Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0555
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0555, 799 aa
1>>>pF1KA0555 799 - 799 aa - 799 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0199+/-0.00143; mu= 6.6345+/- 0.085
mean_var=331.8292+/-69.367, 0's: 0 Z-trim(107.4): 117 B-trim: 202 in 1/54
Lambda= 0.070407
statistics sampled from 9457 (9551) to 9457 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 4.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS59495.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 ( 799) 5070 530.1 5.6e-150
CCDS4285.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 ( 810) 3392 359.6 1.1e-98
CCDS75352.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 ( 820) 3392 359.6 1.2e-98
CCDS64284.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 ( 778) 3127 332.7 1.4e-90
CCDS3385.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4 ( 626) 1836 201.5 3.7e-51
CCDS77897.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4 ( 461) 1324 149.3 1.4e-35
CCDS47005.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4 ( 831) 1318 149.0 3.1e-35
CCDS44494.1 JAKMIP3 gene_id:282973|Hs108|chr10 ( 844) 1214 138.4 4.7e-32
>>CCDS59495.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 (799 aa)
initn: 5070 init1: 5070 opt: 5070 Z-score: 2806.1 bits: 530.1 E(32554): 5.6e-150
Smith-Waterman score: 5070; 100.0% identity (100.0% similar) in 799 aa overlap (1-799:1-799)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSEHCSSPDLRRNQKRIAELNATIRKLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSEHCSSPDLRRNQKRIAELNATIRKLED
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 MREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASFRTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASFRTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 LTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQIE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 EGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVLSLAEKWIQQIEGAEAALHQKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVLSLAEKWIQQIEGAEAALHQKM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 MELESDMEQFCKIKGYLEEELDYRKQALDQAYMRIQELEATLYNALQQETVIKFGELLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MELESDMEQFCKIKGYLEEELDYRKQALDQAYMRIQELEATLYNALQQETVIKFGELLSE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KQQEELRTAVEKLRRQMLRKSREYDCQILQERMELLQQAHQRIRDLEDKTDIQKRQIKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KQQEELRTAVEKLRRQMLRKSREYDCQILQERMELLQQAHQRIRDLEDKTDIQKRQIKDL
730 740 750 760 770 780
790
pF1KA0 EEKFLFLFLFFSLAFILWP
:::::::::::::::::::
CCDS59 EEKFLFLFLFFSLAFILWP
790
>>CCDS4285.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 (810 aa)
initn: 3388 init1: 3388 opt: 3392 Z-score: 1884.8 bits: 359.6 E(32554): 1.1e-98
Smith-Waterman score: 4905; 97.4% identity (97.4% similar) in 804 aa overlap (1-783:1-804)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSEHCSSPDLRRNQKRIAELNATIRKLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSEHCSSPDLRRNQKRIAELNATIRKLED
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 MREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASFRTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASFRTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KA0 LTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQ--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQDS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570
pF1KA0 -------------------IEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HWVEDKQLFIKRNQELLEKIEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPP
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 FNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVL
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 SLAEKWIQQIEGAEAALHQKMMELESDMEQFCKIKGYLEEELDYRKQALDQAYMRIQELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SLAEKWIQQIEGAEAALHQKMMELESDMEQFCKIKGYLEEELDYRKQALDQAYMRIQELE
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 ATLYNALQQETVIKFGELLSEKQQEELRTAVEKLRRQMLRKSREYDCQILQERMELLQQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ATLYNALQQETVIKFGELLSEKQQEELRTAVEKLRRQMLRKSREYDCQILQERMELLQQA
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790
pF1KA0 HQRIRDLEDKTDIQKRQIKDLEEKFLFLFLFFSLAFILWP
::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HQRIRDLEDKTDIQKRQIKDLEEKSNRKHG
790 800 810
>>CCDS75352.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 (820 aa)
initn: 3388 init1: 3388 opt: 3392 Z-score: 1884.8 bits: 359.6 E(32554): 1.2e-98
Smith-Waterman score: 5018; 97.4% identity (97.4% similar) in 820 aa overlap (1-799:1-820)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSEHCSSPDLRRNQKRIAELNATIRKLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSEHCSSPDLRRNQKRIAELNATIRKLED
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 MREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASFRTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASFRTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KA0 LTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQ--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQDS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570
pF1KA0 -------------------IEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HWVEDKQLFIKRNQELLEKIEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPP
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 FNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVL
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 SLAEKWIQQIEGAEAALHQKMMELESDMEQFCKIKGYLEEELDYRKQALDQAYMRIQELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SLAEKWIQQIEGAEAALHQKMMELESDMEQFCKIKGYLEEELDYRKQALDQAYMRIQELE
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 ATLYNALQQETVIKFGELLSEKQQEELRTAVEKLRRQMLRKSREYDCQILQERMELLQQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ATLYNALQQETVIKFGELLSEKQQEELRTAVEKLRRQMLRKSREYDCQILQERMELLQQA
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790
pF1KA0 HQRIRDLEDKTDIQKRQIKDLEEKFLFLFLFFSLAFILWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HQRIRDLEDKTDIQKRQIKDLEEKFLFLFLFFSLAFILWP
790 800 810 820
>>CCDS64284.1 JAKMIP2 gene_id:9832|Hs108|chr5 (778 aa)
initn: 3123 init1: 3123 opt: 3127 Z-score: 1739.6 bits: 332.7 E(32554): 1.4e-90
Smith-Waterman score: 4753; 97.3% identity (97.3% similar) in 777 aa overlap (44-799:2-778)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 ALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRELEQRKHTVLVTEL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MVSKLEREKTQEAKRIRELEQRKHTVLVTEL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 KAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCALRDGSSDKVRTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCALRDGSSDKVRTAL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 TIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIKAGDLRSEHQSHQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIKAGDLRSEHQSHQE
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 AISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQKEALDEQLFLVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQKEALDEQLFLVKE
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 AECNMSSPKREIPGRAGDGSEHCSSPDLRRNQKRIAELNATIRKLEDRNTLLGDERNELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AECNMSSPKREIPGRAGDGSEHCSSPDLRRNQKRIAELNATIRKLEDRNTLLGDERNELL
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 KRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSEMREKITSHPPLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKAVTKENSEMREKITSHPPLKK
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 LKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHRRSSKPIKRPVLDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKLIRRRKHRRSSKPIKRPVLDP
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 FIGYDEDSMDSETSSMASFRTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQLTKEYQALQRAYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 FIGYDEDSMDSETSSMASFRTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQLTKEYQALQRAYA
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530
pF1KA0 LLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQ---------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQDSHWVEDKQLFIKRN
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 ------IEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QELLEKIEKQEAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVS
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 ALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVLSLAEKWIQQIEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVLSLAEKWIQQIEGA
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 EAALHQKMMELESDMEQFCKIKGYLEEELDYRKQALDQAYMRIQELEATLYNALQQETVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EAALHQKMMELESDMEQFCKIKGYLEEELDYRKQALDQAYMRIQELEATLYNALQQETVI
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 KFGELLSEKQQEELRTAVEKLRRQMLRKSREYDCQILQERMELLQQAHQRIRDLEDKTDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KFGELLSEKQQEELRTAVEKLRRQMLRKSREYDCQILQERMELLQQAHQRIRDLEDKTDI
700 710 720 730 740 750
780 790
pF1KA0 QKRQIKDLEEKFLFLFLFFSLAFILWP
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QKRQIKDLEEKFLFLFLFFSLAFILWP
760 770
>>CCDS3385.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4 (626 aa)
initn: 2216 init1: 966 opt: 1836 Z-score: 1031.9 bits: 201.5 E(32554): 3.7e-51
Smith-Waterman score: 2257; 61.2% identity (81.8% similar) in 606 aa overlap (1-574:1-605)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE
::::::.:::::: :.: :::.::.:::.::::..::::::.:: ::. :::: ::
CCDS33 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKLERE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA
:::.::. ..:::::::::: :::::.::.::.::::: .::.:...::.:::...: .
CCDS33 QEQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK
::::..:::.::: :::::::. :: :::.: ::: .::.:.::..::::: .:::: :
CCDS33 LRDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARKQAEEALSNCMQADKTK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ
:.:::. .:.::. . .:: : ::::::::::::.:::.:..::::: .:.: .::: ::
CCDS33 AADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KA0 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSE-------HCSSPDLRRNQKRIAELNA
:::::::: ::::: . ::::::.: :: : : . :.:: : .:::::.
CCDS33 KEALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 TIRKLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKA
.:::::::::::.::::::::: :::: : :::.:.:: . :.:..:. :.::::::.:
CCDS33 VIRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 VTKENSEMREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKL
.:.:: ::.::.... ::. :::::. . .::: :::.:::.:::..::.:. .::.:
CCDS33 LTRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KA0 IRRRKHR-RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASF---RTDRTPATPDDDLDESL
.: ..:: .: :: :. :.. :.:.::.:.:::: : .:. :::::::::..:::..
CCDS33 LRSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDAT
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 AAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDL
: ::..::: :::.:::::::::::::::.:: .::::::...:::::..:: .::::::
CCDS33 AREEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560
pF1KA0 EATLAQKGQI-----EKQ----------------EAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNL
: :..::: ::: : :...:..:.:::.::::::::: :
CCDS33 EKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVL
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 ELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNEE
::: :.
CCDS33 ELEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM
600 610 620
>>CCDS77897.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4 (461 aa)
initn: 1346 init1: 563 opt: 1324 Z-score: 752.4 bits: 149.3 E(32554): 1.4e-35
Smith-Waterman score: 1388; 57.0% identity (78.6% similar) in 412 aa overlap (195-574:30-440)
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 QVDEALSNMIQADKIKAGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLE
...:. : ... . :::::.:::.:..::
CCDS77 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSK-MDEIKGKDRVILALE
10 20 30 40 50
230 240 250 260 270
pF1KA0 KELETQTGYVQKLQLQKEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSE-------HCS
::: .:.: .::: :::::::::: ::::: . ::::::.: :: : : .
CCDS77 KELGVQAGQTQKLLLQKEALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMD
60 70 80 90 100 110
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 SPDLRRNQKRIAELNATIRKLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRN
:.:: : .:::::..:::::::::::.::::::::: :::: : :::.:.:: . :.:
CCDS77 ERDVRRFQLKIAELNSVIRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKN
120 130 140 150 160 170
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 DELMVSLQRMEEKLKAVTKENSEMREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVI
..:. :.::::::.: .:.:: ::.::.... ::. :::::. . .::: :::.:::.
CCDS77 EDLLQSIQRMEEKIKNLTRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVL
180 190 200 210 220 230
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 EQQNIIDELTRDREKLIRRRKHR-RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASF---R
:::..::.:. .::.:.: ..:: .: :: :. :.. :.:.::.:.:::: : .:. :
CCDS77 EQQHVIDDLSLERERLLRSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDR
240 250 260 270 280 290
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 TDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQE
::::::::..:::.. : ::..::: :::.:::::::::::::::.:: .::::::...:
CCDS77 TDRTPATPEEDLDDATAREEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTRE
300 310 320 330 340 350
520 530 540 550
pF1KA0 QLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQI-----EKQ----------------EAENHRLQQE
::::..:: .::::::: :..::: ::: : :...:..:
CCDS77 QLQADLLRCQAKIEDLEKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNE
360 370 380 390 400 410
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 LQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDLI
.:::.::::::::: :::: :.
CCDS77 MQDAKDQNELLEFRVLELEVRDSICCKLSNGADILFEPKLKFM
420 430 440 450 460
>>CCDS47005.1 JAKMIP1 gene_id:152789|Hs108|chr4 (831 aa)
initn: 3117 init1: 1008 opt: 1318 Z-score: 746.2 bits: 149.0 E(32554): 3.1e-35
Smith-Waterman score: 3330; 64.4% identity (84.3% similar) in 832 aa overlap (1-799:1-831)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKRIRE
::::::.:::::: :.: :::.::.:::.::::..::::::.:: ::. :::: ::
CCDS47 MSKKGRSKGEKPEMETDAVQMANEELRAKLTSIQIEFQQEKSKVGKL-RERLQEAKLERE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 LEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSALCA
:::.::. ..:::::::::: :::::.::.::.::::: .::.:...::.:::...: .
CCDS47 QEQRRHTAYISELKAKLHEEKTKELQALREGLIRQHEQEAARTAKIKEGELQRLQATLNV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQADKIK
::::..:::.::: :::::::. :: :::.: ::: .::.:.::..::::: .:::: :
CCDS47 LRDGAADKVKTALLTEAREEARRAFDGERLRLQQEILELKAARKQAEEALSNCMQADKTK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 AGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKLQLQ
:.:::. .:.::. . .:: : ::::::::::::.:::.:..::::: .:.: .::: ::
CCDS47 AADLRAAYQAHQDEVHRIKRECERDIRRLMDEIKGKDRVILALEKELGVQAGQTQKLLLQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KA0 KEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIPGRAGDGSE-------HCSSPDLRRNQKRIAELNA
:::::::: ::::: . ::::::.: :: : : . :.:: : .:::::.
CCDS47 KEALDEQLVQVKEAERHHSSPKRELPPGIGDMVELMGVQDQHMDERDVRRFQLKIAELNS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 TIRKLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRMEEKLKA
.:::::::::::.::::::::: :::: : :::.:.:: . :.:..:. :.::::::.:
CCDS47 VIRKLEDRNTLLADERNELLKRSRETEVQLKPLVEKNKRMNKKNEDLLQSIQRMEEKIKN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 VTKENSEMREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTRDREKL
.:.:: ::.::.... ::. :::::. . .::: :::.:::.:::..::.:. .::.:
CCDS47 LTRENVEMKEKLSAQASLKRHTSLNDLSLTRDEQEIEFLRLQVLEQQHVIDDLSLERERL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KA0 IRRRKHR-RSSKPIKRPVLDPFIGYDEDSMDSETSSMASF---RTDRTPATPDDDLDESL
.: ..:: .: :: :. :.. :.:.::.:.:::: : .:. :::::::::..:::..
CCDS47 LRSKRHRGKSLKPPKKHVVETFFGFDEESVDSETLSETSYNTDRTDRTPATPEEDLDDAT
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 AAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQEQLQAEVLRYKAKIEDL
: ::..::: :::.:::::::::::::::.:: .::::::...:::::..:: .::::::
CCDS47 AREEADLRFCQLTREYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREARTREQLQADLLRCQAKIEDL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560
pF1KA0 EATLAQKGQI-----EKQ----------------EAENHRLQQELQDARDQNELLEFRNL
: :..::: ::: : :...:..:.:::.::::::::: :
CCDS47 EKLLVEKGQDSKWVEEKQLLIRTNQDLLEKIYRLEMEENQLKNEMQDAKDQNELLEFRVL
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KA0 ELEERERRSPPFNLQIHPFSDG-VSALQIYCMKEGVKDVNIPDLIKQLDILGDNGNLRNE
:::::::::: ::::: : .. ::::..: .:::::::. .:.:.:::::::::::::
CCDS47 ELEERERRSPAFNLQITTFPENHSSALQLFCHQEGVKDVNVSELMKKLDILGDNGNLRNE
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KA0 EQVAIIQASTVLSLAEKWIQQIEGAEAALHQKMMELESDMEQFCKIKGYLEEELDYRKQA
::::::::.:::.: :::..::::.:::: :::..::.. . : . ::::::::::::::
CCDS47 EQVAIIQAGTVLALCEKWLKQIEGTEAALTQKMLDLEKEKDLFSRQKGYLEEELDYRKQA
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 LDQAYMRIQELEATLYNALQQETVIKFGELLSEKQQEELRTAVEKLRRQMLRKSREYDCQ
:::::..::.::::::.::::: . :: ::: :.:.:..::::.:::.::.:::.: :
CCDS47 LDQAYLKIQDLEATLYTALQQEPGRRAGEALSEGQREDLQAAVEKVRRQILRQSREFDSQ
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790
pF1KA0 ILQERMELLQQAHQRIRDLEDKTDIQKRQIKDLEEKFLFLFLFFSLAFILWP
::.:::::::::.::::.:::: ..:::..:.::::::::::::::::::::
CCDS47 ILRERMELLQQAQQRIRELEDKLEFQKRHLKELEEKFLFLFLFFSLAFILWP
780 790 800 810 820 830
>>CCDS44494.1 JAKMIP3 gene_id:282973|Hs108|chr10 (844 aa)
initn: 2348 init1: 1102 opt: 1214 Z-score: 689.0 bits: 138.4 E(32554): 4.7e-32
Smith-Waterman score: 3042; 60.1% identity (82.6% similar) in 834 aa overlap (11-798:14-843)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSKKGRNKGEKPEALIVALQAANEDLRTKLTDIQIELHQEKSKVSKLEREKTQEAKR
: ::: .::::::::::.:::::::::.::::::::.::::.:: ..
CCDS44 MSKRGMSSRAKGDKAEAL-AALQAANEDLRAKLTDIQIELQQEKSKVSKVEREKNQELRQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 IRELEQRKHTVLVTELKAKLHEEKMKELQAVRENLIKQHEQEMSRTVKVRDGEIQRLKSA
.:: ::.: .::.::::.:::::::::::::::.:..::: :. :..:..:.: :::..
CCDS44 VREHEQHKTAVLLTELKTKLHEEKMKELQAVRETLLRQHEAELLRVIKIKDNENQRLQAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 LCALRDGSSDKVRTALTIEAREEARKLFDTERLKLLQEIADLKTAKKQVDEALSNMIQAD
: :::::. .::.:.: ::.:::.: :..:..:. :::..:: ::.::.:::. .::::
CCDS44 LSALRDGGPEKVKTVLLSEAKEEAKKGFEVEKVKMQQEISELKGAKRQVEEALTLVIQAD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 KIKAGDLRSEHQSHQEAISKIKWESERDIRRLMDEIKAKDRIIFSLEKELETQTGYVQKL
::::...:: .. ::: :..:: : ::.:::::.::: ::: .: ::.:: .:.:..:.:
CCDS44 KIKAAEIRSVYHLHQEEITRIKKECEREIRRLMEEIKFKDRAVFVLERELGVQAGHAQRL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KA0 QLQKEALDEQLFLVKEAECNMSSPKREIP--GRAGDGSEHCSSP-------DLRRNQKRI
::::::::::: :.::. . .::.::.: . :::.:.: .:: : :: : .:
CCDS44 QLQKEALDEQLSQVREADRHPGSPRRELPHAAGAGDASDHSGSPEQQLDEKDARRFQLKI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 AELNATIRKLEDRNTLLGDERNELLKRVRETEKQCKPLLERNKCLAKRNDELMVSLQRME
:::.: ::::::::.::..:::::::::::.:.: ::::..:: :...:..: .:.:::
CCDS44 AELSAIIRKLEDRNALLSEERNELLKRVREAESQYKPLLDKNKRLSRKNEDLSHALRRME
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 EKLKAVTKENSEMREKITSHPPLKKLKSLNDLDQANEEQETEFLKLQVIEQQNIIDELTR
.::: ::.:: :::.. ... .:::::::...:.:..:::::..::::.::::..
CCDS44 NKLKFVTQENIEMRQRAG---IIRRPSSLNDLDQSQDEREVDFLKLQIVEQQNLIDELSK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KA0 ------------DREKLIRRRKHRRSSKPIKRPVL-DPFIGYDED-SMDSETSSMA--SF
.:.::.: ::.:.. . .::. . :.::::. :..:. ::.. .
CCDS44 TLETAGYVKSVLERDKLLRFRKQRKKMAKLPKPVVVETFFGYDEEASLESDGSSVSYQTD
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 RTDRTPATPDDDLDESLAAEESELRFRQLTKEYQALQRAYALLQEQTGGIIDAEREAKAQ
:::.:: ::::::.:..: ::.:::::::: :::::::::::::::.:: .:::::.:..
CCDS44 RTDQTPCTPDDDLEEGMAKEETELRFRQLTMEYQALQRAYALLQEQVGGTLDAEREVKTR
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550
pF1KA0 EQLQAEVLRYKAKIEDLEATLAQKGQ---------------------IEKQEAENHRLQQ
::::::: : .:.::::: .::..:: :...:.:. ::..
CCDS44 EQLQAEVQRAQARIEDLEKALAEQGQDMKWIEEKQALYRRNQELVEKIKQMETEEARLRH
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 ELQDARDQNELLEFRNLELEERERRSPPFNLQIHPFSDGVSALQIYCMKEGVKDVNIPDL
:.::::::::::::: ::::::::.:: .... :: :: : ::.:: ::: :. . .:
CCDS44 EVQDARDQNELLEFRILELEERERKSPAISFHHTPFVDGKSPLQVYCEAEGVTDIVVAEL
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 IKQLDILGDNGNLRNEEQVAIIQASTVLSLAEKWIQQIEGAEAALHQKMMELESDMEQFC
.:.:::::::.:: :::::..::: :::.:::::.:::: .::::..::..:::. : :
CCDS44 MKKLDILGDNANLTNEEQVVVIQARTVLTLAEKWLQQIEETEAALQRKMVDLESEKELFS
660 670 680 690 700 710
680 690 700 710 720 730
pF1KA0 KIKGYLEEELDYRKQALDQAYMRIQELEATLYNALQQETVIKFGELLSEKQQEELRTAVE
: ::::.::::::::::::: .: :::: ::.:::::. : .:::::...:.:..:::
CCDS44 KQKGYLDEELDYRKQALDQANKHILELEAMLYDALQQEAGAKVAELLSEEEREKLKVAVE
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780 790
pF1KA0 KLRRQMLRKSREYDCQILQERMELLQQAHQRIRDLEDKTDIQKRQIKDLEEKFLFLFLFF
. .::.. . :: : :::.::::::: :.:::..::.. . ::::::.::::::::::::
CCDS44 QWKRQVMSELRERDAQILRERMELLQLAQQRIKELEERIEAQKRQIKELEEKFLFLFLFF
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 SLAFILWP
:::::::
CCDS44 SLAFILWS
840
799 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 09:43:04 2016 done: Thu Nov 3 09:43:05 2016
Total Scan time: 4.590 Total Display time: 0.220
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]