Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0563
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0563, 1634 aa
1>>>pF1KA0563 1634 - 1634 aa - 1634 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8955+/-0.0013; mu= -16.9894+/- 0.077
mean_var=443.6463+/-92.659, 0's: 0 Z-trim(112.1): 81 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.060891
statistics sampled from 12883 (12946) to 12883 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.398), width: 16
Scan time: 7.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32708.1 LRRC37A3 gene_id:374819|Hs108|chr17 (1634) 10908 974.2 0
CCDS42353.1 LRRC37A2 gene_id:474170|Hs108|chr17 (1700) 10563 943.9 0
CCDS11504.2 LRRC37A gene_id:9884|Hs108|chr17 (1700) 10524 940.5 0
CCDS77091.1 LRRC37A3 gene_id:374819|Hs108|chr17 ( 752) 4368 399.5 2.2e-110
CCDS82102.1 LRRC37B gene_id:114659|Hs108|chr17 ( 865) 2387 225.5 5.9e-58
CCDS32609.1 LRRC37B gene_id:114659|Hs108|chr17 ( 947) 2387 225.5 6.4e-58
>>CCDS32708.1 LRRC37A3 gene_id:374819|Hs108|chr17 (1634 aa)
initn: 10908 init1: 10908 opt: 10908 Z-score: 5195.2 bits: 974.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10908; 100.0% identity (100.0% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1634)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSAQCPALACVMSPLRFWGPWPLLMWQLLWLLVKEAQPLEWVKDPLQLTSNPLGPPEPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MTSAQCPALACVMSPLRFWGPWPLLMWQLLWLLVKEAQPLEWVKDPLQLTSNPLGPPEPW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SSHSSHFPRESPHAPTLPADPWDFDHLGPSASSEMPAPPQESTENLVPFLDTWDSAGELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSHSSHFPRESPHAPTLPADPWDFDHLGPSASSEMPAPPQESTENLVPFLDTWDSAGELP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LEPEQFLASQQDLKDKLSPQERLPVSPKKLKKDPAQRWSLAEIIGIIHQLSTPQSQKQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEPEQFLASQQDLKDKLSPQERLPVSPKKLKKDPAQRWSLAEIIGIIHQLSTPQSQKQTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QNEYSSTDTPYPGSLPPELRVKSDEPPGPSEQVGPSQFHLEPETQNPETLEDIQSSSLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QNEYSSTDTPYPGSLPPELRVKSDEPPGPSEQVGPSQFHLEPETQNPETLEDIQSSSLQQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EAPAQLPQLLEEEPSSMQQEAPALPPESSMESLTLPNHEVSVQPPGEDQAYYHLPNITVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EAPAQLPQLLEEEPSSMQQEAPALPPESSMESLTLPNHEVSVQPPGEDQAYYHLPNITVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 PADVEVTITSEPTNETESSQAQQETPIQFPEEVEPSATQQEAPIEPPVPPMEHELSISEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PADVEVTITSEPTNETESSQAQQETPIQFPEEVEPSATQQEAPIEPPVPPMEHELSISEQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QQPVQPSESSREVESSPTQQETPGQPPEHHEVTVSPPGHHQTHHLASPSVSVKPPDVQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QQPVQPSESSREVESSPTQQETPGQPPEHHEVTVSPPGHHQTHHLASPSVSVKPPDVQLT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 IAAEPSAEVGTSLVHQEATTRLSGSGNDVEPPAIQHGGPPLLPESSEEAGPLAVQQETSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IAAEPSAEVGTSLVHQEATTRLSGSGNDVEPPAIQHGGPPLLPESSEEAGPLAVQQETSF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QSPEPINNENPSPTQQEAAAEHPQTAEEGESSLTHQEAPAQTPEFPNVVVAQPPEHSHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QSPEPINNENPSPTQQEAAAEHPQTAEEGESSLTHQEAPAQTPEFPNVVVAQPPEHSHLT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 QATVQPLDLGFTITPESMTEVELSPTMKETPTQPPKKVVPQLRVYQGVTNPTPGQDQAQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QATVQPLDLGFTITPESMTEVELSPTMKETPTQPPKKVVPQLRVYQGVTNPTPGQDQAQH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PVSPSVTVQLLDLGLTITPEPTTEVGHSTPPKRTIVSPKHPEVTLPHPDQVQTQHSHLTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PVSPSVTVQLLDLGLTITPEPTTEVGHSTPPKRTIVSPKHPEVTLPHPDQVQTQHSHLTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 ATVQPLDLGFTITPKSMTEVEPSTALMTTAPPPGHPEVTLPPSDKGQAQHSHLTQATVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ATVQPLDLGFTITPKSMTEVEPSTALMTTAPPPGHPEVTLPPSDKGQAQHSHLTQATVQP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LDLELTITTKPTTEVKPSPTTEETSTQLPDLGLAIIPEPTTETGHSTALEKTTAPRPDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDLELTITTKPTTEVKPSPTTEETSTQLPDLGLAIIPEPTTETGHSTALEKTTAPRPDRV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QTLHRSLTEVTGPPTELEPAQDSLVQSESYTQNKALTAPEEHKASTSTNICELCTCGDEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QTLHRSLTEVTGPPTELEPAQDSLVQSESYTQNKALTAPEEHKASTSTNICELCTCGDEM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LSCIDLNPEQRLRQVPVPEPNTHNGTFTILNFQGNYISYIDGNVWKAYSWTEKLILRENN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LSCIDLNPEQRLRQVPVPEPNTHNGTFTILNFQGNYISYIDGNVWKAYSWTEKLILRENN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LTELHKDSFEGLLSLQYLDLSCNKIQSIERHTFEPLPFLKFINLSCNVITELSFGTFQAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTELHKDSFEGLLSLQYLDLSCNKIQSIERHTFEPLPFLKFINLSCNVITELSFGTFQAW
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 HGMQFLHKLILNHNPLTTVEDPYLFKLPALKYLDMGTTLVPLTTLKNILMMTVELEKLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HGMQFLHKLILNHNPLTTVEDPYLFKLPALKYLDMGTTLVPLTTLKNILMMTVELEKLIV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 PSHMACCLCQFKNSIEAVCKTVKLHCNSACLTNTTHCPEEASVGNPEGAFMKVLQARKNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSHMACCLCQFKNSIEAVCKTVKLHCNSACLTNTTHCPEEASVGNPEGAFMKVLQARKNY
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 TSTELIIEPEEPSDSSGINLSGFGSEQLDTNDESDVTSTLSYILPYFSAVNLDVKSLLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSTELIIEPEEPSDSSGINLSGFGSEQLDTNDESDVTSTLSYILPYFSAVNLDVKSLLLP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 FIKLPTTGNSLAKIQTVGKNRQRLNRVLMGPRSIQKRHFKEVGRQSIRREQGAQASVENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIKLPTTGNSLAKIQTVGKNRQRLNRVLMGPRSIQKRHFKEVGRQSIRREQGAQASVENT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 AEEKRLGSPAPRELKQPHTQQGPEKLAGNAVYTKPSFTQEHKAAVSVLKPFSKGAPSTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AEEKRLGSPAPRELKQPHTQQGPEKLAGNAVYTKPSFTQEHKAAVSVLKPFSKGAPSTSS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 PAKALPQVRDRWKDLTHAISILESAKARVTNMKTSKPIVHSRKKYRFHKTRSRMTHRTPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PAKALPQVRDRWKDLTHAISILESAKARVTNMKTSKPIVHSRKKYRFHKTRSRMTHRTPK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 VKKSPKVRKKSYLSRLMLSNRLPFSAAKSLINSPSQGAFSSLRDLSPQENPFLEVSAPSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VKKSPKVRKKSYLSRLMLSNRLPFSAAKSLINSPSQGAFSSLRDLSPQENPFLEVSAPSE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 HFIENNNTKDTTARNAFEENVFMENTNMPEGTISENTNYNHPPEADSAGTAFNLGPTVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HFIENNNTKDTTARNAFEENVFMENTNMPEGTISENTNYNHPPEADSAGTAFNLGPTVKQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 TETKWEYNNVGTDLSPEPKSFNYPLLSSPGDQFEIQLTQQLQSVIPNNNVRRLIAHVIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TETKWEYNNVGTDLSPEPKSFNYPLLSSPGDQFEIQLTQQLQSVIPNNNVRRLIAHVIRT
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 LKMDCSGAHVQVTCAKLVSRTGHLMKLLSGQQEVKASKIEWDTDQWKTENYINESTEAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LKMDCSGAHVQVTCAKLVSRTGHLMKLLSGQQEVKASKIEWDTDQWKTENYINESTEAQS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 EQKEKSLEFTKELPGYGYTKKLILALIVTGILTILIILLCLIEICCHRRSLQEDEEGFSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EQKEKSLEFTKELPGYGYTKKLILALIVTGILTILIILLCLIEICCHRRSLQEDEEGFSR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630
pF1KA0 DSEAPTEEESEALP
::::::::::::::
CCDS32 DSEAPTEEESEALP
1630
>>CCDS42353.1 LRRC37A2 gene_id:474170|Hs108|chr17 (1700 aa)
initn: 10563 init1: 10563 opt: 10563 Z-score: 5031.2 bits: 943.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10563; 97.5% identity (98.8% similar) in 1620 aa overlap (1-1620:1-1620)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MTSAQCPALACVMSPLRFWGPWPLLMWQLLWLLVKEAQPLEWVKDPLQLTSNPLGPPEPW
:.:::::::.:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :
CCDS42 MSSAQCPALVCVMSRLRFWGPWPLLMWQLLWLLVKEAQPLEWVKDPLQLTSNPLGPPDSW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SSHSSHFPRESPHAPTLPADPWDFDHLGPSASSEMPAPPQESTENLVPFLDTWDSAGELP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS42 SSHSSHFPRESPHAPTLPADPWDFDHLGPSASSEMPAPPQESTENLVPFLDTWDSAGEQP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 LEPEQFLASQQDLKDKLSPQERLPVSPKKLKKDPAQRWSLAEIIGIIHQLSTPQSQKQTL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::
CCDS42 LEPEQFLASQQDLKDKLSPQERLPVSPKKLKKDPAQRWSLAEIIGITRQLSTPQSQKQTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 QNEYSSTDTPYPGSLPPELRVKSDEPPGPSEQVGPSQFHLEPETQNPETLEDIQSSSLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QNEYSSTDTPYPGSLPPELRVKSDEPPGPSEQVGPSQFHLEPETQNPETLEDIQSSSLQQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EAPAQLPQLLEEEPSSMQQEAPALPPESSMESLTLPNHEVSVQPPGEDQAYYHLPNITVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EAPAQLPQLLEEEPSSMQQEAPALPPESSMESLTLPNHEVSVQPPGEDQAYYHLPNITVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 PADVEVTITSEPTNETESSQAQQETPIQFPEEVEPSATQQEAPIEPPVPPMEHELSISEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PADVEVTITSEPTNETESSQAQQETPIQFPEEVEPSATQQEAPIEPPVPPMEHELSISEQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 QQPVQPSESSREVESSPTQQETPGQPPEHHEVTVSPPGHHQTHHLASPSVSVKPPDVQLT
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QQPVQPSESPREVESSPTQQETPGQPPEHHEVTVSPPGHHQTHHLASPSVSVKPPDVQLT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 IAAEPSAEVGTSLVHQEATTRLSGSGNDVEPPAIQHGGPPLLPESSEEAGPLAVQQETSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IAAEPSAEVGTSLVHQEATTRLSGSGNDVEPPAIQHGGPPLLPESSEEAGPLAVQQETSF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QSPEPINNENPSPTQQEAAAEHPQTAEEGESSLTHQEAPAQTPEFPNVVVAQPPEHSHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QSPEPINNENPSPTQQEAAAEHPQTAEEGESSLTHQEAPAQTPEFPNVVVAQPPEHSHLT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 QATVQPLDLGFTITPESMTEVELSPTMKETPTQPPKKVVPQLRVYQGVTNPTPGQDQAQH
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QATVQPLDLGFTITPESKTEVELSPTMKETPTQPPKKVVPQLRVYQGVTNPTPGQDQAQH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 PVSPSVTVQLLDLGLTITPEPTTEVGHSTPPKRTIVSPKHPEVTLPHPDQVQTQHSHLTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PVSPSVTVQLLDLGLTITPEPTTEVGHSTPPKRTIVSPKHPEVTLPHPDQVQTQHSHLTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 ATVQPLDLGFTITPKSMTEVEPSTALMTTAPPPGHPEVTLPPSDKGQAQHSHLTQATVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ATVQPLDLGFTITPKSMTEVEPSTALMTTAPPPGHPEVTLPPSDKGQAQHSHLTQATVQP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LDLELTITTKPTTEVKPSPTTEETSTQLPDLGLAIIPEPTTETGHSTALEKTTAPRPDRV
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS42 LDLELTITTKPTTEVKPSPTTEETSTQPPDLGLAIIPEPTTETRHSTALEKTTAPRPDRV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QTLHRSLTEVTGPPTELEPAQDSLVQSESYTQNKALTAPEEHKASTSTNICELCTCGDEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QTLHRSLTEVTGPPTELEPAQDSLVQSESYTQNKALTAPEEHKASTSTNICELCTCGDEM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 LSCIDLNPEQRLRQVPVPEPNTHNGTFTILNFQGNYISYIDGNVWKAYSWTEKLILRENN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSCIDLNPEQRLRQVPVPEPNTHNGTFTILNFQGNYISYIDGNVWKAYSWTEKLILRENN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 LTELHKDSFEGLLSLQYLDLSCNKIQSIERHTFEPLPFLKFINLSCNVITELSFGTFQAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LTELHKDSFEGLLSLQYLDLSCNKIQSIERHTFEPLPFLKFINLSCNVITELSFGTFQAW
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 HGMQFLHKLILNHNPLTTVEDPYLFKLPALKYLDMGTTLVPLTTLKNILMMTVELEKLIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS42 HGMQFLHKLILNHNPLTTVEDPYLFKLPALKYLDMGTTLVPLTTLKNILMMTVELEKLIL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 PSHMACCLCQFKNSIEAVCKTVKLHCNSACLTNTTHCPEEASVGNPEGAFMKVLQARKNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PSHMACCLCQFKNSIEAVCKTVKLHCNSACLTNTTHCPEEASVGNPEGAFMKVLQARKNY
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 TSTELIIEPEEPSDSSGINLSGFGSEQLDTNDESDVTSTLSYILPYFSAVNLDVKSLLLP
::::::.:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS42 TSTELIVEPEEPSDSSGINLSGFGSEQLDTNDESDFISTLSYILPYFSAVNLDVKSLLLP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 FIKLPTTGNSLAKIQTVGKNRQRLNRVLMGPRSIQKRHFKEVGRQSIRREQGAQASVENT
::::::::::::::::::.::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS42 FIKLPTTGNSLAKIQTVGQNRQRVKRVLMGPRSIQKRHFKEVGRQSIRREQGAQASVENA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 AEEKRLGSPAPRELKQPHTQQGPEKLAGNAVYTKPSFTQEHKAAVSVLKPFSKGAPSTSS
:::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AEEKRLGSPAPREVEQPHTQQGPEKLAGNAVYTKPSFTQEHKAAVSVLKPFSKGAPSTSS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 PAKALPQVRDRWKDLTHAISILESAKARVTNMKTSKPIVHSRKKYRFHKTRSRMTHRTPK
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::..::::::
CCDS42 PAKALPQVRDRWKDLTHAISILESAKARVTNTKTSKPIVHARKKYRFHKTRSHVTHRTPK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 VKKSPKVRKKSYLSRLMLSNRLPFSAAKSLINSPSQGAFSSLRDLSPQENPFLEVSAPSE
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS42 VKKSPKVRKKSYLSRLMLANRLPFSAAKSLINSPSQGAFSSLGDLSPQENPFLEVSAPSE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 HFIENNNTKDTTARNAFEENVFMENTNMPEGTISENTNYNHPPEADSAGTAFNLGPTVKQ
::::::::: :::::::::: ::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS42 HFIENNNTKHTTARNAFEENDFMENTNMPEGTISENTNYNHPHEADSAGTAFNLGPTVKQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS42 TETKWEYNNVGTDLSPEPKSFNYPLLSSPGDQFEIQLTQQLQSLIPNNNVRRLIAHVIRT
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:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS42 LKMDCSGAHVQVTCAKLISRTGHLMKLLSGQQEVKASKIEWDTDQWKIENYINESTEAQS
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::::::::. ::.:::::: ::::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::
CCDS42 EQKEKSLELKKEVPGYGYTDKLILALIVTGILTILIILFCLIVICCHRRSLQEDEEGFSR
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1630
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:.:::::::.:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS11 SSHSSHFPRESPHAPTLPADPWDFDHLGPSASSEMPAPPQESTENLVPFLDTWDSAGEQP
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CCDS11 LEPEQFLASQQDLKDKLSPQERLPVSPKKLKKDPAQRWSLAEIIGITRQLSTPQSQKQTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PADVEVTITSEPTNETESSQAQQETPIQFPEEVEPSATQQEAPIEPPVPPMEHELSISEQ
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CCDS11 QQPVQPSESPREVESSPTQQETPGQPPEHHEVTVSPPGHHQTHHLASPSVSVKPPDVQLT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSCIDLNPEQRLRQVPVPEPNTHNGTFTILNFQGNYISYIDGNVWKAYSWTEKLILRENN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS11 HGMQFLHKLILNHNPLTTVEDPYLFKLPALKYLDMGTTLVPLTTLKNILMMTVELEKLIL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::.:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::.::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::.
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:::::: ::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
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::::::::::: ::::::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::..:::: :
CCDS11 PAKALPQVRDRSKDLTHAISILESAKARVTNTKTSKPIVHARKKYRFHKTRSHVTHRTTK
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::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: ::
CCDS11 VKKSPKVRKKSYLSRLMLANRLPFSAAKSLINSPSQGAFSSLGDLSPQENPFLEVSALSE
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pF1KA0 HFIENNNTKDTTARNAFEENVFMENTNMPEGTISENTNYNHPPEADSAGTAFNLGPTVKQ
::::.:::: :::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HFIEKNNTKHTTARNAFEENDFMENTNMPEGTISENTNYNHPPEADSAGTAFNLGPTVKQ
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS11 TETKWEYNNVGTDLSPEPKSFNYPLLSSPGDQFEIQLTQQLQSLIPNNNVRRLIAHVIRT
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:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS11 LKMDCSGAHVQVTCAKLISRTGHLMKLLSGQQEVKASKIEWDTDQWKIENYINESTEAQS
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::::::::. ::.:::::: ::::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::
CCDS11 EQKEKSLELKKEVPGYGYTDKLILALIVTGILTILIILFCLIVICCHRRSLQEDEEGFSR
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CCDS11 GIFRFLPWRGCSSRRESQDGLSSFGQPLWFKDLYKPLSATRINNHAWKLHKKSSNEDKIL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PSHMACCLCQFKNSIEAVCKTVKLHCNSACLTNTTHCPEEASVGNPEGAFMKVLQARKNY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TSTELIIEPEEPSDSSGINLSGFGSEQLDTNDESDVTSTLSYILPYFSAVNLDVKSLLLP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FIKLPTTGNSLAKIQTVGKNRQRLNRVLMGPRSIQKRHFKEVGRQSIRREQGAQASVENT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AEEKRLGSPAPRELKQPHTQQGPEKLAGNAVYTKPSFTQEHKAAVSVLKPFSKGAPSTSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PAKALPQVRDRWKDLTHAISILESAKARVTNMKTSKPIVHSRKKYRFHKTRSRMTHRTPK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VKKSPKVRKKSYLSRLMLSNRLPFSAAKSLINSPSQGAFSSLRDLSPQENPFLEVSAPSE
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pF1KA0 HFIENNNTKDTTARNAFEENVFMENTNMPEGTISENTNYNHPPEADSAGTAFNLGPTVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HFIENNNTKDTTARNAFEENVFMENTNMPEGTISENTNYNHPPEADSAGTAFNLGPTVKQ
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pF1KA0 TETKWEYNNVGTDLSPEPKSFNYPLLSSPGDQFEIQLTQQLQSVIPNNNVRRLIAHVIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TETKWEYNNVGTDLSPEPKSFNYPLLSSPGDQFEIQLTQQLQSVIPNNNVRRLIAHVIRT
560 570 580 590 600 610
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pF1KA0 LKMDCSGAHVQVTCAKLVSRTGHLMKLLSGQQEVKASKIEWDTDQWKTENYINESTEAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LKMDCSGAHVQVTCAKLVSRTGHLMKLLSGQQEVKASKIEWDTDQWKTENYINESTEAQS
620 630 640 650 660 670
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EQKEKSLEFTKELPGYGYTKKLILALIVTGILTILIILLCLIEICCHRRSLQEDEEGFSR
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pF1KA0 DSEAPTEEESEALP
::::::::::::::
CCDS77 DSEAPTEEESEALP
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: : ::: ::::.::: :::::::: ::
CCDS82 MSALPQEPTENLAPFLKELDSAGELPLGPE
10 20 30
130 140
pF1KA0 QFLASQQDLKDKLSPQERLP----------------------------------------
:::..:::.:: .:.::::
CCDS82 PFLAAHQDLNDKRTPEERLPEVVPLLNRDQNQALVQLPRLKWVQTTDLDRAAGHQADEIL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KA0 --------------VSPKKLKKDPAQRWSLAEIIGIIHQLSTPQSQKQTLQNEYSSTDTP
::::.:::: :.:::: ::.:: :::: :: ::::: ..: : ::
CCDS82 VPLDSKVSRPTKFVVSPKNLKKDLAERWSLPEIVGIPHQLSKPQRQKQTLPDDYLSMDTL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 YPGSLPPELRVKSDEPPGPSEQVGPSQFHLEPETQNPETLEDIQSSSLQQEAPAQLPQLL
:::::::::::..:::::: :::: :::::::..:::::::::::::::.:::::: ::
CCDS82 YPGSLPPELRVNADEPPGPPEQVGLSQFHLEPKSQNPETLEDIQSSSLQEEAPAQLLQLP
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300
pF1KA0 EEEPSSMQQEAPALPPESSMESLT-LP-NHEVSVQPPGEDQAYYHLPNITVKPADVEVTI
.: : ::::::::::::::::. : ::::.:::::::::.:.::..::::::::::.
CCDS82 QEVEPSTQQEAPALPPESSMESLAQTPLNHEVTVQPPGEDQAHYNLPKFTVKPADVEVTM
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TSEPTNETESSQAQQETPIQFPEEVEPSATQQEAPIEPPVPPMEHELSISEQQQPVQPSE
:::: :::::.:::::.::: :::.:::
CCDS82 TSEPKNETESTQAQQEAPIQPPEEAEPS--------------------------------
280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 SSREVESSPTQQETPGQPPEHHEVTVSPPGHHQTHHLASPSVSVKPPDVQLTIAAEPSAE
CCDS82 ------------------------------------------------------------
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 VGTSLVHQEATTRLSGSGNDVEPPAIQHGGPPLLPESSEEAGPLAVQQETSFQSPEPINN
CCDS82 ------------------------------------------------------------
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ENPSPTQQEAAAEHPQTAEEGESSLTHQEAPAQTPEFPNVVVAQPPEHSHLTQATVQPLD
CCDS82 ------------------------------------------------------------
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pF1KA0 LGFTITPESMTEVELSPTMKETPTQPPKKVVPQLRVYQGVTNPTPGQDQAQHPVSPSVTV
CCDS82 ------------------------------------------------------------
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pF1KA0 QLLDLGLTITPEPTTEVGHSTPPKRTIVSPKHPEVTLPHPDQVQTQHSHLTRATVQPLDL
CCDS82 ------------------------------------------------------------
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pF1KA0 GFTITPKSMTEVEPSTALMTTAPPPGHPEVTLPPSDKGQAQHSHLTQATVQPLDLELTIT
:::: :: ::: ::::::::::::::::::::.::::::::::.::
CCDS82 --------------STALRTTDPPPEHPEVTLPPSDKGQAQHSHLTEATVQPLDLELSIT
300 310 320 330 340
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 TKPTTEVKPSPTTEETSTQLPDLGLAIIPEPTTETGHSTALEKTTAPRPDRVQTLHRSLT
:.:::::::::::::::.: :: :::: :::::: ::::::::: ::.::.:::::::::
CCDS82 TEPTTEVKPSPTTEETSAQPPDPGLAITPEPTTEIGHSTALEKTRAPHPDQVQTLHRSLT
350 360 370 380 390 400
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pF1KA0 EVTGPPTELEPAQDSLVQSESYTQNKALTAPEEHKASTSTNICELCTCGDEMLSCIDLNP
:::::::.:: .:::::::: :::::.::::::::::::::::: :::. :.:
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.:::::::::::.:.:: :: ::::::::::.:::::::::::::::: :: :::: :::
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::::: :::::::::::. :::.::: ::::..:::.::.::.::.:::::::::::::.
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::::.::::::::::::.:::::::::::: . :::::::: :::::::::.::::::::
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: ...:
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