Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0591
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0591, 1816 aa
1>>>pF1KA0591 1816 - 1816 aa - 1816 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7510+/-0.00114; mu= 13.3559+/- 0.069
mean_var=132.0249+/-25.703, 0's: 0 Z-trim(106.4): 90 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.111621
statistics sampled from 8885 (8974) to 8885 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 7.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 9102 1478.6 0
CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791) 3306 545.2 8e-154
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 2462 409.2 4.5e-113
CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690) 2342 390.0 4.1e-107
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103) 2069 345.9 4.8e-94
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 1445 245.5 1.3e-63
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 1445 245.5 1.3e-63
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 1445 245.5 1.3e-63
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 1445 245.5 1.3e-63
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826) 1438 244.4 2.9e-63
CCDS82598.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1266) 1408 239.5 6e-62
CCDS13122.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1317) 1408 239.5 6.2e-62
CCDS56178.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1392) 1408 239.5 6.5e-62
CCDS30963.1 KIF14 gene_id:9928|Hs108|chr1 (1648) 1170 201.2 2.6e-50
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 644 116.3 3.9e-25
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 644 116.3 3.9e-25
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 644 116.4 4e-25
CCDS65072.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1304) 622 112.9 7.8e-24
CCDS65071.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1335) 622 112.9 8e-24
CCDS6665.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1401) 622 112.9 8.3e-24
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 ( 963) 590 107.7 2.1e-22
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 ( 957) 577 105.6 9.1e-22
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032) 564 103.5 4.1e-21
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 536 99.1 1.2e-19
CCDS32325.2 KIF7 gene_id:374654|Hs108|chr15 (1343) 525 97.3 4e-19
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 514 95.7 2.4e-18
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 514 95.7 2.5e-18
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 687) 500 93.2 3.7e-18
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 724) 500 93.2 3.9e-18
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 826) 500 93.2 4.3e-18
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 833) 500 93.2 4.3e-18
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 848) 500 93.2 4.4e-18
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 684) 493 92.0 8e-18
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 665) 489 91.4 1.2e-17
CCDS58444.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 597) 458 86.4 3.5e-16
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 459 86.6 3.7e-16
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 459 86.6 4e-16
CCDS7407.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10 (1780) 423 80.9 4.5e-14
CCDS60590.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10 (1820) 423 80.9 4.6e-14
CCDS6427.1 KIFC2 gene_id:90990|Hs108|chr8 ( 838) 416 79.7 5.2e-14
CCDS53774.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1621) 416 79.8 9.1e-14
CCDS53775.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1637) 416 79.8 9.2e-14
CCDS31773.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1661) 416 79.8 9.3e-14
CCDS53776.1 KIF21A gene_id:55605|Hs108|chr12 (1674) 416 79.8 9.4e-14
CCDS58054.1 KIF21B gene_id:23046|Hs108|chr1 (1610) 402 77.5 4.3e-13
CCDS58055.1 KIF21B gene_id:23046|Hs108|chr1 (1623) 402 77.5 4.4e-13
CCDS30965.1 KIF21B gene_id:23046|Hs108|chr1 (1624) 402 77.5 4.4e-13
CCDS58056.1 KIF21B gene_id:23046|Hs108|chr1 (1637) 402 77.5 4.4e-13
CCDS34430.1 KIFC1 gene_id:3833|Hs108|chr6 ( 673) 390 75.4 7.8e-13
CCDS72774.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 671) 381 74.0 2.1e-12
>>CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770 aa)
initn: 10938 init1: 9093 opt: 9102 Z-score: 7919.5 bits: 1478.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11465; 97.4% identity (97.4% similar) in 1816 aa overlap (1-1816:1-1770)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFGGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVDNCTSKSKKKKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEV------SKKKKK
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDIDPLIDDYSGSGSKYLKDFQNNKHRYL
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIID---------------------------
360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LASENQRPGHFSTASMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKES
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 -------------TSMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKES
390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 EKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNED
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPC
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWT
560 570 580 590 600 610
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 FAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQVET
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 RSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAIS
680 690 700 710 720 730
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 VELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPELLPTEMEKTHEDRPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPELLPTEMEKTHEDRPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYW
740 750 760 770 780 790
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SLEKLKQRLDLMREMYDRAGEMASSAQDESETTVTGSDPFYDRFHWFKLVGSSPIFHGCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLEKLKQRLDLMREMYDRAGEMASSAQDESETTVTGSDPFYDRFHWFKLVGSSPIFHGCV
800 810 820 830 840 850
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 NERLADRTPSPTFSTADSDITELADEQQDEMEDFDDEAFVDDAGSDAGTEEGSDLFSDGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NERLADRTPSPTFSTADSDITELADEQQDEMEDFDDEAFVDDAGSDAGTEEGSDLFSDGH
860 870 880 890 900 910
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 DPFYDRSPWFILVGRAFVYLSNLLYPVPLIHRVAIVSEKGEVRGFLRVAVQAIAADEEAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DPFYDRSPWFILVGRAFVYLSNLLYPVPLIHRVAIVSEKGEVRGFLRVAVQAIAADEEAP
920 930 940 950 960 970
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 DYGSGIRQSGTAKISFDNEYFNQSDFSSVAMTRSGLSLEELRIVEGQGQSSEVITPPEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DYGSGIRQSGTAKISFDNEYFNQSDFSSVAMTRSGLSLEELRIVEGQGQSSEVITPPEEI
980 990 1000 1010 1020 1030
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SRINDLDLKSSTLLDGKMVMEGFSEEIGNHLKLGSAFTFRVTVLQASGILPEYADIFCQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SRINDLDLKSSTLLDGKMVMEGFSEEIGNHLKLGSAFTFRVTVLQASGILPEYADIFCQF
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 NFLHRHDEAFSTEPLKNNGRGSPLAFYHVQNIAVEITESFVDYIKTKPIVFEVFGHYQQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NFLHRHDEAFSTEPLKNNGRGSPLAFYHVQNIAVEITESFVDYIKTKPIVFEVFGHYQQH
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 PLHLQGQELNSPPQPCRRFFPPPMPLSKPVPATKLNTMSKTSLGQSMSKYDLLVWFEISE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PLHLQGQELNSPPQPCRRFFPPPMPLSKPVPATKLNTMSKTSLGQSMSKYDLLVWFEISE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 LEPTGEYIPAVVDHTAGLPCQGTFLLHQGIQRRITVTIIHEKGSELHWKDVRELVVGRIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEPTGEYIPAVVDHTAGLPCQGTFLLHQGIQRRITVTIIHEKGSELHWKDVRELVVGRIR
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 NKPEVDEAAVDAILSLNIISAKYLKSSHNSSRTFYRFEAVWDSSLHNSLLLNRVTPYGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NKPEVDEAAVDAILSLNIISAKYLKSSHNSSRTFYRFEAVWDSSLHNSLLLNRVTPYGEK
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 IYMTLSAYLELDHCIQPAVITKDVCMVFYSRDAKISPPRSLRSLFGSGYSKSPDSNRVTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IYMTLSAYLELDHCIQPAVITKDVCMVFYSRDAKISPPRSLRSLFGSGYSKSPDSNRVTG
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 IYELSLCKMSDTGSPGMQRRRRKILDTSVAYVRGEENLAGWRPRGDSLILEHQWELEKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IYELSLCKMSDTGSPGMQRRRRKILDTSVAYVRGEENLAGWRPRGDSLILEHQWELEKLE
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 LLHEVEKTRHFLLLRERLGDSIPKSLSDSLSPSLSSGTLSTSTSISSQISTTTFESAITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLHEVEKTRHFLLLRERLGDSIPKSLSDSLSPSLSSGTLSTSTSISSQISTTTFESAITP
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 SESSGYDSGDIESLVDREKELATKCLQLLTHTFNREFSQVHGSVSDCKLSDISPIGRDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SESSGYDSGDIESLVDREKELATKCLQLLTHTFNREFSQVHGSVSDCKLSDISPIGRDPS
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 ESSFSSATLTPSSTCPSLVDSRSNSLDQKTPEANSRASSPCPEFEQFQIVPAVETPYLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ESSFSSATLTPSSTCPSLVDSRSNSLDQKTPEANSRASSPCPEFEQFQIVPAVETPYLAR
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 AGKNEFLNLVPDIEEIRPSSVVSKKGYLHFKEPLYSNWAKHFVVVRRPYVFIYNSDKDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AGKNEFLNLVPDIEEIRPSSVVSKKGYLHFKEPLYSNWAKHFVVVRRPYVFIYNSDKDPV
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 ERGIINLSTAQVEYSEDQQAMVKTPNTFAVCTKHRGVLLQALNDKDMNDWLYAFNPLLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERGIINLSTAQVEYSEDQQAMVKTPNTFAVCTKHRGVLLQALNDKDMNDWLYAFNPLLAG
1700 1710 1720 1730 1740 1750
1810
pF1KA0 TIRSKLSRRCPSQSKY
::::::::::::::::
CCDS11 TIRSKLSRRCPSQSKY
1760 1770
>>CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791 aa)
initn: 8091 init1: 2338 opt: 3306 Z-score: 2875.1 bits: 545.2 E(32554): 8e-154
Smith-Waterman score: 8237; 69.6% identity (85.1% similar) in 1838 aa overlap (1-1815:1-1790)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
:.::::::::::::::::: :..:::::::.:..:.:.:::.:::.::::::::::::::
CCDS58 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFGGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
:::: .:::..:: :::.::: ::: :::::::::::::::::::::::::..: ::::
CCDS58 SPEDINYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::.:: .:::. :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QLCEDLFSRINDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
:::::::::.:: ::::.:::::::::::::::::::::::.:.::::.:: :::..:::
CCDS58 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVDNCTSKSKKKKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. .:.:::::
CCDS58 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS58 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDIDPLIDDYSGSGSKYLKDFQNNKHRYL
::::: ::.::::.:::::.::: ::::::: : . . .: :
CCDS58 NEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGDITDTNTV-----PGGPK-------------
370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LASENQRPGHFSTASMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKES
...: .: .. : : .:::... ::.:..:::. .::.:::::::::.
CCDS58 ----------LTNALVG-MSPSSSLSALSSRAA--SVSSLHERILFAPGSEEAIERLKET
410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 EKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNED
::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALLAEMGVAMREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNED
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pF1KA0 PLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPC
:::::::::::::::::::. :.:::::::::: ::::::.:::. ...:..::::::
CCDS58 PLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDIVLSGHFIKEEHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPC
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pF1KA0 ERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWT
: ..::::::.:..: :::::::::::.:::::::::::: :::.:: ::::.:::::.
CCDS58 EGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKSHVFRFNHPEQARQERERTPCAETPAEPVDWA
570 580 590 600 610 620
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pF1KA0 FAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQVET
:::::::::::::::::::.::::.: :..:.::: :::::::::::::.:::::...
CCDS58 FAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQYRREREEATYLLEQQRLDYESKLEALQKQMDS
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pF1KA0 RSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAIS
: . :::: :.:: ::..: ::: ::::::: .:::::::::::::..::::::::
CCDS58 RYYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELALWAFRKWKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAIS
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pF1KA0 VELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPELLPTEMEKTHEDRPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYW
::::::::::::::::::::::::.::: : : .: ::::::.::::::: ::::::::
CCDS58 VELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPPEAAKDRETRPFPRTIVAVEVQDQKNGATHYW
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pF1KA0 SLEKLKQRLDLMREMYDRAGEMASSAQDESETTVTGSDPFYDRFHWFKLVGSS-------
.::::.:::::::::::::.:. ::. .. ...:::.::::::: ::.:::::
CCDS58 TLEKLRQRLDLMREMYDRAAEVPSSVIEDCDNVVTGGDPFYDRFPWFRLVGSSAISGCNS
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pF1KA0 -PIFHGCVNERLADRTPSPTFSTADSDITELADEQ----QDEMEDFDDEAFVDDAGSDAG
:... :..::.: :::::::. ::: :: :.:: ..: :. ... .: .:.
CCDS58 YPLLNTCMSERMAALTPSPTFSSPDSDATEPAEEQSVGEEEEEEEEEEDEEEEDLEDDVF
870 880 890 900 910 920
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pF1KA0 TEEGSDLFSDGHDPFYDRSPWFILVGRAFVYLSNLLYPVPLIHRVAIVSEKGEVRGFLRV
:.. . ::.:::::: : : ::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::
CCDS58 PEHA---LCDGRDPFYDRPPLFSLVGRAFVYLSNLLYPVPLVHRVAIVSEKGEVKGFLRV
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:::::.:::::::::::.:::::::::::...:.. . : :.:.::: : :::::::
CCDS58 AVQAISADEEAPDYGSGVRQSGTAKISFDDQHFEKFQSESCPVVGMSRSGTSQEELRIVE
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::::...: .:.. . . . :::. : ...: . .::.::..::::::
CCDS58 GQGQGADVGPSADEVNNNTCSAVPPEGLLLDSSEKAALDGPLDAALDHLRLGNTFTFRVT
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:::::.: :::::::::::.::::::::::::::.::: ::.::::::::::.:.::..
CCDS58 VLQASSISAEYADIFCQFNFIHRHDEAFSTEPLKNTGRGPPLGFYHVQNIAVEVTKSFIE
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CCDS58 YIKSQPIVFEVFGHYQQHPFPPLCKDVLSPLRPSRRHFPRVMPLSKPVPATKLSTLTRPC
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pF1KA0 LGQSMSKYDLLVWFEISELEPTGEYIPAVVDHTAGLPCQGTFLLHQGIQRRITVTIIHEK
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CCDS58 PGPCHCKYDLLVYFEICELEANGDYIPAVVDHRGGMPCMGTFLLHQGIQRRITVTLLHET
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::...::.::::::::::: ::.::. .: ::::::.:. :.. .... ::::.:::.:
CCDS58 GSHIRWKEVRELVVGRIRNTPETDESLIDPNILSLNILSSGYIHPAQDD-RTFYQFEAAW
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pF1KA0 DSSLHNSLLLNRVTPYGEKIYMTLSAYLELDHCIQPAVITKDVCMVFYSRDAKISPPRSL
:::.:::::::::::: ::::::::::.:...: ::::.::: ::::::::::. ::.
CCDS58 DSSMHNSLLLNRVTPYREKIYMTLSAYIEMENCTQPAVVTKDFCMVFYSRDAKLPASRSI
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pF1KA0 RSLFGSGYSKSPDSNRVTGIYELSLCKMSDTGSPGMQRRRRKILDTSVAYVRGEENLAGW
:.::::: .. .::::::.::::::...:.::::::::::..:::::::::::::::::
CCDS58 RNLFGSGSLRASESNRVTGVYELSLCHVADAGSPGMQRRRRRVLDTSVAYVRGEENLAGW
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:::.:::::.:::::::: ::.:::::::.:::::.: .. . . ..:::..: . :
CCDS58 RPRSDSLILDHQWELEKLSLLQEVEKTRHYLLLREKL-ETAQRPVPEALSPAFSEDSESH
1470 1480 1490 1500 1510 1520
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pF1KA0 STSISSQISTTTFESAITPSESSGYDSGDIESLVDREKELATKCLQLLTHTFNREFSQVH
..: :: .: . : : .:. .:..:::.:::.:::::::::... :
CCDS58 GSS-----------SASSPLSAEGRPS-PLEAPNERQRELAVKCLRLLTHTFNREYTHSH
1530 1540 1550 1560 1570
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pF1KA0 G--SVSDCKLSDIS-PIGRDPSESSFSSATLTPSSTCPSLVDSRSNSLDQKTPEANSRAS
:.:. :::..: . :::: : .. :::::::::::::..: .. : .::. :: .
CCDS58 VCVSASESKLSEMSVTLLRDPSMSPLGVATLTPSSTCPSLVEGRYGATDLRTPQPCSRPA
1580 1590 1600 1610 1620 1630
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pF1KA0 SPCPEFEQFQIVPAVETPYLARAGKNEFLNL-VPDIEEIRPSSVVSKKGYLHFKEPLYSN
:: ::. . .: : .: : ::::.::: : .::::::::: :: :.
CCDS58 SPEPELLPEADSKKLPSPARATETDKEPQRLLVPDIQEIRVSPIVSKKGYLHFLEPHTSG
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pF1KA0 WAKHFVVVRRPYVFIYNSDKDPVERGIINLSTAQVEYSEDQQAMVKTPNTFAVCTKHRGV
::..::::::::...:::::: ::: ..::.:::::::::::::.::::::::::.:::.
CCDS58 WARRFVVVRRPYAYMYNSDKDTVERFVLNLATAQVEYSEDQQAMLKTPNTFAVCTEHRGI
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pF1KA0 LLQALNDKDMNDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRRCPSQSKY
:::: .::::.::::::::::::::::::::: .: .
CCDS58 LLQAASDKDMHDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRRRSAQMRV
1760 1770 1780 1790
>>CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
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pF1KA0 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFGGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
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pF1KA0 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVDNCTSKSKKKKK
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CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEV------SKKKKK
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pF1KA0 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
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:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIID---------------------------
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.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 -------------TSMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKES
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pF1KA0 EKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNED
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWT
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pF1KA0 FAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQVET
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:
CCDS11 FAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLDADSDSGDDSDKRSC
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pF1KA0 RSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAIS
CCDS11 EESWKLITSLREKLPPSKLQTIVKKCGLPSSGKKREPIKMYQIPQRRRLSKDSKWVTISD
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>>CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690 aa)
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Smith-Waterman score: 7838; 67.7% identity (82.0% similar) in 1826 aa overlap (1-1815:1-1689)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
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CCDS46 MAGASVKVAVRVRPFNSREMSRDSKCIIQMSGSTTTIVNPKQPKETPKSFSFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KA0 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFGGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
:::: .:::..:: :::.::: ::: :::::::::::::::::::::::::..: ::::
CCDS46 SPEDINYASQKQVYRDIGEEMLQHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEKDQQGIIP
70 80 90 100 110 120
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pF1KA0 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::.:: .:::. :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLCEDLFSRINDTTNDNMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
:::::::::.:: ::::.:::::::::::::::::::::::.:.::::.:: :::..:::
CCDS46 LSKLAVTSYNDIQDLMDSGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFNIIFTQKRHDAETNITTEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVDNCTSKSKKKKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. .:.:::::
CCDS46 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEMDSGPNKNKKKKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS46 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIRCNAVI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDIDPLIDDYSGSGSKYLKDFQNNKHRYL
::::: ::.::::.:::::.::: ::::::: :.
CCDS46 NEDPNNKLIRELKDEVTRLRDLLYAQGLGDITDM--------------------------
370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LASENQRPGHFSTASMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKES
: .. ... : : .:::... ::.:..:::. .::.:::::::::.
CCDS46 ------------TNALVGMSPSSSLSALSSRAA--SVSSLHERILFAPGSEEAIERLKET
400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 EKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNED
::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALLAEMGVAMREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNED
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPC
:::::::::::::::::::. :.:::::::::: ::::::.:::. ...:..::::::
CCDS46 PLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDIVLSGHFIKEEHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPC
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 ERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWT
: ..::::::.:..: :::::::::::.:::::::::::: :::.:: ::::.:::::.
CCDS46 EGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKSHVFRFNHPEQARQERERTPCAETPAEPVDWA
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 FAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQVET
:::::::::::::::::::.::::.: :..:.::: :::::::::::::.:::::...
CCDS46 FAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQYRREREEATYLLEQQRLDYESKLEALQKQMDS
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 RSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAIS
: . :::: :.:: ::..: ::: ::::::: .:::::::::::::..::::::::
CCDS46 RYYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELALWAFRKWKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAIS
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 VELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPELLPTEMEKTHEDRPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYW
::::::::::::::::::::::::.::: : : .: ::::::.::::::: ::::::::
CCDS46 VELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPPEAAKDRETRPFPRTIVAVEVQDQKNGATHYW
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SLEKLKQRLDLMREMYDRAGEMASSAQDESETTVTGSDPFYDRFHWFKLVGSSPIFHGCV
.::::.:::::::::::::.:. ::. .. ...:::.:::::::
CCDS46 TLEKLRQRLDLMREMYDRAAEVPSSVIEDCDNVVTGGDPFYDRF----------------
810 820 830 840
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 NERLADRTPSPTFSTADSDITELADEQQDEMEDFDDEAFVDDAGSDAGTEEGSDLFSDGH
CCDS46 ------------------------------------------------------------
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 DPFYDRSPWFILVGRAFVYLSNLLYPVPLIHRVAIVSEKGEVRGFLRVAVQAIAADEEAP
::: ::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::.::::::
CCDS46 -------PWFRLVGRAFVYLSNLLYPVPLVHRVAIVSEKGEVKGFLRVAVQAISADEEAP
850 860 870 880 890
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 DYGSGIRQSGTAKISFDNEYFNQSDFSS---VAMTRSGLSLEELRIVEGQGQSSEVITPP
:::::.:::::::::::...:.. . : :.:.::: : :::::::::::...:
CCDS46 DYGSGVRQSGTAKISFDDQHFEKFQSESCPVVGMSRSGTSQEELRIVEGQGQGADVGPSA
900 910 920 930 940 950
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 EEISRINDLDLKS-STLLDG--KMVMEGFSEEIGNHLKLGSAFTFRVTVLQASGILPEYA
.:.. . . . :::. : ...: . .::.::..:::::::::::.: :::
CCDS46 DEVNNNTCSAVPPEGLLLDSSEKAALDGPLDAALDHLRLGNTFTFRVTVLQASSISAEYA
960 970 980 990 1000 1010
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 DIFCQFNFLHRHDEAFSTEPLKNNGRGSPLAFYHVQNIAVEITESFVDYIKTKPIVFEVF
::::::::.::::::::::::::.::: ::.::::::::::.:.::..:::..:::::::
CCDS46 DIFCQFNFIHRHDEAFSTEPLKNTGRGPPLGFYHVQNIAVEVTKSFIEYIKSQPIVFEVF
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 GHYQQHPLHLQGQELNSPPQPCRRFFPPPMPLSKPVPATKLNTMSKTSLGQSMSKYDLLV
:::::::. ... :: .: :: :: ::::::::::::.:... : ::::::
CCDS46 GHYQQHPFPPLCKDVLSPLRPSRRHFPRVMPLSKPVPATKLSTLTRPCPGPCHCKYDLLV
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA0 WFEISELEPTGEYIPAVVDHTAGLPCQGTFLLHQGIQRRITVTIIHEKGSELHWKDVREL
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CCDS46 YFEICELEANGDYIPAVVDHRGGMPCMGTFLLHQGIQRRITVTLLHETGSHIRWKEVREL
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA0 VVGRIRNKPEVDEAAVDA-ILSLNIISAKYLKSSHNSSRTFYRFEAVWDSSLHNSLLLNR
::::::: ::.::. .: ::::::.:. :.. .... ::::.:::.::::.::::::::
CCDS46 VVGRIRNTPETDESLIDPNILSLNILSSGYIHPAQDD-RTFYQFEAAWDSSMHNSLLLNR
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA0 VTPYGEKIYMTLSAYLELDHCIQPAVITKDVCMVFYSRDAKISPPRSLRSLFGSGYSKSP
:::: ::::::::::.:...: ::::.::: ::::::::::. ::.:.::::: ..
CCDS46 VTPYREKIYMTLSAYIEMENCTQPAVVTKDFCMVFYSRDAKLPASRSIRNLFGSGSLRAS
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KA0 DSNRVTGIYELSLCKMSDTGSPGMQRRRRKILDTSVAYVRGEENLAGWRPRGDSLILEHQ
.::::::.::::::...:.::::::::::..::::::::::::::::::::.:::::.::
CCDS46 ESNRVTGVYELSLCHVADAGSPGMQRRRRRVLDTSVAYVRGEENLAGWRPRSDSLILDHQ
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KA0 WELEKLELLHEVEKTRHFLLLRERLGDSIPKSLSDSLSPSLSSGTLSTSTSISSQISTTT
:::::: ::.:::::::.:::::.: .. . . ..:::..: . : ..:
CCDS46 WELEKLSLLQEVEKTRHYLLLREKL-ETAQRPVPEALSPAFSEDSESHGSS---------
1380 1390 1400 1410 1420
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KA0 FESAITPSESSGYDSGDIESLVDREKELATKCLQLLTHTFNREFSQVHG--SVSDCKLSD
:: .: . : : .:. .:..:::.:::.:::::::::... : :.:. :::.
CCDS46 --SASSPLSAEGRPS-PLEAPNERQRELAVKCLRLLTHTFNREYTHSHVCVSASESKLSE
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA0 IS-PIGRDPSESSFSSATLTPSSTCPSLVDSRSNSLDQKTPEANSRASSPCPEFEQFQIV
.: . :::: : .. :::::::::::::..: .. : .::. :: .:: ::.
CCDS46 MSVTLLRDPSMSPLGVATLTPSSTCPSLVEGRYGATDLRTPQPCSRPASPEPELLPEADS
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1680 1690 1700 1710 1720
pF1KA0 PAVETPYLARAGKNEFLNL-VPDIEEIRPSSVVSKKGYLHFKEPLYSNWAKHFVVVRRPY
. .: : .: : ::::.::: : .::::::::: :: :.::..::::::::
CCDS46 KKLPSPARATETDKEPQRLLVPDIQEIRVSPIVSKKGYLHFLEPHTSGWARRFVVVRRPY
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KA0 VFIYNSDKDPVERGIINLSTAQVEYSEDQQAMVKTPNTFAVCTKHRGVLLQALNDKDMND
...:::::: ::: ..::.:::::::::::::.::::::::::.:::.:::: .::::.:
CCDS46 AYMYNSDKDTVERFVLNLATAQVEYSEDQQAMLKTPNTFAVCTEHRGILLQAASDKDMHD
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1790 1800 1810
pF1KA0 WLYAFNPLLAGTIRSKLSRRCPSQSKY
:::::::::::::::::::: .: .
CCDS46 WLYAFNPLLAGTIRSKLSRRRSAQMRV
1670 1680 1690
>>CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSIINPKNPKEAPKSFSFDYSYWSHT
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CCDS11 MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTSIINPKQSKDAPKSFTFDYSYWSHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 SPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFGGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQAGIIP
: ::: ::::..:: :::.::::::: ::::::::::::::::::::::.:: .: ::.:
CCDS11 STEDPQFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 QLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKNKGNLRVREHPLLGPYVED
::::.:: ....: . ..:::::::::::::::::::::::..:.:::::::.:::::.:
CCDS11 QLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNETNLSTEK
:::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::. ::. :.:..::
CCDS11 LSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLTGLDSEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 VSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVDNCTSKSKKKKK
:::::::::::::::::.::.: :::::::::::::::::::::::.... ::.:
CCDS11 VSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQS------KKRK
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 TDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQIKCNAVI
.::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::.:::::::::::.:::.:::.:
CCDS11 SDFIPYRDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAII
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 NEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDIDPLIDDYSGSGSKYLKDFQNNKHRYL
::::::.:.:::.:::.::..:: :::: :.:. . ::
CCDS11 NEDPNARLIRELQEEVARLRELLMAQGL-------------SASALEGLK----------
360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LASENQRPGHFSTASMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKES
. :.. : . ..: :::: . . : . : : : :::.:::.:.
CCDS11 -TEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPSSPTTHNGELEPSFSPNTE---SQIGPEEAMERLQET
400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 EKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNED
::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS11 EKIIAELNETWEEKLRKTEALRMEREALLAEMGVAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNED
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 PLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPC
:::::::::.::::.:::::.: .:: :.: :.:.::.::: . .:::.::::::
CCDS11 PLMSECLLYHIKDGVTRVGQVD----MDIKLTGQFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPC
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650
pF1KA0 ERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREK--TPSAETPSEPVD
: .::::::: :..:. :.:::::.:::::::::::::::: :::. : ::::::
CCDS11 EGAETYVNGKLVTEPLVLKSGNRIVMGKNHVFRFNHPEQARLERERGVPPPPGPPSEPVD
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 WTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQV
:.:::.::::.::::.: :::::::..: :.::::::::::::::: .:
CCDS11 WNFAQKELLEQQGIDIKLEMEKRLQDLENQYRKEKEEADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKR
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 ETRSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANA
CCDS11 SCEESWRLISSLREQLPPTTVQTIVKRCGLPSSGKRRAPRRVYQIPQRRRLQGKDPRWAT
690 700 710 720 730 740
>>CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749 aa)
initn: 1416 init1: 533 opt: 1445 Z-score: 1255.6 bits: 245.5 E(32554): 1.3e-63
Smith-Waterman score: 1978; 33.8% identity (59.1% similar) in 1460 aa overlap (1-1427:1-1287)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSI-INPKNPKEA----PKSFSFDYS
:: ..:::::::::.: :: ..::...:.::.: . :.: :.. :: :.:::
CCDS47 MSDTKVKVAVRVRPMNRRELELNTKCVVEMEGNQTVLHPPPSNTKQGERKPPKVFAFDYC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 YWSHTSPEDPCFASQNRVYNDIGKEMLLHAFGGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGKQEESQ
.:: . .:.:. :.. .:. .: .:: :::.:::::::::.:::..:::. : :
CCDS47 FWSMDESNTTKYAGQEVVFKCLGEGILEKAFQGYNACIFAYGQTGSGKSFSMMGHAE--Q
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 AGIIPQLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPK-NKGNLRVREHPLL
:.::.:: ::..:. . :: ....::::::::: :.:::::.:: .. .:.:::: .:
CCDS47 LGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQSLKVREHKVL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 GPYVEDLSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQKKHDNET
::::. ::.:::::. :: .::. :::.:::::::::: ::::::::.:..:: .: ..
CCDS47 GPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIIITQTLYDLQS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 NLSTEKVSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVISALAEVDNCTSK
. : :::::.::::::::::...::: : :::::.:::::::::: :::.:: :. ..:
CCDS47 GNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSLA--DQAAGK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SKKKKKTDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYADRAKQI
.:.: :.:::::::::::..::::::.:.:.:..::: ::.:::::::::::::.:
CCDS47 GKSK----FVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRAKRI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 KCNAVINEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDIDPLIDDYSGSGSKYLKDFQN
.::.:::::::..:::.::: .:.. :
CCDS47 VNHAVVNEDPNAKVIRELREEVEKLREQLS------------------------------
360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 NKHRYLLASENQRPGHFSTASMGSLTSSPSSCSLSSQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAI
: . :..: :
CCDS47 ----------------------------------------------QAEAMKAP---ELK
390
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 ERLKESEKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHL
:.:.::::.: ::. :::::::::: : .::. : ::.... .: .: .:
CCDS47 EKLEESEKLIKELTVTWEEKLRKTEEIAQERQRQLESMGISLEMSGIKVG----DDKCYL
400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 VNLNEDPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVI
:::: :: ..: :.::.:: :::: :. ::: : : :. .:: . . ...:.
CCDS47 VNLNADPALNELLVYYLKDH-TRVG---ADTSQDIQLFGIGIQPQHC--EIDIASDGD--
450 460 470 480 490 500
600 610 620 630 640
pF1KA0 VTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARA------EREKTP
::: : : ... ::: : . .:: :.::. :.:: ::.: :.. : :.: :
CCDS47 VTLTPKENARSCVNGTLVCSTTQLWHGDRILWGNNHFFRINLPKRKRRDWLKDFEKETGP
510 520 530 540 550 560
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 -------SAETPSEP-VDWTFAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLL
..:. ::: .. ::: :.. : .. .. ... .: .: : .::. : :
CCDS47 PEHDLDAASEASSEPDYNYEFAQMEVIMKT-LNSNDPVQNVVQVLEKQYLEEKRSA---L
570 580 590 600 610
710 720 730 740 750
pF1KA0 EQQRLDYESKLQALQKQVETRSLAAETTEEEEEEEEVPWTQH--EFELAQWAFRKWK--S
:.::: :: .:. :..: :. . . ... .... . ...::: .. .
CCDS47 EEQRLMYERELEQLRQQ-----LSPDRQPQSSGPDRLAYSSQTAQQKVTQWAEERDELFR
620 630 640 650 660 670
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 HQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPELLPTEMEKTHE
.....::. : . ..::: .. :..: ...: .: .:. ....
CCDS47 QSLAKLREQLVKANTLVREANFLAEEMSKLTDYQVTLQ------------IPAANLSANR
680 690 700 710 720
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pF1KA0 DRPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYWSLEKLKQRLDLMREMYDRAGEMASSAQDESETTVTG
: . :..:. :. .:. :..:::...: ::..:.. : . :. .
CCDS47 KRGAIVSEPAIQVRR-KGKSTQVWTIEKLENKLIDMRDLYQEWKEKVPEAK---RLYGKR
730 740 750 760 770
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 SDPFYDRFHWFKLVGSSPIFHGCVNERLADRTPSPTFSTADSDITELADEQQDEMEDFDD
.::::. . .:.: . .: :. . . : .: .: : . ..
CCDS47 GDPFYEAQENHNLIGVANVFLECLFCDVKLQYAVPIISQQGEVAGRLHVEVM-RVTGAVP
780 790 800 810 820 830
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 EAFVDDAGSDAGTEEGSDLFSDGHDPFYDRSPWFILVGRAFVYLSNLLYPVPLIHRVAIV
: :.: .:. ..: :: :. . : :. :. . .. : :. : . .:
CCDS47 ERVVEDDSSENSSESGSLEVVDSSGEIIHRVKK--LTCRVKIKEATGL-PLNLSN---FV
840 850 860 870 880
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 SEKGEVRGFLRVAVQAIAADEEAPDYGSGIRQSGTAKISFDNEYF-NQSDFSSVAMTRSG
. . .: : ..: :.:. : : :. .: ..: : .. .. ..
CCDS47 FCQYTFWDQCESTVAAPVVDPEVPSPQSKDAQY-TVTFSHCKDYVVNVTEEFLEFISDGA
890 900 910 920 930 940
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 LSLEEL-RIVEGQGQSSEVITPPEEISRINDLDLKSSTLLDGKMVMEGFSEEIGNHLKLG
:..: . :.:.: : ....: :. :: : . : . :.:.
CCDS47 LAIEVWGHRCAGNGSS---------IWEVDSLHAKTRTLHDRWNEVTRRIEMWISILELN
950 960 970 980 990
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 SAFTFRVTVL-QASGILPEYADIFCQFNFLHRHDEAFSTEPLKNNGRGSPLAFYHVQNIA
. .. : ::. . . . :: :. : . ...:....: :: . ...
CCDS47 ELGEYAAVELHQAKDV--NTGGIF-QLRQGHSRRVQVTVKPVQHSGT-LPLMVEAILSVS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 VEITESFVDYIKTKPIVFEVFGHYQQHPLHLQGQELNSPPQPCRRFFPPPMPLSKPVPAT
. . : .:: . . . ::.. :. .: : :: . :.. . .
CCDS47 I----GCVTARSTK--LQRGLDSYQEEDLNCV-RERWSDALIKRREY-----LDEQIKKV
1060 1070 1080 1090 1100
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA0 KLNTMSKTSLGQSMSKYDLLV--WFEISELEPTGEYIPAVVDHTAGLPCQGTFLLHQGIQ
. : :: ... . :: : ..: : .. .:: . : : . .. :..
CCDS47 S-NKTEKTE--DDVEREAQLVEQWVGLTE-ERNAVLVPAPGSGIPGAPAD--WIPPPGME
1110 1120 1130 1140 1150
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA0 RRITVTIIHEKGSELHWKDVRELVVGRIRNKPEVDEAAVDAILSLNIISAKYLKSSHNSS
.: : .. ....: .. : .:: :.. ..:..:: . : . . :
CCDS47 THIPVLFLDLNADDL---SANEQLVG-----PHA--SGVNSILPKEHGSQFFYLPIIKHS
1160 1170 1180 1190 1200
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA0 RTFYRFEAVWDSSLHNSLLLNRVTPYGEKIYMTLSAYLELDH-CIQPAVITKDVCMVFYS
: ::::.:.:. :::::: .:.::. ... ..:.: . :. : . .:.
CCDS47 DDEVSATASWDSSVHDSVHLNRVTPQNERIYLIVKTTVQLSHPAAMELVLRKRIAANIYN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1420 1430 1440 1450 1460
pF1KA0 RDAKISPPR---SLRSLFGSGYSKSPDSNRVTGIYELSLCKMSDTGSPGMQRRRRKILDT
... . . ::...: :
CCDS47 KQSFTQSLKRRISLKNIFYSCGVTYEIVSNIPKATEEIEDRETLALLAARSENEGTSDGE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
>>CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757 aa)
initn: 1416 init1: 533 opt: 1445 Z-score: 1255.6 bits: 245.5 E(32554): 1.3e-63
Smith-Waterman score: 1978; 33.8% identity (59.1% similar) in 1460 aa overlap (1-1427:1-1287)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MSGASVKVAVRVRPFNSRETSKESKCIIQMQGNSTSI-INPKNPKEA----PKSFSFDYS
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CCDS47 MSDTKVKVAVRVRPMNRRELELNTKCVVEMEGNQTVLHPPPSNTKQGERKPPKVFAFDYC
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CCDS47 FWSMDESNTTKYAGQEVVFKCLGEGILEKAFQGYNACIFAYGQTGSGKSFSMMGHAE--Q
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CCDS47 LGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGSRQSLKVREHKVL
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CCDS47 GPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIIITQTLYDLQS
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