FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0596, 1514 aa 1>>>pF1KA0596 1514 - 1514 aa - 1514 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2987+/-0.00115; mu= -7.8659+/- 0.069 mean_var=374.0877+/-76.989, 0's: 0 Z-trim(113.2): 42 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.066311 statistics sampled from 13865 (13898) to 13865 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.427), width: 16 Scan time: 6.760 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45239.1 MAPKBP1 gene_id:23005|Hs108|chr15 (1514) 10109 982.4 0 CCDS32201.1 MAPKBP1 gene_id:23005|Hs108|chr15 (1508) 10049 976.7 0 CCDS58359.1 MAPKBP1 gene_id:23005|Hs108|chr15 (1231) 7493 732.1 2.5e-210 CCDS33001.1 WDR62 gene_id:284403|Hs108|chr19 (1518) 2334 238.6 1.1e-61 CCDS46059.1 WDR62 gene_id:284403|Hs108|chr19 (1523) 2334 238.6 1.1e-61 >>CCDS45239.1 MAPKBP1 gene_id:23005|Hs108|chr15 (1514 aa) 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:::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 ------------------------------EPAVSLEQCEQLVAELRGSVRQAVRLYHSV 1130 1140 1150 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KA0 AGCKMPSAEQSRIAQLLRDTFSSVRQELEAVAGAVLSSPGSSPGAVGAEQTQALLEQYSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 AGCKMPSAEQSRIAQLLRDTFSSVRQELEAVAGAVLSSPGSSPGAVGAEQTQALLEQYSE 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1510 pF1KA0 LLLRAVERRMERKL :::::::::::::: CCDS58 LLLRAVERRMERKL 1220 1230 >>CCDS33001.1 WDR62 gene_id:284403|Hs108|chr19 (1518 aa) initn: 2301 init1: 1159 opt: 2334 Z-score: 1220.9 bits: 238.6 E(32554): 1.1e-61 Smith-Waterman score: 3570; 41.1% identity (67.0% similar) in 1556 aa overlap (18-1509:37-1514) 10 20 30 40 pF1KA0 MAVEGSTITSRIKNLLRSPSIKLRRSK--AGNRREDLSSKVTLEKVL .: : ::: . .: ....:.::::: CCDS33 GGYARNDAGEKLPSVMAGVPARRGQSSPPPAPPICLRRRTRLSTASEETVQNRVSLEKVL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KA0 GITVSGGRGLACDPRSGLVAYPAGCVVVLFNPRKHKQHHILNSSRKTITALAFSPDGKYL :::.... ::.::: .: ::: ::::::...:...::.::.:..::...::::::::::. CCDS33 GITAQNSSGLTCDPGTGHVAYLAGCVVVILDPKENKQQHIFNTARKSLSALAFSPDGKYI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KA0 VTGESGHMPAVRVWDVAEHSQVAELQEHKYGVACVAFSPSAKYIVSVGYQHDMIVNVWAW ::::.:: ::::.::: :..::::. ::::::::::::. :.:::.::::::..::: : CCDS33 VTGENGHRPAVRIWDVEEKNQVAEMLGHKYGVACVAFSPNMKHIVSMGYQHDMVLNVWDW 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 KKNIVVASNKVSSRVTAVSFSEDCSYFVTAGNRHIKFWYLDDSKTSKVNATVPLLGRSGL ::.::::::::: :: :.::::: :::::.::::..::.:. : .::..::::.::::. CCDS33 KKDIVVASNKVSCRVIALSFSEDSSYFVTVGNRHVRFWFLEVSTETKVTSTVPLVGRSGI 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 LGELRNNLFTDVACGRGKKADSTFCITSSGLLCEFSDRRLLDKWVELRNIDSFTTTVAHC ::::.::.: ::::::. : ::::.. :::::.:...:.:.::..:. .... : CCDS33 LGELHNNIFCGVACGRGRMAGSTFCVSYSGLLCQFNEKRVLEKWINLK------VSLSSC 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 ISVSQDYIFCGCADGTVRLFNPSNLHFLSTLPRPHALGTDIASVTEASRLFSGVANARYP . :::. :::::.:: ::.:. .::.:..::.:: ::.:.:. : : :: :.: :: CCDS33 LCVSQELIFCGCTDGIVRIFQAHSLHYLANLPKPHYLGVDVAQGLEPSFLFHRKAEAVYP 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 DTIALTFDPTNQWLSCVYNDHSIYVWDVRDPKKVGKVYSALYHSSCVWSVEVYPEVKDSN ::.:::::: .:::::::.:::::.:::.: ..::::.: :.::: ::.:::::: .:. CCDS33 DTVALTFDPIHQWLSCVYKDHSIYIWDVKDINRVGKVWSELFHSSYVWNVEVYPEFEDQ- 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 QACLPPSSFITCSSDNTIRLWNTESSGVHGSTLHRNILSSDLIKIIYVDGNTQALLD-TE .:::: .::.:::::::::.:: .:: : ..::.:. :.:..::... : : : .. CCDS33 RACLPSGSFLTCSSDNTIRFWNLDSS--PDSHWQKNIFSNTLLKVVYVENDIQHLQDMSH 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 LPGGDKADASLLDPRVGIRSVCVSPNGQHLASGDRMGTLRVHELQSLSEMLKVEAHDSEI .: . ... .: ..:.: . :::.::::::::: :.::.:::. ..:..::::::.:. CCDS33 FPDRGSENGTPMDVKAGVRVMQVSPDGQHLASGDRSGNLRIHELHFMDELVKVEAHDAEV 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 LCLEYSKPDTGLKLLASASRDRLIHVLDAGREYSLQQTLDEHSSSITAVKFAASDGQVRM ::::::::.::: ::::::::::::::.. ..:.:.::::.:::::::.:::. . ...: CCDS33 LCLEYSKPETGLTLLASASRDRLIHVLNVEKNYNLEQTLDDHSSSITAIKFAG-NRDIQM 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 ISCGADKSIYFRTAQKSGDGVQFTRTHHVVRKTTLYDMDVEPSWKYTAIGCQDRNIRIFN ::::::::::::.::...::..:.:::::..::::::::.. . ::.:..:::::.:..: CCDS33 ISCGADKSIYFRSAQQGSDGLHFVRTHHVAEKTTLYDMDIDITQKYVAVACQDRNVRVYN 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 ISSGKQKKLFKGSQGEDGTLIKVQTDPSGIYIATSCSDKNLSIFDFSSGECVATMFGHSE .::::: .:::::..:.:.::..:::: ..:::::::..:..:: ::::.: :::::: CCDS33 TVNGKQKKCYKGSQGDEGSLLKVHVDPSGTFLATSCSDKSISVIDFYSGECIAKMFGHSE 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KA0 IVTGMKFSNDCKHLISVSGDSCIFVWRLSSEMTISMRQRLAELRQRQRGGKQQGPSSPQR :.:.:::. ::.:::.::::::.:.:.:. :.: :.:.: :. .:: :: .. .. CCDS33 IITSMKFTYDCHHLITVSGDSCVFIWHLGPEITNCMKQHLLEIDHRQ----QQQHTNDKK 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 pF1KA0 ASGPNRHQAPSMLSPGPALSSDSDKEGEDEGTEEELPALPVLAKSTKKALASVPSPALPR :: :.. ...: . : : : .. ::: .: .: .: : : CCDS33 RSGHPRQD--TYVSTPSEIHSLSPGEQTEDDLEEECEPEEMLKTPSKDSLDPDPRCLLTN 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 pF1KA0 S-LSHWEMSRAQESVGFLDPAPAANPGPRR----RGRWVQPGVELSVRSMLDLRQLETLA . : : :.. .: : : . .: .:::.. . . ....:: ..:. CCDS33 GKLPLW----AKRLLGDDDVADGLAFHAKRSYQPHGRWAERAGQEPLKTILDAQDLDCYF 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KA0 PSLQDPSQDSLAIIPSGPRKHGQEALETSLTSQNEKPPRPQASQPCSYPHIIRLLSQEEG .. : .. . : ..: .:: :..:.: . ..: :. :.:. CCDS33 TPMKPESLENSILDSLEP-----QSL-ASLLSESESPQEAGRGHPSFLPQ------QKES 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 pF1KA0 VFAQDLEPAPIEDGIVYPEPSDN---PTMDTSEFQVQAPARGTLGRVYPGSRSSEKHSPD :..: .: .. ... .... . :. . .. : ..: . : . CCDS33 SEASELILYSLEAEVTVTGTDSQYCRKEVEAGPGDQQGDSYLRVSSDSPKDQSPPEDSGE 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KA0 SACSVDYSSSCLSSPEHPTEDSESTEPLSVDGISSDLEE-PAEGDEEEEEEEGGMGPYGL : ... : . . :: : : . ....: . :. . :.: :: CCDS33 SEADLECSFAAIHSPAPP--------PDPAPRFATSLPHFPGCAGPTEDELSLPEGPSVP 1000 1010 1020 1030 1040 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KA0 QEGSPQTPDQEQFLKQHFETLASGAAPGAPVQVPERSESR--------SISSRFL--LQV . . ::::.::.::..:::::. .: . : ::.. :::..:: :: CCDS33 SSSLPQTPEQEKFLRHHFETLTE--SPCRALGDVEASEAEDHFFNPRLSISTQFLSSLQK 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KA0 QTRPLREPSPSSSSLALMSRPAQVPQASGEQPRGNGANPPGAPPEVEPSSGNPSPQQAAS .: . : ... . : ... . .: :::.. .: ::... CCDS33 ASRFTHTFPPRATQCLVKSPEVKLMDRGGSQPRAG--------------TGYASPDRT-H 1110 1120 1130 1140 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KA0 VLLPRCRLNPDSSWAPKRVATASP-FSGLQKAQSVHSLVPQERHEAS-LQAPSPGALLSR :: . .: : : ...: . . :..: .:. . .::.:: :.. CCDS33 VLAAGKAEETLEAWRPP-----PPCLTSLASCVPASSVLPTDRNLPTPTSAPTPG--LAQ 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KA0 EIEAQDGLGSLPPADGPPSRPHSYQNPTTSSMAKISRSISVGENLGLVAEPQAHAPIRVS ..: :: ::.. :.:: :.::::::.:.. : .. :. : : CCDS33 GVHA-------------PST-CSYMEATASSRARISRSISLGDSEGPIVATLAQPLRRPS 1210 1220 1230 1240 1290 1300 1310 1320 pF1KA0 PLSKLA-LPSRAHLVLDIPKPLPD----RPTLAAF-------------SPVTKGR-APGE ...:: : .. . . : : .:.: .. : . : : CCDS33 SVGELASLGQELQAITTATTPSLDSEGQEPALRSWGNHEARANLRLTLSSACDGLLQPPV 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KA0 AEKPGF--PVGLGKAHSTTERWACLGEGTTPKPRTECQAHPG-PSSPCAQQLPVS--SLF .:: :. : : .:. : .:.. .: :: :. : ::: . .. CCDS33 DTQPGVTVPAVSFPAPSPVEESALRLHGSAFRPSLPAPESPGLPAHPSNPQLPEARPGIP 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KA0 QGPENLQPPPPEKTP----NPMECTKPGAALSQDSEPAVSLEQCEQLVAELRGSVRQAVR : .: : .: . ..: . . . : . ... .:. . ..:. 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CCDS33 YPLASPDLQALLEHYSELLVQAVRRKARGH 1490 1500 1510 >>CCDS46059.1 WDR62 gene_id:284403|Hs108|chr19 (1523 aa) initn: 2327 init1: 1159 opt: 2334 Z-score: 1220.8 bits: 238.6 E(32554): 1.1e-61 Smith-Waterman score: 3567; 41.2% identity (67.0% similar) in 1560 aa overlap (18-1509:37-1519) 10 20 30 40 pF1KA0 MAVEGSTITSRIKNLLRSPSIKLRRSK--AGNRREDLSSKVTLEKVL .: : ::: . .: ....:.::::: CCDS46 GGYARNDAGEKLPSVMAGVPARRGQSSPPPAPPICLRRRTRLSTASEETVQNRVSLEKVL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KA0 GITVSGGRGLACDPRSGLVAYPAGCVVVLFNPRKHKQHHILNSSRKTITALAFSPDGKYL :::.... ::.::: .: ::: ::::::...:...::.::.:..::...::::::::::. 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