Result of FASTA (ccds) for
pF1KA0621
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0621, 722 aa
1>>>pF1KA0621 722 - 722 aa - 722 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9024+/-0.00136; mu= 7.4610+/- 0.080
mean_var=185.9271+/-39.425, 0's: 0 Z-trim(104.9): 161 B-trim: 3 in 1/49
Lambda= 0.094060
statistics sampled from 7992 (8164) to 7992 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 2.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47297.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 ( 759) 4316 599.4 6.3e-171
CCDS4277.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 ( 814) 4316 599.5 6.6e-171
CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs108|chr4 ( 786) 2559 361.0 3.8e-99
CCDS14388.1 OPHN1 gene_id:4983|Hs108|chrX ( 802) 2163 307.3 5.8e-83
CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs108|chr2 ( 475) 436 72.8 1.4e-12
CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3 ( 778) 439 73.3 1.5e-12
CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 332) 423 70.9 3.6e-12
CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 468) 423 71.0 4.7e-12
CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 334) 412 69.4 1e-11
CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 433) 412 69.5 1.2e-11
CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 459) 412 69.5 1.3e-11
CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1 ( 834) 415 70.1 1.5e-11
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 548) 409 69.1 2e-11
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 889) 409 69.3 2.8e-11
CCDS78219.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 274) 390 66.3 7e-11
>>CCDS47297.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 (759 aa)
initn: 4704 init1: 4316 opt: 4316 Z-score: 3182.1 bits: 599.4 E(32554): 6.3e-171
Smith-Waterman score: 4593; 95.1% identity (95.1% similar) in 754 aa overlap (1-717:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKF
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CCDS47 MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFR
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CCDS47 ADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 YVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VPFDQKSGGKGGEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VPFDQKSGGKGGEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 MEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 QKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 NQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRP
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KA0 NSL-------------------------------------TPFRKAKALYACKAEHDSEL
::: ::::::::::::::::::::
CCDS47 NSLPPNPSPTSPLSPSWPMFSAPSSPMPTSSTSSDSSPVSTPFRKAKALYACKAEHDSEL
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720
pF1KA0 SFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTGLIPENYVEFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTGLIPENYVEFL
730 740 750
>>CCDS4277.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 (814 aa)
initn: 4316 init1: 4316 opt: 4316 Z-score: 3181.7 bits: 599.5 E(32554): 6.6e-171
Smith-Waterman score: 4316; 99.8% identity (99.8% similar) in 665 aa overlap (1-665:1-665)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 YVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VPFDQKSGGKGGEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VPFDQKSGGKGGEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 MEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 QKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 NQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 LTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 NSLTPFRKAKALYACKAEHDSELSFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTGLIPENYVE
::: :
CCDS42 NSLPPNPSPTSPLSPSWPMFSAPSSPMPTSSTSSDSSPVRSVAGFVWFSVAAVVLSLARS
670 680 690 700 710 720
>>CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs108|chr4 (786 aa)
initn: 2807 init1: 1253 opt: 2559 Z-score: 1893.4 bits: 361.0 E(32554): 3.8e-99
Smith-Waterman score: 2599; 56.1% identity (76.1% similar) in 758 aa overlap (1-690:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKF
::: :::::: :::: ::: ...:::::..:::::::::::::.::.: :.:: :.:::
CCDS34 MGLQPLEFSDCYLDSPWFRERIRAHEAELERTNKFIKELIKDGKNLIAATKSLSVAQRKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFR
: :: .:::. :::: :::: :: ::.::.. :.:::..: : ...:.:: ::::::
CCDS34 AHSLRDFKFEFIGDAVTDDERCIDASLREFSNFLKNLEEQREIMALSVTETLIKPLEKFR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLE
:::.::.:: :::.:::::: ....::::::.:::.:.::::: ::. ::::::.:::
CCDS34 KEQLGAVKEEKKKFDKETEKNYSLIDKHLNLSAKKKDSHLQEADIQVEQNRQHFYELSLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 YVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFE
:: :.::.:::: ::::::.:.:.::.:::::.:.::::::. .: .: :.:::::::::
CCDS34 YVCKLQEIQERKKFEFVEPMLSFFQGMFTFYHQGHELAKDFNHYKMELQINIQNTRNRFE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KA0 GTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRH--FGTSWVKHYCTYQRDSKQI
::::::: ::.:...:: .:: : .: :::::::::: ::.::::::: :.. .:..
CCDS34 GTRSEVEELMNKIRQNPKDHKRASQFTAEGYLYVQEKRPAPFGSSWVKHYCMYRKAAKKF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 TMVPFDQKSGGKGGEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGV-ITMQALSEEDR
.:.::...:::: :. : .:: ::.:.::::..:::::.::.::::: .::::.:::.:
CCDS34 NMIPFEHRSGGKLGDGEVFFLKECTKRHTDSIDRRFCFDIEAADRPGVSLTMQAFSEEER
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 RLWMEAMDGREPV---YNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIV
. :.::. :.: . .:. . ::.::::..::.:::::: ::::::::.:::::.:
CCDS34 KQWLEALGGKEALSHSFNTAIIPRPEGNAQLDKMGFTIIRKCISAVETRGINDQGLYRVV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 GVNSRVQKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFI
::.:.::.:::.::: :: .:.. . :.::.:::::::: ::: :: ::: :... .::
CCDS34 GVSSKVQRLLSMLMDVKTCNEVDLENSADWEVKTITSALKQYLRSLPEPLMTYELHGDFI
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 KAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGP
:: . ::::. :: :::.:::::..::..:..::.::.:. ::::::::::::::::
CCDS34 VPAKSGSPESRVNAIHFLVHKLPEKNKEMLDILVKHLTNVSNHSKQNLMTVANLGVVFGP
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 TLLRPQEETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPP
::.:::::::::.::.::::::.::::::::::: : :: . . :: : . ::
CCDS34 TLMRPQEETVAALMDLKFQNIVVEILIENHEKIFRTPPDTTFPEPTC-LS--ASPPNAPP
550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KA0 SCSER-------PLTLFHTVQSTEKQEQ----RNSIINSSLESVSS-NP-----------
:.: :..... : .. ... .:::.:.:: .:
CCDS34 RQSKRQGQRTKRPVAVYNLCLELEDGDNPYPSKEDTPTSSLDSLSSPSPVTTAVPGPPGP
600 610 620 630 640 650
640 650 660
pF1KA0 --NSIL---------------NSSSSLQPNMNSSDPDL----AVVKPTRPNSLTPF----
: .: .. ::. .: ..: ..: : :.: .::
CCDS34 DKNHLLADGGSFGDWASTIPGQTRSSMVQWLNPQSPTTTSSNSAVTPLSPGS-SPFPFSP
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710
pF1KA0 --------------RKAKALYACKAEHDSELSFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTG
:::.:.: :.:::.::::: :..
CCDS34 PATVADKPPESIRSRKARAVYPCEAEHSSELSFEIGAIFEDVQTSREPGWLEGTLNGKRG
720 730 740 750 760 770
720
pF1KA0 LIPENYVEFL
CCDS34 LIPQNYVKLL
780
>>CCDS14388.1 OPHN1 gene_id:4983|Hs108|chrX (802 aa)
initn: 2129 init1: 1170 opt: 2163 Z-score: 1602.9 bits: 307.3 E(32554): 5.8e-83
Smith-Waterman score: 2163; 51.4% identity (77.9% similar) in 664 aa overlap (1-660:1-656)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGLPALEFSDCCLDSPHFRETLKSHEAELDKTNKFIKELIKDGKSLISALKNLSSAKRKF
:: : :::::: :::: ::: :: .: ::..::::::..::::..::::..: ::: .::
CCDS14 MGHPPLEFSDCYLDSPDFRERLKCYEQELERTNKFIKDVIKDGNALISAMRNYSSAVQKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFR
...:. :.:. :::. ::::. ::.:..::: .: ..:.::. :..:::..:: :::.::
CCDS14 SQTLQSFQFDFIGDTLTDDEINIAESFKEFAELLNEVENERMMMVHNASDLLIKPLENFR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 KEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLE
::::: .:: :::..:. :.. ..:..::.:::::::::::::: ::: :..:.: ::.
CCDS14 KEQIGFTKERKKKFEKDGERFYSLLDRHLHLSSKKKESQLQEADLQVDKERHNFFESSLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 YVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAKDFGDFKTQLTISIQNTRNRFE
::...::::: : :..:::.::::..:: ::..:: .: :: .:.:::::.:
CCDS14 YVYQIQEVQESKKFNIVEPVLAFLHSLFISNSLTVELTQDFLPYKQQLQLSLQNTRNHFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 GTRSEVESLMKKMKENPLEHKTISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITM
.:: :.: : :.::: : : . :.:::::.::: .: ::::.:: :....: .::
CCDS14 STREEMEELKKRMKEAPQTCKLPGQPTIEGYLYTQEKWALGISWVKYYCQYEKETKTLTM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 VPFDQKSGGKGGEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLW
.:..:: :.: : . . :: :.::::.::.::::::.:. .:::.::.::::: .::::
CCDS14 TPMEQKPGAKQGPLD-LTLKYCVRRKTESIDKRFCFDIETNERPGTITLQALSEANRRLW
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 MEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRV
::::::.::.:.: .:.: .:. .::...::::. .::.::. .:::: :: : .:
CCDS14 MEAMDGKEPIYHSPITKQQE--MELNEVGFKFVRKCINIIETKGIKTEGLYRTVGSNIQV
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 QKLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLE
::::....::: .... ..:.::::::.:: ::: : :.: :.... ...::: .
CCDS14 QKLLNAFFDPKCPGDVDFH-NSDWDIKTITSSLKFYLRNLSEPVMTYRLHKELVSAAKSD
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 NQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQ
: . :.. :::::..::::::.::.::. ::.:: .. :.:::: .:.::.:::::.: :
CCDS14 NLDYRLGAIHSLVYKLPEKNREMLELLIRHLVNVCEHSKENLMTPSNMGVIFGPTLMRAQ
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERP
:.::::.:.:::::::.:::::. ::. :. . . : . :: . :.:
CCDS14 EDTVAAMMNIKFQNIVVEILIEHFGKIYLGPPEES-AAPPVPPPRVTARRHKPITISKRL
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650
pF1KA0 L---TLFHTVQSTEKQEQ-RNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVK
: :.:.: . :.... ... :... : :. . . .: :.. : . .
CCDS14 LRERTVFYTSSLDESEDEIQHQTPNGTITSSIEPPKPPQHPKLPIQ---RSGETDPGRKS
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 PTRPNSLTPFRKAKALYACKAEHDSELSFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTGLIPE
:.::
CCDS14 PSRPILDGKLEPCPEVDVGKLVSRLQDGGTKITPKATNGPMPGSGPTKTPSFHIKRPAPR
660 670 680 690 700 710
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...::.::: ::.. .:.::. : . .::
CCDS21 LQEKGLIKDQIFGSHLHKVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQK
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pF1KA0 LLSVLMDPKTASETETDICAEWE-IKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLEN
: .. . . . .. .:: :...:.::: ..: :: ::. :.: ..:..: : ..
CCDS21 LRFIVNQEEKLNLDDS----QWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQD
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pF1KA0 QESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQE
...:. ..:::..:: ::. ...:..::.... . ..:::.. .::.:::::::: ..
CCDS21 NNTRIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAEN
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 ETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERPL
:: . . .:: . :... .. :::.. :
CCDS21 ETGNMAIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGSEED
450 460 470
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 TLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRPN
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CCDS33 MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQF
10 20 30 40 50
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pF1KA0 ADSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIENASEVLITPLEKFR
... .. .:: . :: .:. :... . . ....... . . :..:
CCDS33 MNGIRDLAQYSSNDA------VVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFV
60 70 80 90 100 110
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pF1KA0 KEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQVDLVRQHFYEVSLE
::.. :.:::...: .:. . : :. ... ..:. ...:: . . .:. : ...:.
CCDS33 KEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQ-RNKQHEVEEATNILTATRKCFRHIALD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KA0 YVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYEL-------AKDFGDFKTQLTISIQ
::.... .: .. :... .:.:. . ..:.:.::.: ::.: .:...
CCDS33 YVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMKDLGAQLDRLVVDAA
180 190 200 210 220 230
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pF1KA0 NTRNRFEGTRSEVESLMKKMKENPLEHKT--ISPYTMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTY
. . ..: .: ... . .. ::... . .:::::. . . : : : ... .
CCDS33 KEKREMEQKHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRASNAFKT-WNRRWFSI
240 250 260 270 280 290
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: . :... :: : .. .:. :. :: .. ..::.::::.: . . .
CCDS33 QNN--QLVY----QK---KFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRFCFEVVSPTKSCM--
300 310 320 330 340
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pF1KA0 MQALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQ
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CCDS33 LQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLDSGNESKEKLLKGES
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 GLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTAS-ETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMY
.: :. . . .. : ::. :: . .: :
CCDS33 ALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGVHFSKVRSLTLDTWE
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470 480 490 500 510 520
pF1KA0 QFQRSFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVAN
CCDS33 PELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPGQRQEKEAYIRAKYVERKFVDKYSISL
470 480 490 500 510 520
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pF1KA0 EAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQ
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CCDS47 DCQPDLKRIKKVYCCDLTTLVKAHNTQRPMVVDICIREIEARGLKSEGLYRVSGFTEHIE
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pF1KA0 KLLSVLMDPKTASETETDICAEW--EIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKL
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CCDS47 ---DVKMAFDRDGE-KADISANVYPDINIITGALKLYFRDLPIPVITYDTYSKFIDAAKI
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pF1KA0 ENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRP
: . :. .: .. :: . . :. :: :: .:. :.:.:.:.. :::.::::::.::
CCDS47 SNADERLEAVHEVLMLLPPAHYETLRYLMIHLKKVTMNEKDNFMNAENLGIVFGPTLMRP
250 260 270 280 290 300
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pF1KA0 QEE-TVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSE
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CCDS47 PEDSTLTTLHDMRYQKLIVQILIENEDVLF
310 320 330
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pF1KA0 EAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQ
.. ::. .:.::.. .::::. : . ...
CCDS54 DCQPDLKRIKKVYCCDLTTLVKAHNTQRPMVVDICIREIEARGLKSEGLYRVSGFTEHIE
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470
pF1KA0 KLLSVLMDPKTASETETDICAEW--EIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKL
.: : .: ..:: :. .:. ::.::: :.: :: :.. :. .:: :::.
CCDS54 ---DVKMAFDRDGE-KADISANVYPDINIITGALKLYFRDLPIPVITYDTYSKFIDAAKI
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480 490 500 510 520 530
pF1KA0 ENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRP
: . :. .: .. :: . . :. :: :: .:. :.:.:.:.. :::.::::::.::
CCDS54 SNADERLEAVHEVLMLLPPAHYETLRYLMIHLKKVTMNEKDNFMNAENLGIVFGPTLMRP
380 390 400 410 420 430
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 QEE-TVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSE
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CCDS54 PEDSTLTTLHDMRYQKLIVQILIENEDVLF
440 450 460
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pF1KA0 EAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQ
.. ::. .:.::.: .::::. : .. ..
CCDS56 DCKPDLKHVKKVYSCDLTTLVKAHTTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIE
130 140 150 160 170 180
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. .. .: . . ... .. .:. ::.::: :.: :: ::. :. .::..::. .
CCDS56 DV-KMAFD-RDGEKADISVNMYEDINIITGALKLYFRDLPIPLITYDAYPKFIESAKIMD
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pF1KA0 QESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLR-PQ
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CCDS56 PDEQLETLHEALKLLPPAHCETLRYLMAHLKRVTLHEKENLMNAENLGIVFGPTLMRSPE
250 260 270 280 290 300
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERP
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CCDS56 LDAMAALNDIRYQRLVVELLIKNEDILF
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pF1KA0 EAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQ
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CCDS46 DCKPDLKHVKKVYSCDLTTLVKAHTTKRPMVVDMCIREIESRGLNSEGLYRVSGFSDLIE
230 240 250 260 270 280
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 KLLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLEN
. .. .: . . ... .. .:. ::.::: :.: :: ::. :. .::..::. .
CCDS46 DV-KMAFD-RDGEKADISVNMYEDINIITGALKLYFRDLPIPLITYDAYPKFIESAKIMD
290 300 310 320 330 340
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLR-PQ
. .. .: .. :: . . :. :: :: :. ..:.:::.. :::.::::::.: :.
CCDS46 PDEQLETLHEALKLLPPAHCETLRYLMAHLKRVTLHEKENLMNAENLGIVFGPTLMRSPE
350 360 370 380 390 400
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 EETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]