FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0591, 1816 aa 1>>>pF1KA0591 1816 - 1816 aa - 1816 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1315+/-0.000453; mu= 11.3745+/- 0.028 mean_var=141.2111+/-29.420, 0's: 0 Z-trim(114.2): 326 B-trim: 2252 in 2/54 Lambda= 0.107929 statistics sampled from 23570 (23905) to 23570 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16 Scan time: 22.510 The best scores are: opt bits E(85289) NP_055889 (OMIM: 118210,171300,256700,605995) kine (1770) 9102 1430.3 0 XP_016859875 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1816) 5553 877.7 0 XP_016859874 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1824) 4735 750.3 3.8e-215 XP_016859872 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1825) 4735 750.3 3.8e-215 XP_016859873 (OMIM: 201300,601255,610357,614213,61 (1825) 4735 750.3 3.8e-215 NP_001317219 (OMIM: 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XP_016 IEYIKSQPIVFEVFGHYQQHPFPPLCKDVLSPLRPSRRHFPRVMPLSKPVPATKLSTLTR 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA0 TSLGQSMSKYDLLVWFEISELEPTGEYIPAVVDHTAGLPCQGTFLLHQGIQRRITVTIIH : ::::::.::: ::: .:.:::::::: .:.::.::::::::::::::::..: XP_016 PCPGPCHCKYDLLVYFEICELEANGDYIPAVVDHRGGMPCMGTFLLHQGIQRRITVTLLH 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KA0 EKGSELHWKDVRELVVGRIRNKPEVDEAAVDA-ILSLNIISAKYLKSSHNSSRTFYRFEA : ::...::.::::::::::: ::.::. .: ::::::.:. :.. .... ::::.::: XP_016 ETGSHIRWKEVRELVVGRIRNTPETDESLIDPNILSLNILSSGYIHPAQDD-RTFYQFEA 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA0 VWDSSLHNSLLLNRVTPYGEKIYMTLSAYLELDHCIQPAVITKDVCMVFYSRDAKISPPR .::::.:::::::::::: ::::::::::.:...: ::::.::: ::::::::::. : XP_016 AWDSSMHNSLLLNRVTPYREKIYMTLSAYIEMENCTQPAVVTKDFCMVFYSRDAKLPASR 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KA0 SLRSLFGSGYSKSPDSNRVTGIYELSLCKMSDTGSPGMQRRRRKILDTSVAYVRGEENLA :.:.::::: .. .::::::.::::::...:.::::::::::..::::::::::::::: XP_016 SIRNLFGSGSLRASESNRVTGVYELSLCHVADAGSPGMQRRRRRVLDTSVAYVRGEENLA 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KA0 GWRPRGDSLILEHQWELEKLELLHEVEKTRHFLLLRERLGDSIPKSLSDSLSPSLSSGTL :::::.:::::.:::::::: ::.:::::::.:::::.: .. . . ..:::..: . XP_016 GWRPRSDSLILDHQWELEKLSLLQEVEKTRHYLLLREKL-ETAQRPVPEALSPAFSEDSE 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KA0 STSTSISSQISTTTFESAITPSESSGYDSGDIESLVDREKELATKCLQLLTHTFNREFSQ : ..: :: .: . : : .:. .:..:::.:::.:::::::::... XP_016 SHGSS-----------SASSPLSAEGRPS-PLEAPNERQRELAVKCLRLLTHTFNREYTH 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KA0 VHG--SVSDCKLSDIS-PIGRDPSESSFSSATLTPSSTCPSLVDSRSNSLDQKTPEANSR : :.:. :::..: . :::: : .. :::::::::::::..: .. : .::. :: XP_016 SHVCVSASESKLSEMSVTLLRDPSMSPLGVATLTPSSTCPSLVEGRYGATDLRTPQPCSR 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KA0 ASSPCPEFEQFQIVPAVETPYLARAGKNEFLNL-VPDIEEIRPSSVVSKKGYLHFKEPLY .:: ::. . .: : .: : ::::.::: : .::::::::: :: XP_016 PASPEPELLPEADSKKLPSPARATETDKEPQRLLVPDIQEIRVSPIVSKKGYLHFLEPHT 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KA0 SNWAKHFVVVRRPYVFIYNSDKDPVERGIINLSTAQVEYSEDQQAMVKTPNTFAVCTKHR :.::..::::::::...:::::: ::: ..::.:::::::::::::.::::::::::.:: XP_016 SGWARRFVVVRRPYAYMYNSDKDTVERFVLNLATAQVEYSEDQQAMLKTPNTFAVCTEHR 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KA0 GVLLQALNDKDMNDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRRCPSQSKY :.:::: .::::.::::::::::::::::::::: .: . 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XP_016 SMHNSLLLNRVTPYREKIYMTLSAYIEMENCTQPAVVTKDFCMVFYSRDAKLPASRSIRN 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA0 LFGSGYSKSPDSNRVTGIYELSLCKMSDTGSPGMQRRRRKILDTSVAYVRGEENLAGWRP ::::: .. .::::::.::::::...:.::::::::::..::::::::::::::::::: XP_016 LFGSGSLRASESNRVTGVYELSLCHVADAGSPGMQRRRRRVLDTSVAYVRGEENLAGWRP 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA0 RGDSLILEHQWELEKLELLHEVEKTRHFLLLRERLGDSIPKSLSDSLSPSLSSGTLSTST :.:::::.:::::::: ::.:::::::.:::::.: .. . . ..:::..: . : .. XP_016 RSDSLILDHQWELEKLSLLQEVEKTRHYLLLREKL-ETAQRPVPEALSPAFSEDSESHGS 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KA0 SISSQISTTTFESAITPSESSGYDSGDIESLVDREKELATKCLQLLTHTFNREFSQVHG- : :: .: . : : .:. .:..:::.:::.:::::::::... : XP_016 S-----------SASSPLSAEGRPS-PLEAPNERQRELAVKCLRLLTHTFNREYTHSHVC 1470 1480 1490 1500 1510 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KA0 -SVSDCKLSDIS-PIGRDPSESSFSSATLTPSSTCPSLVDSRSNSLDQKTPEANSRASSP :.:. :::..: . :::: : .. :::::::::::::..: .. : .::. :: .:: XP_016 VSASESKLSEMSVTLLRDPSMSPLGVATLTPSSTCPSLVEGRYGATDLRTPQPCSRPASP 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KA0 CPEFEQFQIVPAVETPYLARAGKNEFLNL-VPDIEEIRPSSVVSKKGYLHFKEPLYSNWA ::. . .: : .: : ::::.::: : .::::::::: :: :.:: XP_016 EPELLPEADSKKLPSPARATETDKEPQRLLVPDIQEIRVSPIVSKKGYLHFLEPHTSGWA 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KA0 KHFVVVRRPYVFIYNSDKDPVERGIINLSTAQVEYSEDQQAMVKTPNTFAVCTKHRGVLL ..::::::::...:::::: ::: ..::.:::::::::::::.::::::::::.:::.:: XP_016 RRFVVVRRPYAYMYNSDKDTVERFVLNLATAQVEYSEDQQAMLKTPNTFAVCTEHRGILL 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1780 1790 1800 1810 pF1KA0 QALNDKDMNDWLYAFNPLLAGTIRSKLSRRCPSQSKY :: .::::.::::::::::::::::::::: .: . 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NP_001 ----------LTNALVG-MSPSSSLSALSSRAA--SVSSLHERILFAPGSEEAIERLKET 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 EKIIAELNETWEEKLRKTEAIRMEREALLAEMGVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNED ::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::: NP_001 EKIIAELNETWEEKLRRTEAIRMEREALLAEMGVAMREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNED 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 PLMSECLLYYIKDGITRVGQADAERRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPC :::::::::::::::::::. :.:::::::::: ::::::.:::. ...:..:::::: NP_001 PLMSECLLYYIKDGITRVGREDGERRQDIVLSGHFIKEEHCVFRSDSRGGSEAVVTLEPC 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 ERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRIIMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWT : ..::::::.:..: :::::::::::.:::::::::::: :::.:: ::::.:::::. NP_001 EGADTYVNGKKVTEPSILRSGNRIIMGKSHVFRFNHPEQARQERERTPCAETPAEPVDWA 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 FAQRELLEKQGIDMKQEMEKRLQEMEILYKKEKEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQVET :::::::::::::::::::.::::.: :..:.::: :::::::::::::.:::::... NP_001 FAQRELLEKQGIDMKQEMEQRLQELEDQYRREREEATYLLEQQRLDYESKLEALQKQMDS 630 640 650 660 670 680 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 RSLAAETTEEEEEEEEVPWTQHEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAIS : . :::: :.:: ::..: ::: ::::::: .:::::::::::::..:::::::: NP_001 RYYPEVNEEEEEPEDEVQWTERECELALWAFRKWKWYQFTSLRDLLWGNAIFLKEANAIS 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 VELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPELLPTEMEKTHEDRPFPRTVVAVEVQDLKNGATHYW ::::::::::::::::::::::::.::: : : .: ::::::.::::::: :::::::: NP_001 VELKKKVQFQFVLLTDTLYSPLPPDLLPPEAAKDRETRPFPRTIVAVEVQDQKNGATHYW 750 760 770 780 790 800 850 860 870 880 890 pF1KA0 SLEKLKQRLDLMREMYDRAGEMASSAQDESETTVTGSDPFYDRFHWFKLVGSS------- .::::.:::::::::::::.:. ::. .. ...:::.::::::: ::.::::: NP_001 TLEKLRQRLDLMREMYDRAAEVPSSVIEDCDNVVTGGDPFYDRFPWFRLVGSSAISGCNS 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 pF1KA0 -PIFHGCVNERLADRTPSPTFSTADSDITELADEQ----QDEMEDFDDEAFVDDAGSDAG :... :..::.: :::::::. ::: :: :.:: ..: :. ... .: .:. NP_001 YPLLNTCMSERMAALTPSPTFSSPDSDATEPAEEQSVGEEEEEEEEEEDEEEEDLEDDVF 870 880 890 900 910 920 950 960 970 980 990 1000 pF1KA0 TEEGSDLFSDGHDPFYDRSPWFILVGRAFVYLSNLLYPVPLIHRVAIVSEKGEVRGFLRV :.. . ::.:::::: : : ::::::::::::::::::.::::::::::::.::::: NP_001 PEHA---LCDGRDPFYDRPPLFSLVGRAFVYLSNLLYPVPLVHRVAIVSEKGEVKGFLRV 930 940 950 960 970 980 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA0 AVQAIAADEEAPDYGSGIRQSGTAKISFDNEYFNQSDFSS---VAMTRSGLSLEELRIVE :::::.:::::::::::.:::::::::::...:.. . : :.:.::: : ::::::: NP_001 AVQAISADEEAPDYGSGVRQSGTAKISFDDQHFEKFQSESCPVVGMSRSGTSQEELRIVE 990 1000 1010 1020 1030 1040 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA0 GQGQSSEVITPPEEISRINDLDLKS-STLLDG--KMVMEGFSEEIGNHLKLGSAFTFRVT ::::...: .:.. . . . :::. : ...: . .::.::..:::::: NP_001 GQGQGADVGPSADEVNNNTCSAVPPEGLLLDSSEKAALDGPLDAALDHLRLGNTFTFRVT 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA0 VLQASGILPEYADIFCQFNFLHRHDEAFSTEPLKNNGRGSPLAFYHVQNIAVEITESFVD :::::.: :::::::::::.::::::::::::::.::: ::.::::::::::.:.::.. 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NP_001 YIKSQPIVFEVFGHYQQHPFPPLCKDVLSPLRPSRRHFPRVMPLSKPVPATKLSTLTRPC 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA0 LGQSMSKYDLLVWFEISELEPTGEYIPAVVDHTAGLPCQGTFLLHQGIQRRITVTIIHEK : ::::::.::: ::: .:.:::::::: .:.::.::::::::::::::::..:: NP_001 PGPCHCKYDLLVYFEICELEANGDYIPAVVDHRGGMPCMGTFLLHQGIQRRITVTLLHET 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KA0 GSELHWKDVRELVVGRIRNKPEVDEAAVDA-ILSLNIISAKYLKSSHNSSRTFYRFEAVW ::...::.::::::::::: ::.::. .: ::::::.:. :.. .... ::::.:::.: NP_001 GSHIRWKEVRELVVGRIRNTPETDESLIDPNILSLNILSSGYIHPAQDD-RTFYQFEAAW 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KA0 DSSLHNSLLLNRVTPYGEKIYMTLSAYLELDHCIQPAVITKDVCMVFYSRDAKISPPRSL :::.:::::::::::: ::::::::::.:...: ::::.::: ::::::::::. ::. 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