.: .:.:. ::.. : . .. . .:: :::::::.:.:
CCDS32 ALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGNLGGTLGPTVSSPIEQDVVGPVSLPRRAETFGGFDS
2420 2430 2440 2450 2460 2470
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 TNSPTKNGSFKKKVSSTDPRPRDWRGPPNSPDLKLSDSDIPGSSEESPQVVEAPGTESDP
. ...:. :.. : .. ::. ..:: .. . ..: .:.
CCDS32 HQMNASKGGEKEE------------GD-DGQDLRRTESDSGLKKGGNANLVFMLKRNSE-
2480 2490 2500 2510
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RLPTVLESELVQRIQTLSQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQSTRGNLLL
..:: . : .:: ::.:. .::::.: :. ...:: : .: . :.
CCDS32 --------QVVQSVVHLYELLSALQGVVLQQDSYIEDQKLVLSERALTRSL--SRPSSLI
2520 2530 2540 2550 2560
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 EQERQRNFEKQREERAALEKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQL
:::.::..::::.. : :.: :.: .:..: ::: . ...::.. : : .:: :..:
CCDS32 EQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQYLEEKRRREREWEARERELREREALLAQREEEVQQG
2570 2580 2590 2600 2610 2620
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 RERLEQERAELERQRQAYQHDLERLREAQRAVERERERLEL-LRRLKKQNTAPGALPPDT
.. ::.:: ::.... .::.:::::: ::. .:::.:.:. .::....:
CCDS32 QQDLEKEREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLRREAERLSQRQT------ERD
2630 2640 2650 2660 2670 2680
820 830 840 850 860
pF1KA0 LAEAQPPSHPPSFNGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTE----------S
: .. ::: . . .. : :..:: : : .:. : .: :
CCDS32 LCQV---SHPHT---KLMRIP--SFFPSPEEPPSPSAPSIAKSGSLDSELSVSPKRNSIS
2690 2700 2710 2720 2730
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 RLAKSDVPIQLLSATNQFQRQAAVQQQIPTKLAASTKGGKDKGGKSRGSQRWESSASFDL
: :. :...::.:.: .. :.: :.. .:::.
CCDS32 RTHKDKGPFHILSSTSQTNKGPEGQSQAPASTSASTRLFGLTKPKEKKEKKKKNKTSRSQ
2740 2750 2760 2770 2780 2790
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 KQQLLLNKLMGKDESTSRNRRSLSPILPGRHSPAPPPDPGFPAPSPPPADSPSEGFSLKA
CCDS32 PGDGPASEVSAEGEEIFC
2800 2810
>>CCDS32320.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2817 aa)
initn: 1864 init1: 1346 opt: 1768 Z-score: 872.4 bits: 174.5 E(32554): 2.8e-42
Smith-Waterman score: 2015; 41.6% identity (69.1% similar) in 907 aa overlap (25-898:1914-2776)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPITGE-MDEADSAFLKFKQTADDSL---SLT
::: :: : :: . . ::: : .
CCDS32 LVDETATTPIFANRRSQQSVSLSKSVSIQNITGVGNDENMSNTWKFLSHSTDSLNKISKV
1890 1900 1910 1920 1930 1940
60 70 80 90 100
pF1KA0 SPNTESIFVE----DPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVKRQDVL
. .:::. : : ..: ...: .....:::::: .:. . :.::..:::::.:.
CCDS32 NESTESLTDEGVGTDMNEGQLLGDFEIESKQLEAESWSRIIDSKFLKQQKKDVVKRQEVI
1950 1960 1970 1980 1990 2000
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 YELMQTEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLARLKER
::::::: ::::::::: :::.... .: : .. . .:::: :.:. ::.:. :. ::
CCDS32 YELMQTEFHHVRTLKIMSGVYSQGMMADLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILER
2010 2020 2030 2040 2050 2060
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 RQESLEEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLLLQQNK
..::: . :..:..:..:::.::.::::::.::.:. :: ::. ::..:...: : ..:
CCDS32 KKESLVDKSEKNFLIKRIGDVLVNQFSGENAERLKKTYGKFCGQHNQSVNYFKDLYAKDK
2070 2080 2090 2100 2110 2120
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 KFQNLIKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDLTQALN
.:: ..:: . :.:::::. :::::::::::::::: .::.: :. . . :::.:.:.
CCDS32 RFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRITKYPVLFQRILQCTKDNEVEQEDLAQSLS
2130 2140 2150 2160 2170 2180
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 LIKDIISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDMLQRQLHLEGMLC
:.::.:. ::.::. :: :: :: : : :: ..:.: : :::. ...: .: .
CCDS32 LVKDVIGAVDSKVASYEKKVRLNEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFAKEDLKRKKLVRDGSVF
2190 2200 2210 2220 2230 2240
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 WKTTSGRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVANEEKAMF
:...::::.. :.::::.:..::::::::.:::.:.: ::::.::::::::.:::..:
CCDS32 LKNAAGRLKEVQAVLLTDILVFLQEKDQKYIFASLDQKSTVISLKKLIVREVAHEEKGLF
2250 2260 2270 2280 2290 2300
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LISASLQGPEMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCP-DEEEGPFSLPEEERKVVEARAT
::: .. ::: :...::::.::.:. :: .... ::.:: : :::.:....::
CCDS32 LISMGMTDPEMVEVHASSKEERNSWIQIIQDTINTLNRDEDEGIPSENEEEKKMLDTRA-
2310 2320 2330 2340 2350 2360
470 480 490 500 510
pF1KA0 RLRDFQERLSMKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLEDLPQ-------PRGLFRGGDPSE
:...:.: .::: : : ::..:. .::: . ::. :: :::. . :
CCDS32 --RELKEQLHQKDQKILLLLEEKEMIFRDMAECS--TPLPEDCSPTHSPRVLFRS-NTEE
2370 2380 2390 2400 2410
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 TLQGELILKSAMSEIEGIQSLICRRLGSANGQAEDGG---SSTGP---PRRAETFAGYDC
.:.: ..:::..:.: .:.:. ::.. : . .. . .:: :::::::.:.:
CCDS32 ALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGNLGGTLGPTVSSPIEQDVVGPVSLPRRAETFGGFDS
2420 2430 2440 2450 2460 2470
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 TNSPTKNGSFKKKVSSTDPRPRDWRGPPNSPDLKLSDSDIPGSSEESPQVVEAPGTESDP
. ...:. :.. : .. ::. ..:: .. . ..: .:.
CCDS32 HQMNASKGGEKEE------------GD-DGQDLRRTESDSGLKKGGNANLVFMLKRNSE-
2480 2490 2500 2510 2520
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 RLPTVLESELVQRIQTLSQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQEREKQFRLQSTRGNLLL
..:: . : .:: ::.:. .::::.: :. ...:: : .: . :.
CCDS32 --------QVVQSVVHLYELLSALQGVVLQQDSYIEDQKLVLSERALTRSL--SRPSSLI
2530 2540 2550 2560 2570
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 EQERQRNFEKQREERAALEKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQL
:::.::..::::.. : :.: :.: .:..: ::: . ...::.. : : .:: :..:
CCDS32 EQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQYLEEKRRREREWEARERELREREALLAQREEEVQQG
2580 2590 2600 2610 2620 2630
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 RERLEQERAELERQRQAYQHDLERLREAQRAVERERERLEL-LRRLKKQNTAPGALPPDT
.. ::.:: ::.... .::.:::::: ::. .:::.:.:. .::....:
CCDS32 QQDLEKEREELQQKKGTYQYDLERLRAAQKQLEREQEQLRREAERLSQRQT------ERD
2640 2650 2660 2670 2680
820 830 840 850 860
pF1KA0 LAEAQPPSHPPSFNGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTE----------S
: .. ::: . . .. : :..:: : : .:. : .: :
CCDS32 LCQV---SHPHT---KLMRIP--SFFPSPEEPPSPSAPSIAKSGSLDSELSVSPKRNSIS
2690 2700 2710 2720 2730
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 RLAKSDVPIQLLSATNQFQRQAAVQQQIPTKLAASTKGGKDKGGKSRGSQRWESSASFDL
: :. :...::.:.: .. :.: :.. .:::.
CCDS32 RTHKDKGPFHILSSTSQTNKGPEGQSQAPASTSASTRLFGLTKPKEKKEKKKKNKTSRSQ
2740 2750 2760 2770 2780 2790
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 KQQLLLNKLMGKDESTSRNRRSLSPILPGRHSPAPPPDPGFPAPSPPPADSPSEGFSLKA
CCDS32 PGDGPASEVSAEGEEIFC
2800 2810
>>CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 (958 aa)
initn: 1479 init1: 1076 opt: 1448 Z-score: 723.0 bits: 145.2 E(32554): 6e-34
Smith-Waterman score: 1580; 38.7% identity (68.0% similar) in 781 aa overlap (25-791:128-859)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPITGEM-DEADSAFLKFKQTADDSLSLTSP-
:.:.. ::. .. .. . . :::.. .
CCDS11 YPSDSFRQSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRRILSQSTDSLNMRNRT
100 110 120 130 140 150
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 -NTESIFVEDPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVKRQDVLYELMQ
..::.. :. . : :..: : ..: :.:::::::... ...:.::.:.:::.:::.:
CCDS11 LSVESLIDEEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELIQ
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 TEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLARLKERRQESL
::.::::::::: ... .. :::.. .. ::::.:.: . :..::..: :::...:
CCDS11 TELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLERRRQAL
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLLLQQNKKFQNL
:: ::.::...::::..:::: ..:.: . :. ::: :..:.. :: : ..:.::..
CCDS11 CPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDKRFQQF
280 290 300 310 320 330
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 IKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDLTQALNLIKDI
:.:. ....: :::::::::::::::::.:. ::.:.... :. .::: ::.:.:..
CCDS11 IRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALGLVKEL
340 350 360 370 380 390
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDMLQRQLHLEGMLCWKTTS
.:.:: . . ::: ::.:: ..:: .... . . : .:..:.:.: .: : :::..
CCDS11 LSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQTPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGCLLWKTAT
400 410 420 430 440 450
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 GRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVANEEKAMFLISAS
::.::.:..:.::::..::::::::.: ..: :: :.:::.::::..::.::.::::::.
CCDS11 GRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLD-KPSVVSLQNLIVRDIANQEKGMFLISAA
460 470 480 490 500 510
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 LQGPEMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPFSLPEEERKVVEARATRLRDFQ
:::::..:.:..::..:. ::..:..::..:. :. :.: . :: ..
CCDS11 --PPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTCPSREDFPLIETEDE--------AYLRRIK
520 530 540 550 560
480 490 500 510 520
pF1KA0 ERLSMKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLED------LPQ-PRGLFRGGDPSETLQGEL
.:..::. ... : :: .. ::... . :: :: ::::::. . :. .::
CCDS11 MELQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRS-ESLESPRGER
570 580 590 600 610 620
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 ILKSAMSEIEGIQSLICRRLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGYDCTNSPTKNGSFKK
.:..:. :.::...:. .: . .: . : : .: . . . : ::
CCDS11 LLQDAIREVEGLKDLL---VGPG---VELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANG----
630 640 650 660 670
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 KVSSTDPRPRDWRGPPNSPDLKLSDSDIPGSSEESPQVVEAPGTESDPRLPTVLESELVQ
. : . : : .: .::: .... :. : : . : .:
CCDS11 -------EARTFNG---SIELCRADSDSSQRDRNGNQL----------RSP---QEEALQ
680 690 700 710
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 RIQTLSQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQER-EKQFRLQSTRGNLLLEQERQRNFEKQ
:. .: :: .:::..:.::. .:.. :: :: : .: :. :::
CCDS11 RLVNLYGLLHGLQAAVAQQDTLMEARFPEGPERREKLCRANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQ
720 730 740 750 760 770
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 REERAALEKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQLRERLEQERAEL
: : :.. : : .:. : : :. ... .::. :. : :..: : ::.: :
CCDS11 ATELALLQR-QHALLQEELR--RCRRLGEERATEAGS-LEARLRESEQARALLEREAEEA
780 790 800 810 820
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 ERQRQAYQHDLERLREA---QRAVERERERLELLRRLKKQNTAPGALPPDTLAEAQPPSH
.:: : . :: .: :. .:. :
CCDS11 RRQLAALGQTEPLPAEAPWARRPVDPRRRSLPAGDALYLSFNPPQPSRGTDRLDLPVTTR
830 840 850 860 870 880
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 PPSFNGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTESRLAKSDVPIQLLSATNQFQ
CCDS11 SVHRNFEDRERQELGSPEERLQDSSDPDTGSEEEGSSRLSPPHSPRDFTRMQDIPEETES
890 900 910 920 930 940
>>CCDS53375.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 (985 aa)
initn: 1479 init1: 1076 opt: 1448 Z-score: 722.8 bits: 145.3 E(32554): 6.1e-34
Smith-Waterman score: 1580; 38.7% identity (68.0% similar) in 781 aa overlap (25-791:155-886)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MTVSQKGGPQPTPSPAGPGTQLGPITGEM-DEADSAFLKFKQTADDSLSLTSP-
:.:.. ::. .. .. . . :::.. .
CCDS53 YPSDSFRQSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESPLGLRRILSQSTDSLNMRNRT
130 140 150 160 170 180
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 -NTESIFVEDPYTASLRSEIESDGHEFEAESWSLAVDAAYAKKQKREVVKRQDVLYELMQ
..::.. :. . : :..: : ..: :.:::::::... ...:.::.:.:::.:::.:
CCDS53 LSVESLIDEEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELIQ
190 200 210 220 230 240
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 TEVHHVRTLKIMLKVYSRALQEELQFSSKAIGRLFPCADDLLETHSHFLARLKERRQESL
::.::::::::: ... .. :::.. .. ::::.:.: . :..::..: :::...:
CCDS53 TELHHVRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLERRRQAL
250 260 270 280 290 300
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 EEGSDRNYVIQKIGDLLVQQFSGENGERMKEKYGVFCSGHNEAVSHYKLLLQQNKKFQNL
:: ::.::...::::..:::: ..:.: . :. ::: :..:.. :: : ..:.::..
CCDS53 CPGSTRNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDKRFQQF
310 320 330 340 350 360
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 IKKIGNFSIVRRLGVQECILLVTQRITKYPVLVERIIQNTEAGTEDYEDLTQALNLIKDI
:.:. ....: :::::::::::::::::.:. ::.:.... :. .::: ::.:.:..
CCDS53 IRKVTRPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALGLVKEL
370 380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 ISQVDAKVSECEKGQRLREIAGKMDLKSSSKLKNGLTFRKEDMLQRQLHLEGMLCWKTTS
.:.:: . . ::: ::.:: ..:: .... . . : .:..:.:.: .: : :::..
CCDS53 LSNVDEGIYQLEKGARLQEIYNRMDPRAQTPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGCLLWKTAT
430 440 450 460 470 480
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 GRLKDILAILLTDVLLLLQEKDQKYVFASVDSKPPVISLQKLIVREVANEEKAMFLISAS
::.::.:..:.::::..::::::::.: ..: :: :.:::.::::..::.::.::::::.
CCDS53 GRFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLD-KPSVVSLQNLIVRDIANQEKGMFLISAA
490 500 510 520 530 540
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 LQGPEMYEIYTSSKEDRNAWMAHIQRAVESCPDEEEGPFSLPEEERKVVEARATRLRDFQ
:::::..:.:..::..:. ::..:..::..:. :. :.: . :: ..
CCDS53 --PPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTCPSREDFPLIETEDE--------AYLRRIK
550 560 570 580 590
480 490 500 510 520
pF1KA0 ERLSMKDQLIAQSLLEKQQIYLEMAEMGGLED------LPQ-PRGLFRGGDPSETLQGEL
.:..::. ... : :: .. ::... . :: :: ::::::. . :. .::
CCDS53 MELQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRS-ESLESPRGER
600 610 620 630 640 650
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 ILKSAMSEIEGIQSLICRRLGSANGQAEDGGSSTGPPRRAETFAGYDCTNSPTKNGSFKK
.:..:. :.::...:. .: . .: . : : .: . . . : ::
CCDS53 LLQDAIREVEGLKDLL---VGPG---VELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANG----
660 670 680 690 700
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 KVSSTDPRPRDWRGPPNSPDLKLSDSDIPGSSEESPQVVEAPGTESDPRLPTVLESELVQ
. : . : : .: .::: .... :. : : . : .:
CCDS53 -------EARTFNG---SIELCRADSDSSQRDRNGNQL----------RSP---QEEALQ
710 720 730
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 RIQTLSQLLLNLQAVIAHQDSYVETQRAAIQER-EKQFRLQSTRGNLLLEQERQRNFEKQ
:. .: :: .:::..:.::. .:.. :: :: : .: :. :::
CCDS53 RLVNLYGLLHGLQAAVAQQDTLMEARFPEGPERREKLCRANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQ
740 750 760 770 780 790
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 REERAALEKLQSQLRHEQQRWERERQWQHQELERAGARLQEREGEARQLRERLEQERAEL
: : :.. : : .:. : : :. ... .::. :. : :..: : ::.: :
CCDS53 ATELALLQR-QHALLQEELR--RCRRLGEERATEAGS-LEARLRESEQARALLEREAEEA
800 810 820 830 840 850
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 ERQRQAYQHDLERLREA---QRAVERERERLELLRRLKKQNTAPGALPPDTLAEAQPPSH
.:: : . :: .: :. .:. :
CCDS53 RRQLAALGQTEPLPAEAPWARRPVDPRRRSLPAGDALYLSFNPPQPSRGTDRLDLPVTTR
860 870 880 890 900 910
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 PPSFNGEGLEGPRVSMLPSGVGPEYAERPEVARRDSAPTESRLAKSDVPIQLLSATNQFQ
CCDS53 SVHRNFEDRERQELGSPEERLQDSSDPDTGSEEEGSSRLSPPHSPRDFTRMQDIPEETES
920 930 940 950 960 970
1015 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 00:44:30 2016 done: Fri Nov 4 00:44:31 2016
Total Scan time: 5.750 Total Display time: 0.380
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]