FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0533, 3690 aa 1>>>pF1KA0533 3690 - 3690 aa - 3690 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1517+/-0.00127; mu= 17.2092+/- 0.076 mean_var=309.1938+/-59.084, 0's: 0 Z-trim(110.8): 158 B-trim: 15 in 1/53 Lambda= 0.072939 statistics sampled from 11710 (11867) to 11710 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16 Scan time: 8.570 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20 (3695) 26126 2766.3 0 CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3277) 2681 299.2 3.4e-79 CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3333) 2681 299.2 3.4e-79 CCDS11880.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (1724) 1743 200.1 1.2e-49 CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18 (3075) 1432 167.7 1.2e-39 CCDS59307.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (1668) 1380 161.9 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CCDS45 MAAAARPRGRAL---GPVLPPTPLLLLVLRVLPACGATARDPGAAAGLSLHPTYFNLAEA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 ARIAASATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAH ::: :.:::::..:..: :.: .:::::::::.: :. ..::.::.:: :.. . ::: CCDS45 ARIWATATCGERGPGEGRPQP--ELYCKLVGGPTAPGS-GHTIQGQFCDYCNSEDPRKAH 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 PASNAIDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERS :..:::::.:::::::::: : .::.::.::::::.:::::.:::::::::::::::::: CCDS45 PVTNAIDGSERWWQSPPLSSGTQYNRVNLTLDLGQLFHVAYILIKFANSPRPDLWVLERS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 MDFGRTYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLV .::: ::.:::.:: :: :::..:: .. .:::: ..:.:::::::::::::.::::. CCDS45 VDFGSTYSPWQYFAHSKVDCLKEFGREANMAVTRDDDVLCVTEYSRIVPLENGEVVVSLI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 NGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDIS :::::: ::..: :::::::::.::::::::::::::..:: ::::::::::::::::: CCDS45 NGRPGAKNFTFSHTLREFTKATNIRLRFLRTNTLLGHLISKAQRDPTVTRRYYYSIKDIS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 IGGRCVCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANE :::.:::.:::..:. ..: :: : :::.::: :::::: :.::. :.::. ....: CCDS45 IGGQCVCNGHAEVCNINNPEKLFR--CECQHHTCGETCDRCCTGYNQRRWRPAAWEQSHE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 CQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRS :..:::.:::..:::::.:.:..:: . .: : ::::::.:::.:.:::::.: :.:: CCDS45 CEACNCHGHASNCYYDPDVERQQASLNTQGIYAGGGVCINCQHNTAGVNCEQCAKGYYRP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 PNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTP . :.:.: : :.:. . .:: ::. .:::.:.::: :. :. :: :. .:: : : CCDS45 YGVPVDAPDGCIPCSCDPEHADG-CEQGSGRCHCKPNFHGDNCEKCAIGYYNFPFCLRIP 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 SSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYG ..:. CCDS45 ---------IFPV----------------------------------------------- 540 550 560 570 580 590 pF1KA0 PGCQPCQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTL :.:. :: .:. . : : :. :.: CCDS45 --------STPSSE----DPVAGDIK------G------------------CDCNLEGVL 480 490 600 610 620 630 640 650 pF1KA0 PEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAGGLCRCRPG :: :: :::::.: ::.:: :: :...:: :::: : CCDS45 PEICDAHGRCLCRPGVEGPRCDTCRSGFYSFPICQACWC--------------------- 500 510 520 530 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 YTGTACQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRPRVTGLRCDTCVPGAY :: :: . :. .::: ::: ::: ::: :. ::: CCDS45 ------------------------SALGSYQMPCSSVTGQCECRPGVTGQRCDRCLSGAY 540 550 560 570 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 NFPYCEAGS--CHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSPSNPEGC .::.:...: : ::: .. : :.:. :::::.:.::: .:.:. :: :: CCDS45 DFPHCQGSSSACDPAGT--INSNLGY----CQCKLHVEGPTCSRCKLLYWNLDKENPSGC 580 590 600 610 620 780 790 800 810 820 830 pF1KA0 TRCSCDLRGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDI ..:.: ::..:..::. : :.: :: :: :..: .:.::.:.:....::::..:.::: CCDS45 SECKCHKAGTVSGTGECRQGDGDCHCKSHVGGDSCDTCEDGYFALEKSNYFGCQGCQCDI 630 640 650 660 670 680 840 850 860 870 880 890 pF1KA0 GGALGQSCEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAMRFGF ::::.. : .:::.:: .. : .:..: ..:.:::::.. :.:...::.:. .:::: CCDS45 GGALSSMCSGPSGVCQCREHVVGKVCQRPENNYYFPDLHHMKYEIEDGSTPNGRDLRFGF 690 700 710 720 730 740 900 910 920 930 940 950 pF1KA0 NPLEFENFSWRGYAQMAPVQPRIVARLNL--TSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSVREE .:: : .:::::::::. :: . ::. .: .:: ...:::: :. .:::.... CCDS45 DPLAFPEFSWRGYAQMTSVQNDVRITLNVGKSSGSLFRVILRYVNPGTEAVSGHITIYPS 750 760 770 780 790 800 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA0 GRSATCANCTAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNPGTWALRVEAEGVLLDYVV .: ::. . : :: ::::.::: ::..:: ..:: :. ..::::::::.: CCDS45 WGAA-------QSKEIIFLPSKEPAFVTVPGNGFADPFSITPGIWVACIKAEGVLLDYLV 810 820 830 840 850 860 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA0 LLPSAYYEAALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCRQDNSL ::: ::::..::: ::: :.: :. ::::: :::. :: . . :: .. CCDS45 LLPRDYYEASVLQLPVTEPCAYAGPPQE---NCLLYQHLPVTRFPCTLACEARHFLLDGE 870 880 890 900 910 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KA0 PRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGVAVHTP ::: ..: .:.:: .. .: .:...:.. .:: :.:..::::..: :. : : :.. CCDS45 PRPVAVRQPTPAHPVMVDLSGREVELHLRLRIPQVGHYVVVVEYSTEAAQLFV-VDVNVK 920 930 940 950 960 970 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KA0 QRAP-QQGLLSLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHGVTLV . . : .... : ::.:::... : ....:...: ..:...: ...:::.:: : .. CCDS45 SSGSVLAGQVNIYSCNYSVLCRSAVIDHMSRIAMYELLADADIQLKGHMARFLLHQVCII 980 990 1000 1010 1020 1030 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KA0 PIEEFSPEFVEPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTH :::::: :.:.:.: ::.:.: : .::.:. :: .:: .:. : :. : CCDS45 PIEEFSAEYVRPQVHCIASYGRFVNQSATCVSLAHETPPTALIL---DVL---SGRPFPH 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KA0 AQDLTPAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAH : .: : . : : . :. :: :.. .:: ::::.:..: :: :: CCDS45 ----LPQQSS------PSVDVLPGVT---LKAPQNQVTLRGRVPHLGRYVFVIHFYQAAH 1100 1110 1120 1130 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KA0 PTFPVEVLINAGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPEGRW ::::..: ...: : .:::::: ::: :. ::: .:... :...::.::::. CCDS45 PTFPAQVSVDGGWPRAGSFHASFCPHVLGCRDQVIAEGQIEFDISEPEVAATVKVPEGKS 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KA0 LWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLF : : ::::: . :.. :... .::: .::..:. ......:...: ::.:.: :: : CCDS45 LVLVRVLVVPAENYDYQILHKKSMDKSLEFITNCGKNSFYLDPQTASRFCKNSARSLVAF 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KA0 YNNGARPCGCHEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARL :..:: :: :: .::::: : : ::::::. .::::.:.:::::..::: :.::.:: :: CCDS45 YHKGALPCECHPTGATGPHCSPEGGQCPCQPNVIGRQCTRCATGHYGFPRCKPCSCGRRL 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KA0 CDELTGQCICPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQC :.:.:::: :::::. :.: .:. ..:. ::..::: :::: : : . : :: ::::: CCDS45 CEEMTGQCRCPPRTVRPQCEVCETHSFSFHPMAGCEGCNCSRRGTIEAAMPECDRDSGQC 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KA0 KCRPNVTGRRCDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQC .:.: .:::.:: :. ::. .:.: ::.:.. :: :::::: :: : :::::.: .:. : CCDS45 RCKPRITGRQCDRCASGFYRFPECVPCNCNRDGTEPGVCDPGTGACLCKENVEGTECNVC 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KA0 SLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPG :.: :: :: :::: :::::....:.:: : .:::: :: : ..:: .: .:: CCDS45 REGSFHLDPANLKGCTSCFCFGVNNQCHSSHKRRTKFVDMLGWHLETADRVDIPVSFNPG 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KA0 TEMLRADLRHVPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPME .. . :::...: .. : : :: :::::.:::::: : :. .: ::. : .: CCDS45 SNSMVADLQELPATIHSA----SWVAPTSYLGDKVSSYGGYLTYQAKSFGLPGDM-VLLE 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KA0 SRPDVVLQGNQMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASL ..::: : :..::: . : : : ..:.:....:::::::. .: ::::::: ::. : CCDS45 KKPDVQLTGQHMSIIYEETNTPRPDRLHHGRVHVVEGNFRHASSRAPVSREELMTVLSRL 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KA0 EQLQIRALFSQISSAVSLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFY ...:..:. .. ..: .:.:: :: .:.: .: ::.: :: .: ::::: :.::.: CCDS45 ADVRIQGLYFTETQRLTLSEVGLEEASDTGSGRIALAVEICACPPAYAGDSCQGCSPGYY 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1860 1870 1880 1890 1900 1910 pF1KA0 RDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDPSAPC :: :::. ::::::.:.:::..: :::.::.::::: : :::::: :.... : : CCDS45 RDHKGLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHGS--C 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1920 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KA0 VSCPCPLSVPSNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCD .:::: .:.:: :::. :: ..: :: ::.:..:::::::.:::: .:.:::::. CCDS45 RACPCP---HTNSFATGCVVNGGDVRCSCKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSCQPCS 1740 1750 1760 1770 1780 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KA0 CSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGT :..::. ...: :::: :: CCDS45 CNSNGQ----LGSCHPLTG----------------------------------DCIN--- 1790 1800 2040 2050 2060 2070 2080 2090 pF1KA0 EACDPRSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHC :: : .:: : CCDS45 ------------------------QE------------PKDSSPAEE------------- 1810 2100 2110 2120 2130 2140 2150 pF1KA0 RPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQ CCDS45 ------------------------------------------------------------ 2160 2170 2180 2190 2200 2210 pF1KA0 VPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNA :. :: ::. ::.:: : : .. ::.:..::. ....... CCDS45 -------------CDDCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQLQGLSASAGLLEQMRHMET 1820 1830 1840 1850 1860 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KA0 SIADLQSQL---RSPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAG . ::..:: :: .. : ....: ::.. :.:.:. . : .: . .:. : . CCDS45 QAKDLRNQLLNYRSAISNH---GSKIEGLERELTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQTLNNN 1870 1880 1890 1900 1910 1920 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KA0 TEATLGHAKTLLAAIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMR .. . :: : . :. : :.. :. CCDS45 VNRATQSAKELDVKIKNVIRNV--------HM---------------------------- 1930 1940 2330 2340 2350 2360 2370 2380 pF1KA0 ARDLGAPQAAAEAELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREA : :.. .. ::..::.. :: : ..:: : ::: CCDS45 ---------------------LNRIRTWQKTHQGENNGLANSIRDSLNEYEAKLSDLRAR 1950 1960 1970 1980 2390 2400 2410 2420 2430 2440 pF1KA0 LNRAVDATREAQELNSRNQERLEEALQRK-QELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLHS :..:. ...:. ::..: :: :.::. .:.. .. . : .: ..: .. :. CCDS45 LQEAAAQAKQANGLNQEN-ERALGAIQRQVKEINSLQSDFTKYLTTADSSLLQTNIALQL 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2450 2460 2470 2480 2490 2500 pF1KA0 LDQAKEELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSII ......: :.:::::. :: : .... .: ...: ::: :: ::..: .:: .: : CCDS45 MEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLVEEAEKHARSLQELAKQLEEIK 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2510 2520 2530 2540 2550 2560 pF1KA0 LDVNQDRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQLL ... :.:.. :..:..:: ::.:..::::::..: . .. . ::... : .:. : CCDS45 RNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAEDAANRAASASESALQTVIKEDLPRKAKTLS 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2570 2580 2590 2600 2610 2620 pF1KA0 ANSTAL-EEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAML-AMDTDE .:: : .:: . ... : ::.. . : : ..:. ..... . . : ... . CCDS45 SNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLTTLRDGLHGIQRGD 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2630 2640 2650 2660 2670 2680 pF1KA0 TSKKIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSVS . :. ::... .:.: . .: . :. .: .::: . : ...:. .:. :: .::. CCDS45 IDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDADNSVN 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2690 2700 2710 2720 2730 2740 pF1KA0 TLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRSG : . ::.: :. .... . ... : .. :.:::: ::: ::::: :::.:::.:: CCDS45 KLTNKLPDLWRKIESINQQLLPLGNI--SDNMDRIRELIQQARDAASKVAVPMRFNGKSG 2290 2300 2310 2320 2330 2340 2750 2760 2770 2780 2790 2800 pF1KA0 VQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKKV :..: : :: :: .::.:...:: :. . . :::. ::::.:...:. ::.:... : .. CCDS45 VEVRLPNDLEDLKGYTSLSLFLQRPNSRENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVVDGQL 2350 2360 2370 2380 2390 2400 2810 2820 2830 2840 2850 pF1KA0 HWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGE---KFAA---VSLDRTLQFGHMSVTV-ERQMIQETKG- ::.::. : :..:. . . : :. :...: ::.... : . :: : CCDS45 TCVYNLGDR-EAELQVDQILTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFARLNYTKGATSSKPETPGV 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2860 2870 2880 2890 2900 2910 pF1KA0 -DTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYNF : . ... :::: :.. :::::::: : : : :: :.::::.: :::.:.::::: CCDS45 YDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDDLNENVLSLYNF 2470 2480 2490 2500 2510 2520 2920 2930 2940 2950 2960 2970 pF1KA0 ERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLVSY ..::.:.:. .:: : : .: .:..:::.::. . . . : : .. . CCDS45 KKTFNLNTTEVEPCRRRKEE-----SDKNYFEGTGYARVPTQPH-APIPTFGQTIQTTVD 2530 2540 2550 2560 2570 2980 2990 3000 3010 3020 3030 pF1KA0 SGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFLLGGS :.::: .. ..:. : ...:.:.. : ... : : . .. ...::. .: CCDS45 RGLLFFAENGDRFISLNIEDGKLMVRYKLNSELPKERGVGDAIN-NGRDHSIQI-KIGKL 2580 2590 2600 2610 2620 2630 3040 3050 3060 3070 3080 3090 pF1KA0 RKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFP-TGGSVRGCVKGI .::. . :. : .. :... ..:::::.: ..:. : . . :::.:.. CCDS45 QKRMWINVD---VQNTIIDGEVFDFSTYYLGGIPI-----AIRERFNISTPAFRGCMKNL 2640 2650 2660 2670 2680 3100 3110 3120 3130 3140 3150 pF1KA0 KALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVA-PLTGNVYSGFGF : . : :. .:.::. :. : . :. .: : .:...... : : .. ..::: CCDS45 KKTSGVVRLN--DTVGVTKKCSEDWKLVRSASFSRGG--QLSFTDLGLPPTDHLQASFGF 2690 2700 2710 2720 2730 2740 3160 3170 3180 3190 3200 3210 pF1KA0 HSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLRTE---VKTQAGFADGAPHYVAFYSNA .. : :..: . . ::.:..: . :. . :. . :: :::. :. CCDS45 QTFQPSGILLDHQTWTRNLQVTLEDGYIELSTSDSGGPIFKSPQTYMDGLLHYVSVISDN 2750 2760 2770 2780 2790 2800 3220 3230 3240 3250 3260 3270 pF1KA0 TGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQRL .:. : .:::: . . . :. . : ::: :: ::::::::::: CCDS45 SGLRLLIDDQLLRNSKR------LKHISSSRQSLRLGG-------SNFEGCISNVFVQRL 2810 2820 2830 2840 3280 3290 3300 3310 3320 pF1KA0 -LGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CA---PALQAQTPGLGPRGLQATARKASRRSRQPARH :.:. :.:: .: . .:: : :. : . : . : : . . :. CCDS45 SLSPE-VLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQLLQDTPVAS 2850 2860 2870 2880 2890 2900 3330 3340 3350 3360 3370 pF1KA0 P--------ACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFV--GILARHRNWPSLSMHVLPRSS : :: :. .... . ::: .::: : : . :. ...:.. :: CCDS45 PRSVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQTT--SS 2910 2920 2930 2940 2950 2960 3380 3390 3400 3410 3420 3430 pF1KA0 RGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRWHKVSVRWEKN :::.. :. . .::.::.:..: . : .:: .:... :.:: : . . CCDS45 RGLVFHTGT---KNSFMALYLSKGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVFGHDGE 2970 2980 2990 3000 3010 3020 3440 3450 3460 3470 3480 3490 pF1KA0 RILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSKLPVTVGFSGCVKRLR . ::.:: :: : . . . : ...:. : :.. ..:: : .: ::.: .. CCDS45 KGRLVVDGLRAREGSLPGNSTISIRAP----VYLGS-PPSGKPKSLP-TNSFVGCLKNFQ 3030 3040 3050 3060 3070 3500 3510 3520 3530 3540 3550 pF1KA0 LHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVRPLAVT : ..:: .:. ::. :. :::: :..: :: ..: :. : . .:: ..: CCDS45 LDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIRPRSLT 3080 3090 3100 3110 3120 3130 3560 3570 3580 3590 3600 pF1KA0 GLIFHLGQARTPPYLQLQVLLRA-------DDGAGEFSTSVTRPSVLCDGQWHRLAVMKS :...:.: . : .: : :.: :.::: ::::: . ::::::: .:: . CCDS45 GILIHIG---SQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSVAVTIK 3140 3150 3160 3170 3180 3190 3610 3620 3630 3640 3650 3660 pF1KA0 GNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQPWP--PAYCGCMRRLAVN ..:.::.:..:..:.: . :.. ::.::: : ... : .. ::.: . :: CCDS45 QHILHLELDTDSSYTAGQIPFPPASTQEPLHLGGAPANLTTLRIPVWKSFFGCLRNIHVN 3200 3210 3220 3230 3240 3250 3670 3680 3690 pF1KA0 RSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA . :: .:...::.: :. .::: CCDS45 HIPVPVTEALEVQGPVSLNGCPDQ 3260 3270 >>CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3333 aa) initn: 5885 init1: 1705 opt: 2681 Z-score: 1535.2 bits: 299.2 E(32554): 3.4e-79 Smith-Waterman score: 8908; 39.8% identity (64.3% similar) in 3735 aa overlap (8-3688:9-3331) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MAKRLCAGSALCVRGPR-GPAPLLLVGLALLGA--ARAREE-AGGGFSLHPPYFNLAEG : :: :: :.::::. : .: : : ::. :..:.:::: ::::::. CCDS42 MAAAARPRGRAL---GPVLPPTPLLLLVLRVLPACGATARDPGAAAGLSLHPTYFNLAEA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 ARIAASATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAH ::: :.:::::..:..: :.: .:::::::::.: :. ..::.::.:: :.. . ::: CCDS42 ARIWATATCGERGPGEGRPQP--ELYCKLVGGPTAPGS-GHTIQGQFCDYCNSEDPRKAH 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 PASNAIDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERS :..:::::.:::::::::: : .::.::.::::::.:::::.:::::::::::::::::: CCDS42 PVTNAIDGSERWWQSPPLSSGTQYNRVNLTLDLGQLFHVAYILIKFANSPRPDLWVLERS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 MDFGRTYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLV .::: ::.:::.:: :: :::..:: .. .:::: ..:.:::::::::::::.::::. CCDS42 VDFGSTYSPWQYFAHSKVDCLKEFGREANMAVTRDDDVLCVTEYSRIVPLENGEVVVSLI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 NGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDIS :::::: ::..: :::::::::.::::::::::::::..:: ::::::::::::::::: CCDS42 NGRPGAKNFTFSHTLREFTKATNIRLRFLRTNTLLGHLISKAQRDPTVTRRYYYSIKDIS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 IGGRCVCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKPATANSANE :::.:::.:::..:. ..: :: : :::.::: :::::: :.::. :.::. ....: CCDS42 IGGQCVCNGHAEVCNINNPEKLFR--CECQHHTCGETCDRCCTGYNQRRWRPAAWEQSHE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 CQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCERCLPGFYRS :..:::.:::..:::::.:.:..:: . .: : ::::::.:::.:.:::::.: :.:: CCDS42 CEACNCHGHASNCYYDPDVERQQASLNTQGIYAGGGVCINCQHNTAGVNCEQCAKGYYRP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 PNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTGFPSCYPTP . :.:.: : :.:. . .:: ::. .:::.:.::: :. :. :: :. .:: : : CCDS42 YGVPVDAPDGCIPCSCDPEHADG-CEQGSGRCHCKPNFHGDNCEKCAIGYYNFPFCLRIP 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 SSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCELCAPGFYG ..:. CCDS42 ---------IFPV----------------------------------------------- 540 550 560 570 580 590 pF1KA0 PGCQPCQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTL :.:. :: .:. . : : :. :.: CCDS42 --------STPSSE----DPVAGDIK------G------------------CDCNLEGVL 480 490 600 610 620 630 640 650 pF1KA0 PEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAGGLCRCRPG :: :: :::::.: ::.:: :: :...:: :::: : CCDS42 PEICDAHGRCLCRPGVEGPRCDTCRSGFYSFPICQACWC--------------------- 500 510 520 530 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 YTGTACQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRPRVTGLRCDTCVPGAY :: :: . :. .::: ::: ::: ::: :. ::: CCDS42 ------------------------SALGSYQMPCSSVTGQCECRPGVTGQRCDRCLSGAY 540 550 560 570 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 NFPYCEAGS--CHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSPSNPEGC .::.:...: : ::: .. : :.:. :::::.:.::: .:.:. :: :: CCDS42 DFPHCQGSSSACDPAGT--INSNLGY----CQCKLHVEGPTCSRCKLLYWNLDKENPSGC 580 590 600 610 620 780 790 800 810 820 830 pF1KA0 TRCSCDLRGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCRSCRCDI ..:.: ::..:..::. : :.: :: :: :..: .:.::.:.:....::::..:.::: CCDS42 SECKCHKAGTVSGTGECRQGDGDCHCKSHVGGDSCDTCEDGYFALEKSNYFGCQGCQCDI 630 640 650 660 670 680 840 850 860 870 880 890 pF1KA0 GGALGQSCEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHAMRFGF ::::.. : .:::.:: .. : .:..: ..:.:::::.. :.:...::.:. .:::: CCDS42 GGALSSMCSGPSGVCQCREHVVGKVCQRPENNYYFPDLHHMKYEIEDGSTPNGRDLRFGF 690 700 710 720 730 740 900 910 920 930 940 950 pF1KA0 NPLEFENFSWRGYAQMAPVQPRIVARLNL--TSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSVREE .:: : .:::::::::. :: . ::. .: .:: ...:::: :. .:::.... CCDS42 DPLAFPEFSWRGYAQMTSVQNDVRITLNVGKSSGSLFRVILRYVNPGTEAVSGHITIYPS 750 760 770 780 790 800 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA0 GRSATCANCTAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFVLNPGTWALRVEAEGVLLDYVV .: ::. . : :: ::::.::: ::..:: ..:: :. ..::::::::.: CCDS42 WGAA-------QSKEIIFLPSKEPAFVTVPGNGFADPFSITPGIWVACIKAEGVLLDYLV 810 820 830 840 850 860 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA0 LLPSAYYEAALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCRQDNSL ::: ::::..::: ::: :.: :. ::::: :::. :: . . :: .. CCDS42 LLPRDYYEASVLQLPVTEPCAYAGPPQE---NCLLYQHLPVTRFPCTLACEARHFLLDGE 870 880 890 900 910 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KA0 PRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGVAVHTP ::: ..: .:.:: .. .: .:...:.. .:: :.:..::::..: :. : : :.. CCDS42 PRPVAVRQPTPAHPVMVDLSGREVELHLRLRIPQVGHYVVVVEYSTEAAQLFV-VDVNVK 920 930 940 950 960 970 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KA0 QRAP-QQGLLSLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHGVTLV . . : .... : ::.:::... : ....:...: ..:...: ...:::.:: : .. CCDS42 SSGSVLAGQVNIYSCNYSVLCRSAVIDHMSRIAMYELLADADIQLKGHMARFLLHQVCII 980 990 1000 1010 1020 1030 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KA0 PIEEFSPEFVEPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGLPLTH :::::: :.:.:.: ::.:.: : .::.:. :: .:: .:. : :. : CCDS42 PIEEFSAEYVRPQVHCIASYGRFVNQSATCVSLAHETPPTALIL---DVL---SGRPFPH 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KA0 AQDLTPAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGYQPAH : .: : . : : . :. :: :.. .:: ::::.:..: :: :: CCDS42 ----LPQQSS------PSVDVLPGVT---LKAPQNQVTLRGRVPHLGRYVFVIHFYQAAH 1100 1110 1120 1130 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KA0 PTFPVEVLINAGRVWQGHANASFCPHGYGCRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPEGRW ::::..: ...: : .:::::: ::: :. ::: .:... :...::.::::. CCDS42 PTFPAQVSVDGGWPRAGSFHASFCPHVLGCRDQVIAEGQIEFDISEPEVAATVKVPEGKS 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KA0 LWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLF : : ::::: . :.. :... .::: .::..:. ......:...: ::.:.: :: : CCDS42 LVLVRVLVVPAENYDYQILHKKSMDKSLEFITNCGKNSFYLDPQTASRFCKNSARSLVAF 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KA0 YNNGARPCGCHEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPNCRPCDCGARL :..:: :: :: .::::: : : ::::::. .::::.:.:::::..::: :.::.:: :: CCDS42 YHKGALPCECHPTGATGPHCSPEGGQCPCQPNVIGRQCTRCATGHYGFPRCKPCSCGRRL 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KA0 CDELTGQCICPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQC :.:.:::: :::::. :.: .:. ..:. ::..::: :::: : : . : :: ::::: CCDS42 CEEMTGQCRCPPRTVRPQCEVCETHSFSFHPMAGCEGCNCSRRGTIEAAMPECDRDSGQC 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KA0 KCRPNVTGRRCDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQC .:.: .:::.:: :. ::. .:.: ::.:.. :: :::::: :: : :::::.: .:. : CCDS42 RCKPRITGRQCDRCASGFYRFPECVPCNCNRDGTEPGVCDPGTGACLCKENVEGTECNVC 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KA0 SLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFVDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPG :.: :: :: :::: :::::....:.:: : .:::: :: : ..:: .: .:: CCDS42 REGSFHLDPANLKGCTSCFCFGVNNQCHSSHKRRTKFVDMLGWHLETADRVDIPVSFNPG 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KA0 TEMLRADLRHVPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPME .. . :::...: .. : : :: :::::.:::::: : :. .: ::. : .: CCDS42 SNSMVADLQELPATIHSA----SWVAPTSYLGDKVSSYGGYLTYQAKSFGLPGDM-VLLE 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KA0 SRPDVVLQGNQMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSREELMMVLASL ..::: : :..::: . : : : ..:.:....:::::::. .: ::::::: ::. : CCDS42 KKPDVQLTGQHMSIIYEETNTPRPDRLHHGRVHVVEGNFRHASSRAPVSREELMTVLSRL 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KA0 EQLQIRALFSQISSAVSLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFY ...:..:. .. ..: .:.:: :: .:.: .: ::.: :: .: ::::: :.::.: CCDS42 ADVRIQGLYFTETQRLTLSEVGLEEASDTGSGRIALAVEICACPPAYAGDSCQGCSPGYY 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1860 1870 1880 1890 1900 1910 pF1KA0 RDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDPSAPC :: :::. ::::::.:.:::..: :::.::.::::: : :::::: :.... : : CCDS42 RDHKGLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHGS--C 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1920 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KA0 VSCPCPLSVPSNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCD .:::: .:.:: :::. :: ..: :: ::.:..:::::::.:::: .:.:::::. CCDS42 RACPCP---HTNSFATGCVVNGGDVRCSCKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSCQPCS 1740 1750 1760 1770 1780 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KA0 CSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGT :..::. ...: :::: :: CCDS42 CNSNGQ----LGSCHPLTG----------------------------------DCIN--- 1790 1800 2040 2050 2060 2070 2080 2090 pF1KA0 EACDPRSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHC :: : .:: : CCDS42 ------------------------QE------------PKDSSPAEE------------- 1810 2100 2110 2120 2130 2140 2150 pF1KA0 RPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQ CCDS42 ------------------------------------------------------------ 2160 2170 2180 2190 2200 2210 pF1KA0 VPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNA :. :: ::. ::.:: : : .. ::.:..::. ....... CCDS42 -------------CDDCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQLQGLSASAGLLEQMRHMET 1820 1830 1840 1850 1860 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KA0 SIADLQSQL---RSPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAG . ::..:: :: .. : ....: ::.. :.:.:. . : .: . .:. : . CCDS42 QAKDLRNQLLNYRSAISNH---GSKIEGLERELTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQTLNNN 1870 1880 1890 1900 1910 1920 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KA0 TEATLGHAKTLLAAIRAVDRTLSELMSQ-TGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEM .. . :: : . :. : :.. :..: .: : .: ..:::. . : ::..:.. :. CCDS42 VNRATQSAKELDVKIKNVIRNVHILLKQISGTDGEGN-NVPSGD-FSREWAEAQRMMREL 1930 1940 1950 1960 1970 1980 2330 2340 2350 2360 2370 2380 pF1KA0 RARDLGAPQAAAEAELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLRE : :..: :::. .: :: :.. .. ::..::.. :: : ..:: : ::: CCDS42 RNRNFGKHLREAEADKRESQLLLNRIRTWQKTHQGENNGLANSIRDSLNEYEAKLSDLRA 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2390 2400 2410 2420 2430 2440 pF1KA0 ALNRAVDATREAQELNSRNQERLEEALQRK-QELSRDNATLQATLHAARDTLASVFRLLH :..:. ...:. ::..: :: :.::. .:.. .. . : .: ..: .. :. CCDS42 RLQEAAAQAKQANGLNQEN-ERALGAIQRQVKEINSLQSDFTKYLTTADSSLLQTNIALQ 2050 2060 2070 2080 2090 2450 2460 2470 2480 2490 2500 pF1KA0 SLDQAKEELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSI ......: :.:::::. :: : .... .: ...: ::: :: ::..: .:: .: : CCDS42 LMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLVEEAEKHARSLQELAKQLEEI 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2510 2520 2530 2540 2550 2560 pF1KA0 ILDVNQDRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQL ... :.:.. :..:..:: ::.:..::::::..: . .. . ::... : .:. : CCDS42 KRNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAEDAANRAASASESALQTVIKEDLPRKAKTL 2160 2170 2180 2190 2200 2210 2570 2580 2590 2600 2610 2620 pF1KA0 LANSTAL-EEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAML-AMDTD .:: : .:: . ... : ::.. . : : ..:. ..... . . : ... CCDS42 SSNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLTTLRDGLHGIQRG 2220 2230 2240 2250 2260 2270 2630 2640 2650 2660 2670 2680 pF1KA0 ETSKKIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAGHSV . . :. ::... .:.: . .: . :. .: .::: . : ...:. .:. :: .:: CCDS42 DIDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDADNSV 2280 2290 2300 2310 2320 2330 2690 2700 2710 2720 2730 2740 pF1KA0 STLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNGRS . : . ::.: :. .... . ... : .. :.:::: ::: ::::: :::.:::.: CCDS42 NKLTNKLPDLWRKIESINQQLLPLGNI--SDNMDRIRELIQQARDAASKVAVPMRFNGKS 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2750 2760 2770 2780 2790 2800 pF1KA0 GVQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRDKK ::..: : :: :: .::.:...:: :. . . :::. ::::.:...:. ::.:... : . CCDS42 GVEVRLPNDLEDLKGYTSLSLFLQRPNSRENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVVDGQ 2400 2410 2420 2430 2440 2450 2810 2820 2830 2840 2850 pF1KA0 VHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGE---KFAA---VSLDRTLQFGHMSVTV-ERQMIQETKG . ::.::. : :..:. . . : :. :...: ::.... : . :: : CCDS42 LTCVYNLGDR-EAELQVDQILTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFARLNYTKGATSSKPETPG 2460 2470 2480 2490 2500 2510 2860 2870 2880 2890 2900 2910 pF1KA0 --DTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYN : . ... :::: :.. :::::::: : : : :: :.::::.: :::.:.:::: CCDS42 VYDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDDLNENVLSLYN 2520 2530 2540 2550 2560 2570 2920 2930 2940 2950 2960 2970 pF1KA0 FERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLVS :..::.:.:. .:: : : .: .:..:::.::. . . . : : .. . CCDS42 FKKTFNLNTTEVEPCRRRKEE-----SDKNYFEGTGYARVPTQPH-APIPTFGQTIQTTV 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2980 2990 3000 3010 3020 3030 pF1KA0 YSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFLLGG :.::: .. ..:. : ...:.:.. : ... : : . .. ...::. .: CCDS42 DRGLLFFAENGDRFISLNIEDGKLMVRYKLNSELPKERGVGDAIN-NGRDHSIQI-KIGK 2640 2650 2660 2670 2680 3040 3050 3060 3070 3080 3090 pF1KA0 SRKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFP-TGGSVRGCVKG .::. . :. : .. :... ..:::::.: ..:. : . . :::.:. CCDS42 LQKRMWINVD---VQNTIIDGEVFDFSTYYLGGIPI-----AIRERFNISTPAFRGCMKN 2690 2700 2710 2720 2730 2740 3100 3110 3120 3130 3140 3150 pF1KA0 IKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVA-PLTGNVYSGFG .: . : :. .:.::. :. : . :. .: : .:...... : : .. ..:: CCDS42 LKKTSGVVRLN--DTVGVTKKCSEDWKLVRSASFSRGG--QLSFTDLGLPPTDHLQASFG 2750 2760 2770 2780 2790 3160 3170 3180 3190 3200 pF1KA0 FHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLRTE---VKTQAGFADGAPHYVAFYSN :.. : :..: . . ::.:..: . :. . :. . :: :::. :. CCDS42 FQTFQPSGILLDHQTWTRNLQVTLEDGYIELSTSDSGGPIFKSPQTYMDGLLHYVSVISD 2800 2810 2820 2830 2840 2850 3210 3220 3230 3240 3250 3260 pF1KA0 ATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQR .:. : .:::: . . . :. . : ::: :: :::::::::: CCDS42 NSGLRLLIDDQLLRNSKR------LKHISSSRQSLRLGG-------SNFEGCISNVFVQR 2860 2870 2880 2890 2900 3270 3280 3290 3300 3310 3320 pF1KA0 L-LGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CA---PALQAQTPGLGPRGLQATARKASRRSRQPAR : :.:. :.:: .: . .:: : :. : . : . : : . . :. CCDS42 LSLSPE-VLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQLLQDTPVA 2910 2920 2930 2940 2950 2960 3330 3340 3350 3360 3370 pF1KA0 HP--------ACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFV--GILARHRNWPSLSMHVLPRS : :: :. .... . ::: .::: : : . :. ...:.. : CCDS42 SPRSVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQTT--S 2970 2980 2990 3000 3010 3020 3380 3390 3400 3410 3420 3430 pF1KA0 SRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRWHKVSVRWEK ::::.. :. . .::.::.:..: . : .:: .:... :.:: : . CCDS42 SRGLVFHTGT---KNSFMALYLSKGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVFGHDG 3030 3040 3050 3060 3070 3440 3450 3460 3470 3480 3490 pF1KA0 NRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSKLPVTVGFSGCVKRL .. ::.:: :: : . . . : ...:. : :.. ..:: : .: ::.: . CCDS42 EKGRLVVDGLRAREGSLPGNSTISIRAP----VYLGS-PPSGKPKSLP-TNSFVGCLKNF 3080 3090 3100 3110 3120 3130 3500 3510 3520 3530 3540 3550 pF1KA0 RLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVRPLAV .: ..:: .:. ::. :. :::: :..: :: ..: :. : . .:: .. CCDS42 QLDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIRPRSL 3140 3150 3160 3170 3180 3190 3560 3570 3580 3590 3600 pF1KA0 TGLIFHLGQARTPPYLQLQVLLRA-------DDGAGEFSTSVTRPSVLCDGQWHRLAVMK ::...:.: . : .: : :.: :.::: ::::: . ::::::: .:: CCDS42 TGILIHIG---SQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSVAVTI 3200 3210 3220 3230 3240 3610 3620 3630 3640 3650 3660 pF1KA0 SGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQPWP--PAYCGCMRRLAV . ..:.::.:..:..:.: . :.. ::.::: : ... : .. ::.: . : CCDS42 KQHILHLELDTDSSYTAGQIPFPPASTQEPLHLGGAPANLTTLRIPVWKSFFGCLRNIHV 3250 3260 3270 3280 3290 3300 3670 3680 3690 pF1KA0 NRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA :. :: .:...::.: :. .::: CCDS42 NHIPVPVTEALEVQGPVSLNGCPDQ 3310 3320 3330 >>CCDS11880.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (1724 aa) initn: 1764 init1: 673 opt: 1743 Z-score: 1004.8 bits: 200.1 E(32554): 1.2e-49 Smith-Waterman score: 2841; 32.3% identity (58.5% similar) in 1917 aa overlap (1818-3688:40-1722) 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KA0 ASLEQLQIRALFSQISSAVSLRRVALEVASPAGQGAL-ASNVELCLCPASYRGDSCQECA : ::. : :: :: .: . : :. CCDS11 CSMGWLWIFGAALGQCLGYSSQQQRVPFLQPPGQSQLQASYVE-------FRPS--QGCS 10 20 30 40 50 60 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KA0 PGFYRDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDP ::.::: :::. ::::::.:.:::..: :::.::.::::: : :::::: :.... CCDS11 PGYYRDHKGLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHG 70 80 90 100 110 120 1910 1920 1930 1940 1950 1960 pF1KA0 SAPCVSCPCPLSVPSNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSC : : .:::: .:.:: :::. :: ..: :: ::.:..:::::::.:::: .:.:: CCDS11 S--CRACPCP---HTNSFATGCVVNGGDVRCSCKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSC 130 140 150 160 170 1970 1980 1990 2000 2010 2020 pF1KA0 QPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCT :::.:..::. ...: :::: :: CCDS11 QPCSCNSNGQ----LGSCHPLTG----------------------------------DCI 180 190 2030 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KA0 PCGTEACDPRSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSG :: : .:: : CCDS11 N---------------------------QE------------PKDSSPAEE--------- 200 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KA0 QCHCRPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCS CCDS11 ------------------------------------------------------------ 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KA0 QQHQVPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLH :. :: ::. ::.:: : : .. ::.:..::. ... CCDS11 -----------------CDDCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQLQGLSASAGLLEQMR 210 220 230 240 250 2210 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KA0 RLNASIADLQSQL---RSPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQ ..... ::..:: :: .. : ....: ::.. :.:.:. . : .: . .:. CCDS11 HMETQAKDLRNQLLNYRSAISNH---GSKIEGLERELTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQT 260 270 280 290 300 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KA0 LLAGTEATLGHAKTLLAAIRAVDRTLSELMSQ-TGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERL : ... . :: : . :. : :.. :..: .: : .: ..:::. . : ::..:. CCDS11 LNNNVNRATQSAKELDVKIKNVIRNVHILLKQISGTDGEGN-NVPSGD-FSREWAEAQRM 310 320 330 340 350 360 2330 2340 2350 2360 2370 2380 pF1KA0 LWEMRARDLGAPQAAAEAELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLM . :.: :..: :::. .: :: :.. .. ::..::.. :: : ..:: : CCDS11 MRELRNRNFGKHLREAEADKRESQLLLNRIRTWQKTHQGENNGLANSIRDSLNEYEAKLS 370 380 390 400 410 420 2390 2400 2410 2420 2430 2440 pF1KA0 DLREALNRAVDATREAQELNSRNQERLEEALQRK-QELSRDNATLQATLHAARDTLASVF ::: :..:. ...:. ::..: :: :.::. .:.. .. . : .: ..: .. CCDS11 DLRARLQEAAAQAKQANGLNQEN-ERALGAIQRQVKEINSLQSDFTKYLTTADSSLLQTN 430 440 450 460 470 480 2450 2460 2470 2480 2490 2500 pF1KA0 RLLHSLDQAKEELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALN :. ......: :.:::::. :: : .... .: ...: ::: :: ::..: .:: . CCDS11 IALQLMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLVEEAEKHARSLQELAKQ 490 500 510 520 530 540 2510 2520 2530 2540 2550 2560 pF1KA0 LSSIILDVNQDRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDR : : ... :.:.. :..:..:: ::.:..::::::..: . .. . ::... : . CCDS11 LEEIKRNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAEDAANRAASASESALQTVIKEDLPRK 550 560 570 580 590 600 2570 2580 2590 2600 2610 pF1KA0 AQQLLANSTAL-EEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAML-A :. : .:: : .:: . ... : ::.. . : : ..:. ..... . . : . CCDS11 AKTLSSNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLTTLRDGLHG 610 620 630 640 650 660 2620 2630 2640 2650 2660 2670 pF1KA0 MDTDETSKKIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDA .. . . :. ::... .:.: . .: . :. .: .::: . : ...:. .:. :: CCDS11 IQRGDIDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDA 670 680 690 700 710 720 2680 2690 2700 2710 2720 2730 pF1KA0 GHSVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKF .::. : . ::.: :. .... . ... : .. :.:::: ::: ::::: :::.: CCDS11 DNSVNKLTNKLPDLWRKIESINQQLLPLGNI--SDNMDRIRELIQQARDAASKVAVPMRF 730 740 750 760 770 780 2740 2750 2760 2770 2780 2790 pF1KA0 NGRSGVQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSL ::.:::..: : :: :: .::.:...:: :. . . :::. ::::.:...:. ::.:... CCDS11 NGKSGVEVRLPNDLEDLKGYTSLSLFLQRPNSRENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAV 790 800 810 820 830 840 2800 2810 2820 2830 2840 2850 pF1KA0 RDKKVHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGE---KFAA---VSLDRTLQFGHMSVTV-ERQMIQ : .. ::.::. : :..:. . . : :. :...: ::.... : . CCDS11 VDGQLTCVYNLGDR-EAELQVDQILTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFARLNYTKGATSSKP 850 860 870 880 890 900 2860 2870 2880 2890 2900 2910 pF1KA0 ETKG--DTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVV :: : : . ... :::: :.. :::::::: : : : :: :.::::.: :::.:. CCDS11 ETPGVYDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDDLNENVL 910 920 930 940 950 960 2920 2930 2940 2950 2960 2970 pF1KA0 SLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQEL :::::..::.:.:. .:: : : .: .:..:::.::. . . . : : . CCDS11 SLYNFKKTFNLNTTEVEPCRRRKEE-----SDKNYFEGTGYARVPTQPH-APIPTFGQTI 970 980 990 1000 1010 2980 2990 3000 3010 3020 3030 pF1KA0 RLVSYSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVF . . :.::: .. ..:. : ...:.:.. : ... : : . .. ...::. CCDS11 QTTVDRGLLFFAENGDRFISLNIEDGKLMVRYKLNSELPKERGVGDAIN-NGRDHSIQI- 1020 1030 1040 1050 1060 1070 3040 3050 3060 3070 3080 pF1KA0 LLGGSRKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFP-TGGSVRG .: .::. . :. : .. :... ..:::::. : ..:. : . . :: CCDS11 KIGKLQKRMWINVD---VQNTIIDGEVFDFSTYYLGGI-----PIAIRERFNISTPAFRG 1080 1090 1100 1110 1120 3090 3100 3110 3120 3130 3140 pF1KA0 CVKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVA-PLTGNVY :.:..: . : :. .:.::. :. : . :. .: : .:...... : : .. CCDS11 CMKNLKKTSGVVRLN--DTVGVTKKCSEDWKLVRSASFSRGG--QLSFTDLGLPPTDHLQ 1130 1140 1150 1160 1170 1180 3150 3160 3170 3180 3190 3200 pF1KA0 SGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLRTE---VKTQAGFADGAPHYVA ..:::.. : :..: . . ::.:..: . :. . :. . :: :::. CCDS11 ASFGFQTFQPSGILLDHQTWTRNLQVTLEDGYIELSTSDSGGPIFKSPQTYMDGLLHYVS 1190 1200 1210 1220 1230 1240 3210 3220 3230 3240 3250 3260 pF1KA0 FYSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNV :. .:. : .:::: . . . :. . : ::: :: :::::: CCDS11 VISDNSGLRLLIDDQLLRNSKR------LKHISSSRQSLRLGG-------SNFEGCISNV 1250 1260 1270 1280 1290 3270 3280 3290 3300 3310 3320 pF1KA0 FVQRL-LGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CA---PALQAQTPGLGPRGLQATARKASRRSR ::::: :.:. :.:: .: . .:: : :. : . : . : : . . CCDS11 FVQRLSLSPE-VLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQLLQD 1300 1310 1320 1330 1340 3330 3340 3350 3360 3370 pF1KA0 QPARHP--------ACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFV--GILARHRNWPSLSMHV :. : :: :. .... . ::: .::: : : . :. ...:.. CCDS11 TPVASPRSVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQT 1350 1360 1370 1380 1390 1400 3380 3390 3400 3410 3420 3430 pF1KA0 LPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRWHKVSV :::::.. :. . .::.::.:..: . : .:: .:... :.:: : CCDS11 T--SSRGLVFHTGT---KNSFMALYLSKGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVF 1410 1420 1430 1440 1450 1460 3440 3450 3460 3470 3480 3490 pF1KA0 RWEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSKLPVTVGFSGC . .. ::.:: :: : . . . : ...:. : :.. ..:: : .: :: CCDS11 GHDGEKGRLVVDGLRAREGSLPGNSTISIRAP----VYLGS-PPSGKPKSLP-TNSFVGC 1470 1480 1490 1500 1510 3500 3510 3520 3530 3540 3550 pF1KA0 VKRLRLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVR .: ..: ..:: .:. ::. :. :::: :..: :: ..: :. : . .: CCDS11 LKNFQLDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIR 1520 1530 1540 1550 1560 1570 3560 3570 3580 3590 3600 pF1KA0 PLAVTGLIFHLGQARTPPYLQLQVLLRA-------DDGAGEFSTSVTRPSVLCDGQWHRL : ..::...:.: . : .: : :.: :.::: ::::: . ::::::: . CCDS11 PRSLTGILIHIG---SQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSV 1580 1590 1600 1610 1620 1630 3610 3620 3630 3640 3650 3660 pF1KA0 AVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQPWP--PAYCGCMR :: . ..:.::.:..:..:.: . :.. ::.::: : ... : .. ::.: CCDS11 AVTIKQHILHLELDTDSSYTAGQIPFPPASTQEPLHLGGAPANLTTLRIPVWKSFFGCLR 1640 1650 1660 1670 1680 1690 3670 3680 3690 pF1KA0 RLAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA . ::. :: .:...::.: :. .::: CCDS11 NIHVNHIPVPVTEALEVQGPVSLNGCPDQ 1700 1710 1720 >>CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18 (3075 aa) initn: 2084 init1: 520 opt: 1432 Z-score: 825.2 bits: 167.7 E(32554): 1.2e-39 Smith-Waterman score: 3083; 25.3% identity (49.1% similar) in 3816 aa overlap (22-3688:5-3071) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA .::: : : ::. :... : : .::: .:.:.. CCDS32 MRGGVLLV-LLLCVAAQCRQRG-----LFPAILNLASNAHIST 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KA0 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDIC--TAANSNKAHPAS .:::::..: ...:::: :.. .:. : :: ..:: . :: : CCDS32 NATCGEKGP---------EMFCKLVEHV-----PGRPVRNPQCRICDGNSANPRERHPIS 40 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 NAIDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDF .:::::. ::::: .. : ::. :..:::: :::.::::.:: ::.::: :.::::.: CCDS32 HAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVAYVIIKAANAPRPGNWILERSLD- 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 GRTYQPWQFFASSKRDCLERF------GPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVV : :..:::..: : .:: :. :: : . :: .:::. :::.::::.::: . CCDS32 GTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRA---DDEVICTSYYSRLVPLEHGEIHT 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 pF1KA0 SLVNGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALR-----DPTVTRRY ::.::::.: ..: : : :::.: .:::. : :: . :: . : :: ::::: CCDS32 SLINGRPSADDLS--PKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRY 200 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 YYSIKDISIGGRCVCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKP ::::::::.:: :.:.:::..: . : .::: :.::::: .:.:::::..::::.: CCDS32 YYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTK--KLQCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRP 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 ATANSANECQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCER .:..:.: :..:::...: ::::: : ... : . : ..::::::.: ..: :.::: CCDS32 GTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCET 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 CLPGFYRSPNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTG :. :.:: : : . ::. :: ::: CCDS32 CIDGYYR-P-HKV-SPY----------------EDEP----CRP---------------- 380 390 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 FPSCYPTPSSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCE :.:. .:. ...: :: : . CCDS32 --------------------------CNCDPVGSLSSVCIKD-------------DLHSD 400 410 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 LCAPGFYGPGCQPCQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLC : : :: ::: :. :. : :::: :: .: : : CCDS32 LHN------GKQP-----------------GQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSC 420 430 440 450 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 GCSPAGTLPEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAG ::.:.:. . :: CCDS32 GCNPVGS---ASDE---------------------------------------------- 460 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 GLCRCRPGYTGTACQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRPRVTGLRC :: :: CCDS32 ----------------------------PC-------------------------TG--- 710 720 730 740 750 760 pF1KA0 DTCVPGAYNFPYCEAGSCHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSP ::.:. .::: .::::::::..:. CCDS32 -----------------------------------PCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKE 470 480 490 770 780 790 800 810 820 pF1KA0 SNPEGCTRCSCDLRGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCR .::.::..: : ::.. : ::. . .:.. : . CCDS32 KNPRGCSECFC------FGVSDV------CSSLSWPVGQV--NSMSGWLVTDLISPRKIP 500 510 520 530 540 830 840 850 860 870 880 pF1KA0 SCRCDIGGALGQSCEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGH : . .:: : . . . : :. .: :.::.. CCDS32 SQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPK------------YYW-------------AAPEAY 550 560 570 890 900 910 920 930 940 pF1KA0 AMRFGFNPLEFENFSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVS .: . : .: . ::. :. . :: . : CCDS32 ---LGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVET--------------------VDSNLMS-HADVI 580 590 600 610 950 960 970 980 990 1000 pF1KA0 VREEGRSATCANCTAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFV-LNPGTWALRVEAEGVL .. .: . . .:.. ... : : ...: : : : .. : . :: CCDS32 IKGNGLTLS-----TQAEGLSLQPYEE--YLNVV-RLVPENFQDFHSKRQIDRDQLMTVL 620 630 640 650 660 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA0 LDYVVLLPSAYYEAALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCR . . :: : :..: . : :. . ..... : . :: .: :. CCDS32 ANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVV------------AADVEH-CE 670 680 690 700 710 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA0 QDNSLPRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGV :: ::.. . :. : : . :. :. CCDS32 --------CPQGY-----------TGTSCESCLS------GYYRV-------DGILFGGI 720 730 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA0 AVHTPQRAPQQGLLSLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHG .:: :.: : .: .: :: CCDS32 C---------------QPCE----CHGHA-------------AECNV-----------HG 740 750 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA0 VTLVPIEEFSPEFVEPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGL : ..: .:.. : . :::. . .: . ::: : . CCDS32 VC---------------IAC--AHNTTGVHCEQCLPGFYGEPSRGTP-GDCQ----PCAC 760 770 780 790 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA0 PLTHAQDLTPAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGY ::: :.. .::. : : : . .. : : :: CCDS32 PLTIASN---NFSPTCHLN------DGDEVVCDWCAPGYSGAWCE------RCA---DGY 800 810 820 830 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KA0 QPAHPTFPVEVLIN---AGRVWQGHANASFCPHGYG-CRTLVVCEGQALLDVTHSELTVT ..:: : : . .: : ..:. : : : . : :.. : .: : CCDS32 Y-GNPTVPGESCVPCDCSGNV--DPSEAGHCDSVTGEC---LKCLGNT--DGAHCE---- 840 850 860 870 880 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KA0 VRVPEGRWLWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRN : .: .. : : . .: . : . :.. . : . .:. .. : . CCDS32 -RCADG--FYGDAVTA--KNCRAC----ECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQ 890 900 910 920 930 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA0 AAASL-SLFYNNGARPCGCHEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPN- . .: ..: :::.: .:... : : :: : : :. :.::: :.... . CCDS32 CLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTDEG-QCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDG 940 950 960 970 980 990 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KA0 -CRPCDCG--ARLCDELTGQCICPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQE : :::: :: ::.:.:::.: : :. .: :::. :::: : CCDS32 SCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVG--- 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KA0 LTDPTCDTDSGQCKCRPNVTGRRCDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCD------- : ::. .:.:.:. . :: :: :: :.. .: : :::: ::. .:. CCDS32 STHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCG 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KA0 --PLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRS-SSYTRQEF :: : ::::: ::.:..: :::.: : :: ::. ::: : .. : .:.: CCDS32 CVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPV 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KA0 VDMEGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRHVPEAVPE---AFPELYWQAPPSYLGDR . :: . : . :. . :. .: . : : .::. : .. ::. CCDS32 TLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPDFLLDAATVRQHIRAEP-FYWRLPQQFQGDQ 1180 1190 1200 1210 1220 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KA0 VSSYGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGNQM--SITFLEPAYPTPGHVHRGQL . .::: :.: . . : .: :.:...:... .. ... : : .. .. CCDS32 LMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFE--PQVLIKGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEV 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KA0 QLVEGNFRH--TETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFSQISSAVSLRRVALEVASPA- . :. ... . ... :.::..: ::...: . :.: ..: . . ...::. : CCDS32 AMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAE 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KA0 ---GQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDV------KGL--FLGRCVPCQCHG . .:: .: :.:: . : :::.::::..: .: ... ::::.:.. CCDS32 KLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNN 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KA0 HSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDPSAPCVSCPCPLSVPSNNFAEGC ::: : :..: :..: :: : ::. : .:.... .. :. : :: : :.. :. : CCDS32 HSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYGKVTGSASDCALCACPHSPPAS-FSPTC 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KA0 VLRGGRT-QC-LCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLLFSDCDP ::.: . .: : :: : ::::. ...::: . :.::: :::. .:. CCDS32 VLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQTPGGSCQKCDCNPHGS---------- 1470 1480 1490 1500 1510 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KA0 LTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPRSGHCLCKAGV .:. :: ::.:.:. :. CCDS32 -----------------------VHGD-------------------CDRTSGQCVCRLGA 1520 1530 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KA0 TGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCRECAPGY .: :::.:. :. CCDS32 SGLRCDECEPRHI----------------------------------------------- 1540 2110 2120 2130 2140 2150 2160 pF1KA0 WGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGHSIHCEV : : : :. CCDS32 --LMETDCVSCD------------------------------------------------ 1550 2170 2180 2190 2200 2210 2220 pF1KA0 CDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNASIADLQSQLRSPLGPH :.:: .::.::.. : . ... : :: . .. : :. . :: .: . . CCDS32 -DECVGVLLNDLDEIGDAVLSLN--LTGII--PVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQK 1560 1570 1580 1590 1600 1610 2230 2240 2250 2260 2270 2280 pF1KA0 HETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAGTEATLGHAKTLLAAIRAVD .:: . ... .: . :. ... ..... .:: . ... : ::. .. CCDS32 DLGKIKLEGVAEETDNLQKKLTRM----LASTQKVNR---ATERIFKESQDLAIAIERLQ 1620 1630 1640 1650 1660 2290 2300 2310 2320 2330 pF1KA0 RTLSELMSQTG-------HLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARDLGAPQAAAE ...:.: .: . : :.. . .: .: :. :. ::. . : CCDS32 MSITEIMEKTTLNQTLDEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEI------MQIRDFTQLHQNAT 1670 1680 1690 1700 1710 2340 2350 2360 2370 2380 2390 pF1KA0 AELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDAT-REA :: ::. ::...::. .. :: ..: . :..:. : ::: : ..: .:. CCDS32 LELKAAEDLLSQIQENYQKPLEELEVLKEAASHVLSKHNNEL-KAAEALVREAEAKMQES 1720 1730 1740 1750 1760 1770 2400 2410 2420 2430 2440 2450 pF1KA0 QEL----NSRNQERLEEAL--QRKQELSRDNATL-QATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAK ..: :. .: .. : :..:.:. . . .. . :: .: :. :.. . CCDS32 NHLLLMVNANLREFSDKKLHVQEEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQ 1780 1790 1800 1810 1820 1830 2460 2470 2480 2490 2500 2510 pF1KA0 EELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIILDVNQ ..: .:.. :...:. . . :: :: :: .. .:: : : . .. . CCDS32 DKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMSQRNAVD----LVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRN 1840 1850 1860 1870 1880 1890 2520 2530 2540 2550 2560 2570 pF1KA0 DRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQLLANSTA :. : :. .. : . .. .:. : .: . . .: ... ..::. .. . :. CCDS32 VSLN--ATSAAYVHYNIQSLIEESEELARDAHRTVTET--SLLSESLVSNGKAAVQRSSR 1900 1910 1920 1930 1940 1950 2580 2590 2600 2610 2620 pF1KA0 LEEAMLQEQQRLG--LVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDTDETS--K . :.: . :. : ::. .. . . : ... .: :. ...: . . . CCDS32 F----LKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQENAVEITRQTNESLLILRAIPKGIRD 1960 1970 1980 1990 2000 2630 2640 2650 2660 2670 pF1KA0 KIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYE----GLRG-----QDLGQAVLD : :..: .:. :...:. . .. ...... ... :: :: .:.: CCDS32 KGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTSASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLL 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2680 2690 2700 2710 2720 2730 pF1KA0 AGHSVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMK ::..:. .: :. .:. :. :: ...... ::.::: :...:: .. CCDS32 AGRKVKDVEIQANLLFDRLKPLKM-----LEENLSRNLSEIKLLISQARKQAASIKVAVS 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2740 2750 2760 2770 2780 2790 pF1KA0 FNGRSGVQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVS . :. .. :. . . :..: . .. :: : ...:.:: :. :...: CCDS32 AD-RDCIRAYQPQ--ISSTNYNTLTLNVKTQEP-------DNLLFYLGSSTAS-DFLAVE 2130 2140 2150 2160 2170 2800 2810 2820 2830 2840 2850 pF1KA0 LRDKKVHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGE-KFAAVSLDRTLQFGHMSVTVERQMIQETKGD .: .: ....:: .. . : : . .. .. . : ..: .:: ..: .. :. CCDS32 MRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSV---KEMSSNQKSP 2180 2190 2200 2210 2220 2860 2870 2880 2890 2900 2910 pF1KA0 TV---APGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYN : .::. ..:.. . ..: ::: . . : .. ..::. :: . ..:.: CCDS32 TKTSKSPGTANVLDVNNSTLMF-VGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGKSIGLWN 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2920 2930 2940 2950 2960 2970 pF1KA0 F-ERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLV . :: . : : :... :: . ..::.:.. . : .:. .. . . CCDS32 YIEREGKC-----RGCFGSSQNEDP----SFHFDGSGYSVVE-KSLPATVTQIIMLFNTF 2290 2300 2310 2320 2330 2980 2990 3000 3010 3020 3030 pF1KA0 SYSGVLFFLKQQS--QFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFL : .:.:..: . . .:: . . .: . .. :.:.: . : .... .. . CCDS32 SPNGLLLYLGSYGTKDFLSIELFRGRVKVMTDLGSG---PITLLTDRRYNNGTW-YKIAF 2340 2350 2360 2370 2380 2390 3040 3050 3060 3070 3080 pF1KA0 LGGSRKRVLVRVERATVYSVEQ--------DNDLEL--ADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLF . .. ::. .. .. . : ..::. : :.::.: ... .:: CCDS32 QRNRKQGVLAVIDAYNTSNKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRV---VRRGV 2400 2410 2420 2430 2440 3090 3100 3110 3120 3130 3140 pF1KA0 PTGGSVRGCVKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVA : . : ::.:... . :: : :. :: :: . . :...: :...: .... CCDS32 TTKSFV-GCIKNLEISRSTFDLLR-NSYGVRKGCLLEPI--RSVSFLKGGYIELPPKSLS 2450 2460 2470 2480 2490 2500 3150 3160 3170 3180 3190 pF1KA0 PLTGNVYSGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRV---SLQLLRTEVKTQAGFAD : . . . : ....:... . : . . ....: :..:. ....... .: CCDS32 PESEWLVT---FATTNSSGIILAALGGDVEKRGDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGD 2510 2520 2530 2540 2550 2560 3200 3210 3220 3230 3240 pF1KA0 GAPHYVAFYSNATG---------VWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPR------ :. :. :: . : . .. .. .. : :.. : CCDS32 GTGLRKALLHAPTGTCSDGQAHSISLVRNRRIITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSN 2570 2580 2590 2600 2610 2620 3250 3260 3270 3280 3290 pF1KA0 LLLGGLPES-GTIY-----NFSGCISN-VFVQRLLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CAPA : .::.::. :: .: :::.: .: .:: :... .: .:. : CCDS32 LYVGGIPEGEGTSLLTMRRSFHGCIKNLIFNLELL------DFNSAVGHEQVDLDTC--- 2630 2640 2650 2660 2670 3300 3310 3320 3330 3340 3350 pF1KA0 LQAQTPGLGPRGLQATARKASRRSRQPARHPA-CMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSH--LE .. : :.: . . :. .: : :.. :. . ..::: . .:: : CCDS32 WLSERPKLAPDA------EDSKLLPEPRAFPEQCVVDAALEYVPGAHQFGLTQNSHFILP 2680 2690 2700 2710 2720 3360 3370 3380 3390 3400 3410 pF1KA0 FVGILARHRNWPSLSMHVLPRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNG--HFVAQMEGLGT : .:.. ::.... .: ::. . :. .. .. : : .: ::. .. : : CCDS32 FNQSAVRKKLSVELSIRTF--ASSGLIYYMAHQNQADYAV-LQLHGGRLHFMFDL-GKG- 2730 2740 2750 2760 2770 2780 3420 3430 3440 3450 3460 pF1KA0 RLRAQSRQRSRPGRWHKVSVRWEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQ--HQGAEHPQPHTLF : ... :.:: :.. . : . ....:: .:.: .:. .. CCDS32 RTKVSHPALLSDGKWHTVKTDYVKRKGFITVDG-----RESPMVTVVGDGTMLDVEGLFY 2790 2800 2810 2820 2830 3470 3480 3490 3500 3510 3520 pF1KA0 VGGLPASSHSSKLP-VTVGFSGCVKRLRLHGRPLG--APTRMAGVTPCILGPLEAGLFFP .::::.. .. :. .: .. .:. . .... : .:. :. : : : .: CCDS32 LGGLPSQYQARKIGNITHSIPACIGDVTVNSKQLDKDSPVSAFTVNRCYAVAQE-GTYFD 2840 2850 2860 2870 2880 2890 3530 3540 3550 3560 3570 3580 pF1KA0 GSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVRPLAVTGLIFHLGQARTPPY-LQL---QVLLRADDG ::: . . . ::.. :: : . .:... .. :.. :.: .::.....: CCDS32 GSGYAALVKEGYKVQSDVNITLEFRTSSQNGVLLGISTAKVDAIGLELVDGKVLFHVNNG 2900 2910 2920 2930 2940 2950 3590 3600 3610 3620 3630 pF1KA0 AGEFSTSVTRP---SVLCDGQWHRLAVMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGP-LLAAAAGAPAP ::.. :.. .: .:::::.:: : . :: . . : ::... . .: .... . : CCDS32 AGRI-TAAYEPKTATVLCDGKWHTLQANKSKHRITLIVDGNAVGAESPHTQSTSVDTNNP 2960 2970 2980 2990 3000 3010 3640 3650 3660 3670 3680 3690 pF1KA0 LYLGGLPEPMAVQPW--PPAYCGCMRRLAVNRSPVAMT----RSVEVHGAVGASGCPAA .:.:: : . . .. ::.:.::. .:: ... :. :.:: : .:: CCDS32 IYVGGYPAGVKQKCLRSQTSFRGCLRKLALIKSPQVQSFDFSRAFELHG-VFLHSCPGTE 3020 3030 3040 3050 3060 3070 CCDS32 S >>CCDS59307.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (1668 aa) initn: 1683 init1: 592 opt: 1380 Z-score: 798.5 bits: 161.9 E(32554): 3.7e-38 Smith-Waterman score: 2632; 31.3% identity (56.6% similar) in 1916 aa overlap (1818-3688:40-1666) 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KA0 ASLEQLQIRALFSQISSAVSLRRVALEVASPAGQGAL-ASNVELCLCPASYRGDSCQECA : ::. : :: :: .: . : :. CCDS59 CSMGWLWIFGAALGQCLGYSSQQQRVPFLQPPGQSQLQASYVE-------FRPS--QGCS 10 20 30 40 50 60 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KA0 PGFYRDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMSSRDDP ::.::: :::. ::::::.:.:::..: :::.::.::::: : :::::: :.... CCDS59 PGYYRDHKGLYTGRCVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHG 70 80 90 100 110 120 1910 1920 1930 1940 1950 1960 pF1KA0 SAPCVSCPCPLSVPSNNFAEGCVLRGGRTQCLCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSC : : .:::: .:.:: :::. :: ..: :: ::.:..:::::::.:::: .:.:: CCDS59 S--CRACPCP---HTNSFATGCVVNGGDVRCSCKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSC 130 140 150 160 170 1970 1980 1990 2000 2010 2020 pF1KA0 QPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCT :::.:..::. ...: :::: :: CCDS59 QPCSCNSNGQ----LGSCHPLTG----------------------------------DCI 180 190 2030 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KA0 PCGTEACDPRSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSG :: : .:: : CCDS59 N---------------------------QE------------PKDSSPAEE--------- 200 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KA0 QCHCRPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCS CCDS59 ------------------------------------------------------------ 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KA0 QQHQVPVPGGPVGHSIHCEVCDHCVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLH :. :: ::. ::.:: : : .. ::.:..::. ... CCDS59 -----------------CDDCDSCVMTLLNDLATMGEQLRLVKSQLQGLSASAGLLEQMR 210 220 230 240 250 2210 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KA0 RLNASIADLQSQL---RSPLGPHHETAQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQ ..... ::..:: :: .. : ....: ::.. :.:.:. . : .: . .:. CCDS59 HMETQAKDLRNQLLNYRSAISNH---GSKIEGLERELTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQT 260 270 280 290 300 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KA0 LLAGTEATLGHAKTLLAAIRAVDRTLSELMSQTGHLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLL : ... . :: : . :. : :.. :. CCDS59 LNNNVNRATQSAKELDVKIKNVIRNV--------HM------------------------ 310 320 330 2330 2340 2350 2360 2370 2380 pF1KA0 WEMRARDLGAPQAAAEAELAAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMD : :.. .. ::..::.. :: : ..:: : : CCDS59 -------------------------LNRIRTWQKTHQGENNGLANSIRDSLNEYEAKLSD 340 350 360 370 2390 2400 2410 2420 2430 2440 pF1KA0 LREALNRAVDATREAQELNSRNQERLEEALQRK-QELSRDNATLQATLHAARDTLASVFR :: :..:. ...:. ::..: :: :.::. .:.. .. . : .: ..: .. CCDS59 LRARLQEAAAQAKQANGLNQEN-ERALGAIQRQVKEINSLQSDFTKYLTTADSSLLQTNI 380 390 400 410 420 430 2450 2460 2470 2480 2490 2500 pF1KA0 LLHSLDQAKEELERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNL :. ......: :.:::::. :: : .... .: ...: ::: :: ::..: .:: .: CCDS59 ALQLMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELSRSAGKTSLVEEAEKHARSLQELAKQL 440 450 460 470 480 490 2510 2520 2530 2540 2550 2560 pF1KA0 SSIILDVNQDRLTQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRA : ... :.:.. :..:..:: ::.:..::::::..: . .. . ::... : .: CCDS59 EEIKRNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAEDAANRAASASESALQTVIKEDLPRKA 500 510 520 530 540 550 2570 2580 2590 2600 2610 2620 pF1KA0 QQLLANSTAL-EEAMLQEQQRLGLVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAML-AM . : .:: : .:: . ... : ::.. . : : ..:. ..... . . : .. CCDS59 KTLSSNSDKLLNEAKMTQKKLKQEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLTTLRDGLHGI 560 570 580 590 600 610 2630 2640 2650 2660 2670 2680 pF1KA0 DTDETSKKIAHAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYEGLRGQDLGQAVLDAG . . . :. ::... .:.: . .: . :. .: .::: . : ...:. .:. :: CCDS59 QRGDIDAMISSAKSMVRKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDAD 620 630 640 650 660 670 2690 2700 2710 2720 2730 2740 pF1KA0 HSVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFN .::. : . ::.: :. .... . ... : .. :.:::: ::: ::::: :::.:: CCDS59 NSVNKLTNKLPDLWRKIESINQQLLPLGNI--SDNMDRIRELIQQARDAASKVAVPMRFN 680 690 700 710 720 2750 2760 2770 2780 2790 2800 pF1KA0 GRSGVQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLR :.:::..: : :: :: .::.:...:: :. . . :::. ::::.:...:. ::.:... CCDS59 GKSGVEVRLPNDLEDLKGYTSLSLFLQRPNSRENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVV 730 740 750 760 770 780 2810 2820 2830 2840 2850 pF1KA0 DKKVHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGE---KFAA---VSLDRTLQFGHMSVTV-ERQMIQE : .. ::.::. : :..:. . . : :. :...: ::.... : . : CCDS59 DGQLTCVYNLGDR-EAELQVDQILTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFARLNYTKGATSSKPE 790 800 810 820 830 840 2860 2870 2880 2890 2900 2910 pF1KA0 TKG--DTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVS : : : . ... :::: :.. :::::::: : : : :: :.::::.: :::.:.: CCDS59 TPGVYDMDGRNSNTLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDDLNENVLS 850 860 870 880 890 900 2920 2930 2940 2950 2960 2970 pF1KA0 LYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELR ::::..::.:.:. .:: : : .: .:..:::.::. . . . : : .. CCDS59 LYNFKKTFNLNTTEVEPCRRRKEE-----SDKNYFEGTGYARVPTQPH-APIPTFGQTIQ 910 920 930 940 950 960 2980 2990 3000 3010 3020 3030 pF1KA0 LVSYSGVLFFLKQQSQFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFL . :.::: .. ..:. : ...:.:.. : ... : : . .. ...::. CCDS59 TTVDRGLLFFAENGDRFISLNIEDGKLMVRYKLNSELPKERGVGDAIN-NGRDHSIQI-K 970 980 990 1000 1010 1020 3040 3050 3060 3070 3080 3090 pF1KA0 LGGSRKRVLVRVERATVYSVEQDNDLELADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFP-TGGSVRGC .: .::. . :. : .. :... ..:::::. : ..:. : . . ::: CCDS59 IGKLQKRMWINVD---VQNTIIDGEVFDFSTYYLGGI-----PIAIRERFNISTPAFRGC 1030 1040 1050 1060 1070 3100 3110 3120 3130 3140 pF1KA0 VKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVA-PLTGNVYS .:..: . : :. .:.::. :. : . :. .: : .:...... : : .. . CCDS59 MKNLKKTSGVVRLN--DTVGVTKKCSEDWKLVRSASFSRGG--QLSFTDLGLPPTDHLQA 1080 1090 1100 1110 1120 3150 3160 3170 3180 3190 3200 pF1KA0 GFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLRTE---VKTQAGFADGAPHYVAF .:::.. : :..: . . ::.:..: . :. . :. . :: :::. CCDS59 SFGFQTFQPSGILLDHQTWTRNLQVTLEDGYIELSTSDSGGPIFKSPQTYMDGLLHYVSV 1130 1140 1150 1160 1170 1180 3210 3220 3230 3240 3250 3260 pF1KA0 YSNATGVWLYVDDQLQQMKPHRGPPPELQPQPEGPPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVF :. .:. : .:::: . . . :. . : ::: :: ::::::: CCDS59 ISDNSGLRLLIDDQLLRNSKR------LKHISSSRQSLRLGG-------SNFEGCISNVF 1190 1200 1210 1220 1230 3270 3280 3290 3300 3310 3320 pF1KA0 VQRL-LGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CA---PALQAQTPGLGPRGLQATARKASRRSRQ :::: :.:. :.:: .: . .:: : :. : . : . : : . . CCDS59 VQRLSLSPE-VLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQLLQDT 1240 1250 1260 1270 1280 1290 3330 3340 3350 3360 3370 pF1KA0 PARHP--------ACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFV--GILARHRNWPSLSMHVL :. : :: :. .... . ::: .::: : : . :. ...:.. CCDS59 PVASPRSVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQTT 1300 1310 1320 1330 1340 1350 3380 3390 3400 3410 3420 3430 pF1KA0 PRSSRGLLLFTARLRPGSPSLALFLSNGHFVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRWHKVSVR :::::.. :. . .::.::.:..: . : .:: .:... :.:: : CCDS59 --SSRGLVFHTGT---KNSFMALYLSKGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVFG 1360 1370 1380 1390 1400 3440 3450 3460 3470 3480 3490 pF1KA0 WEKNRILLVTDGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSKLPVTVGFSGCV . .. ::.:: :: : . . . : ...:. : :.. ..:: : .: ::. CCDS59 HDGEKGRLVVDGLRAREGSLPGNSTISIRAP----VYLGS-PPSGKPKSLP-TNSFVGCL 1410 1420 1430 1440 1450 1460 3500 3510 3520 3530 3540 3550 pF1KA0 KRLRLHGRPLGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVRP : ..: ..:: .:. ::. :. :::: :..: :: ..: :. : . .:: CCDS59 KNFQLDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIRP 1470 1480 1490 1500 1510 1520 3560 3570 3580 3590 3600 pF1KA0 LAVTGLIFHLGQARTPPYLQLQVLLRA-------DDGAGEFSTSVTRPSVLCDGQWHRLA ..::...:.: . : .: : :.: :.::: ::::: . ::::::: .: CCDS59 RSLTGILIHIG---SQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSVA 1530 1540 1550 1560 1570 1580 3610 3620 3630 3640 3650 3660 pF1KA0 VMKSGNVLRLEVDAQSNHTVGPLLAAAAGAPAPLYLGGLPEPMAVQPWP--PAYCGCMRR : . ..:.::.:..:..:.: . :.. ::.::: : ... : .. ::.: CCDS59 VTIKQHILHLELDTDSSYTAGQIPFPPASTQEPLHLGGAPANLTTLRIPVWKSFFGCLRN 1590 1600 1610 1620 1630 1640 3670 3680 3690 pF1KA0 LAVNRSPVAMTRSVEVHGAVGASGCPAA . ::. :: .:...::.: :. .::: CCDS59 IHVNHIPVPVTEALEVQGPVSLNGCPDQ 1650 1660 >>CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6 (3122 aa) initn: 1666 init1: 498 opt: 1329 Z-score: 766.6 bits: 156.9 E(32554): 2.2e-36 Smith-Waterman score: 3282; 25.3% identity (48.5% similar) in 3852 aa overlap (15-3689:3-3121) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLV--GLALLGAARAREE----AGGGFSLHPPYFNLAE : : :::. ::. . : : ... : .: : .::: CCDS51 MPGAAGVLLLLLLSGGLGGVQAQRPQQQRQSQAHQQRGLFPAVLNLAS 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 GARIAASATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICT--AANSN .: :...:::::..: ..::::: :.: .:. : ::. ..: : CCDS51 NALITTNATCGEKGP---------EMYCKLVEHV-----PGQPVRNPQCRICNQNSSNPN 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 KAHPASNAIDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVL . :: .::::: . ::::: .. :.::. :..:::: :::..:::..: :::::: :.: CCDS51 QRHPITNAIDGKNTWWQSPSIKNGIEYHYVTITLDLQQVFQIAYVIVKAANSPRPGNWIL 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 pF1KA0 ERSMDFGRTYQPWQFFASSKRDCLE------RFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLE :::.: :.:::. : . .:: : :: . ..:: .:::. ::.: ::: CCDS51 ERSLD-DVEYKPWQYHAVTDTECLTLYNIYPRTGPPS---YAKDDEVICTSFYSKIHPLE 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 NGEIVVSLVNGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPT---- :::: .::.::::.: . :: : :::.: .:::: : :: . :: : .:: CCDS51 NGEIHISLINGRPSADD--PSPELLEFTSARYIRLRFQRIRTLNADLMMFAHKDPREIDP 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 pF1KA0 -VTRRYYYSIKDISIGGRCVCHGHADACDAKDPTDPF--RLQCTCQHNTCGGTCDRCCPG ::::::::.::::.:: :.:.::: :: : :: . .: :.::::: .::.:::: CCDS51 IVTRRYYYSVKDISVGGMCICYGHARAC----PLDPATNKSRCECEHNTCGDSCDQCCPG 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KA0 FNQQPWKPATANSANECQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHH :.:.::. .: . .::..:::.:.: .:::: .: :: : .. : : ::::::.: .. CCDS51 FHQKPWRAGTFLTKTECEACNCHGKAEECYYDENVARRNLSLNIRGKYIGGGVCINCTQN 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KA0 TTGVNCERCLPGFYR----SPNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSG :.:.::: : ::.: :::.: :: CCDS51 TAGINCETCTDGFFRPKGVSPNYP------------------------------RP---- 390 400 410 460 470 480 490 500 510 pF1KA0 ERCDVCAEGFTGFPSCYPTPSSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRC : : : :. :. ...: :: . .: CCDS51 ---------------CQP--------------------CHCDPIGSLNEVCVKDEKHAR- 420 430 520 530 540 550 560 570 pF1KA0 LCKPNFQGTHCELCAPGFYGPGCQPCQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCA .: :: :.:.:..:: :..::::: CCDS51 ------RGL-----AP--------------------------GSCHCKTGFGGVSCDRCA 440 450 580 590 600 610 620 630 pF1KA0 PGYFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCD :: :.:.:.::.:. 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CCDS51 AKFI-DFLAIEMRKGKVSFLWDVGSGVGRVEYPDLTIDDSYWYRIVASRTGRNGTISVRA 2190 2200 2210 2220 2230 2240 2850 2860 2870 2880 2890 2900 pF1KA0 ----ERQMIQETKGDTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEM . ... :. .: :: .:.. . ..: ::: . . .: . ::. CCDS51 LDGPKASIVPSTHHSTSPPGYT-ILDVDANAMLF-VGGLTGKLKKADAVRVITFTGCMGE 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2910 2920 2930 2940 2950 pF1KA0 DTLNEEVVSLYNFERTFQLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSY-LDGTGFARIS----FD .... ..:.:: : . : . :. : .. : ..:. .:: :.: .: . CCDS51 TYFDNKPIGLWNF-REKEGDC---KGCTVSPQVED---SEGTIQFDGEGYALVSRPIRWY 2310 2320 2330 2340 2350 2960 2970 2980 2990 3000 3010 pF1KA0 SQISTTKRFEQELRLVSYSGVLFFL--KQQSQFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQ .:::. :. .: : :..:..: .. .:. . . .: . . ::.:.:. ..: : CCDS51 PNISTVM-FK--FRTFSSSALLMYLATRDLRDFMSVELTDGHIKVSYDLGSGMASVVSNQ 2360 2370 2380 2390 2400 2410 3020 3030 3040 3050 3060 pF1KA0 PPPPLTSASKAIQVFLLGGSRKRVLVRV-------ERATVYSVEQDN---DLELADAYYL . . . : :. .:.. . . :. . : .: ::. : :. CCDS51 -----NHNDGKWKSFTLSRIQKQANISIVDIDTNQEENIATSSSGNNFGLDLKADDKIYF 2420 2430 2440 2450 2460 2470 3070 3080 3090 3100 3110 3120 pF1KA0 GGVPPDQLPPSLRRLFPTGGSVRGCVKGIK-ALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRA ::.: . : . . ::.: :. . : :. . .::. ::. . . . CCDS51 GGLPTLRNLSMKARPEVNLKKYSGCLKDIEISRTPYNILSSPDYVGVTKGCSLENV--YT 2480 2490 2500 2510 2520 3130 3140 3150 3160 3170 3180 pF1KA0 MTFHGHGFLRLALSNVAPLTGNVYSGFGFHSAQDSA--LLYYRASPDGLCQVSLQQGRVS ..: ::..:. .:. .. ...: . ..:. :: ..: . : :.. CCDS51 VSFPKPGFVELS---PVPIDVGTEINLSFSTKNESGIILLGSGGTPAPPRRKRRQTGQAY 2530 2540 2550 2560 2570 2580 3190 3200 3210 3220 pF1KA0 LQLL----RTEVKTQAG---------------FADGAPHYVAFYSNATGVW-LYVDDQLQ .: : ::. ..: : :: : : . :.. . ::.. . CCDS51 YAILLNRGRLEVHLSTGARTMRKIVIRPEPNLFHDGREHSV-HVERTRGIFTVQVDENRR 2590 2600 2610 2620 2630 2640 3230 3240 3250 3260 pF1KA0 QMK------PHR-------GPPPELQPQPEGPPRLLLGGLPESGTIYNFSGCISNVFVQR :. : . : :::.::.: : ..: : ::: :. .. CCDS51 YMQNLTVEQPIEVKKLFVGGAPPEFQPSP-------LRNIPP------FEGCIWNLVINS 2650 2660 2670 2680 2690 3270 3280 3290 3300 3310 3320 pF1KA0 LLGPQRVFDLQQNLGSVNVSTG-CA-PALQAQTPGLGPRGL----QATARKASRRSRQPA . :. :. . .. :.. : :: :. . : .: . . . : CCDS51 V--PM---DFARPVSFKNADIGRCAHQKLREDEDGAAPAEIVIQPEPVPTPAFPTPTPVL 2700 2710 2720 2730 2740 3330 3340 3350 3360 3370 3380 pF1KA0 RHPACMLPPHLRTTRDSYQFGGSLSSHLEFVGILARHRNWPSLSMHVLPRSSRGLLLFTA : : . : ::: : .::. .. .. .: .. ..: .. :::.. : CCDS51 THGPCAAESEPALLIGSKQFGLSRNSHIAIAFDDTKVKNRLTIELEVRTEAESGLLFYMA 2750 2760 2770 2780 2790 2800 3390 3400 3410 3420 3430 3440 pF1KA0 RLRPGSPSLALFLSNG--HFVAQMEGLGTRLRAQSRQRSRPGRWHKVSVRWEKNRILLVT :. .. . .. : :: .: .. . :. .. . :.:::... :.. .: . CCDS51 RINHADFA-TVQLRNGLPYFSYDLGSGDTHTMIPTKIND--GQWHKIKIMRSKQEGILYV 2810 2820 2830 2840 2850 2860 3450 3460 3470 3480 3490 3500 pF1KA0 DGARAWSQEGPHRQHQGAEHPQPHTLFVGGLPASSHSSKL-PVTVGFSGCVKRLRLHGRP ::: . .:.. :.::::: . . .. ::: ...:::. :.. : CCDS51 DGASNRTI-SPKKADI---LDVVGMLYVGGLPINYTTRRIGPVTYSIDGCVRNLHMAEAP 2870 2880 2890 2900 2910 3510 3520 3530 3540 3550 pF1KA0 --LGAPTRMAGVTPCILGPLEAGLFFPGSGGVITLDLPGATLPDVGLELEVRPLAVTGLI : :: : :. . . : .: :.: . .. . : :. .:.: : ..::.. CCDS51 ADLEQPTSSFHVGTCFANA-QRGTYFDGTGFAKAVGGFKVGL-DLLVEFEFRTTTTTGVL 2920 2930 2940 2950 2960 2970 3560 3570 3580 3590 3600 3610 pF1KA0 FHLGQARTP----PYLQLQVLLRADDGAGEFST--SVTRPSVLCDGQWHRLAVMKSGNVL . ... . ... ......:.:::.:.. .. :. :::::::.... : . . CCDS51 LGISSQKMDGMGIEMIDEKLMFHVDNGAGRFTAVYDAGVPGHLCDGQWHKVTANKIKHRI 2980 2990 3000 3010 3020 3030 3620 3630 3640 3650 3660 pF1KA0 RLEVDAQSNHTVGPLLAA-AAGAPAPLYLGGLPEPM---AVQPWPPAYCGCMRRLAVNRS .: ::... .. .: :. .: . :...::.:. . .. : . ::.: : .... CCDS51 ELTVDGNQVEAQSPNPASTSADTNDPVFVGGFPDDLKQFGLTTSIP-FRGCIRSLKLTKG 3040 3050 3060 3070 3080 3090 3670 3680 3690 pF1KA0 ---P--VAMTRSVEVHGAVGASGCPAA : : .....:..: : .::: CCDS51 TGKPLEVNFAKALELRG-VQPVSCPAN 3100 3110 3120 >>CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1 (4391 aa) initn: 633 init1: 366 opt: 1148 Z-score: 662.1 bits: 138.0 E(32554): 1.5e-30 Smith-Waterman score: 1307; 26.7% identity (48.7% similar) in 1482 aa overlap (608-1968:281-1670) 580 590 600 610 620 630 pF1KA0 YFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPR .: ::. :: :. : :: CCDS30 TTSLPPRPETTIMRQPPVTHAPQPLLPGSVRPLPCGPQEAACRNGH----------CIPR 260 270 280 290 300 640 650 660 670 680 pF1KA0 GALDQLCGAGGLCRCRPGYTGTACQECSPGFHGFPSCVPC---HCS-----AEGSLHAAC : :: : :. : . .:.: :. :: ::. .:.. : CCDS30 ---DYLC--DGQEDCEDG---SDELDCGPPPPCEPNEFPCGNGHCALKLWRCDGDFD--C 310 320 330 340 350 690 700 710 720 730 pF1KA0 DPRSGQCSC---RPR-VTG---LRC---DTCVPGAYNFPYCEAGSCHPA-----GLAPVD . :. . .: ::. : : .:: . :.:... .:. : : : : . CCDS30 EDRTDEANCPTKRPEEVCGPTQFRCVSTNMCIPASF---HCDEESDCPDRSDEFGCMPPQ 360 370 380 390 400 740 750 760 770 780 pF1KA0 PALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRC---KPGF-----WGLSPSNPEGCTRCSCDLRGTL-- . : . :... .: : . :: ::.:. : : :::: CCDS30 VVTPPRESIQASRGQTVTFTCVAIGVPTPIINWRLNWGHIPSHPR-VTVTSEGGRGTLII 410 420 430 440 450 460 790 800 810 820 830 pF1KA0 -------GGVAECQP--GTGQCFCKPHVCGQACAS---CKDGFFGLDQADYFGCRSCRCD :. :. . :. : : . . : :: : :... .: : : CCDS30 RDVKESDQGAYTCEAMNARGMVFGIPDGVLELVPQRGPCPDGHFYLEHSA--ACLPCFCF 470 480 490 500 510 520 840 850 860 870 880 pF1KA0 IGGALGQSCEPRTGVCRCR---PNT-QGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGHA .. :: . : : :. .: . . ::. : : .:... . : . CCDS30 GITSVCQSTRRFRDQIRLRFDQPDDFKGVNVTMPAQPG-TPPLSSTQLQIDPS-LHEFQL 530 540 550 560 570 580 890 900 910 920 930 940 pF1KA0 MRFGFNPLEFENFSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVSV . .. : ..: : : : . ... . .: . : . :: . : .: CCDS30 VDLSRRFLVHDSF-W-----ALPEQ-FLGNKVDSYGGSLRYNVRYELARGMLEPVQRPDV 590 600 610 620 630 950 960 970 980 990 1000 pF1KA0 REEGRSATCANCTAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEP-FVLNPGTWALRVEAEGVLL : :. :. . : :.:. .. : :.: .: . : . :.: :: CCDS30 VLMG-----AGYRLLSR--GHTP-TQPGALNQRQVQFSEEHWVHESGRPVQRAELLQVLQ 640 650 660 670 680 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA0 DYVVLLPSAYYEAALLQLRVTEAC---TYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEAL . ..: .. :.. . .. ... : ..... . . . :. :. .:: CCDS30 SLEAVLIQTVYNTKMASVGLSDIAMDTTVTHATSHGRAHSVEECRCPI-GY---SGLS-- 690 700 710 720 730 740 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA0 CRQ-DNSLPRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQE :.. : . : :. : : ::.: . . . . : : . : .. : .. : CCDS30 CESCDAHFTR-------VPGGPYLGTCSGCNCNGHASSCDPVYG-HCLNCQH-NTEGPQC 750 760 770 780 790 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KA0 VGVAVHTPQRAPQQGLLSLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTA------ . : . : .:: . ..: .: . :..:. : CCDS30 NKCKAGFFGDAMKATATSCRPCPCPYI--DASRRFSD-TCFLDTDGQATCDACAPGYTGR 800 810 820 830 840 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KA0 --EQARFFLHGVTLVPIEEFSPEFVEPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILR :. .: . : . : : : : . .:..: .. :: : . . CCDS30 RCESCAPGYEGNPIQPGGKCRPVNQEI-VRC-DERGSMGTSGEAC---RCKNNVVGRLCN 850 860 870 880 890 900 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KA0 DCQVIPL------PPGLPLTHAQDLT-PAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVV .: . : : . .. : . : . : . :: . .:. . CCDS30 ECADGSFHLSTRNPDGCLKCFCMGVSRHCTSSSWSRAQLHGASE---EPGHFSLTNAAST 910 920 930 940 950 960 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KA0 FTTH----VPTLGRYAF-----LLHGYQPAHPTFPVEVLINAGRVWQGHANASFCPHGYG ::. :: :. .: :: : : ..: . : . . :. . .. CCDS30 HTTNEGIFSPTPGELGFSSFHRLLSG--PYFWSLPSRFLGDKVTSYGGELRFTVTQRSQP 970 980 990 1000 1010 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KA0 CRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRVPEGRWLWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYD : . .:: :. . ... . .: . ...:: .. .: . . CCDS30 GSTPL--HGQPLVVLQGNNIILEHHVAQEPSPGQPSTFIVPFREQAWQRPDGQPATREHL 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KA0 FISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGCHEVGATGPTCEPFGGQCPC ... . . : : .. .. ....:. . : : .:.: :. : :: : CCDS30 LMALAGIDTLLIRASYAQQPAESRVSGISM---DVAVP---EETGQD-PALEV--EQCSC 1080 1090 1100 1110 1120 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KA0 HAHVIGRDCSRCATGYWGFPN------CRPCDCG--ARLCDELTGQCI-CPPRTIPPDCL : .:. : ::: :. :. :.: .. :. :: : : .: : : CCDS30 PPGYRGPSCQDCDTGYTRTPSGLYLGTCERCSCHGHSEACEPETGACQGCQHHTEGPRCE 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KA0 LCQPQTFG----CHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTC--DTDSGQ-CK-CRPNVTGRRCD ::: .: : :. : : : . :: :::. : : :. .::.:. CCDS30 QCQPGYYGDAQRGTPQ-DCQLCPCYGDPAAGQAAHTCFLDTDGHPTCDACSPGHSGRHCE 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1570 1580 1590 1600 pF1KA0 TCSPGFHGYPR----CR-----P----CDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQ :.::..: : :. : :.: :.. . :: .::: :: .:.: :.. CCDS30 RCAPGYYGNPSQGQPCQRDSQVPGPIGCNCDPQGSVSSQCDA-AGQCQCKAQVEGLTCSH 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KA0 CSLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQ----EFV--DMEGWVLLSTDRQ-- : : :.:.:: :: :::.: :..: ::.:::. .:. :..:..:.. .:. CCDS30 CRPHHFHLSASNPDGCLPCFCMGITQQCASSAYTRHLISTHFAPGDFQGFALVNPQRNSR 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KA0 -VVPHERQPGTEMLRADLRHVPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSET . .: : . .. . . :.: ::: : .: ::.:..::: ::: : : : CCDS30 LTGEFTVEPVPEGAQLSFGNFAQLGHESF---YWQLPETYQGDKVAAYGGKLRYTL-SYT 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KA0 QRGDVFVPMESRPDVVLQGNQMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSR : :. : ::: . ::.. .. .:: : . :. . . .: . . ..: CCDS30 A-GPQGSPL-SDPDVQITGNNIMLVASQPALQGPER--RSYEIMFREEFWRRPDGQPATR 1430 1440 1450 1460 1470 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KA0 EELMMVLASLEQLQIRALFSQISSAVSLRRVALEVASPAGQG-ALASNVELCLCPASYRG :.:.:.::.:..: ::: ::.. :.:. :.::::.:. .. : .:: : :: .: : CCDS30 EHLLMALADLDELLIRATFSSVPLAASISAVSLEVAQPGPSNRPRALEVEECRCPPGYIG 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KA0 DSCQECAPGFYRDVKGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGF :::.::::. : .::.::.: :.:.:::: : : .:.: .::::. : :: : :. CCDS30 LSCQDCAPGYTRTGSGLYLGHCELCECNGHSDLCHPETGACSQCQHNAAGEFCELCAPGY 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KA0 MSSRDDPSAP-CVSCPCPLSVPSNNFAEGC-VLRGGRTQCL-CKPGYAGASCERCAPGFF ... . : : :::. : : :.. : : .: .: :.:::.: ::.:.::. CCDS30 YGDATAGTPEDCQPCACPLTNPENMFSRTCESLGAGGYRCTACEPGYTGQYCEQCGPGYV 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1960 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KA0 GNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALL ::: : :..: : CCDS30 GNPSVQGGQCLPETNQAPLVVEVHPARSIVPQGGSHSLRCQVSGSPPHYFYWSREDGRPV 1660 1670 1680 1690 1700 1710 >>CCDS6938.1 LAMC3 gene_id:10319|Hs108|chr9 (1575 aa) initn: 873 init1: 246 opt: 1104 Z-score: 641.8 bits: 132.8 E(32554): 2e-29 Smith-Waterman score: 1885; 30.5% identity (55.5% similar) in 1373 aa overlap (1431-2692:265-1569) 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KA0 ISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAASLSLFYNNGARPCGCHEVGATGPTCEP-FGGQ--C .. :.: : :. . . : : .:: : CCDS69 LISLDRLNTFGDDIFKDPKVLQSYYYAVSDFSVGGR-CKCN---GHASECGPDVAGQLAC 240 250 260 270 280 290 1460 1470 1480 1490 pF1KA0 PCHAHVIGRDCSRCATGYWGFP----------NCRPCDCGARL--CD---ELT------G :. .. : :: :: . : .: ::.:..: : :: : CCDS69 RCQHNTTGTDCERCLPFFQDRPWARGTAEAAHECLPCNCSGRSEECTFDRELFRSTGHGG 300 310 320 330 340 350 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KA0 QCI-CPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTDPTCDTDSGQCKCRPN .: : .: : : :: . . : . :. :.:.. : .: :: :.: : :.:. CCDS69 RCHHCRDHTAGPHCERCQENFYHWDPRMPCQPCDCQSAGSLHLQ---CD-DTGTCACKPT 360 370 380 390 400 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KA0 VTGRRCDTCSPGFHGYPR--CRPCDCHEAGTAPGVCDPLTGQCYCKENVQGPKCDQCSLG ::: .:: : ::::. . :::: :. ::. .::: .:.: :::::.: ::.: : CCDS69 VTGWKCDRCLPGFHSLSEGGCRPCTCNPAGSLD-TCDPRSGRCPCKENVEGNLCDRCRPG 410 420 430 440 450 460 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KA0 TFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRSSSYTRQEFV--DM----EGWVLLSTDRQVVPHER ::.:. :: ::. :::.: .. : :.. . . . :. ::: :. . : . CCDS69 TFNLQPHNPAGCSSCFCYGHSKVCASTAQFQVHHILSDFHQGAEGWWARSVGGSEHPPQW 470 480 490 500 510 520 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KA0 QPGTEMLRADLRHVPEAVPEAFPELYWQAPPSYLGDRVSSYGGTLRYELHSETQRGDVFV .:. .: :: :: :: ..:::. ::: : : .. :: . CCDS69 SPNGVLLS----------PEDEEEL--TAPEKFLGDQRFSYGQPLI--LTFRVPPGDSPL 530 540 550 560 570 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KA0 PMESRPDVVLQGNQMSITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLVEGNFRHTETRNTVSRE----EL :.. : :.:. ..... . . : . :. . :: :. :: . :. .. CCDS69 PVQLR----LEGTGLALSLRHSSLSGPQDA--GHPREVELRFHLQETSEDVAPPLPPFHF 580 590 600 610 620 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KA0 MMVLASLEQLQIRALFS-QISSAVSLRRVALEVASPAGQGALASNVELCLCPASYRGDSC . .::.: .:..:. . . .. : : .: : : : : . :: ::.: ::..: :. : CCDS69 QRLLANLTSLRLRVSPGPSPAGPVFLTEVRLTSARP-GLSPPASWVEICSCPTGYTGQFC 630 640 650 660 670 680 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KA0 QECAPGFYRDV-KGLFLGRCVPCQCHGHSDRCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFMS . ::::. :.. .: . :::: :. :. : :..:.:: :.:.::: :::: ::.. CCDS69 ESCAPGYKREMPQGGPYASCVPCTCNQHGT-CDPNTGICV-CSHHTEGPSCERCLPGFYG 690 700 710 720 730 740 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KA0 SRDDPSAP-CVSCPCPLSVPSNNFAEGCVLRGGRTQCL-CKPGYAGASCERCAPGFFGNP . .: : :::: . ... :. .. : : :: : :: : ::::.: CCDS69 NPFAGQADDCQPCPCPGQSACTTIPES-----REVVCTHCPPGQRGRRCEVCDDGFFGDP 750 760 770 780 790 1960 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KA0 L-VLG--SSCQPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTGACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALL : ..: . :. :.:::: ::: . ..::::.: : ::..::: .:: : ::::.:: CCDS69 LGLFGHPQPCHQCQCSGNVDPNAV-GNCDPLSGHCLRCLHNTTGDHCEHCQEGFYGSALA 800 810 820 830 840 850 2020 2030 2040 2050 2060 pF1KA0 P---GNCTRCDCTPCGTEA----CDPRSGHCLCKAGVTGRRCDRCQEGHFGFDGCGGCRP : .: :.: : :. . ::: .:.: : ::.: :.:: : : .. ::: CCDS69 PRPADKCMPCSCHPQGSVSEQMPCDPVTGQCSCLPHVTARDCSRCYPGFFDLQPGRGCRS 860 870 880 890 900 910 2070 2080 2090 2100 2110 2120 pF1KA0 CACGP-AAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCRECAPGYWGLPEQGCRRCQC-PGG----R : : : ... ..:::..::: ::::. : : .: :..:. .::: :.: : : . 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