FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0628, 536 aa 1>>>pF1KA0628 536 - 536 aa - 536 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0322+/-0.0018; mu= 11.4343+/- 0.106 mean_var=235.7681+/-48.210, 0's: 0 Z-trim(104.2): 946 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.083528 statistics sampled from 6783 (7806) to 6783 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16 Scan time: 3.220 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 536) 3760 467.4 1.8e-131 CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 496) 3511 437.4 1.9e-122 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1810 232.6 1.2e-60 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1747 225.2 2.9e-58 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1747 225.3 2.9e-58 CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1741 224.3 3.7e-58 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1728 222.6 1e-57 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1728 222.7 1.1e-57 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1728 222.7 1.1e-57 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1728 222.7 1.1e-57 CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1720 221.5 1.7e-57 CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1711 220.7 4.6e-57 CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1704 219.7 6.9e-57 CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1704 219.8 8.1e-57 CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1700 219.2 1e-56 CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1700 219.3 1.1e-56 CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1691 218.0 1.9e-56 CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1695 218.8 1.9e-56 CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1695 218.9 2e-56 CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1695 218.9 2e-56 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1692 218.4 2.3e-56 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1686 217.7 3.8e-56 CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1685 217.6 4.3e-56 CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1685 217.6 4.4e-56 CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1684 217.5 4.6e-56 CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1681 217.0 5.2e-56 CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1681 217.0 5.4e-56 CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1681 217.1 5.6e-56 CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1671 215.6 1.1e-55 CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1662 214.7 2.5e-55 CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1662 214.7 2.6e-55 CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1660 214.6 3.4e-55 CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1658 214.3 3.8e-55 CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1655 213.8 4.6e-55 CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1655 213.8 4.6e-55 CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1657 214.3 4.7e-55 CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1653 213.7 5.9e-55 CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1653 213.7 6.1e-55 CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1651 213.4 6.6e-55 CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1651 213.4 6.7e-55 CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1647 212.9 9.1e-55 CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1648 213.1 9.3e-55 CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1647 212.9 9.4e-55 CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1644 212.5 1.1e-54 CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1641 212.2 1.5e-54 CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1641 212.2 1.5e-54 CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1641 212.3 1.7e-54 CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1639 212.0 1.8e-54 CCDS33046.1 ZNF224 gene_id:7767|Hs108|chr19 ( 707) 1639 212.0 1.9e-54 CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1633 211.1 2.7e-54 >>CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 (536 aa) initn: 3760 init1: 3760 opt: 3760 Z-score: 2473.7 bits: 467.4 E(32554): 1.8e-131 Smith-Waterman score: 3760; 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CCDS74 YCCKECGKSFTFRSTRNRHQRIHTGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYHCK 450 460 470 480 490 500 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 ECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGK :::: :. :.. :: .::::: :.:.::::.: : ::.::.:::::. :.:::::: CCDS74 ECGKSFTFRSGLIGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALIQHQRIHTGEKPYHCKECGK 510 520 530 540 550 560 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 AFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQ .: . : .::.::.:..:..::.::::: .: :: :::::::: :. :::.:.. CCDS74 SFTVGSTLLQHQQIHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQHQQIHTGEKPYQCQECGKAFVS 570 580 590 600 610 620 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 RSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKG :.. ::..::: :: ::: . :. : . : .....:.: CCDS74 VSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFCSGL 630 640 650 660 670 680 pF1KA0 EHTGNL CCDS74 IQHQQNHTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQ 690 700 710 720 730 740 >-- initn: 1620 init1: 1620 opt: 1620 Z-score: 1076.8 bits: 209.9 E(32554): 1.2e-53 Smith-Waterman score: 1620; 54.3% identity (77.8% similar) in 392 aa overlap (90-481:664-1055) 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 LGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIE ::: : . :.. . : :. :.. . CCDS74 IHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFCSGLIQHQQNHTD 640 650 660 670 680 690 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 GEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLY . :::.:: .: :..:. :.::::: : .:::.: . : :..::.:::::.:: CCDS74 EKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLY 700 710 720 730 740 750 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 VCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKE :. :::.: .: ::.:: .:.::::..: .:::.: : ::.:. ::: :. . ::: CCDS74 DCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKE 760 770 780 790 800 810 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 CGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKA :::.:.. : ::.::::::::.::.:.:::::: :..:.: .::: : :.::::::: CCDS74 CGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFAFRSAIIQHRRIHTGEKPYDCKECGKA 820 830 840 850 860 870 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 FRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQT ::.:: : .::::::::.:..:.::::::.: : : .:. :::::.:: :. ::: : : CCDS74 FRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQR 880 890 900 910 920 930 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 SNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLT ...: :::::::.. :::.::::.: .: :::::. ::::. :.:::::::: ..:. 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CCDS74 QHKRIHTGEKTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTCGKAFKQLTQLTRHQR 1000 1010 1020 1030 1040 1050 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 IHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL :: CCDS74 IHDLT >>CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090 aa) initn: 10108 init1: 1739 opt: 1747 Z-score: 1159.4 bits: 225.3 E(32554): 2.9e-58 Smith-Waterman score: 1747; 53.8% identity (77.6% similar) in 429 aa overlap (83-509:269-695) 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 EPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLL . ::.:.::. : . :.. ..: : CCDS59 HLIQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHLIQHWRIHTGDKPYECKECGKS--FTSGSTL 240 250 260 270 280 290 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 LQRELIEGEANP--CDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQ :.. :. .: : :::.:: .: :.::. :.::::: : .:::.:...: :..:: CCDS59 NQHQQIHTGEKPYHCKQCGKSFTVGSTLIRHQQIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALIRHQ 300 310 320 330 340 350 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 RIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHT ::::::. : :. :::.: .:.::.:::.:.::::. : .:::.: : :: :: .:: CCDS59 RIHTGEKPYDCKECGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAIHT 360 370 380 390 400 410 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 RERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQ :.:..::::::.:. .: ::.::::::::.::.:.:::::: .:.:..: .::: : CCDS59 GEKPYDCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKP 420 430 440 450 460 470 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 YECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCN : ::::::.: :: .::::::::.:..:.::::.: .: :.:::::::::.:: :. CCDS59 YCCKECGKSFTFRSTRNRHQRIHTGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYHCK 480 490 500 510 520 530 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 ECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGK :::: :. :.. :: .::::: :.:.::::.: : ::.::.:::::. :.:::::: CCDS59 ECGKSFTFRSGLIGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALIQHQRIHTGEKPYHCKECGK 540 550 560 570 580 590 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 AFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQ .: . : .::.::.:..:..::.::::: .: :: :::::::: :. :::.:.. CCDS59 SFTVGSTLLQHQQIHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQHQQIHTGEKPYQCQECGKAFVS 600 610 620 630 640 650 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 RSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKG :.. ::..::: :: ::: . :. : . : .....:.: CCDS59 VSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFCSGL 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 EHTGNL CCDS59 IQHQQNHTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQ 720 730 740 750 760 770 >-- initn: 1620 init1: 1620 opt: 1620 Z-score: 1076.7 bits: 210.0 E(32554): 1.2e-53 Smith-Waterman score: 1620; 54.3% identity (77.8% similar) in 392 aa overlap (90-481:696-1087) 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 LGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIE ::: : . :.. . : :. :.. . CCDS59 IHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFCSGLIQHQQNHTD 670 680 690 700 710 720 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 GEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLY . :::.:: .: :..:. :.::::: : .:::.: . : :..::.:::::.:: CCDS59 EKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLY 730 740 750 760 770 780 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 VCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKE :. :::.: .: ::.:: .:.::::..: .:::.: : ::.:. ::: :. . ::: CCDS59 DCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKE 790 800 810 820 830 840 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 CGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKA :::.:.. : ::.::::::::.::.:.:::::: :..:.: .::: : :.::::::: CCDS59 CGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFAFRSAIIQHRRIHTGEKPYDCKECGKA 850 860 870 880 890 900 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 FRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQT ::.:: : .::::::::.:..:.::::::.: : : .:. :::::.:: :. ::: : : CCDS59 FRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQR 910 920 930 940 950 960 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 SNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLT ...: :::::::.. :::.::::.: .: :::::. ::::. :.:::::::: ..:. CCDS59 THLTLHQRIHTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHTGEKPYDCKECGKAFRCPSQLS 970 980 990 1000 1010 1020 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 EHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQK .:..::.:.. ..: .:::::. .: : :: .::::::: :. :::.: : ... .::. CCDS59 QHKRIHTGEKTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTCGKAFKQLTQLTRHQR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 IHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL :: CCDS59 IHDLT 1090 >>CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 (682 aa) initn: 4880 init1: 1731 opt: 1741 Z-score: 1157.7 bits: 224.3 E(32554): 3.7e-58 Smith-Waterman score: 1741; 52.8% identity (76.7% similar) in 451 aa overlap (59-509:209-651) 30 40 50 60 70 80 pF1KA0 NSHRTTSDRLTVMELPSPESEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKI :. : :... ..: : .:. . CCDS64 RPHPYDMGGQSFQHSVDLTGHEGVPTAESPLICNECGKTFQGNP--DLIQRQI------V 180 190 200 210 220 230 90 100 110 120 130 140 pF1KA0 QTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGE .:::.. .: :.. :: : .: . .: :. :::.: .::. ::. :..: CCDS64 HTGEASFMCDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSE 240 250 260 270 280 290 150 160 170 180 190 200 pF1KA0 KPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFK .:: :..:::.:.:.: : .::. : .:. : :: ::: : . :.::.:::.::::::. CCDS64 RPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYV 300 310 320 330 340 350 210 220 230 240 250 260 pF1KA0 CAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNEC :..::::: .::.::.:.:.:: :.:::: ::::.::::. : .:::.::::.:::::.: CCDS64 CSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDC 360 370 380 390 400 410 270 280 290 300 310 320 pF1KA0 GKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAF :: : : :.::.:...:: : :.:..::::: . :.::.:.::::::.: :: ::::: CCDS64 GKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGKAF 420 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 380 pF1KA0 IRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSS :: : .:: :::::.:: :. ::: ::..: . ::: .:::.: : :.::::.: :: CCDS64 SYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSS 480 490 500 510 520 530 390 400 410 420 430 440 pF1KA0 YLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLL :: ::..::::. ::: ::::.: :.. : .::.::.: .: ::..::::: .::.:. CCDS64 NLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIH 540 550 560 570 580 590 450 460 470 480 490 500 pF1KA0 HQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRV :: .:::::::.: ::::: : :...::: ::: :. :.::. :. :.. . . ..::. 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