Result of FASTA (omim) for
pF1KA0606
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0606, 1205 aa
1>>>pF1KA0606 1205 - 1205 aa - 1205 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3505+/-0.000402; mu= 9.6807+/- 0.025
mean_var=227.8158+/-50.972, 0's: 0 Z-trim(118.9): 189 B-trim: 1560 in 1/58
Lambda= 0.084973
statistics sampled from 32040 (32293) to 32040 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16
Scan time: 14.300
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_919431 (OMIM: 609396) PH domain leucine-rich re (1717) 8031 998.9 0
NP_055835 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich re (1323) 4113 518.5 1.1e-145
XP_011524188 (OMIM: 609396) PREDICTED: PH domain l (1109) 3928 495.8 6.6e-139
NP_001275932 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich (1256) 1838 239.6 9.7e-62
NP_001255968 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 536) 511 76.6 4.9e-13
NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582) 421 65.6 1.1e-09
XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 421 65.6 1.1e-09
NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582) 421 65.6 1.1e-09
NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repea ( 582) 421 65.6 1.1e-09
XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 421 65.6 1.1e-09
XP_016872192 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 421 65.6 1.1e-09
NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-conta ( 524) 409 64.0 2.8e-09
XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 524) 409 64.0 2.8e-09
XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 331) 350 56.6 3.1e-07
NP_056171 (OMIM: 607733) protein scribble homolog (1630) 334 55.3 3.7e-06
NP_874365 (OMIM: 607733) protein scribble homolog (1655) 334 55.3 3.7e-06
XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 465) 302 50.9 2.3e-05
NP_001073982 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 275 47.6 0.00026
XP_005269337 (OMIM: 603104) PREDICTED: carboxypept ( 545) 275 47.6 0.00026
NP_001278917 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 275 47.6 0.00026
NP_443204 (OMIM: 611289) leucine-rich alpha-2-glyc ( 347) 266 46.3 0.0004
NP_963844 (OMIM: 610846) leucine-rich repeat-conta ( 277) 264 46.0 0.0004
NP_001304841 (OMIM: 611931) protein phosphatase 1L ( 181) 256 44.8 0.00059
NP_001304840 (OMIM: 611931) protein phosphatase 1L ( 233) 256 44.9 0.00071
NP_001017403 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 967) 266 46.8 0.00083
NP_640338 (OMIM: 611931) protein phosphatase 1L is ( 360) 256 45.1 0.00096
NP_002014 (OMIM: 600245) fibromodulin precursor [H ( 376) 256 45.1 0.00099
NP_001258 (OMIM: 602178) chondroadherin precursor ( 359) 252 44.6 0.0013
XP_011522516 (OMIM: 602178) PREDICTED: chondroadhe ( 440) 252 44.7 0.0016
NP_002336 (OMIM: 600616) lumican precursor [Homo s ( 338) 245 43.8 0.0023
NP_067649 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-conta ( 915) 253 45.2 0.0024
NP_036557 (OMIM: 179555) ras suppressor protein 1 ( 277) 240 43.1 0.0031
XP_005252609 (OMIM: 179555) PREDICTED: ras suppres ( 277) 240 43.1 0.0031
XP_016857485 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 876) 249 44.6 0.0033
XP_011508141 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 900) 249 44.7 0.0033
XP_005245461 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 924) 249 44.7 0.0034
XP_016857384 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1255) 250 44.9 0.0039
NP_003658 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-conta ( 907) 247 44.4 0.004
XP_016857383 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1438) 250 45.0 0.0043
XP_016857382 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1472) 250 45.0 0.0043
XP_016857381 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1490) 250 45.0 0.0044
NP_001317564 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-co (1495) 250 45.0 0.0044
XP_016857379 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1528) 250 45.0 0.0045
XP_016857378 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1537) 250 45.0 0.0045
NP_065845 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-conta (1537) 250 45.0 0.0045
XP_016857377 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1541) 250 45.0 0.0045
XP_016857376 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1547) 250 45.0 0.0045
XP_016857374 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594) 250 45.0 0.0046
XP_016857375 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594) 250 45.0 0.0046
NP_056379 (OMIM: 610868) leucine-rich repeat trans ( 516) 240 43.3 0.0048
>>NP_919431 (OMIM: 609396) PH domain leucine-rich repeat (1717 aa)
initn: 8031 init1: 8031 opt: 8031 Z-score: 5330.8 bits: 998.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8031; 99.9% identity (99.9% similar) in 1205 aa overlap (1-1205:513-1717)
10 20 30
pF1KA0 MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 LEAEEKPLQIQNDYLFQLGFGELWRVQEEGMDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
490 500 510 520 530 540
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
550 560 570 580 590 600
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
610 620 630 640 650 660
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
670 680 690 700 710 720
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
730 740 750 760 770 780
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
790 800 810 820 830 840
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
850 860 870 880 890 900
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
910 920 930 940 950 960
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
970 980 990 1000 1010 1020
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 SRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 RRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 LDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCDNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 LDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCDNR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 EALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQKLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 EALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQKLG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 GAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCEEELKRIKQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 GAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCEEELKRIKQH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 KAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDSLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 KAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDSLSV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 EEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGAVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 EEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGAVPP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 PSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPPPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 PSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPPPGA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 LSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTNGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 LSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTNGSR
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 VEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQVPAEASDEGIVISANEDEPGLPRKADFSAVGTIGRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 VEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQVPAEASDEGIVISANEDEPGLPRKADFSAVGTIGRRR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 ANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPDDQFIIPPELEEEVKEIMKHHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 ANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPDDQFIIPPELEEEVKEIMKHHQ
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1180 1190 1200
pF1KA0 EQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 EQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
1690 1700 1710
>>NP_055835 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich repeat (1323 aa)
initn: 3627 init1: 1880 opt: 4113 Z-score: 2736.4 bits: 518.5 E(85289): 1.1e-145
Smith-Waterman score: 4343; 54.8% identity (80.1% similar) in 1207 aa overlap (2-1186:128-1315)
10 20 30
pF1KA0 MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGMY
. ..::.::::. :: .:: :::.:
NP_055 EPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIY
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 NVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCLA
:::::: :: ..:..: :.::::::::::::: :::::.:::.:::.::::..:. ::
NP_055 NVRKGKTQL--HKWAERLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLA
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 FSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLT
:::.: :.:::.. :.:..:: :: ::.:::.:::::.::::: :::..: .::::::.:
NP_055 FSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDIT
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 HLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSC
.:::..::.. : ::. : .:..::.::::.:.:: ::. .: : ::.:::.::
NP_055 YLNLRHNFMQ----LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSC
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 NALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLT
:.....:. .: . ::::. :::::: .:: :: :..::: ::.:::.:..:::: ::::
NP_055 NGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLT
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 AVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKL
.:.. :.:::.:.: : .: .: ::::::::.: .. .. .... .:.:..:::::.:
NP_055 MLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRL
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 GDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVSR
::: . ..: ::: :::: : . :. :..::::::.:. ..:::::. :...:.::
NP_055 TDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSR
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 NRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERTS
: :: ::.:.::..:.::::...: . :.:.:.. . :::::. :::.. :: .:.
NP_055 NLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIP
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNNS
.::::.::: : .:: .:. :: .::.::::::.::::: : .::. :.:: ::::::
NP_055 LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNLRYLNASANSLESLPSACTGEESLSMLQLLYLTNNL
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCS
:::.:.:.:.:: ::.:::.: :.::.:::::. :::.:::..:::::::.::::: ::.
NP_055 LTDQCIPVLVGHLHLRILHLANNQLQTFPASKLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCK
640 650 660 670 680 690
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 RMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVL
:.::..:::: : .:::..:::.:. ::::::.:.:. .:: :: ::.:::::: :::
NP_055 RLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVL
700 710 720 730 740 750
640 650 660 670 680
pF1KA0 DHKTLELLNNIRCFKIDQ---PSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCD
.::::.....: .:::: :.: :.. . . :::: .: .: .:::::.::....: .
NP_055 EHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTT-DSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAE
760 770 780 790 800 810
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 NREALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQK
. :.::.:::::: :.: ::::::.:.: ::.:.. :. .:.:::.: .:::: ::::
NP_055 GVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQSTNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQK
820 830 840 850 860 870
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 LGGAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCE-EELKRI
::..:.::.:. : .::..::.:: :::: ::.::::.:::.:::. . . . :: .:.
NP_055 LGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRV
880 890 900 910 920 930
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 KQHKAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDS
:..:::::::.:::::: ::.:: :.:.: ..:.::..:. :: :::..:::.:.::.
NP_055 KDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPHISSTPLTIQDELLILGNKALWEH
940 950 960 970 980 990
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 LSVEEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGA
:: :::.:::.: : ::::::::::::::::.:...:.:: :.. :.. : ::.. : .
NP_055 LSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVGAMVVYLNIGEEG-CTCEMN-GLT
1000 1010 1020 1030 1040
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 VPPPSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPP
.: : :. . . .::: :. . .::::::.:::.:::.::::.:::::::::::
NP_055 LPGPV-GF---ASTTTIKDAPKPA--TPSSSSGIASEFSSEMSTSEVSSEVGSTASDEHN
1050 1060 1070 1080 1090 1100
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 PGALSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTN
:.:. : :.:: ::: :. :::: ::::::: :::::::::..:.:::.::
NP_055 AGGLDTALLPRP-ERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGLDSDDDQPVEGVITN
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1050 1060 1070 1080
pF1KA0 GSRVEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQV-PAEASDE-----------------GIVISANE
::.::::::::: :... :.. :.. :. :.: :... ..
NP_055 GSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRRQNSVNSGMLLPMSK
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 DEPGLPRKADFSAVGTIGRRRANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPD
:. : .. . : . :.. .:::..: : : :.:::::..: :: : :::::.: .:.
NP_055 DRMELQKSPSTSCL--YGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG-YFAAPTQMEPE
1230 1240 1250 1260 1270
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 DQFIIPPELEEEVKEIMKHHQEQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
:::..: .::::::: ::.::... . .: . .:
NP_055 DQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
1280 1290 1300 1310 1320
>>XP_011524188 (OMIM: 609396) PREDICTED: PH domain leuci (1109 aa)
initn: 3928 init1: 3928 opt: 3928 Z-score: 2614.8 bits: 495.8 E(85289): 6.6e-139
Smith-Waterman score: 3928; 99.8% identity (99.8% similar) in 596 aa overlap (1-596:513-1108)
10 20 30
pF1KA0 MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEAEEKPLQIQNDYLFQLGFGELWRVQEEGMDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
490 500 510 520 530 540
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
550 560 570 580 590 600
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
610 620 630 640 650 660
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
670 680 690 700 710 720
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
730 740 750 760 770 780
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
790 800 810 820 830 840
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
850 860 870 880 890 900
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
910 920 930 940 950 960
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
970 980 990 1000 1010 1020
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 SRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLV
:::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKD
1090 1100
>>NP_001275932 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich rep (1256 aa)
initn: 2843 init1: 1096 opt: 1838 Z-score: 1229.4 bits: 239.6 E(85289): 9.7e-62
Smith-Waterman score: 3900; 51.2% identity (75.3% similar) in 1207 aa overlap (2-1186:128-1248)
10 20 30
pF1KA0 MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGMY
. ..::.::::. :: .:: :::.:
NP_001 EPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIY
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KA0 NVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCLA
:::::: :: ..:..: :.::::::::::::: :::::.:::.:::.::::..:. ::
NP_001 NVRKGKTQL--HKWAERLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLA
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KA0 FSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLT
:::.: :.:::.. :.:..:: :: ::.:::.:::::.::::: :::..: .::::::.:
NP_001 FSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDIT
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KA0 HLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSC
.:::..::.. : ::. : .:..::.::::.:.:: ::. .: : ::.:::.::
NP_001 YLNLRHNFMQ----LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSC
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 NALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLT
:.....:. .: . ::::. :::::: .:: :: :..::: ::.:::.:..:::: ::::
NP_001 NGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLT
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KA0 AVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKL
.:.. :.:::.:.: : .: .: ::::::::.: .. .. .... .:.:..:::::.:
NP_001 MLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRL
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 GDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVSR
::: . ..: ::: :::: : . :. :..::::::.:. ..:::::. :...:.::
NP_001 TDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSR
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 NRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERTS
: :: ::.:.::..:.::::...: . :.:.:.. . :::::. :::.. :: .:.
NP_001 NLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIP
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 VEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNNS
.::::.::: : .:: .:. :: ::
NP_001 LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKA-----LN-------------------------------
580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCS
:. :::.:::..:::::::.::::: ::.
NP_001 -------------------------------KLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCK
600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 RMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVL
:.::..:::: : .:::..:::.:. ::::::.:.:. .:: :: ::.:::::: :::
NP_001 RLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVL
630 640 650 660 670 680
640 650 660 670 680
pF1KA0 DHKTLELLNNIRCFKIDQ---PSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCD
.::::.....: .:::: :.: :.. . . :::: .: .: .:::::.::....: .
NP_001 EHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTT-DSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAE
690 700 710 720 730 740
690 700 710 720 730 740
pF1KA0 NREALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQK
. :.::.:::::: :.: ::::::.:.: ::.:.. :. .:.:::.: .:::: ::::
NP_001 GVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQSTNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQK
750 760 770 780 790 800
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 LGGAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCE-EELKRI
::..:.::.:. : .::..::.:: :::: ::.::::.:::.:::. . . . :: .:.
NP_001 LGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRV
810 820 830 840 850 860
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 KQHKAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDS
:..:::::::.:::::: ::.:: :.:.: ..:.::..:. :: :::..:::.:.::.
NP_001 KDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPHISSTPLTIQDELLILGNKALWEH
870 880 890 900 910 920
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 LSVEEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGA
:: :::.:::.: : ::::::::::::::::.:...:.:: :.. :.. : ::.. : .
NP_001 LSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVGAMVVYLNIGEEG-CTCEMN-GLT
930 940 950 960 970 980
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 VPPPSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPP
.: : :. . . .::: :. . .::::::.:::.:::.::::.:::::::::::
NP_001 LPGPV-GF---ASTTTIKDAPKPA--TPSSSSGIASEFSSEMSTSEVSSEVGSTASDEHN
990 1000 1010 1020 1030
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 PGALSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTN
:.:. : :.:: ::: :. :::: ::::::: :::::::::..:.:::.::
NP_001 AGGLDTALLPRP-ERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGLDSDDDQPVEGVITN
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1050 1060 1070 1080
pF1KA0 GSRVEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQV-PAEASDE-----------------GIVISANE
::.::::::::: :... :.. :.. :. :.: :... ..
NP_001 GSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRRQNSVNSGMLLPMSK
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 DEPGLPRKADFSAVGTIGRRRANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPD
:. : .. . : . :.. .:::..: : : :.:::::..: :: : :::::.: .:.
NP_001 DRMELQKSPSTSCL--YGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG-YFAAPTQMEPE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 DQFIIPPELEEEVKEIMKHHQEQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
:::..: .::::::: ::.::... . .: . .:
NP_001 DQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL
1220 1230 1240 1250
>>NP_001255968 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repeat (536 aa)
initn: 371 init1: 187 opt: 511 Z-score: 354.9 bits: 76.6 E(85289): 4.9e-13
Smith-Waterman score: 512; 30.6% identity (61.9% similar) in 438 aa overlap (161-582:83-505)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 DLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNH
... . . . ::. .. .... :.::.
NP_001 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
. .: .. . :.:: . : :.:.:: :: . ::.:. :. : : ::: :.:.:.:
NP_001 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
.: : :.. .:: :. .: .. : . : . :.. . .... ... ...: : :..:
NP_001 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360
pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMI--FNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYA-
: :. :. ...: :: :.:. . . . .: :. : :.. :: .:..:
NP_001 PA-EIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPES--LLSSLVKL
240 250 260 270 280
370 380 390 400 410
pF1KA0 SSNELVQ--LDVYPV--PNYLSY---MDVSRNRLENVPEWVCESRK-LEVLDIGHNQICE
.: :.. ...::: :. .: ... .::....: . : : :.. ::.
NP_001 NSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTS
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 LPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLER-TSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRF
:: . .:. .: . :::...:: . .:.::: . :.::. :. : . .::
NP_001 LPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVL-ILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRE
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 LNASANKLESLPP--ATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPLLTGH-PHLKILHMAYNR
:. ::::::: : :.. ::.: ::::.:: .: :: .: : .. :
NP_001 LDLEENKLESLPNEIAYLKD-----LQKLVLTNNQLT--TLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 LQSFPASKMAKLEELEEIDLSGN-KLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPE
: .: ... ::.:::. :. : .:...: . ::.. .... ::
NP_001 LTHLPE-EIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKL-SIMSIENCPLSHLPPQIVAG
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 IKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGD
NP_001 GPSFIIQFLKMQGPYRAMV
520 530
>>NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repeat (582 aa)
initn: 328 init1: 187 opt: 421 Z-score: 294.9 bits: 65.6 E(85289): 1.1e-09
Smith-Waterman score: 524; 28.1% identity (61.2% similar) in 477 aa overlap (161-629:83-530)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 DLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNH
... . . . ::. .. .... :.::.
NP_001 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
. .: .. . :.:: . : :.:.:: :: . ::.:. :. : : ::: :.:.:.:
NP_001 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
.: : :.. .:: :. .: .. : . : . :.. . .... ... ...: : :..:
NP_001 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSN
: :. : .. ::. :.: : :. .: .:...::. . :
NP_001 PA-EIGELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHN
240 250 260 270
380 390 400 410 420
pF1KA0 ELVQL-DVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCN-S
::..: :. . :: . . ::: .:. . . :: :.. .:.: :: :. .
NP_001 ELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SLRKLLAGHN--QLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKL
.: .: ..: :: . . ... :...::.. ..: ... .: : :: . :.:
NP_001 KLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQL
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPL-LTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMA
::: :. : . . :: :..:.:: .: ..: :..: .. : :...: . ..
NP_001 TSLP---LDFGTWTSMVELNLATNQLTK--IPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHG-LG
400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNE
.:..:.:.:: :::...:. : . .. .. .: . ..:. . .: .. . :. :
NP_001 NLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LSEVTLPENLPP--KLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVW
:.. :::.. .:.:: :. :: :
NP_001 LTH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAG
510 520 530 540 550 560
>>XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leucine- (582 aa)
initn: 328 init1: 187 opt: 421 Z-score: 294.9 bits: 65.6 E(85289): 1.1e-09
Smith-Waterman score: 524; 28.1% identity (61.2% similar) in 477 aa overlap (161-629:83-530)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 DLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNH
... . . . ::. .. .... :.::.
XP_016 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
. .: .. . :.:: . : :.:.:: :: . ::.:. :. : : ::: :.:.:.:
XP_016 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
.: : :.. .:: :. .: .. : . : . :.. . .... ... ...: : :..:
XP_016 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSN
: :. : .. ::. :.: : :. .: .:...::. . :
XP_016 PA-EIGELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHN
240 250 260 270
380 390 400 410 420
pF1KA0 ELVQL-DVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCN-S
::..: :. . :: . . ::: .:. . . :: :.. .:.: :: :. .
XP_016 ELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SLRKLLAGHN--QLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKL
.: .: ..: :: . . ... :...::.. ..: ... .: : :: . :.:
XP_016 KLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQL
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPL-LTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMA
::: :. : . . :: :..:.:: .: ..: :..: .. : :...: . ..
XP_016 TSLP---LDFGTWTSMVELNLATNQLTK--IPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHG-LG
400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNE
.:..:.:.:: :::...:. : . .. .. .: . ..:. . .: .. . :. :
XP_016 NLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LSEVTLPENLPP--KLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVW
:.. :::.. .:.:: :. :: :
XP_016 LTH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAG
510 520 530 540 550 560
>>NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repeat (582 aa)
initn: 328 init1: 187 opt: 421 Z-score: 294.9 bits: 65.6 E(85289): 1.1e-09
Smith-Waterman score: 524; 28.1% identity (61.2% similar) in 477 aa overlap (161-629:83-530)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 DLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNH
... . . . ::. .. .... :.::.
NP_001 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
. .: .. . :.:: . : :.:.:: :: . ::.:. :. : : ::: :.:.:.:
NP_001 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
.: : :.. .:: :. .: .. : . : . :.. . .... ... ...: : :..:
NP_001 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSN
: :. : .. ::. :.: : :. .: .:...::. . :
NP_001 PA-EIGELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHN
240 250 260 270
380 390 400 410 420
pF1KA0 ELVQL-DVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCN-S
::..: :. . :: . . ::: .:. . . :: :.. .:.: :: :. .
NP_001 ELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SLRKLLAGHN--QLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKL
.: .: ..: :: . . ... :...::.. ..: ... .: : :: . :.:
NP_001 KLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQL
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPL-LTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMA
::: :. : . . :: :..:.:: .: ..: :..: .. : :...: . ..
NP_001 TSLP---LDFGTWTSMVELNLATNQLTK--IPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHG-LG
400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNE
.:..:.:.:: :::...:. : . .. .. .: . ..:. . .: .. . :. :
NP_001 NLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LSEVTLPENLPP--KLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVW
:.. :::.. .:.:: :. :: :
NP_001 LTH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAG
510 520 530 540 550 560
>>NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repeat pr (582 aa)
initn: 328 init1: 187 opt: 421 Z-score: 294.9 bits: 65.6 E(85289): 1.1e-09
Smith-Waterman score: 524; 28.1% identity (61.2% similar) in 477 aa overlap (161-629:83-530)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 DLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNH
... . . . ::. .. .... :.::.
NP_031 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
. .: .. . :.:: . : :.:.:: :: . ::.:. :. : : ::: :.:.:.:
NP_031 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
.: : :.. .:: :. .: .. : . : . :.. . .... ... ...: : :..:
NP_031 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSN
: :. : .. ::. :.: : :. .: .:...::. . :
NP_031 PA-EIGELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHN
240 250 260 270
380 390 400 410 420
pF1KA0 ELVQL-DVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCN-S
::..: :. . :: . . ::: .:. . . :: :.. .:.: :: :. .
NP_031 ELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SLRKLLAGHN--QLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKL
.: .: ..: :: . . ... :...::.. ..: ... .: : :: . :.:
NP_031 KLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQL
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPL-LTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMA
::: :. : . . :: :..:.:: .: ..: :..: .. : :...: . ..
NP_031 TSLP---LDFGTWTSMVELNLATNQLTK--IPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHG-LG
400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNE
.:..:.:.:: :::...:. : . .. .. .: . ..:. . .: .. . :. :
NP_031 NLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LSEVTLPENLPP--KLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVW
:.. :::.. .:.:: :. :: :
NP_031 LTH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAG
510 520 530 540 550 560
>>XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leucine- (582 aa)
initn: 328 init1: 187 opt: 421 Z-score: 294.9 bits: 65.6 E(85289): 1.1e-09
Smith-Waterman score: 524; 28.1% identity (61.2% similar) in 477 aa overlap (161-629:83-530)
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 DLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNH
... . . . ::. .. .... :.::.
XP_016 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
. .: .. . :.:: . : :.:.:: :: . ::.:. :. : : ::: :.:.:.:
XP_016 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
.: : :.. .:: :. .: .. : . : . :.. . .... ... ...: : :..:
XP_016 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSN
: :. : .. ::. :.: : :. .: .:...::. . :
XP_016 PA-EIGELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHN
240 250 260 270
380 390 400 410 420
pF1KA0 ELVQL-DVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCN-S
::..: :. . :: . . ::: .:. . . :: :.. .:.: :: :. .
XP_016 ELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SLRKLLAGHN--QLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKL
.: .: ..: :: . . ... :...::.. ..: ... .: : :: . :.:
XP_016 KLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQL
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 ESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPL-LTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMA
::: :. : . . :: :..:.:: .: ..: :..: .. : :...: . ..
XP_016 TSLP---LDFGTWTSMVELNLATNQLTK--IPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHG-LG
400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNE
.:..:.:.:: :::...:. : . .. .. .: . ..:. . .: .. . :. :
XP_016 NLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
450 460 470 480 490 500
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LSEVTLPENLPP--KLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVW
:.. :::.. .:.:: :. :: :
XP_016 LTH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAG
510 520 530 540 550 560
1205 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 09:53:16 2016 done: Thu Nov 3 09:53:18 2016
Total Scan time: 14.300 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]