Result of FASTA (ccds) for pF1KA0584
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0584, 626 aa
  1>>>pF1KA0584 626 - 626 aa - 626 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3546+/-0.000906; mu= 18.8927+/- 0.055
 mean_var=68.5085+/-13.425, 0's: 0 Z-trim(105.6): 21  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.154954
 statistics sampled from 8490 (8500) to 8490 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.261), width:  16
 Scan time:  2.810

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1360.1 COLGALT2 gene_id:23127|Hs108|chr1       ( 626) 4265 962.9       0
CCDS12363.1 COLGALT1 gene_id:79709|Hs108|chr19     ( 622) 2812 638.0 1.1e-182
CCDS6901.2 CERCAM gene_id:51148|Hs108|chr9         ( 595) 2152 490.5 2.7e-138
CCDS69675.1 CERCAM gene_id:51148|Hs108|chr9        ( 517) 1874 428.3 1.2e-119
CCDS3131.1 PLOD2 gene_id:5352|Hs108|chr3           ( 737)  304 77.4 7.4e-14
CCDS5715.1 PLOD3 gene_id:8985|Hs108|chr7           ( 738)  284 72.9 1.7e-12
CCDS142.1 PLOD1 gene_id:5351|Hs108|chr1            ( 727)  283 72.7 1.9e-12
CCDS3132.1 PLOD2 gene_id:5352|Hs108|chr3           ( 758)  263 68.3 4.4e-11


>>CCDS1360.1 COLGALT2 gene_id:23127|Hs108|chr1            (626 aa)
 initn: 4265 init1: 4265 opt: 4265  Z-score: 5148.8  bits: 962.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4265; 100.0% identity (100.0% similar) in 626 aa overlap (1-626:1-626)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAARPAATLAWSLLLLSSALLREGCRARFVAERDSEDDGEEPVVFPESPLQSPTVLVAVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MAARPAATLAWSLLLLSSALLREGCRARFVAERDSEDDGEEPVVFPESPLQSPTVLVAVL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 ARNAAHTLPHFLGCLERLDYPKSRMAIWAATDHNVDNTTEIFREWLKNVQRLYHYVEWRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ARNAAHTLPHFLGCLERLDYPKSRMAIWAATDHNVDNTTEIFREWLKNVQRLYHYVEWRP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 MDEPESYPDEIGPKHWPTSRFAHVMKLRQAALRTAREKWSDYILFIDVDNFLTNPQTLNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDEPESYPDEIGPKHWPTSRFAHVMKLRQAALRTAREKWSDYILFIDVDNFLTNPQTLNL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LIAENKTIVAPMLESRGLYSNFWCGITPKGFYKRTPDYVQIREWKRTGCFPVPMVHSTFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LIAENKTIVAPMLESRGLYSNFWCGITPKGFYKRTPDYVQIREWKRTGCFPVPMVHSTFL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 IDLRKEASDKLTFYPPHQDYTWTFDDIIVFAFSSRQAGIQMYLCNREHYGYLPIPLKPHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IDLRKEASDKLTFYPPHQDYTWTFDDIIVFAFSSRQAGIQMYLCNREHYGYLPIPLKPHQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 TLQEDIENLIHVQIEAMIDRPPMEPSQYVSVVPKYPDKMGFDEIFMINLKRRKDRRDRML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TLQEDIENLIHVQIEAMIDRPPMEPSQYVSVVPKYPDKMGFDEIFMINLKRRKDRRDRML
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 RTLYEQEIEVKIVEAVDGKALNTSQLKALNIEMLPGYRDPYSSRPLTRGEIGCFLSHYSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RTLYEQEIEVKIVEAVDGKALNTSQLKALNIEMLPGYRDPYSSRPLTRGEIGCFLSHYSV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 WKEVIDRELEKTLVIEDDVRFEHQFKKKLMKLMDNIDQAQLDWELIYIGRKRMQVKEPEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WKEVIDRELEKTLVIEDDVRFEHQFKKKLMKLMDNIDQAQLDWELIYIGRKRMQVKEPEK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 AVPNVANLVEADYSYWTLGYVISLEGAQKLVGANPFGKMLPVDEFLPVMYNKHPVAEYKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVPNVANLVEADYSYWTLGYVISLEGAQKLVGANPFGKMLPVDEFLPVMYNKHPVAEYKE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 YYESRDLKAFSAEPLLIYPTHYTGQPGYLSDTETSTIWDNETVATDWDRTHAWKSRKQSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YYESRDLKAFSAEPLLIYPTHYTGQPGYLSDTETSTIWDNETVATDWDRTHAWKSRKQSR
              550       560       570       580       590       600

              610       620      
pF1KA0 IYSNAKNTEALPPPTSLDTVPSRDEL
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IYSNAKNTEALPPPTSLDTVPSRDEL
              610       620      

>>CCDS12363.1 COLGALT1 gene_id:79709|Hs108|chr19          (622 aa)
 initn: 2796 init1: 2796 opt: 2812  Z-score: 3393.4  bits: 638.0 E(32554): 1.1e-182
Smith-Waterman score: 2812; 66.8% identity (88.5% similar) in 581 aa overlap (46-626:45-622)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KA0 LSSALLREGCRARFVAERDSEDDGEEPVVFPESPLQSPTVLVAVLARNAAHTLPHFLGCL
                                     ::::::.: ::.:.:::::::.::  :: :
CCDS12 LLALLLLLLAPLPPGAPPGADAYFPEERWSPESPLQAPRVLIALLARNAAHALPTTLGAL
           20        30        40        50        60        70    

          80        90       100       110       120       130     
pF1KA0 ERLDYPKSRMAIWAATDHNVDNTTEIFREWLKNVQRLYHYVEWRPMDEPESYPDEIGPKH
       ::: .:. : :.:.:::::.:::. ..::::  :. ::: ::::: .::.::::: ::::
CCDS12 ERLRHPRERTALWVATDHNMDNTSTVLREWLVAVKSLYHSVEWRPAEEPRSYPDEEGPKH
           80        90       100       110       120       130    

         140       150       160       170       180       190     
pF1KA0 WPTSRFAHVMKLRQAALRTAREKWSDYILFIDVDNFLTNPQTLNLLIAENKTIVAPMLES
       :  ::. ::::::::::..::. :.:::::.:.::.. ::.::.::::::::.:::::.:
CCDS12 WSDSRYEHVMKLRQAALKSARDMWADYILFVDADNLILNPDTLSLLIAENKTVVAPMLDS
          140       150       160       170       180       190    

         200       210       220       230       240       250     
pF1KA0 RGLYSNFWCGITPKGFYKRTPDYVQIREWKRTGCFPVPMVHSTFLIDLRKEASDKLTFYP
       :. :::::::.: .:.::::: :. ::.  : ::: :::::::::::::: :: .:.:::
CCDS12 RAAYSNFWCGMTSQGYYKRTPAYIPIRKRDRRGCFAVPMVHSTFLIDLRKAASRNLAFYP
          200       210       220       230       240       250    

         260       270       280       290       300       310     
pF1KA0 PHQDYTWTFDDIIVFAFSSRQAGIQMYLCNREHYGYLPIPLKPHQTLQEDIENLIHVQIE
       :: ::::.:::::::::: .:: .:::.::.:.::.::.::. :.:::.. :...:::.:
CCDS12 PHPDYTWSFDDIIVFAFSCKQAEVQMYVCNKEEYGFLPVPLRAHSTLQDEAESFMHVQLE
          260       270       280       290       300       310    

         320       330       340       350       360       370     
pF1KA0 AMIDRPPMEPSQYVSVVPKYPDKMGFDEIFMINLKRRKDRRDRMLRTLYEQEIEVKIVEA
       .:. .:: :::...:.  : ::::::::.:::::.::.:::.::::.:  :::: ..:::
CCDS12 VMVKHPPAEPSRFISAPTKTPDKMGFDEVFMINLRRRQDRRERMLRALQAQEIECRLVEA
          320       330       340       350       360       370    

         380       390       400       410       420       430     
pF1KA0 VDGKALNTSQLKALNIEMLPGYRDPYSSRPLTRGEIGCFLSHYSVWKEVIDRELEKTLVI
       :::::.::::..::.:.::::::::: .::::.::.:::::::..::::.:: :.:.::.
CCDS12 VDGKAMNTSQVEALGIQMLPGYRDPYHGRPLTKGELGCFLSHYNIWKEVVDRGLQKSLVF
          380       390       400       410       420       430    

         440       450       460       470       480       490     
pF1KA0 EDDVRFEHQFKKKLMKLMDNIDQAQLDWELIYIGRKRMQVKEPEKAVPNVANLVEADYSY
       :::.:::  ::..::.:: ....  :::.:::.:::::::..:::::: : :::::::::
CCDS12 EDDLRFEIFFKRRLMNLMRDVEREGLDWDLIYVGRKRMQVEHPEKAVPRVRNLVEADYSY
          440       450       460       470       480       490    

         500       510       520       530       540       550     
pF1KA0 WTLGYVISLEGAQKLVGANPFGKMLPVDEFLPVMYNKHPVAEYKEYYESRDLKAFSAEPL
       :::.:::::.::.::..:.:..::::::::::::..::::.::: ..  :.:.:::.:::
CCDS12 WTLAYVISLQGARKLLAAEPLSKMLPVDEFLPVMFDKHPVSEYKAHFSLRNLHAFSVEPL
          500       510       520       530       540       550    

         560       570       580       590       600       610     
pF1KA0 LIYPTHYTGQPGYLSDTETSTIWDNETVATDWDRTHAWKSRKQSRIYSNAKNTEALPPPT
       :::::::::. ::.::::::..:.:: : :::::... : :.:. .  .:::...:  : 
CCDS12 LIYPTHYTGDDGYVSDTETSVVWNNEHVKTDWDRAKSQKMREQQALSREAKNSDVLQSP-
          560       570       580       590       600       610    

         620      
pF1KA0 SLDTVPSRDEL
        ::.. .::::
CCDS12 -LDSA-ARDEL
             620  

>>CCDS6901.2 CERCAM gene_id:51148|Hs108|chr9              (595 aa)
 initn: 2096 init1: 1712 opt: 2152  Z-score: 2596.3  bits: 490.5 E(32554): 2.7e-138
Smith-Waterman score: 2153; 52.8% identity (78.7% similar) in 581 aa overlap (47-626:27-595)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KA0 SSALLREGCRARFVAERDSEDDGEEPVVFPESPLQSPTVLVAVLARNAAHTLPHFLGCLE
                                     ::::  :.:..:.::::: :.:::.:: ::
CCDS69     MRAARAAPLLQLLLLLGPWLEAAGVAESPL--PAVVLAILARNAEHSLPHYLGALE
                   10        20        30          40        50    

         80        90       100       110       120       130      
pF1KA0 RLDYPKSRMAIWAATDHNVDNTTEIFREWLKNVQRLYHYVEWRPMDEPESYPDEIGPKHW
       :::::..:::.: :::::::::::...:::  :   :  : :::  ::. :::: :::::
CCDS69 RLDYPRARMALWCATDHNVDNTTEMLQEWLAAVGDDYAAVVWRPEGEPRFYPDEEGPKHW
           60        70        80        90       100       110    

        140       150       160       170       180       190      
pF1KA0 PTSRFAHVMKLRQAALRTAREKWSDYILFIDVDNFLTNPQTLNLLIAENKTIVAPMLESR
          :   .:.:.: ::  ::.  .::::: :.::.::: ::: ::....  .:::::.:.
CCDS69 TKERHQFLMELKQEALTFARNWGADYILFADTDNILTNNQTLRLLMGQGLPVVAPMLDSQ
          120       130       140       150       160       170    

        200       210       220       230       240       250      
pF1KA0 GLYSNFWCGITPKGFYKRTPDYVQIREWKRTGCFPVPMVHSTFLIDLRKEASDKLTFYPP
         ::::::::::.:.:.:: .:   .. .: ::: ::::::::: .:: :..:.:.::::
CCDS69 TYYSNFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRRGCFRVPMVHSTFLASLRAEGADQLAFYPP
          180       190       200       210       220       230    

        260       270       280       290       300       310      
pF1KA0 HQDYTWTFDDIIVFAFSSRQAGIQMYLCNREHYGYLPIPLKPHQTLQEDIENLIHVQIEA
       : .::: ::::::::.. . ::.....::...:::. .:.: :: :...  :.::. .::
CCDS69 HPNYTWPFDDIIVFAYACQAAGVSVHVCNEHRYGYMNVPVKSHQGLEDERVNFIHLILEA
          240       250       260       270       280       290    

        320       330       340       350       360       370      
pF1KA0 MIDRPPMEPSQYVSVVPKYPDKMGFDEIFMINLKRRKDRRDRMLRTLYEQEIEVKIVEAV
       ..: : :. : .:.   : :.:.::::.:.:.: :: :::.::: .:.:.::  ..:.::
CCDS69 LVDGPRMQASAHVTRPSKRPSKIGFDEVFVISLARRPDRRERMLASLWEMEISGRVVDAV
          300       310       320       330       340       350    

        380       390       400       410       420       430      
pF1KA0 DGKALNTSQLKALNIEMLPGYRDPYSSRPLTRGEIGCFLSHYSVWKEVIDRELEKTLVIE
       ::  ::.: .. :....::::.::::.: ::.::.::::::::.:.::. : : ..::.:
CCDS69 DGWMLNSSAIRNLGVDLLPGYQDPYSGRTLTKGEVGCFLSHYSIWEEVVARGLARVLVFE
          360       370       380       390       400       410    

        440       450       460       470       480       490      
pF1KA0 DDVRFEHQFKKKLMKLMDNIDQAQLDWELIYIGRKRMQVKEPEKAVPNVANLVEADYSYW
       :::::: .:. .: .::....  .:.:.:::.:::...  : : :: .. .:: : ::::
CCDS69 DDVRFESNFRGRLERLMEDVEAEKLSWDLIYLGRKQVN-PEKETAVEGLPGLVVAGYSYW
          420       430       440       450        460       470   

        500       510       520       530       540       550      
pF1KA0 TLGYVISLEGAQKLVGANPFGKMLPVDEFLPVMYNKHPVAEYKEYYESRDLKAFSAEPLL
       ::.:.. : ::.::....:. .:::::::::.:...::  .:: ..  ::: ::::.:::
CCDS69 TLAYALRLAGARKLLASQPLRRMLPVDEFLPIMFDQHPNEQYKAHFWPRDLVAFSAQPLL
           480       490       500       510       520       530   

        560       570       580        590       600       610     
pF1KA0 IYPTHYTGQPGYLSDTETSTIWDNET-VATDWDRTHAWKSRKQSRIYSNAKNTEALPPPT
         ::::.:.  .:::::::. ::...    .:  . . :. .. :.  .... ..: :  
CCDS69 AAPTHYAGDAEWLSDTETSSPWDDDSGRLISW--SGSQKTLRSPRLDLTGSSGHSLQPQ-
           540       550       560         570       580       590 

         620      
pF1KA0 SLDTVPSRDEL
            : ::::
CCDS69 -----P-RDEL
                  

>>CCDS69675.1 CERCAM gene_id:51148|Hs108|chr9             (517 aa)
 initn: 1852 init1: 1468 opt: 1874  Z-score: 2261.3  bits: 428.3 E(32554): 1.2e-119
Smith-Waterman score: 1875; 50.7% identity (77.6% similar) in 527 aa overlap (101-626:1-517)

               80        90       100       110       120       130
pF1KA0 FLGCLERLDYPKSRMAIWAATDHNVDNTTEIFREWLKNVQRLYHYVEWRPMDEPESYPDE
                                     ...:::  :   :  : :::  ::. ::::
CCDS69                               MLQEWLAAVGDDYAAVVWRPEGEPRFYPDE
                                             10        20        30

              140       150       160       170       180       190
pF1KA0 IGPKHWPTSRFAHVMKLRQAALRTAREKWSDYILFIDVDNFLTNPQTLNLLIAENKTIVA
        :::::   :   .:.:.: ::  ::.  .::::: :.::.::: ::: ::....  .::
CCDS69 EGPKHWTKERHQFLMELKQEALTFARNWGADYILFADTDNILTNNQTLRLLMGQGLPVVA
               40        50        60        70        80        90

              200       210       220       230       240       250
pF1KA0 PMLESRGLYSNFWCGITPKGFYKRTPDYVQIREWKRTGCFPVPMVHSTFLIDLRKEASDK
       :::.:.  ::::::::::.:.:.:: .:   .. .: ::: ::::::::: .:: :..:.
CCDS69 PMLDSQTYYSNFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRRGCFRVPMVHSTFLASLRAEGADQ
              100       110       120       130       140       150

              260       270       280       290       300       310
pF1KA0 LTFYPPHQDYTWTFDDIIVFAFSSRQAGIQMYLCNREHYGYLPIPLKPHQTLQEDIENLI
       :.::::: .::: ::::::::.. . ::.....::...:::. .:.: :: :...  :.:
CCDS69 LAFYPPHPNYTWPFDDIIVFAYACQAAGVSVHVCNEHRYGYMNVPVKSHQGLEDERVNFI
              160       170       180       190       200       210

              320       330       340       350       360       370
pF1KA0 HVQIEAMIDRPPMEPSQYVSVVPKYPDKMGFDEIFMINLKRRKDRRDRMLRTLYEQEIEV
       :. .::..: : :. : .:.   : :.:.::::.:.:.: :: :::.::: .:.:.::  
CCDS69 HLILEALVDGPRMQASAHVTRPSKRPSKIGFDEVFVISLARRPDRRERMLASLWEMEISG
              220       230       240       250       260       270

              380       390       400       410       420       430
pF1KA0 KIVEAVDGKALNTSQLKALNIEMLPGYRDPYSSRPLTRGEIGCFLSHYSVWKEVIDRELE
       ..:.::::  ::.: .. :....::::.::::.: ::.::.::::::::.:.::. : : 
CCDS69 RVVDAVDGWMLNSSAIRNLGVDLLPGYQDPYSGRTLTKGEVGCFLSHYSIWEEVVARGLA
              280       290       300       310       320       330

              440       450       460       470       480       490
pF1KA0 KTLVIEDDVRFEHQFKKKLMKLMDNIDQAQLDWELIYIGRKRMQVKEPEKAVPNVANLVE
       ..::.::::::: .:. .: .::....  .:.:.:::.:::...  : : :: .. .:: 
CCDS69 RVLVFEDDVRFESNFRGRLERLMEDVEAEKLSWDLIYLGRKQVN-PEKETAVEGLPGLVV
              340       350       360       370        380         

              500       510       520       530       540       550
pF1KA0 ADYSYWTLGYVISLEGAQKLVGANPFGKMLPVDEFLPVMYNKHPVAEYKEYYESRDLKAF
       : ::::::.:.. : ::.::....:. .:::::::::.:...::  .:: ..  ::: ::
CCDS69 AGYSYWTLAYALRLAGARKLLASQPLRRMLPVDEFLPIMFDQHPNEQYKAHFWPRDLVAF
     390       400       410       420       430       440         

              560       570       580        590       600         
pF1KA0 SAEPLLIYPTHYTGQPGYLSDTETSTIWDNET-VATDWDRTHAWKSRKQSRIYSNAKNTE
       ::.:::  ::::.:.  .:::::::. ::...    .:. ..  :. .. :.  .... .
CCDS69 SAQPLLAAPTHYAGDAEWLSDTETSSPWDDDSGRLISWSGSQ--KTLRSPRLDLTGSSGH
     450       460       470       480       490         500       

     610       620      
pF1KA0 ALPPPTSLDTVPSRDEL
       .: :       : ::::
CCDS69 SLQPQ------P-RDEL
       510              

>>CCDS3131.1 PLOD2 gene_id:5352|Hs108|chr3                (737 aa)
 initn: 329 init1: 143 opt: 304  Z-score: 362.2  bits: 77.4 E(32554): 7.4e-14
Smith-Waterman score: 355; 29.4% identity (59.6% similar) in 272 aa overlap (29-292:268-515)

                 10        20        30        40        50        
pF1KA0   MAARPAATLAWSLLLLSSALLREGCRARFVAERDSEDDGEEPVVFPESPLQS----PT
                                     .: .  ..:.:     :    :..    :.
CCDS31 ARAKNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPN
       240       250       260       270       280       290       

           60        70        80        90       100       110    
pF1KA0 VLVAVLARNAAHTLPHFLGCLERLDYPKSRMAIWAATDHNVDNTTEIFREWLKNVQRLYH
       : ..:. .. .  ::.::  :  :::::  . ..    ::     :...:  :... .. 
CCDS31 VSIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFI---HN----KEVYHE--KDIKVFFD
       300       310       320       330              340          

          120       130       140       150       160       170    
pF1KA0 YVEWRPMDEPESYPDEIGPKHWPTSRFAHVMKLRQAALRTAREKWSDYILFIDVDNFLTN
           .   : ..    .::..  ..  :. : .    .    ::  :: . .:.:  :::
CCDS31 ----KAKHEIKTIKI-VGPEENLSQAEARNMGMD---FCRQDEK-CDYYFSVDADVVLTN
          350        360       370          380        390         

          180       190        200       210       220       230   
pF1KA0 PQTLNLLIAENKTIVAPMLESRG-LYSNFWCGITPKGFYKRTPDYVQIREWKRTGCFPVP
       :.::..:: .:. :.::..  .: :.:::: ...: :.: :. :::.: . .:.: . ::
CCDS31 PRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVP
     400       410       420       430       440       450         

           240          250       260       270       280       290
pF1KA0 MVHSTFLID---LRKEASDKLTFYPPHQDYTWTFDDIIVFAFSSRQAGIQMYLCNREHYG
       .. ...::    ::.: ...  :    .:    .:  ...  ..:. :. ::. ::...:
CCDS31 YMANVYLIKGKTLRSEMNERNYFV---RD---KLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFG
     460       470       480             490       500       510   

              300       310       320       330       340       350
pF1KA0 YLPIPLKPHQTLQEDIENLIHVQIEAMIDRPPMEPSQYVSVVPKYPDKMGFDEIFMINLK
        :                                                          
CCDS31 RLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSE
           520       530       540       550       560       570   

>>CCDS5715.1 PLOD3 gene_id:8985|Hs108|chr7                (738 aa)
 initn: 265 init1: 129 opt: 284  Z-score: 338.0  bits: 72.9 E(32554): 1.7e-12
Smith-Waterman score: 356; 30.1% identity (57.8% similar) in 282 aa overlap (53-329:296-545)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KA0 EGCRARFVAERDSEDDGEEPVVFPESPLQSPTVLVAVLARNAAHTLPHFLGCLERLDYPK
                                     : :..::.... .  ::.::  :  :::: 
CCDS57 GNYVPNGWTPEGGCGFCNQDRRTLPGGQPPPRVFLAVFVEQPTPFLPRFLQRLLLLDYPP
         270       280       290       300       310       320     

             90       100       110        120       130       140 
pF1KA0 SRMAIWAATDHNVDNTTEIFREWLKNVQRLYHYVE-WRPMDEPESYPDEIGPKHWPTSRF
       .:....    ::    .:.:.:         : .. :  ...  :    .::..  .   
CCDS57 DRVTLFL---HN----NEVFHE--------PHIADSWPQLQDHFSAVKLVGPEEALSPGE
         330              340               350       360       370

             150        160       170       180       190          
pF1KA0 AHVMKLRQAALRTAREK-WSDYILFIDVDNFLTNPQTLNLLIAENKTIVAPMLESRG-LY
       :     :. :.   :.    .. . .:.:  ::: ::: .:: ::. ..::::  .: :.
CCDS57 A-----RDMAMDLCRQDPECEFYFSLDADAVLTNLQTLRILIEENRKVIAPMLSRHGKLW
                   380       390       400       410       420     

     200       210       220       230       240       250         
pF1KA0 SNFWCGITPKGFYKRTPDYVQIREWKRTGCFPVPMVHSTFLIDLRKEASDKLTFYPPHQD
       :::: ...:  .: :. :::.. . ::.: . ::.. ....:      .: : .  :..:
CCDS57 SNFWGALSPDEYYARSEDYVELVQRKRVGVWNVPYISQAYVIR-----GDTLRMELPQRD
         430       440       450       460            470       480

      260        270       280       290       300       310       
pF1KA0 -YTWT-FDDIIVFAFSSRQAGIQMYLCNREHYGYLPIPLKPHQTLQEDIENLIHVQIEAM
        .. .  :  ..:  : :. :: ..: :....: :        : . : :.: : ..  .
CCDS57 VFSGSDTDPDMAFCKSFRDKGIFLHLSNQHEFGRL------LATSRYDTEHL-HPDLWQI
              490       500       510             520        530   

       320       330       340       350       360       370       
pF1KA0 IDRPPMEPSQYVSVVPKYPDKMGFDEIFMINLKRRKDRRDRMLRTLYEQEIEVKIVEAVD
       .: :     ::.                                                
CCDS57 FDNPVDWKEQYIHENYSRALEGEGIVEQPCPDVYWFPLLSEQMCDELVAEMEHYGQWSGG
           540       550       560       570       580       590   

>>CCDS142.1 PLOD1 gene_id:5351|Hs108|chr1                 (727 aa)
 initn: 271 init1: 138 opt: 283  Z-score: 336.9  bits: 72.7 E(32554): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 315; 28.8% identity (59.6% similar) in 260 aa overlap (53-306:286-520)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KA0 EGCRARFVAERDSEDDGEEPVVFPESPLQSPTVLVAVLARNAAHTLPHFLGCLERLDYPK
                                     :::::.:. .. .  .  :.  : :: ::.
CCDS14 YIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTVLVGVFIEQPTPFVSLFFQRLLRLHYPQ
         260       270       280       290       300       310     

             90       100       110       120       130       140  
pF1KA0 SRMAIWAATDHNVDNTTEIFREWLKNVQRLYHYVEWRPMDEPESYPDEIGPKHWPTSRFA
       ..: ..   .:.  . ... .:.: .    :. :.             .::.     :.:
CCDS14 KHMRLFIH-NHEQHHKAQV-EEFLAQHGSEYQSVKL------------VGPE----VRMA
         320        330        340                   350           

            150       160       170       180       190        200 
pF1KA0 HVMKLRQAALRTAREKWSDYILFIDVDNFLTNPQTLNLLIAENKTIVAPMLESRG-LYSN
       ..    ..:    ...   : . .:.:  ::.:..: ::: .::...::..  .: :.::
CCDS14 NADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLMTRHGRLWSN
       360       370       380       390       400       410       

             210       220       230       240          250        
pF1KA0 FWCGITPKGFYKRTPDYVQIREWKRTGCFPVPMVHSTFLID---LRKEASDKLTFYPPHQ
       :: ...  :.: :. :::.: . .:.: . ::.. . .::    :: : ...  :.  :.
CCDS14 FWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQSSDLFH--HS
       420       430       440       450       460       470       

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pF1KA0 DYTWTFDDIIVFAFSSRQAGIQMYLCNREHYGYLPIPLKPHQT--LQEDIENLIHVQIEA
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CCDS14 ----KLDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHL-LSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNPEDW
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       : ..:. .. .  ::.::  :  :::::  . ..    ::     :...:  :... .. 
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           .   : ..    .::..  ..  :. : .    .    ::  :: . .:.:  :::
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       :.::..:: .:. :.::..  .: :.:::: ...: :.: :. :::.: . .:.: . ::
CCDS31 PRTLKILIEQNRKIIAPLVTRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVP
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       .. ...::    ::.: ...  :   . :   ..             :.    .: . : 
CCDS31 YMANVYLIKGKTLRSEMNERNYFVRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSP
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CCDS31 PKGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIV
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